单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28751 篇文献，本页显示第 17741 - 17760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17741 | 2024-08-07 |
Characterization of tumour microenvironment reprogramming reveals invasion in epithelial ovarian carcinoma
2023-Oct-10, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-023-01270-7
PMID:37817210
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据探讨了肿瘤微环境重编程与上皮性卵巢癌侵袭之间的关系 | 发现了缺氧、氧化磷酸化和糖酵解在细胞间质上皮转化过程中的生物活性轨迹，并确定了HMGA1、EGR1和RUNX1作为上皮性卵巢癌中EMT过程的关键驱动因子 | NA | 揭示上皮性卵巢癌中肿瘤侵袭和肿瘤微环境重编程的分子机制及生物标志物 | 上皮性卵巢癌的肿瘤细胞侵袭及其分子机制 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 17742 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a peripheral landscape of immune cells in Schistosomiasis japonica
2023-Oct-10, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-023-05975-y
PMID:37817226
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了日本血吸虫病感染者外周血单个核细胞的免疫景观 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了日本血吸虫病患者外周免疫细胞的转录图谱 | 样本量较小，且仅基于外周血单个核细胞进行分析 | 深入理解血吸虫病中的免疫机制 | 日本血吸虫病感染者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康对照组4例，慢性血吸虫病组4例，晚期血吸虫病组2例 |
| 17743 | 2024-08-05 |
scIBD: a self-supervised iterative-optimizing model for boosting the detection of heterotypic doublets in single-cell chromatin accessibility data
2023-10-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03072-y
PMID:37814314
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研究论文 | 提出了一种自监督迭代优化模型scIBD，用于提高单细胞染色质可及性数据中异质双重体的检测 | scIBD引入了一种自适应策略，以模拟高可信度的异质双重体并进行自我监督 | 对特定于检测的挑战以及多重测定的影响未进行详细讨论 | 提高单细胞染色质可及性数据中异质双重体的检测准确性 | 单细胞染色质可及性 sequencing (scCAS) 数据中的异质双重体 | 数字病理学 | NA | 微流控技术 | 自监督迭代优化模型 | 数据集（模拟和真实） | 多种模拟和真实数据集 |
| 17744 | 2024-08-05 |
Pan-Cancer Analysis of Patient Tumor Single-Cell Transcriptomes Identifies Promising Selective and Safe Chimeric Antigen Receptor Targets in Head and Neck Cancer
2023-Oct-08, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15194885
PMID:37835579
|
研究论文 | 该文章分析了患者肿瘤单细胞转录组数据，以识别头颈癌中有前景的选择性和安全的嵌合抗原受体靶点 | 发现了二十个新的嵌合抗原受体靶点，其中五个具有优越的选择性和安全性分数 | 在几乎所有癌种中，未能找到比当前靶点更好的选择，显示当前靶点空间近乎最佳 | 寻找适合肿瘤免疫治疗的新型嵌合抗原受体靶点 | 患者肿瘤单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 17745 | 2024-08-07 |
Integrated Analyses of Single-Cell Transcriptome and Mendelian Randomization Reveal the Protective Role of Resistin in Sepsis Survival in Intensive Care Unit
2023-Oct-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241914982
PMID:37834432
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和孟德尔随机化分析，探讨了在重症监护室（ICU）中抵抗素对脓毒症患者生存的保护作用 | 本研究首次通过孟德尔随机化分析探讨了抵抗素在脓毒症中的保护作用，并利用meQTL分析确定了影响脓毒症的CpG位点 | NA | 探索脓毒症中细胞类型特异性差异表达基因（DEGs），并研究抵抗素在脓毒症患者生存中的作用 | 脓毒症患者和健康对照的单细胞及批量转录组数据 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞转录组分析，孟德尔随机化分析，meQTL分析 | NA | 转录组数据 | 560个细胞类型特异性差异表达基因 |
