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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-06-02 |
Human Fibroblast-Myeloid cell tissue atlas across lung, synovium, skin and heart
2026-Jun-01, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70238
PMID:42223224
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研究论文 | 通过整合14个公开的单细胞RNA测序数据集,分析了人类肺、滑膜、皮肤和心脏中成纤维细胞和髓系细胞的共性和特异性 | 跨四个组织(肺、滑膜、皮肤和心脏)系统比较了成纤维细胞和髓系细胞的细胞亚群,发现了共享的致病亚群如SPP1+巨噬细胞和POSTN+成纤维细胞 | 数据来自多个研究,可能存在批次效应和异质性,且仅基于公共数据集,缺乏更多独立验证 | 表征不同组织中髓系和间质细胞表型的共性和组织特异性,揭示参与致病组织激活的关键细胞亚型 | 人类肺、滑膜、皮肤和心脏组织样本 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 14个公开数据集,包含136741个髓系细胞和117102个成纤维细胞,样本数:心脏41例、肺25例、皮肤34例、滑膜48例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 162 | 2026-06-02 |
CLEC14A correlates with neutrophil infiltration in hepatocellular carcinoma and mediates neutrophil recruitment across liver endothelial cells
2026-Jun-01, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70077
PMID:42223241
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研究论文 | 本研究揭示CLEC14A与肝细胞癌中中性粒细胞浸润相关,并通过肝内皮细胞介导中性粒细胞的募集 | 首次发现CLEC14A在肝细胞癌血管和急性肝损伤血管中高表达,并证实其通过调节中性粒细胞与肝内皮的牢固粘附来促进中性粒细胞募集,且该作用不依赖于其已知配体MMRN2 | 研究主要基于细胞实验和小鼠模型,尚需在更大规模临床样本中验证CLEC14A作为治疗靶点的有效性 | 阐明CLEC14A在肝细胞癌中调控中性粒细胞募集的机制,探索其作为免疫治疗新靶点的潜力 | 肝细胞癌患者肿瘤组织、人肝内皮细胞、小鼠肝缺血再灌注损伤模型 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 空间转录组学、siRNA敲低、抗体阻断、流式细胞术、免疫组化 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、组织图像 | 公共数据集和手术切除的肝细胞癌组织样本(具体数量未明确) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于分析CLEC14A表达肿瘤的基因表达 |
| 163 | 2026-06-02 |
Exploring the potential targets and mechanisms of artemisinin in the treatment of diabetic kidney disease using network pharmacology and molecular docking
2026-Jun-01, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01894-0
PMID:42223693
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研究论文 | 该研究通过网络药理学和分子对接技术,探讨青蒿素治疗糖尿病肾病(DKD)的潜在靶点和作用机制 | 首次将网络药理学、转录组数据、三种机器学习算法(LASSO、SVM-RFE、RF)及单细胞测序数据相结合,系统筛选和验证青蒿素治疗DKD的关键靶点FLT1 | 仅使用人肾小球内皮细胞(HRGECs)进行体外实验验证,缺乏体内动物模型验证;且未进行FLT1下游信号通路的深入探索 | 探究青蒿素对糖尿病肾病的潜在治疗作用及其分子机制 | 青蒿素及其治疗糖尿病肾病的分子靶点 | 自然语言处理 | 糖尿病肾病 | 网络药理学,分子对接,单细胞测序,Western blot,MTT,TUNEL,ELISA | LASSO,SVM-RFE,随机森林 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 人肾小球内皮细胞(HRGECs)体外高糖损伤模型 | 不适用 | 单细胞测序 | 不适用 | 不适用 |
| 164 | 2026-06-02 |
ScSpTITH: a rank-correlation framework for robust quantification of multi-dimensional tumor heterogeneity
2026-Jun-01, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-026-02841-6
PMID:42223713
