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当前共找到 40705 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-06-19 |
METTL3 depletion mitigates hypoxic pulmonary arterial smooth muscle cell over-proliferation via YTHDF2-dependent regulation of FOXO1 mRNA N6-methyladenosine modification: a potential mechanism of hypoxic pulmonary hypertension
2026-May-19, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2026.124466
PMID:42162687
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研究论文 | 本研究探讨METTL3介导的m6A修饰在缺氧性肺动脉平滑肌细胞过度增殖及缺氧性肺动脉高压中的作用机制 | 首次揭示METTL3通过YTHDF2依赖方式调控FOXO1 mRNA的N6-甲基腺苷修饰，从而影响缺氧性肺动脉平滑肌细胞增殖，提出METTL3-YTHDF2-FOXO1信号轴作为潜在治疗靶点 | NA | 确定METTL3介导的m6A修饰在缺氧性肺动脉平滑肌细胞过度增殖和缺氧性肺动脉高压中的作用 | 人类肺动脉高压组织、平滑肌特异性Mettl3基因敲除小鼠、缺氧性肺动脉高压模型、人肺动脉平滑肌细胞 | 机器学习 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、MeRIP-qPCR、RIP-qPCR、荧光素酶报告实验 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 162 | 2026-06-19 |
Integrated spatial transcriptomic and metabolic profiling identifies molecular networks associated with cognitive performance in the porcine prefrontal cortex
2026-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 通过整合空间转录组学和代谢组学，生成了猪前额叶皮层的高分辨率多维分子图谱，揭示了与认知表现相关的分子网络 | 首次在有沟回的大型动物大脑中建立空间解析的多组学框架，用于研究认知功能 | NA | 阐明认知功能背后的分子结构 | 猪前额叶皮层组织 | NA | 认知障碍 | 空间转录组学、代谢组学、免疫组化分析 | NA | 空间转录组数据、代谢组数据 | 猪和分层小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 163 | 2026-06-19 |
Workload-induced changes to cell state contribute to β-cell failure in diabetes
2026-May-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.13.725004
PMID:42239070
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示工作负荷诱导的β细胞状态变化在糖尿病发病中的作用 | 首次发现工作负荷诱导的β细胞过度刺激会导致失代偿，并鉴定出一种与应激状态不同的新型补偿状态 | 未提及具体局限性 | 研究β细胞从功能正常到失代偿状态转变的机制，特别是工作负荷诱导的过度刺激的作用 | 胰岛素分泌β细胞 | 机器学习 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠糖尿病模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 164 | 2026-06-19 |
Immune cells during compensatory renal hypertrophy after unilateral nephrectomy
2026-May-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9568023/v1
PMID:42183369
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研究论文 | 探讨单侧肾切除后代偿性肾肥大的免疫细胞动态变化及其对肾功能的影响 | 首次系统揭示单侧肾切除后残余肾脏中免疫细胞的多阶段动态变化，包括先天性免疫快速激活、适应性免疫逐步调控以及免疫检查点水平变化，并发现Rag1小鼠中GFR恢复更显著 | 研究基于小鼠模型，结果需在人体中验证；未深入探讨具体免疫细胞亚群的分子机制 | 阐明单侧肾切除后代偿性肾肥大中免疫细胞的作用及机制 | 小鼠（野生型C57BL/6和Rag1小鼠） | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、肾小球滤过率测量 | 无特定模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 小鼠模型，具体数量未说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 165 | 2026-06-19 |
GatorSC: multi-scale cell and gene graphs with mixture-of-experts fusion for single-cell transcriptomics
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag330
PMID:42308421
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研究论文 | 提出GatorSC框架，通过多尺度细胞和基因图与混合专家融合进行单细胞转录组学表示学习 | 首次将多尺度细胞图和基因图与混合专家架构结合，通过图重建和图对比学习的自监督目标实现噪声鲁棒和结构保持的表示学习 | 未明确讨论计算效率或大规模数据集的扩展性 | 开发统一的表示学习框架，有效利用单细胞转录组数据中跨细胞和基因的多尺度结构信息进行综合分析 | 单细胞转录组数据中的细胞和基因 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq | 图神经网络、混合专家模型 | 单细胞基因表达数据 | 19个公开scRNA-seq数据集，涵盖不同组织、物种和测序平台；一个阿尔茨海默病单细胞核数据集 | NA | scRNA-seq | NA | NA |
| 166 | 2026-06-19 |
Current trends and challenges in deciphering single molecule resolution maps of single cell transcriptomes
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag323
PMID:42308418
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综述 | 回顾单细胞RNA测序技术从手动分离到高通量短读和长读测序的演变，并讨论其在单分子分辨率下解析单细胞转录组的当前趋势与挑战 | 整合技术、计算和生物学视角，系统阐述长读长测序与高通量条形码结合后对细胞异质性和转录动态研究的变革潜力 | 文中未提及自身局限性，但长读长测序仍面临碱基识别准确性较低和通量相对短读技术不足等问题 | 总结单细胞RNA测序技术发展历程并探讨长读长测序在单细胞转录组学中的应用前景 | 单细胞RNA测序技术及其在细胞异质性、转录动态及相关计算工具中的应用 | 自然语言处理 | NA | RNA-seq, scRNA-seq, 长读长测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, 组合条形码平台 | 高通量短读液滴与组合条形码平台，结合长读长测序协议 |
| 167 | 2026-06-19 |
Machine learning-guided multimodal profiling defines perturbed immune states at the time of cancer diagnosis
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag320
PMID:42308424
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研究论文 | 利用机器学习引导的多模态分析，在癌症诊断时描绘外周血单个核细胞的免疫状态变化 | 首次整合流式细胞术、多重细胞因子分析和单细胞RNA测序的多组学数据，并结合机器学习模型对初治癌症患者的免疫状态进行系统性刻画，且模型可解释性强 | 未在独立外部队列中验证模型的泛化能力，样本量可能有限，且仅聚焦于外周血而未能涵盖肿瘤微环境 | 阐明癌症诊断时全身免疫状态的扰动特征，并建立基于免疫的多组学分析方法 | 初治癌症患者的血液样本，包括外周血单个核细胞和血浆 | 机器学习 | 癌症 | 流式细胞术、多重细胞因子分析、单细胞RNA测序 | 机器学习模型（具体类型未明确） | 单细胞多组学数据（流式细胞术和单细胞RNA测序）、血浆细胞因子数据 | 初治癌症患者与健康供者，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | NA |
| 168 | 2026-06-19 |
Activation of the Cerebrospinal Fluid-Contacting Nucleus Mitigates Systemic Inflammation Induced by Sepsis
2026-May-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002665
PMID:41457044
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研究论文 | 本研究揭示脑脊液接触核在脓毒症中通过调控免疫反应发挥保护性作用 | 首次阐明脑脊液接触核通过神经-免疫交互机制调控脓毒症全身性炎症反应 | 未明确脑脊液接触核调控免疫的具体下游分子通路 | 探究脑脊液接触核在脓毒症中的免疫调节作用及机制 | 脓毒症小鼠模型中的脑脊液接触核 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 脓毒症小鼠脑脊液接触核组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 169 | 2026-06-19 |
Therapy-driven clonal dynamics in chronic lymphocytic leukemia
2026-05, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2026.04.001
PMID:42002058
|
综述 | 总结慢性淋巴细胞白血病中克隆演化与治疗耐药机制的知识，并讨论新兴技术及未来研究方向 | 系统总结了慢性淋巴细胞白血病从化疗免疫疗法向靶向药物转变后的耐药机制差异，并强调了单细胞测序和多组学整合等新兴技术的应用潜力 | 尚未涵盖所有临床试验结果，且对联合靶向治疗、双特异性抗体和CAR-T细胞疗法等新型策略的耐药机制讨论较为初步 | 阐述CLL中克隆演化如何驱动治疗耐药，并为个性化治疗策略的开发提供基础 | 慢性淋巴细胞白血病患者的肿瘤克隆及亚克隆群体 | 自然语言处理 | 白血病 | 单细胞测序， 整合多组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 170 | 2026-06-19 |
Integrated Bulk and Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals Transcriptional Activation of PTGS2 by FOS in Progression From T2DM to T2DM-Associated NAFLD
2026-05, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71182
PMID:42108421
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研究论文 | 通过整合批量与单细胞RNA测序数据，揭示FOS介导的PTGS2转录激活在2型糖尿病相关非酒精性脂肪肝病进展中的调控作用 | 首次证明FOS直接结合PTGS2启动子驱动其转录，并阐明该通路在T2DM向NAFLD转化中介导肝脏炎症和凋亡的机制 | 未提及具体局限性 | 探究从2型糖尿病进展为T2DM相关非酒精性脂肪肝病的分子机制 | 2型糖尿病及T2DM相关NAFLD患者样本中的基因表达和调控网络 | 机器学习和转录组学 | 2型糖尿病, 非酒精性脂肪肝病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 双荧光素酶报告实验 | LASSO回归, 随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 171 | 2026-06-19 |
SLA2 is Associated With Immune evasion and Exhaustion of CD8+ T Cells in Gastric Cancer
2026-05, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71164
PMID:42108520
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研究论文 | 研究SLA2在胃癌中与CD8+ T细胞免疫逃逸和耗竭的关联 | 首次揭示SLA2在胃癌肿瘤微环境中通过负调控CD8 T细胞促进免疫逃逸的机制，并从表观遗传学角度阐明其表达调控 | 未在体内模型中验证SLA2敲低对免疫治疗的增强效果；样本来源和机制研究的深度可能有限 | 探索SLA2在胃癌肿瘤微环境中对CD8 T细胞功能的影响及其免疫逃逸机制 | 胃癌组织样本、CD8 T细胞 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 172 | 2026-06-19 |
Integrating single-cell RNA and bulk RNA sequencing data to identify prognostic genes associated with pyrimidine metabolism in triple-negative breast cancer by machine learning algorithm combinations
2026-Apr-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05118-6
PMID:42060238
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA和批量RNA测序数据，利用机器学习算法组合识别三阴性乳腺癌中与嘧啶代谢相关的预后基因 | 采用101种机器学习算法组合构建风险模型，并结合单细胞RNA测序分析探索与预后基因表达相关的细胞类型 | 数据均来自公共数据库，未提及外部验证队列的多样性或前瞻性验证 | 识别三阴性乳腺癌中与嘧啶代谢相关的预后基因并构建风险模型 | 三阴性乳腺癌的基因表达数据和患者预后信息 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | RNA测序 | 机器学习算法组合 | 基因表达数据 | 来自公共数据库的三阴性乳腺癌样本 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 173 | 2026-06-19 |
Integration of 117 machine learning algorithms and single-cell transcriptomics identifies macrophage polarization and ER stress signatures for cancer prognosis and precision therapy
2026-Apr-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05126-6
PMID:42062606
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研究论文 | 通过整合117种机器学习算法和单细胞转录组学，识别巨噬细胞极化和内质网应激特征用于癌症预后和精准治疗 | 首次系统性地在泛癌水平分析巨噬细胞极化和内质网应激相关基因，并利用117种机器学习算法组合开发出稳健的预后特征 | 未提及具体限制 | 探究巨噬细胞极化和内质网应激相关基因在癌症进展和治疗抵抗中的作用，并开发预后标志物和精准治疗策略 | 33种癌症类型的多组学数据，包括TCGA、GTEx、CCLE以及单细胞RNA测序数据集中的86,378个细胞 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 机器学习算法组合（117种） | 文本 | 86,378个单细胞（来自多种癌症类型） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 174 | 2026-06-19 |
Lipid metabolism as a central driver of immune remodeling and therapeutic vulnerability in metastatic colorectal cancer
2026-Apr-30, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-026-02956-9
PMID:42063056
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综述 | 本综述整合了结直肠癌中脂质代谢重编程的最新知识，结合新兴多组学见解，揭示了脂质代谢在转移性结直肠癌免疫重塑和潜在治疗靶点中的核心驱动作用 | 通过整合单细胞和空间转录组学、代谢组学及脂质组学等多组学技术，首次高分辨率绘制了转移性结直肠癌病变中脂质依赖性免疫微环境，并识别出先前未被认识到的代谢脆弱性，提出了脂质代谢作为统一框架理解转移性结直肠癌生物学 | 研究主要基于相关性和临床前证据，缺乏大规模临床验证，脂质代谢与免疫重塑的因果关系机制尚需进一步确认 | 系统阐述脂质代谢在结直肠癌转移中驱动免疫重塑和产生治疗易感性的分子机制，并探讨靶向脂质代谢通路与免疫治疗的协同策略 | 结直肠癌，特别是转移性结直肠癌 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学，空间转录组学，代谢组学，脂质组学 | NA | 多组学数据 | 鼠类模型和人类研究数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学，代谢组学，脂质组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞转录组测序，10x Visium空间转录组学技术 |
| 175 | 2026-06-19 |
Identification and validation of an intratumor heterogeneity-related prognostic signature in triple-negative breast cancer: a study based on integrative machine learning and single-cell sequencing
2026-Apr-25, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-026-02291-y
PMID:42035196
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研究论文 | 本研究结合机器学习和单细胞测序，构建并验证了三阴性乳腺癌中基于肿瘤内异质性的预后签名，提高了预后预测准确性 | 创新性地结合十种机器学习算法和单细胞测序技术，构建了包含七个基因的肿瘤内异质性相关预后签名，并验证了其对免疫治疗反应的预测能力 | 该研究主要基于公共数据库，未说明外部前瞻性验证样本的获取情况 | 开发并验证基于肿瘤内异质性的三阴性乳腺癌预后签名，以改进风险分层和治疗反应预测 | 三阴性乳腺癌患者 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞测序，qRT-PCR | StepCox[backward] + GBM | 转录组数据 | METABRIC训练集以及来自GEO数据库的多个验证集，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 176 | 2026-06-19 |
Integrating optogenetic fMRI and spatial transcriptomics to reveal circuit-specific gene signatures in fronto- and hippo-thalamic networks
2026-Apr-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71923-w
PMID:42000729
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研究论文 | 通过整合清醒小鼠的光遗传学fMRI和空间转录组学，揭示前额-丘脑和海马-丘脑通路中调控神经血管耦合的回路特异性基因特征 | 首次在同一小鼠中同时进行清醒光遗传学fMRI与空间转录组学分析，克服了跨模态数据来自不同个体的局限性，实现了神经活动与基因表达的因果关联解析 | 仅关注前额-丘脑和海马-丘脑两个回路，且传统线性模型主要捕获线性基因-过程关系，未充分探索非线性计算方法 | 揭示微观分子结构如何塑造宏观脑网络组织，特别是基因表达与神经血管耦合之间的因果联系 | 清醒状态下的B6小鼠，涉及前额叶皮层、海马下托和丘脑区域 | 计算机视觉 | 不适用 | 光遗传学fMRI, 空间转录组学 | 广义线性模型, 主成分分析 | fMRI影像, 空间基因表达数据 | 同一批小鼠，具体数量未详述 | NA | 空间转录组学, 光遗传学fMRI | NA | 采用定制化光遗传学fMRI和空间转录组学流程，具体平台未指明 |
| 177 | 2026-06-19 |
Single-cell transcriptomic landscape highlights epithelial-fibroblast interactions and CD44-mediated malignant traits in laryngeal squamous cell carcinoma
2026-Apr-18, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01431-z
PMID:42000946
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示喉鳞状细胞癌中上皮-成纤维细胞相互作用及CD44介导的恶性特征 | 首次在喉鳞状细胞癌中绘制单细胞转录组图谱，识别出三种恶性上皮亚型和五种成纤维细胞亚型，并发现CD44在成纤维细胞-上皮细胞互作中驱动转移的关键作用 | 样本量较小（仅3例患者），未提及功能验证的体内模型细节及临床相关性分析 | 探究喉鳞状细胞癌中上皮细胞和成纤维细胞的异质性及其在肿瘤进展和转移中的作用 | 喉鳞状细胞癌患者的原发肿瘤、癌旁正常组织和转移淋巴结样本 | 数字病理学 | 喉鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3例患者的9份匹配样本（原发肿瘤、癌旁组织、转移淋巴结各3份） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 178 | 2026-06-19 |
Antiviral CD4+ T and myeloid cell responses to influenza vaccines are attenuated in older adults
2026-Apr-17, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-026-01586-7
PMID:41998201
|
研究论文 | 本研究结合体外和体内免疫检测与人类样本，在血清学和单细胞水平上探究老年人和年轻人对流感疫苗的B细胞、CD4+ T细胞和髓系细胞反应差异 | 首次在单细胞转录组水平揭示老年人在流感疫苗应答中T辅助细胞和髓系细胞干扰素转录程序减弱，且抗体应答虽正常但细胞免疫应答受损 | 未明确说明局限性 | 探究老年人对流感疫苗的细胞免疫反应减弱机制，特别是CD4+ T细胞和髓系细胞的转录变化 | 年轻和老年人外周血样本中的B细胞、CD4+ T细胞和髓系细胞 | NA | 老年疾病 | 单细胞转录组测序（single-cell transcriptomics） | NA | 基因表达数据 | 年轻人和老年人的血液样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 179 | 2026-06-19 |
Integrative single-cell analysis reveals endothelial diversity in the vasa vasorum of human atherosclerosis
2026-Apr-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10095-1
PMID:41998210
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研究论文 | 通过整合单细胞分析揭示人类动脉粥样硬化血管外膜血管内皮细胞的多样性 | 首次构建人类动脉粥样硬化单细胞转录组图谱，识别出SULF1 ArtECs和VenECs作为内皮间质转化和白细胞招募的潜在治疗靶点 | 未提及具体局限性 | 研究动脉粥样硬化斑块中微血管的内皮细胞异质性及其在疾病进展中的作用 | 动脉粥样硬化斑块中的血管内皮细胞 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自5项研究的17,367个血管内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 180 | 2026-06-19 |
Design of the biosensor-dependent coupling system stabilizes the high-synthesis phenotype of cell factory
2026-Apr-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71801-5
PMID:41974726
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研究论文 | 本研究通过快速转录组挖掘方法开发了响应甘草次酸和美迪紫檀素的酵母生物传感器，并将其与必需基因耦合构建生长依赖的合成回路，以稳定高产表型，同时利用单细胞转录组揭示群体分工机制 | 提出一种快速转录组挖掘工作流，用于开发缺乏特异性生物传感器的天然产物；创建生长依赖的耦合回路，避免传统方法中高产表型随传代丢失的问题；通过单细胞转录组揭示耦合策略通过扩增特定高产亚群而非消除表型异质性来提升产量 | 仅以甘草次酸和美迪紫檀素作为概念验证，其他天然产物的适用性尚需验证；PDR5启动子的微调过程可能需针对不同传感器进行优化；单细胞分析揭示了基因表达特征，但删除或富集特定亚群的操作在工业规模上的可行性未讨论 | 设计一种基于生物传感器的生长耦合系统，以稳定微生物细胞工厂中天然产物的高产表型，并利用单细胞分析优化群体生产性能 | 酿酒酵母细胞工厂中产甘草次酸和美迪紫檀素的菌株群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 初始菌株和进化菌株的酵母细胞群体（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |