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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-07-04 |
Attenuated kidney oxidative metabolism in young adults with type 1 diabetes
2024-10-22, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI183984
PMID:39436695
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研究论文 | 本论文研究了1型糖尿病年轻成人中肾脏氧化代谢减弱及其与糖尿病肾病早期发展的关系 | 首次结合单细胞RNA测序、空间代谢组学与伪时间轨迹分析,揭示1型糖尿病患者肾近端小管细胞亚型转换与氧化代谢减弱的分子机制 | 样本量较小(T1D组30例,对照组20例),且未进行纵向随访验证因果关系 | 探究1型糖尿病中胰岛素敏感性下降是否通过改变肾脏氧化代谢促进糖尿病肾病发生 | 年轻1型糖尿病成人患者与健康对照者 | digital pathology | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序,空间代谢组学,伪时间轨迹分析 | Slingshot算法 | 基因表达数据,代谢物空间分布数据 | 30例1型糖尿病年轻患者和20例健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学 | NA | 使用11C-醋酸盐PET进行氧化代谢成像 |
| 162 | 2026-07-04 |
Evaluation of single-cell sorting accuracy using antibody-derived tag-based qPCR
2024-10, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24888
PMID:39132928
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研究论文 | 开发了一种基于抗体衍生标签的qPCR方法,用于评估单细胞分选准确性 | 首次利用抗体衍生标签(ADTs)结合多路TaqMan qPCR来确认分选后单细胞的蛋白表达,从而验证单细胞分选准确性 | 未在标题和摘要中明确提及局限性 | 开发一种新型检测方法,以确认分选单细胞的蛋白表达,并评估单细胞分选准确性 | 分选后的单细胞及全细胞裂解液 | NA | NA | qPCR, 荧光激活细胞分选(FACS), 抗体衍生标签(ADTs) | NA | NA | NA | Thermo Fisher | NA | TaqMan | 多路TaqMan qPCR |
| 163 | 2026-07-04 |
CXCL8 secreted by immature granulocytes inhibits WT hematopoiesis in chronic myelomonocytic leukemia
2024-09-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI180738
PMID:39545419
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研究论文 | 本研究探讨了未成熟粒细胞分泌的CXCL8抑制慢性粒单核细胞白血病中正常造血干细胞增殖的机制 | 首次发现未成熟粒细胞通过分泌CXCL8选择性抑制正常造血干细胞,而白血病干细胞因下调CXCL8受体得以逃逸,并证明阻断CXCL8可恢复正常造血 | 未提及具体局限性,但需进一步验证CXCL8靶向治疗的临床可行性 | 阐明未成熟粒细胞在CMML进展中的炎症作用及其对正常造血的抑制机制 | 慢性粒单核细胞白血病患者的未成熟粒细胞、正常和白血病造血干细胞与祖细胞 | 数字病理学, 机器学习 | 慢性粒单核细胞白血病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 164 | 2026-07-04 |
Points2Regions: Fast, interactive clustering of imaging-based spatial transcriptomics data
2024-09, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24884
PMID:38958502
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研究论文 | 介绍了一种用于成像空间转录组学数据快速交互聚类的工具Points2Regions | 通过将mRNA点栅格化到金字塔网格上进行快速特征提取,并结合层次聚类和K-means聚类实现高效的多尺度区域发现,无需依赖分割细胞等补充数据 | 未明确提及局限性,可能包括对真实数据集的验证有限或需要进一步评估不同实验条件下的性能 | 开发一种快速交互式的计算工具,用于识别成像空间转录组学数据中具有相似mRNA组成区域,支持多尺度分析 | 成像空间转录组学数据中的mRNA空间点数据 | 数字病理学 | NA | 成像空间转录组学 | 层次聚类和K-means聚类 | 图像 | 两个模拟数据集和多个真实世界数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 165 | 2026-07-04 |
Impact of different tissue dissociation protocols on endothelial cell recovery from developing mouse lungs
