单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 17681 - 17700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17681 | 2024-08-07 |
A Network Medical Framework based on Inflammatory Genes to Identify Drug Candidates for Abdominal Aortic Aneurysms
2024, Current molecular pharmacology
IF:2.4Q3
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研究论文 | 本研究基于炎症基因构建网络医学框架，用于识别腹主动脉瘤的潜在药物候选 | 本研究首次通过网络医学方法，结合单细胞RNA测序和RNA测序数据，识别了腹主动脉瘤的关键治疗靶点和潜在药物 | 研究主要基于计算模拟和数据分析，尚未进行临床试验验证 | 旨在发现腹主动脉瘤的新治疗靶点和潜在药物 | 腹主动脉瘤的细胞类型、基因差异表达和药物靶点 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), RNA测序 | NA | 基因数据 | 10种细胞类型，327个差异表达基因 |
| 17682 | 2024-08-05 |
TGF-β-p-STAT1-LAIR2 axis has a "self-rescue" role for exhausted CD8+ T cells in hepatocellular carcinoma
2023-Dec, Cellular oncology (Dordrecht)
DOI:10.1007/s13402-023-00830-9
PMID:37223874
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研究论文 | 本研究探讨了TGF-β在肝细胞癌中对CD8+ T细胞功能的影响 | 发现TGF-β-p-STAT1-LAIR2轴具有CD8+ T细胞的“自我拯救”机制 | 该“自我拯救”机制在TGF-β刺激下存在时间和剂量限制，容易被更强的抑制信号掩盖 | 研究TGF-β对肝细胞癌中CD8+ T细胞的调控效应及分子机制 | 主要研究肝细胞癌中浸润的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 流式细胞术, 质量细胞术, 免疫组化, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 高通量测序的可转置酶可接近染色质检测, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告基因测定 | NA | NA | NA |
| 17683 | 2024-08-05 |
Differential Effects of Ontamalimab Versus Vedolizumab on Immune Cell Trafficking in Intestinal Inflammation and Inflammatory Bowel Disease
2023-Nov-24, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjad088
PMID:37208197
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研究论文 | 本研究探讨了Ontamalimab与Vedolizumab在肠道炎症和炎症性肠病中的免疫细胞迁移的不同影响 | Ontamalimab展现出独特且更广泛的作用机制，超出Vedolizumab的机制 | 研究的结果基于小鼠实验模型，可能无法完全预测临床应用中的效果 | 探索Ontamalimab的作用机制并与Vedolizumab进行比较 | 研究对象包括活跃的炎症性肠病患者中的MAdCAM-1表达及其在小鼠模型中的作用 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | RNA测序, 免疫组化, 荧光显微镜 | NA | 单细胞RNA测序 | 使用了小鼠模型进行实验，具体样本数量未明确说明 |
| 17684 | 2024-08-07 |
Engineered human Diamond-Blackfan anemia disease model confirms therapeutic effects of clinically applicable lentiviral vector at single-cell resolution
2023-11-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2022.282068
PMID:37199130
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研究论文 | 本研究利用CRISPR-Cas9和同源定向修复技术生成可追踪的RPS19缺陷细胞模型，以单细胞分辨率研究临床适用慢病毒载体的治疗效果 | 开发了一种温和的纳米吸管递送平台，用于编辑人类脐带血来源的CD34+造血干细胞和祖细胞中的RPS19基因，并首次通过单细胞RNA测序分析鉴定了特定的红系祖细胞及其异常细胞周期状态 | NA | 验证临床适用慢病毒载体在单细胞分辨率下的治疗效果 | RPS19缺陷细胞模型及人类脐带血来源的CD34+造血干细胞和祖细胞 | 基因编辑 | 骨髓衰竭症 | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类脐带血来源的CD34+造血干细胞和祖细胞 |
| 17685 | 2024-08-07 |
CellEnBoost: A Boosting-Based Ligand-Receptor Interaction Identification Model for Cell-to-Cell Communication Inference
2023-10, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2023.3278685
PMID:37216267
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研究论文 | 本文开发了一种基于Boosting的配体-受体相互作用识别模型CellEnBoost，用于细胞间通信的推断 | CellEnBoost模型结合了Light梯度提升机和AdaBoost以及卷积神经网络，用于预测和过滤配体-受体相互作用，并通过结合细胞间通信强度测量和单细胞RNA测序数据进行验证 | NA | 旨在识别肿瘤微环境中癌细胞自身及癌细胞与正常细胞间的通信，以帮助理解癌症的发生、发展和转移 | 细胞间通信及配体-受体相互作用 | 机器学习 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | CNN | 数据集 | 收集了四个配体-受体相互作用数据集 |
| 17686 | 2024-08-08 |
A Carboxy-terminal Smarcb1 Point Mutation Induces Hydrocephalus Formation and Affects AP-1 and Neuronal Signalling Pathways in Mice
2023-Oct, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-023-01361-5
PMID:37219662
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研究论文 | 本文通过建立一个新的携带羧基端Smarcb1 c.1148del点突变的小鼠模型，研究了该突变对小鼠大脑发育的影响。 | 首次探讨了特定非截断型Smarcb1突变的影响，并通过磁共振成像、组织学和单细胞RNA测序技术进行了深入分析。 | 仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现。 | 研究SMARCB1突变对神经发育的影响及其相关表型。 | 携带羧基端Smarcb1 c.1148del点突变的小鼠。 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 磁共振成像、组织学、单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 图像、组织切片、RNA序列 | 新生突变小鼠的脑组织 |
| 17687 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic data reveal the increase in extracellular matrix organization and antigen presentation abilities of fibroblasts and smooth muscle cells in patients with pelvic organ prolapse
2023-Oct, International urogynecology journal
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00192-023-05539-9
PMID:37222740
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组测序分析了盆腔器官脱垂患者阴道壁中成纤维细胞和平滑肌细胞的细胞特性变化 | 首次揭示了盆腔器官脱垂患者中成纤维细胞和平滑肌细胞的细胞外基质组织和抗原呈递能力增强的现象 | 研究样本量较小，仅包括5例盆腔器官脱垂患者和5例对照组 | 探索盆腔器官脱垂中成纤维细胞和平滑肌细胞的细胞特性，以增进对盆腔器官脱垂分子机制的理解 | 盆腔器官脱垂患者的成纤维细胞和平滑肌细胞 | 数字病理学 | 盆腔器官脱垂 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 5例盆腔器官脱垂患者和5例对照组 |
| 17688 | 2024-08-05 |
Early cortical oligodendrocyte precursor cells are transcriptionally distinct and lack synaptic connections
2023-09, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24388
PMID:37226895
|
研究论文 | 研究早期皮层少突胶质前体细胞的转录特征及其缺乏突触连接的情况 | 首次明确表明早期胚胎少突胶质前体细胞在转录上与后天细胞显著不同且缺乏突触输入 | 未能直接展示突触信号对少突胶质前体细胞发展的影响 | 探究早期少突胶质前体细胞在胚胎大脑中的功能和分子特征 | 小鼠胚胎阶段的少突胶质前体细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎阶段的少突胶质前体细胞 |
| 17689 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals heterogeneity of the patterns of responsive genes and cell communications in liver cell populations of zebrafish exposed to polystyrene nanoplastics
2023-Sep-01, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2023.164082
PMID:37207780
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了聚苯乙烯纳米塑料暴露后斑马鱼肝脏细胞群体中的异质性响应模式和细胞通讯模式 | 本研究首次阐明了纳米塑料暴露对斑马鱼肝脏细胞群体的异质性响应模式，并通过单细胞转录组学分析揭示了细胞间的特殊相互作用 | NA | 探索纳米塑料对斑马鱼肝脏细胞的细胞毒性及其异质性响应模式 | 斑马鱼肝脏细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 九种细胞类型 |
| 17690 | 2024-08-08 |
Integrated mass spectrometry imaging and single-cell transcriptome atlas strategies provide novel insights into taxoid biosynthesis and transport in Taxus mairei stems
