单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28786 篇文献，本页显示第 17821 - 17840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17821 | 2024-08-05 |
Alveolar macrophages in tissue homeostasis, inflammation, and infection: evolving concepts of therapeutic targeting
2023-10-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170501
PMID:37781922
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研究论文 | 该文章探讨了肺泡巨噬细胞在组织稳态、炎症和感染中的作用及其治疗靶向的概念演变 | 首次结合单细胞RNA测序和空间组学方法深入研究了肺泡巨噬细胞的起源、功能和可塑性 | 治疗靶向肺泡巨噬细胞可能面临严重的副作用风险，例如抗菌宿主防御能力的丧失 | 探索肺泡巨噬细胞在急性肺损伤中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 主要研究对象为肺泡巨噬细胞及其在感染和无菌肺炎中的功能 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 17822 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of cuproptosis and copper homeostasis genotyping and related immune land scape in lung adenocarcinoma
2023-10-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-43795-3
PMID:37783723
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研究论文 | 本研究分析了肺腺癌中铜死亡和铜稳态基因型及相关免疫景观 | 首次在肺腺癌中识别出新的铜死亡和铜稳态相关基因，并建立了基于这些基因的预后标志物 | NA | 探索肺腺癌中铜死亡和铜稳态相关基因及其在肿瘤治疗中的潜在应用 | 肺腺癌中的铜死亡和铜稳态相关基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），lasso-惩罚的cox回归方法，单细胞RNA测序（scRNA-seq），实时定量聚合酶链反应（RT-qPCR） | NA | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 使用了来自TCGA和GEO的转录组数据，以及GSE30219、GSE183219和GSE203360的单细胞RNA测序数据 |
| 17823 | 2024-08-07 |
Unravelling the role of immune cells and FN1 in the recurrence and therapeutic process of skull base chordoma
2023-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1429
PMID:37784253
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和T/B细胞受体测序，研究了颅底脊索瘤原发和复发肿瘤细胞及其微环境细胞的差异，并探讨了纤维连接蛋白1（FN1）在脊索瘤复发和治疗中的作用。 | 首次详细分析了颅底脊索瘤原发和复发肿瘤细胞及其微环境细胞的差异，并揭示了FN1在脊索瘤复发中的重要作用。 | NA | 深入了解颅底脊索瘤原发和复发肿瘤的细胞差异及其复发机制，为开发有效治疗策略提供依据。 | 颅底脊索瘤的原发和复发肿瘤细胞、浸润淋巴细胞、骨髓细胞、成纤维细胞和B细胞。 | 数字病理学 | 颅底脊索瘤 | 单细胞RNA测序，T/B细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA序列数据 | NA |
| 17824 | 2024-08-07 |
Bladder cancer intrinsic LRFN2 drives anticancer immunotherapy resistance by attenuating CD8+ T cell infiltration and functional transition
2023-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007230
PMID:37802603
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研究论文 | 本文研究了膀胱癌中LRFN2蛋白通过调节肿瘤微环境影响免疫治疗抵抗的机制 | 首次揭示了LRFN2在膀胱癌中通过抑制CD8+ T细胞的招募和功能转变，影响免疫检查点抑制剂治疗效果的新机制 | NA | 探讨LRFN2在膀胱癌免疫治疗抵抗中的作用及其机制 | 膀胱癌中的LRFN2蛋白及其对肿瘤微环境和免疫治疗的影响 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序, 免疫测定, 组织全景量化分析 | NA | RNA, 组织 | 涉及大量RNA测序和单细胞RNA测序，具体样本数量未详细说明 |
| 17825 | 2024-08-07 |
Application of single-cell multi-omics approaches in horticulture research
2023-Sep-26, Molecular horticulture
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s43897-023-00067-y
PMID:37789394
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review | 本文总结了目前可用的单细胞多组学方法及其在植物研究中的应用，回顾了基于单细胞的研究在水果、蔬菜和观赏作物中的应用，并讨论了这些方法在未来园艺研究中的潜力 | 本文介绍了单细胞多组学技术在植物发育生物学研究中的应用，以及这些技术在提高表观组和代谢组研究准确性和灵敏度方面的进展 | NA | 总结单细胞多组学方法在园艺研究中的应用，并探讨其未来潜力 | 水果、蔬菜和观赏作物 | NA | NA | 单细胞转录组测序技术 | NA | 转录组、表观组和代谢组数据 | NA |
| 17826 | 2024-08-07 |
Differential effects of aneuploidy on growth and differentiation in human intestinal stem cells
2023-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.23.559117
PMID:37790420
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研究论文 | 研究在非转化的结肠类器官中诱导异质性非整倍体，探讨非整倍体对细胞生长和分化的影响及其在恶性转化中的作用 | 通过单细胞RNA测序揭示了超过100种独特非整倍体核型的基因表达特征，并发现复杂非整倍体细胞通过激活p53导致G1细胞周期阻滞 | 未详细说明非整倍体在不同环境下的具体作用机制 | 探究非整倍体对人类肠道干细胞生长和分化的影响及其在癌症演变中的作用 | 人类肠道干细胞中的非整倍体效应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过100种独特非整倍体核型的细胞 |
| 17827 | 2024-08-05 |
Cracking the pattern of tumor evolution based on single-cell copy number alterations
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad341
PMID:37791583
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研究论文 | 本研究基于单细胞拷贝数变化探讨肿瘤演化模式 | 提出了一种两步统计方法，能够区分肿瘤细胞群体的演化模式 | 在研究中未提及样本的种类及数量可能限制了结论的普遍性 | 探索肿瘤细胞群体中的拷贝数变化与肿瘤演化模式的关系 | 使用20名乳腺癌患者的单细胞DNA测序数据和132名癌症患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组和转录组数据 | 20名乳腺癌患者和132名癌症患者 |
| 17828 | 2024-08-07 |
ScSmOP: a universal computational pipeline for single-cell single-molecule multiomics data analysis
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad343
PMID:37779245
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ScSmOP的通用计算流程，用于条形码索引的单细胞单分子多组学数据分析 | ScSmOP利用C语言建立了基于间隔种子哈希表的算法，用于根据连接型和合成型条形码数据进行条形码识别，随后进行数据映射和反卷积 | NA | 开发一种高效、易用且稳健的计算流程，用于单细胞单分子多组学数据分析 | 单细胞多组学技术，包括scRNA-seq、scATAC-seq、scARC-seq等 | 生物信息学 | NA | 单细胞多组学技术 | NA | 多组学数据 | 涉及多种细胞类型和物种的单细胞和单分子数据 |
| 17829 | 2024-08-07 |
Interpretable modeling of time-resolved single-cell gene-protein expression with CrossmodalNet
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad342
PMID:37798250
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研究论文 | 本文提出了一种名为CrossmodalNet的可解释机器学习模型，用于从单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中预测细胞表面蛋白表达 | CrossmodalNet模型通过自定义适应性损失函数准确预测表面蛋白丰度，并能将时间信息编码为易于解释的时间嵌入，以时间点特定的方式进行预测，揭示无噪声的因果基因-蛋白关系 | NA | 开发一种可解释的计算方法，用于从scRNA-seq数据中预测细胞表面蛋白表达，以扩展CITE-seq实验的能力 | 细胞表面蛋白表达 | 机器学习 | NA | CITE-seq, scRNA-seq | CrossmodalNet | 基因和表面蛋白表达数据 | 使用了三个公开的时间解析CITE-seq数据集 |
| 17830 | 2024-08-07 |
Fibroblast growth factor receptor 3 mutation attenuates response to immune checkpoint blockade in metastatic urothelial carcinoma by driving immunosuppressive microenvironment
2023-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-006643
PMID:37777251
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研究论文 | 研究探讨了纤维母细胞生长因子受体3（FGFR3）突变如何通过驱动免疫抑制微环境，影响转移性尿路上皮癌（UC）患者对免疫检查点阻断（ICB）治疗的反应 | 首次通过单细胞RNA测序分析，揭示了FGFR3突变型UC与野生型UC在免疫微环境中的差异，并提出了FGFR3抑制剂与ICB联合治疗的新策略 | 研究基于单臂、多中心、II期临床试验IMvigor210，样本量相对较小，需要进一步的大规模临床试验验证 | 比较FGFR3突变型与野生型转移性UC患者在接受ICB治疗后的预后和反应，并解析潜在的分子机制 | 转移性尿路上皮癌患者，特别是FGFR3突变型与野生型的患者 | NA | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA转录组数据 | 39名FGFR3突变型患者和39名FGFR3野生型患者，以及6个UC肿瘤样本中的58,069个单细胞 |
| 17831 | 2024-08-07 |
[The Role of Cancer-Associated Fibroblasts in Modulating Tumor Immunity in Colorectal Cancer]
2023-Sep, Gan to kagaku ryoho. Cancer & chemotherapy
PMID:37800287
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综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞（CAFs）在结直肠癌中调节肿瘤免疫的作用 | 通过单细胞RNA测序识别出一种调节免疫反应的CAFs亚群 | NA | 探讨CAFs在肿瘤微环境中的作用，以期为针对CAFs的疗法提供新思路 | 结直肠癌中的癌症相关成纤维细胞及其对肿瘤免疫的影响 | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠原位直肠肿瘤模型 |
| 17832 | 2024-08-05 |
Exploring the role of macrophages in the progression from atypical hyperplasia to endometrial carcinoma through single-cell transcriptomics and bulk transcriptomics analysis
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1198944
PMID:37780629
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析识别了子宫内膜癌中的关键基因 | 识别了与巨噬细胞M0相关的关键基因，并提出这些基因可能影响从非典型子宫内膜增生向子宫内膜癌的转化 | 未提及具体的样本数量及其他潜在的生物标志物 | 研究巨噬细胞在非典型子宫内膜增生转化为子宫内膜癌中的作用 | 巨噬细胞及其相关基因在子宫内膜癌中的表达 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序和批量转录组分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | NA |
| 17833 | 2024-08-05 |
TCL1A+ B cells predict prognosis in triple-negative breast cancer through integrative analysis of single-cell and bulk transcriptomic data
2023, Open life sciences
IF:1.7Q3
DOI:10.1515/biol-2022-0707
PMID:37791059
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研究论文 | 本文首次通过整合单细胞和全基因组转录组数据识别了TCL1A+ B细胞在三阴性乳腺癌中的预后相关功能 | 发现TCL1A+ B细胞在三阴性乳腺癌预后中的潜在重要性，并扩展了传统肿瘤浸润淋巴细胞的生存预测视角 | 需要进一步研究来验证我们的发现 | 研究TCL1A+ B细胞在三阴性乳腺癌中的作用及其与临床结果的关联 | 五名三阴性乳腺癌患者的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | RNA-seq | 无监督方法 | 转录组数据 | 5名三阴性乳腺癌患者 |
| 17834 | 2024-08-05 |
Ferroptosis: A potential target of macrophages in plaque vulnerability
2023, Open life sciences
IF:1.7Q3
DOI:10.1515/biol-2022-0722
PMID:37791060
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研究论文 | 本文讨论了铁死亡在动脉粥样硬化斑块脆弱性中的作用，及其机制和调控 | 提出铁死亡可以作为调节巨噬细胞与斑块脆弱性之间平衡的潜在靶点 | 对此领域的未来研究方向仍需进一步探讨和验证 | 探讨铁死亡在动脉粥样硬化斑块脆弱性中的作用及其可能的治疗潜力 | 研究焦点是动脉粥样硬化模型中的巨噬细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | ApoE(-/-)小鼠 |
| 17835 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of graft-infiltrating host cells identifies caspase-1 as a potential therapeutic target for heart transplant rejection
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1251028
PMID:37781362
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研究论文 | 本研究探讨了心脏移植早期拒绝阶段中移植物浸润细胞的单细胞组成及其潜在的治疗靶点 | 本研究首次揭示了caspase-1在介导心脏移植中的炎症性单核细胞浸润中的重要作用 | 研究仅限于早期拒绝阶段，缺少长期后果的评估 | 了解早期移植物拒绝的细胞机制以开发有效的免疫抑制策略 | 移植物浸润细胞及其相关的分子靶点 | 数字病理学 | 心脏移植排斥反应 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 27,053个细胞 |
| 17836 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing of tumor-associated macrophages in a Drosophila model
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1243797
PMID:37795097
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研究论文 | 本研究使用果蝇模型对肿瘤相关巨噬细胞进行单细胞RNA测序，以探究其在肿瘤进展中的角色 | 首次通过单细胞RNA测序揭示果蝇中肿瘤相关巨噬细胞的分子特征与作用 | 本研究限制于果蝇模型，可能无法完全反映人类肿瘤微环境的复杂性 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤进展中的作用和分子机制 | 以果蝇中表达Ras-oncogene的幼虫作为研究对象 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 包含肿瘤相关细胞和循环细胞的手动提取样本 |
| 17837 | 2024-08-05 |
Comprehensive pan-cancer analysis reveals NUSAP1 is a novel predictive biomarker for prognosis and immunotherapy response
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.80017
PMID:37781040
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研究论文 | 本研究分析了NUSAP1在不同癌症类型中的预后和免疫治疗反应的预测能力 | 首次系统分析了NUSAP1在肿瘤免疫微环境中的作用及其在多种癌症中的预后价值 | 未说明NUSAP1在特定癌症类型中的作用机制的深入研究 | 探讨NUSAP1作为预后生物标志物在免疫治疗中的潜在应用 | 人类正常及肿瘤组织中的NUSAP1 mRNA和蛋白表达水平 | 数字病理学 | 多种癌症 | RNA测序 | NA | tissue | 包括多种正常和肿瘤组织的临床样本及数据库数据 |
| 17838 | 2024-08-05 |
Adult tissue-specific stem cell interaction: novel technologies and research advances
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1220694
PMID:37808078
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综述 | 本研究综述了成人组织特异性干细胞相互作用的最新方法学进展 | 文章介绍了双酶谱系追踪系统、合成受体系统、近距离标记、单细胞RNA测序和空间转录组学等新技术在研究成人组织特异性干细胞相互作用中的应用 | NA | 旨在阐述成人组织特异性干细胞之间相互作用的机制 | 成人组织特异性干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 17839 | 2024-08-05 |
C5aR1 blockade reshapes immunosuppressive tumor microenvironment and synergizes with immune checkpoint blockade therapy in high-grade serous ovarian cancer
2023, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2023.2261242
PMID:37791232
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研究论文 | 本研究探讨了C5aR1在高分级浆液性卵巢癌中的免疫微环境和免疫治疗反应中的作用 | 揭示了C5aR1作为预测预后和指导治疗的新型生物标志物的潜力 | 未明确探讨不同免疫治疗组合的长远效果 | 识别C5aR1在高分级浆液性卵巢癌中的相关性及其在免疫微环境中的作用 | 高分级浆液性卵巢癌组织及其免疫细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 训练组120个样本和新鲜HGSC组织36个样本 |
| 17840 | 2024-08-05 |
Novel insights from spatial transcriptome analysis in solid tumors
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.83098
PMID:37781515
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综述 | 本文总结了利用空间转录组学研究实体肿瘤的异质性和微环境的研究进展 | 提出了空间转录组学在研究肿瘤异质性和细胞相互作用等多个领域的应用突破 | NA | 探讨空间转录组学在研究肿瘤异质性及其微环境中的应用 | 主要关注实体肿瘤 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |