单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 17641 - 17660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17641 | 2024-08-07 |
Repurposing of the multiciliation gene regulatory network in fate specification of Cajal-Retzius neurons
2023-08-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.05.011
PMID:37321213
|
research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术重构了从小鼠海马体衍生的Cajal-Retzius神经元的分化轨迹，并揭示了控制多纤毛生成的完整基因模块在Cajal-Retzius神经元中的短暂表达。 | 研究展示了如何重新利用一个完整的基因模块来控制不同的过程，从而有助于新细胞身份的出现。 | NA | 探讨Cajal-Retzius神经元的命运特化过程中多纤毛基因调控网络的重新利用。 | Cajal-Retzius神经元及其在脑皮质发育中的作用。 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠海马体衍生的Cajal-Retzius神经元样本 |
| 17642 | 2024-08-07 |
The maturation and aging trajectory of Marchantia polymorpha at single-cell resolution
2023-08-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.05.014
PMID:37321217
|
研究论文 | 本文利用时间分辨的单细胞RNA测序技术，定义了Marchantia polymorpha在无性繁殖阶段的细胞分类学，并识别了其主要植物体在单细胞分辨率下的成熟和衰老轨迹。 | 首次在单细胞分辨率下定义了Marchantia polymorpha的细胞类型和转录状态，揭示了其时间和空间上的发育和衰老过程。 | NA | 研究苔藓植物Marchantia polymorpha的细胞异质性及其在时间和空间上的发育和衰老过程。 | Marchantia polymorpha的细胞类型和转录状态。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 17643 | 2024-08-05 |
Ruxolitinib improves hematopoietic regeneration by restoring mesenchymal stromal cell function in acute graft-versus-host disease
2023-08-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI162201
PMID:37338986
|
研究论文 | 该论文探讨了ruxolitinib如何通过恢复间充质基质细胞功能来改善急性移植物抗宿主病中的造血恢复。 | 此研究首次全面分析了急性移植物抗宿主病中骨髓间充质基质细胞的功能损伤，并提出ruxolitinib可以通过JAK2/STAT1途径直接恢复其功能。 | 该研究主要基于小鼠模型，临床转化的具体过程和效果仍需进一步验证。 | 研究目的是解决急性移植物抗宿主病所导致的造血功能障碍问题。 | 研究对象包括小鼠模型和患者样本中的非造血性骨髓细胞。 | 数字病理学 | 急性移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | haplo-MHC匹配小鼠移植模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型及患者样本，但确切样本数量未提供 |
| 17644 | 2024-08-07 |
AGRN promotes lung adenocarcinoma progression by activating Notch signaling pathway and acts as a therapeutic target
2023-08, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2023.106819
PMID:37321467
|
研究论文 | 本研究探讨了AGRN在肺腺癌进展中的作用及其通过激活Notch信号通路的机制 | 首次阐明了AGRN在肺腺癌中的上调表达及其通过与NOTCH1相互作用激活Notch信号通路的机制 | 研究样本量有限，需要进一步的大规模临床研究验证 | 揭示AGRN在肺腺癌发展中的作用及其调控机制，并探索其作为治疗靶点的潜力 | AGRN在肺腺癌中的表达及其对肿瘤细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡的影响 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | RNA | 120名肺腺癌患者 |
| 17645 | 2024-08-07 |
Innovations advancing our understanding of microglia in Alzheimer's disease: From in vitro to in vivo models
2023-08, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.15885
PMID:37323026
|
综述 | 本文综述了近年来在阿尔茨海默病中对小胶质细胞研究的创新方法，包括使用人多能干细胞（hPSC）衍生的小胶质细胞在2D或3D培养系统中的应用，以及将hPSC衍生的小胶质细胞异种移植到小鼠大脑中 | 引入了人多能干细胞衍生的小胶质细胞模型，以及单细胞RNA测序和脑类器官培养等新技术 | 现有研究常受限于仅能代表人类组织的一个时间点或由于物种间小胶质细胞转录组、蛋白质组和细胞状态的差异 | 提高对阿尔茨海默病中小胶质细胞复杂作用的认识 | 小胶质细胞在阿尔茨海默病中的作用 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 17646 | 2024-08-07 |
Optimization of method for achieving a single-cell suspension from mouse corneas
2023-08, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2023.109544
PMID:37336469
|
研究论文 | 本研究旨在优化从鼠角膜中获取单细胞悬液的方法，以用于单细胞RNA测序技术 | 研究比较了五种不同的鼠角膜消化方法，确定了最佳的消化方案 | 研究仅限于鼠角膜，未涉及其他组织或物种 | 优化从鼠角膜中获取单细胞悬液的方法，以用于单细胞RNA测序 | 鼠角膜 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 5个鼠角膜 |
| 17647 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics of Epstein-Barr Virus and Human Herpesvirus 6 Coinfection
2023-Jul-18, Microbiology resource announcements
IF:0.7Q4
DOI:10.1128/mra.00342-23
PMID:37338391
|
研究论文 | 本文描述了同时感染埃博病毒和人类疱疹病毒6型的单细胞转录组学研究 | 首次在单细胞水平上探讨EBV和HHV-6的共感染及其相互作用 | 未涉及感染过程中其他细胞类型的作用 | 研究EBV和HHV-6共感染在单细胞层面的转录组特征 | 两种携带EBV和HHV-6的淋巴母细胞系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 两个淋巴母细胞系 |
| 17648 | 2024-08-07 |
Spatial Reconstruction of Oligo and Single Cells by De Novo Coalescent Embedding of Transcriptomic Networks
2023-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202206307
PMID:37323105
|
研究论文 | 本文提出了一种新的算法D-CE，用于从头合并非单细胞转录组网络，以重建单细胞的三维空间组织 | D-CE算法通过保留中尺度网络组织，能够捕捉空间域，识别空间表达基因，并重建细胞样本的三维空间分布 | NA | 解决从头重建单细胞三维空间组织的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | D-CE算法 | 转录组数据 | 14个数据集和497个重建 |
| 17649 | 2024-08-07 |
Lactation-associated macrophages exist in murine mammary tissue and human milk
2023-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01530-0
PMID:37337103
|
研究论文 | 本文描述了在小鼠乳腺组织和人乳中存在的哺乳期相关巨噬细胞 | 首次鉴定出哺乳期诱导的CD11cCX3CR1Dectin-1巨噬细胞群体（liMac），并发现其在哺乳期通过增殖在原地扩张，且部分依赖于微生物群 | NA | 研究哺乳期乳腺腺体巨噬细胞的动态变化 | 小鼠乳腺组织和人乳中的巨噬细胞 | NA | NA | 多参数流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 17650 | 2024-08-07 |
Progenitor hierarchy among parietal epithelial cells depicted at the single-cell level
2023-07, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.04.019
PMID:37349059
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术进一步描述了壁上皮细胞（PECs）在肾脏功能和疾病中的作用，并确认了其在小鼠肾脏生物学中的关键病理生理作用。 | 利用单细胞RNA测序技术详细描绘了壁上皮细胞的祖细胞层次结构。 | NA | 探讨壁上皮细胞在肾脏功能和疾病中的作用。 | 壁上皮细胞（PECs）及其在肾脏中的祖细胞类型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 17651 | 2024-08-07 |
Modelling viral encephalitis caused by herpes simplex virus 1 infection in cerebral organoids
2023-07, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01405-y
PMID:37349587
|
研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序、电生理学和免疫染色技术，研究了人脑类器官中由单纯疱疹病毒1型（HSV-1）引起的病毒性脑炎 | 本文首次在人脑类器官中模拟了HSV-1感染，并探讨了抗炎药物与抗病毒治疗结合的可能性 | NA | 研究HSV-1感染对脑类器官的影响及潜在的治疗策略 | 人脑类器官中的HSV-1感染 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 17652 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals maturation of transplanted stem cell-derived retinal pigment epithelial cells toward native state
2023-06-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2214842120
PMID:37339216
|
研究论文 | 该研究揭示了移植的干细胞来源的视网膜色素上皮细胞向原生状态的成熟过程 | 研究首次使用单细胞RNA测序分析了移植的视网膜色素上皮细胞的转录特征，并发现了其向成人原生视网膜色素上皮状态的单向成熟过程 | 对移植RPE细胞如何与宿主视网膜相互作用的理解仍然有限 | 探索干细胞来源的视网膜色素上皮细胞在受体视网膜中的生存和成熟机制 | 免疫功能正常的兔子中的干细胞来源的视网膜色素上皮细胞 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 在免疫功能正常的兔子中移植了干细胞来源的视网膜色素上皮细胞，具体样本数量未提供 |
| 17653 | 2024-08-05 |
Unique evolution of foraminiferal calcification to survive global changes
2023-06-23, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add3584
PMID:37343099
|
研究论文 | 本研究揭示了有孔虫的钙化机制及其对海洋酸化的反应 | 识别了独特的α-碳酸酐酶基因，揭示了应对海洋酸化的钙化控制机制 | 未广泛测量其他有孔虫物种的钙化机制，可能限制了普适性 | 探索有孔虫的钙化机制以理解其对全球变化的适应 | 主要研究有孔虫及其钙化相关基因 | 生物地球化学 | NA | 单细胞转录组学和荧光显微镜 | NA | 基因数据 | 个别有孔虫样本 |
| 17654 | 2024-08-05 |
CCL24 regulates biliary inflammation and fibrosis in primary sclerosing cholangitis
2023-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.162270
PMID:37345655
|
研究论文 | 本研究探讨了CCL24在原发性硬化性胆管炎中的作用及其潜在的治疗效果 | 首次验证了CCL24在原发性硬化性胆管炎中的关键作用，并评估了其作为治疗靶点的潜力 | 实验主要基于小鼠模型，临床适用性需进一步研究验证 | 评估CCL24在原发性硬化性胆管炎中的作用及其抑制对疾病的影响 | 原发性硬化性胆管炎及相关的肝脏炎症和纤维化 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 针对CCL24的单克隆抗体CM-101以及空间转录组学 | Mdr2-/-小鼠模型 | 组织样本和血清样本 | 使用了Mdr2-/-小鼠模型并分析了PSC患者的肝活检和血清样本 |
| 17655 | 2024-08-07 |
Nanoparticle-enhanced proton beam immunoradiotherapy drives immune activation and durable tumor rejection
2023-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.167749
PMID:37345658
|
研究论文 | 本文研究了纳米颗粒增强的质子束免疫放疗在驱动免疫激活和持久肿瘤排斥中的作用 | 首次研究了质子束疗法作为组合免疫放疗策略的效果，并展示了纳米颗粒NBTXR3在增强免疫反应中的显著作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探索质子束疗法与免疫疗法结合在肿瘤治疗中的效果 | 小鼠的肺癌模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 质子束疗法（PBT） | NA | RNA测序数据 | 使用双肿瘤肺癌模型的小鼠 |
| 17656 | 2024-08-05 |
Interactions between MFAP5 + fibroblasts and tumor-infiltrating myeloid cells shape the malignant microenvironment of colorectal cancer
2023-06-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04281-6
PMID:37344903
|
研究论文 | 本研究探讨了MFAP5 + 成纤维细胞与肿瘤浸润性髓系细胞之间的相互作用如何影响结直肠癌的恶性微环境 | 本研究揭示了肿瘤特异性MFAP5 + 成纤维细胞与髓系细胞之间的动态相互作用，并识别出多个肿瘤促进信号通路 | 未提供研究的具体局限性 | 探索结直肠癌中MFAP5 + 成纤维细胞与肿瘤浸润性髓系细胞之间的相互作用及其对肿瘤微环境的影响 | 主要研究MFAP5 + 成纤维细胞及其与肿瘤浸润性髓系细胞的相互作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 27,414个细胞，来自肿瘤及相邻组织 |
| 17657 | 2024-08-05 |
HOPX is a tumor-suppressive biomarker that corresponds to T cell infiltration in skin cutaneous melanoma
2023-Jun-21, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-023-02962-2
PMID:37344870
|
研究论文 | HOPX作为一个肿瘤抑制生物标志物，与皮肤黑色素瘤中的T细胞浸润相关 | HOPX被确认为在SKCM进展中的抑制因子，并可能成为新的免疫治疗靶点 | HOPX在SKCM中的具体功能尚不明确，需要进一步研究 | 探讨HOPX在皮肤黑色素瘤患者中的诊断和预后价值 | 皮肤黑色素瘤患者，特别是HOPX表达的影响 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞测序，转录组测序 | A375细胞系 | 生物数据 | 使用TCGA和GEO数据库的多种样本，具体样本数量未提供 |
| 17658 | 2024-08-05 |
Joint inference of exclusivity patterns and recurrent trajectories from tumor mutation trees
2023-06-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39400-w
PMID:37344522
|
研究论文 | 本文提出了一种新的概率框架TreeMHN，用于从肿瘤进化树共同推断排斥模式和重复轨迹 | 创新点在于TreeMHN能同时处理肿瘤的排斥模式和进化轨迹的推断 | 未提及现有方法在多个方面的不足 | 旨在通过肿瘤变异树推断肿瘤的进化过程和突变模式 | 分析血液、肺部和乳腺癌的数据集 | 数字病理学 | 肺癌 | 多区域和单细胞测序 | TreeMHN | 数据集 | NA |
| 17659 | 2024-08-07 |
Selective oxidative protection leads to tissue topological changes orchestrated by macrophage during ulcerative colitis
2023-06-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39173-2
PMID:37344477
|
研究论文 | 本研究利用成像质谱流式细胞技术和单细胞RNA测序技术，描绘了人类结肠生态系统的单细胞景观，并探讨了溃疡性结肠炎中组织拓扑结构的变化及其机制。 | 本研究首次揭示了溃疡性结肠炎区域中组织驻留巨噬细胞的消失反应，并提出了炎症巨噬细胞替代驻留巨噬细胞的机制。 | NA | 理解溃疡性结肠炎生态系统的组成和空间变化 | 人类结肠生态系统的单细胞景观 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 成像质谱流式细胞技术，单细胞RNA测序 | NA | 图像，基因表达数据 | NA |
| 17660 | 2024-08-07 |
Integrative scATAC-seq and scRNA-seq analyses map thymic iNKT cell development and identify Cbfβ for its commitment
2023-Jun-20, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00547-x
PMID:37336875
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）技术，分析了超过17,000个iNKT细胞的转录组和超过39,000个iNKT细胞的染色质可及性状态，以描绘胸腺中iNKT细胞的发育轨迹并识别关键的转录因子Cbfβ。 | 本研究首次揭示了iNKT细胞在胸腺中的发育程序及其细胞异质性，并发现了一个新的转录因子Cbfβ，该因子在iNKT细胞早期承诺阶段起关键作用。 | NA | 揭示胸腺中iNKT细胞的发育程序及其细胞异质性，并识别关键的转录因子。 | iNKT细胞的发育过程及其分子机制。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 转录组和染色质可及性数据 | 超过17,000个iNKT细胞的转录组和超过39,000个iNKT细胞的染色质可及性状态 |