单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
161	2025-07-19	A novel cuproptosis-related gene signature of prognosis and immune microenvironment in head and neck squamous cell carcinoma cancer 2023-Jan, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-022-04471-7 PMID:36376617	研究论文	本研究评估了头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中铜死亡相关基因(CRGs)的差异表达和遗传变异，并构建了CRG风险模型以预测HNSCC患者的生存	首次系统地评估了HNSCC中CRGs的表达和遗传变异，并构建了预测患者生存的CRG风险模型	研究依赖于公共数据库的数据，可能受到数据质量和样本量的限制	探索铜死亡相关基因在HNSCC中的表达模式及其与患者预后的关系	头颈部鳞状细胞癌患者	肿瘤学	头颈部鳞状细胞癌	单细胞测序、lasso回归	风险模型	基因表达数据、临床数据	公共数据库中的HNSCC和非癌组织样本
162	2025-07-19	Single-cell transcriptional profiling reveals heterogeneity and developmental trajectories of Ewing sarcoma 2022-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-022-04073-3 PMID:35713707	研究论文	通过单细胞转录组测序揭示尤文肉瘤的异质性和发育轨迹	首次在单细胞分辨率下预测尤文肉瘤细胞的起源，并模拟神经嵴细胞谱系分化过程	样本量较小（仅4个肿瘤组织样本），且部分结论基于假设	探究尤文肉瘤的细胞起源和发育轨迹	尤文肉瘤肿瘤细胞	数字病理学	尤文肉瘤	单细胞RNA测序	K-nearest neighbor算法, Monocle2包	RNA测序数据	4个尤文肉瘤肿瘤组织样本
163	2025-07-19	New insights for precision treatment of glioblastoma from analysis of single-cell lncRNA expression 2021-Jul, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-021-03584-9 PMID:33693962	研究论文	通过分析单细胞lncRNA表达，为胶质母细胞瘤的精准治疗提供新见解	使用lncRNA作为分型标志物并结合单细胞表达谱对胶质母细胞瘤进行重新分型，提出新的精准治疗策略	研究基于公开数据库数据，未进行实验验证	提高胶质母细胞瘤分子分型的精确性并探索精准治疗策略	胶质母细胞瘤患者	数字病理	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序	Seurat	基因表达数据	GSE84465数据集和TCGA数据库中的胶质母细胞瘤组织数据
164	2025-07-18	Targeting KIT With Antibody-Drug Conjugates in Chromophobe Renal Cell Carcinoma 2025-Aug, Clinical genitourinary cancer IF:2.3Q2 DOI:10.1016/j.clgc.2025.102359 PMID:40408838	研究论文	该研究探讨了在嗜铬肾细胞癌（ChRCC）中靶向KIT的抗体-药物偶联物（ADC）的治疗潜力	首次在ChRCC中测试了靶向KIT的ADC，并证实其有效性	研究仅基于细胞系和有限的患者样本，未进行大规模临床试验	探索KIT作为ChRCC治疗靶点的可行性	嗜铬肾细胞癌（ChRCC）细胞系和患者样本	肿瘤学	肾细胞癌	单细胞RNA测序、Western blot分析	NA	RNA表达数据、蛋白质表达数据	15例转移性ChRCC样本和5个ChRCC细胞系
165	2025-07-18	SOX11 and GLIS2: Novel Biomarkers for Understanding the Progression of Oral Leukoplakia 2025-Aug, International dental journal IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.identj.2025.100872 PMID:40543136	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和大块RNA测序数据，探讨了口腔白斑病（LP）进展中的转录调控机制，并鉴定了SOX11和GLIS2作为潜在的生物标志物	首次将单细胞RNA测序技术应用于LP研究，发现SOX11和GLIS2作为LP特异性分子标志物，并揭示其通过调控EMT和血管生成影响疾病进展	研究样本量有限，且主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平的功能验证	探索口腔白斑病进展的分子机制并寻找潜在生物标志物	口腔白斑病（LP）组织样本和口腔鳞状细胞癌（OSCC）样本	数字病理学	口腔癌	单细胞RNA测序，大块RNA测序，免疫组化染色	NA	RNA测序数据，临床生存数据	LP组织样本和TCGA数据库中的OSCC样本
166	2025-07-18	Decoding Cellular Landscapes: Unravelling Periodontitis and Periapical Periodontitis at the Single-Cell Frontier 2025-Aug, International dental journal IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.identj.2025.100851 PMID:40554261	研究论文	通过分析单细胞RNA测序数据，揭示了牙周炎和根尖周炎在牙槽骨中关键基因表达和细胞异质性的差异	首次在单细胞水平上比较了牙周炎和根尖周炎的关键基因表达和细胞异质性，并识别了疾病特异性的关键基因和细胞类型	研究仅基于公开可用的单细胞RNA测序数据集，未进行独立实验验证	阐明牙周炎和根尖周炎在牙槽骨中的分子和细胞差异	牙周炎和根尖周炎患者的牙槽骨组织	单细胞组学	牙周炎和根尖周炎	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)	NA	单细胞RNA测序数据	两个公开数据集(GSE171213和GSE181688)
167	2025-07-18	Integrated Analyses to Identify the Roles of GPX1 in Frailty and Hypertension 2025-Aug, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979) DOI:10.1161/HYPERTENSIONAHA.125.24664 PMID:40575858	研究论文	通过整合分析确定GPX1在衰弱和高血压中的作用	首次通过两样本孟德尔随机化分析评估2532个可药物化基因对衰弱和高血压的因果效应，并利用RNA表达谱和单细胞RNA测序进行验证	研究主要基于遗传学和分子水平分析，缺乏临床干预实验验证	确定衰弱和高血压的有效药物靶点	老年人群中的衰弱和高血压患者	生物医学研究	老年疾病	两样本孟德尔随机化分析, RNA表达谱, 单细胞RNA测序, 分子对接	NA	遗传数据, RNA测序数据	2532个可药物化基因的分析
168	2025-07-18	Resolvin D1-mediated cellular crosstalk protects against MASH 2025-Aug, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1 DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101454 PMID:40671835	研究论文	本研究探讨了resolvin D1（RvD1）在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）中的作用机制	揭示了RvD1通过减轻内质网应激介导的细胞凋亡，减少肝细胞死亡和DAMP产生，从而降低KCs、T细胞和HSCs的激活，这一细胞间通讯的新机制	研究主要基于小鼠模型和体外细胞共培养实验，人类样本数量有限	确定RvD1介导的细胞间通讯在MASH中的作用和机制	小鼠MASH模型和人类MASH样本中的肝细胞、Kupffer细胞（KCs）、T细胞和肝星状细胞（HSCs）	肝脏疾病研究	代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）	bulk RNA测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、原代肝细胞共培养实验	NA	RNA测序数据、细胞培养数据	小鼠样本每组4-6只，人类样本每组9-10例
169	2025-07-18	ECM1 expression in chronic liver disease: Regulation by EGF/STAT1 and IFNγ/NRF2 signalling 2025-Aug, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1 DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101423 PMID:40671832	研究论文	研究探讨了ECM1在慢性肝病中的表达调控机制，特别是EGF/STAT1和IFNγ/NRF2信号通路的作用	揭示了EGF/STAT1信号通路维持ECM1表达以防止纤维化，而IFNγ/NRF2信号通路在慢性肝脏炎症中抑制ECM1表达的新机制	研究样本量相对较小（小鼠模型n=2-6，人类患者n=22），可能影响结果的普遍性	探究ECM1在肝细胞中的调控机制及其在慢性肝病中的作用	AML12细胞、小鼠和人类原代肝细胞、小鼠和患者的肝组织	分子生物学	慢性肝病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq）、启动子分析	NA	基因表达数据、组织样本	小鼠模型n=2-6，人类患者n=22
170	2025-07-18	Interleukin (IL)-34 promotes the inflammatory role of IL-1β-producing myeloid cells in pemphigus lesions 2025-Jul-17, The British journal of dermatology DOI:10.1093/bjd/ljaf130 PMID:40203120	研究论文	研究探讨了髓系细胞在天疱疮病变中形成异位淋巴样结构（ELS）的作用，并揭示了IL-34/CSF-1R通路作为潜在治疗靶点	首次发现IL-1β产生的髓系细胞（IL1B_Macro）是天疱疮病变中的主要髓系亚群，并揭示IL-34和TNF-α协同促进其分化	研究主要基于体外实验和单细胞测序数据，尚未进行体内功能验证	探究髓系细胞在天疱疮病变中形成ELS的机制并寻找潜在治疗靶点	天疱疮患者的皮肤病变组织	免疫病理学	天疱疮	scRNA-seq, IHC, 免疫荧光, 流式细胞术, bulk RNA-seq, Transwell趋化实验	NA	单细胞转录组数据, 免疫组织化学数据, 流式细胞数据	天疱疮患者的皮肤病变组织样本（未明确数量）
171	2025-07-18	An unbiased genomewide screen uncovers 7 genes that drive hematopoietic stem cell fate from mouse embryonic stem cells 2025-Jul-17, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024027742 PMID:40209065	研究论文	通过全基因组CRISPR激活筛选，发现了7个基因在小鼠胚胎干细胞向造血干细胞分化过程中的关键作用	采用了一种新颖且无偏的全基因组CRISPR激活筛选方法，首次鉴定了7个在造血干细胞命运决定中起关键作用的基因	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类细胞中验证	探索体外生成造血干细胞的关键调控因素	小鼠胚胎干细胞和造血干细胞	再生医学	血液系统疾病	全基因组CRISPR激活筛选、单细胞RNA测序	小鼠模型	基因组数据、转录组数据	未明确说明具体样本数量，使用了小鼠胚胎干细胞和免疫缺陷NSG小鼠
172	2025-07-18	Identification of CTSK as a TLR-related critical biomarker in liver cirrhosis via integrative bioinformatics and pathological characterization 2025-Jul-17, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-11606-6 PMID:40670571	研究论文	通过整合生物信息学和病理学特征，鉴定CTSK作为与TLR相关的肝硬化关键生物标志物	首次鉴定出与TLR相关的关键基因（CXCL9、CXCL10、SPP1、CTSK），并验证其在肝硬化诊断和治疗中的潜在价值	研究结果主要基于公共数据库和实验验证，需要进一步临床研究验证其实际应用价值	探索肝硬化发病机制并寻找新的诊断和治疗靶点	肝硬化相关基因和信号通路	生物信息学	肝硬化	limma、WGCNA、qRT-PCR、IHC、scRNA-seq、分子对接	机器学习	基因表达数据	NA
173	2025-07-18	PLAUR+ Neutrophils Drive Anti-PD-1 Therapy Resistance in Patients with Hepatocellular Carcinoma by Shaping an Immunosuppressive Microenvironment 2025-Jul-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202507167 PMID:40673864	研究论文	该研究揭示了PLAUR+中性粒细胞在肝细胞癌患者中通过塑造免疫抑制微环境驱动抗PD-1治疗耐药的作用	首次发现PLAUR+中性粒细胞在免疫治疗无应答者中富集，并通过多组学分析揭示其在塑造免疫抑制微环境中的关键作用，同时发现一种新型PLAUR抑制剂可逆转中性粒细胞的免疫抑制表型	研究主要基于临床队列和临床前模型，需要进一步在更大规模的临床试验中验证PLAUR抑制剂的疗效	探索肝细胞癌中免疫治疗耐药的机制并寻找潜在的治疗策略	肝细胞癌患者和临床前模型中的PLAUR+中性粒细胞	肿瘤免疫学	肝细胞癌	多组学分析、空间转录组学、单细胞RNA测序、基于结构的虚拟筛选	NA	临床数据、测序数据	未明确提及具体样本数量，涉及临床队列和多种体内肿瘤模型
174	2025-07-18	ER-phagy Activation by AMFR Attenuates Cardiac Fibrosis Post-Myocardial Infarction via mTORC1 Pathway 2025-Jul-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202504552 PMID:40673870	研究论文	本研究探讨了自分泌运动因子受体(AMFR)通过激活ER-phagy减轻心肌梗死后心脏纤维化的机制	首次揭示了AMFR通过调节FAM134B介导的ER-phagy活性抑制心脏纤维化的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证	探究ER-phagy在心肌梗死后心脏纤维化中的作用机制	心肌梗死后的小鼠心脏组织和心脏成纤维细胞	心血管疾病	心血管疾病	scRNA-seq分析	基因敲除小鼠模型	基因表达数据	小鼠心脏组织和体外培养的心脏成纤维细胞
175	2025-07-18	The Evolutionary Trajectory and Prognostic Value of GITR+ Tregs Reprogramed by Tumor-Intrinsic PD-1/c-MET Signaling in Pancreatic Cancer 2025-Jul-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202500806 PMID:40673866	研究论文	本研究探讨了胰腺导管腺癌(PDAC)中肿瘤固有PD-1/c-MET信号通路对GITR+ Tregs的进化轨迹和预后价值的影响	首次揭示了MET-IL-23-STAT4轴在PDAC中介导GITR+ Tregs免疫逃逸的机制，并证明MET抑制与GITR激动剂联合治疗可增强抗肿瘤免疫	研究主要基于临床前模型，需要进一步临床试验验证	探究PDAC中肿瘤固有PD-1/c-MET信号通路的免疫调节作用及其治疗潜力	胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本和原位PDAC模型	肿瘤免疫学	胰腺癌	单细胞RNA测序	原位PDAC模型	基因表达数据	未明确说明患者样本数量，使用原位PDAC模型
176	2025-07-18	Antibiotic treatment limits survival of peripheral and bone marrow B cell populations 2025-Jul-16, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2024013694 PMID:40668665	研究论文	该研究探讨了长期或广谱抗生素治疗对小鼠骨髓和外周B细胞群体的影响	首次发现抗生素治疗会导致骨髓B细胞在所有发育阶段的显著耗竭，并揭示了MYC信号通路在维持B细胞祖细胞存活中的关键作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探究抗生素治疗对造血系统特别是B细胞群体的影响机制	小鼠骨髓和外周B细胞群体	免疫学	NA	单细胞RNA测序、流式细胞术	小鼠模型	基因表达数据、细胞计数数据	NA
177	2025-07-18	Systemic administration of an RNA binding and cell-penetrating antibody targets therapeutic RNA to multiple mouse models of cancer 2025-Jul-16, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adk1868 PMID:40668891	研究论文	本研究开发了一种名为TMAB3的抗体，能够与RNA形成稳定的复合物，实现RNA在肿瘤细胞中的特异性递送，并在多种癌症小鼠模型中展现出抗肿瘤效果	利用具有肿瘤靶向、细胞穿透和RNA结合能力的单克隆抗体TMAB3，形成稳定的抗体/RNA复合物，实现RNA在肿瘤细胞中的高效特异性递送	研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	开发一种能够特异性递送治疗性RNA至肿瘤细胞的抗体平台，用于癌症治疗	胰腺癌、髓母细胞瘤和黑色素瘤的小鼠模型	肿瘤治疗	胰腺癌、髓母细胞瘤、黑色素瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术	小鼠模型	RNA测序数据、流式细胞数据	多种癌症小鼠模型（具体数量未明确说明）
178	2025-07-18	Excitatory synaptic transmission is differentially modulated by opioid receptors along the claustro-cingulate pathway 2025-Jul-16, eNeuro IF:2.7Q3 DOI:10.1523/ENEURO.0219-25.2025 PMID:40670155	research paper	研究阿片受体如何调节claustro-cingulate通路中的兴奋性突触传递	揭示了KOR、MOR和DOR阿片受体在CLA-ACC通路中对突触传递的不同调节作用，特别是KOR的独特作用	研究仅在小鼠中进行，尚未在人类中验证	探究阿片受体对claustro-cingulate环路中谷氨酸能信号传递的调节作用	小鼠的claustrum（CLA）和前扣带回皮层（ACC）	神经科学	疼痛和情绪障碍	空间转录组学、脑片电生理学、光遗传学和药理学方法	NA	电生理数据	小鼠（性别未具体说明数量）
179	2025-07-18	Single-cell RNA sequencing reveals the effects of mental stress on mouse mammary tumors and the tumor microenvironment 2025-Jul-16, Cell death discovery IF:6.1Q1 DOI:10.1038/s41420-025-02619-1 PMID:40670350	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了精神压力对小鼠乳腺肿瘤及其微环境的影响	首次系统性地揭示了精神压力在体内对乳腺肿瘤及其微环境的影响，并提供了精神压力诱导乳腺癌生长和进展的机制见解	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类乳腺癌患者中验证	探究精神压力对乳腺肿瘤及其微环境的影响	MMTV-PyMT转基因小鼠的乳腺肿瘤组织	肿瘤生物学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	MMTV-PyMT转基因小鼠的乳腺肿瘤组织（有/无精神压力暴露）
180	2025-07-18	Single-cell RNA sequencing reveals that a high salt diet increases IL6R-JAK1-STAT3 gene signaling pathway activity in intestinal B cells and Tfh cells of salt-sensitive hypertension animal model 2025-Jul-16, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-11100-z PMID:40670501	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，研究高盐饮食如何通过IL6R-JAK1-STAT3基因信号通路影响肠道B细胞和Tfh细胞，从而促进盐敏感性高血压的发展	首次揭示了高盐饮食通过IL-6R-JAK-STAT信号通路影响肠道B细胞和Tfh样细胞的机制，为盐敏感性高血压的治疗提供了新的靶点	研究仅使用了Dahl SS大鼠模型，结果是否适用于人类尚需进一步验证	阐明肠道免疫在盐敏感性高血压发展中的作用	Dahl SS大鼠的肠道和血液免疫细胞	免疫学	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	Dahl SS大鼠模型	RNA测序数据	6周龄Dahl SS大鼠，分为正常盐饮食组（0.4% NaCl）和高盐饮食组（4% NaCl），每组数量未明确说明