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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-30 | Preclinical Diagnosis of Type 1 Diabetes: Reality or Utopia 
          2025-Oct-07, Biomedicines
          
          IF:3.9Q1
          
         
          DOI:10.3390/biomedicines13102444
          PMID:41153727
         | 综述 | 本文评估了1型糖尿病经典与新兴生物标志物的研究现状,重点关注早期诊断的潜力与挑战 | 系统整合了从传统生物标志物到新兴技术(如单细胞转录组、FTIR光谱)在1型糖尿病早期诊断中的应用前景 | 许多新兴生物标志物证据基础不足,仍局限于研究环境,尚未在临床诊断中广泛应用 | 评估1型糖尿病生物标志物研究现状,推动早期诊断方法开发 | 1型糖尿病生物标志物(传统与新兴) | 生物信息学 | 1型糖尿病 | NGS, GWAS, 单细胞转录组, scRNA-seq, FTIR光谱 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 光谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组关联分析 | NA | NA | 
| 162 | 2025-10-30 | Harpagide Confers Protection Against Acute Lung Injury Through Multi-Omics Dissection of Immune-Microenvironmental Crosstalk and Convergent Therapeutic Mechanisms 
          2025-Oct-04, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
          
         
          DOI:10.3390/ph18101494
          PMID:41155609
         | 研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了钩果草苷通过调节免疫-微环境相互作用对急性肺损伤的保护作用 | 首次采用单细胞转录组学、血液蛋白质组学和肺组织蛋白质组学的整合多组学策略,发现钩果草苷直接结合HIF-1α并通过多通路调节发挥保护作用 | 研究基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;样本量相对有限(n=6) | 探索钩果草苷对急性肺损伤的保护机制及多通路调节作用 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 多组学分析 | 急性肺损伤 | 单细胞转录组学,蛋白质组学,表面等离子共振,细胞热位移分析,分子动力学模拟 | 动物模型,细胞模型 | 基因表达数据,蛋白质数据,分子相互作用数据 | 6只小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA | 
| 163 | 2025-10-30 | Single-Cell Transcriptomics Reveals a Multi-Compartmental Cellular Cascade Underlying Elahere-Induced Ocular Toxicity in Rats 
          2025-Oct-04, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
          
         
          DOI:10.3390/ph18101492
          PMID:41155607
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了Elahere在大鼠中诱导眼部毒性的多区室细胞级联机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统解析ADC药物Elahere诱导眼部毒性的细胞类型特异性分子机制 | 研究仅使用大鼠模型,与人类病理生理存在物种差异 | 阐明Elahere诱导眼部毒性的细胞特异性分子机制 | Sprague-Dawley大鼠角膜细胞 | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 47,606个角膜细胞 | BD Biosciences | 单细胞RNA测序 | BD Rhapsody | BD Rhapsody单细胞分析系统 | 
| 164 | 2025-10-30 | Exploring the Abnormal Characteristics of the Ovaries During the Estrus Period of Kazakh Horses Based on Single-Cell Transcriptome Technology 
          2025-Oct-02, Biology
          
         
          DOI:10.3390/biology14101351
          PMID:41154754
         | 研究论文 | 基于单细胞转录组技术探索哈萨克马发情期卵巢异常特征 | 构建了首个哈萨克马卵巢单细胞转录组图谱,揭示了九种卵巢细胞类型及其亚型的基因表达特征 | 研究仅针对哈萨克马特定品种,结果可能不适用于其他马种 | 探究马科动物发情期卵巢功能衰退的分子机制 | 哈萨克马卵巢组织 | 单细胞转录组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 112,861个细胞(来自含卵泡和无卵泡卵巢) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 165 | 2025-10-30 | Tumor-derived CD109 orchestrates reprogramming of tumor-associated macrophages to dampen immune response 
          2025-Oct, Journal of hepatology
          
          IF:26.8Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.jhep.2025.03.035
          PMID:40220905
         | 研究论文 | 本研究揭示了肿瘤源性可溶性CD109通过重编程肿瘤相关巨噬细胞抑制免疫反应的机制 | 首次发现sCD109作为'分泌性免疫检查点'通过双重机制调控CD73表达,并证明CD109与PD-L1双重阻断可增强免疫治疗效果 | 研究主要在临床前模型中进行,需要进一步临床验证 | 探索iCCA免疫抑制机制并开发新的免疫治疗靶点 | 肝内胆管癌(iCCA)及其肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 肝内胆管癌 | 蛋白质组学分析、单细胞转录组学、飞行时间质谱流式细胞术、RNA测序、质谱分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | NA | 
| 166 | 2025-10-30 | Immunopathogenesis of IgG4-related disease in the era of single-cell RNA sequencing and highly multiplex immunofluorescence 
          2025-Oct, Expert review of clinical immunology
          
          IF:3.9Q2
          
         
          DOI:10.1080/1744666X.2025.2567589
          PMID:40999941
         | 综述 | 本文总结了单细胞RNA测序和高重免疫荧光技术在IgG4相关疾病免疫发病机制研究中的最新进展 | 利用单细胞技术发现了新的免疫细胞亚群,包括GZMK+细胞毒性Tfh细胞、MKI67+B细胞和双阴性3型B细胞 | 尚未将机制发现与靶向治疗完全衔接,需要改进动物模型和开展转化研究 | 探讨IgG4相关疾病的免疫发病机制 | 浆母细胞、活化B细胞、细胞毒性T淋巴细胞、T滤泡辅助细胞、巨噬细胞、树突状细胞、成纤维细胞等免疫细胞 | 免疫学 | IgG4相关疾病 | 单细胞RNA测序, 高重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA | 
| 167 | 2025-10-30 | RELA Haploinsufficiency Manifesting as an Atypical Phenotype of Crohn's Disease 
          2025-Oct-01, Inflammatory bowel diseases
          
          IF:4.5Q1
          
         
          DOI:10.1093/ibd/izaf159
          PMID:40876844
         | 研究论文 | 本研究报道了一例由RELA单倍体不足引起的克罗恩病非典型表型病例,通过基因组学和免疫学分析揭示了其发病机制 | 首次将RELA单倍体不足与克罗恩病样表型联系起来,揭示了Th1/Th17极化和干扰素驱动炎症的新机制 | 单病例研究,样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 表征由RELA单倍体不足驱动的非典型克罗恩病样表型的临床、基因组和免疫学特征 | 一名17岁男性患者,诊断为全肠克罗恩病伴肛周瘘管、慢性皮肤黏膜念珠菌病和慢性淋巴细胞减少症 | 医学遗传学 | 克罗恩病 | 全外显子组测序, Sanger测序, 蛋白质建模, Western blotting, 免疫荧光, NF-κB激活试验, 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 蛋白质数据, 单细胞转录组数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA | 
| 168 | 2025-10-30 | Immunophenotypic changes in the tumor and tumor microenvironment during progression to multiple myeloma 
          2025-Oct, PLoS genetics
          
          IF:4.0Q1
          
         
          DOI:10.1371/journal.pgen.1011848
          PMID:41056512
         | 研究论文 | 通过单细胞分析研究多发性骨髓瘤进展过程中肿瘤细胞和肿瘤微环境的免疫表型变化 | 首次在未分选的骨髓单核细胞样本中结合单细胞RNA测序、表面蛋白分析和B淋巴细胞抗原受体分析,构建了骨髓微环境的细胞图谱 | 样本量相对有限,需要进一步验证研究结果 | 研究多发性骨髓瘤前驱疾病向活动性疾病进展过程中的细胞和分子机制 | 健康志愿者和单克隆丙种球蛋白病、冒烟型多发性骨髓瘤、多发性骨髓瘤患者 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 表面蛋白分析, B淋巴细胞抗原受体分析 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白表达数据 | 123名受试者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 169 | 2025-10-30 | Liquid Biopsy-Multiomics Link Adhesion Pathway Dysregulation to Kidney Injury Severity 
          2025-Oct, Kidney international reports
          
          IF:5.7Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.ekir.2025.07.021
          PMID:41141506
         | 研究论文 | 本研究通过液体活检多组学分析揭示细胞粘附通路失调与急性肾损伤严重程度的关联 | 首次结合尿液蛋白质组学、血浆蛋白质组学和尿液沉淀单细胞转录组学,系统识别严重急性肾损伤的细胞特异性机制 | 样本量相对有限,特别是单细胞转录组学样本仅40例 | 预测急性肾损伤严重结局并探索其分子机制 | COVID相关和非COVID相关的急性肾损伤患者 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 蛋白质组学,单细胞转录组学,机器学习 | 随机森林 | 蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 169例尿液蛋白质组学样本,437例血浆蛋白质组学样本,40例尿液沉淀单细胞转录组学样本 | NA | 单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA | 
| 170 | 2025-10-30 | Single-cell multi-omic and spatial profiling of esophageal squamous cell carcinoma reveals the immunosuppressive role of GPR116+ pericytes in cancer metastasis 
          2025-Oct, Nature genetics
          
          IF:31.7Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41588-025-02341-9
          PMID:41073785
         | 研究论文 | 通过单细胞多组学和空间转录组学揭示食管鳞癌中GPR116+周细胞通过免疫抑制促进肿瘤转移的机制 | 首次发现GPR116+周细胞亚群在食管鳞癌转移中的关键作用,阐明其通过分泌EGFL6激活整合素β1/NF-κB通路促进转移的分子机制 | 样本量相对有限(16个单细胞多组学样本,5个空间转录组样本),动物模型结果需进一步临床验证 | 探究食管鳞癌肿瘤微环境中细胞多样性和空间结构对肿瘤转移的影响机制 | 食管鳞癌患者组织样本(人类)和Prrx1基因敲除小鼠模型 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞多组学测序,空间转录组学,基因敲除技术 | NA | 单细胞多组学数据,空间转录组数据 | 16个单细胞多组学样本(117,169个细胞),5个空间转录组样本(195,366个细胞) | NA | 单细胞多组学,空间转录组学 | NA | NA | 
| 171 | 2025-10-30 | Identifying senescent cells as prognostic biomarkers and therapeutic targets of nasopharyngeal carcinoma by integrated analysis of single-cell and bulk-RNA sequencing data 
          2025-Sep-30, Translational cancer research
          
          IF:1.5Q4
          
         
          DOI:10.21037/tcr-2025-659
          PMID:41158214
         | 研究论文 | 通过整合分析单细胞和bulk-RNA测序数据,识别鼻咽癌中的衰老细胞作为预后生物标志物和治疗靶点 | 首次在单细胞水平表征鼻咽癌中的衰老细胞,发现衰老上皮C3细胞和SPP1+巨噬细胞与肿瘤进展相关 | 样本量较小(15例初治患者和1例慢性鼻咽炎患者) | 阐明鼻咽癌中衰老细胞的表型特征及其在肿瘤发生中的作用 | 鼻咽癌患者组织样本 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,bulk RNA测序数据 | 16例患者(15例初治鼻咽癌,1例慢性鼻咽炎) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 172 | 2025-10-30 | APOA2 mediates immune therapy tolerance in hepatocellular carcinoma by inhibiting the antigen-presenting function of dendritic cells through the PPAR signaling pathway 
          2025-Sep-30, Translational cancer research
          
          IF:1.5Q4
          
         
          DOI:10.21037/tcr-2025-321
          PMID:41158225
         | 研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,揭示了APOA2通过PPAR信号通路抑制树突状细胞抗原呈递功能,从而介导肝细胞癌免疫治疗耐受的机制 | 首次发现APOA2通过PPAR信号通路抑制树突状细胞抗原呈递功能,阐明了肝细胞癌免疫治疗耐受的新机制 | 研究样本量有限,机制验证主要依赖生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探究肝细胞癌对联合靶向治疗和免疫治疗产生耐受的分子机制 | 接受卡博替尼-纳武利尤单抗治疗的肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | RCTD算法, hdWGCNA, ISCHIA算法, Misty框架, CellChat | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 173 | 2025-10-30 | Integration analysis of single-cell transcriptome reveals SPP1+ and TFF3+ macrophage subsets contributing to the brain metastasis from lung cancer 
          2025-Sep-30, Translational cancer research
          
          IF:1.5Q4
          
         
          DOI:10.21037/tcr-2024-2489
          PMID:41158243
         | 研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了SPP1+和TFF3+巨噬细胞亚群在肺癌脑转移中的作用机制 | 首次发现SPP1+和TFF3+巨噬细胞亚群在肺癌脑转移组织中显著上调,并揭示了其促进肿瘤进展的潜在分子机制 | 研究基于公共数据库数据,缺乏实验验证;样本来源和数量未明确说明 | 探究肺癌脑转移中肿瘤相关巨噬细胞亚群的异质性及其作用机制 | 肺癌脑转移组织中的巨噬细胞亚群 | 单细胞转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 174 | 2025-10-30 | Demystifying programmed cell death in lung adenocarcinoma: combined prognostic model construction 
          2025-Sep-30, Translational cancer research
          
          IF:1.5Q4
          
         
          DOI:10.21037/tcr-2025-309
          PMID:41158258
         | 研究论文 | 本研究构建了基于程序性细胞死亡基因的肺腺癌联合预后模型 | 首次结合坏死性凋亡和焦亡基因构建联合预后模型,并识别PKP2和AHSA1作为关键预后生物标志物 | 研究基于回顾性数据,需要前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 开发肺腺癌预后模型以改善风险分层和识别治疗靶点 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | LASSO回归,多变量Cox回归,机器学习,单细胞RNA测序 | LASSO回归模型,联合预后模型,机器学习模型 | 基因表达数据 | TCGA和8个GEO数据集 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 175 | 2025-10-30 | Development and validation of a lipid metabolism-related prognostic model for gastric adenocarcinoma 
          2025-Sep-30, Translational cancer research
          
          IF:1.5Q4
          
         
          DOI:10.21037/tcr-2025-1540
          PMID:41158277
         | 研究论文 | 开发并验证了一个基于脂质代谢的胃腺癌预后模型 | 首次构建了胃腺癌脂质代谢相关预后特征模型,揭示了其与肿瘤微环境和免疫治疗反应的关系 | 需要整合单细胞测序和多中心临床数据来提升模型适用性 | 构建胃腺癌脂质代谢相关预后模型并评估其临床相关性 | 胃腺癌患者 | 生物信息学 | 胃腺癌 | LASSO回归分析,Cox回归分析,功能富集分析,肿瘤突变负荷分析 | 预后特征模型 | 基因表达数据,临床数据 | 来自TCGA数据库的胃腺癌样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 176 | 2025-10-30 | Integrative analysis of programmed cell death pathways reveals prognostic biomarkers and immune infiltration signatures in coronary artery disease 
          2025-Sep-30, Journal of thoracic disease
          
          IF:2.1Q3
          
         
          DOI:10.21037/jtd-2024-2283
          PMID:41158406
         | 研究论文 | 通过整合基因表达数据和机器学习方法,系统分析程序性细胞死亡通路在冠状动脉疾病中的作用并识别预后生物标志物 | 首次将多种程序性细胞死亡通路整合分析,开发了PCDscore预后评分系统,并结合单细胞RNA测序数据提供新见解 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 阐明程序性细胞死亡通路在冠状动脉疾病中的预后价值并识别关键生物标志物 | 冠状动脉疾病患者基因表达数据和免疫细胞浸润特征 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 基因表达分析,单样本基因集富集分析,单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的冠状动脉疾病样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 177 | 2025-10-30 | Identification and Validation of a Macrophage Phagocytosis-Related Gene Signature for Prognostic Prediction in Colorectal Cancer (CRC) 
          2025-Sep-29, Current issues in molecular biology
          
          IF:2.8Q3
          
         
          DOI:10.3390/cimb47100804
          PMID:41150752
         | 研究论文 | 本研究开发并验证了一个基于巨噬细胞吞噬相关基因的结直肠癌预后预测模型 | 首次构建了包含SPHK1、VSIG4、FCGR2B和FPR2四个基因的巨噬细胞吞噬相关预后特征,并系统评估了其与肿瘤微环境和治疗敏感性的关联 | 研究样本量有限,需要更大规模的前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 开发结直肠癌预后预测模型并探索其临床价值 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单样本基因集富集分析(ssGSEA), LASSO回归, Cox分析, qRT-PCR, 免疫组化, 单细胞RNA测序 | 基因特征模型 | 基因表达数据, 组织样本 | 使用结直肠癌cDNA和组织微阵列进行验证 | NA | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫组化 | NA | NA | 
| 178 | 2025-10-30 | Transient Knockdown of RORB with Cell-Penetrating siRNA Improves Visual Function in a Proteotoxic Mouse Model of Retinitis Pigmentosa 
          2025-Sep-29, Biomedicines
          
          IF:3.9Q1
          
         
          DOI:10.3390/biomedicines13102392
          PMID:41153677
         | 研究论文 | 通过细胞穿透性siRNA瞬时敲低RORB改善视网膜色素变性小鼠模型的视觉功能 | 首次发现RORB在视网膜变性中的致病作用,并开发了基于RNAi的新型治疗策略 | 研究仅限于Rho小鼠模型,RORB在成年视网膜中的确切功能仍不完全清楚 | 探索RORB瞬时敲低对视网膜色素变性的治疗潜力 | Rho小鼠(常染色体显性视网膜色素变性模型) | NA | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序,细胞穿透性不对称小干扰RNA | NA | 基因表达数据,细胞存活数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 179 | 2025-10-30 | Integrating UHPLC-QE-MS and Bioinformatics with Experimental Validation Reveals MAPK/FOS-Mediated Podocyte Apoptosis as the Key Mechanism of Alpiniae oxyphyllae and Saposhnikovia divaricata in Treating Diabetic Kidney Disease 
          2025-Sep-27, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
          
         
          DOI:10.3390/ph18101449
          PMID:41155564
         | 研究论文 | 本研究通过整合UHPLC-QE-MS技术、生物信息学分析和实验验证,揭示了益智与防风通过抑制MAPK/FOS通路减轻糖尿病肾病的分子机制 | 首次系统鉴定益智与防风活性成分,发现其通过MAPK/FOS介导的足细胞凋亡途径治疗糖尿病肾病 | 研究主要基于动物模型,临床验证仍需进一步研究 | 阐明益智与防风治疗糖尿病肾病的活性成分和作用机制 | 糖尿病肾病小鼠模型和足细胞 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | UHPLC-QE-MS, 生物信息学分析, 分子对接, 单细胞测序 | NA | 质谱数据, 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | GEO数据集GSE30529,39种化合物,42个共同差异表达基因 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱分析 | NA | NA | 
| 180 | 2025-10-30 | Spotlight on FAM72B: Pan-Cancer Expression Profiles and Its Potential as a Prognostic and Immunotherapeutic Biomarker 
          2025-Sep-26, Genes
          
          IF:2.8Q2
          
         
          DOI:10.3390/genes16101140
          PMID:41153357
         | 研究论文 | 本研究系统分析了FAM72B基因在泛癌中的表达谱及其作为预后和免疫治疗生物标志物的潜力 | 首次系统研究FAM72B在泛癌中的表达特征及其与肿瘤免疫微环境、免疫治疗响应的关联 | FAM72B基因功能尚未完全阐明,研究主要基于生物信息学分析,需要实验验证 | 探索FAM72B在泛癌中的表达特征及其作为预后和免疫治疗生物标志物的潜力 | 多种癌症类型和肿瘤免疫微环境 | 生物信息学 | 泛癌 | 生物信息学分析,单细胞测序 | NA | 基因表达数据,临床数据,单细胞数据 | 多种癌症类型的公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |