单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-05-02 |
Identification and Validation of Prognostic Genes Related to Histone Lactylation Modification in Glioblastoma: An Integrated Analysis of Transcriptome and Single-cell RNA Sequencing
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.110646
PMID:40302809
|
research paper | 本研究旨在识别与组蛋白乳酸化修饰(HLM)相关的胶质母细胞瘤(GBM)预后基因，并探索其作用机制 | 首次整合转录组和单细胞RNA测序数据，构建了HLM相关基因风险预测模型，并识别了潜在的治疗药物 | 研究主要基于公开数据库和体外实验，需要进一步体内实验验证 | 探索组蛋白乳酸化修饰在胶质母细胞瘤进展中的作用及其预后价值 | 胶质母细胞瘤组织和相关基因 | digital pathology | glioblastoma | 免疫组化染色、Western blotting、RNA-seq、scRNA-seq、WGCNA | LASSO回归模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA-GBM数据集中的样本及临床组织样本 |
| 162 | 2025-05-02 |
Bridging the gap: how patient-derived lung cancer organoids are transforming personalized medicine
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1554268
PMID:40302940
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综述 | 本文总结了患者来源的肺癌类器官（PDLCOs）的培养、验证过程及其在个性化治疗、耐药后药物筛选、PDLCOs生物库构建和药物开发中的临床应用 | 探讨了PDLCOs与肿瘤组装体技术、人工智能、器官芯片、3D生物打印、基因编辑和单细胞RNA测序等前沿技术的整合，极大扩展了其临床潜力 | PDLCOs模型的可重复性和标准化仍面临挑战，主要由于标本来源、后续处理技术、培养基配方和Matrigel批次的差异 | 探索PDLCOs在肺癌精准医学中的应用前景与挑战 | 患者来源的肺癌类器官（PDLCOs） | 数字病理学 | 肺癌 | 肿瘤组装体技术、人工智能、器官芯片、3D生物打印、基因编辑、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 163 | 2025-05-02 |
HDC/histamine Signaling Axis Drives Macrophage Reprogramming to Promote Angiogenesis in Hindlimb-Ischemic Mice
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.105148
PMID:40303294
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研究论文 | 本研究探讨了HDC/组胺信号轴在巨噬细胞重编程中的作用，以促进后肢缺血小鼠的血管生成 | 首次揭示了HDC在Ly6C巨噬细胞中的高表达及其在血管生成中的关键作用，并开发了HA-DA@组胺水凝胶用于治疗缺血性损伤 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 阐明HDC/组胺信号在血管生成和肌肉再生中的作用 | 后肢缺血小鼠模型中的巨噬细胞和内皮细胞 | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞测序技术 | HDC-GFP转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 164 | 2025-05-02 |
Macrophage KDM2A promotes atherosclerosis via regulating FYN and inducing inflammatory response
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.102675
PMID:40303308
|
研究论文 | 本研究揭示了KDM2A在巨噬细胞炎症反应中的新作用，通过转录调控FYN促进动脉粥样硬化的发展 | 首次发现KDM2A作为巨噬细胞特异性转录调节因子，通过调控FYN激活炎症反应、氧化应激和脂质积累，从而促进动脉粥样硬化 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩大 | 探究巨噬细胞在动脉粥样硬化发展中的转录调控机制 | 巨噬细胞、动脉粥样硬化斑块 | 分子生物学 | 心血管疾病 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)、qPCR、虚拟筛选 | 机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞数据 | 人类斑块微阵列数据集、ApoE小鼠模型 |
| 165 | 2025-05-02 |
NAMPT Impairs Vascular Permeability in Periodontitis by Influencing FASN-mediated Lipogenesis
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.104485
PMID:40303304
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研究论文 | 本研究探讨了NAMPT通过影响FASN介导的脂肪生成来损害牙周炎中血管通透性的机制 | 揭示了NAMPT在牙周炎中通过调节FASN介导的脂肪生成促进内皮通透性的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体中进行验证 | 探究牙周炎中内皮细胞通透性调控的关键分子及其作用机制 | 人脐静脉内皮细胞(HUVEC)和牙周炎小鼠模型 | 分子生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 未明确说明样本数量 |
| 166 | 2025-05-02 |
Targeting endothelial MYC using siRNA or miR-218 nanoparticles sensitizes chemo- and immuno-therapies by recapitulating the Notch activation-induced tumor vessel normalization
