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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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17641 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics provides insights into the origin and immune microenvironment of cervical precancerous lesions
2023-09, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12451
PMID:37272256
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
17642 | 2024-08-07 |
Identification of evolutionary mechanisms of myelomatous effusion by single-cell RNA sequencing
2023-08-08, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022009477
PMID:37276129
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序分析了骨髓、外周血和胸腔积液/腹水中的转录组,以识别多发性骨髓瘤浆膜腔积液的进化机制 | 本研究首次定义了外周起始细胞(EMICs)并发现LILRB4在其中的上调,证实了LILRB4促进骨髓瘤细胞的体外迁移 | 研究样本量较小,仅涉及3名患者 | 探索多发性骨髓瘤浆膜腔积液的分子机制 | 骨髓、外周血和胸腔积液/腹水中的细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3名患者 |
17643 | 2024-08-05 |
Somatosensory neuron types and their neural networks as revealed via single-cell transcriptomics
2023-08, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2023.05.005
PMID:37268541
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在脊髓后根神经节(DRG)神经元类型及其神经网络研究中的应用 | 整合了以往DRG转录组研究的发现,并提出进一步研究的建议 | 缺乏统一的分类标准,使得DRG神经元的类型鉴定存在困难 | 旨在全面了解DRG神经元的转录状态及其在生理和慢性疼痛中的作用 | 主要研究脊髓后根神经节中的不同类型神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
17644 | 2024-08-07 |
Mapping the transcriptional landscape of human white and brown adipogenesis using single-nuclei RNA-seq
2023-08, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2023.101746
PMID:37286033
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研究论文 | 通过单核RNA测序技术研究人类白色和棕色脂肪细胞分化的转录组动态变化 | 首次使用单核RNA测序技术构建了人类白色和棕色脂肪细胞分化的高分辨率转录组图谱,并发现了新的转录因子TRPS1在脂肪细胞分化中的作用 | 研究仅限于单个个体的颈部区域细胞,可能无法完全代表所有人群 | 深入理解人类脂肪细胞分化的分子调控机制 | 人类白色和棕色脂肪细胞的分化过程 | 数字病理学 | 代谢疾病 | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | RNA序列 | 超过20,000个正在分化的白色和棕色前脂肪细胞 |
17645 | 2024-08-05 |
Multimodal single-cell analysis of nonrandom heteroplasmy distribution in human retinal mitochondrial disease
2023-07-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165937
PMID:37289546
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研究论文 | 本文研究了人类视网膜线粒体疾病中非随机的线粒体异质性分布现象 | 首次揭示了病态m.3243A>G等位基因在多种细胞类型中的分布模式及其对表型表现的影响 | 研究仅限于特定疾病(MELAS)和样本,可能无法普遍适用于所有线粒体疾病 | 探讨线粒体异质性在不同细胞类型中的分布及其与表型表达的关系 | 研究对象为视网膜细胞,包括来自MELAS患者和健康对照供体的细胞 | 数字病理学 | 线粒体疾病 | 单细胞RNA测序、线粒体单细胞ATAC测序及多模式单细胞测序 | NA | 细胞转录组、染色质可及性状态和异质性数据 | 涉及MELAS患者和健康对照供体的视网膜细胞 |
17646 | 2024-08-05 |
scDFC: A deep fusion clustering method for single-cell RNA-seq data
2023-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad216
PMID:37280190
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研究论文 | 提出了一种新的单细胞深度融合聚类模型用于分析单细胞RNA-seq数据 | 通过引入属性特征聚类模块和结构注意力特征聚类模块,综合利用细胞属性和结构信息 | 未提及具体的局限性 | 旨在通过深度聚类方法研究肿瘤异质性 | 单细胞RNA-seq数据的细胞亚群体和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肿瘤 | RNA-seq | 深度学习聚类 | 基因表达数据 | NA |
17647 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq unravels T cell-related prognostic risk model and tumor immune microenvironment modulation in triple-negative breast cancer
2023-07, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107066
PMID:37263064
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研究论文 | 这项研究揭示了三阴性乳腺癌中与T细胞相关的预后风险模型及肿瘤免疫微环境调节 | 首次整合分析单细胞RNA测序和大规模RNA测序,以建立和验证T细胞标记基因的预后风险模型 | 研究主要依赖公开数据库,可能存在数据偏差 | 加深对三阴性乳腺癌中T细胞异质性及其预后风险模型的理解 | 三阴性乳腺癌患者的T细胞及其与免疫微环境的关系 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 25,932个细胞 |
17648 | 2024-08-05 |
Cerebellar axonopathy in Shivers horses identified by spatial transcriptomic and proteomic analyses
2023 Jul-Aug, Journal of veterinary internal medicine
IF:2.1Q1
DOI:10.1111/jvim.16784
PMID:37288990
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和蛋白质组学分析识别出Shivers马的 cerebellar神经轴突病变 | 本研究揭示了Shivers马在侧小脑半球基因表达和蛋白质表达的区域特异性差异,强调了神经炎症与轴突退化的关系 | 研究样本量较小,仅包含5个Shivers马和4个对照马 | 分析Shivers马与对照马在基因和蛋白质表达上的差异 | Shivers马(5匹)与对照马(4匹) | 数字病理 | NA | 空间转录组学,串联质谱标记蛋白质组学 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 9匹马(5匹Shivers马,4匹对照马) |
17649 | 2024-08-07 |
Heritable transcriptional defects from aberrations of nuclear architecture
2023-Jul, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06157-7
PMID:37286600
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研究论文 | 本文探讨了核内微核和染色体桥等异常结构对遗传转录抑制的影响 | 首次识别微核和染色体桥作为遗传转录抑制的来源,并使用长时程活细胞成像和单细胞RNA测序技术进行验证 | 文中提到的转录抑制改变的穿透性异质性可能导致研究结果的解释存在一定的不确定性 | 揭示导致表观遗传变异的机制,特别是在癌症中的作用 | 癌细胞中的微核和染色体桥 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
17650 | 2024-08-05 |
A single-cell level comparison of human inner ear organoids with the human cochlea and vestibular organs
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112623
PMID:37289589
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研究论文 | 本文展示了人类多能干细胞衍生的内耳类器官与人类耳蜗和前庭器官的比较 | 提出了利用单细胞转录组学评估内耳类器官的细胞类型异质性 | 当前组织培养模型缺乏足够的细胞类型多样性来研究内耳疾病 | 研究内耳类器官及其在内耳发育和疾病中的潜在应用 | 采用单细胞转录组学分析人类胎儿和成人内耳组织的细胞类型 | 数字病理学 | 耳部疾病 | 单细胞转录组学 | 内耳类器官 | 组织 | NA |
17651 | 2024-08-07 |
Intravenous heterologous prime-boost vaccination activates innate and adaptive immunity to promote tumor regression
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112599
PMID:37279110
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研究论文 | 本文研究了一种异源初免-加强疫苗策略,使用自组装肽纳米颗粒TLR-7/8激动剂(SNP)疫苗初免和黑猩猩腺病毒(ChAdOx1)疫苗加强,以激活先天和适应性免疫,促进肿瘤消退。 | 首次证明了静脉注射异源初免-加强疫苗策略能有效增强CD8 T细胞反应和肿瘤消退,且这种效应依赖于I型IFN信号传导。 | NA | 研究一种新的异源初免-加强疫苗策略,以提高肿瘤治疗效果。 | 异源初免-加强疫苗策略对肿瘤免疫的影响。 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型MC38肿瘤 |
17652 | 2024-08-05 |
Integrated spatial transcriptome and metabolism study reveals metabolic heterogeneity in human injured brain
2023-06-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101057
PMID:37263268
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research paper | 本研究揭示了人类受损大脑中的代谢异质性 | 文章创新性在于结合空间转录组学和代谢研究,生成了一种全面的分子标记,展示了人类受伤大脑中多样的代谢变化 | NA | 旨在整合空间组织和功能方向的生物学理解 | 六名脑外伤患者的外科样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据及代谢物数据 | 六名脑外伤患者的外科样本 |
17653 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals ependymal subtypes related to cytoskeleton dynamics as the core driver of syringomyelia pathological development
2023-Jun-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106850
PMID:37275526
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研究论文 | 本研究揭示了与细胞骨架动态相关的脑室细胞亚型,这些亚型是脊髓囊肿病理发展的核心驱动因素 | 首次通过单细胞转录组学分析揭示了脊髓囊肿中脑室细胞亚型的动态变化及其与细胞骨架的关系 | 在研究中仅使用了一种可逆模型,可能无法完全模拟所有临床特征 | 研究脊髓囊肿发生和发展过程中的时空病理改变 | 主要研究脑室细胞(EPCs)、少突胶质细胞谱系和小胶质细胞的动态变化 | 数字病理学 | 脊髓囊肿 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
17654 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptional Mapping Reveals Site-Specific Pathways Underlying Human Atherosclerotic Plaque Rupture
2023-06-13, Journal of the American College of Cardiology
IF:21.7Q1
DOI:10.1016/j.jacc.2023.04.008
PMID:37286250
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研究论文 | 本研究探讨了动脉粥样硬化斑块破裂的确切位置和潜在机制。 | 首次通过空间转录组学在动脉粥样硬化中确定了斑块破裂易感区域的转录特征。 | 研究主要集中在颈动脉斑块,可能无法广泛应用于其他类型的动脉粥样硬化。 | 研究动脉粥样硬化斑块破裂的机制并识别针对心血管事件的治疗靶点。 | 研究对象为人类颈动脉的动脉粥样硬化斑块。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 组织样本 | 人类颈动脉斑块样本 |
17655 | 2024-08-07 |
[Applications and advances of spatial transcriptomics in oncology research]
2023-Jun-08, Zhonghua bing li xue za zhi = Chinese journal of pathology
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
17656 | 2024-08-05 |
Tox4 regulates transcriptional elongation and reinitiation during murine T cell development
2023-06-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04992-y
PMID:37286708
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研究论文 | 本研究揭示了HMG蛋白Tox4在小鼠T细胞发育中的作用 | 首次揭示Tox4在小鼠T细胞发育中调控转录延长与重新启动的机制 | 研究主要集中在小鼠模型,可能存在物种间差异 | 探究Tox4在小鼠T细胞发育中的功能 | 小鼠模型中的T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
17657 | 2024-08-07 |
Combined lineage tracing and scRNA-seq reveals unexpected first heart field predominance of human iPSC differentiation
2023-Jun-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80075
PMID:37284748
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研究论文 | 本文开发了一种TBX5/MYL2谱系追踪报告系统,并结合单细胞RNA测序技术,研究了人类诱导多能干细胞在心脏分化过程中第一心脏场的主导地位。 | 首次在人类诱导多能干细胞中使用谱系追踪和单细胞RNA测序技术,揭示了第一心脏场在心脏分化中的主导地位。 | 研究仅限于二维分化协议和两个独立的人类诱导多能干细胞系。 | 探索人类诱导多能干细胞在心脏分化过程中第一和第二心脏场的起源和分化。 | 人类诱导多能干细胞的心脏分化过程。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12个时间点的数据,涉及两个独立的人类诱导多能干细胞系 |
17658 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling reveals a potent role of quercetin in promoting hair regeneration
2023-06-07, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwac062
PMID:37285263
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研究论文 | 本文报道了外用槲皮素(Que)刺激休眠毛囊生长,促进小鼠毛囊角质细胞增殖和毛囊周围微血管再生的研究 | 首次构建了动态单细胞转录组图谱,揭示了槲皮素治疗促进毛囊分化轨迹和真皮内皮细胞血管生成特征的分子机制 | NA | 探讨槲皮素在促进毛发生长中的作用及其分子机制 | 小鼠毛囊和真皮内皮细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组 | NA |
17659 | 2024-08-07 |
Protocol for analyzing γδ T cells from the vagina of diet-induced obese mice using single-cell RNA sequencing and flow cytometry
2023-Jun-07, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102278
PMID:37289592
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研究论文 | 本文介绍了一种从饮食诱导的肥胖小鼠阴道中分析γδ T细胞的协议,使用单细胞RNA测序和流式细胞术 | 本文提供了一种新的方法来研究肥胖对性传播疾病易感性的影响,特别是通过分析阴道中的γδ T细胞 | NA | 研究肥胖如何影响性传播疾病的易感性,特别是通过分析阴道中的γδ T细胞 | 饮食诱导的肥胖小鼠阴道中的γδ T细胞 | 数字病理学 | 性传播疾病 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
17660 | 2024-08-05 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal changes in cell heterogeneity during progression of human tendinopathy
2023-06-06, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01613-2
PMID:37280595
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研究论文 | 本研究利用单细胞和空间RNA测序揭示了人类肌腱病进展中的细胞异质性变化 | 创新点在于构建了健康和疾病人类肌腱的细胞图谱,并探讨了细胞亚型的空间分布变化 | 本研究未提及具体的限制因素 | 本研究旨在理解肌腱病进展中的细胞异质性和分子机制 | 研究对象为健康和患病的人类肌腱细胞 | 数字病理学 | 肌腱病 | 单细胞RNA测序及空间RNA测序 | NA | 细胞数据 | 大约35,000个细胞 |