单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 17701 - 17720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17701 | 2024-08-05 |
Melatonin modulates the hypothalamic-pituitary neuroendocrine axis to regulate physiological color change in teleost fish
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.81055
PMID:37324950
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研究论文 | 本研究探讨了褪黑激素在海洋硬骨鱼类的下丘脑-垂体神经内分泌轴中的作用 | 发现了褪黑激素/黑色素浓缩激素(MCH)和褪黑激素/(tachykinin前体1（TAC1）+促肾上腺皮质激素释放激素（CRH）)/黑色素刺激激素(MSH)的新型调控通路 | 对褪黑激素信号系统的全面理解仍然有限 | 研究褪黑激素在鱼类生理性变色中的调控机制 | 研究对象为大型黄鱼，一种具有昼夜体色变化行为的海洋硬骨鱼 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 17702 | 2024-08-05 |
Will EGFRvIII and neuronal-derived EGFR be targets for imipramine?
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1156492
PMID:37324489
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研究论文 | 本文探讨了三环类抗抑郁药imipramine在治疗神经胶质母细胞瘤中的潜在分子机制 | 揭示了imipramine可能通过靶向EGFRvIII和神经衍生的EGFR来调节肿瘤微环境的创新点 | 尚不清楚抗抑郁药如何影响神经胶质母细胞瘤的具体机制 | 研究imipramine在治疗神经胶质母细胞瘤中的作用机制 | 神经胶质母细胞瘤（GBM） | 数字病理学 | 神经胶质母细胞瘤 | RNA测序, 网络药理学, 单细胞测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | RNA数据 | NA |
| 17703 | 2024-08-05 |
Laser transfer for circulating tumor cell isolation in liquid biopsy
2023, International journal of bioprinting
IF:6.8Q1
DOI:10.18063/ijb.720
PMID:37323505
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研究论文 | 本文提出了一种新的激光转移方法用于循环肿瘤细胞的分离，旨在液体活检中实现高存活率的单细胞分离 | 使用紫外激光和水泡驱动的激光诱导前转移过程，有效保护细胞免受直接激光照射 | 研究中可能缺乏较大样本的验证，尚未充分探讨其他类型肿瘤细胞的适应性 | 开发一种新方法以实现高存活率的单个循环肿瘤细胞的分离 | 主要研究循环肿瘤细胞及其分离效果 | 数字病理学 | 肿瘤 | 液体激光转移（LLT） | NA | 细胞样本 | 1个MDA-MB-231癌细胞 |
| 17704 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing revealed subclonal heterogeneity and gene signatures of gemcitabine sensitivity in pancreatic cancer
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1193791
PMID:37324492
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胰腺癌中吉西他滨敏感性的亚克隆异质性和基因特征 | 本研究首次揭示了吉西他滨诱导的肿瘤细胞亚克隆的自然选择和肿瘤微环境细胞的重塑，并构建了一个能够预测吉西他滨敏感性和胰腺癌预后的基因面板 | NA | 研究胰腺癌中吉西他滨敏感性的亚克隆异质性和基因特征 | 胰腺癌患者样本和吉西他滨治疗前后的肿瘤进化和微环境变化 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 17个患者来源的异种移植模型 |
| 17705 | 2024-08-07 |
The elucidation of the anti-inflammatory mechanism of EMO in rheumatoid arthritis through an integrative approach combining bioinformatics and experimental verification
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1195567
PMID:37324499
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和实验验证的方法，阐明了大黄素（EMO）在类风湿性关节炎（RA）中的抗炎机制 | 采用网络药理学方法筛选EMO的关键靶点，并通过单细胞RNA测序和实验验证其可靠性 | NA | 探索大黄素在类风湿性关节炎中的抗炎作用机制 | 大黄素（EMO）及其在类风湿性关节炎中的作用靶点 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的GSE55457基因表达数据和GSE159117单细胞RNA测序数据，以及对MH7A细胞和关节滑膜成纤维细胞的实验 |
| 17706 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing (scRNA-Seq) Data Analysis of Retinal Homeostasis and Degeneration of Microglia
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3255-0_6
PMID:37326706
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research paper | 本文介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析和可视化的方法，特别关注视网膜稳态和微胶质细胞退化的研究 | 揭示了以前未见的分子特征 | NA | 探索单细胞RNA测序在视网膜稳态和微胶质细胞退化中的应用 | 视网膜稳态和微胶质细胞退化 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | RNA sequencing data | NA |
| 17707 | 2024-08-07 |
Circulating neutrophils activated by cancer cells and M2 macrophages promote gastric cancer progression during PD-1 antibody-based immunotherapy
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1081762
PMID:37333017
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研究论文 | 分析中性粒细胞与淋巴细胞比率（NLR）与接受PD-1抗体治疗的晚期胃癌（AGC）患者预后的相关性，并通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）描绘循环中性粒细胞的分子特征 | 发现治疗后NLR高的AGC患者预后较差，且循环中性粒细胞的亚群NE-1通过与恶性上皮细胞和M2巨噬细胞的信号交互参与胃癌进展 | 研究样本量较小，仅基于45名患者的数据，且仅在两个患者中进行了单细胞RNA测序分析 | 探讨PD-1抗体治疗对AGC患者NLR的影响及其与预后的关系，以及循环中性粒细胞在胃癌进展中的作用 | 接受PD-1抗体治疗的晚期胃癌患者及其循环中性粒细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 45名晚期胃癌患者，88名胃癌患者的组织样本 |
| 17708 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals cell subpopulations in the tumor microenvironment contributing to hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1194199
PMID:37333982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了肝细胞癌肿瘤微环境中具有特定功能的细胞亚群及其与环境的相互作用 | 首次揭示了肿瘤微环境中某些细胞亚群与肿瘤细胞的相互作用，特别是癌症相关成纤维细胞和巨噬细胞在肿瘤微环境重塑中的作用 | 研究样本仅限于14名肝细胞癌患者，可能影响结果的普遍性 | 探索肝细胞癌肿瘤微环境中特定细胞亚群的功能及其与环境的相互作用，以理解肿瘤的发展、预后和治疗 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织及其邻近的正常组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 43个肿瘤组织样本和14个邻近控制样本 |
| 17709 | 2024-08-07 |
Single-cell multi-omics analysis reveals dysfunctional Wnt signaling of spermatogonia in non-obstructive azoospermia
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1138386
PMID:37334314
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了非阻塞性无精症中精原细胞Wnt信号通路的失调 | 首次揭示了非阻塞性无精症中精原细胞Wnt信号通路的下调活性和功能障碍，并确定了可能涉及的三种转录因子（CTCF、AR和ARNTL） | NA | 探讨非阻塞性无精症中精原细胞Wnt信号通路的功能及其上游调控分子 | 非阻塞性无精症患者的精原细胞 | NA | 男性不育症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞染色质可及性测序（scATAC-seq）、空间转录组学 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 17710 | 2024-08-07 |
Schlafen4+-MDSC in Helicobacter-induced gastric metaplasia reveals role for GTPases
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1139391
PMID:37334372
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研究论文 | 本研究探讨了Schlafen4+ MDSC在幽门螺杆菌诱导的胃肠化生中的作用，并揭示了GTP酶在这一过程中的关键角色。 | 首次揭示了SLFN4在MDSC中的表达及其对GTP酶活性的调控作用，以及其在抑制T细胞功能和减轻胃肠化生发展中的作用。 | NA | 旨在阐明SLFN4+细胞的身份及其在MDSC中的作用。 | Schlafen4+ MDSC在幽门螺杆菌感染的胃中的作用。 | NA | 胃癌 | 单细胞RNA测序，siRNA敲低技术，GTPase-Glo试剂盒 | NA | RNA | 来自未感染和6个月H. felis感染小鼠的免疫细胞。 |
| 17711 | 2024-08-07 |
A novel signature incorporating lipid metabolism- and immune-related genes to predict the prognosis and immune landscape in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1182434
PMID:37346073
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种新的基因签名，结合脂质代谢和免疫相关基因，用于预测肝细胞癌的预后和免疫景观 | 本研究首次将脂质代谢和免疫相关基因结合，形成新的预后基因签名，用于肝细胞癌的预后预测和免疫状态评估 | NA | 开发一种新的基因签名，用于评估肝细胞癌患者的预后和免疫状态 | 肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-SEQ) | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 使用GEO14520和ICGC-LIRI JP数据集进行外部验证 |
| 17712 | 2024-08-07 |
A COMPOSITIONAL MODEL TO ASSESS EXPRESSION CHANGES FROM SINGLE-CELL RNA-SEQ DATA
2021-Jun, The annals of applied statistics
DOI:10.1214/20-aoas1423
PMID:37332668
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research paper | 本文介绍了一种经验贝叶斯混合方法，用于评估单细胞RNA-seq数据中基因表达变化的分布 | 该方法利用细胞亚型结构，通过聚类分析增强基因水平上的表达变化信息，并引入了一种特殊的先验分布，以支持多亚型间的差异表达模式评分 | NA | 评估和改进在单细胞RNA-seq数据中检测基因表达分布变化的方法 | 单细胞RNA-seq数据中的基因表达变化 | natural language processing | NA | RNA-seq | empirical Bayesian mixture model | single-cell RNA-seq data | NA |
| 17713 | 2024-08-07 |
A spatiotemporal gene expression and cell atlases of the developing rat ovary
2023-Dec, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13516
PMID:37309718
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组测序，构建了发育中的大鼠卵巢的转录组图谱，并分析了颗粒细胞的不同阶段及其转录调控网络。 | 发现了新的卵母细胞到卵丘细胞的生长信号，如JAG1-NOTCH2和FGF9-FGFR2，并观察到卵泡发育过程中的三个卵丘连续阶段。 | NA | 揭示正常卵巢发育过程中卵母细胞发育的不同阶段及其与体细胞的调控关系。 | 大鼠卵巢的发育过程及其细胞类型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 17714 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing in osteoarthritis
2023-Dec, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13517
PMID:37317049
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在骨关节炎病理发生中的应用，总结了关节软骨、半月板、滑膜和软骨下骨的微观结构变化，并探讨了其在靶向药物和组织工程中的潜在应用。 | 单细胞RNA测序提供了超越传统技术的高分辨率视图，有助于深入理解骨关节炎的发病机制和进展。 | 目前关于骨相关生物材料的评估研究有限。 | 探讨单细胞RNA测序在骨关节炎治疗中的潜在临床价值和未来发展方向。 | 骨关节炎相关的关节软骨、半月板、滑膜和软骨下骨。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 17715 | 2024-08-05 |
Clonal expansion of intra-epithelial T cells in breast cancer revealed by spatial transcriptomics
2023-11-01, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34620
PMID:37306359
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研究论文 | 这篇文章提出了一种空间转录组学方法ST-FFPE，用于分析乳腺癌中肿瘤浸润淋巴细胞的空间分布 | 该研究展示了ST-FFPE方法能够分析福尔马林固定石蜡包埋样本，为涉及历史组织的研究提供了可能 | 本研究可能在样本数量和类型上有局限性，需要进一步验证其广泛适用性 | 旨在研究乳腺癌尤其是三阴性乳腺癌中的T细胞克隆扩增现象 | 主要研究肿瘤微环境中的T细胞、B细胞、树突状细胞、成纤维细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | RNA | 分析了来自不同肿瘤区室的样本 |
| 17716 | 2024-08-07 |
Correction to Single-cell RNA sequencing identify SDCBP in ACE2-positive bronchial epithelial cells negatively correlates with COVID-19 severity
2023-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17778
PMID:37300372
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17717 | 2024-08-07 |
WISP2 downregulation inhibits the osteogenic differentiation of BMSCs in congenital scoliosis by regulating Wnt/β-catenin pathway
2023-10, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2023.166783
PMID:37302424
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研究论文 | 本研究探讨了WISP2下调通过调节Wnt/β-catenin通路抑制先天性脊柱侧弯中BMSCs的成骨分化 | 首次揭示了WISP2在先天性脊柱侧弯中通过Wnt/β-catenin信号通路调控BMSCs成骨分化的作用 | NA | 揭示BMSCs在先天性脊柱侧弯中的作用及其机制 | 先天性脊柱侧弯患者的BMSCs和健康捐赠者的BMSCs | NA | 先天性脊柱侧弯 | scRNA-seq, RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 先天性脊柱侧弯患者和健康捐赠者的BMSCs |
| 17718 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing identifies a signature based on NK cell marker genes to predict prognosis and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04965-y
PMID:37296316
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研究论文 | 这篇文章关于肝细胞癌中基于NK细胞标记基因的预后模型。 | 提出了一个基于NK细胞标记基因的新特征，能够有效预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗响应。 | 模型在不同数据集上的验证结果可能受到样本异质性的影响。 | 旨在通过单细胞测序数据分析NK细胞标记基因的预后价值。 | 研究对象是肝细胞癌患者的NK细胞标记基因。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA-seq | Cox回归模型 | 转录组数据 | 使用了TCGA、GEO和ICGC的数据进行模型构建和验证 |
| 17719 | 2024-08-05 |
A pairwise immune gene model for predicting overall survival and stratifying subtypes of colon adenocarcinoma
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04957-y
PMID:37316691
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研究论文 | 本文开发了一种与免疫基因相关的模型来评估结肠腺癌患者的预后状态 | 提出了一个新的免疫基因对模型，用于预测结肠腺癌的总体生存率和风险分层 | 模型的验证仅依赖于TCGA和GEO数据库中的数据，可能存在样本选择偏差 | 研究结肠腺癌患者的预后和免疫环境之间的关系 | 结肠腺癌患者的基因表达谱和生存随访信息 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的结肠腺癌患者数据集 |
| 17720 | 2024-08-07 |
Identification and validation of an ECM organization-related gene signature as a prognostic biomarker and therapeutic target for glioma patients
2023-09, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01413-6
PMID:37301776
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研究论文 | 本研究通过分析TCGA和GEO数据库中的glioma患者RNA测序数据，识别并验证了与ECM组织相关的九基因标志物，作为glioma的预后生物标志物和治疗靶点 | 首次验证了ECM组织相关基因标志物在glioma中的预后价值，并揭示了TIMP1作为潜在治疗靶点的机制 | NA | 评估ECM组织相关基因在glioma患者中的预后价值并识别潜在治疗靶点 | glioma患者及其ECM组织相关基因 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的glioma患者数据，以及中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据集 |