单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-05 |
Integrated single-cell RNA-seq analysis reveals that EZH2 regulates the MIF-CD74 axis to modulate T cell activation and exhaustion in hepatocellular carcinoma
2025-Oct-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07071-4
PMID:41034982
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq分析揭示了EZH2通过调控MIF-CD74轴影响肝细胞癌中T细胞活化与耗竭的机制 | 构建了包含16个基因的整合模型，首次发现EZH2通过MIF-CD74信号通路调控CD8+ T细胞的活化与耗竭状态 | 研究结果仍需在更大样本中验证，机制研究主要依赖小鼠模型 | 开发肝细胞癌预后和免疫检查点抑制剂反应预测模型，并探索相关基因在肿瘤免疫微环境中的作用 | 肝细胞癌患者样本和免疫活性小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 整合基因模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 162 | 2025-10-05 |
TEAD3 + high-risk melanoma cells crosstalk with GAS6 + macrophages via the GAS6-TYRO3 ligand-receptor axis to modulate propionate metabolism and drive melanoma progression
2025-Oct-01, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03542-0
PMID:41034991
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了TEAD3驱动的高风险黑色素瘤亚型通过GAS6-TYRO3配体-受体轴与巨噬细胞相互作用，重编程丙酸代谢促进肿瘤进展的机制 | 首次发现TEAD3+高风险黑色素瘤细胞通过GAS6-TYRO3轴与巨噬细胞互作，调控丙酸代谢和甲基丙二酸积累驱动肿瘤进展 | 研究主要基于TCGA数据库和单细胞测序数据，需要更多临床样本验证 | 阐明短链脂肪酸代谢失调驱动的黑色素瘤亚型及其侵袭性机制 | 468例TCGA黑色素瘤样本和单细胞RNA-seq数据 | 肿瘤生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, CRISPR/Cas9, siRNA敲低, 免疫组化, 代谢分析, Seahorse分析 | 非负矩阵分解(NMF)聚类分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 468例TCGA黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 163 | 2025-10-05 |
Targeting tumor microenvironment with biomimetic nanovesicles for non-small cell lung cancer gene therapy
2025-Oct-01, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03684-5
PMID:41035023
|
研究论文 | 本研究开发了一种仿生纳米囊泡用于非小细胞肺癌的基因治疗 | 首次构建了CAF膜包被的siRNA递送系统，靶向ACTN1基因治疗NSCLC | CAF-癌细胞相互作用的精确机制仍需进一步阐明 | 开发靶向肿瘤微环境的基因治疗策略 | 非小细胞肺癌肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 生物医学工程 | 肺癌 | 单细胞测序, siRNA基因沉默 | NA | 基因表达数据, 细胞功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 164 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics of organoids reveals transcriptional control of germline stem cell fate by an E2F1-TFAP2C-SOX17 positive-feedback loop in Turner syndrome
2025-Oct-01, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01464-0
PMID:41035077
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析特纳综合征类器官，揭示了E2F1-TFAP2C-SOX17正反馈环路调控生殖系干细胞命运的分子机制 | 首次在特纳综合征模型中建立类器官系统生成人类生殖系干细胞及其体细胞生态位，并发现E2F1作为关键命运调控因子通过正反馈环路控制生殖系干细胞命运 | 研究仅限于特纳综合征45,XO模型，尚未验证在其他类型生殖障碍中的普适性 | 探究特纳综合征患者生殖系干细胞发育的分子调控机制 | 特纳综合征患者来源的iPSCs、生殖系干细胞及其体细胞生态位 | 单细胞生物学 | 特纳综合征 | 单细胞转录组测序 | 类器官模型 | 单细胞RNA测序数据 | 特纳综合征45,XO类器官模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 165 | 2025-10-05 |
Single-cell sequencing technology in renal cancer: insights into tumor biology and clinical application
2025-Oct-01, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00811-0
PMID:41035074
|
综述 | 本文综述单细胞测序技术在肾癌研究中的应用，揭示肿瘤异质性并探讨临床转化前景 | 系统阐述单细胞测序技术如何揭示肾癌细胞图谱、肿瘤微环境复杂性及与空间组学技术的整合应用 | 未涉及具体实验数据，主要基于现有文献综述，缺乏原始研究验证 | 探讨单细胞测序技术对肾癌生物学机制和临床应用的贡献 | 肾癌（特别是透明细胞肾细胞癌）的肿瘤异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间组学 | NA | NA |
| 166 | 2025-10-05 |
Functional diversity of disorder-specific macrophages involved in various diseases
2025-Oct-01, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-025-00390-5
PMID:41035106
|
综述 | 本文综述了疾病特异性巨噬细胞的功能多样性及其在各种疾病中的作用机制 | 超越传统的M1/M2极化模型，基于单细胞RNA测序技术揭示了疾病特异性巨噬细胞的连续转录状态和功能多样性 | NA | 探讨疾病特异性巨噬细胞的起源、转录调控和空间异质性，及其在疾病进展中的独特作用 | 疾病特异性巨噬细胞亚群 | 免疫学 | 多种疾病（包括结核病、肥胖、神经退行性疾病、非酒精性脂肪性肝炎等） | 单细胞RNA测序，多组学整合分析 | NA | 转录组数据，表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 167 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis reveals an important role of CD137L+ macrophages in the host response to uropathogenic Escherichia coli infection in the bladder
2025-Oct, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013543
PMID:41042739
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示CD137L+巨噬细胞在膀胱宿主应对尿路致病性大肠杆菌感染中的关键保护作用 | 首次发现CD137L+巨噬细胞通过调节Tregs在UPEC感染中发挥关键免疫调节作用 | 研究局限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究宿主对尿路致病性大肠杆菌感染的免疫反应机制 | 小鼠膀胱免疫细胞 | 单细胞生物学 | 泌尿系统感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠膀胱组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 168 | 2025-10-05 |
Targeting cell-state plasticity driven by FOXM1/CEBPB axis disrupts developmental heterogeneity and therapeutic resistance in hepatocellular carcinoma
2025-Oct-01, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.09.022
PMID:41043722
|
研究论文 | 本研究揭示了FOXM1/CEBPB轴通过调控细胞状态可塑性驱动肝细胞癌发育异质性和治疗耐药性的机制 | 首次发现FOXM1/CEBPB轴作为主控开关调控肝细胞癌发育异质性，并开发了靶向FOXM1的GalNAc偶联siRNA疗法 | 研究主要基于临床前模型，需要进一步临床验证 | 探索肝细胞癌发育异质性和治疗耐药性的分子机制并开发靶向治疗策略 | 肝细胞癌患者样本、体外和体内模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 自调控网络分析 | NA | 基因表达数据 | 来自肝细胞癌患者的公共数据集和内部样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 169 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics reveals the regulation of bco1 and bco2 genes in the carotenoid metabolism of koi carp
2025-Oct-01, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147965
PMID:41043743
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了锦鲤类胡萝卜素代谢中bco1和bco2基因的调控机制 | 首次构建了锦鲤红白皮肤的单细胞图谱，揭示了色素细胞从白皮向红皮发育的轨迹，并发现bco2基因比bco1具有更广泛的底物特异性 | 研究聚焦于锦鲤特定品种，结论在其他鱼类中的普适性有待验证 | 探究锦鲤皮肤颜色形成的分子机制 | 锦鲤的红白皮肤组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, TEM, HPLC, ISH, 免疫荧光, RNAi, 细胞培养, 基因编辑, RNA-seq, 基因家族分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 锦鲤红白皮肤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 170 | 2025-10-05 |
DUSP6 is upregulated in metastasis and influences migration and metabolism in pancreatic cancer cells
2025-Sep-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-12967-8
PMID:41028058
|
研究论文 | 本研究探讨DUSP6在胰腺癌转移中的作用及其对细胞迁移和代谢的影响 | 首次揭示DUSP6在胰腺癌转移中独立调控细胞迁移和代谢的双重功能 | 未阐明DUSP6调控迁移和代谢的具体分子机制 | 研究DUSP6在胰腺导管腺癌进展中的作用机制 | 胰腺导管腺癌细胞 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,基因集富集分析,代谢分析 | NA | 基因表达数据,代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 171 | 2025-10-05 |
Crosstalk between the microbiota and intestinal dendritic cells in IBD
2025-Sep-30, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-025-01062-9
PMID:41028655
|
综述 | 本文总结了肠道常规树突状细胞在炎症性肠病中的功能及其与微生物群的相互作用 | 整合单细胞测序技术进展，系统阐述微生物群通过cDCs影响IBD的机制，并提出研究DC-T细胞通讯的新方法 | cDCs在IBD中的确切作用仍不明确，微生物群如何影响cDCs功能的机制尚待阐明 | 探讨肠道常规树突状细胞与微生物群在炎症性肠病中的相互作用机制 | 肠道常规树突状细胞(cDCs)、微生物群、T细胞 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 172 | 2025-10-05 |
Single-nucleus transcriptomics reveal the morphogenesis and artemisinin biosynthesis in Artemisia annua glandular trichomes
2025-Sep-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63770-y
PMID:41028755
|
研究论文 | 本研究通过单核转录组和空间转录组技术构建了青蒿腺毛发育的高分辨率细胞图谱，揭示了青蒿素生物合成的空间机制 | 首次在单细胞分辨率上系统阐明青蒿腺毛发育的三个阶段及其代谢动态，并精确定位青蒿素主要在10细胞腺毛中的6个特定分泌细胞中产生 | NA | 阐明青蒿腺毛的形态发生和青蒿素生物合成机制 | 青蒿腺毛分泌毛状体 | 空间转录组学 | 疟疾 | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 173 | 2025-10-05 |
Fatty acid metabolism in ischemic stroke: multi-omics biomarker discovery and therapeutic potential of GPR84
2025-Sep-30, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02212-6
PMID:41029687
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探索脂肪酸代谢在缺血性脑卒中中的作用，并鉴定出VIM、G0S2和GPR84作为新型诊断生物标志物 | 首次系统整合外周血转录组数据识别脂肪酸代谢相关差异基因，发现GPR84可作为治疗靶点，并通过分子对接预测潜在药物 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证生物标志物的临床适用性 | 探索脂肪酸代谢在缺血性脑卒中中的生物标志物和治疗靶点 | 缺血性脑卒中患者的外周血样本 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接 | 广义线性模型, LASSO, 支持向量机, 随机森林 | 基因表达数据 | 多个公共数据集(GSE22255, GSE58294, GSE16561, GSE174574)的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 174 | 2025-10-05 |
MOADE: a multimodal autoencoder for dissociating bulk multi-omics data
2025-Sep-30, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03805-1
PMID:41029754
|
研究论文 | 提出一种多模态自编码器MOADE，用于从批量多组学数据中解析细胞组成 | 通过多模态自编码器将多维特征关联，联合预测个性化多组学谱和细胞组成，利用内部非转录组参考和外部scRNA-seq数据构建伪批量数据 | NA | 开发能够解离批量多组学数据的计算方法 | 多组织类型的多组学数据 | 机器学习 | NA | 多组学分析，单细胞RNA测序 | 自编码器 | 多组学数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，多组学 | NA | NA |
| 175 | 2025-10-05 |
EnsembleRegNet: Interpretable deep learning for transcriptional network inference from single-cell RNA-seq
2025-Sep-30, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出EnsembleRegNet深度学习框架，用于从单细胞RNA测序数据推断基因调控网络 | 集成编码器-解码器和多层感知器架构，结合HLE二值化、案例删除分析等多种方法增强鲁棒性和生物学可解释性 | NA | 从单细胞RNA测序数据准确推断基因调控网络结构 | 转录因子-靶基因关系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成编码器-解码器, 多层感知器(MLP) | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 176 | 2025-10-05 |
Crocin inhibits neutrophil migration and activation to treat hypoxic pulmonary hypertension through targeting HCK
2025-Sep-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157334
PMID:41043333
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示藏红花素通过靶向HCK抑制中性粒细胞迁移和活化，从而治疗缺氧性肺动脉高压 | 首次发现藏红花素通过直接靶向HCK蛋白抑制中性粒细胞功能，并阐明其在缺氧性肺动脉高压治疗中的新机制 | 研究主要基于大鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究藏红花素治疗缺氧性肺动脉高压的药理机制 | 缺氧性肺动脉高压大鼠模型、中性粒细胞、肺动脉平滑肌细胞 | 单细胞测序 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 分子对接, CETSA, DARTS, 共培养系统 | NA | 单细胞转录组数据 | 缺氧性肺动脉高压大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 177 | 2025-10-05 |
Urine proteomic signatures of kidney function decline after hospitalization
2025-Sep-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195577
PMID:40794429
|
研究论文 | 通过尿液蛋白质组学分析识别与住院后肾功能下降相关的蛋白质标志物 | 首次在多个独立队列中系统鉴定与肾功能下降相关的尿液蛋白质标志物，并结合单细胞和空间转录组学确定其在肾脏细胞中的表达定位 | 样本量相对有限（174例患者），随访时间中位数为5.1年 | 探索尿液蛋白质组学在预测住院后肾功能下降中的机制和应用价值 | 急性肾损伤患者和非急性肾损伤患者 | 生物医学信息学 | 肾脏疾病 | 尿液蛋白质组学分析，单细胞转录组学，空间转录组学 | 加权相关网络分析 | 蛋白质组数据，转录组数据，临床数据 | 174例患者（来自ASSESS-AKI队列），4个独立验证队列包括肾脏精准医学项目 | Olink | 蛋白质组学，单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | Olink蛋白质组分析平台，检测2783种尿液蛋白质 |
| 178 | 2025-10-05 |
Th17 cells with regulatory phenotype are the main IL-17F and IL-26 producers in palmoplantar pustulosis
2025-Sep-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.193038
PMID:40985896
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间分析揭示掌跖脓疱病中具有调节表型的Th17细胞是IL-17F和IL-26的主要生产者 | 首次在PPP中发现共表达调节标记(FOXP3, CTLA4, TIGIT)和IL17F/IL26的混合型regTh17细胞群，并揭示其与IL-36G+角质形成细胞的相互作用机制 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；机制研究主要基于转录组数据，需要功能实验进一步证实 | 解析掌跖脓疱病的细胞和空间结构特征，深入了解IL-17通路在该疾病中的作用机制 | 掌跖脓疱病患者和健康人的肢端皮肤组织（包括病变、非病变和健康皮肤） | 单细胞生物学 | 皮肤炎症性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)，空间转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据，空间定位数据 | 未明确具体样本数量，包括病变、非病变和健康肢端皮肤 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 179 | 2025-10-06 |
A cross model spatial and single-cell atlas reveals the conserved involvement of osteopontin in polycystic kidney disease
2025-Sep-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.17.676846
PMID:41000888
|
研究论文 | 通过构建跨模型空间和单细胞图谱，揭示骨桥蛋白在多囊肾病中的保守作用机制 | 首次整合多个PKD小鼠模型的单细胞和空间转录组数据，系统揭示SPP1信号通路在疾病进展中的保守作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 阐明多囊肾病进展的细胞和分子机制 | 多囊肾病小鼠模型 | 数字病理学 | 多囊肾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 多个PKD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 180 | 2025-10-05 |
Lipoxin B4 Mitigates TRPV4-Activated Müller Cell Gliosis During Ocular Hypertension
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.17.673801
PMID:41000836
|
研究论文 | 本研究探讨了脂氧素B4在眼高压条件下通过调节TRPV4通道减轻Müller细胞胶质增生的作用机制 | 首次发现Müller细胞是视网膜中脂氧素B4的重要来源，并揭示了TRPV4激活同时触发胶质增生和保护性脂质信号的双重作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，需要进一步验证在人类青光眼患者中的适用性 | 研究脂氧素B4是否调节TRPV4驱动的Müller胶质细胞激活和炎症反应 | 小鼠Müller胶质细胞、原代和永生化Müller细胞 | 神经科学 | 青光眼 | 流式细胞术、免疫染色、qPCR、western blotting、LC-MS/MS脂质组学、单细胞RNA-seq、免疫组织化学 | 小鼠硅油模型诱导的眼高压模型 | 转录组数据、蛋白质表达数据、脂质代谢物数据 | 小鼠模型和体外培养的Müller细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA测序 | NA | NA |