2024-07, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24843
PMID:38668123
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研究论文 | 评估不同组织解离方案对从发育中小鼠肺中回收内皮细胞的影响 | 首次系统比较胶原酶A和分散酶两种酶解方法对幼年和成年小鼠肺内皮细胞回收效率及亚型组成的影响,并利用单细胞RNA-Seq揭示不同方法导致的细胞亚型偏差 | 仅限于小鼠肺组织,未涉及其他组织或物种;未深入探讨酶解对细胞功能的影响 | 比较不同组织解离方案对内皮细胞回收效率及亚型组成的影响 | 幼年和成年小鼠肺组织中的内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 小鼠肺组织样本(幼年和成年) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 166 | 2026-07-04 |
Advances in preclinical assessment of therapeutic targets for bladder cancer precision medicine
2024-07-01, Current opinion in urology
IF:2.1Q2
DOI:10.1097/MOU.0000000000001177
PMID:38602053
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综述 | 综述膀胱癌精准医学治疗靶点的临床前评估进展 | 重点介绍了抗体-药物偶联物(ADC)联合免疫疗法、单细胞RNA测序技术及功能精准医学等新策略在膀胱癌靶向治疗中的应用 | 未提及具体临床验证数据及治疗方案的长期效果评估 | 旨在改善膀胱癌患者个体化治疗和疗效 | 膀胱癌患者 | 机器学学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 167 | 2026-07-04 |
Recent contributions of single-cell and spatial profiling to the understanding of bladder cancer
2024-07-01, Current opinion in urology
IF:2.1Q2
DOI:10.1097/MOU.0000000000001183
PMID:38650456
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综述 | 总结了单细胞和空间组学方法在理解膀胱癌生物学方面的最新进展及其对开发新型治疗策略的潜在影响 | 整合单细胞RNA测序与空间组学技术,以前所未有的分辨率揭示膀胱癌肿瘤微环境、异质性、癌症干细胞性和细胞可塑性 | 将研究成果转化为临床实践和实施个性化治疗策略仍面临挑战 | 探讨单细胞和空间组学技术对膀胱癌生物学理解的贡献及对治疗方案的影响 | 膀胱癌肿瘤微环境中的恶性细胞亚群、免疫细胞、癌症相关成纤维细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 空间组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 168 | 2026-07-04 |
Comprehensive single-cell atlas of the mouse retina
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109916
PMID:38812536
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研究论文 | 生成了迄今最大规模的小鼠视网膜单细胞RNA测序数据集,并整合公共数据构建了涵盖12个主要类别和138种细胞类型的小鼠视网膜细胞图谱(MRCA) | 通过抗体介导的磁珠分选富集稀有细胞群体,生成了约190,000个单细胞的最大视网膜scRNA-seq数据集,并整合公共数据构建了包含330,000个细胞、138种细胞类型的综合图谱,发现新细胞类型并提供了公共访问资源 | 未提及具体局限性 | 构建全面的小鼠视网膜单细胞基因表达图谱,填补现有数据集的局限性 | C57BL/6J小鼠视网膜细胞 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞基因表达数据 | 约190,000个单细胞(来自C57BL/6J小鼠视网膜),整合后超过330,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 169 | 2026-07-04 |
Silencing XIST on the future active X: Searching human and bovine preimplantation embryos for the repressor
2024-04, European journal of human genetics : EJHG
IF:3.7Q2
DOI:10.1038/s41431-022-01115-9
PMID:35585273
