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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-31 |
Single-cell RNA profiling of blood CD4+ T cells identifies distinct helper and dysfunctional regulatory clusters in children with SLE
2025-Nov, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02297-2
PMID:41120754
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿童系统性红斑狼疮患者血液CD4⁺ T细胞的异质性 | 首次在儿童SLE患者中通过单细胞RNA测序识别出独特的辅助性T细胞和功能失调调节性T细胞亚群,并发现TLR5和FCRL3在SLE初始T细胞中的上调 | 研究样本仅限于儿童患者,未包含成人队列;样本量相对有限 | 表征系统性红斑狼疮患者CD4⁺ T细胞区室的复杂性 | 儿童系统性红斑狼疮患者和健康供体的血液CD4⁺ T细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 儿童SLE患者和健康供体的血液CD4⁺ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 162 | 2025-10-31 |
Rationale, design and baseline characteristics of REMODEL, a mechanism-of-action trial with semaglutide in people with type 2 diabetes and chronic kidney disease
2025-Oct-30, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfaf114
PMID:40608494
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研究论文 | REMODEL试验是一项为期52周的随机对照试验,旨在研究索马鲁肽对2型糖尿病和慢性肾病患者肾脏保护作用的机制 | 首次结合MRI影像学评估、肾脏活检组织学分析和单核/空间转录组学等多维度方法探究GLP-1受体激动剂的肾脏保护机制 | 样本量相对较小(总106人,活检亚组33人),观察周期为52周 | 探究索马鲁肽在2型糖尿病合并慢性肾病患者中的肾脏保护作用机制 | 2型糖尿病合并慢性肾病的成年患者 | 数字病理学 | 2型糖尿病, 慢性肾病 | 磁共振成像, 单核转录组学, 空间转录组学, 组织病理学分析 | NA | 医学影像, 组织样本, 临床数据 | 总样本106人(其中活检亚组33人) | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 163 | 2025-10-31 |
Spatial Transcriptomics of Adipose Tissue: Technologies, Applications, and Challenges
2025-Oct-30, Journal of obesity & metabolic syndrome
IF:4.7Q1
DOI:10.7570/jomes25078
PMID:41094746
|
综述 | 本文综述了空间转录组学技术在脂肪组织研究中的技术进展、应用场景和面临挑战 | 系统整合了空间转录组学技术在解析脂肪组织空间结构方面的最新进展,强调了该技术在揭示脂肪生成微环境、区域特异性重塑和免疫细胞相互作用方面的独特优势 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于已有文献进行归纳总结 | 探讨空间转录组学技术在脂肪组织生物学研究中的应用前景 | 脂肪组织及其细胞组成 | 空间转录组学 | 代谢疾病 | 空间转录组学,单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq,单核RNA-seq | NA | NA |
| 164 | 2025-10-31 |
Andrias Davidianus Peptide Hydrogel Enables Sustained SR9011 Release to Promote Efferocytosis and Alleviate Colitis
2025-Oct-30, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202509049
PMID:41163542
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研究论文 | 本研究开发了一种大鲵肽水凝胶用于持续释放SR9011,通过激活NR1D1促进胞葬作用并缓解结肠炎 | 首次发现NR1D1在溃疡性结肠炎中的表达降低及其对CD47的转录抑制功能,并创新性地开发了大鲵肽水凝胶递送系统 | 药代动力学分析仅限于结肠组织,未进行全身性评估 | 探索NR1D1在溃疡性结肠炎发病机制中的作用并开发新型治疗策略 | 人类UC活检组织、小鼠结肠炎模型、肠上皮细胞特异性Nr1d1缺陷小鼠 | 生物医学工程 | 溃疡性结肠炎 | CUT&Tag, ChIP-qPCR, 荧光素酶报告实验, 单细胞RNA测序 | DSS诱导结肠炎小鼠模型 | 基因表达数据, 表观遗传数据, 单细胞转录组数据 | 人类UC活检组织和小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 165 | 2025-10-31 |
FXYD3 Promotes Tumor Progression by Binding With IRF7 to Regulate JAK2/STAT5 Signaling in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2025-Oct-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202510782
PMID:41164952
|
研究论文 | 本研究揭示了FXYD3通过结合IRF7调控JAK2/STAT5信号通路促进肝内胆管癌恶性进展的机制 | 首次发现FXYD3通过其60-87aa结构域直接与IRF7相互作用,通过cGAS/STING通路形成正反馈环路持续激活JAK2/STAT5信号 | 未明确说明样本量的具体数值和研究局限性 | 探究FXYD3在肝内胆管癌进展中的作用机制 | 肝内胆管癌细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 肝内胆管癌 | 单细胞转录组测序, 空间转录组分析, 生物信息学分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 166 | 2025-10-31 |
CHB-Induced Immune Zonation Chaos Elicited LXRα-mediated Lipid Metabolism Disorders in Kupffer Cells to Induce Cancer Stem Cell Formation
2025-Oct-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202510275
PMID:41164971
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析揭示了慢性乙型肝炎中Kupffer细胞区室化紊乱通过LXRα介导的脂代谢异常诱导癌症干细胞形成的机制 | 首次揭示了Kupffer细胞区室化在疾病进展中的作用,发现了LXRα在Kupffer细胞中的关键调控功能 | 研究主要基于AAV-HBV小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究慢性乙型肝炎向肝癌转变过程中肝脏微环境的动态分子机制 | AAV-HBV小鼠模型和HBV患者的肝脏组织 | 空间转录组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析 | AAV-HBV小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | AAV-HBV小鼠模型和HBV患者肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 167 | 2025-10-31 |
YAP-Induced Glycolysis Drives Fibroinflammation and Disrupts Fibroblast Fidelity
2025-Oct-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326480
PMID:41165345
|
研究论文 | 本研究揭示了YAP通过诱导糖酵解驱动心脏纤维炎症并破坏成纤维细胞谱系保真度的机制 | 首次发现右心房心脏成纤维细胞具有更高的糖酵解活性和YAP活性,揭示了YAP通过糖酵解促进纤维炎症、诱导成纤维细胞向骨软骨祖细胞状态分化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;机制研究集中在Hippo/YAP通路,其他可能参与的通路未充分探索 | 探究Hippo/YAP通路在心脏成纤维细胞代谢微环境调控和纤维炎症中的作用机制 | 心脏成纤维细胞、心脏四个腔室、巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 单核ATAC测序, 代谢研究, 同位素标记葡萄糖摄取测定 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据, 代谢数据 | 人类和小鼠心脏组织样本 | NA | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 168 | 2025-10-31 |
Endothelial Protective Effects of Ferulic Acid in Pre-eclampsia Treatment
2025-Oct-30, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00495.2025
PMID:41165539
|
研究论文 | 本研究探讨阿魏酸通过STAT3/VEGF信号轴改善子痫前期症状的内皮保护作用 | 首次揭示阿魏酸通过抑制STAT3磷酸化增强内皮屏障功能并改善子痫前期血管功能障碍 | 研究基于L-NAME诱导的小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 评估阿魏酸对子痫前期的治疗潜力及其作用机制 | L-NAME诱导的子痫前期小鼠模型 | 生物医学研究 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序, 分子检测 | 动物模型 | 基因表达数据, 生理指标数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 169 | 2025-10-31 |
The cell as a token: high-dimensional geometry in language models and cell embeddings
2025-Oct-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf595
PMID:41165609
|
综述 | 探讨自然语言嵌入结构理解如何为单细胞数据集分析提供启示 | 将语言模型中的token概念与细胞嵌入进行类比,提出细胞作为token的新视角 | NA | 探索语言模型与细胞嵌入在高维几何结构上的相似性 | 单细胞数据集和自然语言数据 | 自然语言处理, 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型, 语言模型 | 单细胞数据, 文本数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 170 | 2025-10-31 |
Spatially resolved airway niches: mapping epithelial-immune microenvironments in asthma
2025-Oct-29, Expert review of respiratory medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/17476348.2025.2582244
PMID:41146609
|
综述 | 本文综述了空间组学技术在哮喘研究中揭示气道上皮-免疫微环境空间异质性的应用 | 整合多种空间组学技术揭示哮喘中先前被忽视的疾病定义性微环境生态位 | 检测成本较高、RNA扩散问题、FFPE工作流程标准化不足、需要全球队列的多组学整合 | 通过空间组学技术解析哮喘气道上皮-免疫微环境的分子环路和异质性 | 人气道活检组织、离体肺切片、小鼠哮喘模型 | 空间转录组学 | 哮喘 | 空间转录组学、多重成像蛋白质组学、空间代谢组学 | 基于图的人工智能 | 空间分子数据 | NA | 10x Genomics,Nanostring,Akoya Biosciences,Vizgen,Ionpath,Standard BioTools | 空间转录组学,多重成像蛋白质组学,空间代谢组学 | Visium-HD,Xenium,CosMx SMI,MERFISH,Imaging Mass Cytometry,MIBI,MALDI-MSI | 10x Visium HD,10x Xenium,Nanostring CosMx SMI,Vizgen MERFISH,Standard BioTools Imaging Mass Cytometry,Ionpath MIBI,高分辨率MALDI-MSI |
| 171 | 2025-10-31 |
scCT-DB, an omnibus for cancer patient-derived paired pre- and post-treatment single-cell transcriptomes to reveal drug perturbation and drug resistance mechanisms
2025-Oct-29, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1065
PMID:41160885
|
研究论文 | 开发了一个癌症治疗相关单细胞转录组数据库scCT-DB,用于揭示药物扰动和耐药机制 | 首个全面收集患者治疗前后配对单细胞转录组数据的数据库,采用统一流程处理并提供结构化元数据 | NA | 揭示药物扰动和耐药机制,发现预测治疗反应的生物标志物 | 癌症患者治疗前后的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 619万个细胞,来自1142个原始患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 172 | 2025-10-31 |
DeepSpaceDB: a spatial transcriptomics atlas for interactive in-depth analysis of tissues and tissue microenvironments
2025-Oct-29, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1117
PMID:41160880
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研究论文 | 介绍DeepSpaceDB空间转录组数据库,提供交互式组织微环境分析工具 | 开发了新一代空间转录组数据库,强调交互性和高级分析功能,支持跨样本比较和用户数据上传 | 当前版本主要聚焦10X Genomics Visium样本,平台覆盖范围有限 | 解决空间转录组数据分析和交互探索的技术挑战 | 组织切片和微环境,如阿尔茨海默病模型小鼠海马区域 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组技术 | NA | 空间基因表达数据 | NA | 10X Genomics | 空间转录组学 | 10X Visium | 10X Genomics Visium样本 |
| 173 | 2025-10-31 |
Targeting astrocyte-monocyte-neuron crosstalk in spinal cord injury: therapeutic insights from methyl gallate
2025-Oct-29, Spinal cord
IF:2.1Q1
DOI:10.1038/s41393-025-01127-4
PMID:41162682
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法探究没食子酸甲酯在脊髓损伤中的治疗机制 | 首次结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和网络药理学系统解析没食子酸甲酯对星形胶质细胞-单核细胞-神经元通讯的调节作用 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探究没食子酸甲酯在脊髓损伤中的治疗机制 | 脊髓损伤小鼠模型、星形胶质细胞、单核细胞和神经元 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | scRNA-seq, bulk transcriptomics, Mendelian randomization, network pharmacology, molecular docking | NA | 基因表达数据、GWAS汇总数据 | 小鼠亚急性脊髓损伤模型(损伤后3-14天) | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 174 | 2025-10-31 |
Multi-omic profiling reveals age-related immune dynamics in healthy adults
2025-Oct-29, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09686-5
PMID:41162704
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研究论文 | 通过多组学分析揭示健康成年人年龄相关的免疫动态变化 | 发现T细胞亚群随年龄发生稳健的非线性转录重编程,且该过程不受系统性炎症或慢性巨细胞病毒感染驱动 | 样本仅来自健康成年人,未包含疾病人群或更年轻年龄组 | 探究年龄对免疫系统动态变化的影响 | 300多名健康成年人(25-90岁)的外周免疫系统 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 流式细胞数据 | 300多名健康成年人,其中96人进行为期2年的纵向跟踪 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 175 | 2025-10-31 |
Distinct senotypes in p16- and p21-positive cells across human and mouse aging tissues
2025-Oct-29, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00601-2
PMID:41162753
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研究论文 | 通过分析人和小鼠衰老组织的单细胞RNA测序数据,揭示了p21和p16阳性细胞中衰老相关分泌表型的异质性 | 首次在体内系统比较p21和p16阳性细胞的衰老特征,发现它们具有独立的轨迹动态且缺乏共表达 | 基于转录组数据的分析,需要进一步实验验证功能差异 | 阐明p21和p16在细胞衰老过程中的不同作用机制 | 人和小鼠多种衰老组织中的细胞 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序, RNA velocity分析, 伪时间分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个单细胞RNA测序数据集,涵盖人和小鼠多种组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 176 | 2025-10-31 |
Spatiotemporal gene expression and cellular dynamics of the developing human heart
2025-Oct-29, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02352-6
PMID:41162788
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研究论文 | 通过结合空间和单细胞转录组学技术,揭示了人类早期心脏发育的分子景观和细胞动态 | 首次提供了人类早期心脏发育的高分辨率转录组图谱,揭示了心脏起搏传导系统、心脏瓣膜和房间隔的形成机制,并发现了心脏间充质细胞的意外多样性 | 研究时间窗口仅限于孕后5.5至14周,可能无法完全覆盖心脏发育的整个过程 | 探索人类心脏发育过程中的时空基因表达模式和细胞动态 | 人类早期发育心脏组织(孕后5.5-14周) | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 成像验证 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据, 图像数据 | 孕后5.5至14周的人类心脏发育样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 177 | 2025-10-31 |
Mapping disease-specific vascular cell populations responsible for obliterative arterial remodelling during the development of pulmonary arterial hypertension
2025-Oct-28, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf146
PMID:40875786
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别肺动脉高压发展中导致闭塞性动脉重构的疾病特异性血管细胞群 | 首次在肺动脉高压模型中通过多时间点单细胞转录组分析鉴定出两种疾病特异性内皮细胞群,并发现TM4SF1作为动脉重构的新治疗靶点 | 研究基于动物模型,在人类患者中的验证仍需进一步研究 | 阐明肺动脉高压发展中闭塞性动脉病变形成的细胞机制 | 肺动脉高压大鼠模型和PAH患者的肺组织细胞 | 单细胞组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,RNA velocity分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个时间点的肺动脉高压模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 178 | 2025-10-31 |
Changes in neural progenitor lineage composition during astrocytic differentiation of human iPSCs
2025-Oct-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96423
PMID:41150379
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研究论文 | 本研究通过追踪人类iPSCs分化为星形胶质细胞的过程,揭示了神经祖细胞谱系组成的变化及其对星形胶质细胞区域特性的影响 | 首次证明iPSCs衍生的星形胶质细胞谱系组成不能准确反映原始祖细胞群体,并识别了LMX1A祖细胞来源星形胶质细胞的独特转录组特征 | 研究仅聚焦于LMX1A腹侧中脑祖细胞,未涵盖其他脑区祖细胞类型 | 探究人类iPSCs分化为星形胶质细胞过程中神经祖细胞谱系组成的变化规律 | 人类诱导多能干细胞(iPSCs)及其分化的神经祖细胞和星形胶质细胞 | 干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,细胞谱系追踪 | 人类iPSCs分化模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 深度单细胞RNA测序 |
| 179 | 2025-10-31 |
Spatial immune landscapes of the human placenta: Biomarkers and therapeutic insights in pregnancy disorders
2025-Oct-28, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118688
PMID:41160999
|
研究论文 | 通过空间转录组学和蛋白质组学技术解析人类胎盘的免疫景观,揭示妊娠疾病中的生物标志物和治疗机会 | 首次利用空间分析技术揭示胎盘微环境中免疫检查点改变、滋养细胞侵袭模式和局部炎症反应的空间组织特征 | 需要与多组学和纵向分析进一步整合以验证空间发现 | 研究胎盘微环境中的免疫和滋养细胞失调机制,开发妊娠疾病的诊断和治疗策略 | 人类胎盘组织 | 空间转录组学 | 妊娠疾病 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 180 | 2025-10-31 |
Systemic immune activity occurs during human immune system maturation
2025-Oct-28, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.10.003
PMID:41161316
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示人类胎儿免疫系统在妊娠中期存在系统性免疫活动 | 发现胎儿期存在广泛分布的活化T细胞和跨器官共享的组织驻留记忆克隆,挑战了胎儿免疫静息的主流范式 | NA | 研究人类免疫系统发育和耐受机制 | 321个样本中的2,868,420个免疫细胞,涵盖23个器官 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据,T细胞受体序列数据 | 321个样本,2,868,420个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |