单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 17661 - 17680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17661 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling of sepsis identifies HLA-DRlowS100Ahigh monocytes with immunosuppressive function
2023-06-19, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-023-00462-y
PMID:37337301
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了与免疫抑制状态相关的HLA-DRlowS100Ahigh单核细胞的特征 | 本研究首次识别出HLA-DRlowS100Ahigh单核细胞，这些细胞在脓毒症患者中显著富集并可能具有免疫抑制功能 | 本研究主要依赖于已有的数据集，可能存在样本选择偏差 | 探讨脓毒症患者中免疫抑制的免疫细胞特征及其潜在治疗靶点 | 脓毒症患者的单核细胞亚群体 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自脓毒症患者和小鼠模型的两个已发表的数据集 |
| 17662 | 2024-08-05 |
Analysis of Notch1 signaling in mammalian sperm development
2023-Jun-19, BMC research notes
IF:1.6Q2
DOI:10.1186/s13104-023-06378-z
PMID:37337280
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研究论文 | 本文分析了Notch1信号在哺乳动物精子发育中的作用 | 利用转基因小鼠系统研究Notch1信号在精子发育中的表达情况，发现其在正常精子发育中的作用或许被低估 | 在转基因小鼠模型中未观察到Notch1信号的活跃表达，可能影响结果的普适性 | 验证Notch1在精子发育过程中的实际作用 | 小鼠和人类睾丸中的精子细胞谱系 | 数字病理 | NA | RNA-seq | NA | 单细胞数据 | 四个单细胞RNA-seq数据集 |
| 17663 | 2024-08-05 |
Significance of liquid-liquid phase separation (LLPS)-related genes in breast cancer: a multi-omics analysis
2023-06-19, Aging
DOI:10.18632/aging.204812
PMID:37338518
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研究论文 | 本研究探索了与液-液相分离（LLPS）相关的基因在乳腺癌中的重要性 | 建立了一个由九个基因组成的LLPS相关预后模型，特别是发现PGAM1作为新标记 | 研究模型的应用和验证主要集中在特定数据集和基因上，可能不适用于所有乳腺癌患者 | 探讨液-液相分离在乳腺癌中的作用和相关基因的重要性 | 乳腺癌细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序，转录组测序， COX回归，Lasso回归 | 加权共表达网络分析（WGCNA） | 基因表达数据 | 使用了GSE188600和GSE198745的单细胞测序数据集及转录组测序数据，具体样本数量未提及 |
| 17664 | 2024-08-05 |
Prioritization and functional validation of target genes from single-cell transcriptomics studies
2023-06-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05006-7
PMID:37330599
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研究论文 | 该文章探讨了如何从单细胞转录组学研究中优先选择并功能验证靶基因 | 文章创新性地通过针对未报告的高排名尖端内皮细胞标记基因进行优先选择和功能验证 | 并非所有高排名的scRNA-seq标记都表现出预测功能，这可能限制了目标的实际应用 | 目标是选择和验证与血管生成相关的尖端内皮细胞靶基因 | 研究对象为尖端内皮细胞的标记基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因 | 六个候选基因 |
| 17665 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic profiling of microvascular endothelial cell heterogeneity in congenital diaphragmatic hernia
2023-06-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-37050-y
PMID:37330615
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，探讨了先天性膈疝（CDH）中微血管内皮细胞的异质性及其与肺发育不良和重塑的关系 | 首次揭示了CDH肺中微血管内皮细胞的三个不同集群，并发现CDH微血管内皮细胞集群具有独特的炎症转录组特征 | 研究仅使用了硝苯酚诱导的CDH模型，可能限制了结果的普遍性 | 探究先天性膈疝肺中微血管内皮细胞的异质性及其与肺发育不良和重塑的关系 | 先天性膈疝（CDH）肺中的微血管内皮细胞 | 数字病理学 | 先天性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了E21.5的硝苯酚模型中的大鼠胎儿，包括健康对照组（2HC）、硝苯酚暴露对照组（NC）和硝苯酚暴露的CDH组 |
| 17666 | 2024-08-05 |
Heterogeneity of tumor immune microenvironment in malignant and metastatic change in LUAD is revealed by single-cell RNA sequencing
2023-06-16, Aging
DOI:10.18632/aging.204752
PMID:37335089
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了肺腺癌（LUAD）肿瘤免疫微环境的异质性。 | 通过单细胞测序技术，分析了LUAD中不同细胞类型的转录组特征，并识别了709个在LUAD微环境中发挥重要作用的基因。 | 本文没有详细说明样本的多样性及其对结果的影响。 | 研究肺腺癌的肿瘤微环境及其在恶性和转移变化中的异质性。 | 主要研究对象是肺腺癌（LUAD）中的免疫细胞和其相关的转录组特征。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 17667 | 2024-08-07 |
Feedback circuits are numerous in embryonic gene regulatory networks and offer a stabilizing influence on evolution of those networks
2023-Jun-16, EvoDevo
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s13227-023-00214-y
PMID:37322563
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研究论文 | 本文重新分析了两种海胆物种的发育基因调控网络（dGRNs），重点关注基因首次表达的时间，并发现了先前未被识别的反馈回路 | 发现了先前未被识别的反馈回路，并提出这些回路可能在高度保守的dGRNs中缓冲异时性表达的影响 | NA | 研究两种海胆物种的发育基因调控网络的相似性和差异 | Lytechinus variegatus和Strongylocentrotus purpuratus的发育基因调控网络 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 两种海胆物种的基因调控网络数据 |
| 17668 | 2024-08-07 |
Cord blood-derived Vδ2+ and Vδ2- T cells acquire differential cell state compositions upon in vitro expansion
2023-06-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf3120
PMID:37327346
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研究论文 | 研究了人脐带血来源的γδ T细胞在体外扩增过程中不同亚型的细胞状态组成差异 | 通过单细胞RNA测序追踪了脐带血来源的γδ T细胞在体外扩增过程中的分化过程，并揭示了不同亚型细胞的克隆特异性分化动态 | NA | 探讨人脐带血来源的γδ T细胞在早期新生儿阶段的内在细胞差异，并优化细胞制造过程 | 人脐带血来源的γδ T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 17669 | 2024-08-07 |
Single cell profiling of female breast fibroadenoma reveals distinct epithelial cell compositions and therapeutic targets
2023-06-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39059-3
PMID:37328469
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了女性乳腺纤维腺瘤和正常乳腺组织的细胞组成，揭示了纤维腺瘤中上皮细胞的独特结构变化和功能特征，并开发了一种可扩展的人类纤维腺瘤类器官系统，探索了潜在的治疗策略。 | 首次利用单细胞RNA测序技术详细描述了纤维腺瘤的细胞组成和结构变化，并开发了可扩展的纤维腺瘤类器官系统，为纤维腺瘤的治疗提供了新的策略。 | 研究主要集中在细胞和类器官水平，尚未进行临床试验验证治疗策略的有效性。 | 揭示纤维腺瘤的细胞组成和结构变化，探索潜在的治疗方法。 | 女性乳腺纤维腺瘤和正常乳腺组织的上皮细胞。 | 数字病理学 | 乳腺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 人类纤维腺瘤和正常乳腺组织样本 |
| 17670 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome dataset of human and mouse in vitro adipogenesis models
2023-06-16, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02293-x
PMID:37328521
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研究论文 | 本文介绍了人类和小鼠体外脂肪形成模型的单细胞转录组数据集 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成前后的转录变化 | NA | 研究脂肪形成过程中细胞间的转录变异 | 3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成前后的转录变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 混合的3T3-L1和SGBS细胞 |
| 17671 | 2024-08-07 |
Discovery and characterization of potent pan-variant SARS-CoV-2 neutralizing antibodies from individuals with Omicron breakthrough infection
2023-06-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39267-x
PMID:37322000
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和BCR测序，从接种过疫苗并感染奥密克戎变异株的患者中发现了针对多种SARS-CoV-2变异株的中和抗体 | 本文首次从奥密克戎突破感染患者的恢复期血浆中筛选出具有广谱中和活性的抗体，并通过冷冻电镜分析揭示了多种刺突蛋白识别模式 | NA | 开发针对多种SARS-CoV-2变异株的广谱抗病毒药物 | 从奥密克戎突破感染患者的B细胞中筛选出具有广谱中和活性的抗体 | 生物技术 | 新冠肺炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和BCR测序（scBCR-seq） | NA | 基因序列 | 来自接种过2或3剂灭活疫苗并感染奥密克戎变异株的患者 |
| 17672 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing of stria vascularis cells in the adult Slc26a4-/- mouse
2023-06-15, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01549-0
PMID:37322474
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了Slc26a4-/-小鼠的血管纹细胞，以识别可能影响内淋巴pH稳态的pH调节因子及其细胞致病机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了Slc26a4-/-小鼠血管纹细胞的基因表达谱，揭示了pH依赖性变化及其在SLC26A4相关听力损失中的潜在作用 | NA | 识别影响内淋巴pH稳态的pH调节因子及其细胞致病机制 | Slc26a4-/-小鼠的血管纹细胞 | 数字病理学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型（WT, Slc26a4+/+）和Slc26a4-/-小鼠的血管纹细胞 |
| 17673 | 2024-08-07 |
Formation of Müller glia-derived progenitor cells in retinas depleted of microglia
2023-Jun-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.08.544205
PMID:37333380
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研究论文 | 研究通过scRNA-seq技术分析了在鸡视网膜中微胶质细胞缺失后Müller胶质细胞的转录变化，探讨了微胶质细胞对Müller胶质细胞衍生前体细胞形成的影响。 | 首次揭示了微胶质细胞在视网膜损伤后通过调节HBEGF、FGF和视黄酸信号通路促进Müller胶质细胞向增殖性前体细胞转化的作用。 | 研究主要集中在鸡视网膜模型，可能需要进一步在其他物种中验证这些发现。 | 探讨微胶质细胞在视网膜损伤后对Müller胶质细胞衍生前体细胞形成的影响。 | 鸡视网膜中的Müller胶质细胞和微胶质细胞。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 鸡视网膜样本 |
| 17674 | 2024-08-07 |
Revealing the Organ-Specific Expression of SPTBN1 using Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2023-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.01.543198
PMID:37333135
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了三个与骨骨折相关且在肌肉组织中高表达的标记基因在成人细胞图谱（AHCA）中15种器官组织类型中的表达情况 | 首次揭示了SPTBN1基因在多个器官类型中的高表达，特别是在纤维母细胞、平滑肌细胞和组织干细胞中的表达 | 研究仅限于分析三个标记基因在15种器官组织类型中的表达，未涉及这些基因在其他组织或疾病中的作用 | 分析三个标记基因在单细胞水平上对不同组织和器官发育的贡献 | 三个标记基因在成人细胞图谱（AHCA）中15种器官组织类型中的表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 84,363个细胞和228,508个基因 |
| 17675 | 2024-08-07 |
Illuminating Dark Proteins using Reactome Pathways
2023-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.05.543335
PMID:37333417
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研究论文 | 利用Reactome通路数据库，通过集成多种资源和随机森林分类器，预测暗蛋白与已知蛋白的功能相互作用，并开发评分系统评估这些相互作用，结合单细胞RNA测序数据和自然语言处理分析，增强对暗蛋白生物学功能和治疗潜力的理解。 | 首次利用Reactome通路数据库和随机森林分类器预测暗蛋白的功能相互作用，并开发新的评分系统评估这些相互作用，结合单细胞RNA测序数据和自然语言处理分析，增强对暗蛋白的理解。 | NA | 揭示暗蛋白的生物学功能和潜在治疗应用 | 暗蛋白及其在生物通路中的功能相互作用 | 生物信息学 | NA | 随机森林分类器，自然语言处理 | 随机森林 | 文本，基因表达数据 | 106个蛋白质/基因成对特征，2200万个PubMed摘要，20个随机选择的暗蛋白 |
| 17676 | 2024-08-07 |
scRNA-seq Analysis of Hemocytes of Penaeid Shrimp Under Virus Infection
2023-Jun, Marine biotechnology (New York, N.Y.)
DOI:10.1007/s10126-023-10221-8
PMID:37326798
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研究论文 | 本研究使用Drop-seq技术分析了人工感染病毒的日本对虾（Penaeus japonicus）血细胞在病毒感染下的变化 | 本研究首次在非模式生物中使用单细胞RNA测序技术分析了病毒感染对血细胞的影响，并发现了新的抗菌肽基因 | 研究仅限于特定种类的虾和特定的病毒感染，可能不适用于其他物种或病毒 | 旨在更好地理解非模式生物如虾和其他海洋无脊椎动物的免疫相关细胞 | 日本对虾的血细胞在病毒感染下的变化 | 数字病理学 | NA | Drop-seq | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 17677 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing in cornea research: Insights into limbal stem cells and their niche regulation
2023-May-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v15.i5.466
PMID:37342216
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在角膜研究领域的应用，特别是对角膜缘干细胞及其微环境的最新发现 | 介绍了单细胞RNA测序技术揭示的角膜缘干细胞群体的异质性、新的干细胞标志物及其微环境的调控机制 | NA | 总结单细胞RNA测序在角膜研究中的最新进展，为临床治疗如角膜上皮伤口愈合、眼表重建及相关疾病干预提供参考 | 角膜缘干细胞及其微环境 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 17678 | 2024-08-05 |
Quantifying Intratumoral Heterogeneity and Immunoarchitecture Generated In-Silico by a Spatial Quantitative Systems Pharmacology Model
2023-May-13, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15102750
PMID:37345087
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研究论文 | 本文探讨了通过空间定量系统药理学模型量化肿瘤内异质性和免疫结构。 | 该研究采用了一种混合模型，将整体患者的分隔定量系统药理学模型与描述肿瘤微环境的空间基于代理的模型结合起来，以量化肿瘤内异质性。 | 由于样本收集时间点的不确定性和数据的局限性，全面理解肿瘤内异质性的作用仍然具有挑战性。 | 该研究的目的是定量评估肿瘤内异质性及其对治疗反应的影响。 | 研究对象为不同类型的肿瘤微环境及其在有效和无效抗PD-1治疗下的免疫结构。 | 数字病理学 | 肿瘤 | 定量系统药理学模型 | 混合模型、基于代理的模型 | 模拟数据 | 代表性的案例 |
| 17679 | 2024-08-05 |
The Black Hole: CAR T Cell Therapy in AML
2023-May-11, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15102713
PMID:37345050
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综述 | 本文讨论了急性髓性白血病中CAR T细胞疗法的独特治疗挑战及新策略 | 提出了针对急性髓性白血病的CAR T细胞和其他细胞治疗的新观念和策略 | 目前仅约30%的患者对治疗有反应，并且存在显著的肿瘤外副作用 | 探讨急性髓性白血病的细胞疗法及其面临的挑战 | 急性髓性白血病患者的CAR T细胞疗法 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞测序 | NA | DNA、表观遗传、RNA和蛋白质数据 | 约100名患者 |
| 17680 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of the basement membrane in lung adenocarcinoma by bulk and single-cell sequencing analysis
2023, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.83407
PMID:37325048
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研究论文 | 本文评估了基底膜在肺腺癌中的临床作用，并探讨了其机制 | 首次通过一系列差异表达基因发现了37个BM-DEG，并建立了基于4个BM-DEG的预后模型 | 研究可能受到样本异质性和实验设计限制的影响 | 阐明基底膜在肺腺癌进展中的作用 | 1383名肺腺癌患者的临床数据和基因表达信息 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，Cox回归分析 | NA | 基因表达数据 | 1383名肺腺癌患者 |