单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27621 篇文献，本页显示第 17921 - 17940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17921 | 2024-08-05 |
Integrating Bulk-seq and Single-cell-seq Reveals Estrogen and MAPK Pathways Associating with Neuroblastoma Outcome
2023 Jan-Dec, Cancer control : journal of the Moffitt Cancer Center
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/10732748231178177
PMID:37219000
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研究论文 | 本研究揭示了雌激素和MAPK通路与神经母细胞瘤结局相关的发现。 | 整合了Bulk-seq和单细胞测序，并提出了三基因预后签名，具有优秀的预测性能。 | 研究中的样本量和外部验证的数量可能限制结果的普适性。 | 探讨神经母细胞瘤中的信号通路活动与治疗前景的关系。 | 以神经母细胞瘤患者为研究对象，分析信号通路活动。 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | Bulk-seq和单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因组数据 | 涉及的样本数量未明确说明 |
| 17922 | 2024-08-05 |
Integrated multi-omics analysis reveals insights into Chinese forest musk deer (Moschus berezovskii) genome evolution and musk synthesis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1156138
PMID:37228656
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研究论文 | 本文探讨了中国林麝基因组演化和麝香合成的见解。 | 通过对中国林麝组织的基因组重注释，识别了三个扩展的基因家族，并揭示了麝香腺的细胞组成和转录特征。 | 研究仅基于有限数量的样本，且仍需进一步探讨麝香腺的功能特征。 | 探讨麝香腺形成的基因基础和麝香合成过程。 | 中国林麝的麝香腺组织，包括两只幼年和三只成年麝鹿。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据, mRNA表达数据 | 5个样本（2只幼年和3只成年中国林麝） |
| 17923 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals a unique pericyte type associated with capillary dysfunction
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.83532
PMID:37215579
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了一种与毛细血管功能障碍相关的独特周细胞类型 | 首次描绘了来自小鼠视网膜的超过76,000个单细胞转录组，并识别了与视网膜毛细血管功能障碍相关的周细胞亚群 | 主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类疾病的复杂性 | 探索毛细血管功能障碍中周细胞的异质性及其分子特征 | 小鼠视网膜中的周细胞及其在毛细血管功能障碍中的作用 | 数字病理学 | 视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 来自4只小鼠视网膜的76,000个单细胞转录组 |
| 17924 | 2024-08-05 |
Analysis of immunogenic cell death in ascending thoracic aortic aneurysms based on single-cell sequencing data
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1087978
PMID:37207221
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研究论文 | 本文研究了免疫原性细胞死亡在升主动脉瘤中的作用 | 首次探讨了免疫原性细胞死亡在心血管疾病，特别是在升主动脉瘤中的角色 | 未进行临床试验和小规模的样本验证，需进一步研究结合临床数据 | 研究免疫原性细胞死亡在升主动脉瘤中的作用及机制 | 升主动脉瘤中的单细胞RNA测序数据及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从RNA测序数据中识别出10种细胞类型 |
| 17925 | 2024-08-05 |
Single-cell landscape dissecting the transcription and heterogeneity of innate lymphoid cells in ischemic heart
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1129007
PMID:37228603
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研究论文 | 本文揭示了缺血性心脏病中天然淋巴细胞(ILCs)的转录异质性及其亚群的角色 | 首次在心脏中识别出新ILC亚群，并利用单细胞测序技术分析ILC的多样性 | 未详细阐述ILC在缺血性心脏病中具体的细胞和分子机制 | 研究ILC在心肌缺血性疾病中的作用及其相关机制 | 8周龄男性C57BL/6J小鼠，分为心肌梗死、缺血再灌注损伤和对照组 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 共有三组小鼠样本，包括心肌梗死、缺血再灌注损伤和对照组 |
| 17926 | 2024-08-07 |
Different iPSC-derived neural stem cells shows various spectrums of spontaneous differentiation during long term cultivation
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1037902
PMID:37201156
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研究论文 | 本研究探讨了不同来源的iPSC衍生的神经干细胞在长期培养过程中自发分化的谱系变化 | 首次详细分析了不同iPSC衍生神经干细胞在长期培养中的自发分化谱系变化 | 研究仅限于体外培养条件，未涉及体内环境的影响 | 旨在优化神经干细胞的生产和长期培养协议 | 不同来源的iPSC衍生的神经干细胞 | 干细胞研究 | 神经退行性疾病 | 免疫细胞化学、qPCR、bulk转录组和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 四条不同的iPSC细胞系 |
| 17927 | 2024-08-07 |
Classification of tuberculosis-related programmed cell death-related patient subgroups and associated immune cell profiling
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1159713
PMID:37205113
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研究论文 | 本研究通过分析结核病（TB）相关数据集中的免疫细胞谱，识别并验证了与程序性细胞死亡（PCD）相关的基因表达模式，以此来分层TB患者并探讨其与免疫细胞丰度的关系 | 首次通过机器学习方法筛选出与PCD相关的关键基因，并利用这些基因对TB患者进行分层，进一步验证了这些分层在独立数据集中的有效性 | 研究主要基于公共数据库的数据，未来需要更多的临床样本验证这些发现 | 旨在通过PCD相关基因的表达模式来分层TB患者，并探讨其与免疫细胞丰度的关系，为TB的诊断和治疗提供新的策略 | 结核病患者及其PCD相关基因表达模式 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | 基因表达数据 | TB患者样本 |
| 17928 | 2024-08-07 |
Bayesian Data Selection
2023, Journal of machine learning research : JMLR
IF:4.3Q2
PMID:37206375
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研究论文 | 本文介绍了“数据选择”问题，并提出了一种新的评分方法——Stein体积准则（SVC），用于在高维数据中发现与给定参数模型匹配的低维统计量 | 提出了Stein体积准则（SVC），这是一种不需拟合非参数模型的新型数据选择评分方法 | NA | 旨在解决高维数据中数据选择的问题，并提出一种新的评分方法以提高效率和统计性能 | 高维数据和单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率主成分分析和自旋玻璃模型 | 高维数据 | NA |
| 17929 | 2024-08-07 |
TYROBP-positive endothelial cell-derived TWEAK as a promoter of osteosarcoma progression: insights from single-cell omics
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1200203
PMID:37207157
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研究论文 | 本研究探讨了TYROBP阳性内皮细胞在骨肉瘤进展中的作用，特别是通过分泌TWEAK介导的与恶性细胞的相互作用 | 首次揭示了TYROBP阳性内皮细胞作为骨肉瘤进展的启动细胞，并通过TWEAK介导与恶性细胞的强相互作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞转录组数据，需要进一步的体内实验验证 | 探索骨肉瘤中内皮细胞的启动细胞及其与恶性细胞的潜在相互作用 | 骨肉瘤中的内皮细胞及其与恶性细胞的相互作用 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6名骨肉瘤患者 |
| 17930 | 2024-08-07 |
Identification and validation of a novel signature based on cell-cell communication in head and neck squamous cell carcinoma by integrated analysis of single-cell transcriptome and bulk RNA-sequencing
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1136729
PMID:37213285
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和批量RNA测序数据，识别并验证了基于细胞间通讯的头颈鳞状细胞癌（HNSCC）新型标志物。 | 开发了一种基于细胞间通讯相关基因的新型标志物，具有强大的预测HNSCC患者预后和免疫治疗反应的能力。 | NA | 研究HNSCC肿瘤免疫微环境中复杂的通讯网络，阐明免疫细胞与肿瘤之间的相互作用，并建立预后风险模型。 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中的细胞间通讯网络及其对患者临床结果的影响。 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | 20个HNSCC样本 |
| 17931 | 2024-08-07 |
Metabolic profiling reveals altered tryptophan metabolism in patients with kawasaki disease
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1180537
PMID:37214338
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研究论文 | 研究探讨了川崎病患者的代谢变化，特别是色氨酸代谢，以确定新的诊断和预后生物标志物 | 发现了川崎病患者中色氨酸代谢途径的显著改变，并提出代谢指标可能作为新的诊断和治疗生物标志物 | NA | 研究川崎病患者的代谢变化，寻找新的诊断和预后生物标志物 | 川崎病患者和健康对照组的色氨酸代谢 | 代谢组学 | 川崎病 | 代谢组学 | NA | 代谢物数据 | 包括川崎病患者和健康对照组，以及川崎病冠状动脉炎小鼠模型 |
| 17932 | 2024-08-07 |
Assessing the effects of aging on the renal endothelial cell landscape using single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1175716
PMID:37214419
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了衰老对小鼠肾脏内皮细胞转录组的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了衰老过程中肾脏内皮细胞的转录组变化，并确认了免疫调节信号的变化 | NA | 探究衰老对肾脏内皮细胞的影响及其机制 | 小鼠肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 17933 | 2024-08-07 |
Heme oxygenase-1 determines the cell fate of ferroptotic death of alveolar macrophages in COPD
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1162087
PMID:37215140
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了慢性阻塞性肺疾病（COPD）中肺泡巨噬细胞的铁死亡命运及其与疾病发展的关系 | 首次揭示了M2型肺泡巨噬细胞通过调节脂质和铁稳态影响铁死亡敏感性，而M1型肺泡巨噬细胞则表现出对铁死亡的抵抗性 | 研究主要基于动物模型和体外实验，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨COPD中肺泡巨噬细胞的铁死亡机制及其对疾病发展的影响 | COPD患者的肺组织和肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 包括25名额外受试者和RAW 264.7巨噬细胞，以及实验性香烟烟雾诱导的COPD小鼠模型 |
| 17934 | 2024-08-07 |
Comprehensive Analyses Reveal Effects on Tumor Immune Infiltration and Immunotherapy Response of APOBEC Mutagenesis and Its Molecular Mechanisms in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.83824
PMID:37215984
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研究论文 | 本文通过收集169名食管鳞状细胞癌（ESCC）患者的匹配多组学数据，利用多种生物信息学方法评估APOBEC突变对肿瘤免疫浸润和免疫治疗反应的影响及其分子机制 | 首次发现AOBEC3A活性主要由FOSL1转激活，并通过上调加剧细胞质双链DNA积累，从而刺激cGAS-STING途径 | NA | 探讨APOBEC突变在食管鳞状细胞癌中的功能角色及其对免疫治疗的影响 | 食管鳞状细胞癌患者的免疫浸润和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | RNA测序（scRNA-seq） | NA | 多组学数据 | 169名食管鳞状细胞癌患者 |
| 17935 | 2024-08-07 |
C-C motif chemokine receptor 2 inhibition reduces liver fibrosis by restoring the immune cell landscape
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.83530
PMID:37215993
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研究论文 | 本研究探讨了C-C基序趋化因子受体2（CCR2）抑制通过恢复免疫细胞景观减轻肝纤维化的机制 | 本研究揭示了CVC通过恢复免疫细胞景观减轻肝纤维化的新机制，并抑制了CCR2-STAT1/NFκB/ERK信号通路中的促纤维化基因转录 | NA | 探讨CCR2抑制减轻肝纤维化的机制 | 肝纤维化及其相关机制 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 野生型小鼠和敲除小鼠 |
| 17936 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood reveals immune cell dysfunction in premature ovarian insufficiency
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1129657
PMID:37223018
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了早发性卵巢功能不全（POI）患者外周血单个核细胞（PBMC）的特征，探讨了免疫反应在POI中的潜在作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了POI患者PBMC中免疫细胞的功能障碍，并识别了相关的差异表达基因和细胞间通讯变化 | 研究样本量较小，仅包括三名正常受试者和三名POI患者 | 分析POI患者外周血单个核细胞的特征，探索免疫系统在POI中的作用 | 早发性卵巢功能不全（POI）患者的外周血单个核细胞（PBMC） | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 三名正常受试者和三名POI患者 |
| 17937 | 2024-08-08 |
Machine learning-based glycolysis-associated molecular classification reveals differences in prognosis, TME, and immunotherapy for colorectal cancer patients
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1181985
PMID:37228620
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研究论文 | 本文通过结合转录组和单细胞分析，利用机器学习方法基于糖酵解相关基因在结直肠癌中识别新的分子亚型，为结直肠癌患者提供治疗方向 | 首次探讨了糖酵解相关基因在结直肠癌中的整体意义及其对免疫微环境的影响，并开发了基于单细胞和糖酵解相关簇的预测模型 | NA | 研究糖酵解相关基因在结直肠癌中的作用及其对免疫微环境的影响 | 结直肠癌患者的糖酵解相关基因表达模式及其与免疫微环境的关系 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序分析 | 机器学习方法 | 转录组数据 | NA |
| 17938 | 2024-08-07 |
Molecular Computational Anatomy: Unifying the Particle to Tissue Continuum via Measure Representations of the Brain
2022, BME frontiers
IF:5.0Q1
DOI:10.34133/2022/9868673
PMID:37206893
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研究论文 | 本文旨在通过几何测度表示统一脑图谱的分子表征与组织尺度计算解剖学 | 提出了基于几何测度的统一脑图谱理论，将分子尺度与组织尺度进行一致性整合 | NA | 统一空间转录组学和细胞尺度组织学的分子表征与脑图谱的组织尺度计算解剖学 | 脑的分子和组织尺度 | 数字病理学 | NA | 几何测度 | NA | 空间转录组学数据 | NA |
| 17939 | 2024-08-08 |
Ushering in a new era of single-cell transcriptomics in bacteria
2022, microLife
DOI:10.1093/femsml/uqac020
PMID:37223351
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综述 | 本文综述了近期在细菌单细胞转录组学领域的新方法和技术突破 | 介绍了MATQ-seq、microSPLiT、PETRI-seq和par-seqFISH等新方法，这些方法使得细菌单细胞转录组学成为可能 | NA | 探讨新方法如何促进对细菌基因表达细胞间变异的理解，并推动微生物学领域的发展 | 细菌单细胞转录组学方法及其在复杂微生物群落中的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 17940 | 2024-08-08 |
Fibroblast growth factor receptor 1 as a potential marker of terminal effector peripheral T helper cells in rheumatoid arthritis patients
2023-11-02, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/kead220
PMID:37184877
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研究论文 | 本研究旨在探讨纤维母细胞生长因子受体1（FGFR1）在类风湿性关节炎（RA）患者CD4+ T细胞中的表达及其在疾病发病机制中的作用 | 首次揭示了FGFR1在RA患者外周血和滑膜中CD4+ T细胞的表达情况，并发现FGFR1阳性Tph细胞具有终末效应细胞表型 | NA | 研究FGFR1在RA患者CD4+ T细胞中的表达及其在疾病发病机制中的作用 | RA患者的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | RA患者和健康对照组的外周血和滑膜CD4+ T细胞 |