2023-09, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16315
PMID:37219365
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研究论文 | 本研究结合质谱成像和单细胞转录组图谱技术，探索了红豆杉茎中紫杉醇生物合成及运输的精确分布和转录调控 | 开发了一种单细胞策略来筛选紫杉醇生物合成调控的新转录因子，并提出了潜在的紫杉醇转运蛋白候选基因 | NA | 揭示紫杉醇在红豆杉茎中的分布及其生物合成途径的细胞特异性转录调控机制 | 红豆杉茎中的紫杉醇生物合成及运输 | NA | NA | MALDI-IMS分析, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 转录组 | 涉及红豆杉茎的多个细胞类型 |
| 17691 | 2024-08-07 |
Bestrophin3 Deficiency in Vascular Smooth Muscle Cells Activates MEKK2/3-MAPK Signaling to Trigger Spontaneous Aortic Dissection
2023-08-15, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究探讨了Bestrophin3在血管平滑肌细胞中的缺乏如何通过激活MEKK2/3-MAPK信号通路引发主动脉夹层 | 揭示了Bestrophin3在调控血管平滑肌细胞表型转换和主动脉结构完整性中的关键作用，并提出Best3-MEKK2/3信号通路作为治疗主动脉夹层的新靶点 | NA | 研究Bestrophin3在血管疾病中的作用及其机制 | 血管平滑肌细胞和内皮细胞中的Bestrophin3缺乏 | 心血管疾病 | 主动脉夹层 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学分析，共免疫沉淀结合质谱 | NA | RNA，蛋白质 | 包括Best3SMKO和Best3ECKO小鼠模型，以及人类主动脉夹层样本 |
| 17692 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA seq identifies Plg-RKT-PLG as signals inducing phenotypic transformation of scar-associated macrophage in liver fibrosis
2023-08, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2023.166754
PMID:37207518
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术，揭示了肝纤维化过程中瘢痕相关巨噬细胞（SAMs）的表型转化机制，并发现Plg-RKT-PLG信号在这一过程中起关键作用 | 首次揭示了Plg-RKT-PLG信号在肝纤维化过程中瘢痕相关巨噬细胞表型转化中的作用 | NA | 旨在表征瘢痕相关巨噬细胞并阐明其在肝纤维化过程中的转化机制 | 瘢痕相关巨噬细胞（SAMs）及其在肝纤维化中的作用 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、质谱流式细胞术（CyTOF） | NA | RNA | 使用胆管结扎（BDL）和四氯化碳（CCl）诱导的小鼠肝纤维化模型 |
| 17693 | 2024-08-08 |
ScRNA-seq links dental fibroblasts heterogeneity with mechanoresponsiveness
2023-Aug, Journal of periodontal research
IF:3.4Q1
DOI:10.1111/jre.13139
PMID:37221903
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了人类牙周韧带（PDL）和牙髓（DP）的细胞异质性及其与机械应答特性的关系 | 本研究首次揭示了PDL中存在一种特定的机械应答性成纤维细胞亚型，并阐明了其分子机制 | NA | 旨在解析牙源性软组织的细胞异质性和独特的机械应答特性及其分子机制 | 人类牙周韧带（PDL）和牙髓（DP）的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 人类牙周韧带（PDL）和牙髓（DP）的细胞样本 |
| 17694 | 2024-08-07 |
Peripheral immune mapping and multi-omics analysis in Pd-1 inhibitor-induced myocarditis
2023-07-27, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad056
PMID:37202883
|
研究论文 | 研究PD-1抑制剂诱导的心肌炎的临床特征和多组学特征 | 通过单细胞RNA测序、流式细胞术、蛋白质组学和脂质组学分析，揭示了PD-1抑制剂诱导的心肌炎患者外周血T细胞的组成变化和炎症反应 | NA | 深入理解PD-1抑制剂诱导的心肌炎的病理生理机制 | 46名肿瘤患者和16名PD-1抑制剂诱导的心肌炎患者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、蛋白质组学、脂质组学 | NA | 细胞、蛋白质、脂质 | 46名肿瘤患者和16名PD-1抑制剂诱导的心肌炎患者 |
| 17695 | 2024-08-05 |
CIForm as a Transformer-based model for cell-type annotation of large-scale single-cell RNA-seq data
2023-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad195
PMID:37200157
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研究论文 | 本研究开发了一种基于Transformer的CIForm方法，用于对大规模单细胞RNA-seq数据进行细胞类型注释 | 提出了一种新颖的监督学习方法CIForm，旨在处理大规模数据集中的细胞类型注释问题 | 研究中未提及具体的数据集规模和多样性限制 | 本研究旨在提高单细胞RNA-seq分析中对细胞类型的准确注释 | 研究对象为多种单细胞RNA-seq数据集中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | Transformer | 单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 17696 | 2024-08-08 |
An interpretable single-cell RNA sequencing data clustering method based on latent Dirichlet allocation
2023-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad199
PMID:37225419
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研究论文 | 本文提出了一种基于潜在狄利克雷分配（LDA）模型的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据聚类方法 | 引入'细胞-功能-基因'三层框架，通过内置模型方法发现潜在和复杂的基因表达模式，并通过数据驱动的功能解释过程获得生物学上有意义的结果 | NA | 开发一种新的scRNA-seq数据分析方法，以提高细胞聚类的准确性和纯度，并能够精确重建细胞发育轨迹 | scRNA-seq数据集中的细胞聚类和功能解释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 潜在狄利克雷分配（LDA）模型 | 基因表达数据 | 七个基准scRNA-seq数据集和三个复杂公共数据集 |
| 17697 | 2024-08-08 |
In the mouse cortex, oligodendrocytes regain a plastic capacity, transforming into astrocytes after acute injury
2023-07-10, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.04.016
PMID:37220747
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研究论文 | 本文报道了在小鼠大脑皮质中，急性损伤后少突胶质细胞重新获得可塑性，转化为星形胶质细胞的现象 | 首次揭示了急性脑损伤后少突胶质细胞通过激活星形胶质基因，转化为星形胶质细胞的过程 | NA | 研究急性脑损伤后少突胶质细胞的转化机制 | 小鼠大脑皮质中的少突胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了PLP-DsRed1/GFAP-EGFP和PLP-EGFP/GFAP-mRFP1转基因小鼠进行研究 |
| 17698 | 2024-08-05 |
STellaris: a web server for accurate spatial mapping of single cells based on spatial transcriptomics data
2023-07-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad419
PMID:37224539
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研究论文 | 介绍了一个名为STellaris的网络服务器，可以基于空间转录组学数据进行单细胞的空间映射 | STellaris能够根据公共空间转录组学数据的转录组相似性快速为单细胞RNA测序数据分配空间信息 | 未提及具体的限制 | 旨在解密空间相关特征，如细胞间交互作用 | 基于单细胞RNA测序数据与空间转录组学数据进行空间信息的映射 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 101个手动编纂的空间转录组数据集，涵盖823个来自不同器官、发育阶段和病理状态的切片 |
| 17699 | 2024-08-05 |
SMDB: a Spatial Multimodal Data Browser
2023-07-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad413
PMID:37216588
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研究论文 | 本文介绍了一种名为空间多模态数据浏览器（SMDB）的工具，旨在有效结合空间位置、形态信息和空间转录组学数据。 | SMDB集成了多模态数据，提供了一种新的交互式可视化服务来探索空间转录组学数据。 | NA | 本研究旨在开发一种强大的工具，以帮助研究人员理解细微尺度空间组织与生物功能之间的关系。 | 研究重点为空间转录组学数据及其与组织组成和形态的关系。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 (ST) | NA | 图像 | NA |
| 17700 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Reveal Pathogenesis of Meningeal Lymphatic Dysfunction after Experimental Subarachnoid Hemorrhage
2023-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202301428
PMID:37211686
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研究论文 | 该研究探讨了实验性蛛网膜下腔出血后脑膜淋巴功能障碍的发病机制 | 首次描绘了蛛网膜下腔出血后受损脑膜淋巴管的全景，并提出了通过破坏THBS1和CD47相互作用来保护脑膜淋巴管的新治疗策略 | 该研究未明确说明临床研究的数据和结果是否能直接转化 | 揭示蛛网膜下腔出血后脑膜淋巴管的损伤及其潜在机制 | 脑膜淋巴管及其在蛛网膜下腔出血后的变化 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA | NA |