单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27707 篇文献，本页显示第 17801 - 17820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17801 | 2024-08-05 |
CXCL10 and CCL5 as feasible biomarkers for immunotherapy of homologous recombination deficient ovarian cancer
2023, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:37293164
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研究论文 | 本研究旨在识别可用于同源重组缺陷卵巢癌免疫治疗的生物标志物CXCL10和CCL5 | 本研究首次提出CXCL10和CCL5作为卵巢癌免疫治疗的生物标志物，且其效能优于PD-1 | 研究基于TCGA数据库，可能受到样本选择和数据可用性的限制 | 优化同源重组缺陷卵巢癌的免疫治疗 | 卵巢癌患者中表现出同源重组缺陷的肿瘤 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | Cox回归模型 | 转录组数据 | 来自TCGA数据库的卵巢癌队列中不同HRD评分的患者样本 |
| 17802 | 2024-08-05 |
A novel combination therapy of arginine deiminase and an arginase inhibitor targeting arginine metabolism in the tumor and immune microenvironment
2023, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:37293150
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研究论文 | 这项研究探讨了阿根廷酶抑制剂与阿根廷酶抑制剂联合治疗对肿瘤和免疫微环境的影响 | 研究提出了将L-诺伐林与ADI-PEG 20联合使用作为新的潜在癌症治疗方案 | 在免疫缺陷小鼠中L-诺伐林未能抑制肿瘤生长，可能影响结果的推广 | 研究旨在开发新的组合疗法，以增强抗肿瘤反应并激活免疫细胞 | 研究对象为ASS1缺乏的小鼠肿瘤细胞及其免疫微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA-seq | NA | NA | 使用了B16F10黑色素瘤细胞的动物模型进行研究 |
| 17803 | 2024-08-07 |
Focusing on scRNA-seq-Derived T Cell-Associated Genes to Identify Prognostic Signature and Immune Microenvironment Status in Low-Grade Glioma
2023, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/2023/3648946
PMID:37292257
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别了低级别胶质瘤中的T细胞相关基因，并构建了预测模型以评估免疫微环境状态和免疫治疗效果 | 结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别了低级别胶质瘤中的T细胞相关基因，并构建了预测模型以评估免疫微环境状态和免疫治疗效果 | NA | 研究低级别胶质瘤中T细胞的不同功能，并识别与临床结果相关的T细胞相关基因 | 低级别胶质瘤中的T细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 低级别胶质瘤 | scRNA-seq | ROC曲线 | RNA | 10个低级别胶质瘤样本的单细胞RNA测序数据和975个低级别胶质瘤样本的批量RNA数据 |
| 17804 | 2024-08-07 |
Identification of a novel signature based on macrophage-related marker genes to predict prognosis and immunotherapeutic effects in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1176572
PMID:37305578
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研究论文 | 本研究构建了一个基于肿瘤相关巨噬细胞标记基因的新型特征，用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗效果 | 本研究首次构建了一个基于肿瘤相关巨噬细胞标记基因的特征，用于评估肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | NA | 评估肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 从scRNA-seq数据集中获得了10个子群和165个肿瘤相关巨噬细胞相关标记基因 |
| 17805 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals heterogeneity of gastric cancer: progress and prospects
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1074268
PMID:37305583
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术在揭示胃癌异质性方面的进展和前景 | 单细胞转录组测序技术为理解胃癌的异质性提供了新的视角 | 文章中讨论了单细胞转录组测序技术的优势和局限性 | 探讨胃癌的异质性，以促进早期诊断、个体化治疗和预后评估 | 胃癌的细胞异质性、肿瘤微环境、癌变和转移以及药物反应 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 17806 | 2024-08-07 |
Epigenetic and Transcriptional Dynamics of Notch Program in Intestinal Differentiation
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3076-1_7
PMID:37310625
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综述 | 本文综述了Notch程序在肠道分化中的表观遗传和转录动态，并介绍了如何利用ChIP-seq和scRNA-seq结合谱系追踪技术来研究饮食和代谢调控下的细胞命运决策。 | 本文介绍了新的表观遗传和转录分析数据如何完善或修正当前对Notch编程在肠道分化中的理解。 | NA | 探讨Notch程序在肠道分化中的作用及其在饮食和代谢调控下的动态变化。 | Notch信号传导和肠道分化过程中的细胞命运决策。 | 表观遗传学 | NA | ChIP-seq, scRNA-seq | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA |
| 17807 | 2024-08-07 |
Defining Anorectal Transition Zone Heterogeneity Using Single-Cell RNA Sequencing
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3076-1_8
PMID:37310626
|
研究论文 | 本文提供了一种单细胞RNA测序方法，用于分析肛管、肛直肠过渡区和直肠上皮的初级分析 | 本文首次使用单细胞RNA测序技术详细表征了肛直肠过渡区的异质性 | NA | 研究肛直肠过渡区的异质性 | 肛管、肛直肠过渡区和直肠上皮 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 17808 | 2024-08-07 |
A fibroblast-associated signature predicts prognosis and immunotherapy in esophageal squamous cell cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1199040
PMID:37313409
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研究论文 | 本研究旨在探讨食管鳞状细胞癌（ESCC）中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的特征，并构建基于CAFs的风险标志物以预测ESCC患者的预后 | 本研究首次构建了基于CAFs的风险标志物，并开发了一个结合CAF风险标志物和临床阶段的诺模图模型，用于预测ESCC的预后 | NA | 探讨食管鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞的特征，并构建风险标志物以预测患者预后 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Lasso回归 | RNA序列数据 | 从GEO数据库获取的单细胞RNA测序数据和TCGA数据库的批量RNA-seq数据及微阵列数据 |
| 17809 | 2024-08-07 |
A novel phenotype of B cells associated with enhanced phagocytic capability and chemotactic function after ischemic stroke
2023-Nov, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/1673-5374.371365
PMID:37282471
|
研究论文 | 本研究识别了一种与缺血性中风后增强的吞噬能力和趋化功能相关的新型B细胞表型 | 发现了具有巨噬细胞样特性的B细胞，这些细胞表现出增强的吞噬和趋化功能，并上调了与吞噬作用相关的基因表达 | NA | 探讨B细胞在缺血性中风中的作用及其潜在的免疫治疗价值 | B细胞在缺血性中风中的表型及其功能 | NA | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 包括小鼠和人类创伤性脑损伤、阿尔茨海默病和胶质母细胞瘤的脑组织样本 |
| 17810 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics identifies perturbed molecular pathways in midbrain organoids using α-synuclein triplication Parkinson's disease patient-derived iPSCs
2023-Oct, Neuroscience research
IF:2.4Q3
DOI:10.1016/j.neures.2023.06.001
PMID:37271312
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学识别帕金森病患者来源的中脑器官中受扰动的分子通路 | 首次深入分析SNCA三重拷贝、揭示多巴胺神经元中氧化磷酸化、翻译和内质网蛋白折叠的分子功能障碍 | NA | 研究中脑多巴胺神经元在帕金森病中的变化及其分子机制 | 通过来自健康和帕金森病患者的诱导性多能干细胞生成的中脑器官 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自健康和帕金森病捐赠者的iPSC生成的中脑器官 |
| 17811 | 2024-08-07 |
Comprehensive analyses of brain cell communications based on multiple scRNA-seq and snRNA-seq datasets for revealing novel mechanism in neurodegenerative diseases
2023-10, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14280
PMID:37269061
|
研究论文 | 本研究基于多组scRNA-seq和snRNA-seq数据，系统分析了大脑细胞间的通信，揭示了神经退行性疾病中的新机制 | 本研究整合了四种方法评估六种主要脑细胞类型间的配体-受体相互作用得分，并构建了阿尔茨海默病早期预测模型 | NA | 探索大脑细胞通信，揭示正常脑功能和神经退行性疾病中的生物学机制 | 大脑细胞通信，特别是神经退行性疾病中的细胞通信 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | scRNA-seq, snRNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 共提取了1,039,459个细胞，来自28个脑单细胞RNA测序（scRNA-seq）或单核RNA测序（snRNA-seq）数据集，包括12个人类和16个老鼠数据集 |
| 17812 | 2024-08-07 |
Secondary bile acids function through the vitamin D receptor in myeloid progenitors to promote myelopoiesis
2023-09-12, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022009618
PMID:37276450
|
研究论文 | 本文研究了次级胆酸通过维生素D受体在骨髓中的髓系前体细胞促进髓系生成的作用 | 首次揭示了次级胆酸通过维生素D受体在骨髓髓系前体细胞中的作用，以及这种作用对骨髓造血和炎症疾病潜在影响的新机制 | NA | 探讨微生物代谢产物对造血作用的影响，特别是胆酸的作用及其机制 | 次级胆酸（脱氧胆酸和石胆酸）及其在骨髓髓系生成中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 骨髓细胞和造血干细胞及前体细胞 |
| 17813 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics provides insights into the origin and immune microenvironment of cervical precancerous lesions
2023-09, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12451
PMID:37272256
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17814 | 2024-08-07 |
Identification of evolutionary mechanisms of myelomatous effusion by single-cell RNA sequencing
