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当前共找到 37368 篇文献，本页显示第 1781 - 1800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1781 | 2026-02-21 |
From modality-specific to compositional foundation models for cell biology
2026-Feb-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101534
PMID:41713397
|
综述 | 本文探讨了利用组合式AI构建多模态基础模型，以整合染色质可及性、蛋白质丰度、空间转录组学、显微镜成像和文本注释等多种生物模态，形成细胞行为的统一表示 | 提出组合式AI作为模块化设计方法，用于构建多模态基础模型，通过基于transformer的注意力策略整合不同生物模态，并解决数据有限性和模态表示结构差异的挑战 | 面临数据可用性有限和模态表示间结构差异的挑战，且多模态测量的部分重叠连接和对齐仍需进一步研究 | 通过多模态建模从单细胞测量中推导细胞生物学原理，以促进对健康和疾病中细胞状态的理解 | 细胞生物学中的多模态数据，包括染色质可及性、蛋白质丰度、空间转录组学、显微镜成像和文本注释 | 机器学习 | NA | 多模态建模，深度学习，基于transformer的注意力策略 | 基础模型，transformer | 多模态数据（染色质可及性、蛋白质丰度、空间转录组学、显微镜成像、文本注释） | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，显微镜成像 | NA | NA |
| 1782 | 2026-02-21 |
Intestinal epithelial Smad7 drives purine metabolic dysregulation and ileal inflammation
2026-Feb-17, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-026-01224-3
PMID:41703574
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研究论文 | 本研究探讨了肠道上皮细胞中Smad7过表达如何通过干扰嘌呤代谢（特别是降低CD73介导的腺苷生成）导致自发性回肠炎，并揭示了其在克罗恩病病理中的作用 | 首次通过空间转录组学与代谢组学整合分析，揭示了上皮Smad7过表达通过下调CD73破坏嘌呤代谢-腺苷轴，从而驱动回肠炎症的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仅限于相关性分析，缺乏直接因果证据；腺苷治疗的长期效果和安全性未评估 | 阐明肠道上皮细胞中Smad7表达在回肠炎症发生中的具体作用机制 | Smad7过表达转基因小鼠（Smad7TgCre+）的肠道组织、肠道上皮细胞（IECs）以及克罗恩病患者的回肠组织样本 | 空间转录组学 | 克罗恩病 | 空间转录组学、代谢组学、多重免疫荧光、流式细胞术 | 转基因小鼠模型 | 空间转录组数据、代谢组数据、组织图像、流式细胞数据 | 未明确样本数量，涉及Smad7TgCre+转基因小鼠、对照小鼠及克罗恩病患者回肠组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1783 | 2026-02-21 |
Relevance of Chemokines in Mobilizing γδ T Cells in the Biliary Tract Cancer Microenvironment: Potential for γδ T-Cell-Based Adoptive Cell Therapy
2026-Feb-17, American journal of clinical oncology
DOI:10.1097/COC.0000000000001306
PMID:41711559
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胆道癌肿瘤微环境中的趋化因子表达模式，探讨了γδ T细胞的招募机制及其在基于γδ T细胞的过继细胞疗法中的潜在应用 | 首次利用单细胞RNA测序全面描绘胆道癌肿瘤微环境中的趋化因子景观，揭示了支持γδ T细胞浸润的选择性趋化因子招募特征，并发现了免疫抑制群体的共招募现象 | 研究样本量较小（19名患者），且为回顾性分析，需要进一步实验验证趋化因子介导的招募机制 | 探究胆道癌肿瘤微环境中趋化因子介导的γδ T细胞招募机制，为开发基于γδ T细胞的过继细胞疗法提供理论基础 | 胆道癌患者的肿瘤组织样本 | 单细胞组学 | 胆道癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 19名患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1784 | 2026-02-21 |
Vascular basement membrane laminins modulate functional zonation of cerebral microvessels
2026-Feb-16, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X251410040
PMID:41696806
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨了基底膜层粘连蛋白α4和α5缺失对小鼠脑血管功能分区的影响 | 揭示了层粘连蛋白α4/α5比例通过调节内皮细胞和平滑肌细胞的代谢通路影响脑血管功能分区，并首次将autotaxin与中风预后恶化联系起来 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证，且机制细节如autotaxin具体作用途径需进一步探索 | 探究基底膜层粘连蛋白如何调节脑血管的功能分区及其在中风病理中的作用 | 小鼠脑血管（包括内皮细胞、平滑肌细胞和常驻髓系细胞） | 单细胞转录组学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型及层粘连蛋白α4/α5缺失小鼠的脑血管样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1785 | 2026-02-21 |
Targeting MAFB potentiates immune checkpoint inhibitor efficacy by reprogramming tumor-associated macrophages to an M1-like phenotype in colorectal cancer
2026-Feb-13, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2026.02.006
PMID:41692233
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，发现转录因子MAFB在结直肠癌M2样肿瘤相关巨噬细胞中特异性高表达，并证实靶向MAFB可将其重编程为M1样表型，从而增强免疫检查点抑制剂的疗效 | 首次揭示了MAFB在调控结直肠癌M2样肿瘤相关巨噬细胞中的关键细胞内在作用，并提供了靶向MAFB可增强免疫检查点抑制剂疗效的首个证据 | NA | 克服结直肠癌对免疫检查点抑制剂的耐药性，通过重编程肿瘤微环境中的巨噬细胞 | 结直肠癌患者、肿瘤相关巨噬细胞、MAFB转录因子 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1786 | 2026-02-21 |
Temporal modulation of microglial repopulation attenuates retinal degeneration in retinitis pigmentosa
2026-Feb-12, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2026.107295
PMID:41690604
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研究论文 | 本研究探讨了通过时间调控小胶质细胞的清除与再增殖，对视网膜色素变性（RP）中视网膜退行性变的影响 | 首次揭示了小胶质细胞再增殖后的表型具有时间依赖性可塑性，并开发了一种序贯两轮清除-再增殖策略以维持其稳态，从而持续保护视功能和光感受器 | 研究仅在rd10小鼠模型中进行，尚未在人类患者或其它RP模型中验证；长期再增殖后小胶质细胞重新激活的机制尚未完全阐明 | 探索通过时间调控小胶质细胞动态来治疗视网膜色素变性（RP）所致神经退行性变的新策略 | rd10小鼠（视网膜色素变性模型）的视网膜组织及小胶质细胞 | 神经退行性疾病研究 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），转录组分析 | NA | RNA测序数据，形态学数据，功能数据 | rd10小鼠模型（具体数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1787 | 2026-02-21 |
JADE: Joint Alignment and Deep Embedding for Multi-Slice Spatial Transcriptomics
2026-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.21.689823
PMID:41394739
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研究论文 | 本文介绍了一种名为JADE的统一计算框架，用于多切片空间转录组学数据的联合对齐和深度嵌入分析 | JADE首次在共享潜在空间中联合优化对齐和表示学习，采用循环框架交替进行对齐和嵌入细化，并利用注意力机制动态评估嵌入维度的重要性 | NA | 解决多切片空间转录组学数据中的空间对应关系和共享转录组特征识别问题 | 10x Visium人类背外侧前额叶皮层和Stereo-seq蝾螈脑数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习框架（含注意力机制） | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 1788 | 2026-02-21 |
Aberrant medial ganglionic eminence (MGE) GABAergic neurogenesis contributes to Huntington's disease pathogenesis
2026-Feb-05, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2026.107297
PMID:41654201
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研究论文 | 本研究通过使用BACHD小鼠模型，揭示了亨廷顿病发病机制中内侧神经节隆起（MGE）来源的GABA能神经元发育异常的关键作用 | 首次系统阐明了突变亨廷顿蛋白如何破坏早期MGE神经发生程序，并发现基底中间祖细胞是细胞脆弱性的主要位点，同时通过谱系特异性基因拯救验证了其致病贡献 | 研究主要基于小鼠模型，人类HD患者中MGE神经发生异常的直接证据仍需进一步验证 | 探究亨廷顿病发病机制中早期端脑中间神经元功能障碍的发育起源及其因果贡献 | BACHD小鼠模型、胚胎期和早期出生后阶段的MGE来源GABA能谱系细胞 | 神经科学 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序、谱系特异性基因拯救、免疫组织化学分析 | 动物模型（BACHD小鼠） | 转录组数据、细胞计数数据、行为学数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及多个发育时间点（E12.5、PND13、PND30）的小鼠组织分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1789 | 2026-02-21 |
Follicular Helper T Cells and B Cell Maturation in Patients with 22q11.2 Deletion Syndrome and Recurrent Infections
2026-Feb-03, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-026-01987-2
PMID:41629437
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA-seq技术，分析了22q11.2缺失综合征患者（特别是伴有反复感染的患者）与对照组的基因表达模式，重点关注了T细胞功能异常和B细胞成熟减少的机制 | 首次在22q11.2缺失综合征患者中，通过单细胞RNA-seq技术，系统性地揭示了跨所有细胞类型的I型干扰素特征，并在滤泡辅助T细胞中识别出衰老特征，特别是在反复感染患者中最为显著 | 样本量相对较小（患者N=13，对照N=11），且研究主要基于基因表达分析，未深入验证功能机制 | 利用单细胞RNA-seq技术，更好地定义22q11.2缺失综合征患者（尤其是伴有反复感染的患者）中改变的基因表达模式，以阐明与反复感染相关的机制 | 22q11.2缺失综合征患者（包括伴有反复感染的亚组）和健康对照 | 数字病理学 | 免疫缺陷综合征 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 患者13例，对照11例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1790 | 2026-02-21 |
Metformin inhibits proliferation of residing fibroadipogenic progenitor cells from failing human hearts
2026-Feb-03, ESC heart failure
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/eschf/xvag001
PMID:41711740
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研究论文 | 本研究探讨了二甲双胍在射血分数降低的心力衰竭（HFrEF）患者心肌中的分布及其对心脏纤维脂肪源性祖细胞（FAPs）增殖的抑制作用 | 首次使用11C-二甲双胍PET成像评估HFrEF患者心肌二甲双胍分布，并结合单细胞RNA测序鉴定心脏FAPs，揭示二甲双胍通过抑制FAP增殖可能改善心室重构 | 样本量较小（7例HFrEF患者用于PET，4例用于scRNA-seq），且为体外实验，需进一步验证临床疗效 | 探究二甲双胍在HFrEF中的治疗机制，特别是其对心肌纤维化祖细胞的影响 | HFrEF患者的心肌组织及从中分离的纤维脂肪源性祖细胞（FAPs） | 心血管疾病研究 | 心力衰竭 | 11C-二甲双胍正电子发射断层扫描（PET）、15O-H2O-PET、运动负荷超声心动图、荧光激活细胞分选（FACS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 影像数据、基因表达数据、细胞实验数据 | 7例HFrEF患者用于PET研究，4例HFrEF患者和4例对照心脏用于scRNA-seq分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1791 | 2026-02-21 |
CHB-Induced Immune Zonation Chaos Elicited LXRα-mediated Lipid Metabolism Disorders in Kupffer Cells to Induce Cancer Stem Cell Formation
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202510275
PMID:41164971
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了慢性乙型肝炎病毒（CHB）感染中库普弗细胞（KCs）的免疫分区紊乱如何通过LXRα介导的脂质代谢失调诱导癌症干细胞形成 | 首次揭示了库普弗细胞在肝脏疾病进展中的空间分区作用，并阐明了LXRα在KCs中通过脂质代谢失调和Stat3通路介导癌症干细胞形成的分子机制 | 研究主要基于AAV-HBV小鼠模型，人类样本验证相对有限；机制研究集中在KCs与肝细胞的相互作用，其他免疫细胞类型的作用可能未完全涵盖 | 探究慢性乙型肝炎病毒（CHB）感染如何通过肝脏微环境中的细胞间通讯驱动从炎症到肝细胞癌的疾病进展 | AAV-HBV小鼠模型、人类HBV患者肿瘤组织、库普弗细胞（KCs）、肝细胞、内皮细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学分析 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | AAV-HBV小鼠模型（时间序列样本）、人类HBV患者肿瘤组织（包括正常组织、癌旁组织和肿瘤组织） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1792 | 2026-02-21 |
CD168 Identifies Proliferating Pancreatic Islet Cells in Murine and Human
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202510590
PMID:41422437
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研究论文 | 本文发现CD168作为小鼠和人类胰岛中增殖细胞的保守表面标记物，用于富集活体增殖β细胞 | 首次鉴定CD168为胰岛增殖细胞的保守表面标记，并开发CD168-CreERT2小鼠模型进行谱系追踪，揭示新生β细胞约60天的成熟轨迹 | 未明确说明样本量限制或技术潜在偏差 | 研究糖尿病治疗中通过增殖恢复功能性β细胞质量的目标 | 小鼠和人类胰岛细胞，特别是增殖中的β细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫染色，谱系追踪，多组学分析 | CD168-CreERT2小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据，免疫染色图像，谱系追踪数据 | 未明确指定具体样本数量，但提到成年胰岛细胞中CD168细胞约占0.5% | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1793 | 2026-02-21 |
BHLHE40 Orchestrates Effector Tissue-Resident Memory CD8+ T Cells and Limits Long-Term Survival of Kidney Graft
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520518
PMID:41486507
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研究论文 | 本研究通过小鼠肾移植模型，利用单细胞和空间转录组学技术，揭示了CD49aPD1 CD8+ T细胞作为效应性组织驻留记忆T细胞亚群在移植排斥中的作用，并发现BHLHE40是其分化和功能的关键调控因子 | 首次在小鼠肾移植模型中鉴定出CD49aPD1 CD8+ T细胞作为效应性组织驻留记忆T细胞亚群，并阐明BHLHE40通过TGF-β信号调控其分化和功能，强调了驻留免疫细胞而非循环细胞在移植排斥中的主导作用 | 研究基于小鼠模型，结果在人类肾移植中的适用性需进一步验证；长期观察机制的具体时间点未详细说明 | 探究组织驻留记忆T细胞在肾移植排斥中的分化和稳态机制 | 小鼠肾移植模型中的CD8+ T细胞，特别是CD49aPD1亚群 | 数字病理学 | 肾移植排斥 | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据，空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1794 | 2026-02-21 |
RBM15/IGF2BP3 promotes immune escape in bladder cancer by enhancing m6A modification of PFKFB4
2026-Feb, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150142
PMID:41579989
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研究论文 | 本研究揭示了RBM15通过m6A修饰和IGF2BP3依赖的机制稳定PFKFB4表达，从而促进膀胱癌糖酵解并抑制CD8 T细胞功能，为免疫治疗提供了新靶点 | 首次整合单细胞测序、空间转录组学、m6A-seq和乳酰化蛋白质组学，阐明了RBM15通过m6A-IGF2BP3-PFKFB4轴调控肿瘤糖酵解和免疫逃逸的双重机制，并验证了靶向RBM15可增强抗PD1疗法疗效 | 研究主要基于膀胱癌模型，机制在其他癌种中的普适性有待验证；体内实验仅使用了siRNA沉默策略，缺乏更特异的基因编辑验证 | 探究m6A修饰在膀胱癌肿瘤微环境塑造中的作用，特别是RBM15在调控糖酵解和免疫逃逸中的分子机制 | 膀胱癌恶性上皮细胞、CD8 T细胞、RBM15/IGF2BP3/PFKFB4分子轴 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | 单细胞测序、空间转录组学、m6A-seq、乳酰化蛋白质组学、RIP-qPCR、MeRIP-qPCR、荧光素酶报告实验、RNA稳定性检测、脂质纳米颗粒递送 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、m6A修饰数据、蛋白质组数据、体外功能实验数据、体内治疗数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 1795 | 2026-02-21 |
Agonistic GITR treatment enhances antitumor immune responses and suppresses tumor progression in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Feb-01, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-026-02347-y
PMID:41620983
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研究论文 | 本研究探讨了激动性GITR治疗在胰腺导管腺癌中通过调节肿瘤微环境增强抗肿瘤免疫反应并抑制肿瘤进展的机制 | 首次在PDAC中系统评估GITR作为免疫治疗靶点的潜力，结合小鼠模型和人类样本的多组学分析，揭示了GITR激活对Tregs减少和效应T细胞增加的双重调节作用 | 研究主要基于Pan02小鼠模型，人类样本数量有限，且未进行长期临床疗效验证 | 探索GITR作为PDAC免疫治疗新靶点的有效性和作用机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的肿瘤微环境及免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫荧光 | Pan02小鼠模型 | 基因表达数据、空间转录组数据、免疫组化图像 | 未明确样本数量，包括Pan02小鼠模型和人类PDAC手术切除样本（初治患者与新辅助化疗患者） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1796 | 2026-02-21 |
Enteric nervous system and inflammatory bowel disease
2026-Feb, Gastroenterology report
IF:3.8Q2
DOI:10.1093/gastro/goag005
PMID:41696441
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综述 | 本文综述了肠道神经系统（ENS）与炎症性肠病（IBD）之间复杂的相互作用，探讨了ENS功能障碍如何促进IBD的发病机制，并评估了靶向ENS的治疗潜力 | 强调了ENS作为“第二大脑”在IBD中的核心作用，系统阐述了ENS功能障碍（如神经兴奋性增高、突触脆弱性）与肠道炎症的双向关联，并指出了靶向ENS的神经调控疗法作为新兴治疗前沿 | 研究ENS面临神经元细胞丰度低、技术限制等挑战，需要空间转录组学等先进方法来克服 | 探讨ENS在IBD发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 肠道神经系统、炎症性肠病、肠道胶质细胞、神经免疫相互作用 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1797 | 2026-02-21 |
Identifying cell-type-specific marker genes of dental epithelial cells using single-cell RNA sequence: A review
2026-Feb, Journal of oral biosciences
IF:2.6Q1
DOI:10.1016/j.job.2026.100757
PMID:41714012
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综述 | 本文通过整合单细胞RNA测序数据、组织学验证、表型数据库和CAGE-seq，建立了牙上皮细胞类型的更新分子图谱 | 系统性地整合了已发表的scRNA-seq牙齿发育研究中的经典和新提出的标记基因，并结合实验验证和表型数据库，为牙上皮细胞类型提供了全面的分子身份描述 | 主要基于小鼠模型数据，可能不完全适用于人类牙上皮细胞研究，且非成釉细胞群体的分子标记和功能角色仍有待进一步探索 | 识别牙上皮细胞的细胞类型特异性标记基因，以理解牙齿发育中的分子异质性 | 牙上皮细胞，包括成釉细胞（如内釉上皮、分泌期和成熟期）以及非成釉细胞群体（如外釉上皮、星网状层和中间层） | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫染色、原位杂交、CAGE-seq | NA | 文本 | 基于已发表的小鼠牙齿组织研究，具体样本数量未在摘要中指定 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1798 | 2026-02-21 |
Microbiota-dependent transcriptional priming of lung innate immune cells in a mouse model of LPS-induced sepsis-associated lung injury
2026-Feb, Journal of oral biosciences
IF:2.6Q1
DOI:10.1016/j.job.2026.100742
PMID:41714041
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序，揭示了共生微生物群在正常生理和LPS诱导的脓毒症条件下，对小鼠肺先天免疫细胞转录活性和成熟轨迹的调控作用 | 首次在单细胞分辨率下，系统比较了无菌小鼠与常规小鼠肺先天免疫细胞在稳态和脓毒症状态下的转录组差异，并明确了微生物信号通过调控Cebpb表达等机制影响免疫细胞的炎症准备状态 | 研究基于小鼠模型，结论在人体中的普适性有待验证；实验仅聚焦于LPS诱导的脓毒症模型，未涵盖其他类型的肺部损伤 | 阐明微生物信号如何塑造肺先天免疫系统的功能成熟及其在脓毒症相关肺损伤中的作用机制 | 无菌小鼠和常规小鼠的肺免疫细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症相关肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 无菌小鼠和常规小鼠在正常及脓毒症条件下的肺免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1799 | 2026-02-21 |
Applications of Spatial Transcriptomics in Ischemic Stroke Research
2026-Jan-31, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.01.008
PMID:41628770
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综述 | 本文综述了空间转录组学在缺血性卒中研究中的应用，重点探讨了胶质细胞在卒中病理生物学中的复杂作用 | 通过结合空间转录组学与单细胞及多组学方法，识别了新的治疗靶点，如不同激活状态的胶质细胞及其关键信号通路 | 当前研究仍面临挑战，包括需要多时间点分析、三维重建和标准化数据集以推动临床应用 | 探讨空间转录组学如何促进对卒中后细胞变化的理解，并推动卒中研究与治疗 | 缺血性卒中后的脑组织，特别是小胶质细胞、星形胶质细胞和少突胶质细胞 | 数字病理学 | 缺血性卒中 | 空间转录组学，单细胞多组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1800 | 2026-02-21 |
Diffusion-based Representation Integration for Foundation Models Improves Spatial Transcriptomics Analysis
2026-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.20.689624
PMID:41332747
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研究论文 | 提出DRIFT框架，通过热核扩散在空间图上整合空间上下文到基础模型的输入表示中，以改进空间转录组学分析 | 利用热核扩散在空间图上传播嵌入，将ST数据的局部邻域上下文整合到现有单细胞基础模型中，弥补了空间信息利用的不足 | 未明确提及具体局限性，但可能依赖于基础模型的性能和数据质量 | 开发一个通用框架，将空间上下文整合到基础模型中，以提升空间转录组学数据的分析性能 | 空间转录组学数据及其在细胞类型注释、聚类和跨样本对齐等任务中的应用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 基础模型（包括scRNA-seq和ST-based模型） | 基因表达谱数据（空间转录组学和单细胞RNA测序数据） | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |