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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-07-15 |
Single-cell RNA sequencing and Mendelian randomization identify context-dependent LIPA-associated classical monocyte states in sepsis and breast cancer
2026-Apr-17, Breast cancer research and treatment
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10549-026-07965-x
PMID:41991741
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,鉴定败血症和乳腺癌中与LIPA相关的经典单核细胞状态及其环境依赖性 | 首次结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法,揭示LIPA基因在败血症和乳腺癌两种疾病环境中对经典单核细胞状态的差异调控作用 | 研究结果仅作为假设生成,需要未来配对样本、机制性和实验性研究来验证LIPA在免疫调节和乳腺癌中的功能相关性 | 探究LIPA基因在败血症和乳腺癌中与经典单核细胞状态的环境依赖性关联 | 败血症和乳腺癌患者的外周血单核细胞及肿瘤微环境中的经典单核细胞 | 单细胞转录组学、基因组学 | 乳腺癌、败血症 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化 | NA | 单细胞转录组数据 | 乳腺癌和败血症的单细胞RNA测序数据集,以及独立验证的乳腺癌患者外周血单核细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 162 | 2026-07-15 |
Deciphering oxidative stress-related heterogeneity and developing a prognostic signature for colorectal cancer
2026-Apr-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-46560-4
PMID:41935137
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研究论文 | 通过单细胞和批量RNA-seq数据解析氧化应激相关异质性,构建结直肠癌预后风险评分模型 | 创新性地结合单细胞和批量转录组数据解析氧化应激在结直肠癌肿瘤微环境中的异质性,并构建了12基因的氧化应激相关风险评分(OSRRS)模型 | 未明确说明局限性 | 揭示氧化应激对结直肠癌肿瘤微环境的影响,并开发OS相关风险评分模型 | 结直肠癌恶性肿瘤细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq, qRT-PCR, IHC | LASSO Cox | 转录组数据 | 单细胞RNA-seq数据集GSE132465、TCGA-CRC批量RNA-seq数据集、GSE39582和GSE17538验证队列 | NA | NA | NA | NA |
| 163 | 2026-07-15 |
New perspectives on the mechanisms and treatment of valvular heart disease: Mendelian randomization and systematic analysis based on plasma proteins
2026-Apr-03, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000048210
PMID:41931316
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化和整合分析方法,识别心脏瓣膜病的分子靶点和潜在治疗药物 | 首次将孟德尔随机化、药物重定位与单细胞RNA测序结合,系统分析心脏瓣膜病的分子机制和候选药物 | 仅基于公共GWAS数据,缺乏实验验证, 且药物预测需进一步临床检验 | 识别心脏瓣膜病的关键分子靶点和潜在治疗候选物 | 心脏瓣膜病患者及其相关基因和蛋白质 | 机器学习 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 基于公共GWAS数据集,未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 164 | 2026-07-15 |
Transcriptome data combined with two-sample Mendelian randomization reveal IRF1 and PRKD1 as UPR-related key regulators in intervertebral disc degeneration
2026-Apr-03, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000048213
PMID:41931350
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研究论文 | 通过整合转录组数据与双样本孟德尔随机化分析,发现IRF1和PRKD1是椎间盘退变中UPR相关的关键调控因子 | 首次结合双样本孟德尔随机化与单细胞RNA测序数据,证实IRF1和PRKD1与椎间盘退变风险的因果关系,并揭示其在免疫浸润中的角色 | 基于公共数据库的样本量有限,且未进行体外或体内实验验证因果关系的机制 | 探索内质网应激与未折叠蛋白反应在椎间盘退变中的分子调控机制 | 人类髓核组织样本中的差异表达基因、免疫细胞浸润及转录因子靶点 | 机器学习 | 椎间盘退变 | 转录组学、孟德尔随机化、单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据 | 包含GSE70362和GSE56081两个转录组数据集,以及独立验证数据集和单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 165 | 2026-07-15 |
Regulation of mitochondrial ROS by C15ORF48 in a basal cell subpopulation contributes to chemotherapy resistance in TNBC
2026-Apr-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec8684
PMID:41931605
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示在TNBC中C15ORF48在基底细胞亚群中调控线粒体ROS导致化疗耐药的机制 | 首次发现C15ORF48作为线粒体细胞色素c氧化酶相关亚基FA4的旁系同源物,在基底细胞亚群中上调并通过抑制ROS积累诱导化疗耐药,为克服TNBC耐药提供新靶点 | NA | 阐明三阴性乳腺癌对标准化疗(阿霉素和环磷酰胺)耐药的分子机制 | 三阴性乳腺癌患者来源的异种移植模型中的肿瘤上皮细胞 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 166 | 2026-07-15 |
TMBIM6 enhances dopaminergic neuron survival by modulating the IRE1a pathway in Parkinson's disease
2026-Apr-03, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08391-5
PMID:41932887
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研究论文 | 该研究揭示了TMBIM6通过调控IRE1a通路增强帕金森病中多巴胺能神经元存活的机制 | 首次发现TMBIM6在帕金森病中通过直接结合IRE1a调控未折叠蛋白反应,并证明TMBIM6/IRE1a轴可作为潜在治疗靶点 | 文章未明确提及研究局限性,但可能包括动物模型与人类疾病的差异以及机制验证的深度限制 | 探究TMBIM6在帕金森病多巴胺能神经元变性中的作用及其分子机制 | 帕金森病细胞模型、原代神经元、果蝇模型和小鼠模型 | 机器学习 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 基因表达数据 | 包括细胞模型、原代神经元、果蝇和小鼠样本,具体数量未提及 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 167 | 2026-07-15 |
PMEPA1 modulates YAP1 nuclear translocation to disrupt EMT subtypes and promote metastasis in Biliary tract cancer
2026-Apr-03, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08684-3
PMID:41932868
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和多组学分析,揭示PMEPA1通过调控YAP1核转位促进胆道癌EMT亚型转化和转移的分子机制 | 首次发现PMEPA1通过抑制LATS1/2激酶活性绕过Hippo肿瘤抑制通路,释放YAP1入核启动促EMT基因表达程序,并提出了拓扑异构酶抑制剂SN-38作为潜在治疗药物 | 未明确说明样本来源及体内外验证的具体模型限制,可能缺乏大样本临床队列验证 | 阐明胆道癌EMT的分子调控机制,识别关键调控因子并探索靶向治疗策略 | 胆道癌患者样本及细胞系 | 数字病理学 | 胆道癌 | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 47个胆道癌样本 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序, Illumina NovaSeq测序平台 |
| 168 | 2026-07-15 |
Research progress in heterogeneity of dental mesenchymal stem cells
2026-Apr-03, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-026-00433-8
PMID:41932866
|
综述 | 综述了牙科间充质干细胞在发育异质性和亚群异质性方面的研究进展 | 应用单细胞RNA测序等新技术揭示了牙科间充质干细胞的发育层次和异质性 | NA | 整合牙齿和牙周组织发育过程中牙科间充质干细胞异质性的现有知识 | 颅神经嵴来源的牙科间充质干细胞及相关细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 169 | 2026-07-15 |
Single-cell transcriptomics reveals FXR1 as an actionable target for siRNA therapy in ovarian cancer
2026-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71468-y
PMID:41932914
|
研究论文 | 单细胞转录组学揭示FXR1是卵巢癌中siRNA治疗的一个可行靶点 | 首次利用单细胞RNA测序分析高表达FXR1的卵巢癌腹水样本,证实LNA修饰的siRNA(siFXR1-LNA)在体内比天然siRNA更有效抑制肿瘤生长、腹水形成和转移,并揭示FXR1沉默对肿瘤细胞增殖及免疫细胞亚群的调控作用 | 未提供具体样本量或临床前模型的详细限制描述 | 评估FXR1作为卵巢癌中siRNA治疗靶点的可行性和机制 | 卵巢癌肿瘤组织、腹水中的肿瘤细胞、基质细胞和免疫细胞 | 机器学习 | 卵巢癌 | RNA干扰、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'转录组学 |
| 170 | 2026-07-15 |
Spatially resolved osteoblast-traced transcriptomics uncovers TGF-β as a combination target with sclerostin in osteoporosis
2026-Apr-02, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-026-00521-9
PMID:41927532
|
研究论文 | 利用空间分辨成骨细胞示踪转录组学揭示TGF-β与硬骨抑素联合治疗骨质疏松的潜力 | 首次结合成骨细胞特异性谱系追踪和空间分辨激光激活细胞分选技术,实现对静息骨表面成骨细胞状态的空间转录组分析,并发现TGF-β作为成骨细胞活化调控因子,提出双靶点治疗策略 | 未提及具体限制 | 阐明成骨细胞在静息与激活状态间动态转换的分子机制,并探索骨质疏松新型治疗靶点 | 小鼠成骨细胞及骨组织 | 机器学习 | 骨质疏松 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠模型(后肢卸载模型)及体外实验样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 空间分辨激光激活细胞分选(SLACS)结合10x Visium空间转录组学;10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 171 | 2026-07-15 |
MYC-induced USP10 stabilizes SOX4 to promote thymocyte proliferation and leukemia onset in mice
2026-Apr-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71084-w
PMID:41927540
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研究论文 | 本研究揭示了MYC诱导的USP10通过稳定SOX4促进胸腺细胞增殖及小鼠白血病发生的分子机制 | 首次整合去泛素化酶文库筛选与单细胞RNA测序,发现USP10是连接胸腺细胞发育信号、增殖信号与白血病转化的关键协调因子,并验证其作为T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)治疗靶点的潜力 | 研究主要在动物模型中进行,USP10在人类T-ALL患者中的作用机制及其临床应用价值仍需进一步验证 | 阐明胸腺细胞发育异常与白血病发生的分子机制,特别是去泛素化酶USP10在此过程中的功能 | 小鼠胸腺细胞、人胸腺细胞及T-ALL患者外周血样本 | 机器学习 | 白血病(T细胞急性淋巴细胞白血病,T-ALL) | 去泛素化酶文库筛选、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 小鼠胸腺细胞、人胸腺细胞及T-ALL患者外周血样本(具体数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 公开可用的单细胞RNA测序数据 |
| 172 | 2026-07-15 |
Single-cell transcriptome profiling reveals herpesviral manipulation of host processes in spleen of gibel carp infected with a Cyvirus cyprinidallo2
2026-Apr, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1014114
PMID:41926453
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示疱疹病毒对银鲫脾脏宿主过程的操控 | 首次通过单细胞RNA测序解析了鲤疱疹病毒2型在体内的允许细胞类型及其对宿主细胞过程的精细操控机制,发现了病毒诱导的广泛宿主过程抑制和M2型巨噬细胞极化 | 研究仅聚焦于脾脏组织,未涵盖其他可能受影响的组织或器官,且缺乏对病毒潜伏期和再激活机制的探讨 | 揭示鲤疱疹病毒2型(CaHV)在银鲫体内的感染机制及与宿主的相互作用 | 感染鲤疱疹病毒2型(CaHV)的银鲫脾脏细胞 | 单细胞转录组学 | 疱疹病毒性造血坏死病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞基因表达数据 | 感染CaHV的银鲫脾脏样本(具体数量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA |
| 173 | 2026-07-15 |
"Eye-Conic" Spatial Transcriptomics Reveals the Layer-Specific Molecular Alterations in Corneas of Patients With Keratoconus
2026-Apr-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.4.7
PMID:41931003
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研究论文 | 使用空间转录组学揭示圆锥角膜患者角膜的层特异性分子改变 | 首次应用空间转录组学方法研究圆锥角膜角膜的层特异性分子改变,揭示细胞周期失调、细胞外基质通路上调及内皮层翻译和核糖体通路激活等新发现 | 信息未提供 | 识别圆锥角膜锥形成过程中角膜层特异性细胞和分子改变 | 圆锥角膜和正常对照角膜 | 数字病理学 | 圆锥角膜 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 圆锥角膜和对照角膜样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 174 | 2026-07-15 |
Using cell-specific late-phase asthma mRNA biomarkers to repurpose drugs that concurrently reverse disease signatures across multiple immune cell-types
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014081
PMID:41931526
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research paper | 本研究利用哮喘晚期反应特异性mRNA生物标志物,通过药物特征匹配重新定位药物,以逆转多个免疫细胞类型中的疾病特征 | 结合血液生物标志物与单细胞RNA测序数据,识别细胞特异性转录变化,并通过公共单细胞扰动数据集进行药物特征匹配,发现能逆转这些变化的化合物 | 研究样本量较小,且仅基于轻度过敏性哮喘患者,结果需在更大样本和更严重患者中验证 | 探索哮喘晚期反应mRNA生物标志物在预测哮喘恶化和严重程度中的作用,并识别潜在的治疗药物 | 轻度过敏性哮喘患者 | machine learning | asthma | RNA-seq, single-cell RNA sequencing | NA | gene expression data, single-cell RNA sequencing data | 轻度过敏性哮喘患者,具体数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 175 | 2026-07-15 |
Multi omics analysis reveals senescence associated genes in metabolic dysfunction associated steatohepatitis related liver cancer and their functional validation
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151713
PMID:41933769
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research paper | 通过多组学分析揭示代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌中的衰老相关基因并进行功能验证 | 首次系统性地筛选并验证了SOD2、ALDH2、MME和IGFBP1四个衰老相关基因在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌中的关键作用,并发现EPZ5676药物对这些基因具有良好亲和力,为MRLC的靶向治疗提供新思路 | 未提及明显的局限性,但可能包括样本量有限或动物模型与人类疾病的差异 | 探究衰老相关基因在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌中的作用及其潜在治疗靶点 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌患者和C57BL/6小鼠模型 | 机器学习 | 肝癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 多机器学习方法(包括加权基因共表达网络分析、Mendelian randomization等) | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 全球疾病负担数据库分析,C57BL/6小鼠模型用于实验验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 176 | 2026-07-15 |
LAML-Pro: Joint Maximum Likelihood Inference of Cell Genotypes and Cell Lineage Trees
2026-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.27.714879
PMID:41959070
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研究论文 | 提出LAML-Pro算法,通过联合最大似然推断细胞基因型和细胞谱系树,以纠正基因型错误并提高谱系树重建的准确性 | 首次实现从原始测序或成像数据中联合推断细胞基因型和谱系树,而非分步进行,有效减少基因型错误对谱系树重建的影响 | 主要基于模拟数据和两类成像谱系追踪系统验证,真实应用场景的泛化性有待进一步测试 | 开发一种能同时纠正基因型错误并重建细胞谱系树的算法 | 通过基因编辑技术(如CRISPR)诱导的遗传疤痕数据进行谱系追踪的细胞 | 计算生物学 | NA | 单细胞测序、成像、基因编辑谱系追踪 | PMMO模型、最大似然估计 | 测序数据、荧光成像数据 | 数千个细胞(模拟数据和两类成像谱系追踪系统数据) | NA | 单细胞测序、成像谱系追踪 | NA | NA |
| 177 | 2026-07-15 |
Transcriptional mechanisms of sex-biased gene expression and their connections to disease-associated variation
2026-Mar-23, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddag019
PMID:41934611
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研究论文 | 利用单细胞RNA-seq分析480个淋巴母细胞系中性别偏倚基因表达的转录机制及其与疾病相关遗传变异的关联 | 首次大规模鉴定性别偏倚表达基因及其上游转录因子调控机制,并通过性别特异性eQTL分析揭示其与多种疾病(特别是自身免疫疾病)的遗传关联 | 独立数据集验证结果较为有限,需要进一步复制研究 | 探索性别偏倚基因表达的转录调控机制及其对疾病相关遗传变异的影响 | 480个淋巴母细胞系(LCLs)及其单细胞转录组数据 | 计算机视觉 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA-seq,eQTL分析 | 机器学习,线性模型 | 单细胞转录组数据 | 480个淋巴母细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 178 | 2026-07-15 |
Single-cell RNA sequencing dissect the immunological network of immune checkpoint inhibitors-induced myocarditis
2026-Mar-23, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddag025
PMID:41934610
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析免疫检查点抑制剂诱导心肌炎的免疫网络 | 首次在相对低剂量PD-1/PD-L1抑制剂处理的小鼠模型中,通过单细胞RNA测序揭示CCL5+CD8+ T细胞与CCR5+巨噬细胞的相互作用及成纤维细胞激活在心肌炎发病中的作用 | 研究仅基于小鼠模型,尚需在人类患者中验证;BMS-1剂量虽较低,但仍可能影响免疫系统的整体复杂度 | 探索免疫检查点抑制剂诱导心肌炎的潜在机制 | 小鼠心脏组织和外周血单核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型,实验组和对照组各若干样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 179 | 2026-07-15 |
[Mechanism of MDA5 in macrophages in SiO(2)-induced epithelial-mesenchymal transition]
2026-Mar-20, Zhonghua lao dong wei sheng zhi ye bing za zhi = Zhonghua laodong weisheng zhiyebing zazhi = Chinese journal of industrial hygiene and occupational diseases
|
研究论文 | 探讨巨噬细胞中MDA5在SiO2诱导肺上皮细胞上皮-间充质转化中的调控作用及分子机制 | 首次揭示巨噬细胞来源的MDA5在矽肺纤维化中通过促炎级联反应诱导肺上皮EMT的机制 | 仅使用小鼠模型和体外细胞实验,缺乏临床样本验证;MDA5在矽肺患者中的具体作用尚需进一步研究 | 阐明巨噬细胞MDA5在SiO2诱导肺上皮细胞EMT中的调控机制 | C57BL/6小鼠、THP-1细胞、A549细胞 | 机器学习 | 矽肺 | 单细胞RNA测序、Western blot、qRT-PCR、siRNA敲低 | NA | 基因表达数据 | 16只小鼠(每组8只,每组2只用于测序,6只用于实验);THP-1细胞设4组,每组3个重复 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 180 | 2026-07-15 |
NEXT-scASV: a Nextflow pipeline for allele-specific variant calling from single-cell RNA-seq data
2026-01-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag042
PMID:41947412
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研究论文 | 提出了一个用于从单细胞RNA-seq数据进行等位基因特异性变异检测的可扩展Nextflow流程 | 自动化整个流程,从读段比对到等位基因失衡统计评估,无需先验基因型即可进行从头检测,并支持大规模并行化处理现代图谱级研究 | 未明确提及局限性 | 开发一个可重复、可扩展的NEXT-scASV流程,用于从单细胞RNA测序数据中识别等位基因特异性变异 | 外周血单核细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 序列数据 | 135,000个PBMC细胞来自57名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 5'单细胞RNA测序 |