单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 17681 - 17700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17681 | 2024-08-07 |
Consensus label propagation with graph convolutional networks for single-cell RNA sequencing cell type annotation
2023-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad360
PMID:37267208
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研究论文 | 本文介绍了一种基于图卷积网络（GCN）的方法，用于自动化单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的细胞类型注释 | 该方法通过共识和半监督GCN传播高置信度标签，提高了注释的准确性，并允许特征解释，识别细胞类型分类的重要基因 | NA | 自动化和解释单细胞RNA测序数据的分类 | 单细胞RNA测序数据的细胞类型注释 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 图卷积网络（GCN） | 基因表达数据 | 使用模拟数据和来自不同组织的两个scRNA-seq数据集进行验证 |
| 17682 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a mechanism underlying the susceptibility of the left atrial appendage to intracardiac thrombogenesis during atrial fibrillation
2023-06, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1297
PMID:37278111
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了心房颤动期间左心耳易形成血栓的分子机制 | 首次展示了心房颤动患者左心耳与右心耳的单细胞转录组比较，并发现了左心耳内皮细胞向成纤维细胞的表型转换及炎症相关变化 | 研究样本量较小，仅包括三名患者，且未涉及更多不同类型的心房颤动患者 | 探究心房颤动期间左心耳易形成血栓的分子机制 | 心房颤动患者的左心耳和右心耳组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三名持续性心房颤动患者的匹配左心耳样本 |
| 17683 | 2024-08-07 |
Myc promotes polyploidy in murine trophoblast cells and suppresses senescence
2023-06-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201581
PMID:37278344
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研究论文 | 本研究探讨了Myc在鼠胎盘滋养层细胞中促进多倍体化并抑制衰老的作用 | 首次揭示了Myc是多倍体化和正常胎盘发育的关键调控因子，并防止过早衰老 | NA | 研究Myc在胎盘发育中的作用及其对多倍体化和衰老的影响 | 鼠胎盘滋养层巨细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 17684 | 2024-08-07 |
The tumor immune microenvironment of nasopharyngeal carcinoma after gemcitabine plus cisplatin treatment
2023-Jun, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02369-6
PMID:37280275
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞及B细胞受体测序，分析了吉西他滨联合顺铂（GP）化疗后鼻咽癌（NPC）肿瘤免疫微环境的变化 | 首次揭示了GP化疗激活以先天样B细胞（ILB）为主的抗肿瘤免疫反应的机制，并验证了ILB作为GP治疗NPC的潜在生物标志物 | NA | 探究GP化疗后鼻咽癌肿瘤免疫微环境的变化及其机制 | 鼻咽癌患者在接受GP化疗前后的肿瘤样本 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序，T细胞和B细胞受体测序 | NA | 基因表达数据 | 15对治疗前和治疗后的鼻咽癌样本，以及139名和380名接受GP化疗和免疫治疗联合治疗的鼻咽癌患者 |
| 17685 | 2024-08-07 |
Diverse intratumoral heterogeneity and immune microenvironment of two HPV-related cervical cancer types revealed by single-cell RNA sequencing
2023-06, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28857
PMID:37287196
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了人乳头瘤病毒相关宫颈鳞状细胞癌（SCC）和腺癌（AD）在肿瘤异质性和肿瘤微环境（TME）中的细胞差异 | 首次详细描述了SCC和AD在细胞类型特异性分子差异、信号通路调控和免疫细胞浸润模式上的不同 | 研究样本仅包括三名SCC和三名AD患者，可能不足以代表所有病例 | 阐明SCC和AD在肿瘤异质性和肿瘤微环境中的细胞差异，并提出潜在的治疗策略 | 宫颈鳞状细胞癌（SCC）和腺癌（AD）的细胞类型特异性分子差异 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 61,723个细胞，来自三名SCC和三名AD患者 |
| 17686 | 2024-08-07 |
BOTH THE INFECTION STATUS AND INFLAMMATORY MICROENVIRONMENT INDUCE TRANSCRIPTIONAL REMODELING IN MACROPHAGES IN MURINE LEISHMANIAL LESIONS
2023-05-01, The Journal of parasitology
IF:1.0Q4
DOI:10.1645/22-94
PMID:37270767
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了在小鼠利什曼原虫感染病变中，感染和未感染寄生虫的巨噬细胞的转录重塑情况 | 首次区分了寄生虫和炎症微环境对巨噬细胞转录重塑的独立影响 | NA | 探究利什曼原虫感染后巨噬细胞的转录重塑及其影响因素 | 巨噬细胞在利什曼原虫感染病变中的转录变化 | 数字病理学 | 皮肤利什曼病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 感染和未感染利什曼原虫的巨噬细胞样本 |
| 17687 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq reveals developmental deficiencies in both the placentation and the decidualization in women with late-onset preeclampsia
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1142273
PMID:37283740
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研究论文 | 本研究利用单细胞 RNA 测序在晚发性子痫前期女性中揭示了胎盘和蜕膜的发育缺陷 | 首次通过单细胞 RNA 测序揭示晚发性子痫前期患者胎盘和蜕膜的发育缺陷 | 研究主要集中于晚发性子痫前期的少数样本，可能无法全面代表所有子痫前期患者 | 探讨晚发性子痫前期的分子机制 | 晚发性子痫前期女性和正常妊娠女性的胎盘及蜕膜 | 数字病理学 | 子痫前期 | 单细胞 RNA 测序 | NA | 转录组数据 | 晚发性子痫前期患者和正常妊娠女性的多个样本 |
| 17688 | 2024-08-05 |
Bioinformatics analysis of aging-related genes in thoracic aortic aneurysm and dissection
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1089312
PMID:37283588
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研究论文 | 本研究探讨了老化与胸主动脉瘤和撕裂（TAAD）之间的关系及其潜在机制 | 研究首次系统性地分析了与老化相关的基因在胸主动脉瘤和撕裂中的表达差异，并识别了五个关键基因，可能为TAAD的诊断和治疗提供新见解 | 本研究依赖于现有数据集，可能存在数据偏倚，且尚需在临床样本中验证结果 | 旨在揭示老化如何影响胸主动脉瘤和撕裂的发病机制 | 研究对象为与老化相关的基因和胸主动脉瘤患者样本 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 总共分析了70个差异共表达基因 |
| 17689 | 2024-08-05 |
Protecting RNA quality for spatial transcriptomics while improving immunofluorescent staining quality
2023, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2023.1198154
PMID:37274189
|
研究论文 | 本文开发了一种方法来改善空间转录组学中的RNA质量，并同时提升免疫荧光染色质量 | 提出了一种改进的生产商协议，既不影响RNA质量，又能使用更多以前不兼容的额外抗体 | 实验主要基于小鼠脑切片，可能限制了结果的广泛适用性 | 旨在提高免疫荧光染色的效率，同时保持RNA的质量 | 针对新鲜冷冻小鼠脑切片进行研究 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 组织切片 | 采用了多个小鼠脑切片 |
| 17690 | 2024-08-05 |
Subject clustering by IF-PCA and several recent methods
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1166404
PMID:37287536
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研究论文 | 本文提出了IF-VAE作为一种新的受试者聚类方法，并与多种方法进行了比较 | 结合了变分自编码器和影响特征主成分分析的新方法IF-VAE | IF-VAE相较于IF-PCA表现较差 | 研究如何结合无监督深度学习和其他方法进行受试者聚类 | 研究基于10个基因微阵列数据集和8个单细胞RNA-seq数据集的受试者聚类 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 变分自编码器 | 基因数据 | 10个基因微阵列数据集和8个单细胞RNA-seq数据集 |
| 17691 | 2024-08-05 |
Machine learning and integrative analysis identify the common pathogenesis of azoospermia complicated with COVID-19
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1114870
PMID:37283758
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研究论文 | 本研究探讨了与COVID-19相关的无精症的共同发病机制 | 通过整合加权共表达网络分析、机器学习和单细胞RNA测序，识别与无精症和COVID-19相关的关键基因和通路 | 未提及具体的局限性 | 进一步研究无精症与COVID-19的共同发病机制 | 无精症患者和COVID-19患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 无精症，COVID-19 | 单细胞RNA测序，机器学习 | NA | 基因表达数据 | 分析了阻塞性无精症和非阻塞性无精症样本的转录组数据 |
| 17692 | 2024-08-05 |
Expression quantitative trait locus studies in the era of single-cell omics
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1182579
PMID:37284065
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综述 | 本文概述了单细胞eQTL研究及其在基因表达调控中的应用 | 介绍了单细胞RNA-seq技术对细胞类型特异性基因表达调控的识别 | 单细胞eQTL分析的局限性被讨论 | 研究基因表达调控与遗传变异之间的关系 | 主要关注单细胞eQTL和其数据处理及映射过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 17693 | 2024-08-05 |
Single-cell atlas of dental pulp stem cells exposed to the oral bacteria Porphyromonas gingivalis and Enterococcus faecalis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1166934
PMID:37287452
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研究论文 | 本文探讨了口腔细菌对人类牙髓干细胞的影响及其机制 | 该研究建立了牙髓干细胞在细菌刺激下的单细胞转录组图谱，并揭示了细菌如何影响干细胞的分化和再生能力 | 文章未详细探讨不同细菌种类的影响程度和比较分析 | 研究人类牙髓干细胞在细菌侵袭下的反应机制 | 人类牙髓干细胞（hDPSCs） | 数字病理学 | 牙髓炎和根尖周围炎 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 17694 | 2024-08-07 |
Bioinformatic analysis reveals potential relationship between chondrocyte senescence and protein glycosylation in osteoarthritis pathogenesis
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1153689
PMID:37265706
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，探讨了软骨细胞衰老与蛋白质糖基化在骨关节炎发病机制中的潜在关系 | 揭示了软骨细胞衰老信号与O-连接糖基化途径在骨关节炎发病机制中的相互关联 | NA | 研究软骨细胞衰老与蛋白质糖基化在骨关节炎发病机制中的关系 | 骨关节炎患者的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自Gene Expression Omnibus数据库的临床骨关节炎样本 |
| 17695 | 2024-08-07 |
Refined expression quantitative trait locus analysis on adenocarcinoma at the gastroesophageal junction reveals susceptibility and prognostic markers
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1180500
PMID:37265963
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研究论文 | 本研究旨在探索胃食管交界处腺癌（ACGEJ）的细胞类型水平表达数量性状位点（eQTL），并识别易感性和预后标记 | 本研究通过精细的eQTL分析，识别了2,036个潜在的ACGEJ特异性eQTL，并发现ACGEJ-gain eQTL在启动子区域富集程度高于ACGEJ-loss eQTL | NA | 探索胃食管交界处腺癌的细胞类型水平表达数量性状位点，并识别易感性和预后标记 | 胃食管交界处腺癌（ACGEJ） | 数字病理学 | 胃食管交界处腺癌 | 全基因组测序（WGS），RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 线性混合模型 | 基因组数据，转录组数据 | 120对来自中国ACGEJ患者的样本 |
| 17696 | 2024-08-07 |
Neutrophil-Derived IL-6 Potentially Drives Ferroptosis Resistance in B Cells in Lupus Kidney
2023, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/2023/9810733
PMID:37273451
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研究论文 | 本研究通过scRNA-seq技术和流式细胞术，发现中性粒细胞中IL-6表达上调，并与狼疮肾炎中B细胞的IL-6受体和SLC7A11表达相关，揭示了中性粒细胞通过IL-6促进B细胞铁死亡抵抗的机制。 | 首次揭示了中性粒细胞通过IL-6和SLC7A11介导的B细胞铁死亡抵抗机制，为理解狼疮肾炎中中性粒细胞与B细胞的相互作用提供了新视角。 | NA | 探究狼疮肾炎中B细胞铁死亡抵抗的机制。 | 中性粒细胞和B细胞在狼疮肾炎中的相互作用。 | NA | 狼疮肾炎 | scRNA-seq, 流式细胞术 | NA | RNA | NA |
| 17697 | 2024-08-07 |
In-depth mining of single-cell transcriptome reveals the key immune-regulated loops in age-related macular degeneration
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1173123
PMID:37273909
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研究论文 | 本研究通过深入分析年龄相关性黄斑变性（AMD）的单细胞转录组，揭示了关键的免疫调节环路 | 本研究采用细胞表达特异性基因（CESG）作为指标，识别新的细胞标记物，并设计计算框架探索细胞特异性转录因子调节环路 | 年龄相关性黄斑变性是一种多因素疾病，其病理生理机制复杂，仍是一个持续的挑战 | 旨在更好地理解疾病发病机制并识别有效治疗靶点 | 年龄相关性黄斑变性的单细胞转录组 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞基因组学 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 17698 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals a cellular immune response in freshwater dark sleeper (Odontobutis potamophila) after infection with Aeromonas veronii
2023, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2023.1201914
PMID:37275236
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析（scRNA-seq）探讨了淡水暗睡鱼（Odontobutis potamophila）头部肾脏细胞在感染Aeromonas veronii后的基因表达调控及细胞免疫反应 | 本研究首次揭示了淡水暗睡鱼在感染Aeromonas veronii后，其头部肾脏细胞中B细胞、内皮细胞、巨噬细胞和粒细胞的基因表达差异，以及中性粒细胞的活化和免疫反应的激活 | NA | 研究淡水暗睡鱼在感染Aeromonas veronii后的细胞免疫反应及基因表达调控 | 淡水暗睡鱼的头部肾脏细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组 | 涉及B细胞、内皮细胞、巨噬细胞和粒细胞等多种细胞类型 |
| 17699 | 2024-08-07 |
The human Stat1 gain-of-function T385M mutation causes expansion of activated T-follicular helper/T-helper 1-like CD4 T cells and sex-biased autoimmunity in specific pathogen-free mice
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1183273
PMID:37275873
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研究论文 | 研究了人类STAT1基因的增益功能突变T385M在无特定病原体小鼠中的免疫影响，发现该突变导致激活的T滤泡辅助/T辅助1样CD4 T细胞扩张和性别偏向性自身免疫。 | 首次在无特定病原体条件下模拟STAT1 DNA结合域增益功能突变对免疫系统的影响，并通过单细胞RNA测序分析揭示了突变对B细胞和T细胞转录程序的激活作用。 | 研究仅在特定条件下的小鼠模型中进行，可能需要进一步在人类中验证这些发现。 | 探究STAT1增益功能突变在无特定病原体小鼠中的免疫影响及其与自身免疫的关系。 | STAT1 T385M突变小鼠的淋巴细胞及其在不同年龄段的免疫变化。 | 免疫学 | 自身免疫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Stat1T385M/+突变小鼠的淋巴细胞样本 |
| 17700 | 2024-08-07 |
A single-cell RNA sequencing atlas of circulating leukocytes from healthy and osteosarcoma affected dogs
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1162700
PMID:37275879
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对健康犬和骨肉瘤患犬的循环白细胞进行了详细的细胞图谱构建，并探讨了骨肉瘤对循环免疫细胞转录组的影响 | 首次构建了犬类循环白细胞的单细胞RNA测序图谱，并分析了骨肉瘤对这些细胞转录组的影响 | 研究样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨犬类作为疾病模型的适用性，并深入了解犬类免疫细胞的特性 | 健康犬和骨肉瘤患犬的循环白细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康犬7只，骨肉瘤患犬10只 |