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当前共找到 38417 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-04-15 |
A murine model of sepsis induces age- and sex-specific chromatin remodeling in myeloid-derived suppressor cells
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1750174
PMID:41953016
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研究论文 | 本研究利用小鼠脓毒症模型，通过单分子表观遗传分析技术探究了骨髓源性抑制细胞中年龄和性别特异性的染色质重塑机制 | 首次结合MAPit-FENGC单分子分析（同时检测DNA甲基化和染色质可及性）与单细胞RNA测序，在年轻和年老、雄性和雌性小鼠中系统绘制了脓毒症后MDSCs的高分辨率表观遗传图谱 | 研究局限于小鼠模型，结果需在人类样本中验证；仅聚焦脾脏CD11b+Gr1+细胞，未涵盖其他免疫细胞或组织 | 阐明脓毒症幸存者长期免疫功能障碍的表观遗传机制，特别是年龄和性别对骨髓源性抑制细胞染色质状态的影响 | 小鼠脾脏中的骨髓源性抑制细胞（MDSCs） | 表观遗传学 | 脓毒症 | MAPit-FENGC（单分子DNA甲基化与染色质可及性分析）、单细胞RNA测序 | NA | 表观遗传数据、转录组数据 | 年轻和年老成年雄性与雌性小鼠的脾脏MDSCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 162 | 2026-04-15 |
Gain-of-function PPM1D mutations attenuate ischemic stroke
2025-Nov, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-025-01523-6
PMID:40399534
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研究论文 | 本文通过全基因组测序发现PPM1D基因的功能获得性突变可减轻缺血性脑卒中损伤，并揭示了其通过PPARα通路影响内皮细胞脂肪酸代谢的机制，同时鉴定出小分子稳定剂T2755作为潜在疗法 | 首次在缺血性脑卒中患者中鉴定出PPM1D基因的功能获得性突变具有保护作用，并发现小分子化合物T2755可通过稳定PPM1D蛋白减轻脑损伤 | 研究样本中PPM1D突变携带者仅8例，样本量较小；机制研究主要基于小鼠模型，在人类中的直接验证有限 | 探究PPM1D基因在缺血性脑卒中中的作用机制并寻找潜在治疗策略 | 缺血性脑卒中患者（人类）和Ppm1d基因缺陷小鼠（动物模型） | 基因组学与分子机制研究 | 缺血性脑卒中 | 全基因组测序，空间转录组学，蛋白质组学分析 | NA | 基因组测序数据，转录组数据，蛋白质组数据 | 10,241名缺血性脑卒中患者（其中8例携带PPM1D突变）及Ppm1d缺陷小鼠模型 | NA | 全基因组测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 163 | 2026-04-15 |
Mechanical confinement governs phenotypic plasticity in melanoma
2025-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09445-6
PMID:40866703
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研究论文 | 本研究通过斑马鱼模型和人类样本，揭示了机械限制通过染色质重塑介导黑色素瘤细胞表型可塑性转换的机制 | 首次证明机械限制通过HMGB2蛋白介导的染色质重塑驱动黑色素瘤细胞在增殖与侵袭状态间的可逆转换 | 研究主要基于斑马鱼模型，人类样本验证相对有限，且机械限制的具体物理参数尚未完全量化 | 探究黑色素瘤细胞表型可塑性转换的外部触发机制 | 黑色素瘤细胞（斑马鱼模型及人类样本） | 癌症生物学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、单细胞转录组学、形态学分析、定量建模 | NA | 转录组数据、形态学图像 | 斑马鱼黑色素瘤模型及人类肿瘤样本（具体数量未明确） | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 164 | 2026-04-15 |
Amoeboid-Mesenchymal Transition and the Proteolytic Control of Cancer Invasion Plasticity
2025-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.24.684403
PMID:41278919
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研究论文 | 本文研究了癌症细胞在侵袭过程中通过阿米巴-间质转化和蛋白水解控制来调节侵袭可塑性的机制 | 意外发现阿米巴型和间质型侵袭程序均涉及通过ECM屏障的主动隧道形成和基质降解金属蛋白酶的表达，并强调MMP14在维持核完整性和支持侵袭活性中的关键作用 | 研究主要基于癌症球体-3D基质模型、单细胞RNA测序和人组织外植体，可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究控制间质与阿米巴侵袭的机制，特别是MMP14在癌症侵袭可塑性中的角色 | 癌症细胞，包括在3D基质模型和人乳腺癌组织外植体中的侵袭行为 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，免疫组织化学分析，CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 基因表达数据，组织图像 | 未明确指定样本数量，但涉及癌症球体模型和人组织外植体 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 165 | 2026-04-15 |
Sepsis Induces Age- and Sex-Specific Chromatin Remodeling in Myeloid-Derived Suppressor Cells
2025-Oct-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.26.656229
PMID:41279791
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研究论文 | 本研究利用单分子检测技术MAPit-FENGC，结合单细胞RNA测序，揭示了脓毒症后骨髓源性抑制细胞中年龄和性别特异性的染色质重塑机制 | 首次应用MAPit-FENGC技术同时分析DNA甲基化和染色质可及性，在临床相关小鼠模型中系统揭示了脓毒症诱导的年龄和性别特异性表观遗传重编程 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证；样本量相对有限，可能影响统计效力 | 探究脓毒症幸存者长期免疫功能障碍的表观遗传机制，特别是骨髓源性抑制细胞在年龄和性别特异性免疫失调中的作用 | 年轻和老年成年雄性和雌性小鼠的脾脏骨髓源性抑制细胞 | 表观遗传学 | 脓毒症 | MAPit-FENGC, 单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | 表观遗传数据, 转录组数据 | 年轻和老年成年雄性和雌性小鼠的脾脏MDSCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 166 | 2026-04-15 |
RESCUE: recovery of idiosyncratic expression patterns in spatial transcriptomics
2025-Aug-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.11.669542
PMID:40832184
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RESCUE的计算方法，用于恢复空间转录组学数据中被现有分析方法遗漏的独特表达模式 | RESCUE能够捕获脆弱或代表性不足的细胞类型、亚细胞结构（如神经突）和细胞外表达等现有方法可能忽略的重要表达模式 | NA | 开发一种计算方法来改善空间转录组学数据分析的完整性和准确性 | 空间转录组学数据，特别是来自蜜蜂大脑的MERFISH数据及其他ST数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，MERFISH | NA | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学，MERFISH | NA | NA |
| 167 | 2026-04-15 |
GatorST: A Versatile Contrastive Meta-Learning Framework for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2025-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.01.662625
PMID:40672304
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研究论文 | 本文提出了一种名为GatorST的新型通用对比元学习框架，用于分析空间转录组数据，旨在通过整合空间拓扑和全局基因表达信息来改善下游任务性能 | GatorST通过结合基于图的建模、伪标签生成和对比元学习，首次在空间转录组分析中同时捕捉局部（邻域级）和全局（组织范围）的空间上下文，并采用元学习启发的片段式训练策略以增强模型对新空间环境的泛化能力 | 未在摘要中明确说明 | 开发一个能够有效整合空间信息与转录组数据、并提升多种下游任务性能的通用空间转录组数据分析框架 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 基于图的模型，对比学习，元学习 | 空间转录组数据（基因表达谱与空间坐标） | 14个空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 168 | 2026-04-15 |
Experimental and Computational Methods for Allelic Imbalance Analysis from Single-Nucleus RNA-seq Data
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.13.607784
PMID:39185246
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研究论文 | 本文探讨了实验和计算方法如何改进单细胞RNA测序数据中的等位基因失衡分析 | 开发了新的计算工具套件，专注于利用单核RNA测序中的内含子区域读取来增强等位基因特异性表达分析，并比较了等位基因失衡分析与eQTL分析在识别SNP/基因对方面的效能 | 未明确说明样本的具体来源或实验设计的潜在偏差 | 改进单细胞RNA测序数据中的等位基因失衡分析方法 | 单细胞RNA测序和单核RNA测序数据，特别是来自帕金森病队列的样本 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序，单核RNA测序，等位基因特异性表达分析 | NA | RNA测序数据 | 94名个体的帕金森病队列 | NA | 单细胞RNA-seq，单核RNA-seq | NA | NA |
| 169 | 2026-04-15 |
Score matching for differential abundance testing of compositional high-throughput sequencing data
2024-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.05.627006
PMID:39713439
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研究论文 | 本文提出了一种名为cosmoDA的新型差异丰度测试方案，用于处理具有相关特征的组成型高通量测序数据 | 扩展了a-b幂交互模型以纳入协变量信息，并结合广义得分匹配估计框架，显著降低了相关特征导致的假阳性检测 | 未明确说明模型对极端稀疏数据或大规模特征交互的适用性限制 | 开发能够准确估计群体异质性下特征交互并降低假发现率的差异丰度测试方法 | 稀疏组成型计数数据，特别是单细胞RNA测序和扩增子测序数据 | 生物信息学 | NA | 高通量测序，单细胞RNA-seq，扩增子测序 | a-b幂交互模型，广义得分匹配估计 | 组成型计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 170 | 2026-04-15 |
Widespread transposable element dysregulation in human aging brains with Alzheimer's disease
2024-11, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14164
PMID:39356058
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研究论文 | 本研究通过大规模测序数据和CRISPRi实验，揭示了人类阿尔茨海默病衰老大脑中广泛存在的转座子失调及其与神经炎症的关联 | 首次在人类阿尔茨海默病衰老大脑中系统表征了转座子表达数量性状位点，并通过CRISPRi实验验证了特定转座子对C1QTNF4基因表达的神经元特异性抑制作用 | 研究主要基于三个脑库的数据，样本代表性可能有限，且CRISPRi实验仅在iPSC衍生神经元中进行，未涵盖其他脑细胞类型 | 探究人类阿尔茨海默病衰老大脑中转座子失调的遗传调控机制及其在疾病中的作用 | 人类阿尔茨海默病患者的衰老脑组织样本及iPSC衍生神经元 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序、全基因组测序、CRISPR干扰 | 数量性状位点分析 | 基因组数据、转录组数据 | 基于三个人类AD脑库的大规模样本 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、全基因组测序 | NA | NA |
| 171 | 2026-04-15 |
A scalable approach to topic modelling in single-cell data by approximate pseudobulk projection
2024-10, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402713
PMID:39107066
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研究论文 | 本文提出了一种名为ASAP的可扩展近似方法，用于单细胞RNA-seq数据中的主题建模，通过近似伪批量投影提高计算效率 | ASAP方法在单细胞RNA-seq数据分析中实现了比现有方法更准确且计算时间和内存消耗大幅降低的可扩展近似主题建模 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种可扩展的近似方法，用于单细胞数据中的主题建模，以降低计算资源需求 | 单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 概率主题模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 172 | 2026-04-15 |
TRPC3 suppression ameliorates synaptic dysfunctions and memory deficits in Alzheimer's disease
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.16.611061
PMID:39345364
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研究论文 | 本研究通过抑制TRPC3通道，改善了阿尔茨海默病模型中的突触功能障碍和记忆缺陷 | 首次发现TRPC3在AD患者和模型中的上调，并鉴定出抑制剂JW-65能通过恢复钙信号通路发挥神经保护作用 | 研究主要基于动物和细胞模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探究TRPC3通道在阿尔茨海默病神经退行性变中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | AD患者脑组织、AD小鼠模型（急性和慢性）以及培养的大鼠海马神经元 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq、生物信息学分析、RNA-seq | NA | RNA-seq数据、细胞和动物模型数据 | AD患者队列的已发表单细胞RNA-seq数据、死后AD脑组织、急性和慢性AD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 173 | 2026-04-15 |
Lin-CD117+CD34+FcεRI+ progenitor cells are increased in chronic spontaneous urticaria and predict clinical responsiveness to anti-IgE therapy
2024-09, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16127
PMID:38634175
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研究论文 | 本研究探讨了慢性自发性荨麻疹患者外周血中Lin-CD117+CD34+FcεRI+祖细胞的增加及其对抗IgE疗法临床反应性的预测价值 | 首次将外周血中特定的祖细胞亚群（Lin-CD34+CD117+FcεRI+）与CSU的临床表型及抗IgE治疗反应相关联，并利用单细胞RNA测序揭示了其细胞谱系组成 | 样本量相对有限（CSU患者n=55，对照组n=22），单细胞RNA测序仅在部分患者（n=8）和对照（n=4）中进行，需要更大规模的研究验证 | 探究慢性自发性荨麻疹的病理机制，并寻找预测抗IgE治疗（奥马珠单抗）临床反应性的生物标志物 | 慢性自发性荨麻疹患者（n=55，其中12人接受奥马珠单抗治疗）和健康对照（n=22）的外周血样本 | 免疫学，皮肤病学 | 慢性自发性荨麻疹 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据，单细胞转录组数据 | CSU患者55例（其中12例接受奥马珠单抗），健康对照22例；scRNA-Seq子集：CSU患者8例，健康对照4例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 174 | 2026-04-15 |
Hepatic organoids move from adolescence to maturity
2024-06, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15893
PMID:38451053
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综述 | 本文回顾了肝类器官作为研究工具的发展历程，并探讨了其在肝脏基础研究、药物发现与安全性测试以及疾病病理生物学理解三个领域的贡献 | 系统性地阐述了肝类器官从“青春期”向“成熟期”发展的关键路径，并前瞻性地指出了未来五年内单细胞RNA测序、CRISPR技术与类器官方法学改进相结合将带来的突破 | 未提供具体的实验数据或案例研究，主要基于现有文献和发展趋势进行评述 | 评估肝类器官作为研究工具的当前应用与未来潜力，推动其在肝脏疾病研究和治疗中的应用 | 肝类器官及其在肝脏研究中的应用 | 组织工程与疾病模型 | 肝脏疾病（包括肝纤维化） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR技术、类器官培养技术 | 类器官模型 | 综述性文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 175 | 2026-04-15 |
Thrombospondin 2 is a key determinant of fibrogenesis in non-alcoholic fatty liver disease
2024-02, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15792
PMID:38010940
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研究论文 | 本研究通过分析NAFLD患者的单细胞RNA测序数据、肝组织样本和LX-2细胞，揭示了THBS2/TSP2在肝星状细胞中的高表达及其通过TGFβ通路调控纤维化的机制 | 首次在NAFLD中通过单细胞RNA测序和原位杂交技术，明确了THBS2/TSP2在肝星状细胞中的特异性高表达，并发现其通过非经典TGFβ-SMAD2/3通路调控胶原生成 | 研究主要基于体外细胞模型（LX-2细胞）和基因数据集分析，缺乏体内实验验证；样本量未明确说明，可能影响结果的普适性 | 识别NAFLD中表达THBS2/TSP2的特定细胞，并探究其上调的分子机制 | 非酒精性脂肪肝病（NAFLD）患者肝组织、肝星状细胞（HSCs）及LX-2细胞系 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、定量聚合酶链反应（qPCR）、原位杂交、计算生物学、遗传学、免疫学和药理学方法 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、肝组织样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 176 | 2026-04-14 |
A multi-scale biocompatibility atlas of porous silicon nanoparticles: From whole embryo to single-cell resolution
2026-Aug, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本研究建立了一个多尺度评估流程，利用斑马鱼模型结合整体表型分析和单细胞RNA测序，系统评估了多孔硅纳米颗粒的生物相容性 | 首次将整体生物体表型分析与单细胞转录组测序相结合，构建了从胚胎到单细胞分辨率的多尺度生物相容性图谱 | 研究主要基于斑马鱼胚胎模型，其结果向更复杂哺乳动物系统的外推仍需进一步验证 | 评估多孔硅纳米颗粒的生物安全性和生物相容性，为其临床转化提供依据 | 多孔硅纳米颗粒 | 纳米医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 177 | 2026-04-14 |
Multi-layer molecular profiling defines an immune-active colorectal cancer subtype with therapeutic relevance
2026-Jun-16, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2026.102907
PMID:41971068
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据定义了结直肠癌的免疫活性亚型，并开发了预后模型和联合治疗策略 | 建立了整合转录组、表观遗传和突变谱的多组学框架，识别出具有免疫活性的CS3亚型，该亚型在临床微卫星稳定肿瘤中可能被常规检测忽略 | 未明确说明样本的具体来源和验证队列的规模，临床转化仍需进一步验证 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2026-04-14 |
Subtypes estimation in single-cell multi-omics data via S-multi-SNE
2026-Jun-07, Journal of theoretical biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.jtbi.2026.112442
PMID:41895518
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研究论文 | 本文提出S-multi-SNE方法，用于单细胞多组学数据的细胞亚型估计和可视化 | 将多视图降维方法multi-SNE和S-multi-SNE应用于单细胞RNA测序数据，并展示其在跨个体、跨物种和跨测序技术数据中识别细胞亚型的有效性，同时整合scATAC-seq和scRNA-seq数据以改进细胞亚型识别 | NA | 开发用于单细胞多组学数据细胞亚型估计和可视化的多视图降维方法 | 单细胞RNA测序数据和单细胞多组学数据（包括scATAC-seq和scRNA-seq） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | S-multi-SNE，multi-SNE | mRNA计数矩阵，多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，单细胞多组学 | NA | NA |
| 179 | 2026-04-14 |
Identifying Potential Drug Targets in the Knee Osteoarthritis: Insights from the Druggable Genome
2026-Jun, Rejuvenation research
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15491684251403435
PMID:41457786
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研究论文 | 本研究通过整合可药基因组和孟德尔随机化分析，识别了膝骨关节炎的潜在药物靶点 | 结合了可药基因组、孟德尔随机化、单细胞MR分析、蛋白质组学验证及遗传信息空间映射框架，从外周和中枢组织角度识别并验证了多个潜在治疗靶点 | 需要未来进一步实验验证所识别靶点在膝骨关节炎中的作用机制 | 寻找膝骨关节炎的潜在药物靶点 | 膝骨关节炎（KOA） | 生物信息学 | 骨关节炎 | 孟德尔随机化分析、单细胞MR分析、蛋白质组学验证、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质定量性状位点数据、全基因组关联研究数据、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 180 | 2026-04-14 |
A proliferative subpopulation of coelomocytes in sea cucumber is identified and characterized by single-cell RNA-seq after evisceration
2026-Jun, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111262
PMID:41796696
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在海参中鉴定并表征了去内脏后体腔中一个增殖性亚群的体腔细胞 | 首次在海参中利用单细胞RNA测序技术，系统识别了体腔和水管系统中的体腔细胞亚群，并揭示了去内脏后一个增殖性亚群（簇10）的动态变化和分化能力 | 研究主要基于海参单一物种，且依赖于同源物种的细胞标记进行亚群分配，可能限制了结果的普适性 | 探究海参去内脏后体腔细胞的恢复机制，特别是增殖性亚群的鉴定和功能表征 | 海参（Apostichopus japonicus）的体腔细胞，包括体腔和水管系统中的细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量，但涉及海参体腔和水管系统的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |