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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1761 - 1780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1761 | 2025-10-05 |
Principles of synaptogenesis: Insights from Caenorhabditiselegans
2025-Aug, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2025.103056
PMID:40483740
|
综述 | 基于秀丽隐杆线虫模型阐述突触发生的原理、组织与精细化调控机制 | 整合基因编辑、显微成像、单细胞转录组与计算分析等前沿技术解析突触发育机制 | NA | 揭示突触组装、精细化与重塑的遗传基础与调控机制 | 秀丽隐杆线虫神经系统 | 神经科学 | NA | 基因编辑, 显微成像, 单细胞转录组分析, 计算分析 | NA | 基因表达数据, 显微图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1762 | 2025-10-05 |
Molecular characterization and functional prioritization of CD46, IL6R, KLRC1, LEAP2 and SMOX as candidate targets in acute kidney injury
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146096
PMID:40683494
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研究论文 | 通过多组学整合框架鉴定并验证急性肾损伤的候选治疗靶点 | 建立遗传信息指导的多组学整合框架，系统筛选具有治疗潜力的候选靶点，并结合计算药物重定位和实验验证 | NA | 识别和验证急性肾损伤的潜在治疗靶点 | CD46、IL6R、KLRC1、LEAP2和SMOX基因及其编码蛋白 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | 多组学整合分析、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、计算机药物重定位 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1763 | 2025-10-05 |
Computational methods for alternative polyadenylation and splicing in post-transcriptional gene regulation
2025-Aug, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01496-z
PMID:40804481
|
综述 | 全面概述选择性多聚腺苷酸化和选择性剪接的计算分析方法及其在转录后基因调控中的作用 | 系统总结了单细胞RNA测序专用的APA和AS分析技术，提供了从群体到单细胞水平的基因调控新见解 | 作为综述文章，主要总结现有方法而非提出新算法，依赖已有文献的覆盖范围 | 探讨选择性多聚腺苷酸化和选择性剪接在转录后基因调控中的计算分析方法 | 基因转录本和调控机制 | 生物信息学 | NA | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1764 | 2025-10-05 |
Clonal hematopoiesis is clonally unrelated to multiple myeloma and is associated with specific microenvironmental changes
2025-Jul-31, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026236
PMID:40112284
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研究论文 | 本研究探讨了克隆造血与多发性骨髓瘤的克隆无关性及其对肿瘤微环境的特定影响 | 首次证明CHIP与MM克隆起源无关，并通过单细胞RNA测序揭示了CHIP阳性微环境的特异性改变 | 样本量有限（16例单细胞RNA测序），血红蛋白差异趋势未达统计学显著性 | 研究克隆造血在多发性骨髓瘤肿瘤微环境中的作用机制 | 106例多发性骨髓瘤患者（其中16例进行单细胞RNA测序） | 单细胞基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 106例患者（16例进行单细胞RNA测序） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1765 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis unveils immune dysregulation and EBV-driven lymphoproliferative disorder in pediatric liver transplant recipients
2025-Jul, Human immunology
IF:3.1Q3
DOI:10.1016/j.humimm.2025.111309
PMID:40263002
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小儿肝移植受者中EB病毒驱动的淋巴增殖性疾病的免疫失调机制 | 首次在单细胞水平系统描绘PTLD患者的免疫微环境特征，揭示EBV感染特异性靶向记忆B细胞和浆细胞的机制 | 样本量有限，未涉及组织样本分析，未能验证功能性恢复策略 | 阐明小儿肝移植后EBV相关淋巴增殖性疾病的免疫病理机制 | 小儿肝移植受者外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 淋巴增殖性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 四组人群：EBV阳性PTLD患者、EBV阳性非PTLD移植受者、EBV阴性移植受者、健康儿童 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1766 | 2025-10-05 |
Astragalus polysaccharide reduces the severity of acute pancreatitis under a high-fat diet through enriching L. reuteri and propionate
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140021
PMID:39837455
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研究论文 | 本研究探讨黄芪多糖通过富集罗伊氏乳杆菌和丙酸盐减轻高脂饮食下急性胰腺炎严重程度的机制 | 首次揭示黄芪多糖通过调节肠道菌群-胰腺轴缓解急性胰腺炎的具体机制，发现罗伊氏乳杆菌和丙酸盐的协同保护作用 | 研究局限于小鼠模型，尚未在人体验证；具体信号通路细节需进一步探索 | 研究黄芪多糖对高脂饮食诱导的急性胰腺炎的保护作用及其机制 | 高脂饮食诱导的急性胰腺炎小鼠模型 | 消化系统疾病研究 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，微生物组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1767 | 2025-10-05 |
Genome-wide prediction of dominant and recessive neurodevelopmental disorder-associated genes
2025-Mar-06, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.02.001
PMID:40015282
|
研究论文 | 提出一种利用机器学习加速神经发育障碍风险基因识别的计算方法 | 首次证明仅使用单细胞RNA测序数据训练的模型能稳健预测NDD风险基因，并发现单等位基因和双等位基因遗传模式在发育中人皮层中的表达差异 | 未明确说明样本规模和具体数据来源的局限性 | 加速神经发育障碍风险基因的发现和识别 | 自闭症谱系障碍、发育性和癫痫性脑病、发育迟缓相关的风险基因 | 机器学习 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序, 机器学习 | 半监督机器学习框架(mantis-ml) | 基因表达数据, 蛋白互作数据, 遗传耐受度指标 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1768 | 2025-10-05 |
A survey of biclustering and clustering methods in clustering different types of single-cell RNA sequencing data
2025-Jan-15, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elaf010
PMID:40795763
|
综述 | 本文系统综述了双聚类和聚类方法在不同类型单细胞RNA测序数据分析中的应用与性能比较 | 首次系统评估5种双聚类和21种聚类方法在10个真实scRNA-seq数据集上的性能，并从六个维度量化数据集特性以推荐最适合的方法 | 仅评估了有限数量的方法（5种双聚类和21种聚类），且仅使用10个公开数据集，可能无法覆盖所有场景 | 评估当前无监督方法在单细胞RNA测序数据分析中的发展现状，总结各方法的优缺点和改进策略 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 双聚类方法, 聚类方法 | 基因表达数据 | 10个公开真实数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1769 | 2025-10-05 |
A framework to mine laser microdissection-based omics data and uncover regulators of pancreatic cancer heterogeneity
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf101
PMID:40910795
|
研究论文 | 开发并验证了一种基于激光显微切割的空间分辨RNA测序框架，用于挖掘胰腺癌异质性调控机制 | 提出优化的LMD-seq框架，在检测低表达基因方面优于单细胞RNA-seq方法，并首次绘制了PDAC形态生物型的调控网络图谱 | NA | 揭示胰腺导管腺癌肿瘤内异质性的分子机制和关键调控因子 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤组织 | 生物信息学 | 胰腺癌 | RNA测序(RNA-seq), 激光显微切割(LMD) | NA | 空间分辨转录组数据 | NA | NA | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 激光显微切割测序(LMD-seq) |
| 1770 | 2025-10-05 |
Discovery of Multiple Effects of Reactive Oxygen Species on Lung Adenocarcinoma at the Single-cell and Bulk Tissue Levels
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究在单细胞和批量组织水平上探讨了活性氧对肺腺癌的影响机制 | 首次在单细胞和批量组织水平系统分析ROS对LUAD的多重影响，并开发了ROS相关基因特征 | 未明确说明样本来源和具体样本量 | 探究ROS在肺腺癌发展和治疗中的作用机制 | 肺腺癌组织和细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，批量转录组测序 | LASSO回归，逐步多元回归 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1771 | 2025-10-05 |
Enhancing Single-Cell RNA-Seq Data Completeness With a Graph Learning Framework
2025 Jan-Feb, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3492384
PMID:39504287
|
研究论文 | 提出基于变分图自编码器的单细胞RNA测序数据插补方法VAImpute，用于检测和填补dropout事件 | 利用细胞/基因间的copula相关性构建图网络，通过变分图自编码器学习数据固有分布来预测dropout事件 | NA | 提高单细胞RNA测序数据的完整性，减少dropout事件的影响 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分图自编码器 | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1772 | 2025-10-05 |
RORα-activated mitophagy attenuating hypoxic-ischemic encephalopathy via suppression of microglial cGAS-STING axis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1592737
PMID:40799648
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研究论文 | 本研究揭示RORα通过激活线粒体自噬抑制小胶质细胞cGAS-STING轴，从而减轻缺氧缺血性脑病的神经炎症 | 首次发现RORα通过调控线粒体自噬抑制mtDNA-cGAS-STING-NLRP3信号通路的新机制 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究RORα在缺氧缺血性脑病中调控小胶质细胞神经炎症的分子机制 | HIE大鼠模型和体外培养的小胶质细胞 | 神经科学 | 缺氧缺血性脑病 | 单细胞RNA测序, WGCNA, LASSO回归, RT-qPCR, Western Blot, ELISA | 动物疾病模型, 细胞模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 行为学数据 | HIE大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1773 | 2025-10-05 |
Model-based dimensionality reduction for single-cell RNA-seq using generalized bilinear models
2024-Dec-31, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxaf024
PMID:40795862
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研究论文 | 开发了一种基于广义双线性模型的单细胞RNA测序数据降维新方法scGBM | 提出使用泊松双线性模型直接建模计数数据，并引入快速估计算法实现百万级细胞数据集的扩展，同时量化细胞潜在位置的不确定性 | 未明确说明在特定生物场景下的适用性限制 | 解决单细胞RNA测序数据降维中标准方法可能诱导虚假异质性和掩盖真实生物变异性的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 广义双线性模型, 泊松双线性模型 | 基因表达计数矩阵 | 百万级细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1774 | 2025-10-05 |
Impaired innate and adaptive immune responses to BNT162b2 SARS-CoV-2 vaccination in systemic lupus erythematosus
2024-03-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176556
PMID:38456511
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研究论文 | 系统性红斑狼疮患者对BNT162b2 SARS-CoV-2疫苗的先天性和适应性免疫应答受损 | 首次全面分析SLE患者接种mRNA疫苗后的先天与适应性免疫应答缺陷，并通过单细胞RNA测序发现疫苗诱导单核细胞群减少 | 样本量较小（19例SLE患者），未评估不同免疫抑制方案的具体影响 | 评估自身免疫疾病患者对SARS-CoV-2疫苗的免疫应答特性 | 19例系统性红斑狼疮患者与56例健康对照志愿者 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序，中和抗体检测，T细胞应答分析 | NA | 基因表达数据，免疫细胞计数数据 | 19例SLE患者，56例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1775 | 2025-10-05 |
A mouse model of Zhu-Tokita-Takenouchi-Kim syndrome reveals indispensable SON functions in organ development and hematopoiesis
2024-03-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.175053
PMID:38290089
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研究论文 | 本研究通过建立Son单倍体不足小鼠模型，揭示了SON基因在器官发育和造血过程中的关键作用 | 首次建立ZTTK综合征的小鼠模型，并系统阐明SON单倍体不足对多器官发育和造血谱系分化的影响机制 | 动物模型与人类疾病存在物种差异，部分病理机制仍需进一步验证 | 探究SON基因在器官发育和造血过程中的功能及其与ZTTK综合征的关联 | Son单倍体不足小鼠模型 | 发育生物学 | ZTTK综合征 | 单细胞转录组测序，表面标志物分析 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据，表型数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1776 | 2025-10-05 |
Comparative Methods for Demystifying Spatial Transcriptomics
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3838-5_17
PMID:38819570
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研究论文 | 本文比较分析了空间转录组学数据分析方法，重点关注10x Visium平台的分析流程 | 系统分解空间转录组学分析流程为四个关键步骤，并比较不同spot选择和基因组/转录组参考对分析结果的影响 | 仅聚焦于制造商提供的软件套件，未涵盖其他分析工具 | 阐明空间转录组学数据分析方法及其影响因素 | 空间转录组学数据分析流程 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，RNA测序 | NA | 基因表达数据，显微镜图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 1777 | 2025-10-05 |
A mouse model of ZTTK syndrome reveals indispensable SON functions in organ development and hematopoiesis
2023-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.19.567732
PMID:38014320
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研究论文 | 本研究通过建立ZTTK综合征小鼠模型，揭示了SON基因在器官发育和造血过程中的关键作用 | 首次建立SON单倍体不足小鼠模型，成功模拟人类ZTTK综合征症状，并通过单细胞转录组分析揭示了造血发育异常机制 | 未明确说明样本量大小，且为动物模型研究，结果向人类临床转化的有效性需要进一步验证 | 研究SON基因在器官发育和造血过程中的功能，探索ZTTK综合征的发病机制 | SON单倍体不足小鼠模型及其造血干细胞和祖细胞 | 发育生物学 | ZTTK综合征 | 单细胞转录组测序，表面标志物分析 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据，表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1778 | 2025-10-05 |
An analysis of classical multidimensional scaling with applications to clustering
2023-Mar, Information and inference : a journal of the IMA
DOI:10.1093/imaiai/iaac004
PMID:36761434
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研究论文 | 本文分析了经典多维标度法的理论性能，并应用于噪声数据聚类 | 建立了分析经典多维标度法嵌入样本质量的理论框架，提出了信噪比缩放条件 | NA | 分析经典多维标度法的统计性能，为下游统计分析奠定基础 | 经典多维标度法及其在聚类分析中的应用 | 机器学习 | 癌症 | 多维标度法，距离聚类算法 | 经典多维标度法 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据，自然语言数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1779 | 2025-10-05 |
Examining heterogeneity of stromal cells in tumor microenvironment based on pan-cancer single-cell RNA sequencing data
2021-Aug-17, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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综述 | 基于泛癌单细胞RNA测序数据研究肿瘤微环境中基质细胞的异质性 | 通过整合多种癌症类型的单细胞RNA测序数据，发现内皮细胞和成纤维细胞/肌成纤维细胞在不同癌症中可划分为共同亚型，且亚型组成与癌症特征和疗法响应相关 | NA | 研究肿瘤微环境中基质细胞的异质性 | 多种癌症类型的单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1780 | 2025-10-05 |
Hypoxic microenvironment induced spatial transcriptome changes in pancreatic cancer
2021-Jun-04, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
|
研究论文 | 本研究首次描述了胰腺癌中缺氧微环境诱导的空间转录组变化，并识别了潜在治疗靶点 | 首次利用空间转录组技术揭示胰腺癌缺氧微环境的空间异质性特征 | 研究基于小鼠移植瘤模型，临床相关性需进一步验证 | 探究胰腺癌缺氧微环境的空间转录组特征及其临床意义 | 人胰腺导管腺癌（PDAC）在小鼠缺血后肢中的移植瘤 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠移植瘤模型（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |