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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-05-31 |
Cancer-Associated Endocrine Cells Participate in Pancreatic Carcinogenesis
2024-11, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.07.016
PMID:39048054
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研究论文 | 通过单细胞转录组、空间转录组和多重免疫组化技术,揭示胰腺导管腺癌中内分泌细胞的改变及其与癌细胞的相互作用机制 | 首次系统描绘胰腺内分泌细胞在PDAC中的改变,定义并表征癌症相关内分泌细胞,揭示内分泌-外分泌相互作用的旁分泌机制 | 尚未明确胰腺多肽阳性细胞在临床样本中的预后价值及具体分子机制细节 | 探究胰腺内分泌细胞在胰腺导管腺癌发生发展中的作用及其与外分泌部分的相互作用机制 | 胰腺内分泌细胞(包括α细胞、β细胞、胰腺多肽阳性细胞等)与胰腺导管腺癌细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序、多重免疫组化、原位移植小鼠模型、基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、组织切片图像 | 未提及具体样本数量,涉及原位移植小鼠、KrasLSL-G12DPdx1-Cre小鼠、KrasLSL-G12Dp53LoxPPdx1-CreER小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组测序 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3'和10x Visium空间转录组平台 |
| 162 | 2026-05-31 |
Ependymal cells undergo astrocyte-like reactivity in response to neuroinflammation
2024-10, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.16120
PMID:38702968
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研究论文 | 通过单细胞转录组学比较反应性室管膜细胞和反应性星形胶质细胞的转录组,发现神经炎症中室管膜细胞呈现星形胶质细胞样反应性,并鉴定保守的胶质反应性特征 | 首次直接比较反应性室管膜细胞与反应性星形胶质细胞的转录组,揭示了保守的胶质反应性基因特征,并证明该特征在多种神经炎症背景下存在 | 未来工作需要探索驱动室管膜反应性的机制及下游功能后果 | 研究神经炎症中室管膜细胞的反应性转录特征及其与星形胶质细胞反应性的相似性 | 室管膜细胞和星形胶质细胞 | 机器学习 | 神经炎症 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 163 | 2026-05-31 |
The temporal protein signature analyses of developing human deciduous molar tooth germ
2024-10, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202300396
PMID:38522031
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析揭示了人类发育中的乳磨牙牙胚的时相性蛋白特征 | 首次利用蛋白质组学和单细胞RNA测序技术,系统分析了人类胚胎期乳磨牙从帽状期到钟状早期的时间依赖性蛋白质变化,并筛选出24个潜在的牙发育驱动蛋白 | 未提及具体局限性 | 探究人类乳磨牙牙胚发育过程中的时间依赖性蛋白质组变化,为牙齿发育和矿化组织畸形的机制研究提供资源 | 健康人类乳磨牙的牙胚组织 | 蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 人类胚胎期乳磨牙样本,涵盖帽状期到钟状早期 | NA | 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 164 | 2026-05-31 |
Biomarker discovery in hepatocellular carcinoma (HCC) for personalized treatment and enhanced prognosis
2024-10, Cytokine & growth factor reviews
IF:9.3Q1
DOI:10.1016/j.cytogfr.2024.08.006
PMID:39191624
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综述 | 本文综述肝细胞癌生物标志物发现及其在个性化治疗和预后改善中的作用 | 系统整合了蛋白质组学技术、免疫标志物及新兴单细胞测序和机器学习在肝细胞癌生物标志物发现中的应用前景 | 生物标志物验证、标准化、临床整合及成本障碍仍存在挑战 | 探讨肝细胞癌生物标志物在早期检测、精确诊断和个性化治疗中的潜力 | 肝细胞癌患者及相关生物标志物(如甲胎蛋白、磷脂酰肌醇蛋白聚糖3、脱-γ-羧基凝血酶原、PD-L1、肿瘤浸润淋巴细胞等) | 机器学习 | 肝癌 | NGS, 质谱分析, 液体活检 | NA | NA | NA | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 165 | 2026-05-31 |
Single-cell proteomics by mass spectrometry: Advances and implications in cancer research
2024-06, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202300210
PMID:38727198
|
研究论文 | 本文综述了单细胞蛋白质组学在癌症研究中的应用,并揭示了该技术的最新发展进展 | 本文重点介绍了单细胞蛋白质组学在癌症研究中的新兴应用,并分析了该领域的研究空白和未来方向 | 本文未明确指出局限性,但可能受限于单细胞蛋白质组学技术的当前发展水平和数据复杂性 | 总结单细胞蛋白质组学在癌症研究中的应用,并推动该技术在癌症研究中的进一步发展 | 单细胞蛋白质组学技术及癌症研究领域 | 机器学习 | 癌症 | 质谱法 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2026-05-31 |
Advancing skeletal health and disease research with single-cell RNA sequencing
2024-05-30, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00538-3
PMID:38816888
|
综述 | 全面介绍了单细胞RNA测序技术在骨骼健康与疾病研究中的应用,包括细胞获取方法、技术概述和生物信息学分析流程 | 提出了一种从骨骼组织中获取高质量单细胞的简化方法,并系统总结了scRNA-seq在脊柱、关节、骨、肌肉和肌腱疾病中的最新研究进展 | 高度矿化的骨骼组织在单细胞水平上研究机制仍面临技术挑战 | 推动对骨骼疾病细胞和分子水平病理过程的理解,发现新的治疗靶点 | 骨骼组织中的细胞,包括脊柱、关节、骨、肌肉和肌腱相关细胞 | 单细胞转录组学 | 退行性椎间盘疾病, 骨关节炎, 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 167 | 2026-05-31 |
Interferon-α stimulates DExH-box helicase 58 to prevent hepatocyte ferroptosis
2024-04-15, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00524-9
PMID:38622688
|
研究论文 | 本研究揭示干扰素-α通过刺激DExH盒螺旋酶58防止肝细胞铁死亡,为肝缺血再灌注损伤提供潜在治疗策略 | 首次发现DHX58作为RNA结合蛋白,通过招募m6A读取器YTHDC2促进GPX4 mRNA翻译,以m6A依赖方式抑制铁死亡,并揭示IFN-α在其中的调控作用 | 未提及具体局限性 | 探究DEAD/DExH盒螺旋酶家族成员在肝缺血再灌注损伤中调控肝细胞铁死亡的机制 | 肝细胞特异性Dhx58敲除小鼠和肝脏I/R损伤模型 | 数字病理学 | 其他疾病(肝缺血再灌注损伤) | 转录组分析、单细胞RNA测序、RNA免疫沉淀测序、免疫沉淀质谱 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 肝细胞特异性Dhx58敲除小鼠;肝脏I/R损伤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 168 | 2026-05-31 |
The implications of single-cell RNA-seq analysis in prostate cancer: unraveling tumor heterogeneity, therapeutic implications and pathways towards personalized therapy
2024-04-11, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00526-7
PMID:38605399
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在揭示前列腺癌肿瘤异质性、治疗意义及个性化治疗路径中的应用 | 系统总结了单细胞RNA测序与其他单细胞技术在前列腺癌研究中的综合应用,特别是小鼠与人类前列腺癌差异及多组学整合分析 | 单细胞技术在前列腺癌中的应用仍有限,现有研究多集中于特定亚型,未来需扩大样本和数据类型 | 探讨单细胞RNA测序在前列腺癌基础与临床研究中的意义,并为个性化医疗提供新见解 | 前列腺癌肿瘤细胞及微环境 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 169 | 2026-05-31 |
FOXO1 reshapes neutrophils to aggravate acute brain damage and promote late depression after traumatic brain injury
2024-03-31, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00523-w
PMID:38556884
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学、代谢组学和蛋白质组学分析,发现FOXO1高表达的中性粒细胞在创伤性脑损伤急性和慢性阶段的作用 | 首次揭示了FOXO1高表达中性粒细胞作为一种新型中性粒细胞表型,在创伤性脑损伤急性和慢性阶段通过不同机制促进脑损伤和晚期抑郁 | 未提及明显局限性,但可能需进一步验证机制在人体的普适性 | 探究中性粒细胞在创伤性脑损伤后的异质性、多功能性和时间依赖性调控,以及FOXO1在其中介导的脑损伤和行为结局 | 创伤性脑损伤患者和小鼠模型的中性粒细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、代谢组学、蛋白质组学、染色质免疫沉淀、双荧光素酶报告基因 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、代谢组数据、蛋白质组数据 | 创伤性脑损伤患者和FOXO1条件性基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 170 | 2026-05-31 |
A single-cell atlas of the murine pancreatic ductal tree identifies novel cell populations with potential implications in pancreas regeneration and exocrine pathogenesis
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.582044
PMID:38463969
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序构建小鼠胰腺导管树图谱,发现新的导管细胞群体及其在胰腺再生和外分泌病理中的潜在作用 | 首次在单细胞分辨率下全面描绘从小叶中心细胞到主导管的整个小鼠胰腺导管上皮图谱,鉴定出15个导管细胞群体及其器官形成和内分泌分化能力 | 未提供具体限制信息 | 探究胰腺导管细胞在单细胞水平上的异质性及其在胰腺再生和外分泌发病机制中的作用 | 小鼠胰腺导管上皮细胞 | 数字病理学 | 胰腺疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 健康小鼠胰腺样本、慢性胰腺炎和胰腺肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 171 | 2026-05-31 |
Targeting PLCG2 Suppresses Tumor Progression, Orchestrates the Tumor Immune Microenvironment and Potentiates Immune Checkpoint Blockade Therapy for Colorectal Cancer
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.98200
PMID:39494327
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研究论文 | 本文探究PLCG2在结直肠癌进展、肿瘤免疫微环境和增强免疫检查点阻断治疗中的作用 | 首次发现PLCG2可作为结直肠癌精准生物标志物和治疗靶点,逆转免疫逃逸及免疫检查点阻断治疗耐药 | 未提及 | 研究PLCG2在结直肠癌进展、肿瘤微环境及增强免疫检查点阻断治疗中的作用 | 结直肠癌患者及临床样本、细胞和动物模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq、单细胞转录组、空间转录组、蛋白印迹、定量逆转录PCR、多色免疫荧光、多重免疫组化、流式细胞术、动物模型 | NA | 基因表达数据、图像 | 结直肠癌患者样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 172 | 2026-05-31 |
Reconstruction of the Hepatic Microenvironment and Pathological Changes Underlying Type II Diabetes through Single-Cell RNA Sequencing
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.99176
PMID:39494341
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序重建II型糖尿病肝脏微环境及病理变化 | 首次利用单细胞RNA-seq技术系统性地探索了两种T2DM小鼠模型中肝脏微环境的变化,揭示了肝星状细胞活化、Kupffer细胞新亚群及细胞间相互作用在糖尿病性MAFLD进展中的动态作用 | 研究对象仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;对某些基因(如Tgfb1i1、Txnip)的功能机制仍需进一步探索 | 阐明II型糖尿病并发代谢相关脂肪性肝病在不同阶段的肝脏微环境变化和病理机制 | II型糖尿病小鼠模型(两种)的肝脏组织 | 单细胞转录组学 | II型糖尿病、代谢相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 两种T2DM小鼠模型肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 173 | 2026-05-31 |
Complement C1q is a key player in tumor-associated macrophage-mediated CD8+ T cell and NK cell dysfunction in malignant pleural effusion