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和qRT-PCR技术,研究人类和牛胚胎着床前XIST基因在活性X染色体上的沉默机制 | 首次在人类和牛胚胎中系统检测了XIST在活性X染色体上的表达时间,并确定了DNMT1、UHRF1、SAFB和SAFB2在XIST抑制中的潜在作用 | 仅分析了人类和牛胚胎着床前的特定阶段,未涉及其他哺乳动物或更广泛的发育时期 | 探索活性X染色体免受XIST介导失活的保护机制 | 人类和牛着床前胚胎中XIST的表达调控机制 | 基因表达调控 | NA | 单细胞RNA测序、qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 人类胚胎和牛胚胎的多个发育阶段(4-8细胞期、桑椹胚期、早期囊胚期) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 170 | 2026-07-04 |
Transcriptomic research in atherosclerosis: Unravelling plaque phenotype and overcoming methodological challenges
2023-Dec, Journal of molecular and cellular cardiology plus
DOI:10.1016/j.jmccpl.2023.100048
PMID:39802625
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综述 | 探讨转录组研究在揭示动脉粥样硬化斑块表型及克服方法学挑战中的作用 | 系统讨论了整体和单细胞测序等最新转录组技术进展在斑块表型分析中的附加价值,并强调了多组学数据整合和机器学习对理解动脉粥样硬化的贡献 | 该领域研究结果可重复性低且缺乏标准化流程 | 阐明转录组研究如何帮助理解动脉粥样硬化斑块的不同表型及其在疾病发生发展中的作用 | 动脉粥样硬化斑块 | 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组测序、单细胞测序 | NA | 转录组数据、多组学数据 | NA | NA | 整体RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 171 | 2026-07-03 |
Sini decoction inhibits colorectal cancer liver metastasis by suppressing HIF-1α-dependent exosomal integrin signaling
2026-Nov-15, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121951
PMID:42259422
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研究论文 | 该研究探讨了四逆汤通过抑制HIF-1α依赖性外泌体整合素信号来抑制结直肠癌肝转移的作用和机制 | 首次揭示四逆汤通过靶向HIF-1α减少ITGαvβ5富集的外泌体分泌,进而阻断M2巨噬细胞极化,从而抑制结直肠癌肝转移 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步的临床验证来确认其转化潜力 | 阐明四逆汤抑制结直肠癌肝转移的活性成分和机制,重点关注肿瘤来源外泌体和巨噬细胞极化 | 小鼠结直肠癌肝转移模型及其肿瘤微环境 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠结直肠肝转移模型(具体样本量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 172 | 2026-07-03 |
The crosstalk between SPP1+ macrophages and follicular helper T cells promotes the immune disorder of Graves' disease
2026-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110712
PMID:42128213
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研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学揭示Graves病中SPP1+巨噬细胞与滤泡辅助性T细胞的相互作用促进免疫紊乱 | 首次在Graves病中通过单细胞和空间转录组学联合分析,发现SPP1+巨噬细胞与CXCL13+ Tfh细胞通过SPP1-CD44相互作用加重免疫微环境失调,并揭示SPP1+巨噬细胞通过SPP1和VEGF信号通路促进新生血管内皮细胞形成 | NA | 探究Graves病甲状腺组织中免疫细胞和空间基因表达模式的变化,以及SPP1+巨噬细胞在疾病免疫紊乱中的作用 | Graves病患者、缓解期患者和正常对照个体的甲状腺组织 | 数字病理学 | 自身免疫性甲状腺疾病 | 单细胞转录组测序,空间转录组技术 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 对照个体、Graves病患者和缓解期患者的甲状腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 173 | 2026-07-03 |
JAK-STAT3-MYC axis defines pathogenic stem cell-like memory CD4+ T cells in rheumatoid arthritis
2026-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110733
PMID:42309459
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,揭示了类风湿关节炎患者CD4+ Tscm细胞中JAK-STAT3-MYC轴驱动致病性干细胞样记忆T细胞的作用 | 首次在类风湿关节炎Tscm细胞中鉴定出STAT3-MYC转录特征,并揭示其与治疗抵抗及疾病严重程度的相关性 | JAK抑制剂仅部分抑制STAT3活性,未完全阻断信号通路,MYC作为潜在治疗靶点需进一步验证 | 探究类风湿关节炎中CD4+ Tscm细胞的分子特征及其在慢性免疫激活中的致病机制 | 11名类风湿关节炎患者和8名健康对照的CD4+ Tscm细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 | 不适用 | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 11名类风湿关节炎患者和8名健康对照的外周血Tscm细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于Tscm细胞转录组分析,同时结合蛋白质组学分析 |
| 174 | 2026-07-03 |
Multiomic Single-Cell Sequencing Identifies BCR::ABL1 as an Acquired Resistance Mechanism in FLT3+ AML
2026-Aug, European journal of haematology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/ejh.70207
PMID:42046307
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研究论文 | 利用多组学单细胞测序识别FLT3阳性急性髓系白血病中BCR::ABL1作为获得性耐药机制 | 首次通过多组学单细胞DNA测序在单细胞分辨率下揭示BCR::ABL1获得作为FLT3-ITD AML患者对FLT3抑制剂耐药的克隆演化机制 | 基于单个病例的研究,结果可能需在更大样本中验证 | 阐明FLT3突变型AML中BCR::ABL1获得性耐药机制的克隆演化特征 | FLT3-ITD突变型急性髓系白血病患者 | 基因组学 | 急性髓系白血病 | 多组学单细胞DNA测序 | NA | 单细胞基因组数据 | 1例FLT3-ITD AML患者 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 175 | 2026-07-03 |
Cross-stage single-cell and spatial metabolome analyses reveal periderm specialization and tanshinone biosynthesis in Salvia miltiorrhiza roots
2026-Aug, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.71285
PMID:42169223
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研究论文 | 通过跨阶段单细胞和空间代谢组分析揭示丹参根周皮特化和丹参酮生物合成机制 | 首次结合单细胞RNA测序与空间代谢组学,构建丹参根从表皮到周皮的发育轨迹,鉴定与二萜生物合成相关的转录程序,并预测SmCYP76AK5参与丹参酮合成 | 未提及明确局限性 | 解析多年生根中周皮分化和次生代谢的细胞程序 | 丹参(Salvia miltiorrhiza)根在不同发育阶段的细胞类型组成和转录动态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间代谢组数据 | 不同发育阶段的丹参根样品 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 176 | 2026-07-03 |
Chromatin and genomic instability in the cochlea contributing to age-related hearing loss: Insights from in vitro and in vivo models
2026-Aug, Hearing research
IF:2.5Q1
DOI:10.1016/j.heares.2026.109691
PMID:42263393
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研究论文 | 通过体外和体内模型研究染色质和基因组不稳定性在年龄相关性听力损失中的贡献 | 结合多种体内外模型和单细胞RNA测序技术,首次揭示外毛细胞在衰老过程中染色质和基因组不稳定性的具体变化,并验证了ATRX基因的差异表达 | 具体限制未在标题和摘要中提及 | 探讨染色质和基因组不稳定性在年龄相关性听力损失中的作用机制 | 年龄相关性听力损失的小鼠模型(HEI-OC1细胞及Corti器、血管纹、螺旋神经节细胞)和转基因小鼠(tdTomato标记外毛细胞) | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 177 | 2026-07-03 |
Targeting YAP1-Mediated Tubular Cell Senescence to Attenuate Maladaptive Repair and Fibrotic Transition After Acute Kidney Injury
2026-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503969RR
PMID:42381472
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研究论文 | 探讨YAP1介导的肾小管细胞衰老在急性肾损伤后修复及纤维化转变中的机制 | 首次揭示YAP1持续过表达通过驱动肾小管细胞衰老促进急性肾损伤向慢性肾病转变,并提出衰老细胞清除药物或维替泊芬可双重保护再生能力并抑制纤维化 | 未明确YAP1调控衰老的具体信号通路细节,且体内外模型可能不能完全模拟人类疾病的全部特征 | 阐明急性肾损伤后肾小管细胞衰老及上皮-间质转化在不良修复和纤维化中的分子机制,探索治疗靶点 | 小鼠肾组织(IRI及叶酸模型)、人肾小管上皮HK-2细胞 | 机器学习和数字病理学 | 肾脏疾病(急性肾损伤及慢性肾病) | 单细胞RNA测序(ScRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 人肾组织活检样本(GSE212273)及小鼠模型(未明确数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 178 | 2026-07-03 |
Tumor-Infiltrating Platelets Recruit Neutrophils to Promote Tumor Growth through the 5-HIAA-GPR35-ERK1/2 Axis in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jul-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0498
PMID:41962042
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研究论文 | 该论文发现肿瘤浸润血小板通过5-HIAA-GPR35-ERK1/2轴招募中性粒细胞促进肝细胞癌生长 | 首次揭示肿瘤浸润血小板与肿瘤相关中性粒细胞在肝细胞癌中的空间共定位,并阐明其通过5-HIAA-GPR35-ERK1/2信号轴促进肿瘤生长的机制 | NA | 探究肝细胞癌中肿瘤浸润血小板与肿瘤相关中性粒细胞的关系及其促进肿瘤生长的分子机制 | 肝细胞癌患者样本、Hepa1-6小鼠模型、血小板和中性粒细胞 | NA | 肝细胞癌 | 多重免疫组化、Transwell迁移实验、代谢组学分析、单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 患者来源的肝细胞癌样本,Hepa1-6小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 179 | 2026-07-03 |
NMB+CXCL13+CD4+ T Cell-Derived Neuromedin B Promotes Neuropeptide S Receptor 1-Positive Malignant Cell Senescence and Malignancy
2026-Jul-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1081
PMID:42029557
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序整合分析,发现NMB+CXCL13+CD4+ T细胞通过NMB-NPSR1轴促进结直肠癌恶性细胞的衰老与转移 | 首次鉴定出促转移的NMB+CXCL13+CD4+ T细胞亚群,并揭示了其通过NMB-NPSR1轴调控肿瘤细胞“衰老-恶性转化”的新机制 | 作为原理验证研究,仍需进一步验证SHA68与抗PD-1联合治疗在临床中的效果 | 探究CXCL13+CD4+ T细胞亚群在结直肠癌肝转移中的功能异质性及其机制 | 结直肠癌临床样本及泛癌数据集中的CD4+ T细胞和恶性细胞 | 自然语言处理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 结直肠癌临床样本及泛癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 180 | 2026-07-03 |
CD28+ CD8+ Tem cells with a STAT1-dependent glucocorticoid receptor deficit contribute to steroid-refractory acute GVHD
2026-Jul-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025032587
PMID:41980031
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研究论文 | 该研究通过整合多组学方法,发现CD28+ CD8+ Tem细胞中STAT1依赖性糖皮质激素受体缺陷是导致类固醇难治性急性移植物抗宿主病的关键机制 | 首次通过多中心队列验证CD28+ CD8+ Tem细胞绝对计数作为类固醇耐药预测生物标志物,并揭示STAT1-糖皮质激素受体调控轴在类固醇抵抗中的核心作用 | 未详细说明研究样本的种族多样性及潜在混杂因素控制,回顾性研究设计可能引入选择偏倚 | 阐明类固醇难治性急性移植物抗宿主病的免疫机制并寻找预测性生物标志物 | 异基因造血细胞移植后无aGVHD、类固醇敏感aGVHD和类固醇难治性aGVHD患者的外周血样本 | 数字病理学 | 移植物抗宿主病 | NGS, RNA-seq, 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | 图像, 文本 | 多中心队列包含无aGVHD、类固醇敏感aGVHD和类固醇难治性aGVHD患者的外周血样本,具体数量未在摘要中说明 | Illumina, 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | Illumina NovaSeq, 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |