单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32278 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-11-06 |
New advances on the interaction between internal and external factors in the tumor microenvironment of solid tumors
2025-Nov-05, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2025.2585349
PMID:41177968
|
综述 | 本文综述了实体瘤肿瘤微环境中内外因素相互作用的最新研究进展，重点关注肿瘤免疫逃逸、代谢重编程和神经免疫等领域 | 整合单细胞测序和空间肿瘤学技术揭示肿瘤微环境中细胞间相互作用的复杂细节，为联合免疫治疗提供新思路 | 基于文献综述，缺乏原始实验数据验证 | 寻求突破实体瘤免疫治疗瓶颈的联合治疗方案 | 实体瘤肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 实体瘤 | 单细胞测序技术,空间肿瘤学技术 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 162 | 2025-11-06 |
Single-Cell RNA Sequencing of Retina Reveals Nna1 Upregulation in Myopic Diabetic Retinopathy as a Protective Factor Against Diabetic Damage
2025-Nov-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500438
PMID:41190783
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现近视糖尿病视网膜病变中Nna1上调，并证实其通过抑制微管过度谷氨酰化发挥保护作用 | 首次揭示Nna1在近视对糖尿病视网膜病变保护作用中的关键机制，发现其通过调节微管谷氨酰化水平影响细胞自噬和凋亡 | 研究主要基于动物模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究近视对糖尿病视网膜病变的保护机制及Nna1在此过程中的作用 | db/db糖尿病小鼠的视网膜组织及Müller细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | db/db糖尿病小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 163 | 2025-11-06 |
A Single-Cell-Inspired Self-Enrichment Therapeutic Strategy Delays Intervertebral Disc Degeneration by Inhibiting Pyroptosis
2025-Nov-05, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202516405
PMID:41190793
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学与临床验证构建椎间盘退变细胞图谱，开发自富集纳米载体延缓椎间盘退变进程 | 首次发现STING介导的炎症通路激活髓核细胞焦亡机制，并设计具有不对称气泡推进功能的自富集纳米载体实现病变组织选择性穿透 | 未明确纳米载体在长期使用中的潜在安全性问题及临床转化可行性 | 开发靶向治疗策略延缓椎间盘退变进程 | 椎间盘退变组织及髓核细胞 | 单细胞组学与纳米医学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序, 纳米载体技术, siRNA干扰 | NA | 单细胞转录组数据, 体内外实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 164 | 2025-11-06 |
Spatial transcriptomic landscape and cellular neighborhood heterogeneity in cervical cancer: integrative single-cell and spatial RNA sequencing analysis
2025-Nov-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03788-2
PMID:41191175
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，构建了首个宫颈癌全面空间分子图谱 | 首次构建宫颈癌空间转录组图谱，识别38个具有独特分子特征的细胞邻域，揭示肿瘤微环境的空间组织模式 | 主要依赖公共数据库数据，仅使用HeLa和SiHa两种细胞系进行体外验证 | 解析宫颈癌的空间转录组景观和细胞邻域异质性 | 宫颈癌组织样本和HeLa、SiHa细胞系 | 空间转录组学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 定量PCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 公共GEO数据库数据集和两种细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium平台 |
| 165 | 2025-11-06 |
Exploration of prognosis and immune infiltration characteristics in glioblastoma multiforme based on lipid metabolism related genes
2025-Nov-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03865-6
PMID:41191203
|
研究论文 | 本研究基于脂代谢相关基因探索多形性胶质母细胞瘤的预后和免疫浸润特征 | 首次基于脂代谢相关基因将GBM患者分为不同预后亚群，并鉴定出四个新的预后相关枢纽基因 | 使用公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 识别GBM中与脂代谢相关的预后生物标志物和治疗靶点 | 多形性胶质母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 多形性胶质母细胞瘤 | 转录组分析，单细胞测序，生物信息学算法 | LASSO-Cox回归分析 | 临床数据和转录组数据 | TCGA和GEO数据库中的GBM患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 166 | 2025-11-06 |
Identification of lactylation-related biomarkers in HNSC by integrating machine learning and Spatial transcriptomics analysis
2025-Nov-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03849-6
PMID:41191207
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习和空间转录组学分析，识别头颈部鳞状细胞癌中与乳酸化修饰相关的关键生物标志物 | 首次结合12种机器学习方法和空间转录组学技术系统筛选HNSC中乳酸化相关基因，并发现MSN、KIF2C和RFC4在肿瘤核心区域特异性表达 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证这些生物标志物的功能机制 | 识别头颈部鳞状细胞癌中乳酸化相关关键基因及其预后价值 | 头颈部鳞状细胞癌患者基因表达数据 | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, Western blotting, RT-qPCR | Limma, WGCNA, 12种机器学习方法, CIBERSORT, UMAP | 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞数据 | TCGA-HNSC队列和GSE6631数据集 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 167 | 2025-11-06 |
Microvascular Endothelial Cells License APS Vasculopathy Through YAP1- and CCN2-Mediated Signaling
2025-Nov-04, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究揭示抗磷脂综合征微血管内皮细胞通过YAP1-CCN2信号通路促进血管病变的机制 | 首次发现YAP1-CCN2信号轴在APS血管病变中的关键作用，并证明抗CCN2抗体可抑制血管平滑肌细胞增殖 | 研究主要基于皮肤和肾脏样本，其他器官血管病变机制仍需验证 | 阐明抗磷脂综合征微血管病变的分子机制 | 抗磷脂综合征患者皮肤活检组织、血浆样本及小鼠模型 | 单细胞生物学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光显微镜, ELISA, 定量PCR, 免疫印迹 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据, 显微镜图像, 蛋白质定量数据 | APS患者皮肤活检和肾脏活检样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 168 | 2025-11-06 |
Sig27 stratifies prostate cancer recurrence via assessing tumor's immunosuppressive properties
2025-Nov-04, Endocrine-related cancer
IF:4.1Q2
DOI:10.1530/ERC-25-0326
PMID:41186269
|
研究论文 | 本研究开发了Sig27基因面板及其衍生面板Sig27IMG，用于评估前列腺癌的免疫抑制特性并预测复发风险 | 首次提出27基因面板Sig27及其5基因核心面板Sig27IMG，能够通过评估肿瘤免疫抑制特性来分层前列腺癌复发风险 | 研究基于现有数据集，需要进一步实验验证 | 开发前列腺癌复发风险分层工具并探索其免疫学机制 | 前列腺癌患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 前列腺癌 | RNA测序 | 基因表达面板 | 基因表达数据 | 批量RNA-seq数据集13个(n=3,133肿瘤)，单细胞RNA-seq数据集6个(n=53患者) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 169 | 2025-11-06 |
Benchmarking porcine pancreatic ductal organoids for drug screening applications
2025-Nov-04, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-025-00330-3
PMID:41188536
|
研究论文 | 本研究建立并评估猪胰腺导管类器官作为药物筛选平台的应用潜力 | 首次建立猪胰腺导管类器官模型，通过单细胞RNA测序与人类胰腺导管类器官进行系统比对 | 猪胰腺导管类器官向内分泌谱系的分化潜力有限 | 开发可靠的胰腺导管/祖细胞生物学模型用于药物筛选 | 猪胰腺导管类器官、人类胰腺导管类器官和原代猪胰腺组织 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 多个发育阶段的猪胰腺导管类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 170 | 2025-11-06 |
Single-cell resolution spatial transcriptomic signature of the retrosplenial cortex during memory consolidation
2025-Nov-04, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03331-3
PMID:41188622
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了压后皮层在空间记忆巩固过程中的分子特征 | 首次在单细胞分辨率下解析了压后皮层在记忆巩固期间的转录组特征，并发现了阿尔茨海默病模型中神经元激活的减少 | 研究主要聚焦于小鼠模型，结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 探索压后皮层在空间记忆巩固过程中的分子机制 | 小鼠压后皮层的兴奋性神经元 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病及相关痴呆 | 空间转录组学，深度学习计算工具，化学遗传学方法 | 深度学习 | 空间转录组数据 | 成年小鼠压后皮层组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组分析 |
| 171 | 2025-11-06 |
Single Cell Sequencing Identifies Distinct Cellular Alterations in Impaired Aged and Diabetic Wounds
2025-Nov-04, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70217
PMID:41189300
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较老年和糖尿病小鼠伤口愈合的细胞差异 | 首次在单细胞水平直接比较老年和糖尿病伤口愈合过程，揭示不同的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本验证 | 探究老年和糖尿病伤口愈合障碍的细胞机制差异 | 老年和糖尿病小鼠的伤口组织 | 单细胞组学 | 糖尿病、老年性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，伪时序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 老年和糖尿病小鼠伤口组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 172 | 2025-11-06 |
Single-cell characterization of trophoblast-epithelial interactions at the human maternal-fetal interface during early implantation
2025-Nov-04, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf246
PMID:41189328
|
研究论文 | 本研究利用输卵管异位妊娠模型通过单细胞RNA测序技术探索人早期胚胎植入过程中母胎界面滋养细胞与上皮细胞的相互作用机制 | 首次利用输卵管异位妊娠模型作为研究工具，通过单细胞转录组分析揭示母胎界面细胞间通讯网络 | 研究基于异位妊娠模型，与正常宫内妊娠存在生理环境差异 | 阐明人类早期胚胎植入过程中母胎界面的分子机制 | 输卵管异位妊娠和正常宫内妊娠的母胎界面组织 | 单细胞生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色 | CellPhoneDB，CellChat | 单细胞转录组数据 | 输卵管异位妊娠患者植入部位样本及公共数据库正常宫内妊娠数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 173 | 2025-11-06 |
Epigenetic repression of hepatocyte FoxO1 disrupts local immune homeostasis and promotes liver inflammation
2025-Nov-04, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001590
PMID:41190981
|
研究论文 | 本研究揭示了肝细胞FoxO1通过JMJD1C维持的表观遗传调控在肝脏免疫稳态中的关键作用 | 首次发现JMJD1C通过调控Foxo1启动子区H3K9二甲基化水平控制FoxO1转录，从而维持肝脏局部免疫稳态的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 阐明肝细胞FoxO1在肝脏免疫稳态和炎症中的作用机制 | 人类肝脏样本、肝细胞特异性Foxo1敲除小鼠、酒精性肝炎和血吸虫病肝病小鼠模型 | 表观遗传学 | 肝脏炎症性疾病 | 单细胞RNA测序、CUT&Tag分析、转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | 多种肝脏疾病患者样本和基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 174 | 2025-11-06 |
Mouse cortical cellular diversification through lineage progression of radial glia
2025-Nov-03, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.352826.125
PMID:40774817
|
研究论文 | 通过时间序列单细胞测序技术研究小鼠皮层放射状胶质细胞的谱系进展与细胞多样化机制 | 首次构建了皮层细胞谱系进展的全面分子图谱，揭示染色质可及性通过限制转录因子表达时序驱动细胞多样化的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，人类皮层发育可能存在物种特异性差异 | 探索皮层细胞多样化的细胞内在程序机制 | 小鼠皮层放射状胶质细胞及其衍生细胞类型 | 发育生物学 | NA | scRNA-seq, snATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据，单细胞染色质可及性数据 | 胚胎期和出生后多个发育阶段的小鼠皮层祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 175 | 2025-11-06 |
Neoadjuvant Immunotherapy Promotes the Formation of Mature Tertiary Lymphoid Structures in a Remodeled Pancreatic Tumor Microenvironment
2025-Nov-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0387
PMID:40815230
|
研究论文 | 本研究通过构建胰腺导管腺癌的空间多组学图谱，揭示了新辅助免疫治疗促进成熟三级淋巴结构形成及其在肿瘤微环境重塑中的作用 | 首次报道了新辅助免疫治疗在胰腺癌中促进成熟三级淋巴结构形成的空间特征，并发现了与患者生存改善相关的TLS特异性空间基因表达特征 | 研究样本量有限，且主要关注特定免疫治疗方案下的反应机制 | 探究三级淋巴结构在胰腺导管腺癌免疫治疗中的作用及其空间分布特征 | 接受新辅助免疫治疗联合治疗的胰腺导管腺癌患者肿瘤组织及肿瘤邻近淋巴结 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 成像质谱流式技术,空间转录组学,无监督基因表达矩阵分解 | 机器学习分类模型,无监督学习 | 图像,基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,成像质谱流式 | NA | NA |
| 176 | 2025-11-06 |
Highly accurate reference and method selection for universal cross-data set cell type annotation with CAMUS
2025-Nov-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280821.125
PMID:41034048
|
研究论文 | 提出一种通用参考数据和方法选择策略CAMUS，用于跨数据集细胞类型注释 | 开发了首个通用参考数据和方法选择策略，显著提升细胞类型注释准确性 | NA | 提高单细胞数据中细胞类型注释的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据和单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞测序数据 | 672对跨物种scRNA-seq数据集，80个scST数据集，5个scATAC-seq数据集 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 177 | 2025-11-06 |
Evaluation of Proton Minibeam Radiotherapy on Antitumor Immune Responses in a Rat Model of Glioblastoma
2025-Nov-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0902
PMID:40833465
|
研究论文 | 评估质子微束放疗在胶质母细胞瘤大鼠模型中对抗肿瘤免疫反应的影响 | 首次在临床前胶质母细胞瘤模型中系统研究质子微束放疗的免疫调节作用，发现其优于传统质子疗法的免疫激活特性 | 研究仅限于大鼠模型，尚未在人体验证；单细胞转录组学分析可能未完全捕捉所有免疫细胞亚群 | 探索质子微束放疗对胶质母细胞瘤免疫反应的调节机制 | 胶质母细胞瘤原位大鼠模型 | 放射肿瘤学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学，质子微束放疗 | NA | 基因表达数据，免疫细胞密度数据 | 胶质母细胞瘤大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 178 | 2025-11-06 |
Protocol for decoding immune predictors of response to immunotherapy through pan-cancer multiomics analysis
2025-Nov-03, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104183
PMID:41187056
|
研究论文 | 提出一种通过单细胞多组学分析解码免疫检查点阻断治疗反应预测因子的实验方案 | 整合单细胞RNA测序、免疫分型和质谱流式技术，结合基因调控网络和细胞互作分析，建立跨癌种的免疫预测模型 | NA | 开发识别免疫治疗反应相关T细胞亚群和预测生物标志物的分析方法 | 多种癌症类型中的T细胞动态 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫分型, 质谱流式技术 | 基因调控网络分析, 细胞互作分析 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞免疫分析, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 179 | 2025-11-06 |
Monohaloacetamide disinfection by-products are potential risk factors for the quality of mouse oocytes
2025-Nov-03, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119343
PMID:41187544
|
研究论文 | 本研究系统评估了单卤乙酰胺消毒副产物对雌性小鼠生殖系统的毒性作用及分子机制 | 首次系统比较不同单卤乙酰胺的生殖毒性等级，并通过单细胞RNA测序揭示其分子作用机制 | 研究仅使用小鼠模型，未涉及人类样本；暴露浓度和时长可能无法完全反映真实环境暴露情况 | 评估单卤乙酰胺消毒副产物的生殖毒性及其分子机制 | 雌性小鼠卵母细胞 | 生殖毒理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,氧化应激生物标志物检测,线粒体功能测定,卵巢组织病理学分析 | 小鼠动物模型 | 基因表达数据,组织病理图像,生化指标数据 | 雌性小鼠群体（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | Smart-seq2 | Smart-seq2单细胞RNA测序技术 |
| 180 | 2025-11-06 |
A phenotypic brain organoid atlas and biobank for neurodevelopmental disorders
2025-Nov-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.10.006
PMID:41187745
|
研究论文 | 本研究建立了神经发育障碍的表型脑类器官图谱和生物样本库 | 创建了首个包含352个遗传多样性患者来源iPSCs的NDD生物样本库，并系统分析了6000多个脑类器官的组织学和单细胞转录组特征 | 仅从35名代表性患者中深入分析，样本规模相对有限 | 建立神经发育障碍的疾病模型并探索其细胞机制 | 神经发育障碍患者来源的诱导多能干细胞和脑类器官 | 发育神经生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组测序，组织学分析 | 脑类器官模型 | 单细胞RNA-seq数据，影像数据，基因组数据 | 352个iPSC系，35名代表性患者，6000多个脑类器官，10名神经典型对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |