单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
161	2025-07-05	A novel, rapid, and practical prognostic model for sepsis patients based on dysregulated immune cell lactylation 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1625311 PMID:40612938	研究论文	本研究基于免疫细胞乳酸化修饰的失调，开发了一种新型、快速且实用的脓毒症患者预后模型	首次系统性地研究了脓毒症进展过程中乳酸化修饰的动态变化，并基于此开发了一个预后特征模型	研究样本量相对有限（N=51），且验证队列为单中心数据	探索脓毒症进展中乳酸化修饰的动态变化，并开发基于乳酸化的预后模型	脓毒症患者血液转录组数据和单细胞RNA测序数据	生物医学信息学	脓毒症	单细胞RNA测序、机器学习算法、伪时间轨迹重建	机器学习模型（具体算法未明确说明）	转录组数据、单细胞RNA测序数据	训练队列未明确说明数量，验证队列51例脓毒症患者
162	2025-07-05	Applications and Prospects of Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics in Cervical Cancer 2025, BioMed research international IF:2.6Q3 DOI:10.1155/bmri/1532745 PMID:40612935	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST）技术在宫颈癌研究中的最新进展和应用前景	整合了scRNA-seq和ST技术，以揭示宫颈癌的肿瘤异质性、肿瘤微环境复杂性及治疗抵抗机制	未提及具体实验数据或样本量的限制	探讨scRNA-seq和ST技术在宫颈癌研究中的应用，以促进更有效的治疗和预防策略的开发	宫颈癌的肿瘤异质性、肿瘤微环境、肿瘤进化轨迹及治疗抵抗机制	数字病理学	宫颈癌	scRNA-seq, ST	NA	RNA测序数据	NA
163	2025-07-05	Bridging aging, immunity, and atherosclerosis: novel insights into senescence-related genes 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1557266 PMID:40612944	研究论文	本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序数据，识别了与衰老相关的基因，并探讨了这些基因在动脉粥样硬化中的诊断价值和免疫细胞浸润作用	首次综合应用多种机器学习算法和单细胞RNA测序技术，识别了与衰老相关的基因PDLIM1、PARP14和SEL1L3作为动脉粥样硬化的生物标志物，并揭示了它们在巨噬细胞分化中的阶段特异性表达模式	研究数据主要来源于公共数据库，实验验证仅限于小鼠模型，未在人类样本中进行验证	探索衰老相关基因在动脉粥样硬化中的诊断价值和免疫调节作用	人类和小鼠的动脉粥样硬化组织	生物信息学	心血管疾病	RNA测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、LASSO、SVM、RF、CIBERSORT、ssGSEA、AUCell评分算法、CellChat、Monocle2	LASSO、SVM、RF	RNA测序数据、单细胞RNA测序数据	未明确提及具体样本数量，数据来源于Gene Expression Omnibus数据库和小鼠模型
164	2025-07-05	Single-cell atlas of human skin implicates APOE pro-inflammatory signaling in diabetic foot ulcers 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1591944 PMID:40612951	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了糖尿病足溃疡(DFU)患者皮肤组织中APOE过表达的成纤维细胞群及其在炎症和纤维化中的作用	首次在DFU患者中鉴定出APOE过表达的特定成纤维细胞群，并揭示了其通过FGF信号通路和药物代谢-细胞色素P450途径促进糖尿病发生发展的机制	研究样本量有限，且主要基于体外实验验证，需要进一步临床研究确认APOE在DFU中的具体作用机制	探究糖尿病足溃疡(DFU)的分子机制和潜在治疗靶点	人类皮肤组织中的成纤维细胞	digital pathology	diabetic foot ulcers	single-cell RNA sequencing, 免疫组织化学染色	NA	RNA-seq数据	未明确说明样本数量的人类皮肤组织
165	2025-07-05	Transiently increased coordination in gene regulation during cell phenotypic transitions 2024-Dec, PRX life DOI:10.1103/prxlife.2.043009 PMID:40585428	research paper	该研究通过分析单细胞RNA测序数据，探讨了细胞表型转变过程中基因表达簇切换的协调机制	揭示了细胞表型转变过程中基因调控网络社区间相互作用的动态变化模式，并提出了一个普遍原则：在细胞表型转变过程中，社区间相互作用增加以协调全局基因表达重编程	研究仅分析了五种细胞转变过程，可能无法涵盖所有类型的细胞表型转变	探究细胞表型转变过程中基因表达簇切换的协调机制	五种不同的细胞转变过程	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	transition path theory	RNA-seq数据	五种不同的细胞转变过程
166	2025-07-05	Single-cell transcriptomics link gene expression signatures to clinicopathological features of gonadotroph and lactotroph PitNET 2024-Nov-15, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-05821-4 PMID:39548496	研究论文	该研究通过单细胞转录组学分析，揭示了促性腺激素和催乳素垂体神经内分泌肿瘤（PitNET）中基因表达特征与临床病理特征的联系	首次在PitNET中系统比较了促性腺激素和催乳素亚型的肿瘤微环境差异，并发现了与肿瘤侵袭性相关的淋巴细胞亚群	样本量相对较小（7例促性腺激素和3例催乳素PitNET），且主要关注两种亚型	探究PitNET肿瘤微环境与肿瘤侵袭性行为的关系	促性腺激素和催乳素垂体神经内分泌肿瘤	数字病理学	垂体神经内分泌肿瘤	单细胞RNA测序，bulk RNA-seq，免疫组化	NA	基因表达数据，组织切片图像	10例单细胞测序样本（7例促性腺激素+3例催乳素），134例bulk RNA-seq样本
167	2025-07-05	The novel potential therapeutic target PSMP/MSMP promotes acute kidney injury via CCR2 2024-Jul-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.028 PMID:38796708	研究论文	本文探讨了PSMP/MSMP作为急性肾损伤（AKI）的新型潜在治疗靶点，通过CCR2促进AKI的机制	首次揭示了PSMP在AKI中的关键作用，并证明PSMP中和抗体可作为AKI的治疗药物	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证PSMP中和抗体的疗效	探索PSMP在AKI中的作用机制并评估其作为治疗靶点的潜力	AKI患者和小鼠模型	肾脏病学	急性肾损伤	单细胞RNA测序	AKI小鼠模型（肾缺血再灌注损伤、甘油和顺铂诱导）	RNA测序数据、临床样本数据	AKI患者和小鼠模型，具体样本量未明确说明
168	2025-07-05	S100A8/A9hi neutrophils induce mitochondrial dysfunction and PANoptosis in endothelial cells via mitochondrial complex I deficiency during sepsis 2024-06-28, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06849-6 PMID:38942784	研究论文	本文研究了S100A8/A9高表达的中性粒细胞通过线粒体复合物I缺陷在脓毒症期间诱导内皮细胞线粒体功能障碍和PANoptosis的机制	揭示了S100A8/A9通过下调Nrf1表达抑制线粒体复合物I中的Ndufa3表达，进而导致线粒体功能障碍和PANoptosis的新机制	研究主要基于体外实验和测序分析，缺乏在体实验验证	探究S100A8/A9在脓毒症期间诱导内皮细胞功能障碍的分子机制	中性粒细胞和内皮细胞	分子生物学	脓毒症	scRNA-seq, bulk RNA-seq	NA	测序数据	NA
169	2025-07-05	Multiomics integration-based immunological characterizations of adamantinomatous craniopharyngioma in relation to keratinization 2024-06-21, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06840-1 PMID:38906852	研究论文	通过单核RNA测序和空间转录组学对58,081个细胞核进行综合分析，揭示了颅咽管瘤的免疫微环境特征及其细胞间网络	首次通过多组学整合分析揭示了颅咽管瘤的免疫抑制微环境特征，并发现了一种与肿瘤角质化相关的调控网络	样本量相对有限，且研究结果需要进一步的功能验证	阐明颅咽管瘤的免疫微环境特征及其与肿瘤进展的关系	颅咽管瘤(ACP)样本	数字病理学	颅咽管瘤	单核RNA测序(snRNA-seq), 空间转录组学, asmFISH	NA	单细胞转录组数据, 空间转录组数据	58,081个细胞核
170	2025-07-05	CSTF3 contributes to platinum resistance in ovarian cancer through alternative polyadenylation of lncRNA NEAT1 and generating the short isoform NEAT1_1 2024-06-19, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06816-1 PMID:38898019	研究论文	本研究揭示了CSTF3通过调节lncRNA NEAT1的选择性多聚腺苷酸化（APA）在卵巢癌铂类耐药中的作用机制	首次发现CSTF3通过调控NEAT1的APA过程生成短亚型NEAT1_1，从而促进卵巢癌铂类耐药的新机制	研究主要基于公共数据库的单细胞RNA测序数据，需要进一步实验验证	探索卵巢癌铂类耐药的分子机制	卵巢癌患者的铂类耐药和敏感组织	癌症生物学	卵巢癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	公共数据库中的卵巢癌患者单细胞RNA测序数据集
171	2025-07-05	CXCR7 activation evokes the anti-PD-L1 antibody against glioblastoma by remodeling CXCL12-mediated immunity 2024-06-19, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06784-6 PMID:38898023	研究论文	本研究探讨了CXCR7激活通过重塑CXCL12介导的免疫反应，增强抗PD-L1抗体对胶质母细胞瘤的疗效	发现了CXCR7作为CXCL12的非典型受体在肿瘤细胞中的负调控作用，并验证了选择性CXCR7激动剂VUF11207能逆转GAM诱导的免疫抑制，增强抗PD-L1抗体的治疗效果	研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体临床试验中验证	探索通过靶向CXCR7-CXCL12轴增强胶质母细胞瘤免疫治疗效果的机制	胶质母细胞瘤细胞、胶质母细胞瘤相关巨噬细胞(GAMs)和T细胞	肿瘤免疫学	胶质母细胞瘤	转录组分析、单细胞转录组测序、体外共培养系统	小鼠胶质母细胞瘤模型	转录组数据、单细胞测序数据、体外实验数据	未明确说明样本数量，但使用了复发胶质母细胞瘤标本、公共胶质母细胞瘤数据集和小鼠模型
172	2025-07-05	Chemerin attracts neutrophil reverse migration by interacting with C-C motif chemokine receptor-like 2 2024-06-18, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06820-5 PMID:38890311	研究论文	本研究探讨了中性粒细胞反向迁移（rM）的机制，发现趋化因子受体样2（Ccrl2）及其配体chemerin在这一过程中起关键作用	首次揭示了chemerin通过与其受体CCRL2相互作用吸引中性粒细胞离开炎症部位的新机制	研究主要基于小鼠模型，人体中的相关性尚需验证	探索中性粒细胞反向迁移的分子机制	中性粒细胞及其迁移行为	免疫学	急性肺损伤	scRNA-seq、气袋模型	NA	基因表达数据、细胞追踪数据	小鼠急性肺损伤模型
173	2025-07-05	The Mohawk homeobox gene represents a marker and osteo-inhibitory factor in calvarial suture osteoprogenitor cells 2024-06-17, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06813-4 PMID:38886383	研究论文	该研究揭示了Mohawk同源盒基因（Mkx）在小鼠颅骨缝合间充质祖细胞中作为骨抑制因子的作用及其在骨修复中的机制	首次发现Mkx基因在颅骨缝合间充质祖细胞中作为骨抑制因子，并证明其机械响应性调控骨分化的新机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证	探究Mkx基因在颅骨缝合间充质祖细胞中的功能及其在骨修复中的作用机制	小鼠颅骨缝合间充质祖细胞	骨生物学	骨修复障碍	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、基因敲除/敲低、机械拉伸实验	基因报告小鼠模型（Mkx; R26R）	基因表达数据、细胞表型数据	未明确说明具体样本量（使用转基因小鼠模型）
174	2025-07-05	Synergistic immunochemotherapy targeted SAMD4B-APOA2-PD-L1 axis potentiates antitumor immunity in hepatocellular carcinoma 2024-06-17, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06699-2 PMID:38886351	研究论文	提出一种针对肝细胞癌的协同免疫化疗策略，通过SAMD4B-APOA2-PD-L1轴增强抗肿瘤免疫	首次提出基于三种常见抗肿瘤药物的协同免疫化疗策略，并揭示其通过SAMD4B介导的2'-O-甲基化修饰调控免疫微环境的机制	研究主要基于PDX小鼠模型，临床样本量可能有限	开发针对晚期肝细胞癌的有效治疗方案	肝细胞癌患者和PDX小鼠模型	肿瘤免疫治疗	肝细胞癌	单细胞RNA测序、2'-O-甲基化修饰、多重免疫荧光染色	PDX小鼠模型	RNA测序数据、免疫荧光图像数据	未明确说明具体样本量，涉及PDX小鼠模型和临床患者数据
175	2025-07-05	MAL2 reprograms lipid metabolism in intrahepatic cholangiocarcinoma via EGFR/SREBP-1 pathway based on single-cell RNA sequencing 2024-06-12, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06775-7 PMID:38866777	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序发现MAL2在肝内胆管癌中特异性富集，并通过调控EGFR/SREBP-1通路促进脂质代谢，影响癌细胞增殖和迁移	首次揭示MAL2通过稳定EGFR膜定位激活PI3K/AKT/SREBP-1轴促进脂质积累的机制，并筛选出小分子抑制剂sarizotan	研究主要基于体外实验和类器官模型，尚未进行大规模临床验证	探究MAL2在肝内胆管癌发生发展中的作用机制及治疗靶点	肝内胆管癌细胞及类器官模型	肿瘤生物学	肝内胆管癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组学、代谢组学、分子对接、Co-IP	类器官模型	RNA测序数据、代谢物数据	未明确说明具体样本数量
176	2025-07-05	Temporal Single-Cell Sequencing Analysis Reveals That GPNMB-Expressing Macrophages Potentiate Muscle Regeneration 2024-Mar-28, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-4108866/v1 PMID:38585871	研究论文	通过单细胞RNA测序分析揭示表达GPNMB的巨噬细胞在肌肉再生中的关键作用	发现了一个表达GPNMB的巨噬细胞亚群，该亚群在巨噬细胞介导的肌肉再生中发挥关键作用	研究未详细探讨GPNMB信号通路在肌肉再生中的具体分子机制	探究巨噬细胞在骨骼肌修复过程中的表型多样性和功能	骨骼肌损伤后的巨噬细胞	单细胞测序	肌肉损伤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	不同时间点的骨骼肌单细胞样本
177	2025-07-04	Tracing Early Migratory Neurons in the Developing Nose Using Contactin-2 (Cntn2) CreERT2 2025-Aug, Genesis (New York, N.Y. : 2000) DOI:10.1002/dvg.70021 PMID:40580015	research paper	研究通过生成可诱导的Cntn2CreERT2小鼠系，追踪发育中鼻子内早期迁移神经元	利用Cntn2CreERT2小鼠系作为时间控制嵌合操作特定神经元群体的有效工具	可用的分子标记数量有限，可能限制了对早期迁移神经元的全面追踪和功能操作	研究发育中鼻子内早期迁移神经元的追踪和功能操作	啮齿动物发育中鼻子内的神经元，特别是嗅觉基板早期神经源性波中形成的神经元	神经科学	NA	单细胞RNA测序，可诱导CreERT2小鼠系	Cntn2CreERT2小鼠模型	基因表达数据	NA
178	2025-07-04	Large-scale dependency and drug screens to characterize the therapeutic vulnerabilities of multiple myeloma with 1q 2025-Jul-03, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024025102 PMID:40073369	研究论文	通过大规模依赖性和药物筛选，系统性表征了1q+多发性骨髓瘤的治疗脆弱性，并发现其对MCL1和PI3K抑制剂的敏感性增加	首次系统性揭示了1q+多发性骨髓瘤对MCL1和PI3K抑制剂的敏感性，并阐明了其作用机制	研究主要基于体外实验，尚未进行临床验证	开发针对1q+多发性骨髓瘤的靶向治疗策略	1q+多发性骨髓瘤患者	肿瘤学	多发性骨髓瘤	大规模依赖性筛选、药物筛选、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
179	2025-07-04	IFN-γ promotes the progression of iMCD by activating inflammatory monocytes 2025-Jul-03, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024027689 PMID:40163892	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了特发性多中心Castleman病（iMCD）患者的免疫景观，揭示了IL-6和IFN-II信号通路在疾病进展中的关键作用	首次通过单细胞RNA测序揭示了iMCD患者中CCL单核细胞通过IFN-II信号与NK/NKT细胞相互作用，以及IFN-γ水平与疾病严重程度和治疗抵抗的正相关性	样本量较小（15例iMCD患者和4例健康对照），且部分发现需要在大规模独立队列中进一步验证	深入了解iMCD的免疫机制，建立早期预后分层并发现新的治疗靶点	特发性多中心Castleman病（iMCD）患者的外周血单个核细胞（PBMCs）、淋巴结和骨髓样本	免疫学	特发性多中心Castleman病（iMCD）	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据	15例iMCD患者和4例健康对照的外周血单个核细胞（PBMCs），以及部分淋巴结和骨髓样本
180	2025-07-04	Choroid Plexus Fibroblast-ILC2 Niche Promotes Adult Hippocampal Neurogenesis after Traumatic Brain Injury 2025-Jul-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202415984 PMID:40605604	研究论文	本文研究了创伤性脑损伤（TBI）后脉络丛（ChP）中2型固有淋巴细胞（ILC2）的积累及其对神经发生的影响	首次揭示了ILC2通过优化免疫微环境和促进神经发生在TBI后的潜在治疗作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨TBI后脉络丛的结构变化和免疫细胞浸润特征及其对神经发生的影响	创伤性脑损伤（TBI）小鼠模型	神经科学	创伤性脑损伤	单细胞RNA测序、单核RNA测序、组织学分析	小鼠模型	RNA测序数据、组织学数据	未明确提及具体样本数量