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.112023
PMID:40303332
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研究论文 | 通过靶向内皮细胞MYC基因，使用siRNA或miR-218纳米颗粒，模拟Notch激活诱导的肿瘤血管正常化，从而增强化疗和免疫疗法的敏感性 | 发现MYC是Notch信号通路中调控肿瘤血管正常化的关键靶点，并开发了靶向MYC的纳米颗粒递送系统 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 探索Notch信号通路在肿瘤血管正常化中的作用，并开发新的抗血管生成治疗策略 | 内皮细胞（ECs）和肿瘤内皮细胞（TECs） | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blotting、免疫荧光、流式细胞术 | 基因修饰小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞形态数据 | 基因修饰小鼠模型中的内皮细胞和肿瘤内皮细胞 |
| 167 | 2025-05-02 |
Spatially segregated APOE+ macrophages restrict immunotherapy efficacy in clear cell renal cell carcinoma
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.109097
PMID:40303328
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research paper | 该研究揭示了APOE+巨噬细胞在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中促进免疫抑制和对免疫检查点阻断(ICB)疗法抵抗的关键作用 | 发现了APOE+巨噬细胞在ICB抵抗性ccRCC中的空间分布特征及其通过TGF-β信号塑造免疫抑制微环境的机制 | 研究主要基于单中心队列，需要更大规模的多中心验证 | 探索ccRCC免疫治疗抵抗的微环境机制 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者样本和细胞系 | 肿瘤免疫学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光，Western blot，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，临床样本数据 | 超过2000个样本，包括230名接受ICB治疗的晚期ccRCC患者的真实世界队列 |
| 168 | 2025-05-02 |
Single-nucleus RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal an immunosuppressive tumor microenvironment related to metastatic dissemination during pancreatic cancer liver metastasis
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.108925
PMID:40303346
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research paper | 该研究通过单核RNA测序和空间转录组学揭示了胰腺癌肝转移过程中与转移扩散相关的免疫抑制性肿瘤微环境 | 首次揭示了转移扩散细胞在肝转移过程中EMT相关基因的显著上调，以及SPP1通路在免疫抑制微环境中的关键作用，并发现CITED4作为PDAC肝转移的关键生物标志物 | 研究样本量相对有限，且主要关注肝转移，未涉及其他转移途径 | 探究胰腺导管腺癌(PDAC)肝转移过程中免疫微环境的作用机制 | PDAC的原发肿瘤(PT)和肝转移(LM)组织 | digital pathology | pancreatic cancer | single-nucleus RNA sequencing, spatial transcriptomics, multiplexed immunofluorescence staining, immunohistochemistry (IHC), transwell assay, scratch wound healing assay | prognostic models | RNA sequencing data, spatial transcriptomics data, immunofluorescence images | 62,326个细胞 |
| 169 | 2025-05-02 |
Modulation of brain immune microenvironment and cellular dynamics in systemic inflammation
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.107061
PMID:40303348
|
研究论文 | 本研究探讨了系统性炎症中脑免疫微环境和细胞动力学的调控机制，特别是在脓毒症相关脑病（SAE）中的作用 | 开发了DeconvCellLink R包来研究神经炎症相关的细胞相互作用网络，并构建了系统性炎症反应期间脑细胞网络的动态变化图谱 | 人类和动物模型之间的脑细胞变化存在差异，可能影响研究结果的普适性 | 揭示脓毒症相关脑病的发病机制，特别是脑微环境中细胞通讯网络的作用 | 人类和小鼠模型中的髓系细胞、胶质细胞及其在脑免疫微环境中的相互作用 | 神经免疫学 | 脓毒症相关脑病 | 批量转录组学和单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 人类和小鼠模型的转录组数据 |
| 170 | 2025-05-02 |
Magnetic sculpture-like tumor cell vaccines enable targeted in situ immune activation and potent antitumor effects
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.107162
PMID:40303352
|
研究论文 | 开发了一种新型的全细胞疫苗平台，结合了免疫原性、结构完整性和肿瘤靶向能力 | 通过高浓度FeCl处理肿瘤细胞，诱导快速形态固定，赋予细胞磁性，实现定向导航至肿瘤并增强免疫激活 | NA | 开发一种新型的全细胞疫苗平台，用于靶向、患者特异性的抗肿瘤治疗 | 肿瘤细胞和黑色素瘤小鼠模型 | 免疫治疗 | 黑色素瘤 | 空间转录组分析 | NA | NA | 黑色素瘤小鼠模型 |
| 171 | 2025-05-02 |
PD-1 activation mitigates lupus nephritis by suppressing hyperactive and heterogeneous PD-1+CD8+ T cells
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.107418
PMID:40303350
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研究论文 | 本文研究了PD-1表达的CD8 T细胞在狼疮性肾炎（LN）中的作用，并探索了PD-L1 Fc融合蛋白作为治疗策略的潜力 | 揭示了PD-1+CD8+ T细胞在LN中的过度活跃和克隆扩增特性，并证明了PD-L1 Fc治疗能有效减轻肾脏病理 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化需要进一步验证 | 探索PD-1+CD8+ T细胞在LN中的作用及PD-1/PD-L1通路作为治疗靶点的潜力 | LN患者和NZB/W F1小鼠 | 免疫学 | 狼疮性肾炎 | scRNA-seq, RNA-seq, q-PCR, 流式细胞术, Western blot | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | LN患者和NZB/W F1小鼠样本 |
| 172 | 2025-05-02 |
Serine supplementation suppresses hypoxia-induced pathological retinal angiogenesis
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.105299
PMID:40303351
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研究论文 | 探讨丝氨酸补充在抑制缺氧诱导的病理性视网膜血管生成中的作用 | 首次发现丝氨酸补充通过增强视网膜线粒体代谢和脂质利用，抑制失控的血管生成关键驱动因素 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 研究丝氨酸代谢在抑制缺氧驱动的视网膜新生血管中的作用 | 氧诱导视网膜病变（OIR）小鼠模型 | 眼科 | 视网膜病变 | 代谢组学、脂质组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 生物分子数据（代谢物、脂质、蛋白质、RNA） | 野生型C57BL/6J OIR幼鼠 |
| 173 | 2025-05-02 |
Identification of disulfidptosis in esophageal squamous cell carcinoma based on single-cell and bulk RNA-seq data to predict prognosis and treatment response
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1567793
PMID:40303412
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research paper | 通过单细胞和批量RNA-seq数据识别食管鳞状细胞癌中的二硫键死亡现象，以预测预后和治疗反应 | 首次在食管鳞状细胞癌中识别与二硫键死亡相关的基因分子亚型，并构建预后模型和潜在治疗靶点 | 研究依赖于公开数据集，可能受限于样本量和数据质量 | 识别食管鳞状细胞癌中与二硫键死亡相关的分子亚型，构建预后模型并探索治疗靶点 | 食管鳞状细胞癌患者 | digital pathology | esophageal squamous cell carcinoma | RNA-seq, single-cell sequencing | LASSO-Cox regression | RNA-seq data, single-cell data | GSE53625和TCGA-ESCC队列数据，以及GSE160269单细胞测序数据集 |
| 174 | 2025-05-02 |
Heterogenous cancer-associated fibroblasts related tumor microenvironment marked by CD10/KLF4/TIAM1 were identified in pancreatic adenocarcinoma by integrated transcriptomics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1557698
PMID:40303408
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学方法，识别了胰腺导管腺癌(PDAC)中与异质性癌症相关成纤维细胞(CAFs)相关的肿瘤微环境(TME)亚型 | 首次识别了三种不同的CAF相关TME亚型(iCAF-rich、myCAF-rich和PSC-rich)，并发现这些亚型具有独特的基因表达谱和预后相关性 | 研究主要基于转录组数据，需要进一步实验验证CAF亚型的功能机制 | 探索PDAC肿瘤微环境中CAF亚型的组成、比例及其临床意义 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的肿瘤微环境和癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 肿瘤微环境研究 | 胰腺癌 | 整合转录组学、多重免疫组化、空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | 未明确说明样本数量，但涉及多例PDAC患者样本 |
| 175 | 2025-05-02 |
Decoding immune cell dynamics in ischemic stroke: insights from single-cell RNA sequencing analysis
2025, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2025.1549518
PMID:40303468
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research paper | 通过单细胞RNA测序分析解码缺血性中风中的免疫细胞动态 | 利用单细胞RNA测序技术揭示缺血性中风中的细胞类型和分子生物学过程，并预测细胞命运决定 | 样本量相对较小，仅分析了5,582个单细胞 | 研究缺血性中风的病理机制，特别是炎症过程中的吞噬作用 | 健康对照和缺血性中风患者的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | UMAP, iTALK | 基因表达数据 | 5,582个单细胞（来自健康对照和缺血性中风患者） |
| 176 | 2025-05-02 |
Heterogeneity of Renal Endothelial Cells, Interact with Neighboring Cells, and Endothelial Injury in Chronic Kidney Disease: Mechanisms and Therapeutic Implications
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.108299
PMID:40303495
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综述 | 本文综述了慢性肾脏病（CKD）中肾内皮细胞的异质性及其与邻近细胞的相互作用，以及内皮损伤的机制和治疗策略 | 利用单细胞测序技术深入探讨了肾内皮细胞的异质性及其微环境影响，并讨论了新兴的治疗方法如抗炎治疗、基因治疗和生活方式调整 | 综述性质的文章，未涉及具体实验数据或样本研究 | 探讨慢性肾脏病中内皮细胞异质性、内皮损伤机制及治疗策略 | 肾内皮细胞及其与邻近细胞的相互作用 | NA | 慢性肾脏病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 177 | 2025-05-02 |
Comprehensive Characterization of the Oxidative Stress Profiles in Neonatal Necrotizing Enterocolitis
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.109008
PMID:40303487
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研究论文 | 本研究旨在描述坏死性小肠结肠炎（NEC）中氧化应激（OS）的特征，识别相关枢纽基因及机制，并探索潜在治疗药物 | 整合bulk-RNA测序和单细胞RNA测序数据集，系统阐明NEC和非NEC组织中不同细胞群OS功能差异，并发现10种潜在治疗药物及4种巨噬细胞亚型 | 枢纽基因具体名称未在摘要中列出，可能影响结果解读 | 探究NEC发病机制中氧化应激的免疫环境及治疗方法 | 坏死性小肠结肠炎（NEC）小鼠模型及人类组织样本 | 生物医学 | 坏死性小肠结肠炎 | bulk-RNA测序, 单细胞RNA测序, 差异分析, 基因集富集分析, 免疫浸润分析, RT-qPCR, 免疫荧光染色 | NEC小鼠模型 | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量（含小鼠模型和人类组织） |
| 178 | 2025-05-02 |
Integrative analysis of m6A-SNPs and single-cell RNA sequencing reveals key drivers of endocrine combined with CDK4/6 inhibitor therapy resistance in ER+ breast cancer
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1590363
PMID:40303916
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research paper | 该研究通过整合m6A-SNPs和单细胞RNA测序数据，探索了ER+乳腺癌对内分泌联合CDK4/6抑制剂治疗耐药的关键驱动因素 | 首次结合m6A-SNPs和单细胞RNA测序技术，揭示了FILIP1L和TOM1L1在ER+乳腺癌耐药性发展中的动态表达变化及其在PI3K-Akt和Wnt信号通路中的作用 | 研究样本量有限，且仅针对ER+乳腺癌，未涵盖其他亚型 | 探索ER+乳腺癌对内分泌联合CDK4/6抑制剂治疗耐药的分子机制 | ER+乳腺癌患者 | digital pathology | breast cancer | single-cell RNA sequencing, pseudotime trajectory analysis | NA | RNA-seq | 未明确提及具体样本数量 |
| 179 | 2025-05-02 |
Single Cell Transcriptomics Genomics Based on Machine Learning Algorithm: Constructing and Validating Neutrophil Extracellular Trap Gene Model in COPD
2025, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S516139
PMID:40308227
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和机器学习算法，构建并验证了慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者中中性粒细胞胞外诱捕网（NET）特征基因模型 | 首次针对吸烟和非吸烟COPD患者分别构建了NET特征基因模型，并验证了其特异性和预测能力 | 样本量有限，模型的外部验证需要进一步扩大样本 | 识别不同COPD患者中的NET特征基因，为个性化治疗策略提供基础 | COPD患者和非COPD个体的中性粒细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | COPD和非COPD个体的单细胞RNA测序数据 |
| 180 | 2025-05-02 |
The suppressive role of GLS in radiosensitivity and irradiation-induced immune response in LUAD: integrating bioinformatics and experimental insights
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1582587
PMID:40308578
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和实验方法，探讨了GLS在肺腺癌放射敏感性和放射诱导免疫反应中的抑制作用 | 揭示了GLS通过调节铁死亡和重塑免疫景观（特别是增强CD8+ T细胞毒性）在放射治疗中的双重调节作用，并开发了具有稳健预测性能的GLS-DSBr预后模型 | 需要进一步验证GLS-DSBr模型在临床实践中的适用性 | 阐明GLS在肺腺癌放射敏感性和放射诱导免疫反应中的调控机制及其临床价值 | 肺腺癌（LUAD） | 数字病理 | 肺癌 | RNA-seq、单细胞转录组学、流式细胞术、机器学习 | GLS-DSBr预后模型 | 转录组数据、实验数据 | 2,066名LUAD患者 |