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研究论文 | 提出了一个名为ScSpTITH的鲁棒计算框架,用于在单细胞和空间转录组数据中定量肿瘤内和肿瘤间异质性 | 利用斯皮尔曼等级相关对高度零膨胀的单细胞RNA测序数据具有固有权重,能抵抗技术噪声、非正态性和高丢失率 | 摘要未明确提及局限性 | 开发一种鲁棒的计算方法,以克服单细胞RNA测序数据中丢失伪影的影响,进而准确量化多维肿瘤异质性 | 来自多种癌症和发育数据集的单细胞RNA测序和空间转录组数据 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 165 | 2026-06-02 |
Integrative multi-omics analysis identifies a circadian rhythm-associated gene signature for prognosis and therapeutic stratification in lung adenocarcinoma
2026-Jun-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05279-4
PMID:42223738
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research paper | 通过整合多组学数据,构建了一个基于生物节律相关基因的预后特征,用于肺腺癌的风险分层和个体化治疗策略 | 开发了10基因昼夜节律相关基因预后特征,结合十种机器学习算法和单细胞RNA测序,揭示了昼夜节律紊乱在肺腺癌肿瘤免疫微环境和治疗响应中的新作用 | 研究基于计算机模拟预测,缺乏前瞻性验证;单细胞分析可能受限于数据分辨率 | 建立稳健的昼夜节律相关基因特征,以改善肺腺癌的风险分层并指导个体化治疗 | 超过900名肺腺癌患者的多组学数据,包括TCGA和GEO数据库资源 | machine learning | lung cancer | 多组学分析,单细胞RNA测序,机器学习 | CNN, LSTM, GAN | 多组学数据,单细胞RNA测序数据 | 超过900名肺腺癌患者 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 166 | 2026-06-02 |
A risk stratification framework based on ammonia-induced cell death signatures for prognostic assessment and therapeutic insights in colorectal cancer
2026-Jun-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05257-w
PMID:42223795
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研究论文 | 基于氨诱导细胞死亡信号构建结直肠癌预后风险评估框架,并探讨其治疗意义 | 首次将氨相关基因特征用于结直肠癌的预后分层,通过多组学分析和人工智能虚拟筛选发现CLK2作为潜在药物靶点,揭示了氨在肿瘤微环境中的代谢应激调控作用 | 研究仅基于TCGA-COAD数据集进行模型构建,外部验证局限于单细胞RNA-seq数据,缺乏大规模独立临床队列验证 | 探究氨相关基因在结直肠癌中的预后价值及治疗潜力,建立风险分层模型 | 结直肠癌患者的转录组和临床数据,以及肿瘤微环境中的细胞亚群 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR | Cox回归, LASSO | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | TCGA-COAD数据集(样本数未明确),GSE132465单细胞数据集 | NA | 批量RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 167 | 2026-06-02 |
Hyper-activated low-density neutrophil-derived NGAL predicts fatal SFTS: a multi-cohort and single-cell study
2026-Jun-01, Infection
IF:5.4Q1
DOI:10.1007/s15010-026-02840-9
PMID:42223846
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研究论文 | 该研究通过多队列临床数据和单细胞RNA测序,揭示血清NGAL作为致死性SFTS的早期预测因子,并发现其来源于高度活化的低密度中性粒细胞 | 首次在单细胞水平阐明SFTS患者中血清NGAL主要来源于低密度中性粒细胞,而非传统观点中的其他免疫细胞,并揭示高表达NGAL的LDNs具有高炎症和干扰素刺激的转录特征 | 研究为回顾性多中心设计,样本量有限(215例),且单细胞RNA测序数据来自公共数据库,可能无法完全代表不同人群或环境下的细胞状态 | 评估血清NGAL对SFTS患者死亡风险的预测能力,并在单细胞水平揭示其细胞来源 | 215例SFTS患者(来自三家中国医院)及SFTS患者和健康对照的外周血单核细胞单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 发热伴血小板减少综合征(SFTS) | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 临床数据,单细胞RNA测序数据 | 215例SFTS患者(训练队列152例,外部验证队列63例)及公开单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 168 | 2026-06-02 |