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.100607
PMID:39664577
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研究论文 | 本研究揭示了补体C1q在恶性胸腔积液中通过肿瘤相关巨噬细胞介导CD8+ T细胞和NK细胞功能障碍的关键作用 | 首次通过全基因和巨噬细胞特异性敲除小鼠模型提供C1q介导巨噬细胞促进肿瘤的直接证据,并阐明C1q通过CCR2-CCL2信号轴调控免疫抑制的机制 | 未明确说明研究局限性 | 探究C1q在恶性胸腔积液中巨噬细胞介导的免疫抑制机制 | 小鼠恶性胸腔积液模型及C1q缺陷巨噬细胞 | 机器学习 | 恶性胸腔积液 | scRNA-seq, 代谢组学分析 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | C1qa小鼠MPE模型(具体样本数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | NA |
| 174 | 2026-05-31 |
Single-Nucleus Transcriptome Profiling of Dorsolateral Prefrontal Cortex: Mechanistic Roles for Neuronal Gene Expression, Including the 17q21.31 Locus, in PTSD Stress Response
2023-10-01, The American journal of psychiatry
DOI:10.1176/appi.ajp.20220478
PMID:37491937
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研究论文 | 通过单核RNA测序解析创伤后应激障碍和重性抑郁障碍中背外侧前额叶皮层的细胞类型特异性转录组机制 | 首次在创伤后应激障碍中开展死后脑组织的单核RNA测序研究,以细胞类型分辨率揭示疾病转录组病理,并发现17q21.31位点基因在应激反应中的新作用 | 研究样本量相对有限(32个样本用于发现,15个用于复制),可能影响统计效力;此外,死后脑组织研究无法直接观察活体动态过程 | 阐明创伤后应激障碍和重性抑郁障碍背外侧前前额叶皮层的细胞类型特异性转录组病理及其在应激反应中的作用机制 | 背外侧前额叶皮层样本,包括创伤后应激障碍患者、重性抑郁障碍患者和对照个体 | 自然语言处理 | 创伤后应激障碍, 重性抑郁障碍 | 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 发现阶段:32个样本(约415K细胞核,每样本>13K细胞);复制阶段:15个样本(约160K细胞核,每样本>11K细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 175 | 2026-05-31 |
Spatial transcriptomics stratifies psoriatic disease severity by emergent cellular ecosystems
2023-06-08, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq7991
PMID:37267384
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研究论文 | 通过空间转录组学分析,揭示了银屑病皮肤病变中不同严重程度的分层特征及系统性影响 | 首次利用空间转录组学结合单细胞转录组数据,在组织尺度上绘制银屑病皮肤炎症微环境图谱,并发现轻度与重度银屑病具有不同的分子特征 | 样本量较小(25例活检样本),且未详细说明远端非病变皮肤样本中代谢功能改变的因果关系 | 研究银屑病皮肤炎症的组织背景及系统性影响,探索疾病严重程度的空间分子标志 | 健康皮肤、活动性银屑病病变皮肤及临床非病变皮肤活检样本 | 空间转录组学 | 银屑病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、单细胞转录组数据 | 25例活检样本(健康、活动性病变、非病变) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 176 | 2026-05-31 |
JAG1-NOTCH4 mechanosensing drives atherosclerosis
2022-09-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo7958
PMID:36044575
|
研究论文 | 以猪、小鼠动脉及培养的人冠状动脉内皮细胞为对象,发现扰动血流激活JAG1-NOTCH4信号通路驱动动脉粥样硬化,并揭示内皮细胞异质性的调控机制 | 首次揭示Notch通路(JAG1-NOTCH4)在扰动血流感知中的功能,并阐明其通过调控内皮细胞异质性增强动脉粥样硬化易感性的机制 | 未明确说明,但从标题和摘要推断可能包括:研究主要集中在动物模型和体外培养细胞,人类动脉粥样硬化的直接证据有限 | 探究扰动血流如何通过Notch通路驱动动脉粥样硬化 | 猪动脉、小鼠动脉、培养的人冠状动脉内皮细胞 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、光片成像 | NA | 基因表达数据、图像 | 猪动脉、小鼠动脉及培养的人冠状动脉内皮细胞(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 177 | 2026-05-31 |
Transcriptional and functional divergence in lateral hypothalamic glutamate neurons projecting to the lateral habenula and ventral tegmental area
2021-12-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2021.09.020
PMID:34624220
|
研究论文 | 该研究通过病毒示踪、单细胞测序、电生理和体内钙成像等方法,系统比较了外侧下丘脑(LHA)中投射至外侧缰核(LHb)和腹侧被盖区(VTA)的谷氨酸能神经元的转录组和功能差异 | 首次系统揭示了LHA中投射至不同脑区(LHb和VTA)的谷氨酸能神经元在解剖、转录、电生理和功能上的显著差异,并发现投射至LHb的神经元对饱腹状态和进食激素特别敏感 | 未明确提及局限性 | 解析LHA中不同投射特异性神经元群体的功能异质性 | 小鼠LHA中投射至LHb和VTA的谷氨酸能神经元 | 神经科学 | NA | 病毒示踪, 单细胞测序, 电生理记录, 体内钙成像 | NA | 神经元投射数据, 单细胞转录组数据, 电生理数据, 钙成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 178 | 2026-05-31 |
Multiomic Analysis of Subtype Evolution and Heterogeneity in High-Grade Serous Ovarian Carcinoma
2020-10-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-0521
PMID:32747365
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示高级别浆液性卵巢癌亚型进化与异质性 | 采用绝对拷贝数分析与基因表达的新型整合分析方法,并结合单细胞测序,挑战了传统离散转录组亚型分类,提出连续肿瘤发展模型 | 未明确提及研究局限性 | 解析高级别浆液性卵巢癌亚型进化时序及其与肿瘤纯度、倍性、亚克隆性的关系,评估亚型作为治疗靶点的适用性 | 高级别浆液性卵巢癌肿瘤样本及六例独立肿瘤的单细胞数据 | 机器学习 | 卵巢癌 | 绝对拷贝数分析、基因表达分析、单细胞测序 | 连续肿瘤发展模型 | 基因表达数据、拷贝数数据、单细胞测序数据 | TCGA数据集及六例独立肿瘤的42,000个肿瘤细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 179 | 2026-05-31 |
Resolving medulloblastoma cellular architecture by single-cell genomics
2019-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1434-6
PMID:31341285
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研究论文 | 利用单细胞转录组学研究25例髓母细胞瘤的瘤内和瘤间异质性,揭示其细胞结构及亚型特异性生物学 | 首次通过单细胞基因组学解析髓母细胞瘤各分子亚型的细胞组成和发育状态差异,并跨物种定义SHH和Group 4亚型的潜在起源细胞 | 样本量有限(仅25例),可能未涵盖所有亚型的完整细胞多样性;研究主要依赖转录组数据,缺乏蛋白质或表观遗传学层面的验证 | 探究髓母细胞瘤各分子亚型的细胞异质性及其在生物学和临床行为中的作用 | 25例髓母细胞瘤样本,涵盖WNT、SHH、Group 3和Group 4所有分子亚型 | 单细胞基因组学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 25例髓母细胞瘤患者肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 180 | 2026-05-31 |
Single-cell RNA sequencing reveals the impact of chromosomal instability on glioblastoma cancer stem cells
2019-05-31, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-019-0532-5
PMID:31151460
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示染色体不稳定性对胶质母细胞瘤癌症干细胞基因表达的影响 | 首次证明染色体不稳定性直接导致基因表达变化,并区分了拷贝数依赖和非依赖的差异表达基因,发现一个与肿瘤分级和患者生存预后相关的基因特征 | 使用细胞系而非原代肿瘤样本,可能无法完全反映体内肿瘤异质性;仅分析了单个CSC和NSC细胞系 | 研究染色体不稳定性引起的拷贝数变异如何影响胶质母细胞瘤癌症干细胞的单细胞基因表达 | 染色体不稳定的胶质母细胞瘤癌症干细胞系和正常二倍体神经干细胞系 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq | NA | 文本 | 两个细胞系(胶质母细胞瘤CSC系和正常NSC系) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |