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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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17621 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics combined with proteomics of intrathecal IgG reveal transcriptional heterogeneity of oligoclonal IgG-secreting cells in multiple sclerosis
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1189709
PMID:37362001
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学和质谱分析研究了多发性硬化症中产生寡克隆IgG的细胞异质性 | 首次结合单细胞RNA-seq数据和IgG质谱分析,明确了多发性硬化症中产生寡克隆IgG的B细胞谱系 | 研究未充分探讨其他潜在细胞类型的影响,可能限制对整体免疫环境的理解 | 确定多发性硬化症中产生寡克隆IgG的B细胞的表型和来源 | 多发性硬化症患者的脑脊液中的B细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA-seq和质谱分析 | NA | RNA数据和蛋白质数据 | NA |
17622 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing in primary intraocular tumors: understanding heterogeneity, the microenvironment, and drug resistance
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1194590
PMID:37359513
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综述 | 本文重点讨论了单细胞测序在评估视网膜母细胞瘤和葡萄膜黑色素瘤患者中的应用 | 单细胞测序为肿瘤生物学的研究提供了独特的视角,揭示了肿瘤异质性、微环境特征和细胞基因组突变 | 未提及具体的研究限制 | 探讨单细胞测序如何帮助理解肿瘤的异质性和微环境 | 研究对象为视网膜母细胞瘤和葡萄膜黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤,葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
17623 | 2024-08-07 |
Integrated multi-omics analyses reveal the altered transcriptomic characteristics of pulmonary macrophages in immunocompromised hosts with Pneumocystis pneumonia
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1179094
PMID:37359523
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了免疫缺陷宿主中肺泡巨噬细胞在肺孢子菌肺炎感染下的转录特征变化 | 首次鉴定出一组在肺孢子菌感染中起保护作用的Mmp12+巨噬细胞,并发现糖皮质激素可抑制其功能 | NA | 探究免疫抑制相关肺炎中先天免疫的异质性和代谢变化 | 免疫缺陷宿主中的肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺孢子菌肺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 野生型C57BL/6小鼠及地塞米松处理的小鼠 |
17624 | 2024-08-07 |
Dynamic heterogeneity of colorectal cancer during progression revealed clinical risk-associated cell types and regulations in single-cell resolution and spatial context
2023, Gastroenterology report
IF:3.8Q2
DOI:10.1093/gastro/goad034
PMID:37360193
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组测序技术,揭示了结直肠癌进展过程中肿瘤异质性的动态变化及其与临床风险相关的细胞类型和调控机制 | 首次详细描述了结直肠癌进展中肿瘤异质性的动态变化,并鉴定了与患者总体生存率相关的细胞类型和癌症相关调控枢纽 | 研究仅基于八个单细胞RNA测序数据集和三个空间转录组测序数据集,可能存在样本量不足的问题 | 探究结直肠癌进展过程中肿瘤异质性的动态变化及其与临床风险的关系 | 结直肠癌的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组测序(ST-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组测序数据 | 八个单细胞RNA测序数据集,三个空间转录组测序数据集 |
17625 | 2024-08-07 |
Documenting the immune response in patients with COVID-19-induced acute respiratory distress syndrome
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1207960
PMID:37363730
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了COVID-19诱导的急性呼吸窘迫综合征(ARDS)患者的免疫反应 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了COVID-19诱导的ARDS患者与对照组在单个细胞水平上的显著表型差异 | 研究仅限于外周血样本,未涉及其他组织或器官 | 深入了解COVID-19诱导的ARDS患者的细胞状态 | COVID-19诱导的ARDS患者的外周血细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个COVID-19诱导的ARDS患者的外周血样本 |
17626 | 2024-08-07 |
Constructing a cancer stem cell related prognostic model for predicting immune landscape and drug sensitivity in colorectal cancer
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1200017
PMID:37377935
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和批量转录组数据,构建了一个与癌症干细胞相关的预测结直肠癌免疫景观和药物敏感性的预后模型 | 本研究首次构建了一个包含七个基因的预后模型,能够有效区分高风险和低风险患者,并预测化疗和免疫治疗的反应 | NA | 旨在识别重要的癌症干细胞标记基因,并解析这些标记基因在结直肠癌中的作用 | 结直肠癌样本的单细胞RNA测序数据和批量转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | Lasso和stepAIC | 转录组数据 | NA |
17627 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq reveals abnormal differentiation of keratinocytes and increased inflammatory differentiated keratinocytes in atopic dermatitis
2023-Nov, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.19256
PMID:37326015
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析了中国群体特应性皮炎中角质形成细胞的异常分化和炎症表型 | 发现了特应性皮炎损伤中IL19+ IGFL1+角质形成细胞的新亚群,并探讨了IL19在角质形成细胞中的作用 | 研究样本数量有限,仅涉及五名特应性皮炎患者 | 深入分析特应性皮炎在中国人群中的转录组特征 | 来自五名成人特应性皮炎患者和四名健康对照的真皮活检样本 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞数据 | 五名特应性皮炎患者和四名健康对照 |
17628 | 2024-08-05 |
Investigation and verification of GIMAP6 as a robust biomarker for prognosis and tumor immunity in lung adenocarcinoma
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04980-z
PMID:37338641
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研究论文 | 本研究探讨了GIMAP6在肺腺癌中的预后和肿瘤免疫中的作用 | 确认GIMAP6作为一个有效的预后分子,并参与肺腺癌免疫微环境的调节 | 未提及具体的限制 | 探索GIMAP6在肺腺癌发展及肿瘤免疫中的影响 | 肺腺癌患者和细胞模型 | 数字病理 | 肺癌 | 反转录定量PCR、西方印迹、细胞计数试剂盒-8及其他细胞实验 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未提及 |
17629 | 2024-08-05 |
Comprehensive landscape of the miRNA-regulated prognostic marker LAYN with immune infiltration and stemness in pan-cancer
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04986-7
PMID:37335337
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研究论文 | 本文研究了miRNA调控的预后标志物LAYN在全癌症中的免疫浸润和干性方面的综合特征 | 揭示了LAYN在多种癌症中的功能机制,并为癌症预后、转移和免疫疗法提供了新见解 | 对LAYN的研究在全癌症的广泛性和深入性方面仍然有限 | 探讨LAYN在全癌症中的作用及其潜在的临床应用 | 主要研究了LAYN在不同类型癌症中的表达情况及其与预后的关系 | 数字病理学 | NA | 生物信息学方法和单细胞测序 | NA | 样本数据,包括健康和癌症患者的基因组数据 | 通过GTEx和TCGA数据库收集健康和癌症患者样本 |
17630 | 2024-08-07 |
Unraveling Mechanisms of Autoimmune Skin Blistering: Applying Single-Cell Transcriptomics to Pemphigus B Cells
2023-10, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.05.004
PMID:37330716
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
17631 | 2024-08-07 |
Identification a unique disulfidptosis classification regarding prognosis and immune landscapes in thyroid carcinoma and providing therapeutic strategies
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05006-4
PMID:37347261
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研究论文 | 本研究探讨了二硫化物死亡(disulfidptosis)与甲状腺癌(THCA)预后之间的关系,并基于二硫化物死亡相关基因开发了一个预后指数 | 本研究首次利用二硫化物死亡相关基因进行分类,并开发了一个新的分类系统,能够有效预测甲状腺癌患者的临床预后和药物敏感性 | NA | 研究二硫化物死亡与甲状腺癌预后的关联,并开发基于二硫化物死亡基因的预后指数 | 甲状腺癌患者及其预后 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 非负矩阵分解(NMF) | Enet模型 | 基因表达数据、体细胞突变信息、拷贝数变异数据、临床数据 | 甲状腺癌患者的基因表达数据、体细胞突变信息、拷贝数变异数据和临床数据来自TCGA数据库,单细胞转录组数据GSE184362来自GEO数据库 |
17632 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from Kimura disease patient successfully treated with dupilumab
2023-10, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.alit.2023.06.002
PMID:37349231
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
17633 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals cellular and molecular alterations in small cell lung cancer tumors following chemotherapy
2023-09-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34629
PMID:37334524
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了化疗对小细胞肺癌肿瘤微环境的影响 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了化疗后小细胞肺癌肿瘤微环境中细胞和分子水平的改变 | 研究样本量较小,仅包括五名化疗患者和五名未接受化疗的患者 | 探讨化疗如何影响小细胞肺癌的肿瘤微环境,以指导提高治疗效果 | 小细胞肺癌肿瘤微环境中的细胞和分子变化 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 五名化疗患者和五名未接受化疗的患者 |
17634 | 2024-08-07 |
High-mobility group box-1 peptide ameliorates bronchopulmonary dysplasia by suppressing inflammation and fibrosis in a mouse model
2023-09-03, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2023.06.032
PMID:37329659
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研究论文 | 本研究探讨了HMGB1肽在减轻小鼠模型中支气管肺发育不良(BPD)相关肺损伤的作用 | HMGB1肽通过抑制炎症细胞因子的释放和降低肺中可溶性胶原蛋白水平来减轻肺损伤 | NA | 研究HMGB1肽对BPD相关肺损伤的影响 | 小鼠模型中的支气管肺发育不良 | NA | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
17635 | 2024-08-05 |
Mesenchymal-like Tumor Cells and Myofibroblastic Cancer-Associated Fibroblasts Are Associated with Progression and Immunotherapy Response of Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2023-09-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-3034
PMID:37335139
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研究论文 | 本文探讨了间充质样肿瘤细胞与肌成纤维癌症相关成纤维细胞在透明细胞肾细胞癌进展及免疫疗法反应中的关系 | 介绍了透明细胞肾细胞癌细胞的上皮-间充质可塑性及与肌成纤维癌症相关成纤维细胞之间的新关系 | 未能明确所有患者在免疫检查点抑制剂治疗中的反应机制 | 探讨透明细胞肾细胞癌细胞与微环境的相互作用,以更好地预测治疗反应 | 透明细胞肾细胞癌及其微环境中的细胞群体 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 在不同疾病阶段的ccRCC和正常邻近组织(NAT)中识别了46个细胞群体 |
17636 | 2024-08-07 |
Single cell transcriptomic analysis of Graves' disease thyroid glands reveals the broad immunoregulatory potential of thyroid follicular and stromal cells and implies a major re-interpretation of the role of aberrant HLA class II expression in autoimmunity
2023-09, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2023.103072
PMID:37336012
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了格雷夫斯病甲状腺组织中甲状腺滤泡细胞和间质细胞的免疫调节潜力及其在自身免疫反应中的作用 | 首次对甲状腺滤泡细胞和甲状腺间质细胞进行单细胞转录组分析,揭示了这些细胞在自身免疫反应中的激活和抑制分子/通路,并重新解释了MHC过度表达在自身免疫中的保护作用 | 研究仅限于体外培养的细胞和有限的样本数量 | 深入研究甲状腺自身免疫反应中甲状腺组织细胞的内在特性及其对免疫耐受的影响 | 格雷夫斯病和对照组的甲状腺滤泡细胞及间质细胞 | 数字病理学 | 内分泌疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 5个格雷夫斯病甲状腺组织和4个对照甲状腺组织 |
17637 | 2024-08-07 |
CCRL2 Expression by Specialized Lung Capillary Endothelial Cells Controls NK-cell Homing in Lung Cancer
2023-09-01, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0951
PMID:37343073
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研究论文 | 本文研究了CCRL2/chemerin/CMKLR1轴在调控自然杀伤(NK)细胞向肺部迁移中的作用 | 首次揭示了CCRL2作为NK细胞向肺部迁移的关键分子,并发现其表达受表观遗传调控 | NA | 探讨CCRL2在NK细胞向肺部迁移及肺肿瘤生长中的作用 | CCRL2、chemerin、CMKLR1轴及NK细胞 | 数字病理学 | 肺肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
17638 | 2024-08-07 |
Integrated immunological analysis of single-cell and bulky tissue transcriptomes reveals the role of interactions between M0 macrophages and naïve CD4+ T cells in the immunosuppressive microenvironment of cervical cancer
2023-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107151
PMID:37348264
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研究论文 | 本研究通过综合分析宫颈癌的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,揭示了M0巨噬细胞和幼稚CD4+ T细胞之间的相互作用在宫颈癌免疫抑制微环境中的作用 | 研究发现了M0巨噬细胞和幼稚CD4+ T细胞之间的信号传导及细胞内转录因子活性在肿瘤状态下的显著改变,并通过LASSO回归模型分析了重叠基因 | 相关分子机制需要通过实验和队列研究进一步验证 | 探究宫颈癌免疫抑制微环境中免疫细胞间的相互作用及其对临床预后的影响 | 宫颈癌中的M0巨噬细胞和幼稚CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | RNA测序 | LASSO回归模型 | RNA测序数据 | NA |
17639 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing profiles reveal cell type-specific transcriptional regulation networks conditioning fungal invasion in maize roots
2023-09, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14097
PMID:37349934
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了玉米根尖细胞在真菌侵染下的转录组变化,揭示了细胞类型特异性的转录调控网络。 | 首次在单细胞水平上揭示了玉米根尖细胞对真菌侵染的细胞类型特异性免疫调控网络。 | 研究仅限于两个玉米近交系,可能需要进一步扩大样本多样性以验证结果的普遍性。 | 探究玉米根尖细胞对真菌侵染的防御机制及其转录调控网络。 | 玉米根尖细胞在真菌侵染下的转录组变化及其免疫调控网络。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 转录组数据 | 29,217个单细胞 |
17640 | 2024-08-07 |
Elevated intracellular pH of zygotes during mouse aging causes mitochondrial dysfunction associated with poor embryo development
2023-08-20, Molecular and cellular endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1016/j.mce.2023.111991
PMID:37336488
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研究论文 | 研究揭示了衰老导致小鼠受精卵内细胞质pH升高,进而引发线粒体功能障碍和胚胎发育不良的机制 | 首次发现衰老引起受精卵内细胞质pH升高,并通过单细胞转录组测序识别出与年轻和老年受精卵差异表达的120个基因 | 研究主要集中在受精卵阶段,未涉及胚胎发育后续阶段的详细机制 | 阐明衰老对小鼠植入前胚胎质量和发展不良的影响机制 | 小鼠受精卵及其基因表达 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠受精卵 |