Unveiling the Impact of Copper Metabolism on Epithelial-Mesenchymal Transition of Triple-Negative Breast Cancer: Identification of Therapeutic Targets
2026-Jun-01, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-026-00835-6
PMID:42223885
|
研究论文 | 本研究探讨铜代谢对三阴性乳腺癌上皮-间充质转化的影响,并识别潜在治疗靶点 | 首次系统揭示铜代谢相关基因与三阴性乳腺癌上皮-间充质转化及转移的联系,并构建具有高诊断和预后价值的基因模型 | 转移特异性分类模型因标记转移样本数量有限而性能下降,且临床注释不完整 | 探索铜代谢在三阴性乳腺癌进展中的作用,发现新的诊断和预后生物标志物 | 三阴性乳腺癌患者肿瘤及邻近正常组织样本的转录组数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq | Cox比例风险模型,随机森林,XGBoost,AdaBoost,梯度提升机 | 基因表达数据 | 229个三阴性乳腺癌及邻近正常样本 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 169 | 2026-06-02 |
EXPRESS: Metabolic reprogramming of oligodendrocyte lineage cells in ischemic stroke: insights from literature review and single-cell transcriptomic re-analyses
2026-May-31, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X261458133
PMID:42219915
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研究论文 | 通过文献综述和单细胞转录组再分析,揭示缺血性脑卒中后少突胶质细胞谱系细胞的代谢重编程 | 整合文献综述与三个独立小鼠卒中模型的单细胞RNA测序数据的再分析,首次揭示少突胶质细胞前体细胞和成熟少突胶质细胞中分期特异性的代谢变化,如氧化磷酸化、肌醇磷酸代谢、鞘脂代谢及胆固醇生物合成 | 仅基于小鼠卒中模型的单细胞转录组数据再分析,缺乏人体研究验证,且系统性的代谢变化全景尚未完全阐明 | 系统了解经典代谢通路与少突胶质细胞谱系在缺血性脑卒中中的相互作用,并探索潜在治疗靶点 | 少突胶质细胞谱系细胞,包括少突胶质细胞前体细胞和成熟少突胶质细胞 | 数字病理学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三个独立的小鼠卒中模型数据集,涵盖超急性期、急性期和慢性恢复期 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 170 | 2026-06-02 |
Distinct cellular and subcellular distributions of the alpha and beta isoforms of Heat Shock Protein 90 in the mouse cerebral cortex
2026-May-30, Gene expression patterns : GEP
IF:1.0Q4
DOI:10.1016/j.gep.2026.119412
PMID:42218969
|
研究论文 | 研究揭示热休克蛋白90的α和β亚型在小鼠大脑皮层中具有不同的细胞和亚细胞分布 | 首次通过免疫荧光染色、荧光原位杂交和单细胞RNA测序数据,详细展示了HSP90α和HSP90β在成年小鼠大脑皮层中差异性的细胞类型和亚细胞定位,提示它们在特定细胞类型中具有独特功能 | NA | 探讨HSP90α和HSP90β在小鼠大脑皮层中的分布差异及其潜在的功能专一性 | 小鼠大脑皮层中的细胞(包括第五层兴奋性神经元、各层抑制性神经元、少突胶质细胞和第六层神经元)以及神经突远端区域 | 机器学习 | NA | 免疫荧光染色,荧光原位杂交,单细胞RNA测序 | NA | 图像,文本 | 小鼠大脑皮层样本(具体数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序平台(具体配置未详述) |
| 171 | 2026-06-02 |
Coexistent alterations of BAFF and B cell phenotypes in complicated CVID course
2026-May-30, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.04.029
PMID:42219089
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研究论文 | 本研究探讨了常见变异型免疫缺陷病(CVID)中BAFF及其受体与B细胞表型的共同改变,以及与复杂病程的关联。 | 首次通过联合应用光谱流式细胞术、配对BCR测序RNA-seq及BAFF相关蛋白测量,揭示了CVID伴自身免疫和淋巴增殖并发症时BAFF与B细胞亚群失调的共同特征。 | 研究样本量可能有限,且机制尚未完全阐明,需要进一步验证。 | 探究BAFF、其受体及B细胞亚群的共同改变如何影响CVID的病理过程。 | 常见变异型免疫缺陷病(CVID)患者,特别是伴有自身免疫性血细胞减少和淋巴组织增生的患者。 | 机器学习和生物信息学 | 原发性免疫缺陷病(常见变异型免疫缺陷病) | 光谱流式细胞术、单细胞RNA测序、血浆蛋白测量 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据、血浆蛋白测量数据 | CVID患者样本,包括有和无并发症的亚组,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 172 | 2026-06-02 |
Erratum to: Distinct immune escape and microenvironment between RG-like and pri-OPC-like glioma revealed by single-cell RNA-seq analysis
2026-May-30, MedScience
DOI:10.1007/s11684-026-1253-8
PMID:42223858
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 173 | 2026-06-02 |
Empowering fungal infection research with single-cell RNA sequencing
2026-May-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10304-x
PMID:42215623
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综述 | 概述单细胞RNA测序在真菌感染研究中的应用、关键发现及未来方向 | 系统总结了单细胞RNA测序在解析宿主-真菌病原体相互作用动态机制中的最新进展,并强调了该技术在真菌感染研究中的潜力 | 当前单细胞技术在真菌感染领域的应用仍不广泛,存在技术、样本和数据分析方面的局限 | 促进单细胞技术在真菌感染研究中的更广泛采用,以推动诊断和治疗进步 | 真菌病原体与宿主之间的相互作用 | 自然语言处理 | 真菌感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 174 | 2026-06-02 |
COUP-TFII promotes macrophage-myofibroblast transition by attenuating HIF-1α-mediated glycolysis
2026-05-28, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153640
PMID:41916009
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研究论文 | 本研究揭示COUP-TFII通过抑制HIF-1α介导的糖酵解促进巨噬细胞-肌成纤维细胞转化,从而驱动糖尿病肾病纤维化 | 首次阐明COUP-TFII在糖尿病肾病纤维化中通过负调控HIF-1α依赖性糖酵解促进巨噬细胞-肌成纤维细胞转化的新机制 | NA | 探究COUP-TFII在糖尿病肾病肾纤维化中的调控机制 | TGF-β处理的巨噬细胞和22周龄DB/DB糖尿病肾病小鼠模型 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | Western blotting, 单细胞测序, GEO数据库分析, 基因敲减载体构建, 免疫荧光 | NA | 蛋白质表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 175 | 2026-06-02 |
Pan-cancer spatial atlas of tertiary lymphoid structures
2026-May-28, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adz2742
PMID:42207882
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研究论文 | 对12种癌症类型的空间转录组数据进行分析,构建了三级淋巴结构的全癌种空间图谱,并利用AI模型预测其成熟状态 | 首次构建了涵盖12种癌症类型的TLS全癌种空间图谱,结合超高多重单细胞空间分析和AI框架从H&E染色图像直接预测TLS成熟状态,提出了基于成熟度的复合评分策略 | NA | 系统表征TLS在多种癌症中的空间组织、成熟状态及其临床相关性 | 三级淋巴结构(TLS)及其在肿瘤微环境中的空间分布和成熟状态 | 数字病理学, 机器学习 | 多种癌症类型(12种) | 空间转录组学, 单细胞空间分析, 人工智能 | CNN(卷积神经网络) | 空间转录组数据, H&E染色图像, 超高多重单细胞空间图谱 | 12种癌症类型的空间转录组样本,TCGA及独立治疗队列 | NA | 空间转录组学, 单细胞空间分析 | NA | NA |
| 176 | 2026-06-02 |
Spatial transcriptomics and multi-omics approach to decipher age-related tissue microenvironments and therapeutics in neurodegeneration and aging
2026-May-28, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2026.103189
PMID:42214504
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综述 | 综述空间转录组学在多组学框架下揭示年龄相关神经退行性疾病中组织微环境的作用及治疗策略 | 强调了空间转录组学作为连接分子发现与临床应用的关键桥梁,并整合多组学数据以解析年龄相关病理的空间调控机制 | 文中未明确提及具体局限性,但可能涉及空间转录组学技术通量、成本及数据分析复杂性等挑战 | 阐述空间转录组学在理解神经退行性变与衰老过程中空间调控机制的应用,并推动精准治疗发展 | 年龄相关神经退行性病变中的组织微环境、细胞异质性及神经炎症网络 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 空间转录组学, 多组学 | NA | 转录组数据, 多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 177 | 2026-06-02 |
Single-cell transcriptomics and multimodal molecular profiling revealed the oncogenesis and tumor microenvironment of cardiac myxoma
2026-May-27, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3299-0
PMID:42223569
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和多模态分子分析揭示了心脏黏液瘤的癌变机制及肿瘤微环境 | 首次利用单细胞RNA测序构建心脏黏液瘤细胞图谱,阐明内皮细胞向间充质转化是其细胞起源,并揭示肿瘤相关成纤维细胞和壁细胞亚型差异导致不同形态分化 | 样本量有限(仅5例肿瘤及5例正常组织),缺乏功能验证实验,未深入探讨信号通路调控机制 | 探究心脏黏液瘤的细胞组成、起源及肿瘤形态多样性的形成机制 | 心脏黏液瘤组织和正常房间隔组织 | 机器学习 | 心脏黏液瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例心脏黏液瘤组织样本和5例正常房间隔样本,共86,741个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 178 | 2026-06-02 |
From Multiomics Discovery to Clinical Validation: Identification of Novel Noninvasive Biomarkers for Liver Fibrosis
2026-May-26, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.5c01198
PMID:42192591
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研究论文 | 通过多组学和单细胞测序发现并验证THBS2、GDF15和NFASC作为肝纤维化新型非侵入性生物标志物 | 首次通过整合多组学与单细胞测序发现并临床验证THBS2、GDF15和NFASC作为肝纤维化非侵入性生物标志物,并开发了结合临床变量的多变量模型,显著提高了风险分层准确性 | NA | 识别和验证肝纤维化的新型非侵入性生物标志物 | 肝纤维化患者样本中的生物标志物表达和诊断性能 | 机器学习 | 肝纤维化 | 多组学分析,单细胞测序 | 多变量模型 | 临床变量数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 179 | 2026-06-02 |
Integrating bulk and single-cell sequencing reveals cellular heterogeneity between lung adenocarcinoma in smokers and never-smokers
2026-May-21, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.39.20250160
PMID:40878768
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研究论文 | 整合单细胞和批量测序揭示吸烟与非吸烟肺腺癌患者的细胞异质性 | 首次通过整合单细胞RNA测序和批量测序数据,系统揭示了吸烟与非吸烟肺腺癌患者在细胞亚群、肿瘤微环境和免疫逃逸机制上的差异,并识别出潜在免疫治疗靶点 | NA | 探究吸烟与非吸烟肺腺癌患者的细胞异质性及其在肿瘤发展和免疫治疗中的差异 | 吸烟与非吸烟肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 180 | 2026-06-02 |
Targeting noncanonical nuclear factor kappa B signalling in CYLD cutaneous syndrome by selective inhibition of IκB kinase alpha
2026-05-19, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljag044
PMID:41779628
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研究论文 | 通过选择性抑制IκB激酶α靶向CYLD皮肤综合征中的非经典核因子κB信号通路 | 首次发现非经典NF-κB信号在CYLD皮肤综合征肿瘤角质形成细胞中异常激活,并鉴定IKKα为候选治疗靶点 | 研究仅基于患者来源的肿瘤球体培养模型,缺乏体内实验验证 | 探究CYLD皮肤综合征肿瘤中NF-κB信号异常机制,寻找可药物靶点 | CYLD皮肤综合征患者来源的肿瘤细胞和正常皮肤细胞 | 数字病理学 | 皮肤病 | RNA-seq, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 患者来源的肿瘤细胞分群和单细胞测序样本 | NA | 单细胞RNA测序, 大量RNA测序 | NA | NA |