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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-11-07 |
Hair follicle stem cell fate supports distinct clinical endotypes in hidradenitis suppurativa
2025-Nov-06, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.70152
PMID:41195937
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了毛囊干细胞在化脓性汗腺炎早期发病机制中的两种不同分化轨迹,并基于临床表型定义了三种疾病内型 | 首次发现毛囊干细胞存在两种不同的分化轨迹,分别与炎症和角化相关,并基于此定义了三种临床内型 | 样本量相对有限(49例患者),且仅分析了病灶周围皮肤 | 研究毛囊干细胞命运在化脓性汗腺炎早期发病机制中的作用 | 化脓性汗腺炎患者和健康捐赠者的毛囊细胞 | 单细胞生物学 | 化脓性汗腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 49例HS患者和健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 162 | 2025-11-07 |
scRNA-Seq reveals anti-lymphoma immune responses in mogamulizumab-associated skin eruptions
2025-Nov-06, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.70154
PMID:41195968
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示莫格利珠单抗相关皮疹中抗淋巴瘤免疫反应的分子特征 | 首次在单细胞水平揭示MAR中残留恶性T细胞克隆的沉默状态及抗肿瘤免疫微环境特征 | 样本量较小(MAR组4例,CTCL组6例,健康对照组4例) | 对莫格利珠单抗相关皮疹进行全面的分子特征分析 | 皮肤活检样本(来自MAR患者、未经治疗的CTCL患者和健康对照) | 单细胞基因组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14例皮肤活检(4例MAR,6例CTCL,4例健康对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 163 | 2025-11-07 |
CD103-Positive Tumor-Infiltrating Lymphocytes Predict a Favorable Prognosis in Colorectal Cancer with Liver Metastasis
2025-Nov-06, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-025-17977-4
PMID:41196535
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研究论文 | 本研究探讨CD103+肿瘤浸润淋巴细胞在结直肠癌肝转移中的空间分布特征及其预后价值 | 首次系统揭示CD103+TILs在结直肠癌原发灶和肝转移灶中的空间分布异质性及其不同的预后意义 | 样本量相对有限(84例患者),且为回顾性研究设计 | 阐明CD103+肿瘤浸润淋巴细胞在结直肠癌肝转移中的临床意义和功能特征 | 84例同时接受原发结直肠癌和肝转移灶手术切除的患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组织化学,多重免疫荧光分析,单细胞RNA测序,空间转录组分析 | NA | 组织切片图像,基因表达数据 | 84例患者(包含原发肿瘤和肝转移灶配对样本) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 164 | 2025-11-07 |
TransGRN: a transfer learning-based framework for inferring gene regulatory networks across cell lines
2025-Nov-05, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3628564
PMID:41191474
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研究论文 | 提出一种基于迁移学习的跨细胞系基因调控网络推断框架TransGRN | 采用跨细胞系预训练策略,结合多源细胞系scRNA-seq数据与大型语言模型获取的生物学知识,整合基因表达谱与语义信息 | NA | 解决目标细胞类型调控数据稀缺情况下的基因调控网络推断问题 | 跨细胞系的基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 迁移学习, 大型语言模型 | 基因表达数据, 语义信息 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 165 | 2025-11-07 |
scGCRC: Graph and Contrastive-Based Representation Learning for Single-Cell RNA-Seq Data Clustering
2025-Nov-05, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3629161
PMID:41191468
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研究论文 | 提出一种基于局部自注意力网络和对比学习的单细胞RNA测序数据聚类方法 | 通过局部自注意力网络自动聚合细胞关系图中的潜在信息,并采用双对比学习模块同时在细胞和簇级别优化细胞表征 | NA | 开发更有效的单细胞RNA测序数据聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 局部自注意力网络, 对比学习, Leiden社区发现算法 | 基因表达数据 | 160个子样本数据集,3个不同协议数据集,9个真实公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 166 | 2025-11-07 |
Rapid clonal selection within early hematopoietic cell compartments presages outcome to ivosidenib combination therapy
2025-Nov-05, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027948
PMID:41191518
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示了ivosidenib联合疗法在IDH1突变髓系肿瘤患者中早期克隆选择的动力学特征 | 首次结合高灵敏度单细胞基因分型和单细胞RNA测序技术,在治疗早期识别出具有复发风险的克隆选择过程 | 样本量较小(仅8例患者),需要更大规模研究验证 | 探究靶向治疗中克隆选择的动力学特征和分子机制 | 8例IDH1突变髓系肿瘤患者 | 单细胞组学 | 髓系肿瘤 | 单细胞基因分型, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 167 | 2025-11-07 |
A multi-dimensional bioinformatic dissection of the molecular mechanisms in high BMI-associated colorectal cancer: identification and validation of EGLN1 as a key target
2025-Nov-05, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003801
PMID:41191606
|
研究论文 | 通过多维度生物信息学分析揭示高BMI相关结直肠癌的分子机制,并验证EGLN1作为关键治疗靶点 | 首次通过整合多组学数据识别EGLN1作为高BMI相关结直肠癌的核心保护性靶点,并发现天然化合物Cianidanol作为其调节剂 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,需要进一步体内实验验证 | 系统研究高BMI与结直肠癌的遗传关联和分子机制,识别关键治疗靶点 | 结直肠癌患者数据、HCT116结直肠癌细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 孟德尔随机化分析、差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序、分子对接 | 预后模型、PPI网络 | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA队列数据、全球疾病负担数据(1990-2021) | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 168 | 2025-11-07 |
Ubiquitylation-oxaliplatin-related prognosis signature reveals the landscapes of immune responses, cell communication, and therapeutic sensitivity for colorectal cancer
2025-Nov-05, Anti-cancer drugs
IF:1.8Q3
DOI:10.1097/CAD.0000000000001778
PMID:41191789
|
研究论文 | 本研究构建了一个基于泛素化与奥沙利铂耐药相关的结直肠癌风险评分模型,揭示了免疫应答、细胞通讯和治疗敏感性的特征 | 首次整合泛素化修饰与奥沙利铂耐药性构建风险评分模型,并通过单细胞RNA测序鉴定耐药细胞群体和关键信号通路 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,需要进一步的体内实验验证 | 探索泛素化在结直肠癌奥沙利铂耐药中的作用机制,并开发预测模型和治疗策略 | 结直肠癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,药物敏感性预测 | 风险评分模型 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 169 | 2025-11-07 |
From Gene to Scar: Proteome-Wide Causal Insights into Keloid Pathogenesis and Prevention
2025-Nov-05, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1177/21621918251387987
PMID:41192836
|
研究论文 | 通过大规模孟德尔随机化研究和单细胞RNA测序分析,系统评估血浆蛋白及生活方式因素对瘢痕疙瘩发病风险的因果影响 | 首次建立多层因果推断框架,整合蛋白质组学、表型组学和单细胞转录组学数据,在单细胞分辨率上验证RSPO3作为瘢痕疙瘩致病因子 | 研究样本量相对有限,仅包含30名患者的单细胞数据 | 识别瘢痕疙瘩的新型治疗靶点和可改变风险因素 | 瘢痕疙瘩患者和4,907种血浆蛋白及8,155种生活方式相关特征 | 生物信息学 | 瘢痕疙瘩 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,中介分析 | 因果推断模型 | 基因组数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 30名患者的194,366个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 170 | 2025-11-07 |
Notch signaling is a driver of glandular stem cell activity and regenerative migration after damage
2025-Nov-05, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00607-w
PMID:41193641
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了Notch信号在腺体干细胞自我更新和损伤后迁移修复中的核心调控作用 | 首次整合单细胞RNA测序和批量ATAC/RNA测序系统解析腺体器官干细胞的调控机制,并证实Notch信号在多种腺体组织再生中的保守功能 | 主要基于小鼠模型和类器官系统,人体验证数据有限 | 探索腺体器官干细胞的调控机制及其在组织再生中的作用 | 小鼠唾液腺类器官、唾液腺组织、鼠源及患者来源的唾液腺、乳腺和甲状腺类器官 | 单细胞生物学 | 腺体疾病 | 单细胞RNA测序, 批量ATAC测序, 批量RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 多种腺体类器官模型和辐射损伤组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量ATAC-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 171 | 2025-11-07 |
Anti-progestin therapy targets hallmarks of breast cancer risk
2025-Nov-05, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09684-7
PMID:41193807
|
研究论文 | 本研究评估了抗孕激素药物醋酸乌利司他对乳腺癌风险的预防作用 | 首次发现胶原蛋白VI与SOX9阳性管腔祖细胞定位的空间关联,建立了胶原组织与管腔祖细胞活性之间的联系机制 | 样本量较小(24名绝经前女性),研究周期较短(12周) | 评估孕激素受体拮抗剂降低乳腺癌风险标志物的效果 | 24名绝经前女性乳腺癌高风险人群 | 癌症预防研究 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,组织学,原子力显微镜,磁共振成像 | NA | 分子特征数据,临床影像数据,组织微力学数据 | 24名绝经前女性 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 172 | 2025-11-07 |
Macrophage-Targeted Magnesium Ion-Nourisher for NLRP3 Inflammasome Inhibition to Enhance Liver Inflammatory Disease Treatment
2025-Nov-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513798
PMID:41194407
|
研究论文 | 开发了一种靶向巨噬细胞的镁离子营养剂,通过抑制NLRP3炎症小体激活来增强肝脏炎症疾病治疗 | 利用巨噬细胞的胞葬作用设计纳米级镁离子靶向递送系统,首次揭示细胞内镁离子对NLRP3炎症小体的抑制作用 | 镁离子的免疫调节机制尚未完全阐明,且对多种细胞具有广泛影响 | 开发靶向巨噬细胞的镁离子递送策略以治疗肝脏炎症疾病 | 巨噬细胞、Kupffer细胞、肠道屏障 | 生物医学工程 | 肝脏炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 173 | 2025-11-07 |
Stress-Induced Activation of Prolactin-NR4A1-Midkine Axis Exacerbates Skin Inflammation
2025-Nov-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509679
PMID:41194398
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研究论文 | 本研究揭示了压力通过催乳素-NR4A1-中期因子轴加剧皮肤炎症的新机制 | 首次发现压力通过催乳素激活真皮上层APCDD1成纤维细胞中的NR4A1-中期因子轴,从而放大皮肤炎症反应 | NA | 阐明压力加剧皮肤炎症的分子机制 | 人类银屑病患者、小鼠皮肤炎症模型 | 单细胞转录组学 | 皮肤炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、血浆样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 174 | 2025-11-07 |
HMGB3 promotes brain metastasis of lung adenocarcinoma by recruiting SSBP1 for nuclear translocation to remodel mitochondrial metabolism
2025-Nov-05, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.70075
PMID:41194553
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研究论文 | 本研究揭示了HMGB3通过招募SSBP1进行核转位重塑线粒体代谢,从而促进肺腺癌脑转移的分子机制 | 首次发现HMGB3通过招募SSBP1诱导其核转位,重编程线粒体代谢,激活PI3K-Akt信号通路促进肺腺癌脑转移的新机制 | 研究主要基于细胞模型和回顾性队列,需要更多前瞻性临床研究验证 | 探究HMGB3在调控肿瘤细胞代谢促进肺腺癌脑转移中的作用 | 肺腺癌细胞、临床肺腺癌患者组织样本 | 癌症生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 免疫共沉淀, 质谱分析, Western blotting, 功能获得与缺失实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据, 临床病理数据 | 两个回顾性队列:原发性肺腺癌队列和肺腺癌脑转移队列 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 175 | 2025-11-07 |
Circulating Cathepsin D Exacerbates Injury-Induced Brain Damage by Promoting Neutrophil Infiltration Into the Brain
2025-Nov-04, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.043416
PMID:41147378
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研究论文 | 本研究揭示循环中的组织蛋白酶D前体通过上调脑内皮VCAM-1表达促进中性粒细胞浸润,加剧脑损伤 | 首次发现循环中的非酶活性CTSD前体可通过激活脑内皮细胞促进中性粒细胞脑内浸润的新机制 | 研究主要基于转基因小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究循环CTSD对脑损伤后炎症反应的影响机制 | 转基因hCTSDhi小鼠和CTSD单核敲除小鼠的脑组织 | 神经科学 | 脑损伤 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 多组转基因小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 176 | 2025-11-07 |
A Single-cell and Spatially Resolved Cell Atlas of Human Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2025-Nov-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf095
PMID:41191515
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、空间转录组学和代谢组学技术构建了人类食管鳞状细胞癌的单细胞和空间分辨率细胞图谱 | 首次系统揭示了COL17A1+上皮细胞和POSTN+成纤维细胞亚群在肿瘤免疫抑制微环境中的关键作用及其相互作用机制 | NA | 阐明食管鳞状细胞癌免疫抑制微环境的分子特征和机制 | 人类食管鳞状细胞癌及匹配的非肿瘤组织 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学 | NA | 单细胞RNA序列数据,空间转录组数据,代谢组数据 | 一系列人类食管鳞状细胞癌及匹配非肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 177 | 2025-11-07 |
Inhibition the MAP3K20-mediated ribotoxic stress response pathway downregulates M1 macrophage polarization in ulcerative colitis
2025-Nov-04, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115759
PMID:41192115
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研究论文 | 本研究通过多模态方法揭示MAP3K20介导的核糖毒性应激反应通路在溃疡性结肠炎中驱动M1巨噬细胞极化的机制 | 首次鉴定MAP3K20作为协调RSR介导的M1巨噬细胞极化的关键激酶,并证明其抑制剂Vemurafenib的治疗潜力 | 研究主要基于DSS诱导的UC动物模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究核糖毒性应激反应通路在溃疡性结肠炎中驱动M1巨噬细胞极化的机制 | 溃疡性结肠炎肠道组织、M1巨噬细胞、DSS诱导的UC模型 | 生物医学研究 | 溃疡性结肠炎 | 基因集变异分析, 加权基因共表达网络分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 178 | 2025-11-07 |
Adipocyte death promotes hepatic infiltration of S100A8+ macrophages and steatotic liver disease progression in mice
2025-Nov-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI190635
PMID:41178716
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研究论文 | 本研究揭示脂肪细胞死亡通过诱导S100A8+巨噬细胞肝脏浸润促进肝细胞脂质积累和代谢功能障碍相关脂肪性肝病进展的机制 | 首次发现脂肪细胞死亡通过S100A8+巨噬细胞-CCN3-CD36轴驱动肝脏脂肪变性的新机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究脂肪细胞死亡如何促进肝脏脂肪积累和MASLD进展 | 基因修饰小鼠模型 | 分子生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | bulk RNA-Seq, single-cell RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 179 | 2025-11-07 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing identifies GSTM4 as a tumor suppressor and prognostic biomarker in breast cancer
2025-Nov-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03850-z
PMID:41182420
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研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序分析,鉴定GSTM4作为乳腺癌的肿瘤抑制因子和预后生物标志物 | 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序方法系统鉴定GSTM4在乳腺癌中的肿瘤抑制功能及其与肿瘤免疫微环境的关联 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要更多功能实验确认GSTM4的具体作用机制 | 探索乳腺癌的新型生物标志物和治疗靶点 | 乳腺癌组织、细胞系和患者样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,TWAS,WGCNA,PPI网络分析,ssGSEA,体外实验 | NA | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据,表观遗传数据 | 包含GSE148673单细胞RNA测序数据集和多个数据库的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 180 | 2025-11-07 |
Tumor microenvironment remodeling across thyroid cancer differentiation states revealed by spatial transcriptomics
2025-Nov-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04210-0
PMID:41182416
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研究论文 | 通过空间转录组学揭示甲状腺癌分化状态转变过程中肿瘤微环境的动态重塑 | 首次利用空间转录组学技术系统描绘甲状腺癌分化状态转变过程中肿瘤微环境的时空动态变化 | 样本量较小(12例患者),需要更大队列研究验证发现 | 探究甲状腺癌分化状态与肿瘤微环境特征的关系 | 甲状腺癌患者肿瘤组织(包括PTC、FTC、PDTC和ATC) | 空间转录组学 | 甲状腺癌 | 空间转录组学,免疫组织化学 | CellDART算法,PROGENy和REACTOME分析 | 空间转录组数据,图像数据 | 12例患者甲状腺癌组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium CytAssist平台,FFPE组织 |