单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
161	2025-10-04	Endogenous CD4+ T Cells That Recognize ALK and the NPM1::ALK Fusion Protein Can Be Expanded from Human Peripheral Blood 2025-Apr-02, Cancer immunology research IF:8.1Q1 DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0445 PMID:39774774	研究论文	本研究从人类外周血中成功扩增出能够识别ALK蛋白及NPM1::ALK融合蛋白的内源性CD4+ T细胞	首次在人类外周血中发现ALK特异性CD4+ T细胞，并鉴定出NPM1::ALK融合新抗原特异性T细胞受体	样本量较小（16名受试者），仅针对ALK阳性间变性大细胞淋巴瘤患者	探索ALK特异性CD4+ T细胞在癌症免疫治疗中的潜在应用价值	10名ALK阳性间变性大细胞淋巴瘤缓解期患者和6名健康捐赠者的外周血样本	免疫治疗	淋巴瘤	TCRαβ单细胞测序、自体树突状细胞刺激、长重叠肽段池	TCR报告细胞系（58α-β-）	血液样本、细胞免疫反应数据	16名受试者（10名患者+6名健康捐赠者）
162	2025-10-04	Investigation of the mechanism of Xiaoyin Jiedu Yin in the treatment of psoriasis based on bioinformatics, machine learning 2025, Frontiers in chemistry IF:3.8Q2 DOI:10.3389/fchem.2025.1623449 PMID:40735022	研究论文	基于生物信息学和机器学习探究消银解毒饮治疗银屑病的作用机制	首次结合网络药理学、机器学习靶点筛选与单细胞/空间转录组技术，发现AKR1B10是消银解毒饮治疗银屑病的核心靶点	仅通过体外细胞模型验证，缺乏体内实验验证	探究消银解毒饮治疗银屑病的药理作用机制	银屑病患者皮肤组织、IL-17A诱导的HaCaT细胞	生物信息学	银屑病	网络药理学、机器学习、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录omics(ST)	机器学习	基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据	未明确样本数量
163	2025-10-04	Single-Cell RNA Sequencing Shows Exercise Protects db/db Mouse Pancreatic Injuries by Regulating Endothelial Cell Homeostasis 2025, Journal of diabetes research IF:3.6Q2 DOI:10.1155/jdr/9676094 PMID:41030325	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示运动通过调节内皮细胞稳态保护db/db小鼠胰腺损伤的机制	首次在单细胞水平系统分析运动对糖尿病小鼠多种胰腺细胞类型的影响，特别是发现内皮细胞亚型在运动保护机制中的关键作用	研究仅使用db/db小鼠模型，样本量相对有限，且未验证其他糖尿病动物模型	探究运动对糖尿病胰腺多种细胞类型的保护作用及分子机制	6周龄雄性db/db小鼠	单细胞组学	2型糖尿病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)，基因本体(GO)富集分析	NA	单细胞转录组数据	db/db小鼠分组实验，运动干预10周（每周5天，每天50分钟）
164	2025-10-04	Spatial transcriptomics reveals distinct role of monocytes/macrophages with high FCGR3A expression in kidney transplant rejections 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1654741 PMID:41030449	研究论文	本研究通过空间转录组学分析揭示了FCGR3A高表达的单核/巨噬细胞在肾移植排斥中的关键作用	首次在肾移植排斥中识别出FCGR3A高表达的单核/巨噬细胞亚群，并揭示其空间分布与组织病理特征的对应关系	对特定先天免疫细胞亚群在肾移植排斥中的作用理解仍不完全	探究先天免疫细胞亚群在肾移植排斥中的作用机制	人类肾移植活检组织	空间转录组学	肾移植排斥	空间转录组学，FFPE组织活检	NA	转录组数据，空间分布数据	人类肾移植核心针活检样本
165	2025-10-04	Cytotoxic CD4+ T-follicular cells may mediate killing against lymphoma cells 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1657046 PMID:41030456	研究论文	本研究揭示了具有细胞毒性表型的CD4+ T滤泡细胞在淋巴瘤中的存在及其功能相关性	首次在滤泡性淋巴瘤和弥漫大B细胞淋巴瘤中鉴定出具有细胞毒性的CD4+ T滤泡辅助细胞亚群	NA	阐明杀伤性T滤泡细胞在不同淋巴瘤亚型中的存在和功能作用	滤泡性淋巴瘤和弥漫大B细胞淋巴瘤患者样本	免疫学	淋巴瘤	流式细胞术、单细胞RNA测序、免疫荧光染色、杀伤实验	NA	细胞悬浮液、测序数据、组织切片图像	滤泡性淋巴瘤和弥漫大B细胞淋巴瘤患者组织样本
166	2025-10-04	Characterization of MAIT cells in glioblastoma reveals a potential immunosuppressive role through a MAIT-neutrophil axis 2025 Jan-Dec, Neuro-oncology advances IF:3.7Q2 DOI:10.1093/noajnl/vdaf173 PMID:41030524	研究论文	本研究揭示了胶质母细胞瘤中MAIT细胞通过MAIT-中性粒细胞轴发挥免疫抑制作用的机制	首次系统表征胶质母细胞瘤中MAIT细胞的作用，发现MAIT-中性粒细胞轴这一新的免疫抑制机制	样本量相对有限（20例组织样本），需要进一步功能验证实验	探究MAIT细胞在胶质母细胞瘤免疫微环境中的作用机制	胶质母细胞瘤患者的外周血样本和肿瘤组织样本	肿瘤免疫学	胶质母细胞瘤	流式细胞术、bulk RNA-seq、scRNA-seq、多重组织成像	NA	流式细胞数据、RNA测序数据、组织成像数据	20例胶质母细胞瘤组织样本及对应外周血样本
167	2025-10-04	Exosome-based Sfrp2 inhibition in mesangial cells alleviates osteoporosis and promotes osteointegration in diabetic kidney disease 2025, Regenerative biomaterials IF:5.6Q1 DOI:10.1093/rb/rbaf093 PMID:41030909	研究论文	本研究通过外泌体介导的Sfrp2抑制改善糖尿病肾病中的骨质疏松并促进骨整合	首次发现肾小球系膜细胞分泌的SFRP2是连接肾脏损伤与骨丢失的关键分子桥梁，并利用外泌体靶向递送siRNA成功干预这一过程	研究主要基于动物模型，尚未在人体中验证	探究糖尿病肾病与骨质疏松之间的分子机制并开发治疗策略	糖尿病肾病小鼠和大鼠模型	分子生物学	糖尿病肾病	单细胞测序、外泌体递送技术、siRNA干扰	动物模型	基因表达数据、组织形态学数据	糖尿病小鼠和大鼠模型（具体数量未明确说明）
168	2025-10-04	Characterization of the phenotype and function of PRELP+ fibroblast subtype in liver metastatic colorectal cancer 2025, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2025.1615259 PMID:41031085	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序鉴定并表征了结直肠癌肝转移中PRELP阳性癌症相关成纤维细胞亚型的表型和功能	首次发现并系统表征了PRELP+ CAF这一与肝转移相关的特异性成纤维细胞亚型，揭示了其免疫抑制功能和终末分化状态	NA	探究结直肠癌肝转移中成纤维细胞的异质性和特定功能	原发性结直肠癌伴肝转移和肝转移性肿瘤组织样本	肿瘤生物学	结直肠癌肝转移	单细胞RNA测序、免疫荧光、转录组分析、伪时间轨迹分析、多重免疫荧光染色、细胞间通讯分析	NA	单细胞RNA测序数据、组织切片图像数据	NA