2023-08-08, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022009477
PMID:37276129
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序分析了骨髓、外周血和胸腔积液/腹水中的转录组，以识别多发性骨髓瘤浆膜腔积液的进化机制 | 本研究首次定义了外周起始细胞（EMICs）并发现LILRB4在其中的上调，证实了LILRB4促进骨髓瘤细胞的体外迁移 | 研究样本量较小，仅涉及3名患者 | 探索多发性骨髓瘤浆膜腔积液的分子机制 | 骨髓、外周血和胸腔积液/腹水中的细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3名患者 |
| 17815 | 2024-08-05 |
Somatosensory neuron types and their neural networks as revealed via single-cell transcriptomics
2023-08, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2023.05.005
PMID:37268541
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在脊髓后根神经节（DRG）神经元类型及其神经网络研究中的应用 | 整合了以往DRG转录组研究的发现，并提出进一步研究的建议 | 缺乏统一的分类标准，使得DRG神经元的类型鉴定存在困难 | 旨在全面了解DRG神经元的转录状态及其在生理和慢性疼痛中的作用 | 主要研究脊髓后根神经节中的不同类型神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 17816 | 2024-08-07 |
Mapping the transcriptional landscape of human white and brown adipogenesis using single-nuclei RNA-seq
2023-08, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2023.101746
PMID:37286033
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研究论文 | 通过单核RNA测序技术研究人类白色和棕色脂肪细胞分化的转录组动态变化 | 首次使用单核RNA测序技术构建了人类白色和棕色脂肪细胞分化的高分辨率转录组图谱，并发现了新的转录因子TRPS1在脂肪细胞分化中的作用 | 研究仅限于单个个体的颈部区域细胞，可能无法完全代表所有人群 | 深入理解人类脂肪细胞分化的分子调控机制 | 人类白色和棕色脂肪细胞的分化过程 | 数字病理学 | 代谢疾病 | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA序列 | 超过20,000个正在分化的白色和棕色前脂肪细胞 |
| 17817 | 2024-08-05 |
Multimodal single-cell analysis of nonrandom heteroplasmy distribution in human retinal mitochondrial disease
2023-07-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165937
PMID:37289546
|
研究论文 | 本文研究了人类视网膜线粒体疾病中非随机的线粒体异质性分布现象 | 首次揭示了病态m.3243A>G等位基因在多种细胞类型中的分布模式及其对表型表现的影响 | 研究仅限于特定疾病（MELAS）和样本，可能无法普遍适用于所有线粒体疾病 | 探讨线粒体异质性在不同细胞类型中的分布及其与表型表达的关系 | 研究对象为视网膜细胞，包括来自MELAS患者和健康对照供体的细胞 | 数字病理学 | 线粒体疾病 | 单细胞RNA测序、线粒体单细胞ATAC测序及多模式单细胞测序 | NA | 细胞转录组、染色质可及性状态和异质性数据 | 涉及MELAS患者和健康对照供体的视网膜细胞 |
| 17818 | 2024-08-05 |
scDFC: A deep fusion clustering method for single-cell RNA-seq data
2023-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad216
PMID:37280190
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研究论文 | 提出了一种新的单细胞深度融合聚类模型用于分析单细胞RNA-seq数据 | 通过引入属性特征聚类模块和结构注意力特征聚类模块，综合利用细胞属性和结构信息 | 未提及具体的局限性 | 旨在通过深度聚类方法研究肿瘤异质性 | 单细胞RNA-seq数据的细胞亚群体和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肿瘤 | RNA-seq | 深度学习聚类 | 基因表达数据 | NA |
| 17819 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq unravels T cell-related prognostic risk model and tumor immune microenvironment modulation in triple-negative breast cancer
2023-07, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107066
PMID:37263064
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研究论文 | 这项研究揭示了三阴性乳腺癌中与T细胞相关的预后风险模型及肿瘤免疫微环境调节 | 首次整合分析单细胞RNA测序和大规模RNA测序，以建立和验证T细胞标记基因的预后风险模型 | 研究主要依赖公开数据库，可能存在数据偏差 | 加深对三阴性乳腺癌中T细胞异质性及其预后风险模型的理解 | 三阴性乳腺癌患者的T细胞及其与免疫微环境的关系 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 25,932个细胞 |
| 17820 | 2024-08-05 |
Cerebellar axonopathy in Shivers horses identified by spatial transcriptomic and proteomic analyses
2023 Jul-Aug, Journal of veterinary internal medicine
IF:2.1Q1
DOI:10.1111/jvim.16784
PMID:37288990
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和蛋白质组学分析识别出Shivers马的 cerebellar神经轴突病变 | 本研究揭示了Shivers马在侧小脑半球基因表达和蛋白质表达的区域特异性差异，强调了神经炎症与轴突退化的关系 | 研究样本量较小，仅包含5个Shivers马和4个对照马 | 分析Shivers马与对照马在基因和蛋白质表达上的差异 | Shivers马（5匹）与对照马（4匹） | 数字病理 | NA | 空间转录组学，串联质谱标记蛋白质组学 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 9匹马（5匹Shivers马，4匹对照马） |