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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-05-19 |
Alleviation of diabetic cardiomyopathy via preventing VCAM1-positive cells from senescence by engineered nanovesicles
2026-May-17, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04555-3
PMID:42144613
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现VCAM1阳性细胞作为糖尿病心肌病的前衰老内皮细胞群体,并设计工程化纳米囊泡靶向递送STING抑制剂以缓解疾病 | 首次鉴定VCAM1作为前衰老细胞的标志物,并利用膜脂工程改造纳米囊泡实现精准靶向递送 | 仅在糖尿病小鼠模型中验证,缺乏临床试验数据 | 探讨靶向前衰老细胞治疗糖尿病心肌病的可行性 | 糖尿病小鼠心脏中的VCAM1阳性前衰老内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 糖尿病小鼠心脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 162 | 2026-05-19 |
Nuclear factor IX promotes endometriosis progression through transcriptional activation of tetraspanin-2
2026-May-16, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-026-02665-x
PMID:42141251
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研究论文 | 本研究通过整合公共单细胞RNA测序数据和自身RNA测序数据,发现并验证了核因子IX通过转录激活四跨膜蛋白2促进子宫内膜异位症进展的机制 | 首次揭示核因子IX在子宫内膜异位症间质细胞中高表达,并通过转录调控四跨膜蛋白2促进细胞增殖和侵袭,为子宫内膜异位症治疗提供新靶点 | 本研究未提及潜在局限性 | 探究核因子IX在子宫内膜异位症进展中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力 | 子宫内膜异位症间质细胞、正常子宫内膜间质细胞、子宫内膜异位症小鼠模型 | 机器学习 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序,RNA测序,荧光素酶报告基因实验,染色质免疫沉淀实验 | NA | 基因表达数据 | 整合公共数据库与自身样本,具体数量未说明;小鼠模型实验 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 163 | 2026-05-19 |
Single-cell multi-omics analysis reveals two molecular subtypes of human male breast cancer with distinct neuroendocrine and immune characteristics
2026-May-16, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.05.041
PMID:42144060
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示人类男性乳腺癌的两种分子亚型,具有不同的神经内分泌和免疫特征 | 首次在单细胞分辨率下全面解析男性乳腺癌,识别出两种具有不同神经内分泌和免疫状态的主要分子亚型,并发现CD45+/KRT18+细胞及关键转录因子DLX2调控神经内分泌特征 | 未提及 | 阐明男性乳腺癌的潜在机制,为分子亚型提供基础和新见解,并开发创新治疗选择 | 人类男性乳腺癌患者的多组学数据集 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,成像质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据,成像数据 | 多组学大规模数据集 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 164 | 2026-05-19 |
Role of HMGB1 in tumors and its targeted therapy
2026-May-16, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2026.189612
PMID:42144084
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综述 | 总结了HMGB1在肿瘤中的角色、靶向治疗及其作为生物标志物的应用价值 | 提出了利用单细胞RNA测序、空间转录组学、实时活细胞成像等前沿技术全面研究HMGB1时空动态及其分子调控机制 | 肿瘤异质性、HMGB1双面功能及靶向技术局限性仍构成挑战 | 阐明HMGB1在肿瘤进展中的角色及靶向治疗潜力 | 肿瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞、肿瘤相关中性粒细胞、肿瘤相关成纤维细胞、T细胞 | 机器学习和数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、实时活细胞成像 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 165 | 2026-05-19 |
Spatial Multi-Omics Defines Cancer-associated fibroblasts Subtype Gradients Driving Metabolic Support and Immune Remodeling in Pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-May-16, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218585
PMID:42144098
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研究论文 | 整合空间转录组学和空间代谢组学,定义胰腺导管腺癌中癌症相关成纤维细胞亚型梯度,驱动代谢支持和免疫重塑 | 首次整合空间多组学与最优传输模型,揭示了CAF亚型在代谢支持与免疫重塑中的差异功能 | 未提及技术验证的样本量差异或潜在混杂因素 | 阐明CAF的代谢和空间异质性及其临床相关性 | 胰腺导管腺癌组织中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学, 机器学习 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 空间代谢组学, 多重免疫荧光 | CNN, 最优传输模型 | 图像, 文本 | PDAC组织样本(未具体说明数量)及独立空间代谢组学队列 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 166 | 2026-05-19 |
SENP1 facilitates the adaptation of colonic non-lymphoid tissue Treg cells and restrains intestinal inflammation
2026-May-16, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2026.100349
PMID:42144108
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研究论文 | 该研究揭示了SENP1对结肠非淋巴组织调节性T细胞的适应性调节及抑制肠道炎症的重要作用 | 首次发现SENP1在结肠Treg细胞稳态维持中的特异性调节作用,并阐明其通过影响CD25表达和IL-2信号通路影响Treg功能 | 主要基于小鼠模型研究,部分机制可能需要在人体中进一步验证 | 探究SENP1在结肠调节性T细胞功能及肠道免疫稳态中的调节作用 | 小鼠结肠调节性T细胞及肠道炎症模型 | NA | 肠道炎症性疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型,具体样本数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 167 | 2026-05-19 |
Single-Cell RNA Sequencing Unveils CD8+ T Cell Heterogeneity in the Diffuse Large B-cell Lymphoma Microenvironment: A Systematic Review
2026-May-16, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2026.105381
PMID:42144172
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综述 | 系统性综述单细胞RNA测序揭示弥漫大B细胞淋巴瘤微环境中CD8+ T细胞的异质性 | 构建了CD8+ T细胞动态耗竭轨迹图谱,揭示了多个功能不同的亚群层次连续性,并识别了与预后及治疗反应相关的生物标志物 | 未进行荟萃分析,未来需要多中心研究验证靶点并标准化单细胞RNA测序分析框架 | 系统综合单细胞RNA测序证据,绘制CD8+ T细胞异质性图谱并探讨其对弥漫大B细胞淋巴瘤的临床意义 | 弥漫大B细胞淋巴瘤肿瘤微环境中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18项符合条件的单细胞RNA测序研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 168 | 2026-05-19 |
Islet inflammatory macrophages drive MSC loss and multiple interactions involved in β-cell adaptation during diabetes
2026-May-16, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2026.156636
PMID:42144182
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示2型糖尿病进展中胰岛炎症巨噬细胞导致间充质干细胞丢失及β细胞适应过程中的多重相互作用 | 首次在糖尿病小鼠模型中揭示巨噬细胞与间充质干细胞之间的旁分泌串扰共同调控β细胞适应,并阐明了TNF-α介导的Wntless下调在其中的关键作用 | 研究基于小鼠模型,结论在人类中的适用性尚需验证 | 探究2型糖尿病进展中非β胰岛细胞(尤其是巨噬细胞和间充质干细胞)在β细胞功能适应中的作用 | 糖尿病小鼠胰岛中的巨噬细胞、间充质干细胞和β细胞 | 单细胞转录组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 糖尿病小鼠胰岛样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 169 | 2026-05-19 |
Predicting gene-specific regulation with transcriptomic and epigenetic single-cell data
2026-May-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag299
PMID:42143610
|
研究论文 | 提出MetaFR方法,利用单细胞ATAC-seq和RNA-seq数据学习基因特异性调控模型 | 提出MetaFR方法,通过高效回归树在单细胞或元细胞水平建立基因表达预测模型,运行时间和预测性能优于现有方法SCARlink | 单细胞数据固有的稀疏性使分析具有挑战性 | 研究基因特异性调控机制,利用转录组和表观遗传组单细胞数据预测基因表达 | 基因表达预测模型及调控区域 | 机器学习 | NA | 单细胞ATAC-seq、单细胞RNA-seq | 回归树 | 表观遗传数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 170 | 2026-05-19 |
A CSF disease-associated macrophage signature defines progressive multiple sclerosis
2026-May-13, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03861-9
PMID:42129775
|
研究论文 | 本研究结合流式细胞术和单细胞转录组学,揭示了进行性多发性硬化症患者脑脊液中CD14+单核细胞增多,这些细胞呈现边界相关巨噬细胞样特征并与疾病进展相关 | 首次在脑脊液中定义与进行性多发性硬化症相关的疾病相关巨噬细胞特征,并发现这些细胞与神经退行性病变中发现的疾病相关小胶质细胞/巨噬细胞共享部分特性 | 研究为回顾性与前瞻性结合设计,样本量相对有限,且未探讨脑脊液细胞变化的因果关系 | 探究进行性多发性硬化症患者脑脊液中的细胞变化及其作为生物标志物的潜力 | 多发性硬化症患者(包括复发-缓解型和进行性型)及非炎症性对照的脑脊液细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 流式细胞术、单细胞转录组学、ELISA | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、ELISA数据 | 回顾性流式细胞术:299例(169例RRMS,56例PMS,74例对照);前瞻性单细胞转录组学:35人(11例对照,12例RRMS,12例PMS);额外阿尔茨海默病对照数据来自公开数据集 | NA | 单细胞RNA-seq、流式细胞术 | NA | NA |
| 171 | 2026-05-19 |
A Spatial Atlas of Muscle-Invasive Bladder Cancer Reveals Lineage-Specific Vulnerabilities and Immune Architecture
2026-May-13, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-26-0099
PMID:42126225
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研究论文 | 通过整合空间转录组学、批量RNA和全外显子测序数据,构建了肌层浸润性膀胱癌的空间图谱,揭示了肿瘤内部的管腔-基底轴、谱系特异性脆弱性和免疫结构 | 首次通过空间转录组学揭示MIBC肿瘤内连续有序的管腔-基底轴及其与染色体不稳定性、转录可塑性和治疗敏感性的关联 | 未提及,可能包括样本量限制和空间转录组技术的分辨率局限性 | 构建肌层浸润性膀胱癌的空间图谱,以理解其谱系状态、免疫结构和治疗脆弱性 | 22个肌层浸润性膀胱癌肿瘤样本 | 计算病理学 | 膀胱癌 | 空间转录组学、批量RNA测序、全外显子测序 | NA | 空间基因表达数据、RNA测序数据、全外显子测序数据 | 22个肿瘤样本(空间转录组学),超过3000个肿瘤样本(泛队列分析) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 172 | 2026-05-19 |
Maternal immune activation perturbs the brain epitranscriptome
2026-May-12, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106804
PMID:42128069
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研究论文 | 本研究揭示了母体免疫激活如何扰动大脑表观转录组,并鉴定出脱甲基酶FTO可作为改善MIA后代行为表型的治疗靶点 | 首次通过空间转录组学和直接RNA测序技术,系统地描述了发育中小鼠大脑中表观转录组调控因子的细胞类型和脑区特异性分布,并阐明了MIA如何改变大脑表观转录组图谱 | 未明确提及研究限制 | 阐明母体免疫激活导致的RNA代谢紊乱的精确机制,并寻找潜在治疗靶点 | 母体免疫激活小鼠模型及其后代 | 机器学习, 数字病理学 | 神经发育障碍 | 空间转录组学, 直接RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 直接RNA测序数据 | 使用MIA小鼠模型及其后代,具体样本量未说明 | NA | 空间转录组学, 直接RNA测序 | NA | NA |
| 173 | 2026-05-19 |
A Perturb-seq screen guided by species divergence uncovers pathways for collateral artery formation
2026-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.29.721711
PMID:42146601
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研究论文 | 通过物种分化引导的 Perturb-seq 筛选,揭示侧支动脉形成的通路 | 结合豚鼠和小鼠的单细胞 RNA 测序数据,开发 Perturb-seq 平台以发现调控动脉内皮细胞特化的基因,并识别出抑制侧支动脉形成的通路 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,结果在人类中的适用性尚需验证 | 探索侧支动脉形成的发育机制,鉴定能够促进其生长的治疗靶点 | 豚鼠和小鼠的组织内皮细胞,特别是与侧支动脉发育相关的基因表达模式 | 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞 RNA 测序, Perturb-seq | NA | 基因表达数据 | 来自豚鼠和小鼠组织的内皮细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞 RNA 测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞 3' 测序平台 |
| 174 | 2026-05-19 |
BART-spatial unravels biologically significant transcriptional regulators from spatial omics data
2026-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.05.723027
PMID:42146333
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研究论文 | 提出BART-spatial方法,从空间组学数据中推断有生物学意义的转录调控因子 | 首次整合空间变异性和伪时间信息与公开的转录调控因子结合图谱,从空间组学数据中推断功能性转录调控因子,而传统方法主要针对非空间单细胞数据且忽略空间异质性 | 对转录调控因子低表达的处理仍有限制,且依赖公开的结合图谱可能覆盖不全 | 开发一种计算方法用于从空间组学数据中识别活性转录调控因子 | 空间转录组和空间表观基因组数据中的转录调控因子 | 机器学习 | NA | 空间转录组学、空间表观基因组学 | BART(结合分析预测调控) | 空间组学数据 | 多个空间数据集,来自不同平台 | 10x Genomics, Atera | 空间转录组学, 空间表观基因组学 | 10x Visium, Visium HD, Atera, spatial RNA-ATAC-seq | 10x Visium, Visium HD, Atera平台和空间RNA-ATAC-seq技术 |
| 175 | 2026-05-19 |
LongAllele: a joint inference framework for allele-specific analysis on long-read bulk and single-cell RNA sequencing
2026-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.05.722992
PMID:42146353
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研究论文 | 提出一种基于期望最大化算法的联合推断框架LongAllele,用于长读段批量与单细胞RNA测序的等位基因特异性分析 | 首次将杂合变异检测、单倍型推断与读段-单倍型分配整合为统一统计框架,并引入可相位感知的检验方法处理非相位读段,避免假阳性错误 | 未提及具体局限性,可能包括计算复杂度高或对长读段数据质量依赖较强 | 开发能全面表征基因、异构体和局部事件水平等位基因调控效应的统计框架 | GTEx多组织批量、外周血单核细胞(单细胞)和人海马体(单细胞核)长读段RNA-seq数据集 | 自然语言处理 | NA | 长读段RNA测序 | 期望最大化算法 | RNA测序数据(长读段) | GTEx多组织样本(批量)、外周血单核细胞(单细胞)、人海马体(单细胞核) | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2026-05-19 |
CDCP1 Deletion Protects Against Pressure Overload-Induced Cardiac Dysfunction and Fibrosis in Mice
2026-May-08, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9236741/v1
PMID:42147194
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研究论文 | 通过基因敲除小鼠模型和空间转录组学揭示CDCP1缺失可减轻压力超负荷引起的心脏功能障碍和纤维化 | 首次在体内证明CDCP1缺失通过抑制心脏成纤维细胞激活和促纤维化基因表达,并减少压力超负荷诱导的特定成纤维细胞亚群(FB5)和促炎性心肌细胞亚群(CM4)来保护心脏功能 | 需要进一步阐明CDCP1在心脏纤维化中的具体分子机制,并验证其作为治疗靶点的潜力 | 研究CDCP1在心脏纤维化中的体内功能及其作为治疗靶点的可能性 | 小鼠心脏组织和人心室成纤维细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 基因敲除、空间转录组学、组织学分析 | NA | 空间转录组数据 | CDCP1基因敲除小鼠(数量未具体说明) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于分析压力超负荷诱导的心脏组织 |
| 177 | 2026-05-19 |
Flow Matching for Count Data
2026-May-08, ArXiv
PMID:42147731
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研究论文 | 提出了一种基于连续时间生灭过程的流匹配框架 count-FM,用于高维计数数据的生成与迁移 | 首次将流匹配框架扩展到计数数据领域,利用局部单位跳跃的生灭过程实现无仿真训练的条件迁移率学习,在计数空间中高效完成分布间映射 | 论文未明确讨论模型在大规模高维计数数据上的计算扩展性及超参数敏感性分析 | 建立一种适用于高维计数数据的概率生成框架,实现分布间的自然迁移与高效采样 | 单细胞RNA测序数据和神经脉冲序列数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, 神经脉冲记录 | 流匹配模型(基于生灭过程的连续时间流) | 计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 178 | 2026-05-19 |
CXCL13-CXCR5 Signaling in CD8⁺ T Cell Recruitment and Lymphoid Immune Organization in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722710
PMID:42146336
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研究论文 | 本研究探讨CXCL13-CXCR5信号在透明细胞肾细胞癌中CD8⁺ T细胞募集和淋巴免疫组织中的作用 | 首次揭示CXCL13-CXCR5轴在ccRCC中调控CD8⁺ T细胞募集、分化和免疫组织结构,并发现其与患者预后相关 | 未明确说明 | 探索CXCL13-CXCR5信号在高危非转移性ccRCC中对CD8⁺ T细胞募集和免疫组织的调节机制 | 人类ccRCC肿瘤组织、血浆和匹配的邻近肾标本,以及同源小鼠模型 | 计算机视觉 | 肾细胞癌 | ELISA, 定量PCR, 迁移实验, 多重免疫荧光, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 同源小鼠模型 | NA | 文本 | 人类ccRCC肿瘤组织、血浆和匹配的邻近肾标本;同源小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 179 | 2026-05-19 |
The abscopal effect of IRE combined with anti-PD-1 achieves local ablation and systemic control of PDAC
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722535
PMID:42146443
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研究论文 | 探讨不可逆电穿孔(IRE)联合抗PD-1疗法对胰腺导管腺癌(PDAC)的局部消融及全身性控制效果 | 首次证明IRE联合抗PD-1抗体可在转移性PDAC临床前模型中诱导远隔效应,并揭示B细胞在IRE介导的全身抗肿瘤免疫中发挥重要作用 | NA | 研究IRE联合抗PD-1疗法能否诱导远隔效应以实现局部消融和全身性控制PDAC | 转移性胰腺导管腺癌(PDAC)临床前模型 | 机器学习 | 胰腺导管腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间免疫荧光 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、空间成像数据 | 多个小鼠模型,包含原位PDAC肿瘤和B细胞敲除小鼠 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序, Illumina NovaSeq测序平台 |
| 180 | 2026-05-19 |
Genetic suppression of myeloid receptor Clec7a attenuates microglia neuroinflammation and promotes microglial phagocytosis to delay disease progression in ALS models
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722437
PMID:42146463
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研究论文 | 研究了Clec7a基因在肌萎缩侧索硬化症(ALS)模型中对小胶质细胞神经炎症和吞噬功能的调节作用 | 首次发现Clec7a(Dectin-1)是ALS中疾病相关小胶质细胞的核心标志基因,其敲除可特异性减弱小胶质细胞的神经免疫基因表达并促进病理性hTDP43的吞噬 | 未提及具体局限性 | 阐明Clec7a调节小胶质细胞激活和ALS疾病进展的作用机制 | SOD1G93A小鼠模型和人类ALS样本 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序、双光子成像 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 涉及SOD1G93A小鼠和人类ALS样本,具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 脊髓单细胞RNA测序 |