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当前共找到 37441 篇文献,本页显示第 161 - 180 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
161 2026-03-16
FLASH-MM: fast and scalable single-cell differential expression analysis using linear mixed-effects models
2026-Feb-05, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文开发了一种快速可扩展的线性混合效应模型估计算法FLASH-MM,用于解决单细胞差异表达分析中的样本相关性、个体变异和可扩展性挑战 通过重新设计线性混合模型估计过程,降低计算复杂度和内存使用,实现了快速且可扩展的单细胞差异表达分析 NA 开发快速可扩展的单细胞差异表达分析方法 单细胞RNA测序数据 生物信息学/单细胞分析 结核病、肾脏疾病 单细胞RNA测序 线性混合效应模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
162 2026-03-16
Tumour-intrinsic features shape T cell differentiation through precursor to symptomatic multiple myeloma
2026-Feb-05, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤及其前体状态患者的骨髓和血液样本,揭示了肿瘤内在特征如何影响T细胞分化 首次证明多发性骨髓瘤中T细胞分化并非由耗竭驱动,而是由抗原驱动的终末记忆分化,并发现T细胞特征可预测从前体到症状性多发性骨髓瘤的进展 研究未详细探讨肿瘤微环境中其他免疫细胞的作用,且样本来源仅限于骨髓和血液,可能未全面反映全身免疫状态 探究多发性骨髓瘤及其前体状态中T细胞分化的机制及其与疾病进展的关系 多发性骨髓瘤患者、前体状态患者及非癌症对照者的骨髓和血液样本 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 来自多发性骨髓瘤、前体状态和非癌症对照患者的大型数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
163 2026-03-16
Spatial Analysis of Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms Defines a Paradoxical Keratin 17-positive, Low-grade Epithelial Population Harboring Malignant Features
2026-Feb-02, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术,揭示了胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)中一个表达恶性转录特征的KRT17阳性低级别上皮细胞亚群 首次在组织学低级别IPMN中识别出表达KRT17等恶性标志物的上皮细胞亚群,该亚群具有向高级别不典型增生进展的过渡状态特征 研究样本数量有限,且主要基于转录组学分析,需要进一步的功能验证和临床随访研究 探究IPMN进展过程中的转录变化,识别高风险亚群以提高临床决策准确性 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)患者样本,包括低级别不典型增生、高级别不典型增生和IPMN来源的癌组织 数字病理学 胰腺癌 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 NA 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 包含IPMN疾病全谱的患者样本,具体数量未明确说明,但提及了大型患者队列 Nanostring 空间转录组学, 单细胞RNA-seq Nanostring GeoMx Nanostring GeoMx空间转录组平台
164 2026-03-16
ShinySC: An R/Shiny-based desktop application for seamless analysis of scRNA-Seq data
2026-Feb, Biomedical journal IF:4.1Q2
研究论文 本文介绍了一个名为ShinySC的基于R/Shiny的桌面应用程序,旨在通过直观的图形界面简化单细胞RNA测序数据的全面分析 开发了一个统一的、用户友好的、可扩展的平台,支持多种数据格式,集成了多种自动细胞类型注释方法(包括基于参考、基于标记和基于GPT的方法),并允许并排比较和手动标签细化 分析性能受标准桌面系统硬件限制(例如,在64GB RAM的系统中,对包含多达200,000个细胞的数据集表现稳健),分析时长取决于具体任务和注释方法 为没有编程专业知识的临床医生和研究人员提供一个易于访问的单细胞RNA测序数据分析平台 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 演示分析使用了PBMC和干扰素刺激数据集,基准测试表明可处理多达200,000个细胞的数据集 10x Genomics, BD Biosciences 单细胞RNA-seq 10x Chromium, BD Rhapsody 支持10x Genomics、BD Rhapsody等多种单细胞测序平台的数据格式
165 2026-03-16
From inhibition to regulation: serpins in health and disease
2026-Feb, Biomedical journal IF:4.1Q2
综述 本期《生物医学杂志》重点探讨了从分子、细胞到系统水平上塑造衰老、疾病进展和生物复杂性的调控机制,其中纤溶酶原激活物抑制剂-1(PAI-1)作为连接纤维蛋白溶解、细胞衰老、干细胞动态、纤维化和肿瘤生物学的多功能调节因子是核心主题 强调了PAI-1作为多功能调节因子的核心作用,并探讨了通过结构引导开发小分子PAI-1抑制剂在多种疾病中的治疗潜力,同时整合了表观转录组重塑、铁死亡调控、外泌体介导的细胞间通讯以及多种现代生物医学研究方法论进展 摘要未明确提及本文的具体研究局限性 探讨生物系统中,特别是衰老和疾病背景下,从分子到系统层面的复杂调控机制 纤溶酶原激活物抑制剂-1(PAI-1)、表观转录组修饰(如m6A)、铁死亡相关蛋白(如SLC7A11)、外泌体、以及用于生物医学研究的新方法(如单细胞RNA测序、深度学习、三维成像) 生物医学 血栓性疾病、慢性粒细胞白血病、系统性硬化症、肺癌、皮肤癌、肝细胞癌、寄生虫感染等 结构引导的药物开发、单细胞RNA测序、机器人辅助量化、可解释深度学习框架、基于锥形束计算机断层扫描的三维成像 可解释深度学习框架(结合分类与分割) 医学影像、单细胞RNA测序数据、三维成像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
166 2026-03-16
Mechanisms of immune escape and extramedullary tropism in leukemia cutis
2026-Jan-01, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过批量与单细胞转录组分析,揭示了急性髓系白血病皮肤浸润(白血病皮肤浸润)的免疫逃逸机制和髓外趋向性特征 首次系统比较了白血病皮肤浸润与骨髓复发样本的免疫微环境差异,揭示了HLA II类分子下调、T细胞耗竭特征及8种归巢受体分子的表达差异 样本量有限(23个活检样本来自10例患者),部分发现基于单病例的连续样本分析 探究急性髓系白血病髓外浸润(特别是皮肤)的免疫逃逸机制和分子特征 急性髓系白血病患者的皮肤/皮下组织活检样本(白血病皮肤浸润)及骨髓复发样本 数字病理学 白血病 批量转录组测序,单细胞转录组测序 NA 转录组数据 23个白血病皮肤浸润活检样本(来自10例患者),7个骨髓复发样本 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
167 2026-03-16
Elucidating the mechanistic association of xylene inducing non-small cell lung cancer through network toxicology and molecular docking analysis
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究结合网络毒理学和分子对接分析,探讨二甲苯暴露与非小细胞肺癌(NSCLC)发生之间的潜在分子机制 首次整合网络毒理学、分子对接与单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,系统揭示二甲苯异构体通过影响核心靶点基因(IL1A、H3C13、ITGAM、CCR5、COMT)及相关信号通路(如PI3K-Akt)促进NSCLC发展的分子机制 研究主要基于生物信息学分析和体外分子对接模拟,缺乏体内实验或临床样本验证,且二甲苯暴露剂量与基因表达变化的定量关系尚未明确 阐明环境二甲苯暴露与非小细胞肺癌(NSCLC)发生之间的分子关联机制 二甲苯异构体(邻二甲苯、间二甲苯、对二甲苯)及其潜在作用靶点基因与信号通路 计算毒理学 肺癌 网络毒理学分析、分子对接模拟、单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析 分子对接模型、蛋白-配体相互作用模型 基因表达数据、蛋白质结构数据、化合物-靶点相互作用数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
168 2026-03-16
From genes to diagnosis: The impact of UNC5B and DOK5 in intracranial aneurysm detection and pathogenesis
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合机器学习、免疫浸润分析和单基因测序,探讨UNC5B和DOK5基因在颅内动脉瘤检测和发病机制中的作用 首次结合机器学习算法(LASSO、随机森林、SVM-RFE)识别UNC5B和DOK5作为颅内动脉瘤的潜在诊断生物标志物,并通过免疫细胞浸润和单细胞测序分析揭示其与M1巨噬细胞和成纤维细胞的关联 研究基于微阵列数据,样本来源和数量未明确说明,可能影响结果的普遍性;外部验证数据集的具体细节未详细描述 识别颅内动脉瘤的诊断和治疗相关基因,并阐明其发病机制 颅内动脉瘤患者和健康对照的基因表达数据 机器学习 颅内动脉瘤 单基因测序、微阵列分析 LASSO、随机森林、SVM-RFE 基因表达数据 NA NA 单基因测序 NA NA
169 2026-03-16
Single-Cell RNA Sequencing Study on Two Synovial Derived Tumors in the Temporomandibular Joint
2025-Dec, Oral diseases IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了颞下颌关节滑膜软骨瘤病和弥漫性腱鞘巨细胞肿瘤的细胞组成、分化轨迹及细胞间通讯 首次在颞下颌关节滑膜来源肿瘤中应用单细胞RNA测序技术,揭示了滑膜成纤维样细胞作为共同起源,并通过COMP/TGFβ/SMAD信号通路促进软骨分化的新机制 样本量较小,仅针对颞下颌关节特定肿瘤,可能限制了结果的普适性 研究颞下颌关节滑膜软骨瘤病和弥漫性腱鞘巨细胞肿瘤的细胞组成与分化轨迹 颞下颌关节滑膜软骨瘤病和弥漫性腱鞘巨细胞肿瘤的组织样本 单细胞测序 滑膜来源肿瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确指定样本数量,但涉及两种颞下颌关节肿瘤的组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
170 2026-03-16
Early-life gut microbiome maturity regulates blood-brain barrier and cognitive development
2025-Dec, Gut microbes IF:12.2Q1
研究论文 本研究探讨了早期肠道微生物组的成熟度如何通过影响血脑屏障完整性和大脑转录程序来调节认知发育 首次通过将无菌孕鼠定植人类足月或早产婴儿肠道微生物,建立了微生物组成熟度与血脑屏障完整性及认知功能发育的直接因果关系 研究基于小鼠模型,人类相关性需进一步验证;微生物组影响的具体分子机制尚未完全阐明 探究早期肠道微生物组成熟度对血脑屏障发育和认知功能的影响机制 无菌孕鼠及其后代(定植人类足月或早产婴儿肠道微生物) 微生物组学与神经发育 神经发育障碍 单细胞RNA测序、宏基因组学、代谢组学 动物模型(小鼠) 基因表达数据、微生物组数据、代谢物数据 无菌孕鼠及其后代(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序、宏基因组学、代谢组学 NA NA
171 2026-03-16
Distinct stromal cell populations define the B-cell acute lymphoblastic leukemia microenvironment
2025-Nov, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)骨髓微环境中两种不同的间充质基质细胞群及其功能 首次在B-ALL患者中鉴定出早期间充质祖细胞和成脂祖细胞两种不同的基质细胞群,并发现成脂祖细胞通过IL-7和VCAM1信号支持白血病细胞 研究样本主要来自儿科患者,可能无法完全代表成人B-ALL的微环境特征 解析B-ALL骨髓微环境的细胞异质性及其在白血病进展中的作用 儿科B-ALL患者的骨髓抽吸物和骨活检样本 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序, 空间转录组学分析 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 儿科B-ALL患者的骨髓抽吸物和骨活检样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
172 2026-03-16
Psychological stress and social support are associated with opposing single-cell pro-inflammatory gene regulatory mechanisms in adults
2025-Oct-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和染色质可及性分析,探讨了心理压力和社会支持对成年人外周血单个核细胞中促炎基因调控机制的影响 首次在单细胞水平上揭示了心理压力和社会支持如何通过不同的转录因子调控机制影响免疫基因表达,特别是干扰素信号通路 研究样本仅限于165名非裔美国成年人,年龄范围较窄(50-89岁),可能限制了结果的普适性 探究心理压力和社会支持如何通过分子机制调节免疫系统的炎症反应 165名自我报告的非裔美国成年人(年龄50-89岁)的外周血单个核细胞 单细胞组学 炎症相关疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞染色质可及性测序(scATAC-seq) NA 单细胞转录组数据,单细胞表观基因组数据 165名成年人 NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq NA NA
173 2026-03-16
Loss of BAP1 defines a unique subtype of TP53-mutated de novo AML and confers sensitivity to BCL-xL inhibitors
2025-Sep-18, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本文发现BAP1缺失与TP53突变在急性髓系白血病中共存,定义了独特的亚型,并揭示了其对BCL-xL抑制剂的敏感性 首次揭示BAP1缺失与TP53突变在AML中的协同作用,定义了新的白血病亚型,并发现其依赖BCL2L1表达,对BCL-xL抑制剂敏感 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,人类疾病异质性可能未被完全捕捉 探究与TP53缺陷协同促进红细胞白血病转化的遗传改变 TP53突变的急性髓系白血病患者及小鼠模型 NA 急性髓系白血病 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 NA 基因表达数据, 表观遗传数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
174 2026-03-16
CD81+ senescent-like fibroblasts exaggerate inflammation and activate neutrophils via C3/C3aR1 axis in periodontitis
2025-Aug-13, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究探讨了细胞衰老在牙周炎发病机制中的作用,发现CD81+衰老样成纤维细胞通过C3/C3aR1轴加剧炎症并激活中性粒细胞 首次鉴定出CD81在衰老牙龈成纤维细胞中高表达,并揭示了其通过C3/C3aR1轴招募中性粒细胞、维持炎症的新机制 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,临床转化潜力仍需进一步验证 探究细胞衰老在牙周炎发病机制中的作用及具体分子机制 人类牙周炎样本、小鼠牙周炎模型、牙龈成纤维细胞 单细胞组学 牙周炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 人类牙周炎样本及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
175 2026-03-16
Defining the Ovarian Cancer Precancerous Landscape through Modeling Fallopian Tube Epithelium Reprogramming Driven by Extracellular Vesicles
2025-Aug-01, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 本研究通过微流体组织培养平台结合空间转录组学和蛋白质组学分析,探索卵巢癌来源的小细胞外囊泡如何驱动输卵管上皮细胞重编程,揭示卵巢癌前病变的分子机制 开发了一个结合空间转录组学和蛋白质组学读出的微流体组织培养平台,首次同时捕获组织对细胞外囊泡的短期转录组变化和长期分泌囊泡蛋白质组变化,为研究细胞外囊泡-组织相互作用提供了新工具 研究基于体外模型,可能无法完全模拟体内复杂微环境;样本规模有限,需要进一步验证 探索卵巢癌来源的细胞外囊泡如何驱动输卵管上皮细胞重编程,以理解卵巢癌前病变的分子机制 人输卵管上皮细胞(hFTE)及其对卵巢癌来源小细胞外囊泡(sEV)的响应 数字病理学 卵巢癌 空间转录组学,蛋白质组学,微流体组织培养 微流体组织培养平台 转录组数据,蛋白质组数据 未明确指定具体样本数量,但涉及人输卵管上皮细胞培养 NA 空间转录组学,蛋白质组学 NA NA
176 2026-03-16
Investigating pulmonary neutrophil responses to inflammation in mice via flow cytometry
2025-Mar-14, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本文介绍了一种通过流式细胞术评估小鼠肺部中性粒细胞表型的详细实验方案 提供了一种针对真菌细胞壁颗粒zymosan诱导的肺部无菌炎症模型,结合细胞表面和细胞内标记的全面染色技术,适用于下游单细胞测序等应用 NA 探索肺部中性粒细胞在生理和病理条件下的复杂功能 小鼠肺部组织及气腔中的中性粒细胞 数字病理学 肺部炎症 流式细胞术 NA 细胞表型数据 NA NA NA NA NA
177 2026-03-16
PLXNB1 and other signaling drives a pathologic astrocyte state contributing to cognitive decline in Alzheimer's Disease
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过单核转录组学数据分析,揭示了阿尔茨海默病中Ast10星形胶质细胞亚群在认知衰退中的关键作用及其信号驱动机制 首次通过大规模单核转录组学元分析(869个大脑样本)识别出Ast10星形胶质细胞亚群,并利用空间转录组学验证其与配体的共定位,结合遗传学实验证实PLXNB1等信号通路的调控作用 研究主要基于转录组数据,功能机制验证仍需进一步实验;样本虽多样但可能存在批次效应;动物模型与人类疾病的直接对应性有限 探究阿尔茨海默病中病理性星形胶质细胞状态的信号驱动机制及其对认知衰退的贡献 阿尔茨海默病患者及衰老相关的大脑组织样本(人类和小鼠模型),重点关注星形胶质细胞和小胶质细胞亚群 数字病理学 阿尔茨海默病 单核转录组测序(snRNAseq),空间转录组学,遗传学敲除实验 NA 转录组数据,空间基因表达数据 869个大脑样本(来自多样化捐赠者),涵盖人类和小鼠iPSC衍生细胞 NA 单核RNA-seq,空间转录组学 NA NA
178 2026-03-16
mTOR signaling regulates multiple metabolic pathways in human lung fibroblasts after TGF-β and in pulmonary fibrosis
2025-Feb-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
研究论文 本研究探讨了mTOR和ATF4在TGF-β诱导的人肺成纤维细胞代谢重编程中的作用 首次系统揭示了mTOR和ATF4在调控肺成纤维细胞氨基酸稳态、糖酵解和TCA循环代谢途径中的关键作用,并通过单细胞RNA-seq数据验证了这些通路在IPF患者病理成纤维细胞中的激活 研究主要基于体外细胞模型,体内验证不足;代谢组学分析可能未覆盖所有相关代谢物 阐明mTOR信号通路在肺纤维化中调控成纤维细胞代谢重编程的分子机制 人肺成纤维细胞和IPF患者肺组织样本 分子生物学与代谢研究 肺纤维化 RNA测序、代谢组学分析、单细胞RNA-seq数据分析 NA 转录组数据、代谢组数据、单细胞RNA-seq数据 未明确样本数量,但使用了人肺成纤维细胞和公开的单细胞RNA-seq数据集 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 代谢组学 NA NA
179 2026-03-16
Amniotic fluid cell-free transcriptome: a glimpse into fetal development and placental cellular dynamics during normal pregnancy
2020-02-12, BMC medical genomics IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过分析羊水细胞游离转录组,探讨正常妊娠期间胎儿发育和胎盘细胞动态变化 首次报道单细胞基因组特征可在羊水中追踪并显示妊娠期间复杂的表达模式,同时揭示了选择性剪接在组织身份获取、器官发育和免疫过程中的作用 样本量相对有限(共98例),且仅关注正常妊娠,未纳入病理妊娠病例进行对比 建立正常妊娠羊水基因表达和剪接模式,为产科生物标志物发现提供基础 正常妊娠女性的羊水样本(孕中期30例,足月68例) 转录组学 NA 人类转录组芯片(Human Transcriptome Arrays)和单细胞RNA-seq NA 转录组数据 98例羊水样本(孕中期30例,足月68例) NA 单细胞RNA-seq NA NA
180 2026-03-16
Single-cell transcriptomics identifies CD44 as a marker and regulator of endothelial to haematopoietic transition
2020-Jan-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析和抗体筛选,鉴定出CD44作为内皮向造血转变(EHT)的标志物,并揭示了其在造血干细胞和祖细胞(HSPCs)发育中的调控作用 首次识别CD44为EHT过程的特异性标记物,并证明其与透明质酸的相互作用是HSPC发育的关键调控因素 研究主要基于小鼠主动脉-性腺-中肾(AGM)区域,人类或其他物种中的适用性尚未验证 阐明内皮向造血转变(EHT)的中间步骤及调控机制 小鼠主动脉-性腺-中肾(AGM)区域的内皮细胞和造血干细胞/祖细胞(HSPCs) 单细胞组学 NA 单细胞转录组分析,抗体筛选 NA 单细胞RNA-seq数据 未明确指定样本数量,但涉及AGM区域的细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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