| 17746 | 2024-08-07 |
A SARS-CoV-2 related signature that explores the tumor microenvironment and predicts immunotherapy response in esophageal squamous cell cancer
2023-10-06, Aging
DOI:10.18632/aging.205090
PMID:37812215
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研究论文 | 本研究探讨了SARS-CoV-2相关基因在食管鳞状细胞癌中的特征及其对免疫治疗反应的预测作用 | 首次研究了SARS-CoV-2相关基因在食管鳞状细胞癌中的作用，并开发了一种基于这些基因的风险签名，用于预测免疫治疗反应 | NA | 研究SARS-CoV-2相关基因在食管鳞状细胞癌中的特征及其对免疫治疗反应的影响 | 食管鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 食管癌 | scRNA-seq | Lasso回归 | RNA-seq数据 | NA |
| 17747 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomic Analysis Reveals Regional Transcript Changes in Early and Late Stages of rd1 Model Mice with Retinitis Pigmentosa
2023-Oct-03, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241914869
PMID:37834317
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研究论文 | 使用空间转录组学分析rd1小鼠不同年龄视网膜层的变化 | 首次揭示了视网膜色素变性在早期和晚期阶段的区域转录变化 | 未明确涵盖临床治疗方法 | 研究视网膜色素变性病理机制的时间变化 | rd1小鼠 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | rd1小鼠和对照组 |
| 17748 | 2024-08-05 |
Spatial Heterogeneity of Integrins and Their Ligands in Primary Breast Tumors
2023-10, Discovery medicine
IF:2.0Q3
DOI:10.24976/Discov.Med.202335178.86
PMID:37811629
|
研究论文 | 本文研究了原发性乳腺肿瘤中整合素及其配体的形态学和空间异质性 | 该研究揭示了乳腺癌中整合素-配体表达簇的空间异质性及其对肿瘤功能异质性的重大影响 | 研究主要集中在乳腺癌的特定样本上，结果可能不适用于其他类型的癌症 | 研究原发性乳腺肿瘤中整合素及其配体的表达特征与空间异质性 | 原发性乳腺肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，10X Visium方法 | NICHES算法 | 组织样本 | 5个样本的21个簇，包含多种功能整合素-配体对 |
| 17749 | 2024-08-05 |
ESICCC as a systematic computational framework for evaluation, selection, and integration of cell-cell communication inference methods
2023-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278001.123
PMID:37827697
|
研究论文 | 本文开发了一个名为ESICCC的系统基准框架，用于评估和比较细胞间通信推断方法的性能 | 创新点在于系统性地比较了18种配体-受体推断方法和5种配体/受体-靶标推断方法 | 尚未提及分析结果的长期生物学影响 | 旨在填补细胞间通信推断方法比较的空白 | 对116个数据集的细胞间通信推断方法进行评估与比较 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学(ST) | NA | 数据集 | 116个数据集，包括15个ST数据集、15个细胞系扰动数据集、2个细胞类型特异性表达/蛋白质组学数据集和84个采样或未采样的scRNA-seq数据集 |
| 17750 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of bronchoscopy specimens: development of a rapid minimal handling protocol
2023-10, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.2144/btn-2023-0017
PMID:37815826
|
research paper | 本文开发了一种快速且最小化处理的协议，用于从支气管刷取样品中制备单细胞悬浮液，以便进行单细胞RNA测序。 | 本文提出了一种新的、侵入性较小的支气管刷取样方法，用于单细胞RNA测序，以减少传统方法的风险和限制。 | 目前主要限制是使用侵入性方法（如气道活检、手术切除）进行单细胞RNA测序研究，这些方法存在固有风险。 | 开发一种快速且最小化处理的协议，用于从支气管刷取样品中制备单细胞悬浮液，以便进行单细胞RNA测序。 | 支气管刷取样品中的单细胞悬浮液。 | digital pathology | airway diseases | scRNA-seq | NA | RNA | NA |
| 17751 | 2024-08-07 |
Dissection of key factors correlating with H5N1 avian influenza virus driven inflammatory lung injury of chicken identified by single-cell analysis
2023-10, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011685
PMID:37819993
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，研究了H5N1和H9N2禽流感病毒感染鸡肺组织后的转录组变化，揭示了不同病毒株引起的炎症反应差异及其潜在机制 | 首次系统性地分析了H5N1和H9N2禽流感病毒感染鸡肺组织后16种细胞类型（19个集群）的转录组，并开发了这些细胞类型的标记基因目录 | NA | 揭示禽流感病毒感染鸡肺组织后的免疫反应机制 | 鸡肺组织中的16种细胞类型 | 数字病理学 | 禽流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | H5N1和H9N2禽流感病毒感染的鸡肺组织样本 |
| 17752 | 2024-08-07 |
Transcriptional Regulation of Airway Epithelial Cell Differentiation: Insights into the Notch Pathway and Beyond
2023-Sep-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241914789
PMID:37834236
|
综述 | 本文综述了气道上皮细胞分化的转录调控机制，特别关注了Notch信号通路及其相关因素 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了气道上皮细胞的组成，包括一些特殊和罕见的细胞类型 | NA | 探讨气道上皮细胞分化的机制，为呼吸系统疾病的治疗提供靶向疗法 | 气道上皮细胞的分化过程及其在呼吸系统疾病中的作用 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 17753 | 2024-08-07 |
SLAM Modification as an Immune-Modulatory Therapeutic Approach in Cancer
2023-Sep-29, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15194808
PMID:37835502
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综述 | 本文综述了信号淋巴细胞激活分子（SLAM）家族在肿瘤环境中调节免疫反应的关键作用，并探讨了基于SLAM的免疫调节治疗在癌症治疗中的潜力 | 文章提出了基于SLAM家族的精确靶向治疗方法，利用单细胞RNA测序和高级成像技术，为更个性化和适应性强的癌症治疗提供了新方向 | 文章强调了患者安全性和临床试验的重要性，暗示当前研究可能存在临床应用上的限制 | 探讨SLAM家族在癌症治疗中的应用，特别是作为免疫调节治疗的新策略 | 研究对象为SLAM家族及其在肿瘤免疫反应中的作用 | 肿瘤学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA |
| 17754 | 2024-08-07 |
Recent Advances in Single-Cell RNA-Sequencing of Primary and Metastatic Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2023-Sep-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15194734
PMID:37835428
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在原发性和转移性透明细胞肾细胞癌研究中的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术深入解析了肿瘤、免疫和基质细胞的多样性及其在疾病进展中的相互作用和通路 | 对于转移性透明细胞肾细胞癌的研究相对有限，这可能是导致该类型患者生存率和响应率较低的原因之一 | 旨在填补透明细胞肾细胞癌转移研究的知识空白，并强调提高转移性透明细胞肾细胞癌生存率的关键步骤 | 原发性和转移性透明细胞肾细胞癌 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 17755 | 2024-08-07 |
Deciphering Cellular Heterogeneity and Communication Patterns in Porcine Antral Follicles by Single-Cell RNA Sequencing
2023-Sep-26, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani13193019
PMID:37835625
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索了猪腔前卵泡中颗粒细胞的分子和细胞特征 | 揭示了猪腔前卵泡中颗粒细胞的异质性和通信模式，以及它们在卵泡发育和卵母细胞成熟中的作用 | NA | 理解猪腔前卵泡中颗粒细胞的异质性和通信模式 | 猪腔前卵泡中的颗粒细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 17756 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing of Donor-Reactive T Cells Reveals Role of Apoptosis in Donor-Specific Hyporesponsiveness of Kidney Transplant Recipients
2023-Sep-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241914463
PMID:37833911
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肾移植受者中供体反应性T细胞的转录组和T细胞受体谱，揭示了凋亡在供体特异性低反应性中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了肾移植受者中供体反应性T细胞的转录组和T细胞受体谱，并发现了凋亡在供体特异性低反应性中的作用 | 研究样本量较小，仅包括7名肾移植受者，可能影响结果的普遍性 | 探究肾移植后供体特异性低反应性的潜在机制 | 肾移植受者的供体反应性T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7名肾移植受者 |
| 17757 | 2024-08-05 |
Decoding functional cell-cell communication events by multi-view graph learning on spatial transcriptomics
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad359
PMID:37824741
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研究论文 | 该文章开发了一种名为HoloNet的方法，通过空间转录组学数据解码功能性细胞间通信事件。 | 本研究的创新点在于整合了配体-受体对、细胞类型空间分布和下游基因表达到深度学习模型中，以解码功能性通信事件和其目标基因关系。 | 没有提供HoloNet在其他类型的癌症或疾病中的应用结果，可能限制了其普遍性。 | 本研究旨在解码功能性细胞间通信事件，以理解生物过程的机制。 | 研究对象为乳腺癌和肝癌的三组Visium数据集，专注于细胞间的配体-受体相互作用。 | 数字病理学 | 乳腺癌, 肝癌 | 空间转录组学 | 深度学习模型 | 转录组数据 | 三组Visium数据集 |
| 17758 | 2024-08-05 |
Single-Cell Profiling of Cells in the Lung of a Patient with Chronic Hypersensitivity Pneumonitis Reveals Inflammatory Niche with Abundant CD39+ T Cells with Functional ATPase Phenotype: A Case Study
2023-Sep-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241914442
PMID:37833889
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研究论文 | 本研究调查了慢性超敏性肺炎中免疫细胞特征，重点关注CD39表达细胞对炎症和组织重塑的影响 | 揭示了CD39表达的T细胞在慢性超敏性肺炎中的双重性质，提示其在调节肺炎症中的潜在作用 | 本研究是单一病例研究，样本量较小，可能限制了广泛的适用性 | 探讨慢性超敏性肺炎中免疫细胞的特征及其对病理机制的影响 | 分析一名慢性超敏性肺炎患者的肺组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | 慢性超敏性肺炎 | 单细胞转录组学，流式细胞术，基因表达分析 | NA | 组织样本 | 1名慢性超敏性肺炎患者的肺组织 |
| 17759 | 2024-08-05 |
SGAE: single-cell gene association entropy for revealing critical states of cell transitions during embryonic development
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad366
PMID:37833841
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研究论文 | 本研究提出了一种新颖的计算方法SGAE，用于揭示早期胚胎发育过程中细胞转变的关键状态 | 提出了一种基于基因关联信息的单细胞基因关联熵(SGAE)方法，用于分析单细胞RNA-seq数据，并定量评估基因调控网络的关键特性 | 对单细胞RNA测序数据的精确检测仍然面临稀疏性、噪音和异质性的挑战 | 研究单细胞转变的关键点，以追踪细胞异质性并阐明细胞分化的分子机制 | 分析五个关于胚胎发育的单细胞数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 五个单细胞数据集 |
| 17760 | 2024-08-05 |
Development and validation of a differentiation-related signature based on single-cell RNA sequencing data of immune cells in spinal cord injury
2023-Sep, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e19853
PMID:37809933
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研究论文 | 本文基于脊髓损伤后免疫细胞的单细胞RNA测序数据，开发并验证了一个相关的分化标志。 | 该研究首次利用单细胞RNA测序数据识别了脊髓损伤后的免疫亚型和分子标志。 | 未提及具体的样本来源及其异质性对结果的影响。 | 探讨脊髓损伤后免疫系统的分子亚型及其潜在的诊断标志。 | 脊髓损伤后的免疫细胞及其相关的分化基因。 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三次脊髓样本，时间点为3、10和21天 |