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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17901 | 2024-08-05 | 
         PDGFRα+ITGA11+ fibroblasts foster early-stage cancer lymphovascular invasion and lymphatic metastasis via ITGA11-SELE interplay 
        
          2024-Apr-08, Cancer cell
          
          IF:48.8Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.ccell.2024.02.002
          PMID:38428409
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究揭示了PDGFRαITGA11纤维母细胞在早期膀胱癌中的重要作用 | 发现了一种之前未知的PDGFRαITGA11CAFs亚群,与早期膀胱癌中的淋巴血管侵袭和预后不良相关 | 本研究主要集中在早期膀胱癌,可能无法推广到其他类型癌症 | 探讨早期癌症中癌相关纤维母细胞的功能和机制 | 早期膀胱癌中的PDGFRαITGA11CAF亚群 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | 缺失小鼠模型 | 临床数据 | 910个病例 | NA | NA | NA | NA | 
| 17902 | 2024-08-04 | 
         Exploring the diversity of cancer-associated fibroblasts: insights into mechanisms of drug resistance 
        
          2024, Frontiers in cell and developmental biology
          
          IF:4.6Q1
          
         
        
          DOI:10.3389/fcell.2024.1403122
          PMID:38818409
         
       | 
      
      综述 | 本文综合分析了癌症相关成纤维细胞(CAFs)的多样性及其在药物耐药机制中的作用 | 研究整合了36项独立单细胞RNA测序研究的数据,深入探讨了CAFs的亚群体及其在不同肿瘤类型中的预后相关性和功能贡献 | 可能缺乏某些肿瘤类型的全面数据,且对CAFs的具体机制仍需进一步验证 | 揭示CAFs的多样性及其在化疗耐药中的作用 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs)在17种不同的人类恶性肿瘤类型中的特征 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 36项独立单细胞RNA测序研究涉及的17种人类恶性肿瘤类型的样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 17903 | 2024-08-05 | 
         Exploring the role of innate immunity in Cholangiocarcinoma: implications for prognosis, immune infiltration, and tumor metastasis 
        
          2024, Journal of Cancer
          
          IF:3.3Q2
          
         
        
          DOI:10.7150/jca.94194
          PMID:38817870
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨了先天免疫系统在胆道癌中的作用,特别是在预后、免疫浸润和肿瘤转移中的影响 | 阐明了先天免疫途径与胆道癌之间的关系,并提出其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 当前研究关于先天免疫途径与癌症之间相互作用的文献有限且效果不一致 | 揭示先天免疫途径在胆道癌中的作用及其影响因素 | 胆道癌患者的肿瘤组织和正常组织样本 | 数字病理学 | 胆道癌 | 生物信息学和数据分析 | 单细胞转录组分析 | 基因表达数据和蛋白质组数据 | 胆道癌患者的肿瘤组织切片和HPA数据库中的正常组织切片 | NA | NA | NA | NA | 
| 17904 | 2024-08-05 | 
         Deconvolution analysis identified altered hepatic cell landscape in primary sclerosing cholangitis and primary biliary cholangitis 
        
          2024, Frontiers in medicine
          
          IF:3.1Q1
          
         
        
          DOI:10.3389/fmed.2024.1327973
          PMID:38818402
         
       | 
      
      研究论文 | 本文通过去卷积分析揭示了原发性硬化性胆管炎和原发性胆汁性胆管炎中肝细胞的变化。 | 首次利用CIBERSORTx和自定义签名矩阵系统识别特定肝细胞型的组成,展示了肝细胞在疾病中的不同功能。 | 需要更多研究以阐明这些肝细胞表型在胆汁淤积性肝损伤中的角色。 | 探讨原发性硬化性胆管炎和原发性胆汁性胆管炎中肝细胞的组成及其功能。 | 研究对象为原发性硬化性胆管炎和原发性胆汁性胆管炎患者的肝组织样本。 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序和去卷积分析 | CIBERSORTx | 基因组数据 | 分析了来自PSC和PBC患者的肝组织的多个样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 17905 | 2024-08-05 | 
         Single-cell and spatial transcriptome sequencing uncover a platinum-resistant cluster overexpressed TACSTD2 in high-grade serous ovarian cancer 
        
          2024, Journal of Cancer
          
          IF:3.3Q2
          
         
        
          DOI:10.7150/jca.95269
          PMID:38817863
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究揭示了高恶性度浆液性卵巢癌中与铂耐药性相关的E0亚群及其TACSTD2的表达 | 首次识别出铂耐药性上调TACSTD2的上皮细胞亚群,探讨了其在铂耐药性机制中的作用 | 样本量较小,仅涉及6名患者,可能限制结果的普遍性 | 分析高恶性度浆液性卵巢癌中的耐药机制及潜在靶点 | 研究对象为3名铂敏感患者和3名铂耐药患者的肿瘤组织 | 数字病理 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6个肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 17906 | 2024-08-05 | 
         STREAK: A supervised cell surface receptor abundance estimation strategy for single cell RNA-sequencing data using feature selection and thresholded gene set scoring 
        
          2023-08, PLoS computational biology
          
          IF:3.8Q1
          
         
        
          DOI:10.1371/journal.pcbi.1011413
          PMID:37603589
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究介绍了一种新的监督细胞表面受体丰度估计方法STREAK,用于单细胞转录组数据。 | 提出了一种利用联合scRNA-seq/CITE-seq训练数据的监督受体丰度估计方法,并结合了一种阈值基因集评分机制。 | NA | 开发一种更准确的细胞表面受体丰度估计方法。 | 针对六个联合scRNA-seq/CITE-seq数据集进行的受体丰度估计评估。 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序数据 | 六个联合scRNA-seq/CITE-seq数据集,代表四种人类和小鼠组织类型 | NA | NA | NA | NA | 
| 17907 | 2024-08-05 | 
         Growth Hormone Accelerates Recovery From Acetaminophen-Induced Murine Liver Injury 
        
          2023-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
        
          DOI:10.1101/2023.04.17.537197
          PMID:37131727
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨了生长激素在乙酰氨基酚诱导的小鼠肝损伤中的治疗作用 | 首次提出使用生长激素作为治疗乙酰氨基酚肝毒性的替代疗法,并探讨了性别对肝脏修复的影响 | 研究的局限性在于只在小鼠模型中进行,尚未验证在人类中的有效性 | 旨在建立生长激素作为治疗乙酰氨基酚肝毒性的替代疗法 | 研究重点是乙酰氨基酚诱导的小鼠肝损伤 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 涉及小鼠的实验,样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA | 
| 17908 | 2024-08-05 | 
         SPECK: an unsupervised learning approach for cell surface receptor abundance estimation for single-cell RNA-sequencing data 
        
          2023, Bioinformatics advances
          
          IF:2.4Q2
          
         
        
          DOI:10.1093/bioadv/vbad073
          PMID:37359727
         
       | 
      
      研究论文 | 本文提出了一种新的无监督方法SPECK,用于单细胞RNA测序数据的受体丰度估计 | 创新点在于提出了一种基于CKmeans聚类阈值的无监督算法来估计细胞表面受体的丰度 | 依赖于scRNA-seq数据进行受体丰度估计,无法直接测量表面蛋白,可能影响结果的准确性 | 旨在提高细胞表面蛋白丰度估计的准确性,以支持单细胞转录组学的研究 | 主要研究人类25种受体在多种组织类型中的丰度估计 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督算法 | RNA测序数据 | 涉及至少25个人类受体和多个组织类型 | NA | NA | NA | NA | 
| 17909 | 2024-08-05 | 
         Div-Seq: Single-nucleus RNA-Seq reveals dynamics of rare adult newborn neurons 
        
          2016-08-26, Science (New York, N.Y.)
          
         
        
          DOI:10.1126/science.aad7038
          PMID:27471252
         
       | 
      
      研究论文 | 本文介绍了一种新方法Div-Seq,用于揭示稀有成人新生神经元的动态过程 | 本文创新性地结合了可扩展的单核RNA测序与脉冲标记增殖细胞的方法 | 目前对每个阶段的标记物仍然有限 | 研究成人神经发生中的稀有动态过程 | 主要研究对象为成人海马区和脊髓中的新生神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 17910 | 2024-08-04 | 
         YTHDF2 favors protumoral macrophage polarization and implies poor survival outcomes in triple negative breast cancer 
        
          2024-Jun-21, iScience
          
          IF:4.6Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.isci.2024.109902
          PMID:38812540
         
       | 
      
      研究论文 | 该研究聚焦于YTHDF2及其在三阴性乳腺癌中对巨噬细胞极化的影响 | 发现YTHDF2促进巨噬细胞的促肿瘤表型极化,并与抗原呈递信号的下调密切相关 | NA | 探讨YTHDF2在三阴性乳腺癌中巨噬细胞极化及其影响 | 三阴性乳腺癌中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 17911 | 2024-08-04 | 
         Zinc-a2-Glycoprotein Acts as a Component of PNN to Protect Hippocampal Neurons from Apoptosis 
        
          2024-Jun, Molecular neurobiology
          
          IF:4.6Q1
          
         
        
          DOI:10.1007/s12035-023-03771-4
          PMID:38001359
         
       | 
      
      研究论文 | 本文首次展示了锌-α-糖蛋白(ZAG)在鼠脑中的分布与功能 | 本研究首次揭示ZAG在PNN中定位及其对神经元凋亡的保护作用 | 研究主要集中在小鼠模型,可能无法完全推及人类 | 探讨锌-α-糖蛋白在成年人脑中的作用及其对神经元的保护机制 | 成人小鼠的海马、皮层及其它包含PNN的神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、分子对接 | NA | 细胞数据 | HT22细胞 | NA | NA | NA | NA | 
| 17912 | 2024-08-04 | 
         The upregulation and transcriptional regulatory mechanisms of Extra spindle pole bodies like 1 in bladder cancer: An immunohistochemistry and high-throughput screening Evaluation 
        
          2024-May-30, Heliyon
          
          IF:3.4Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31192
          PMID:38813236
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨了在膀胱癌中Extra Spindle Pole Bodies Like 1 (ESPL1)的表达水平和转录调控机制 | 本研究首次揭示了ESPL1在膀胱癌中的上调表达及其与转录因子的相关性,提出ESPL1可能作为膀胱癌的免疫相关预测和诊断标志物 | 该研究样本虽多,但对特定亚型膀胱癌的适用性可能存在局限性,需进一步验证 | 研究ESPL1在膀胱癌中的表达及其转录调控机制 | 膀胱癌患者样本及其相关的细胞分子机制 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 免疫组化(IHC), 单细胞测序(scRNA-seq), ATAC-seq, ChIP-seq, Hi-C | NA | 组织和血液样本 | 1391个样本用于数据库分析,202个样本用于IHC验证,6625个血液样本和537个组织样本用于miR-299-5p检测 | NA | NA | NA | NA | 
| 17913 | 2024-08-05 | 
         Non-apoptotic regulatory cell death scoring system to predict the clinical outcome and drug choices in breast cancer 
        
          2024-May-30, Heliyon
          
          IF:3.4Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31342
          PMID:38813233
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究提出了一种新型的非凋亡调节细胞死亡评分系统,用于预测乳腺癌的临床结果和药物选择 | 提出了一个与非凋亡调节细胞死亡相关的新风险特征,有望成为乳腺癌的潜在预后标记 | 未提及具体的局限性 | 研究非凋亡调节细胞死亡在乳腺癌中的作用及其预后价值 | 乳腺癌患者的RNA序列和临床数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA测序 | Lasso回归、随机森林、XGBoost | 基因表达数据 | 从TCGA数据库和GEO数据库使用的样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA | 
| 17914 | 2024-08-05 | 
         GHSR in a subset of GABA neurons controls food deprivation-induced hyperphagia in male mice 
        
          2024-May-30, Endocrinology
          
          IF:3.8Q2
          
         
        
          DOI:10.1210/endocr/bqae061
          PMID:38815068
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨了生长激素分泌素受体(GHSR)在特定GABA神经元中对食物剥夺引起的贪食的调控作用 | 确定了GHSR主要作用于下丘脑弓形核中的非AgRP GABA神经元子集 | 研究主要集中在小鼠模型上,可能不适用于其他物种或更广泛的生理条件 | 验证GHSR在特定GABA神经元中的表达是否足以介导其对进食的影响 | 选择性表达GHSR的特定GABA神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本数据 | 涉及多个基因型小鼠 | NA | NA | NA | NA | 
| 17915 | 2024-08-04 | 
         Integration of single-cell sequencing and bulk RNA-seq to identify and develop a prognostic signature related to colorectal cancer stem cells 
        
          2024-05-28, Scientific reports
          
          IF:3.8Q1
          
         
        
          DOI:10.1038/s41598-024-62913-3
          PMID:38806611
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序与传统RNA测序相结合,识别并开发与结直肠癌干细胞相关的预后标记。 | 首次提出基于结直肠癌干细胞相关基因的预后风险模型,并鉴定关键基因RPS17作为潜在的预后标记和治疗靶点。 | 目前尚无临床可用的基于CRCSC相关基因的预后标记。 | 研究结直肠癌干细胞在肿瘤转移、复发和化疗耐药中的作用,并开发相关的预后标记。 | 本研究对象为结直肠癌相关干细胞及其相关基因。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因数据 | 使用TCGA和GEO数据库的数据进行分析,样本数量未具体列出 | NA | NA | NA | NA | 
| 17916 | 2024-08-05 | 
         Single-cell RNA sequencing reveals the evolution of the immune landscape during perihematomal edema progression after intracerebral hemorrhage 
        
          2024-May-28, Journal of neuroinflammation
          
          IF:9.3Q1
          
         
        
          DOI:10.1186/s12974-024-03113-8
          PMID:38807233
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脑出血后周围血肿水肿的免疫环境演变。 | 首次在单细胞水平上全面描绘了人类周围血肿水肿组织中的多样免疫细胞群体。 | 研究仅限于9名患者,样本量较小,可能影响结果的普遍性。 | 目标是表征人类周围血肿水肿组织中免疫细胞群体的转录组特征。 | 9名基底节脑出血患者的周围血肿水肿组织样本。 | 数字病理学 | 脑出血 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 9名患者的周围血肿水肿组织样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 17917 | 2024-08-05 | 
         GLI1+ Cells Contribute to Vascular Remodeling in Pulmonary Hypertension 
        
          2024-May-24, Circulation research
          
          IF:16.5Q1
          
         
        
          DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323736
          PMID:38639105
         
       | 
      
      研究论文 | 这篇文章探讨了GLI1+细胞在肺动脉高压中对血管重塑的贡献 | 阐明了GLI1+细胞作为肺动脉高压中血管平滑肌细胞的新来源,并探索了其信号通路的潜在治疗作用 | 尚未完全阐明GLI1+细胞在动态血管重塑过程中的具体机制 | 研究GLI1+细胞在肺动脉高压中的作用及其在血管重塑中的重要性 | 主要研究GLI1+细胞在肺动脉高压小鼠模型中的表型和功能 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本 | 使用了GLI1Cre-ERT2; tdTomatoflox小鼠进行实验分析 | NA | NA | NA | NA | 
| 17918 | 2024-08-04 | 
         Analysis of synthetic cellular barcodes in the genome and transcriptome with BARtab and bartools 
        
          2024-May-20, Cell reports methods
          
          IF:4.3Q2
          
         
        
          DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100763
          PMID:38670101
         
       | 
      
      研究论文 | 本文介绍了一种用于细胞条形码分析的工具BARtab和bartools | 提出了一个综合的端到端细胞条形码分析工具包,包含多个功能以简化数据提取和分析 | 未提及具体的局限性 | 研究细胞条形码在基因组和转录组中的应用 | 针对细胞条形码的网络状况进行分析,包含人群水平、单细胞和空间转录组实验 | 数字病理学 | NA | 高通量测序 | NA | 转录组数据 | 多个示例样本,包括大样本、单细胞及空间转录组实验 | NA | NA | NA | NA | 
| 17919 | 2024-08-04 | 
         Semaglutide ameliorates obesity-induced cardiac inflammation and oxidative stress mediated via reduction of neutrophil Cxcl2, S100a8, and S100a9 expression 
        
          2024-May, Molecular and cellular biochemistry
          
          IF:3.5Q3
          
         
        
          DOI:10.1007/s11010-023-04784-2
          PMID:37318712
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨了塞马鲁肽在肥胖导致的心脏炎症和氧化压力中的作用。 | 揭示了塞马鲁肽通过降低中性粒细胞Cxcl2、S100a8和S100a9表达来减轻肥胖引起的心脏炎症和氧化压力的新机制。 | 研究主要基于小鼠模型,可能无法完全代表人类的生理情况。 | 探究肥胖引起的心肌损伤机制及塞马鲁肽的心脏保护影响。 | 肥胖小鼠模型及其心脏组织和血清中的炎症和氧化压力水平。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 血清和心脏组织样本 | 肥胖小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | 
| 17920 | 2024-08-04 | 
         The guardians of pulmonary harmony: alveolar macrophages orchestrating the symphony of lung inflammation and tissue homeostasis 
        
          2024-Apr-30, European respiratory review : an official journal of the European Respiratory Society
          
          IF:9.0Q1
          
         
        
          DOI:10.1183/16000617.0263-2023
          PMID:38811033
         
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      综述 | 该文章全面论述了肺泡巨噬细胞在肺部炎症和组织稳态中的重要作用 | 整合了单细胞测序、细胞和组织成像技术等多项最新研究,提供了肺泡巨噬细胞功能可塑性的综合视角 | 未提供具体的实验数据或样本分析结果 | 探讨肺泡巨噬细胞在维持肺部健康和应对疾病环境中的作用 | 主要研究肺泡巨噬细胞及其相应的信号通路和功能特点 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、细胞成像技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |