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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1761 | 2026-06-14 |
Macrophage immunometabolism in stroke: a view from single-cell and nano technologies
2026-Jun-13, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08412-7
PMID:42286638
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review | 综述了单细胞与纳米技术视角下的卒中巨噬细胞免疫代谢研究进展,提出整合框架连接单细胞RNA-seq定义的巨噬细胞亚群、代谢通路与纳米干预策略 | 提出了将单细胞RNA-seq定义的巨噬细胞亚群与其代谢通路、可药物靶点及定制化纳米干预直接关联的整合框架,超越了传统M1/M2二分法 | 临床转化障碍有待解决,需要优先验证可作用靶点(如CCR2、PPARγ、Nrf2) | 阐明卒中后巨噬细胞的代谢重编程机制,探索精准免疫调节的纳米治疗策略 | 卒中后巨噬细胞亚群及其代谢状态 | machine learning | cardiovascular disease | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1762 | 2026-06-14 |
MICA/MICB-Mediated NKG2D Immune Escape in Cervical Cancer: Single-Cell Transcriptomic Mapping of Radionuclide Therapy Targets for Precision Radioimmunotherapy
2026-Jun-13, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1177/10849785261458459
PMID:42287067
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序与实验验证,系统描绘了宫颈癌中MICA/MICB介导的NKG2D免疫逃逸景观,并探讨其对精准放射性核素治疗靶点选择的转化意义 | 首次从单细胞转录组层面解析宫颈癌中NKG2D配体(MICA/MICB)下调与SUSD1上调协同抑制NKG2D介导的抗肿瘤免疫,并建立基于scRNA-seq的精准放射性核素治疗(RNT)分层策略,包括患者分层、放射标记抗MICA/MICB纳米抗体治疗诊断成像及联合放射免疫治疗方案 | 未明确提及,但从文中可推测样本量有限(仅两个scRNA-seq数据集及三种细胞系),且缺乏体内动物模型验证及临床试验数据支持 | 阐明宫颈癌中NKG2D配体失调的机制基础及其对放射性核素治疗靶向性的影响,为精准RNT靶点选择和患者分层提供依据 | 宫颈癌细胞系(HeLa、SiHa)及正常宫颈上皮细胞HCerEpiC,以及两个公共scRNA-seq数据集 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、实时定量PCR、酶联免疫吸附试验 | NA | 基因表达数据 | 两个scRNA-seq数据集(GSM1551311和GSM1551411);三种细胞系(HeLa、SiHa、HCerEpiC),每种细胞系5个独立生物重复 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1763 | 2026-06-14 |
Time-series single-cell transcriptomics reveals pervasive daily rhythmicity and nocturnal spermatogenesis in the zebrafish testis
2026-Jun-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aee7124
PMID:42284396
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研究论文 | 通过时间序列单细胞RNA测序构建成年斑马鱼睾丸时间图谱,揭示昼夜节律调控精子发生的细胞机制 | 首次证明脊椎动物睾丸具有普遍的细胞昼夜节律,发现夜间精子发生的偏好性,并鉴定出新的细胞类型标志物和睾丸亚型 | 仅使用斑马鱼模型,缺乏哺乳动物验证;未完全解析昼夜节律调控的具体分子机制 | 研究斑马鱼睾丸细胞的昼夜节律动态及其在精子发生中的作用 | 成年斑马鱼睾丸细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 时间序列单细胞RNA-seq样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 1764 | 2026-06-14 |
Correction to "Single-Cell RNA Sequencing Identified Novel Nr4a1+ Ear2+ Anti-Inflammatory Macrophage Phenotype under Myeloid-TLR4 Dependent Regulation in Anti-Glomerular Basement Membrane (GBM) Crescentic Glomerulonephritis (cGN)"
2026-Jun-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76055
PMID:42284512
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1765 | 2026-06-14 |
Φ-Space ST: A platform-agnostic method to identify cell states in spatial transcriptomics studies
2026-Jun-12, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101483
PMID:42285101
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研究论文 | 提出一种平台无关的方法Φ-Space ST,利用多个scRNA-seq参考识别空间转录组学数据中的连续细胞状态 | 开发了平台无关的方法,可同时处理超细胞和亚细胞分辨率数据,无需细胞分割即可注释细胞状态,并融合多个scRNA-seq参考的注释结果 | 文章未明确提及局限性 | 开发一种稳健且可扩展的空间转录组数据分析工具,用于理解复杂组织和病理 | 多种癌症组织(包括肿瘤和非肿瘤区域) | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 四个案例研究涵盖CosMx、Visium、Xenium和Stereo-seq平台 | NanoString, 10x Genomics, 华大基因 | 空间转录组学 | CosMx, Visium, Xenium, Stereo-seq | CosMx空间分子成像系统,10x Visium空间基因表达,10x Xenium原位分析,华大Stereo-seq |
| 1766 | 2026-06-14 |
SPP1+ macrophages facilitate the differentiation and maturation of regulatory T cells in tumour-draining lymph nodes of colorectal cancer
2026-Jun-12, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-337038
PMID:42285754
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示结直肠癌肿瘤引流淋巴结中SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴促进调节性T细胞分化和成熟的免疫抑制机制 | 首次阐明肿瘤浸润淋巴结中SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44-NF-κB1轴驱动CD137+调节性T细胞成熟,并验证LNP-siSPP1联合抗CD44单抗可协同抑制淋巴结转移 | 未说明 | 绘制结直肠癌肿瘤引流淋巴结的免疫微环境图谱,识别可靶向的免疫调节轴 | 来自7例结直肠癌患者的23对四联样本(原发肿瘤、癌旁正常组织、无肿瘤淋巴结和肿瘤浸润淋巴结) | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达定量数据 | 7例患者的23例四联样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 1767 | 2026-06-14 |
Corrigendum to "Single-cell RNA-seq reveals functionally distinct biomaterial degradation-related macrophage populations" [Biomaterials Oct:277 (2021) 121116]
2026-Jun-12, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1768 | 2026-06-14 |
Longitudinal profiling reveals immune dynamics and distinct plasma cell signatures during B-cell depletion in IgG4-related disease
2026-Jun-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2026.05.024
PMID:42285873
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研究论文 | 纵向分析揭示IgG4相关疾病中B细胞耗竭期间的免疫动态及独特的浆细胞特征 | 首次发现一种疾病特异性表达神经肽NMU且IGHV1-69高度偏斜的IgG4+浆细胞亚群,并揭示CD4+Tfh和双阴性T细胞在疾病复发和缓解中的动态变化 | 未提及明显局限性 | 通过纵向多组学分析,明确B细胞耗竭治疗期间IgG4相关疾病的免疫动态,识别致病细胞亚群和与复发相关的生物标志物 | 接受利妥昔单抗治疗的IgG4相关疾病患者 | 机器学习和计算生物学(主要涉及单细胞组学数据分析) | IgG4相关疾病 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq)、B细胞受体测序、血清蛋白质组学 | NA | 外周血样本、颌下腺和淋巴结组织样本 | 119份外周血样本(来自接受利妥昔单抗治疗的患者,覆盖活动期、缓解期和复发期) | NA | 单细胞转录组学、B细胞受体测序、血清蛋白质组学 | NA | NA |
| 1769 | 2026-06-14 |
Bidirectional integrin β1 activation synergizes neurovascular coupling and enhances bone regeneration
2026-Jun-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74071-3
PMID:42285943
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研究论文 | 开发了一种能同时递送肽和Talin1质粒的功能支架(PTPG),通过双向激活整合素β1协调神经血管耦合,促进大段骨缺损再生 | 提出通过'由外向内'和'由内向外'双向激活整合素β1的信号机制,协调血管生成、神经生成和骨生成的协同作用 | 未在论文标题和摘要中明确说明 | 促进神经血管化骨再生,解决大段骨缺损重建难题 | 大段骨缺损动物模型及内皮细胞、雪旺细胞 | 数字病理学 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未在论文标题和摘要中明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 1770 | 2026-06-14 |
Inflammation reprograms fibro-adipogenic progenitors to sustain immunopathogenic niches in myositis
2026-Jun-12, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08966-w
PMID:42285969
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研究论文 | 本研究揭示了炎症通过重编程纤维-脂肪祖细胞来维持肌炎中免疫致病微环境的新机制 | 首次发现组织驻留基质细胞(纤维-脂肪祖细胞)在特发性炎症性肌病中通过感知组织环境并形成炎性微环境,驱动促炎和促纤维化表型,其作用此前未被认识 | 研究主要基于转录组学分析,功能验证依赖体外实验,体内成像和因果关系的直接证据可能不足 | 探究特发性炎症性肌病中疾病活动持续存在的机制,寻找新的治疗靶点 | 特发性炎症性肌病患者(24例)和非疾病对照(6例)的骨骼肌组织 | 数字病理学 | 肌炎 | 单细胞核RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 24例IIM患者和6例非疾病对照的骨骼肌样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞核3'测序,10x Visium空间转录组学 |
| 1771 | 2026-06-14 |
CD49a+ NK cells promote M2 polarization and are associated with poor pathological response in NSCLC
2026-Jun-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-57649-1
PMID:42286110
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研究论文 | 本研究鉴定出CD49a+组织驻留NK细胞亚群,并揭示其通过驱动M2巨噬细胞极化促进非小细胞肺癌免疫抑制微环境的机制 | 首次鉴定CD49a+ NK细胞作为非小细胞肺癌中的组织驻留亚群,发现其通过CSF-1表达驱动M2巨噬细胞极化并与不良病理反应相关 | 研究主要基于手术标本,未涉及其他样本类型;机制研究尚未深入阐明CD49a+ NK细胞调控M2极化的具体信号通路 | 分析非小细胞肺癌肿瘤微环境中NK细胞的异质性,鉴定组织驻留亚群及其临床相关性 | 非小细胞肺癌手术标本中的NK细胞亚群 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于单细胞转录组分析 |
| 1772 | 2026-06-14 |
Developing WNT-derived bone anabolic peptides for skeletal aging and fracture by reconstructing thumb and index domains of WNT7B
2026-Jun-12, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-026-01695-7
PMID:42286253
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研究论文 | 通过重建WNT7B的拇指和索引结构域,开发出WNT来源的骨合成肽,用于治疗骨骼老化和骨折 | 利用AlphaFold增强的序列预测和计算机对接筛选,首次识别WNT7B的重组结构域作为骨合成肽,并通过非经典Ca-NFAT通路独立于致癌的经典Wnt/β-catenin信号发挥作用 | 未提及具体局限性 | 开发WNT来源的骨合成肽以治疗骨骼老化和促进骨折愈合 | WNT7B肽对老龄小鼠和猪骨质疏松模型的治疗效果,以及其促进间充质干细胞功能和骨再生的机制 | 机器学习 | 骨骼老化,骨质疏松 | AlphaFold序列预测,计算机对接筛选,单细胞测序,转基因谱系追踪,生化分析 | AlphaFold | 序列数据,单细胞测序数据,图像(用于骨再生评估) | 老龄小鼠和猪骨质疏松模型,临界尺寸骨缺损模型,涉及多种组织样本和细胞(间充质干细胞) | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1773 | 2026-06-14 |
Fibronectin 1 mediates pressure-induced aggressive phenotypes in colorectal cancer cells and cancer stem cells
2026-Jun-12, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04381-5
PMID:42286651
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研究论文 | 本研究揭示纤维连接蛋白1在结直肠癌细胞中介导压力诱导的侵袭性表型及癌症干细胞作用 | 首次阐明机械压力与纤维连接蛋白1在结直肠癌进展中的协同作用机制 | 研究主要基于体外模型,缺乏体内实验验证;样本量较小(n=19) | 评估纤维连接蛋白1在结直肠癌中的预后作用及其与机械压力的相互作用 | 结直肠癌细胞及癌症干细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 19对结直肠癌组织及癌旁正常组织;单细胞RNA测序数据(GSE302903) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1774 | 2026-06-14 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune-peritubular myoid cell crosstalk driving testicular interstitial fibrosis in idiopathic non-obstructive azoospermia
2026-Jun-12, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-026-01600-4
PMID:42286720
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示特发性非梗阻性无精子症中免疫-管周肌样细胞交互驱动睾丸间质纤维化的机制 | 首次识别管周肌样细胞为睾丸间质纤维化的主要贡献者,发现巨噬细胞来源的PDGF信号促进纤维化,并鉴定瑞戈非尼为潜在治疗药物 | 研究主要基于计算分析和有限样本验证,需进一步在更大队列和动物模型中验证机制及治疗效果 | 探究特发性非梗阻性无精子症的发病机制,特别是睾丸间质纤维化的细胞和分子机制 | 特发性非梗阻性无精子症患者和健康对照者的睾丸组织样本 | 数字病理学, 机器学习 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, H&E染色, Masson三色染色, 多重免疫荧光, 网络药理学, 分子对接 | 细胞间通信分析模型 | 单细胞转录组数据, 组织图像 | 特发性非梗阻性无精子症患者和健康对照者的睾丸组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1775 | 2026-06-14 |
Brillouin microscopy for contact- and label-free quantification of tissue stiffness in lung fibrosis
2026-Jun-12, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1093/ajrcmb/aanag114
PMID:42286788
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研究论文 | 利用布里渊显微镜对肺纤维化组织硬度进行无标记、无接触的定量评估 | 首次证明布里渊显微镜可对肺纤维化组织进行定量空间硬度测量,并整合到常规研究流程中 | 该研究为概念验证性研究,且仅限于冷冻切片的离体测量,未涉及活体组织检测 | 评估布里渊显微镜在肺纤维化组织硬度定量表征中的可行性,为机械生物学研究提供新工具 | 小鼠肺组织冷冻切片(含纤维化及对照组)和人类纤维化肺组织切片 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 布里渊显微镜 | NA | 图像 | 未在标题和摘要中明确说明样本数量 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、布里渊显微镜 | NA | 自制布里渊显微镜系统,已用水凝胶刚度标准进行校准 |
| 1776 | 2026-06-14 |
Unraveling the HGF/MET axis in Mallory-Denk body pathogenesis associated with liver fibrosis through single-cell transcriptomics
2026-Jun-11, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02722-4
PMID:42270593
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研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示Mallory-Denk小体(MDB)发病机制中HGF/MET轴的作用及其与肝纤维化的关系 | 首次通过单核RNA测序(snRNA-seq)识别出与MDB相关的肝细胞亚群(MAHs)及肝星状细胞亚群(aHSCs),并揭示HGF/MET/Ubd轴在MDB形成和肝纤维化中的正反馈调控机制 | 主要基于动物模型和体外类器官实验,人类样本验证规模有限 | 探究肝内细胞间交互驱动MDB发病机制及肝纤维化进展的分子途径 | 小鼠肝纤维化模型、MDB类器官培养样本、含MDB的人肝活检组织 | 数字病理学 | 肝纤维化、肝细胞癌 | 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(含Ubd基因敲除鼠)及人类肝活检样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单核RNA测序(snRNA-seq) |
| 1777 | 2026-06-14 |
ScRNA-seq Data Reveal Gene Upregulation and Downregulation in Oxygen-Induced Retinopathy
2026-Jun-11, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research
IF:2.2Q3
DOI:10.12659/MSM.951911
PMID:42272073
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据分析氧气诱导的视网膜病变中的基因上调和下调 | 首次利用单细胞RNA测序数据全面解析氧气诱导视网膜病变中的关键基因表达变化,并鉴定了多个潜在靶基因如Hnrnpu、Vamp2等 | 研究基于小鼠模型,结果需在人类样本中验证;数据来源单一(GSE150703),可能缺乏普适性 | 探索早产儿视网膜病变中氧气诱导视网膜病变的靶基因 | 小鼠视网膜组织细胞 | 数字病理学 | 早产儿视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 来自GSE150703数据集的视网膜组织样本 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 1778 | 2026-06-14 |
Causal effect estimation from trans-regulatory single-cell CRISPR screens
2026-Jun-10, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2026.101251
PMID:42269591
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评论 | 介绍从反式调控单细胞CRISPR筛选实验中估计因果效应的关键概念和原则 | 系统解析了在单细胞CRISPR研究中将统计关联解释为因果效应所需的核心假设,并通过实例展示假设违背如何导致偏差 | 未提出新的统计方法或验证框架,仅对现有方法进行因果假设层面的综述性分析 | 阐明在反式调控单细胞CRISPR研究中实现因果效应估计的统计原则与假设条件 | 单细胞CRISPR筛选实验中的基因扰动与表达数据的因果关联 | 机器学习 | NA | CRISPR, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1779 | 2026-06-14 |
circVDJ-seq for T cell clonotype detection in single-cell and spatial multi-omics
2026-Jun-10, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-026-01691-1
PMID:42271498
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研究论文 | 介绍circVDJ-seq技术,用于在单细胞和空间多组学中简化且经济高效地检测T细胞受体库 | 提出一种无需专用测序设备的简化TCR检测方法,适用于多种3'端定向工作流程(如单细胞RNA-seq、ATAC+RNA多组学和空间转录组学) | 未在摘要中明确说明研究局限性 | 开发一种简化且经济高效的T细胞受体(TCR)分析方法,以克服现有VDJ信息获取的资源密集型或设备专用限制 | 新鲜切除的神经母细胞瘤标本以及受肺炎或COVID-19影响的尸检淋巴结组织 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤, 肺炎, COVID-19 | circVDJ-seq | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, ATAC+RNA多组学数据 | 新鲜切除的神经母细胞瘤标本和受肺炎或COVID-19影响的尸检淋巴结(具体样本数量未在摘要中提供) | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC+RNA多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1780 | 2026-06-14 |
A Systemic Immune State Axis Distinguishes Psoriatic Arthritis from Psoriasis
2026-Jun-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27115121
PMID:42278644
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研究论文 | 通过分析多项公开数据集,定义了区分银屑病关节炎与银屑病的系统性免疫状态轴 | 首次定义了一个与银屑病关节炎相关的系统性免疫状态坐标(CRS),该坐标独立于皮肤炎症反应轴(DIR),并在多种数据层面验证其区分能力 | 研究依赖公开数据集,可能受限于样本异质性和数据整合的批次效应;主要关注未治疗患者,治疗影响未充分探讨 | 揭示区分银屑病与银屑病关节炎的系统性免疫状态特征 | 银屑病患者、银屑病关节炎患者及健康对照者 | 机器学习 | 银屑病、银屑病关节炎 | 全血甲基化测序、单细胞RNA测序、RNA测序、甲基化测序 | NA | 甲基化数据、单细胞转录组数据、转录组数据 | 跨四个核心公开数据集,涉及全血甲基化、PBMC单细胞RNA测序(受试者层面汇总)、皮肤RNA测序和纯化CD4 T细胞甲基化,外加两个外部皮肤队列 | NA | 单细胞RNA测序、全血甲基化测序、RNA测序 | NA | NA |