单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 17861 - 17880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17861 | 2024-08-08 |
Barcode demultiplexing of nanopore sequencing raw signals by unsupervised machine learning
2023, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2023.1067113
PMID:37181486
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研究论文 | 本文介绍了一种名为UNPLEX的新框架，用于通过直接操作记录的信号来解决纳米孔测序原始信号的条形码解复用问题 | UNPLEX结合了两种无监督机器学习方法：自动编码器和自组织映射（SOM），以提取记录信号的紧凑、潜在表示并进行聚类 | NA | 解决纳米孔测序中条形码解复用的问题 | 纳米孔测序的原始信号 | 机器学习 | NA | 纳米孔测序（ONT） | 自动编码器和自组织映射（SOM） | 信号 | 两个数据集，包含生成的类似ONT的信号 |
| 17862 | 2024-08-08 |
Promising immunotherapeutic targets in lung cancer based on single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1148061
PMID:37187731
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综述 | 本文综述了基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在肺癌免疫治疗中的最新进展，特别是关注基质细胞，并提出了基于scRNA-seq识别的细胞标志物的肺癌免疫治疗预测性生物标志物和新靶点 | 利用scRNA-seq技术识别肿瘤微环境（TME）中的细胞标志物，为肺癌免疫治疗提供了新的靶点和策略 | NA | 提高肺癌患者对免疫治疗的反应 | 肺癌中的免疫治疗靶点 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 17863 | 2024-08-08 |
Identification of TREM2-positive tumor-associated macrophages in esophageal squamous cell carcinoma: implication for poor prognosis and immunotherapy modulation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1162032
PMID:37187751
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在食管鳞状细胞癌中鉴定出一种新的TREM2阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群，并探讨其对患者预后和免疫治疗的影响 | 首次在食管鳞状细胞癌中发现TREM2阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群，并揭示其与不良预后和免疫治疗反应的关系 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和少量临床样本，需要更多临床数据验证 | 探讨食管鳞状细胞癌中TREM2阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群对患者预后和免疫治疗的影响 | 食管鳞状细胞癌中的肿瘤相关巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括48名黑色素瘤患者和80名食管鳞状细胞癌患者的样本 |
| 17864 | 2024-08-08 |
Multicellular network analysis of melanoma heterogeneity by scRNA-seq
2023, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:37193189
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研究论文 | 本研究通过分析已发表的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集，绘制了人类黑色素瘤的细胞景观图 | 本研究首次通过构建细胞特异性网络（CSN）对每个细胞群体进行聚类和伪轨迹分析，提供了黑色素瘤免疫微环境的详细图谱 | NA | 揭示黑色素瘤的细胞类型组成和肿瘤免疫微环境 | 分析4645个细胞的转录组数据，来自19个黑色素瘤组织 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 4645个细胞，来自19个黑色素瘤组织 |
| 17865 | 2024-08-08 |
Engineering and Modeling the Lung Mesenchyme
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-26625-6_8
PMID:37195530
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研究论文 | 本文探讨了肺间质细胞的结构及其在肺部功能中的作用，并介绍了使用单细胞RNA测序和生物工程方法研究肺间质细胞功能的新方法 | 利用单细胞RNA测序和遗传小鼠模型揭示了肺间质细胞的转录和功能异质性，并采用生物工程方法模拟组织结构以阐明间质细胞类型的功能和调控 | NA | 研究肺间质细胞的生物学特性和功能 | 肺间质细胞及其在肺部结构和功能中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及遗传小鼠模型 |
| 17866 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic landscape identifies the expansion of peripheral blood monocytes as an indicator of HIV-1-TB co-infection
2022-Feb, Cell insight
DOI:10.1016/j.cellin.2022.100005
PMID:37192986
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了HIV-1和结核病（TB）共感染患者的外周血单核细胞（PBMCs）的转录组特征 | 首次揭示了HIV-1和TB共感染患者中免疫细胞亚群的比例变化，并发现炎症性CD14CD16单核细胞亚群可作为诊断HIV-1-TB共感染的生物标志物 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定治疗阶段的病人 | 探究HIV-1和TB共感染患者中免疫细胞亚群的转录组特征及其在疾病诊断中的应用 | HIV-1感染者、HIV-1-TB共感染者及其治疗前后的外周血单核细胞 | 数字病理学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 超过60,000个细胞，包括80名患者的额外队列 |
| 17867 | 2024-08-05 |
An interferon gamma response signature links myocardial aging and immunosenescence
2023-11-15, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad068
PMID:37141306
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研究论文 | 本研究探讨了衰老的T细胞与老年小鼠心肌细胞生物学变化之间的关系 | 揭示了衰老与心肌IFN-γ信号增强之间的关系，以及这对心力衰竭中的炎症和代谢变化的影响 | 研究主要在小鼠模型中进行，可能限制了结果向人类的翻译相关性 | 研究衰老如何影响心脏的免疫及代谢环境 | 聚焦于不同年龄段C57BL/6J小鼠心脏内的T细胞及心肌细胞 | 数字病理学 | 心脏病 | 单细胞RNA/T细胞受体测序 | NA | 单细胞基因组数据 | 使用2、6、12和18个月龄的C57BL/6J小鼠 |
| 17868 | 2024-08-08 |
Monocyte heterogeneity in cardiovascular disease
2023-09-05, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad069
PMID:37161473
|
研究论文 | 本文综述了单核细胞在心血管疾病中的异质性及其在稳态和疾病中的功能差异 | 提出了超越当前三分法子集划分的单核细胞异质性新范式，并主张更新命名法和功能研究以证实基于标记的子集划分 | 缺乏明确的因果关系证据以及对心血管疾病的预测价值 | 探讨单核细胞异质性在心血管疾病中的作用及其潜在的子集特异性影响 | 单核细胞及其在心血管疾病中的异质性和功能 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 17869 | 2024-08-05 |
M2 macrophage marker CHI3L2 could serve as a potential prognostic and immunological biomarker in glioma by integrated single-cell and bulk RNA-Seq analysis
2023-09, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3523
PMID:37147894
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研究论文 | CHI3L2在胶质瘤中具有预后和免疫标志物的潜在价值 | 综合了散装RNA测序、蛋白组学和单细胞RNA测序以确定CHI3L2在胶质瘤中的作用 | 该研究主要依赖于在线数据库的分析，可能存在数据库数据的局限性 | 探讨CHI3L2在胶质瘤中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 研究对象为胶质瘤患者的CHI3L2表达 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR, IHC | Cox回归模型 | 基因数据 | 涉及多组胶质瘤的样本数据来自多个数据库 |
| 17870 | 2024-08-08 |
Microbiota-mediated shaping of mouse spleen structure and immune function characterized by scRNA-seq and Stereo-seq
2023-09, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2023.04.012
PMID:37156441
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研究论文 | 本文通过scRNA-seq和Stereo-seq技术研究了无菌（GF）小鼠中微生物群对脾脏结构和免疫功能的影响 | 首次揭示了微生物群缺失对脾脏红髓区域红细胞生成和白髓区域先天免疫缺陷的影响，并展示了脾脏免疫细胞的空间分布层次 | NA | 探索微生物群在调节和塑造脾脏结构和免疫功能中的作用 | 小鼠脾脏的结构、细胞类型、功能和空间分子特征 | 免疫学 | NA | scRNA-seq, Stereo-seq | NA | 细胞和分子数据 | 无菌小鼠 |
| 17871 | 2024-08-05 |
Molecular Profiling Provides Clinical Insights Into Targeted and Immunotherapies as Well as Colorectal Cancer Prognosis
2023-08, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.04.029
PMID:37146911
|
研究论文 | 该文章探讨了结直肠癌的肿瘤遗传测试及其在精准医学和免疫治疗中的临床意义 | 集成分析揭示了不同基因组背景下肿瘤免疫微环境的异质性以及针对结直肠癌的个性化治疗策略 | 研究主要集中在特定人群（中国患者），可能限制结果的普遍性 | 了解肿瘤遗传测试在结直肠癌管理中的重要性并优化个性化治疗 | 869名中国结直肠癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 全外显子测序、转录组测序、单细胞测序 | NA | 样本数据、基因组数据 | 869例结直肠癌患者的肿瘤样本 |
| 17872 | 2024-08-05 |
Spatial resolution of cellular senescence dynamics in human colorectal liver metastasis
2023-07, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13853
PMID:37157887
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研究论文 | 本文研究了细胞衰老在人体结直肠肝转移中的作用，揭示了两种不同的衰老转移癌细胞亚型 | 首次发现衰老转移癌细胞亚型与化疗敏感性、免疫调节等的重要生物学特征不同 | 目前研究主要集中在2D临床模型，可能无法完全反映真实的生理状态 | 探讨细胞衰老在结直肠肝转移中的具体作用 | 研究不同类型的衰老转移癌细胞及其对结直肠癌转移的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学，3D显微镜，多细胞转录组学 | 2D预临床模型 | 基因表达数据 | NA |
| 17873 | 2024-08-08 |
Fusion with type 2 macrophages induces melanoma cell heterogeneity that potentiates immunological escape from cytotoxic T lymphocytes
2023-07, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6083
PMID:37138382
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研究论文 | 研究探讨了肿瘤-巨噬细胞融合体在免疫逃避中的作用 | 首次揭示了肿瘤-巨噬细胞融合体在免疫逃避中的具体机制 | 研究主要基于体外模型，需要进一步的临床验证 | 探究肿瘤-巨噬细胞融合体如何促进肿瘤异质性和免疫逃避 | 黑色素瘤细胞与2型巨噬细胞的融合体 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及四个融合体克隆和患者来源的黑色素瘤样本 |
| 17874 | 2024-08-08 |
Nervous tract-bioinspired multi-nanoyarn model system regulating neural differentiation and its transcriptional architecture at single-cell resolution
2023-07, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 研究通过创新的静电纺丝技术构建了一种模仿脊髓的多纳米纱线模型系统，该系统能够调节神经分化及其在单细胞分辨率下的转录结构 | 该研究首次构建了一种模仿脊髓的多纳米纱线模型系统，能够模拟神经通路的结构和功能，促进神经干细胞和前体细胞的分化与成熟，并抑制胶质细胞生成 | NA | 开发下一代体外神经模型系统，通过精确模拟神经通路结构，研究神经干细胞和前体细胞在仿生微环境中的多样化 | 神经干细胞和前体细胞的分化、迁移和成熟 | 生物医学工程 | NA | 静电纺丝 | 多纳米纱线模型 | 单细胞转录组 | NA |
| 17875 | 2024-08-08 |
A bivariate zero-inflated negative binomial model and its applications to biomedical settings
2023-07, Statistical methods in medical research
IF:1.6Q1
DOI:10.1177/09622802231172028
PMID:37167422
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研究论文 | 本文开发了一种参数丰富的双变量零膨胀负二项模型，用于分析生物医学环境中相关的计数变量 | 提出了一个具有简单潜在变量框架和八个直观解释的自由参数的双变量零膨胀负二项模型 | NA | 旨在为生物医学设置中相关的计数变量提供一个有效的统计模型 | 分析稀疏单细胞RNA测序数据中两个基因的相关性以及木糖醇含片对两种不同牙齿表面类型的牙病计数指标的影响 | 生物统计学 | 牙病 | 单细胞RNA测序 | 双变量零膨胀负二项模型 | 计数数据 | NA |
| 17876 | 2024-08-05 |
VISTA: Visualizing the Spatial Transcriptome of the C. elegans Nervous System
2023-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.28.538711
PMID:37163055
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研究论文 | VISTA通过可视化线虫神经系统的空间转录组来展示基因表达。 | 提出了一种利用现有数据集对线虫空间转录组进行可视化的新方法，专注于神经系统。 | 技术的应用范围可能受到现有数据集的限制，以及模型可能无法应用于所有动物物种。 | 实现单细胞分辨率和全转录组覆盖的空间转录组分析。 | 线虫的神经系统及其神经元的基因表达。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用现有单细胞转录组数据集 |
| 17877 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics allows novel insights into the endocrine-disrupting chemicals induced mammalian reproductive disorder
2023-Jun-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2023.114971
PMID:37163908
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研究论文 | 本研究探讨了内分泌干扰化学物质（EDCs）对哺乳动物生殖障碍的影响 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术深入分析EDCs对生殖发展的干扰机制 | 未提及特定的样本规模或实验条件的限制 | 探讨EDCs对哺乳动物生殖系统的毒性机制 | 哺乳动物的生殖健康，特别是EDCs引起的生殖功能相关疾病 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 文本 | NA |
| 17878 | 2024-08-05 |
Predicting cellular responses to complex perturbations in high-throughput screens
2023-06-12, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202211517
PMID:37154091
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研究论文 | 本文提出了一种新的计算方法，名为成分扰动自编码器（CPA），用于预测细胞对复杂扰动的反应 | CPA结合了线性模型的可解释性和深度学习方法的灵活性，能够高效预测未见剂量、细胞类型、时间点和物种的转录扰动反应 | 本研究依赖于未见药物的预测，可能对某些药物组合的通用性不足 | 研究旨在开发计算方法以预测和解释细胞对药物和遗传扰动的反应 | 研究对象为单细胞的转录扰动反应 | 计算机视觉 | NA | 高通量筛选 | 自编码器 | 单细胞转录组数据 | 生成了新单细胞药物组合数据，补全了5,329个缺失组合 |
| 17879 | 2024-08-08 |
Microglia modulate general anesthesia through P2Y12 receptor
2023-06-05, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2023.04.047
PMID:37167975
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研究论文 | 本文揭示了小胶质细胞通过P2Y12受体调节全身麻醉的机制 | 首次证明了小胶质细胞通过P2YR介导的信号传导积极参与全身麻醉的多个过程，扩展了小胶质细胞在脑中的非免疫角色 | NA | 探讨小胶质细胞在全身麻醉中的作用及其机制 | 小胶质细胞及其在全身麻醉中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠 |
| 17880 | 2024-08-05 |
Cuproptosis-related gene CDKN2A as a molecular target for IPF diagnosis and therapeutics
2023-Jun, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-023-01739-7
PMID:37166466
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研究论文 | 本研究探讨了CDKN2A作为特发性肺纤维化（IPF）诊断和治疗的分子靶点 | 首次提出CDKN2A基因在IPF发展中的重要作用，并揭示其与M2巨噬细胞和cuproptosis的关系 | 研究的样本量及范围尚未明确，可能影响结果的普遍性 | 探讨cuproptosis相关基因在IPF中的预后和治疗潜力 | 特发性肺纤维化患者的肺组织样本及相关细胞模型 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA序列分析 | NA | 基因表达数据 | IPF患者肺组织样本及小鼠实验样本 |