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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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161 | 2025-05-13 |
Polymorphisms in immunosuppression-related genes are associated with AML
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1530510
PMID:39975548
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研究论文 | 研究免疫抑制相关基因多态性与急性髓系白血病(AML)的关联 | 首次报道了特定SNPs在AML免疫抑制相关基因中的保护性和风险性作用 | 样本量相对有限,未进行功能验证实验 | 探索免疫抑制相关基因多态性对AML易感性、治疗反应和预后的影响 | 307名AML患者和316名健康个体的DNA样本 | 血液肿瘤遗传学 | 急性髓系白血病 | SNP基因分型(MassARRAY平台) | NA | 基因型数据 | 307例AML患者和316例健康对照 |
162 | 2025-05-13 |
Unveiling macrophage dynamics and efferocytosis-related targets in diabetic kidney disease: insights from single-cell and bulk RNA-sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1521554
PMID:40046045
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研究论文 | 通过单细胞和批量RNA测序揭示糖尿病肾病中巨噬细胞动态变化和胞葬作用相关靶点 | 阐明了巨噬细胞亚型转变的动态过程,并确定了三个关键基因作为巨噬细胞胞葬作用的关键调节因子 | 研究主要基于早期糖尿病肾病患者的测序数据,可能无法完全反映疾病晚期的变化 | 阐明糖尿病肾病中巨噬细胞异质性和表型动态变化,并确定胞葬作用中的关键靶点 | 糖尿病肾病患者的巨噬细胞 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 早期糖尿病肾病患者的测序数据 |
163 | 2025-05-13 |
Single-cell genomics and spatial transcriptomics in islet transplantation for diabetes treatment: advancing towards personalized therapies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1554876
PMID:40051625
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综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学在胰岛移植治疗糖尿病中的应用及其潜力 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,全面解析胰岛移植中的细胞多样性和微环境 | 需解决伦理和技术挑战以实现这些整合方法在研究和临床实践中的成功应用 | 推进糖尿病治疗中的个性化疗法 | 胰岛移植 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
164 | 2025-05-13 |
Development of a prognostic model for hepatocellular carcinoma based on microvascular invasion characteristic genes by spatial transcriptomics sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1529569
PMID:40051627
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研究论文 | 本研究通过空间转录组测序技术,基于微血管侵犯特征基因开发了一种新的肝细胞癌预后预测模型 | 首次利用空间转录组测序技术筛选MVI区域特异性基因,构建了7基因预后模型,并在三个外部验证队列中证实其预测性能优于现有模型 | 研究样本量较小(仅4个MVI样本),需要更大规模临床验证 | 开发基于微血管侵犯特征基因的肝细胞癌预后预测模型 | 肝细胞癌患者(HCC)及微血管侵犯(MVI)样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间转录组测序,单核RNA测序 | Cox回归分析,LASSO回归,随机生存森林 | 基因表达数据 | 4个不同分级的MVI样本,三个外部验证队列 |
165 | 2025-05-13 |
Single-cell analysis of CD14+CD16+ monocytes identifies a subpopulation with an enhanced migratory and inflammatory phenotype
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1475480
PMID:40051633
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析CD14+CD16+单核细胞,识别出一个具有增强迁移和炎症表型的亚群 | 首次在CD14+CD16+单核细胞中识别出具有增强迁移和炎症表型的Group 1单核细胞亚群,并揭示了其在神经炎症疾病中的潜在作用 | 研究仅基于体外实验和单细胞RNA测序数据,未进行体内功能验证 | 探究CD14+CD16+单核细胞的异质性及其在神经炎症疾病中的作用 | 人类CD14+CD16+单核细胞 | 单细胞生物学 | HIV相关神经认知障碍(HIV-NCI) | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
166 | 2025-05-13 |
Cellular and molecular determinants mediating the dysregulated germinal center immune dynamics in systemic lupus erythematosus
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1530327
PMID:40070830
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research paper | 该研究利用空间转录组学和多重成像技术,探讨了系统性红斑狼疮(SLE)患者淋巴结中滤泡免疫景观和原位转录组特征 | 揭示了SLE滤泡中I型干扰素和浆细胞特征的显著增强,以及滤泡T细胞亚群受I型干扰素影响的机制 | 研究样本可能有限,且未涉及其他潜在影响因素 | 探究SLE患者淋巴结滤泡免疫动态的细胞和分子决定因素 | 系统性红斑狼疮(SLE)患者淋巴结中的免疫细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 空间转录组学, 多重成像 | NA | 转录组数据, 图像数据 | 未明确说明样本数量 |
167 | 2025-05-13 |
Identification of prognostic biomarkers for endometrioid endometrial carcinoma based on the miRNA and mRNA co-expression network regulated by estradiol
2025, Clinics (Sao Paulo, Brazil)
DOI:10.1016/j.clinsp.2025.100672
PMID:40319860
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research paper | 本研究通过miRNA和mRNA共表达网络识别与雌二醇调控相关的子宫内膜样子宫内膜癌预后生物标志物 | 首次发现miR-142-5p-SACS和miR-30a-5p-GPR157作为雌二醇调控的潜在诊断和预后生物标志物 | 样本量相对较小,特别是原代测序部分仅使用9个样本 | 识别与雌二醇调控相关的子宫内膜样子宫内膜癌预后生物标志物 | 子宫内膜样子宫内膜癌(EEC)患者和经雌二醇处理的子宫内膜癌Ishikawa细胞系 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | RNA测序、单细胞转录组测序、功能富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | NA | RNA表达谱数据、单细胞转录组数据 | TCGA数据库408例EEC样本 + 9个细胞系样本(3个250nM雌二醇处理组/3个50nM处理组/3个对照组) |
168 | 2025-05-13 |
Tumor microenvironment-driven resistance to immunotherapy in non-small cell lung cancer: strategies for Cold-to-Hot tumor transformation
2025, Cancer drug resistance (Alhambra, Calif.)
DOI:10.20517/cdr.2025.14
PMID:40342732
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review | 该综述探讨了非小细胞肺癌(NSCLC)肿瘤微环境(TME)驱动的免疫治疗耐药机制,并提出了将冷肿瘤转化为热肿瘤的策略 | 提出了一个多维框架来转化冷肿瘤为热肿瘤,包括增强免疫浸润、调节免疫抑制网络和激活休眠免疫通路等策略,并强调了单细胞测序、空间转录组学和纳米医学等前沿技术的应用 | 综述性质文章,未进行原始实验验证,且部分新兴策略的临床效果尚待验证 | 克服非小细胞肺癌对免疫治疗的耐药性,提高免疫治疗效果 | 非小细胞肺癌及其肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞测序, 空间转录组学, 纳米医学 | NA | NA | NA |
169 | 2025-05-13 |
The Low Tumorigenic Risk and Subtypes of Cardiomyocytes Derived from Human-induced Pluripotent Stem Cells
2025, Current stem cell research & therapy
IF:2.1Q4
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research paper | 本研究评估了人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞(hiPSC-CMs)的肿瘤形成风险及其亚型组成,证实了其生物安全性并描述了心脏亚型的组成和表达谱 | 通过单细胞RNA测序和全外显子组测序等方法,首次全面评估了hiPSC-CMs的肿瘤形成风险,并详细描述了其亚型组成和成熟度 | 研究仅观察了移植后3个月的小鼠模型,长期肿瘤形成风险仍需进一步评估 | 评估hiPSC-CMs的肿瘤形成风险并明确其亚型组成,为其临床应用提供理论支持 | 人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞(hiPSC-CMs) | 干细胞研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq)、全外显子组测序(WES)、流式细胞术、分子生物学、细胞生物学、电生理学 | NA | 基因表达数据、测序数据 | 分化第25天的hiPSC-CMs,移植到NOD-SCID小鼠中观察3个月 |
170 | 2025-05-13 |
What single-cell RNA sequencing taught us about MGMT expression in glioblastoma
2025 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdaf058
PMID:40351834
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research paper | 该研究利用单细胞RNA测序技术探讨了胶质母细胞瘤中MGMT表达的情况 | 首次在单细胞水平上评估MGMT表达与MGMTp甲基化状态的关系 | 部分样本的MGMTp甲基化检测方法未明确,可能存在技术误差 | 研究胶质母细胞瘤中MGMT表达的连续性与MGMTp甲基化状态的关系 | 胶质母细胞瘤患者 | digital pathology | glioblastoma | single-cell RNA sequencing | NA | gene expression data | 来自3项研究的公开数据,具体样本数量未明确 |
171 | 2025-05-13 |
Recombinant interleukin-7 treatment of refractory Mycobacterium avium complex lung disease (IMPULSE-7): a pilot phase II, single-center, randomized, clinical trial
2025 Jan-Dec, Therapeutic advances in infectious disease
IF:3.8Q2
DOI:10.1177/20499361251339300
PMID:40351870
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research paper | 该研究评估了重组白细胞介素-7(IL-7)在治疗难治性鸟分枝杆菌复合体肺病(MAC-LD)患者中的效果 | 首次在难治性MAC-LD患者中评估IL-7的治疗效果,并利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)探索免疫抑制的潜在分子机制 | 样本量较小,且IL-7未能实现痰培养转阴 | 评估IL-7在难治性MAC-LD患者中的治疗效果 | 难治性鸟分枝杆菌复合体肺病(MAC-LD)患者 | NA | lung disease | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 临床数据 | 8名参与者(6名完成IL-7治疗方案) |
172 | 2025-05-13 |
Single-cell combined transcriptome probes prognostic mechanisms of sialylation-related genes in cervical cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1534247
PMID:40352586
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research paper | 该研究通过单细胞转录组分析,探讨了宫颈癌中唾液酸化相关基因的预后机制 | 首次构建了基于唾液酸化相关特征的宫颈癌预后模型,并利用单细胞RNA测序数据分析了关键细胞的作用 | 研究仅基于有限的转录组数据集(4个)和110个唾液酸化相关基因,样本量可能不足 | 开发宫颈癌预后模型并研究唾液酸化相关基因在宫颈癌中的变化机制 | 宫颈癌患者和唾液酸化相关基因 | digital pathology | cervical cancer | scRNA-seq, qRT-PCR | LASSO cox regression, nomogram model | transcriptome data | 4个转录组数据集(包含scRNA-seq数据)和临床样本 |
173 | 2025-05-13 |
Overexpression of MMP14 is associated with poor prognosis and immune cell infiltration in colon cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1564375
PMID:40352589
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研究论文 | 本研究探讨了MMP14在结肠癌中的过度表达与不良预后和免疫细胞浸润的关系 | 首次将MMP14与结肠癌的免疫微环境变化及预后联系起来,并构建了一个基于MMP14共表达基因的风险预测模型 | 样本量较小,仅包括4对患者的转录组测序数据,需要更多的体外和体内实验验证 | 研究MMP14在结肠癌中的调控作用及其对预后的影响 | 结肠癌组织和COLO205细胞 | 数字病理学 | 结肠癌 | 转录组测序、单细胞转录组分析、qRT-PCR、Western blotting、免疫荧光、HE染色 | Cox回归分析 | mRNA表达谱、临床数据 | 4对结肠癌患者的肿瘤和邻近非癌组织样本 |
174 | 2025-05-13 |
RGS14 binds to GNAI3 and regulates the proliferation and apoptosis of human spermatogonial stem cells by affecting PLPP2 expression and MAPK signaling
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1593595
PMID:40352663
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研究论文 | 本研究探讨了RGS14在人类精原干细胞增殖和凋亡中的调控作用及其在非梗阻性无精子症发病机制中的意义 | 揭示了RGS14-GNAI3-PLPP2调控轴在精原干细胞稳态中的关键作用,为男性不育治疗提供了新的潜在靶点 | 研究主要基于体外细胞实验和单细胞RNA测序,缺乏体内实验验证 | 探索非梗阻性无精子症患者精原干细胞功能障碍的分子机制 | 人类精原干细胞和非梗阻性无精子症患者睾丸组织 | 生殖医学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、RNA测序分析、蛋白质相互作用分析、共免疫沉淀实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 非梗阻性无精子症患者与正常睾丸组织的精原干细胞 |
175 | 2025-05-13 |
The miR-941/FOXN4/TGF-β feedback loop induces N2 polarization of neutrophils and enhances tumor progression of lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1561081
PMID:40352924
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研究论文 | 本研究揭示了miR-941/FOXN4/TGF-β反馈环路在肺腺癌(LUAD)中促进肿瘤相关中性粒细胞(TANs)N2极化及肿瘤进展的关键作用 | 首次发现miR-941通过FOXN4/TGF-β反馈环路驱动N2-TAN极化并促进LUAD进展 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型,临床样本验证有待加强 | 探究TANs中miRNA调控网络在LUAD进展中的作用机制 | 肺腺癌患者的肿瘤相关中性粒细胞(TANs)及A549/H1299细胞系 | 肿瘤微环境 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、qPCR、荧光素酶报告实验、WB、ELISA | 小鼠异种移植模型 | RNA测序数据、体外实验数据、体内实验数据 | 未明确说明患者样本量(使用公共单细胞RNA-seq数据)及细胞/动物实验样本 |
176 | 2025-05-13 |
Distinct Inflammatory Programs Underlie the Intramuscular Lipid Nanoparticle Response
2024-12-03, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c08490
PMID:39563529
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研究论文 | 研究探讨了mRNA/脂质纳米颗粒(LNP)在肌肉组织中的免疫原性及其对疫苗接种和基因治疗的影响 | 发现了两类炎症基因表达程序(炎症性和非炎症性),并揭示了mRNA和LNP在提供有效疫苗接种所需的先天免疫刺激中的协同作用 | 研究仅针对肌肉注射的LNP反应,未涉及其他给药途径或长期效应 | 评估mRNA/LNP的佐剂性及其在疫苗接种和基因治疗中的应用 | 肌肉组织和免疫细胞(如中性粒细胞、髓系细胞、脾细胞等) | 基因治疗 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9种化学性质不同的LNP |
177 | 2025-05-13 |
The relationship between Sjögren's syndrome and recurrent pregnancy loss: a bioinformatics analysis
2024-12, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2024.104363
PMID:39299134
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research paper | 通过生物信息学分析揭示干燥综合征与复发性流产之间的基因相关性 | 首次揭示干燥综合征与复发性流产共享生物学通路,并鉴定出关键基因KCNN3 | 研究基于公开数据库数据,需进一步实验验证 | 探索干燥综合征与复发性流产之间的基因相关性 | 干燥综合征和复发性流产患者的基因数据 | 生物信息学 | 干燥综合征, 复发性流产 | WGCNA, limma分析, 单细胞RNA测序, ceRNA网络构建 | NA | 基因表达数据 | 来自Gene Expression Omnibus数据库的样本数据 |
178 | 2025-05-13 |
Understanding the development of enzalutamide resistance based on a functional single-cell approach
2024-Oct-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.20.619319
PMID:39484437
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究前列腺癌细胞对恩杂鲁胺耐药性的发展机制 | 发现低表达或不表达雄激素受体(AR)的细胞亚群具有显著的转录反应,并证实其在体内外对恩杂鲁胺的耐药性 | 研究仅基于LNCaP细胞系,未涵盖其他前列腺癌细胞系或临床样本 | 探索前列腺癌细胞对恩杂鲁胺耐药性的发展机制及潜在治疗策略 | LNCaP前列腺癌细胞系 | 癌症研究 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | LNCaP细胞系中的AR+和AR-细胞亚群 |
179 | 2025-05-13 |
SUV39H1 Preserves Cancer Stem Cell Chromatin State and Properties in Glioblastoma
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.15.607856
PMID:39229036
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研究论文 | 本文揭示了SUV39H1在胶质母细胞瘤干细胞(GSCs)维持和肿瘤进展中的关键作用 | 首次报道SUV39H1在GSCs维持中的关键作用,并展示其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于体外和动物模型,尚未进行临床试验 | 探索SUV39H1在胶质母细胞瘤干细胞维持中的作用及其治疗潜力 | 胶质母细胞瘤干细胞(GSCs) | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、ATAC测序 | NA | RNA测序数据、染色质可及性数据 | 患者来源的GSCs和胶质母细胞瘤样本 |
180 | 2025-05-13 |
Single-cell transcriptional analysis of irradiated skin reveals changes in fibroblast subpopulations and variability in caveolin expression
2024-Jun-26, Radiation oncology (London, England)
DOI:10.1186/s13014-024-02472-z
PMID:38926892
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示辐射后皮肤成纤维细胞亚群的变化及caveolin表达的变异性 | 首次在辐射诱导纤维化(RIF)中识别出成纤维细胞亚群的特定变化及Cav1与Cav2的拮抗作用 | 样本量较小(仅6例患者),且仅针对乳腺癌术后重建患者的皮肤样本 | 探究辐射损伤后皮肤纤维化的细胞机制 | 辐射与非辐射的人类皮肤样本 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(10X平台)、组织学评估、免疫组化、生物力学测试 | Seurat聚类分析、SingleR分类器 | 单细胞转录组数据、组织学图像 | 6例女性患者的配对辐射/非辐射皮肤样本 |