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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-29 |
Tissue and cellular spatiotemporal dynamics in colon aging
2025-Oct-22, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02830-6
PMID:41125832
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研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞RNA测序构建结肠衰老的细胞和空间图谱 | 开发了cSplotch计算框架,利用组织学特征在组织样本和数据模态间共享信息,学习与年龄、组织区域和性别相关的空间解析细胞表达层次贝叶斯模型 | 研究仅限于小鼠模型,人类结肠衰老的适用性需要进一步验证 | 研究结肠组织结构和分子回路在衰老过程中的时空动态变化 | 小鼠结肠组织 | 空间转录组学 | 衰老相关疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 层次贝叶斯模型 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 约1,500个小鼠肠道组织, 约400,000个单核RNA测序图谱 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 162 | 2025-10-29 |
Multiomics data reveal microglia's promotion for choroidal neovascularization in endothelial cells
2025-Oct-22, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110701
PMID:41130334
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析揭示了小胶质细胞通过CSRP2基因促进脉络膜新生血管形成的机制 | 首次发现CSRP2在小胶质细胞和内皮细胞中显著上调,并证实其通过VEGF和TGF-β信号通路介导细胞间通讯 | 研究主要基于公共数据库数据,部分发现仍需进一步实验验证 | 阐明脉络膜新生血管形成的细胞类型和分子机制,探索潜在治疗靶点 | 年龄相关性黄斑变性患者的视网膜组织、RPE/脉络膜复合体和血液样本 | 生物信息学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序,差异基因表达分析,免疫浸润分析,基因集富集分析 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 湿性AMD患者和健康对照的组织和血液样本(来自GEO数据库) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 163 | 2025-10-29 |
Identification of a distinctive gene signature associated with disease activity in granulomatous myositis
2025-Oct-22, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf543
PMID:41132132
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了肉芽肿性肌炎的独特基因特征及其与疾病活动的相关性 | 首次在肉芽肿性肌炎中鉴定出包含1293个上调基因和256个下调基因的特定基因特征,并发现CHIT1是与疾病严重程度最显著相关的上调基因 | 样本量相对有限(38例GM患者),需要更大规模的研究验证结果 | 阐明肉芽肿性肌炎的病理生理机制 | 肌肉活检样本(包括GM患者、其他肌病患者和健康对照) | 数字病理学 | 肉芽肿性肌炎 | RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学 | 支持向量机 | RNA序列数据,空间转录组数据,图像数据 | 722例肌肉活检(含38例GM患者) | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 164 | 2025-10-29 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Accumulation of Fcgr2b + Virtual Memory-Like CD8 T Cells With Cytotoxic and Inflammatory Potential in Aged Mouse White Adipose Tissue
2025-Oct-21, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70278
PMID:41116748
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定老年小鼠白色脂肪组织中具有细胞毒性和炎症潜能的Fcgr2b+虚拟记忆样CD8 T细胞的积累 | 首次发现生理性衰老(而非高脂饮食诱导的肥胖)与特定表型的Fcgr2b+CD49d-虚拟记忆样CD8 T细胞在脂肪组织中的积累相关,并揭示其表达颗粒酶M的细胞毒性和促炎特性 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类组织中验证;样本规模相对有限 | 比较生理性衰老和高脂饮食诱导的肥胖对脂肪组织免疫细胞组成的差异影响 | 年轻和老年小鼠的性腺白色脂肪组织基质血管组分中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,功能分析 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 年轻正常饮食小鼠、年轻高脂饮食小鼠和老年正常饮食小鼠的性腺白色脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 165 | 2025-10-29 |
Bioinformatics Analysis and Experimental Validation of Disulphidptosis in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Oct-16, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103955
PMID:41106220
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证研究二硫死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌中的表达及其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 首次系统研究二硫死亡相关基因在口腔鳞癌中的表达模式,发现INF2和DSTN等15个关键基因的表达与患者生存和免疫细胞浸润相关 | 需要进一步的实验室验证和临床试验来探索INF2和DSTN的治疗靶向性及其对免疫微环境的影响 | 研究二硫死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌中的表达水平并评估其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 口腔鳞状细胞癌样本和二硫死亡相关基因 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA测序, 实时PCR, 单细胞RNA测序, 功能富集分析, 生存分析, 免疫细胞浸润分析 | 接收者操作特征分析 | RNA测序数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 166 | 2025-10-29 |
Integrating multi-modal omics to identify therapeutic atherosclerosis pathways for coronary heart disease
2025-Oct-15, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105966
PMID:41101252
|
研究论文 | 通过整合尿液代谢产物、血浆蛋白、动脉粥样斑块组织和单细胞表达数据,识别冠状动脉心脏病的可靶向代谢通路 | 首次将多组学数据(尿液代谢产物、血浆蛋白、斑块组织和单细胞测序)整合应用于冠状动脉心脏病治疗靶点发现 | 研究主要基于欧洲人群数据,可能限制结果的普适性 | 识别冠状动脉心脏病的可靶向代谢通路和治疗靶点 | 尿液代谢产物、血浆蛋白、动脉粥样斑块组织、单细胞表达数据 | 计算医学 | 冠状动脉心脏病 | 孟德尔随机化, 全基因组关联研究, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据, 单细胞表达数据 | 181,522例冠状动脉心脏病病例,954种尿液代谢产物,1,562种独特蛋白 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 167 | 2025-10-29 |
Cell Subtype-specific Analysis of Neuronal Membrane Proteasome in Somatosensory Neurons
2025-Oct-10, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69061
PMID:41144432
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和细胞分选技术揭示了神经元膜蛋白酶体在特定感觉神经元亚型中的表达及其在痛觉调节中的关键作用 | 首次在特定外周体感神经元亚群中发现并表征了神经元膜蛋白酶体(NMP),证明其选择性抑制可降低机械和疼痛敏感性而不引起神经病变 | 研究主要基于小鼠模型,在体实验仅限于爪部皮肤,人类相关性尚需进一步验证 | 探究神经元膜蛋白酶体在体感神经元中的细胞亚型特异性表达及其在感觉信号传导中的功能 | 小鼠体感神经元,特别是MrgprA3和Cysltr2神经元亚群 | 神经科学 | 疼痛疾病 | 单细胞RNA测序,荧光激活细胞分选,抗体标记 | NA | 单细胞转录组数据,细胞分选数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 168 | 2025-10-29 |
Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female
2025-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.12.623125
PMID:39605504
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示疟原虫在按蚊中肠内的发育阶段转换和寄生虫-蚊子相互作用机制 | 首次应用单细胞RNA测序分析疟原虫和蚊子细胞在不同发育阶段和代谢条件下的相互作用,发现SIP2转录因子对子孢子感染人类肝细胞的关键作用 | 研究中涉及的部分生物学过程机制仍需进一步验证 | 研究疟原虫在按蚊体内的发育转换过程和寄生虫-宿主相互作用机制 | 疟原虫和按蚊中肠细胞 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序, 共聚焦显微镜, 共享条形码分析 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 多个发育阶段的寄生虫和蚊子细胞,包括野外来源的寄生虫 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 169 | 2025-10-29 |
Identification of a PRDM1-regulated T cell network to regulate atherosclerotic plaque inflammation
2025-Oct-02, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01541-6
PMID:41039608
|
研究论文 | 本研究通过网络分析方法识别了调控动脉粥样硬化斑块炎症的PRDM1调节T细胞网络 | 首次采用加权基因共表达网络分析和贝叶斯网络推断相结合的方法,识别了区分高低风险斑块的PRDM1调控T细胞网络 | 样本量相对有限(人类斑块样本n=43),且PRDM1靶向药物尚未开发 | 探索人类动脉粥样硬化斑块从低风险向高风险转变过程中的免疫基因调控机制 | 人类颈动脉斑块(稳定型和不稳定型)和Ldlr基因敲除小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 贝叶斯网络推断, 单细胞RNA测序, 计算机药物重定位 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 人类颈动脉斑块样本43例(稳定型16例,不稳定型27例),Ldlr基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 170 | 2025-10-29 |
Targeting Intratumoral Copper Inhibits Tumor Progression via p62-Mediated EZH2 Degradation and Potentiates Anti-PD-1 Immunotherapy in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417795
PMID:40719074
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研究论文 | 本研究揭示了铜通过p62介导的EZH2降解在口腔鳞癌中的作用机制,并证明铜螯合剂联合抗PD-1治疗的疗效 | 首次发现铜通过抑制SMURF2与铜结合促进p62介导的EZH2泛素化和自噬降解,并证实铜螯合剂可增强抗PD-1免疫治疗效果 | NA | 探究铜在口腔鳞癌进展中的作用机制及治疗潜力 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC) | 癌症研究 | 口腔鳞癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组化染色 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 171 | 2025-10-29 |
Mesencephalic Astrocyte-Derived Neurotrophic Factor Binds BAX to Preserve Mitochondrial Homeostasis and Energy Metabolism for Relieving Myocardial Hypertrophy
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502835
PMID:40739335
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研究论文 | 本研究探讨中脑星形胶质细胞源性神经营养因子(MANF)通过结合BAX蛋白维持线粒体稳态和能量代谢来缓解心肌肥厚的机制 | 首次发现MANF通过与促凋亡蛋白BAX相互作用抑制其线粒体转位,从而维持线粒体稳态和能量代谢平衡 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究MANF在心肌肥厚中的作用机制 | 心肌细胞特异性MANF基因敲除小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 心肌肥厚 | 单细胞RNA测序,代谢组学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,代谢数据 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 172 | 2025-10-29 |
Single-Cell Transcriptomics Shows Cellular Heterogeneity, Intercellular Communication, and Extracellular Matrix Remodeling in Corneal Fibrosis In Vivo
2025-Oct-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.13.48
PMID:41147949
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究兔角膜纤维化过程中的细胞异质性、细胞间通讯和细胞外基质重塑 | 首次在体内建立角膜纤维化的整合转录组框架,揭示基质细胞异质性、细胞间信号传导和ECM重塑轨迹 | 研究仅使用新西兰白兔模型,未涉及人类样本 | 表征角膜纤维化过程中的成纤维细胞异质性、细胞轨迹、细胞间通讯和细胞外基质蛋白重塑 | 新西兰白兔的正常和碱损伤纤维化角膜 | 单细胞转录组学 | 角膜纤维化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 无监督聚类、轨迹推断、CellChat细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 新西兰白兔的正常和碱损伤角膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 173 | 2025-10-29 |
Neoplastic immune mimicry potentiates breast tumor progression
2025-Sep-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633673
PMID:39896558
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研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌细胞通过表达白细胞表面受体蛋白进行免疫拟态,从而促进肿瘤进展的新机制 | 首次发现乳腺癌细胞能够表达典型白细胞表面受体蛋白,并将此细胞程序命名为“免疫拟态” | 需要在更多乳腺癌队列中验证其预后价值,并评估与远端转移、生存率和治疗反应的相关性 | 探究乳腺癌细胞免疫拟态现象及其在肿瘤进展中的作用 | 人类乳腺癌单细胞RNA-seq数据集、组织病理标本、乳腺癌细胞系、小鼠转基因和细胞系来源的乳腺肿瘤模型 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据、组织病理图像 | 公共人类乳腺癌单细胞RNA-seq数据集、乳腺癌细胞系、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 174 | 2025-10-29 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Granzyme K+ CD8+ T Cells as a Target for Mitigating Plaque Instability Following Radiation
2025-Sep-16, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.040632
PMID:40913272
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了颗粒酶K+ CD8+ T细胞在放疗后斑块不稳定性中的关键作用 | 首次发现颗粒酶K+ CD8+ T细胞亚群在放疗诱导的动脉粥样硬化病变进展中的致病功能,并确定GZMB作为放射性心血管损伤的介质 | 研究基于动物模型(兔和小鼠),结果需要在人体中进一步验证 | 探究放疗诱导斑块不稳定性的机制及影像学特征变化 | 兔颈动脉斑块模型和ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化病变 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,光学相干断层扫描-血管内超声双模成像,生物信息学分析,病理染色,流式细胞术,基因敲除,抗体清除 | NA | 单细胞转录组数据,影像数据 | 兔模型和小鼠模型(ApoE-/-小鼠在未照射、早期照射和晚期照射三个阶段) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 175 | 2025-10-29 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals Dynamic Cell Populations and Immune Infiltration in Moyamoya Disease
2025-Sep-16, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.041168
PMID:40913267
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了烟雾病病理动脉中的细胞组成和免疫浸润动态 | 首次构建烟雾病浅表颞动脉的单细胞转录组图谱,发现自然杀伤T细胞在促进血管细胞增殖和迁移中的关键作用 | 样本量较小(2例患者和3例对照),仅使用浅表颞动脉样本 | 全面绘制烟雾病病理动脉的细胞组成和分子改变 | 烟雾病患者和健康对照者的浅表颞动脉样本 | 单细胞生物学 | 烟雾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5个样本(2例患者,3例对照),共26,371个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 176 | 2025-10-29 |
Single-Cell Transcriptomics of Human Pericarotid Lymph Nodes Indicating Stability of Carotid Atherosclerotic Plaques
2025-Sep-16, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.039777
PMID:40932121
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析探索颈动脉周围淋巴结与动脉粥样硬化斑块稳定性之间的关系 | 首次在单细胞水平揭示颈动脉周围淋巴结与动脉粥样硬化斑块稳定性的关联,并发现淋巴结肿大可作为斑块不稳定的潜在生物标志物 | 样本仅来自严重颈动脉狭窄患者,结果可能不适用于早期或轻度病例 | 研究淋巴结功能与动脉粥样硬化的关系,特别关注斑块稳定性 | 106例接受颈动脉内膜切除术的严重颈内动脉狭窄患者及其颈动脉周围淋巴结 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序,T/B细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 106例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 177 | 2025-10-29 |
Identification of shared pathogenetic mechanisms between endometriosis and RSA based on comprehensive bioinformatics analysis
2025-Sep, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03596-1
PMID:40705269
|
研究论文 | 通过生物信息学分析识别子宫内膜异位症和复发性流产之间的共享分子机制和关键基因 | 首次发现FXYD1作为连接子宫内膜异位症和复发性流产的关键枢纽基因,并通过单细胞RNA测序验证其在两种疾病中的表达模式 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证功能机制 | 探索子宫内膜异位症和复发性流产之间的共享分子机制 | 子宫内膜异位症和复发性流产患者样本 | 生物信息学 | 妇科疾病 | 生物信息学分析,单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析 | ROC分析,WGCNA | 基因表达数据 | 来自GSE7305和GSE165004数据集 | NA | 单细胞RNA测序,基因表达谱分析 | NA | NA |
| 178 | 2025-10-29 |
Identification of m5C-related genes and subclusters in recurrent pregnancy loss
2025-Sep, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03580-9
PMID:40751792
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法识别复发性流产中m5C相关基因并分析其与免疫细胞的关联 | 首次将复发性流产患者分为两个亚群并分析其免疫微环境差异,开发了高精度的诊断模型 | 样本量较小(48例子宫内膜组织样本),需要进一步实验验证 | 阐明m5C相关基因与复发性流产发病机制的关系 | 复发性流产患者的子宫内膜组织样本 | 生物信息学 | 复发性流产 | 机器学习,单细胞RNA测序,基因集富集分析 | 多种机器学习方法 | 基因表达数据 | 48例子宫内膜组织样本(24例RPL样本进一步分为两个亚群) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 179 | 2025-10-29 |
Cancer stem cells: landscape, challenges and emerging therapeutic innovations
2025-Aug-05, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02360-2
PMID:40759634
|
综述 | 本文综述了癌症干细胞(CSCs)的特性、挑战及新兴治疗策略 | 整合单细胞测序、空间转录组学和多组学数据揭示CSCs异质性和代谢可塑性,提出双代谢抑制、合成生物学干预等创新疗法 | 缺乏普遍可靠的CSCs生物标志物,难以在不影响正常干细胞的前提下靶向CSCs | 探讨癌症干细胞生物学特性及开发靶向治疗策略 | 癌症干细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞测序, 空间转录组学, 多组学整合, 3D类器官模型, CRISPR筛选, AI驱动分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 180 | 2025-10-29 |
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.657506
PMID:40766395
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术解码HepaRG细胞在化学暴露下的应激状态 | 应用TempO-LINC平台系统分析多种化学物质诱导的细胞应激反应,揭示细胞亚群在应激状态下的异质性响应 | 研究仅针对HepaRG细胞系,未验证其他细胞类型;仅观察24小时暴露效果,缺乏更长时程的动态分析 | 解码细胞在毒理学相关化学暴露下的应激状态 | HepaRG肝细胞系 | 单细胞组学 | 毒理学 | 单细胞转录组测序 | 广义Jaccard度量聚类 | 单细胞转录组数据 | 约40,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | TempO-LINC | TempO-LINC单细胞转录组平台 |