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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-11-14 |
Accumulation of Lymphoid Progenitors with Defective B Cell Differentiation and of Putative Natural Killer Progenitors in Aging Human Bone Marrow
2025-Oct-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262110467
PMID:41226506
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类骨髓造血干细胞和祖细胞,揭示衰老过程中淋巴祖细胞中B细胞分化缺陷群体和记忆样自然杀伤细胞祖细胞的积累现象 | 首次发现衰老人类骨髓中积累具有B细胞分化缺陷的淋巴祖细胞群体和记忆样NK细胞祖细胞,为人类造血系统衰老提供了新的标志物 | 样本量相对有限(15例),年龄跨度范围可能影响结果的普遍性 | 研究人类骨髓造血干细胞和祖细胞在衰老过程中的变化特征 | 15名健康人类受试者(19-74岁)的骨髓造血干细胞和祖细胞(CD34+) | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序, 功能转录组分析, 发育轨迹研究 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 15例人类骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 162 | 2025-11-14 |
CD5 Expression in CTCL and Its Implications for Anti-CD5 CAR T-Cell Therapy
2025-Oct-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262110411
PMID:41226451
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析蕈样肉芽肿中CD5的表达模式及其对CAR T细胞治疗的启示 | 首次在单细胞水平揭示CD5在蕈样肉芽肿不同病变阶段的动态表达特征 | 样本量有限,需要更多研究阐明临床意义 | 评估CD5作为CAR T细胞治疗靶点在皮肤T细胞淋巴瘤中的潜力 | 蕈样肉芽肿患者皮肤活检组织中的CD4 T细胞 | 单细胞基因组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 21例活检样本(5例斑块期MF,8例肿瘤期MF,8例健康对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 163 | 2025-11-14 |
Emerging Roles of Megakaryocytes in Immune Regulation and Potential Therapeutic Prospects
2025-Oct-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14211677
PMID:41227322
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综述 | 本文综述巨核细胞在免疫调节中的新兴功能及其治疗前景 | 突破传统认知,揭示巨核细胞在免疫调节、造血干细胞生态位调控和组织特异性功能等方面的多元作用 | NA | 探讨巨核细胞在免疫调节和系统稳态中的新兴功能及治疗潜力 | 巨核细胞及其在骨髓和肺等不同组织中的亚群 | NA | 自身免疫疾病、血液系统疾病 | 单细胞转录组学、成像技术、生物反应器平台、异种移植策略 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 164 | 2025-11-14 |
Collection of Human Follicular Fluid, Follicle Somatic Cells, and Immature Oocytes from Individuals Undergoing In Vitro Fertilization
2025-Oct-24, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69122
PMID:41212768
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研究论文 | 本文提出了一种从接受体外受精个体中系统收集和处理卵泡内容物的标准化方案 | 开发了无需酶解剥离的卵丘细胞分离方法,保持转录组完整性;建立了从新鲜卵泡液中制备单细胞悬液用于单细胞RNA测序的逐步方案 | NA | 利用废弃的生殖组织进行人类生育力和生殖生物学的转化研究 | 人类卵巢卵泡内容物,包括卵泡液、卵母细胞、卵丘细胞和体细胞 | 生殖生物学 | 生育障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),体外成熟培养 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 165 | 2025-11-14 |
The Anti-Cancer Potential of Genistein: Single-Cell RNA Sequencing Analysis and Spatial Transcriptome Reveal That Genistein Targets HSD17B1 to Inhibit the Progression of Gastric Adenocarcinoma
2025-Oct-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262110369
PMID:41226409
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析揭示金雀异黄素通过靶向HSD17B1抑制胃腺癌进展的分子机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统解析金雀异黄素在胃腺癌中的'药物-基因-细胞'互作网络 | NA | 探究金雀异黄素在胃腺癌治疗中的分子靶点及作用机制 | 胃腺癌相关基因和细胞 | 生物信息学 | 胃腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接,分子动力学 | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 166 | 2025-11-14 |
Single-Cell Heterogeneity of Epigenetic Factor Regulation Deciphers Alteration of RNA Metabolism During Proliferative SHH-Medulloblastoma
2025-Oct-24, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17213424
PMID:41228218
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析髓母细胞瘤中表观遗传调控因子的表达异质性,揭示其在RNA代谢和肿瘤进展中的作用 | 开发了与RNA代谢相关的表观遗传评分(epi-score),并发现其作为独立不良预后因素;首次在单细胞水平系统分析髓母细胞瘤各分子亚型中表观遗传调控因子的特异性改变 | 研究基于现有数据库和有限样本量,需要进一步实验验证表观遗传调控因子的功能机制 | 探究表观遗传调控在髓母细胞瘤分子异质性和临床预后中的作用机制 | 髓母细胞瘤患者肿瘤组织样本,特别是SHH亚型的恶性细胞 | 单细胞转录组学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,bulk RNA测序数据 | 两个独立RNA测序队列(PBTA和Williamson),具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 167 | 2025-11-14 |
Intratumoral SPP1+BCL2A1+ Tumor-Associated Macrophages Predict Poor Response to PD1 Blockade
2025-Oct-23, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics15212680
PMID:41225975
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现SPP1+BCL2A1+肿瘤相关巨噬细胞是预测肝细胞癌患者PD1阻断治疗反应不良的新型生物标志物 | 首次鉴定出SPP1和BCL2A1双阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群,并证实其与免疫检查点阻断治疗反应不良相关 | 样本量相对较小,需要更大规模的研究验证 | 寻找预测肝细胞癌免疫检查点阻断治疗反应的可靠生物标志物 | 肝细胞癌患者肿瘤组织中的免疫细胞亚群 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 发现队列10例,ICB队列4例,验证队列18例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 168 | 2025-11-14 |
Visceral Peritoneum Hyperpigmentation in Chickens Is Associated with DCT Expression
2025-Oct-23, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15213076
PMID:41227407
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研究论文 | 本研究探讨了鸡内脏腹膜色素沉着过度的遗传机制,发现DCT基因过表达是主要驱动因素 | 首次在单细胞水平解析鸡内脏腹膜色素沉着的细胞机制,并鉴定出DCT基因多态性作为潜在遗传标记 | 研究样本量有限,需要更大规模验证DCT多态性与表型的关联 | 探究鸡内脏腹膜色素沉着过度的成因和调控机制 | 鸡内脏腹膜组织和黑色素细胞 | 生物医学 | 色素沉着异常 | HPLC, bulk RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR, Western blotting, siRNA干扰 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 代谢物数据 | 超过9700个高质量单细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 169 | 2025-11-14 |
Single-Cell RNA-Seq Identifies Immune Remodeling in Lungs of β-Carotene Oxygenase 2 Knockout Mice with Improved Antiviral Response
2025-Oct-23, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu17213329
PMID:41228402
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示β-胡萝卜素加氧酶2敲除小鼠肺部免疫重塑与抗病毒反应增强机制 | 首次发现BCO2缺失通过重塑肺部免疫细胞组成和细胞状态编程增强抗病毒反应 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究BCO2酶在肺部免疫结构和抗病毒反应中的作用机制 | BCO2敲除小鼠和C57BL/6J野生型小鼠的肺部组织 | 单细胞组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,免疫印迹,基因集变异分析 | 小鼠基因敲除模型 | 单细胞转录组数据,蛋白质数据 | BCO2-KO和WT小鼠肺部细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 170 | 2025-11-14 |
CRATER tumor niches facilitate CD8+ T cell engagement and correspond with immunotherapy success
2025-Oct-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.09.021
PMID:41109214
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研究论文 | 本研究通过活体成像和空间转录组学鉴定了一种促进免疫治疗反应的肿瘤微环境结构CRATER | 首次在斑马鱼和人类黑色素瘤中发现CRATER结构,揭示了其作为CD8+T细胞与肿瘤细胞相互作用和免疫治疗响应的关键区域 | 研究主要聚焦于黑色素瘤,其他肿瘤类型中的适用性需要进一步验证 | 探索肿瘤微环境中促进免疫治疗成功的特定结构域 | 斑马鱼内源性黑色素瘤和人类黑色素瘤样本 | 空间转录组学 | 黑色素瘤 | 长期活体成像、高分辨率空间转录组学、多重成像 | NA | 图像、空间转录组数据 | 斑马鱼和人类黑色素瘤样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 171 | 2025-11-14 |
Single-cell clonal lineage tracing identifies the transcriptional program controlling the cell-fate decisions by neoantigen-specific CD8+ T cells
2025-Oct-13, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0203
PMID:41081433
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研究论文 | 通过单细胞克隆谱系追踪揭示新抗原特异性CD8+ T细胞命运决定的转录调控程序 | 首次结合单细胞转录组和T细胞受体谱分析,系统描绘了新抗原特异性CD8+ T细胞在肿瘤和引流淋巴结中的克隆扩增与分化轨迹 | 研究基于小鼠前列腺癌模型,在人类中的直接适用性需要进一步验证 | 揭示新抗原特异性CD8+ T细胞命运决定的转录调控机制及其与临床疗效的关联 | 新抗原特异性CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序,T细胞受体谱分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 172 | 2025-11-14 |
Exploring Sex Differences in Type 2 Diabetes via a Male-Dominant Beta-Cell Cluster from Single-Cell Pancreatic Sequencing of Public Datasets
2025-Oct, Endocrinology and metabolism (Seoul, Korea)
DOI:10.3803/EnM.2025.2297
PMID:40389209
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研究论文 | 通过分析公共单细胞数据集发现男性主导的β细胞簇,揭示2型糖尿病性别差异的分子机制 | 首次在2型糖尿病患者中鉴定出男性主导的β细胞亚群,该亚群具有独特的基因表达模式和细胞通讯特征 | 基于公共数据集进行二次分析,样本来源和数量受原始数据限制 | 探索2型糖尿病性别差异的分子基础 | 2型糖尿病患者的胰腺β细胞 | 单细胞基因组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序,轨迹推断,差异基因表达分析,基因集富集分析,细胞通讯分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 | 来自四个公共数据集的2型糖尿病患者胰腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 173 | 2025-11-14 |
Expression of marker genes to assess the spermatogenic capacity in patients with idiopathic non-obstructive azoospermia
2025-Oct, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03584-5
PMID:40681857
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研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞RNA测序的定量方法,用于评估特发性非梗阻性无精子症患者的睾丸生精能力 | 利用单细胞RNA测序技术开发了生精能力评分系统,并鉴定了与生精潜能相关的关键基因标记物 | 样本量相对较小(18名iNOA患者),需要在更大群体中进一步验证 | 开发评估特发性非梗阻性无精子症患者睾丸生精能力的可靠定量方法 | 特发性非梗阻性无精子症患者 | 单细胞测序分析 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 模糊聚类, 基因表达趋势分析 | 单细胞基因表达数据 | 18名iNOA患者,近4000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 174 | 2025-11-14 |
Comprehensive Analysis of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Identified TIMP1 as a Prognostic Marker in Colorectal Cancer
2025-Oct, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2025.25.e38
PMID:41220845
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,开发了结直肠癌预后模型并鉴定TIMP1作为预后生物标志物 | 首次整合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据构建结直肠癌免疫预后模型,并实验验证TIMP1的生物学功能 | 未明确说明样本量大小和具体数据来源 | 解析结直肠癌肿瘤微环境的免疫异质性并开发预后预测模型 | 结直肠癌患者和RKO细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,差异表达分析,功能富集分析,随机森林分析,LASSO回归 | 随机森林,LASSO | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 175 | 2025-11-14 |
Hepatocyte-Specific MET Deletion Exacerbates Acetaminophen-Induced Hepatotoxicity in Mice
2025-Sep-30, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.09.010
PMID:41038273
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研究论文 | 本研究通过肝细胞特异性MET基因敲除小鼠模型,揭示了MET在乙酰氨基酚诱导肝损伤中的保护作用机制 | 首次阐明MET在乙酰氨基酚肝损伤模型中的具体作用机制,发现MET通过抑制JNK线粒体转位和细胞死亡信号通路减轻肝毒性 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性仍需进一步验证 | 明确MET在乙酰氨基酚诱导肝损伤中的具体作用机制 | 肝细胞特异性MET基因敲除小鼠和乙酰氨基酚肝损伤模型 | 分子病理学 | 药物性肝损伤 | RNA测序,免疫印迹,单核RNA测序,空间转录组学 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 基因敲除小鼠模型及人类急性肝衰竭患者数据 | NA | RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 176 | 2025-11-14 |
Precision and Accuracy in Quantitative Measurement of Gene Expression from Single-cell/nucleus RNA Sequencing Data
2025-Sep-22, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf077
PMID:40857558
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研究论文 | 系统评估单细胞/单核RNA测序数据中基因表达定量测量的精确度和准确性 | 首次系统评估23个sc/snRNA-seq数据集的定量精度,建立数据驱动的实验设计阈值,开发VICE工具评估数据质量 | 研究主要基于单核吞噬细胞数据,可能不适用于所有细胞类型 | 提高单细胞/单核RNA测序研究的可靠性和可重复性 | 单核吞噬细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3,682,576个细胞来自339个样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 177 | 2025-11-14 |
Tick Extracellular Vesicles Alter Epidermal Keratinocyte Function
2025-Sep-05, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.037
PMID:40915408
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研究论文 | 本研究揭示蜱类通过细胞外囊泡改变表皮角质形成细胞功能,破坏皮肤伤口愈合机制以维持吸血行为的策略 | 首次发现蜱类通过细胞外囊泡调控宿主伤口愈合通路的新机制,涉及PI3K活性、角质形成细胞GF1和TGF-β水平的改变 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,在人类系统中的适用性需要进一步验证 | 探索吸血节肢动物如何通过细胞外囊泡调控宿主伤口愈合机制以维持吸血生存 | 三种医学相关蜱种(包括肩板硬蜱)及其与宿主表皮角质形成细胞的相互作用 | 分子生物学 | 节肢动物传播疾病 | 单细胞RNA测序, 小鼠遗传学, 体外划痕实验 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | 野生型动物模型和体外角质形成细胞培养 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 178 | 2025-11-14 |
Squidiff: Predicting cellular development and responses to perturbations using a diffusion model
2025-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.16.623974
PMID:40909548
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研究论文 | 提出基于扩散模型的生成框架Squidiff,用于预测细胞在不同环境变化下的转录组变化 | 首次将扩散模型应用于预测细胞转录组变化,能够学习瞬态细胞状态并预测高分辨率转录组景观 | NA | 预测细胞在环境变化下的转录组变化,促进精准医学发展 | 细胞分化、基因扰动、药物反应、血管类器官发育、中子辐射和生长因子反应 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 扩散模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 179 | 2025-11-14 |
CD38+ Endothelial Remodeling Defines Spatially Diverse Vasculopathy Programs in Rapidly Advancing Oral Inflammation
2025-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.29.667333
PMID:40766487
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间蛋白质组学揭示了快速进展性口腔炎症中CD38+内皮细胞重塑的空间特异性血管病变模式 | 首次发现CD38+内皮细胞在快速进展性口腔炎症中的空间特异性重塑模式,并开发了三重空间分析方法 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 揭示快速进展性口腔炎症的细胞机制和空间结构特征 | 种植体周围炎和重度牙周炎患者的口腔组织样本 | 单细胞生物学 | 口腔炎症疾病 | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学, 激光捕获显微切割, 微生物组分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间蛋白质组数据, 微生物组数据 | 总计59个样本,包括36个scRNA-seq样本(121,395个细胞),15个空间蛋白质组学样本(337,260个细胞),8个黏膜活检样本(225,137个细胞) | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 180 | 2025-11-14 |
Epiblast-derived CX3CR1+ progenitors generate cardiovascular cells during cardiogenesis
2025-Aug, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00488-z
PMID:40551012
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研究论文 | 本研究揭示了胚胎CX3CR1+细胞作为多能性上胚层来源祖细胞群,在心脏发育过程中生成心肌细胞、内皮细胞和巨噬细胞 | 首次发现CX3CR1+细胞起源于上胚层,并在心脏发育过程中通过新生分化和细胞融合两种机制生成心血管细胞 | 研究主要基于小鼠模型,人类中的类似机制尚未验证 | 探究CX3CR1+细胞在心脏发育过程中的起源和命运 | 小鼠胚胎和成年小鼠心脏中的CX3CR1+细胞及其谱系细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 遗传谱系追踪、单细胞RNA测序、体外分化实验 | NA | 基因表达数据、细胞谱系数据 | 小鼠胚胎发育不同阶段(E6.5-E9.5)及成年小鼠心脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |