单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 17801 - 17820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17801 | 2024-08-07 |
Formation of Müller glia-derived progenitor cells in retinas depleted of microglia
2023-Jun-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.08.544205
PMID:37333380
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研究论文 | 研究通过scRNA-seq技术分析了在鸡视网膜中微胶质细胞缺失后Müller胶质细胞的转录变化，探讨了微胶质细胞对Müller胶质细胞衍生前体细胞形成的影响。 | 首次揭示了微胶质细胞在视网膜损伤后通过调节HBEGF、FGF和视黄酸信号通路促进Müller胶质细胞向增殖性前体细胞转化的作用。 | 研究主要集中在鸡视网膜模型，可能需要进一步在其他物种中验证这些发现。 | 探讨微胶质细胞在视网膜损伤后对Müller胶质细胞衍生前体细胞形成的影响。 | 鸡视网膜中的Müller胶质细胞和微胶质细胞。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 鸡视网膜样本 |
| 17802 | 2024-08-07 |
Revealing the Organ-Specific Expression of SPTBN1 using Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2023-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.01.543198
PMID:37333135
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了三个与骨骨折相关且在肌肉组织中高表达的标记基因在成人细胞图谱（AHCA）中15种器官组织类型中的表达情况 | 首次揭示了SPTBN1基因在多个器官类型中的高表达，特别是在纤维母细胞、平滑肌细胞和组织干细胞中的表达 | 研究仅限于分析三个标记基因在15种器官组织类型中的表达，未涉及这些基因在其他组织或疾病中的作用 | 分析三个标记基因在单细胞水平上对不同组织和器官发育的贡献 | 三个标记基因在成人细胞图谱（AHCA）中15种器官组织类型中的表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 84,363个细胞和228,508个基因 |
| 17803 | 2024-08-07 |
Illuminating Dark Proteins using Reactome Pathways
2023-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.05.543335
PMID:37333417
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研究论文 | 利用Reactome通路数据库，通过集成多种资源和随机森林分类器，预测暗蛋白与已知蛋白的功能相互作用，并开发评分系统评估这些相互作用，结合单细胞RNA测序数据和自然语言处理分析，增强对暗蛋白生物学功能和治疗潜力的理解。 | 首次利用Reactome通路数据库和随机森林分类器预测暗蛋白的功能相互作用，并开发新的评分系统评估这些相互作用，结合单细胞RNA测序数据和自然语言处理分析，增强对暗蛋白的理解。 | NA | 揭示暗蛋白的生物学功能和潜在治疗应用 | 暗蛋白及其在生物通路中的功能相互作用 | 生物信息学 | NA | 随机森林分类器，自然语言处理 | 随机森林 | 文本，基因表达数据 | 106个蛋白质/基因成对特征，2200万个PubMed摘要，20个随机选择的暗蛋白 |
| 17804 | 2024-08-07 |
scRNA-seq Analysis of Hemocytes of Penaeid Shrimp Under Virus Infection
2023-Jun, Marine biotechnology (New York, N.Y.)
DOI:10.1007/s10126-023-10221-8
PMID:37326798
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研究论文 | 本研究使用Drop-seq技术分析了人工感染病毒的日本对虾（Penaeus japonicus）血细胞在病毒感染下的变化 | 本研究首次在非模式生物中使用单细胞RNA测序技术分析了病毒感染对血细胞的影响，并发现了新的抗菌肽基因 | 研究仅限于特定种类的虾和特定的病毒感染，可能不适用于其他物种或病毒 | 旨在更好地理解非模式生物如虾和其他海洋无脊椎动物的免疫相关细胞 | 日本对虾的血细胞在病毒感染下的变化 | 数字病理学 | NA | Drop-seq | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 17805 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing in cornea research: Insights into limbal stem cells and their niche regulation
2023-May-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v15.i5.466
PMID:37342216
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在角膜研究领域的应用，特别是对角膜缘干细胞及其微环境的最新发现 | 介绍了单细胞RNA测序技术揭示的角膜缘干细胞群体的异质性、新的干细胞标志物及其微环境的调控机制 | NA | 总结单细胞RNA测序在角膜研究中的最新进展，为临床治疗如角膜上皮伤口愈合、眼表重建及相关疾病干预提供参考 | 角膜缘干细胞及其微环境 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 17806 | 2024-08-05 |
Quantifying Intratumoral Heterogeneity and Immunoarchitecture Generated In-Silico by a Spatial Quantitative Systems Pharmacology Model
2023-May-13, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15102750
PMID:37345087
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研究论文 | 本文探讨了通过空间定量系统药理学模型量化肿瘤内异质性和免疫结构。 | 该研究采用了一种混合模型，将整体患者的分隔定量系统药理学模型与描述肿瘤微环境的空间基于代理的模型结合起来，以量化肿瘤内异质性。 | 由于样本收集时间点的不确定性和数据的局限性，全面理解肿瘤内异质性的作用仍然具有挑战性。 | 该研究的目的是定量评估肿瘤内异质性及其对治疗反应的影响。 | 研究对象为不同类型的肿瘤微环境及其在有效和无效抗PD-1治疗下的免疫结构。 | 数字病理学 | 肿瘤 | 定量系统药理学模型 | 混合模型、基于代理的模型 | 模拟数据 | 代表性的案例 |
| 17807 | 2024-08-05 |
The Black Hole: CAR T Cell Therapy in AML
2023-May-11, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15102713
PMID:37345050
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综述 | 本文讨论了急性髓性白血病中CAR T细胞疗法的独特治疗挑战及新策略 | 提出了针对急性髓性白血病的CAR T细胞和其他细胞治疗的新观念和策略 | 目前仅约30%的患者对治疗有反应，并且存在显著的肿瘤外副作用 | 探讨急性髓性白血病的细胞疗法及其面临的挑战 | 急性髓性白血病患者的CAR T细胞疗法 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞测序 | NA | DNA、表观遗传、RNA和蛋白质数据 | 约100名患者 |
| 17808 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of the basement membrane in lung adenocarcinoma by bulk and single-cell sequencing analysis
2023, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.83407
PMID:37325048
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研究论文 | 本文评估了基底膜在肺腺癌中的临床作用，并探讨了其机制 | 首次通过一系列差异表达基因发现了37个BM-DEG，并建立了基于4个BM-DEG的预后模型 | 研究可能受到样本异质性和实验设计限制的影响 | 阐明基底膜在肺腺癌进展中的作用 | 1383名肺腺癌患者的临床数据和基因表达信息 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，Cox回归分析 | NA | 基因表达数据 | 1383名肺腺癌患者 |
| 17809 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq uncovers distinct pathways and genes in endothelial cells during atherosclerosis progression
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1176267
PMID:37325477
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了动脉粥样硬化进展中内皮细胞的不同途径和基因 | 首次使用单细胞RNA-seq分析确定了在动脉粥样硬化过程中内皮细胞的关键基因和信号通路 | 研究仅基于小鼠模型和部分人类动脉样本，可能无法完全反映动脉粥样硬化的复杂机制 | 探索动脉粥样硬化中内皮细胞的分子机制 | 聚焦于动脉粥样硬化人类冠状动脉中的不同细胞类型及其基因 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个动脉粥样硬化患者的冠状动脉和小鼠样本 |
| 17810 | 2024-08-05 |
Melatonin modulates the hypothalamic-pituitary neuroendocrine axis to regulate physiological color change in teleost fish
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.81055
PMID:37324950
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研究论文 | 本研究探讨了褪黑激素在海洋硬骨鱼类的下丘脑-垂体神经内分泌轴中的作用 | 发现了褪黑激素/黑色素浓缩激素(MCH)和褪黑激素/(tachykinin前体1（TAC1）+促肾上腺皮质激素释放激素（CRH）)/黑色素刺激激素(MSH)的新型调控通路 | 对褪黑激素信号系统的全面理解仍然有限 | 研究褪黑激素在鱼类生理性变色中的调控机制 | 研究对象为大型黄鱼，一种具有昼夜体色变化行为的海洋硬骨鱼 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 17811 | 2024-08-05 |
Will EGFRvIII and neuronal-derived EGFR be targets for imipramine?
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1156492
PMID:37324489
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研究论文 | 本文探讨了三环类抗抑郁药imipramine在治疗神经胶质母细胞瘤中的潜在分子机制 | 揭示了imipramine可能通过靶向EGFRvIII和神经衍生的EGFR来调节肿瘤微环境的创新点 | 尚不清楚抗抑郁药如何影响神经胶质母细胞瘤的具体机制 | 研究imipramine在治疗神经胶质母细胞瘤中的作用机制 | 神经胶质母细胞瘤（GBM） | 数字病理学 | 神经胶质母细胞瘤 | RNA测序, 网络药理学, 单细胞测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | RNA数据 | NA |
| 17812 | 2024-08-05 |
Laser transfer for circulating tumor cell isolation in liquid biopsy
2023, International journal of bioprinting
IF:6.8Q1
DOI:10.18063/ijb.720
PMID:37323505
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研究论文 | 本文提出了一种新的激光转移方法用于循环肿瘤细胞的分离，旨在液体活检中实现高存活率的单细胞分离 | 使用紫外激光和水泡驱动的激光诱导前转移过程，有效保护细胞免受直接激光照射 | 研究中可能缺乏较大样本的验证，尚未充分探讨其他类型肿瘤细胞的适应性 | 开发一种新方法以实现高存活率的单个循环肿瘤细胞的分离 | 主要研究循环肿瘤细胞及其分离效果 | 数字病理学 | 肿瘤 | 液体激光转移（LLT） | NA | 细胞样本 | 1个MDA-MB-231癌细胞 |
| 17813 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing revealed subclonal heterogeneity and gene signatures of gemcitabine sensitivity in pancreatic cancer
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1193791
PMID:37324492
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胰腺癌中吉西他滨敏感性的亚克隆异质性和基因特征 | 本研究首次揭示了吉西他滨诱导的肿瘤细胞亚克隆的自然选择和肿瘤微环境细胞的重塑，并构建了一个能够预测吉西他滨敏感性和胰腺癌预后的基因面板 | NA | 研究胰腺癌中吉西他滨敏感性的亚克隆异质性和基因特征 | 胰腺癌患者样本和吉西他滨治疗前后的肿瘤进化和微环境变化 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 17个患者来源的异种移植模型 |
| 17814 | 2024-08-07 |
The elucidation of the anti-inflammatory mechanism of EMO in rheumatoid arthritis through an integrative approach combining bioinformatics and experimental verification
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1195567
PMID:37324499
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和实验验证的方法，阐明了大黄素（EMO）在类风湿性关节炎（RA）中的抗炎机制 | 采用网络药理学方法筛选EMO的关键靶点，并通过单细胞RNA测序和实验验证其可靠性 | NA | 探索大黄素在类风湿性关节炎中的抗炎作用机制 | 大黄素（EMO）及其在类风湿性关节炎中的作用靶点 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的GSE55457基因表达数据和GSE159117单细胞RNA测序数据，以及对MH7A细胞和关节滑膜成纤维细胞的实验 |
| 17815 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing (scRNA-Seq) Data Analysis of Retinal Homeostasis and Degeneration of Microglia
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3255-0_6
PMID:37326706
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research paper | 本文介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析和可视化的方法，特别关注视网膜稳态和微胶质细胞退化的研究 | 揭示了以前未见的分子特征 | NA | 探索单细胞RNA测序在视网膜稳态和微胶质细胞退化中的应用 | 视网膜稳态和微胶质细胞退化 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | RNA sequencing data | NA |
| 17816 | 2024-08-07 |
Circulating neutrophils activated by cancer cells and M2 macrophages promote gastric cancer progression during PD-1 antibody-based immunotherapy
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1081762
PMID:37333017
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研究论文 | 分析中性粒细胞与淋巴细胞比率（NLR）与接受PD-1抗体治疗的晚期胃癌（AGC）患者预后的相关性，并通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）描绘循环中性粒细胞的分子特征 | 发现治疗后NLR高的AGC患者预后较差，且循环中性粒细胞的亚群NE-1通过与恶性上皮细胞和M2巨噬细胞的信号交互参与胃癌进展 | 研究样本量较小，仅基于45名患者的数据，且仅在两个患者中进行了单细胞RNA测序分析 | 探讨PD-1抗体治疗对AGC患者NLR的影响及其与预后的关系，以及循环中性粒细胞在胃癌进展中的作用 | 接受PD-1抗体治疗的晚期胃癌患者及其循环中性粒细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 45名晚期胃癌患者，88名胃癌患者的组织样本 |
| 17817 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals cell subpopulations in the tumor microenvironment contributing to hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1194199
PMID:37333982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了肝细胞癌肿瘤微环境中具有特定功能的细胞亚群及其与环境的相互作用 | 首次揭示了肿瘤微环境中某些细胞亚群与肿瘤细胞的相互作用，特别是癌症相关成纤维细胞和巨噬细胞在肿瘤微环境重塑中的作用 | 研究样本仅限于14名肝细胞癌患者，可能影响结果的普遍性 | 探索肝细胞癌肿瘤微环境中特定细胞亚群的功能及其与环境的相互作用，以理解肿瘤的发展、预后和治疗 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织及其邻近的正常组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 43个肿瘤组织样本和14个邻近控制样本 |
| 17818 | 2024-08-07 |
Single-cell multi-omics analysis reveals dysfunctional Wnt signaling of spermatogonia in non-obstructive azoospermia
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1138386
PMID:37334314
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了非阻塞性无精症中精原细胞Wnt信号通路的失调 | 首次揭示了非阻塞性无精症中精原细胞Wnt信号通路的下调活性和功能障碍，并确定了可能涉及的三种转录因子（CTCF、AR和ARNTL） | NA | 探讨非阻塞性无精症中精原细胞Wnt信号通路的功能及其上游调控分子 | 非阻塞性无精症患者的精原细胞 | NA | 男性不育症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞染色质可及性测序（scATAC-seq）、空间转录组学 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 17819 | 2024-08-07 |
Schlafen4+-MDSC in Helicobacter-induced gastric metaplasia reveals role for GTPases
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1139391
PMID:37334372
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研究论文 | 本研究探讨了Schlafen4+ MDSC在幽门螺杆菌诱导的胃肠化生中的作用，并揭示了GTP酶在这一过程中的关键角色。 | 首次揭示了SLFN4在MDSC中的表达及其对GTP酶活性的调控作用，以及其在抑制T细胞功能和减轻胃肠化生发展中的作用。 | NA | 旨在阐明SLFN4+细胞的身份及其在MDSC中的作用。 | Schlafen4+ MDSC在幽门螺杆菌感染的胃中的作用。 | NA | 胃癌 | 单细胞RNA测序，siRNA敲低技术，GTPase-Glo试剂盒 | NA | RNA | 来自未感染和6个月H. felis感染小鼠的免疫细胞。 |
| 17820 | 2024-08-07 |
A novel signature incorporating lipid metabolism- and immune-related genes to predict the prognosis and immune landscape in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1182434
PMID:37346073
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种新的基因签名，结合脂质代谢和免疫相关基因，用于预测肝细胞癌的预后和免疫景观 | 本研究首次将脂质代谢和免疫相关基因结合，形成新的预后基因签名，用于肝细胞癌的预后预测和免疫状态评估 | NA | 开发一种新的基因签名，用于评估肝细胞癌患者的预后和免疫状态 | 肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-SEQ) | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 使用GEO14520和ICGC-LIRI JP数据集进行外部验证 |