169	2025-10-04	Identification and Validation of Fibroblast-Associated Genes in Osteoarthritis Based on High-Dimensional Weighted Gene Coexpression Network Analysis 2025, Journal of immunology research IF:3.5Q2 DOI:10.1155/jimr/5547701 PMID:41031145	研究论文	基于单细胞转录组数据筛选与骨关节炎成纤维细胞相关的关键基因并构建诊断模型	首次结合成纤维细胞特异性单细胞数据和hdWGCNA方法系统筛选具有诊断潜力的关键基因	NA	筛选骨关节炎中与成纤维细胞相关的关键基因并探索其诊断价值	骨关节炎患者的基因表达数据	生物信息学	骨关节炎	RNA-seq, scRNA-seq, hdWGCNA, 细胞通讯分析	诊断模型	基因表达数据	来自GEO数据库的骨关节炎RNA-seq和scRNA-seq数据
170	2025-10-04	SPP1+ Macrophage-Associated Prognostic Signature in Hepatocellular Carcinoma via Integrated Single-Cell and Bulk Transcriptomic Analysis 2025, International journal of genomics IF:2.6Q2 DOI:10.1155/ijog/5555332 PMID:41031219	研究论文	通过整合单细胞和批量转录组分析开发肝细胞癌中SPP1+巨噬细胞相关的预后特征模型	首次整合单细胞和批量转录组数据构建SPP1+巨噬细胞相关的七基因预后特征，并应用多算法AI框架提升模型性能	NA	开发肝细胞癌的预后预测模型并探索SPP1+巨噬细胞在肿瘤免疫微环境中的作用	肝细胞癌患者及其肿瘤免疫微环境	生物信息学	肝细胞癌	scRNA-seq, 批量转录组分析, 单变量Cox回归, Lasso回归, 多算法AI框架	预后风险模型	转录组数据	来自GEO、TCGA和ICGC数据库的肝细胞癌样本
171	2025-10-04	Single-Cell Transcriptomic Analysis Highlights the Impact of NFKB2-Mediated MIF-CD44 Signaling Axis in Endometrioid Endometrial Cancer 2025, International journal of women's health DOI:10.2147/IJWH.S530666 PMID:41040843	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析揭示了NFKB2介导的MIF-CD44信号轴在子宫内膜样子宫内膜癌中的关键作用	首次在单细胞水平系统描绘EC肿瘤微环境，发现M2_like2巨噬细胞与SOX9+LGR5-上皮细胞间的MIF-CD44信号通讯新机制	样本量相对有限（15例EC和5例正常样本），需进一步实验验证机制细节	探索子宫内膜样子宫内膜癌肿瘤微环境的细胞组成和分子机制	子宫内膜样子宫内膜癌患者和正常子宫内膜组织	数字病理	子宫内膜癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	生物信息学分析（包括拟时序轨迹、拷贝数变异、细胞通讯分析）	单细胞转录组数据	15例子宫内膜样子宫内膜癌样本和5例正常子宫内膜样本
172	2025-10-04	Cell-weighted polygenic risk scores are associated with β-amyloid and tau biomarkers in Alzheimer's disease 2025, Brain communications IF:4.1Q2 DOI:10.1093/braincomms/fcaf353 PMID:41040848	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序数据开发细胞加权多基因风险评分，探讨不同细胞类型在阿尔茨海默病β-淀粉样蛋白和tau蛋白病理积累中的作用	首次开发基于特定细胞类型（星形胶质细胞、兴奋性神经元、抑制性神经元、小胶质细胞等）的加权多基因风险评分，揭示不同细胞类型对阿尔茨海默病病理的差异化影响	研究结果需要在更广泛人群中验证，且机制研究仍需深入	探究不同细胞类型在阿尔茨海默病β-淀粉样蛋白和tau蛋白病理积累中的分子机制	BioFINDER-1和BioFINDER-2研究中的认知正常个体、轻度认知障碍患者、阿尔茨海默病痴呆患者和非阿尔茨海默病神经退行性疾病患者	生物信息学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序、全基因组关联研究、多基因风险评分	回归模型	基因组数据、脑脊液生物标志物数据、认知评估数据	BioFINDER-1：1293名参与者（734名认知正常，235名轻度认知障碍，97名阿尔茨海默病痴呆，227名非阿尔茨海默病）；BioFINDER-2：1736名参与者（773名认知正常，358名轻度认知障碍，286名阿尔茨海默病痴呆，319名非阿尔茨海默病）
173	2025-10-04	Structure-guided integrative soft deep clustering analysis of scRNA-seq and scATAC-seq data 2025, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2 DOI:10.3389/fmicb.2025.1678891 PMID:41040877	研究论文	提出一种结构引导的软深度聚类框架，用于整合单细胞RNA测序和ATAC测序数据的聚类分析	开发了结构引导融合模块和全局注意力机制，采用对比学习对齐多模态表示，并引入新型软聚类损失函数实现概率性聚类分配	NA	解决单细胞聚类分析中硬聚类分配无法捕捉细胞动态和过渡状态的问题	单细胞RNA测序和ATAC测序数据	生物信息学	NA	scRNA-seq, scATAC-seq, 对比学习	深度学习框架	单细胞多组学数据	四个基准数据集
174	2025-10-04	Macrophage-TREM2 promotes cardiac repair by restricting the infiltration of CD8+ T cells via CXCL16-CXCR6 axis after myocardial infarction 2025, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.118014 PMID:41041054	研究论文	本研究揭示了巨噬细胞TREM2通过CXCL16-CXCR6轴限制CD8+ T细胞浸润并促进淋巴管生成，从而促进心肌梗死后的心脏修复	首次发现TREM2通过调控PI3K-AKT信号通路影响CXCL16分泌，进而限制CD8+ T细胞浸润，并揭示其同时促进VEGFC介导的淋巴管生成	研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性有待验证；TREM2在其他免疫细胞中的作用未充分探讨	探究巨噬细胞TREM2在心肌梗死后限制CD8+ T细胞浸润和促进心脏修复的分子机制	心肌梗死小鼠模型、巨噬细胞、CD8+ T细胞、TREM2基因敲除小鼠	心血管疾病研究	心血管疾病	单细胞测序、ELISA、Transwell、Western Blot、KEGG分析、细胞过继转移	基因敲除小鼠模型	基因表达数据、蛋白质印迹数据、细胞迁移数据	未明确说明具体样本数量，使用TREM2 KO小鼠和野生型小鼠进行对比研究
175	2025-10-04	Luminal Stem-like Cells in High-Risk/Locally Advanced Prostate Cancer Promote Resistance to Hormonal Therapy 2025, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.112496 PMID:41041045	研究论文	本研究通过单细胞测序和类器官模型揭示了高危/局部晚期前列腺癌中管腔干细胞样细胞对激素治疗的耐药机制	首次发现SOX9高转录活性的管腔干细胞样细胞在激素治疗后存活并成为主要上皮细胞成分，并系统阐明了肿瘤微环境在治疗后的动态变化	样本量较小（9例患者），需要更大规模研究验证发现	探究HRLPC患者激素治疗后残留肿瘤的分子特征及高复发率原因	高危/局部晚期前列腺癌患者肿瘤样本及患者来源类器官	数字病理	前列腺癌	单细胞测序、患者来源类器官培养、药物筛选	NA	单细胞转录组数据、类器官药物反应数据	9例HRLPC患者样本，建立患者来源类器官模型
176	2025-10-04	Kazald1 attenuates chondrocyte fibrosis to potentiate hyaline cartilage regeneration by interfering with the pro-fibrotic TGF-β signaling 2025, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.113604 PMID:41041066	研究论文	本研究通过单细胞测序发现Kazald1是维持软骨稳态的关键分子，并证明重组Kazald1蛋白可通过抑制TGF-β信号通路促进透明软骨再生	首次发现Kazald1在软骨纤维化过程中的关键调控作用，并阐明其通过形成TGFBR1二聚体阻断促纤维化信号通路的分子机制	研究主要基于大鼠模型和人类软骨外植体，尚未进行临床人体试验	探索软骨纤维化的分子机制并寻找促进透明软骨再生的治疗靶点	大鼠软骨细胞、大鼠骨软骨损伤模型、人类软骨外植体	分子生物学	软骨疾病	单细胞测序、蛋白质重组表达与纯化、体外细胞培养	NA	基因表达数据、蛋白质结构数据、组织形态数据	大鼠软骨组织样本和人类软骨外植体
177	2025-10-04	Single-cell RNA sequencing reveals endothelial cell heterogeneity and Sox18-mediated EndMT in abdominal aortic aneurysm 2025, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.110254 PMID:41041074	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了腹主动脉瘤中内皮细胞的异质性及Sox18介导的内皮-间质转化的作用机制	首次在单细胞水平系统揭示腹主动脉瘤中内皮细胞的异质性特征，并发现Sox18作为新的EndMT调控因子在AAA形成中的关键作用	研究主要基于小鼠模型和有限的临床样本，需要更多临床验证	探究腹主动脉瘤中内皮细胞的异质性及其在疾病发生发展中的作用机制	腹主动脉瘤患者和小鼠模型中的内皮细胞	单细胞测序分析	心血管疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	AngⅡ和盐诱导的AAA小鼠模型及公共人类和小鼠AAA scRNA-seq数据
178	2025-10-04	Xrcc6 coordinates cardiomyocyte repair and immune regulation in myocardial ischemia-reperfusion injury: Fisetin as a therapeutic modulator 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1653738 PMID:41041340	研究论文	本研究揭示了Xrcc6在心肌缺血再灌注损伤中的双重调控作用，并发现黄酮类化合物非瑟酮通过靶向Xrcc6发挥心脏保护作用	首次整合批量与单细胞RNA测序发现Xrcc6在心肌修复和免疫调节中的双重功能，并通过分子对接验证非瑟酮与Xrcc6的稳定结合	研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证	阐明Xrcc6在心肌缺血再灌注损伤中的作用机制，探索非瑟酮的心脏保护效应	心肌细胞亚型（特别是vCMs3）、巨噬细胞极化、DNA损伤修复机制	心血管疾病研究	心血管疾病	批量RNA测序、单细胞RNA测序、hdWGCNA、轨迹推断、细胞通讯分析、分子对接、分子动力学模拟	小鼠心肌缺血再灌注损伤模型	RNA测序数据、单细胞转录组数据、分子对接数据	未明确样本数量的小鼠模型和测序数据
179	2025-10-04	Immunotherapy strategies targeting tumor-associated macrophages and their mechanisms of action in tumor progression 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1680455 PMID:41041337	综述	本文综述了肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的类型、对肿瘤发展的影响及其调控功能，以及针对TAMs的肿瘤免疫治疗进展	整合单细胞测序技术揭示TAMs功能多样性和异质性，提出TAMs作为肿瘤治疗创新靶点	NA	探讨靶向肿瘤相关巨噬细胞的免疫治疗策略及其在肿瘤进展中的作用机制	肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)及其在肿瘤微环境中的相互作用	肿瘤免疫学	实体肿瘤	单细胞测序技术	NA	研究文献数据	NA
180	2025-10-04	Novel cuproptosis-related genes C1QBP and PFKP identified as prognostic and therapeutic targets in lung adenocarcinoma 2025, Open life sciences IF:1.7Q3 DOI:10.1515/biol-2025-1142 PMID:41041346	研究论文	本研究通过识别铜死亡相关基因C1QBP和PFKP作为肺腺癌的预后标志物和治疗靶点	首次发现C1QBP和PFKP基因在铜死亡调控中的关键作用，并建立四基因风险模型用于肺腺癌预后分层	样本量有限（566例TCGA样本），需要进一步临床验证	探索铜死亡相关基因在肺腺癌中的预后价值和治疗潜力	肺腺癌患者组织样本和癌细胞系	癌症基因组学	肺腺癌	微阵列、单细胞测序、功能实验	四基因风险模型	基因组数据、临床数据	566例TCGA样本加上肺腺癌特异性微阵列和单细胞测序数据