单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31986 篇文献，本页显示第 17601 - 17620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17601 | 2024-08-05 |
The neuropeptide NMU amplifies ILC2-driven allergic lung inflammation
2017-09-21, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature24029
PMID:28902842
|
研究论文 | 这篇文章探讨了神经肽NMU在ILC2驱动的过敏性肺炎症中的作用 | 首次揭示了NMUR1信号通路在促进ILC2炎性反应中的重要性 | 尚未详细阐明ILC2在维持稳态与促进炎症之间的信号转导机制 | 识别指引ILC2促进稳态与炎症的分子信号 | 小鼠肺部常驻ILC的单细胞RNA测序和刺激后的分析 | 数字病理学 | 过敏性哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 17602 | 2024-08-05 |
CBP/Catenin antagonists: Targeting LSCs' Achilles heel
2017-08, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2017.04.010
PMID:28479420
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评论 | 这篇文章讨论了利用小分子特异性CBP/catenin拮抗剂靶向白血病干细胞的机制 | 创新点在于识别和验证了一种针对LSCs/CSCs的共同“阿基琉斯之踵”的安全有效机制 | 对LSCs和正常内源性造血干细胞之间关键机制的识别仍然是一个主要挑战 | 本文旨在研究针对白血病干细胞的治疗策略 | 研究对象为慢性髓细胞白血病和急性淋巴细胞白血病中的白血病干细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 下一代测序，单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17603 | 2024-08-05 |
Single-Cell Profiling of an In Vitro Model of Human Interneuron Development Reveals Temporal Dynamics of Cell Type Production and Maturation
2017-Mar-08, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2017.02.014
PMID:28279351
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research paper | 这篇文章描述了一种从人类胚胎干细胞生成皮质抑制神经元的协议，并分析了不同细胞类型的特性和成熟时间过程 | 文章创新性在于揭示了细胞类型的产生和成熟时间动态，模拟了体内神经元和胶质细胞的生成时间模式 | 文中未具体提及实验样本的多样性和研究的长期效果 | 研究人类抑制神经元的生成及其在神经精神疾病中的潜在应用 | 主要研究对象为从人类胚胎干细胞生成的皮质抑制神经元 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 表达数据 | 使用人类胚胎干细胞产生的皮质抑制神经元样本 | NA | NA | NA | NA |
| 17604 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of mixed-lineage states leading to a binary cell fate choice
2016-09-29, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature19348
PMID:27580035
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序结合新的分析工具，揭示了在小鼠中导致中性粒细胞或巨噬细胞分化的基因组和调控状态 | 本文引入了一种新的分析工具——迭代聚类和指导基因选择，并结合克隆形成实验，揭示了混合谱系中间状态及其动态不稳定性 | NA | 阐明细胞分化的层次状态，包括稀有的中间状态和调控基因网络 | 造血多能祖细胞和双潜能中间体的混合谱系基因表达模式 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 17605 | 2024-08-05 |
Dissecting the multicellular ecosystem of metastatic melanoma by single-cell RNA-seq
2016-Apr-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aad0501
PMID:27124452
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索转移性黑色素瘤的多细胞生态系统 | 揭示了黑色素瘤肿瘤中细胞的转录异质性及其与细胞周期和空间背景的关系 | 研究仅分析了19名患者的样本，样本量相对较小 | 探讨黑色素瘤肿瘤的基因型和表型状态 | 4645个来自19名患者的单细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 4645个单细胞来自19名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 17606 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals coordinated ectopic gene-expression patterns in medullary thymic epithelial cells
2015-Sep, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/ni.3246
PMID:26237553
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研究论文 | 本研究揭示了髓质胸腺上皮细胞中组织特异性自身抗原的表达模式 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了髓质胸腺上皮细胞中TRAs的协同表达模式 | 研究未阐明单个mTEC中TRAs表达的具体调控机制 | 探讨髓质胸腺上皮细胞中自身抗原表达的调控机制 | 针对髓质胸腺上皮细胞中的组织特异性自身抗原进行研究 | 数字病理学 | 自体免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个mTECs样本 | NA | NA | NA | NA |
| 17607 | 2024-08-05 |
Aire controls gene expression in the thymic epithelium with ordered stochasticity
2015-Sep, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/ni.3247
PMID:26237550
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研究论文 | Aire转录因子通过诱导外源性胸腺特异性基因的表达来控制免疫耐受性 | 本研究揭示了Aire靶基因在小部分胸腺髓样上皮细胞中的特异性激活，与DNA甲基化模式无关 | 未提及具体样本数量和限制因素 | 探讨Aire对胸腺上皮基因表达的特异性调控机制 | Aire充足和缺乏的胸腺髓样上皮细胞(mTECs) | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和DNA甲基化分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17608 | 2024-08-05 |
Droplet barcoding for single-cell transcriptomics applied to embryonic stem cells
2015-May-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2015.04.044
PMID:26000487
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研究论文 | 该文章介绍了一种用于单细胞转录组学的高通量液滴条形码技术。 | 提出了一种高效的液滴微流控方法，可以从成千上万个单细胞中标记RNA，并进行后续的下一代测序分析。 | 没有明确提到该方法在特定样本上的适用性或潜在的技术障碍 | 旨在有效识别和分析单细胞水平的基因表达。 | 分析小鼠胚胎干细胞以揭示细胞群体结构和分化异质性。 | 数字病理学 | NA | 下一代测序 | NA | RNA数据 | 数千个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 17609 | 2024-08-05 |
Recent advances in genomic DNA sequencing of microbial species from single cells
2014-Sep, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/nrg3785
PMID:25091868
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研究论文 | 本文讨论了通过单细胞测序对微生物物种的基因组DNA进行测序的最新进展 | 揭示了通过单细胞测序技术填补未培养物种的基因组序列空白的潜力 | 对微生物物种的研究仍然受到技术和样本可得性的限制 | 研究未培养微生物的基本生物学、分类和进化 | 未培养的微生物物种及其基因组 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17610 | 2024-08-05 |
Quantitative assessment of single-cell RNA-sequencing methods
2014-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2694
PMID:24141493
|
研究论文 | 该文章比较了不同的单细胞RNA扩增方法的敏感性和准确性 | 系统评估了多种单细胞RNA-seq方法的性能，并显示出在较小的测序读取数下仍能准确测量单细胞转录组 | 未提及具体的限制 | 探讨单细胞转录组分析的有效性 | 比较不同的单细胞RNA扩增方法 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | RNA序列 | 使用了不同数量的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 17611 | 2024-08-05 |
Remodeling ceramide homeostasis promotes functional maturation of human pluripotent stem cell-derived β cells
2024-Jun-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.04.010
PMID:38697109
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研究论文 | 该研究探讨了人类多能干细胞来源的β细胞的功能成熟过程 | 揭示了蜕膜代谢重塑，尤其是对神经酰胺代谢活动的下调对β细胞成熟的重要性 | 研究中具体的细胞标志物和环境因素对成熟过程的影响未深入探讨 | 研究人类胰腺β细胞的成熟机制及其功能获得 | 人类多能干细胞来源的β细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和单细胞转座酶易接触染色质测序 (scATAC-seq) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17612 | 2024-08-05 |
Neuronal cell populations in circumoral nerve ring of sea cucumber Apostichopus japonicus: Ultrastructure and transcriptional profile
2024-Jun-05, Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics
DOI:10.1016/j.cbd.2024.101263
PMID:38850626
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研究论文 | 本文观察了海参Apostichopus japonicus中环口神经环内神经细胞的超微结构和转录特征 | 首次应用单细胞RNA测序研究海参中神经细胞的转录特征并识别了六种神经细胞类型 | 缺乏对神经细胞功能及其在生态系统中作用的进一步研究 | 研究海参神经细胞的超微结构以及其转录特征 | 海参Apostichopus japonicus的环口神经环中的神经细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 六种神经细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 17613 | 2024-08-05 |
A cell atlas of the adult female Aedes aegypti midgut revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Jun-05, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03432-8
PMID:38839790
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序建立了成蚊Aedes aegypti中肠细胞图谱 | 首次建立了Aedes aegypti中肠单细胞RNA测序的分离和测序协议 | 缺乏对已知转录组的重复性验证和其他中肠细胞的功能研究 | 研究Aedes aegypti中肠细胞类型及其在arbovirus感染中的作用 | Aedes aegypti成虫的中肠细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞类型 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17614 | 2024-08-04 |
Modifications of lipid pathways restrict SARS-CoV-2 propagation in human induced pluripotent stem cell-derived 3D airway organoids
2024-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.08.005
PMID:37557954
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研究论文 | 本研究探讨了脂质代谢修改如何限制SARS-CoV-2在类人气道器官中的传播 | 通过建立人诱导多能干细胞衍生的气道类器官，首次揭示了脂质通路修改对SARS-CoV-2传播的限制作用 | 本研究主要基于体外模型，尚需进一步验证在真实生物体中的效果 | 揭示脂质代谢在COVID-19病毒感染中的作用机制 | 人诱导多能干细胞衍生的气道类器官，主要关注SARS-CoV-2的感染和传播 | 数字病理学 | 新冠病毒感染 | 单细胞测序（ScRNAseq） | 气道类器官（iPSC-AOs） | 细胞与分子生物数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17615 | 2024-08-05 |
Hypoxia-Inducible Factor-1α in SM22α-Expressing Cells Modulates Alveolarization
2023-10, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0045OC
PMID:37290124
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研究论文 | 本文研究了HIF-1α在SM22α表达细胞中的作用对肺泡化的影响 | 文章创新性地探讨了HIF-1α在特定间充质细胞亚群中调节出生后肺泡化的机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，可能无法完全推及人类 | 研究HIF-1α在SM22α表达细胞中的功能及其对肺发育的影响 | 以SM22α-表达细胞为对象，分析其在肺泡化中的作用 | 数字病理学 | 慢性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 使用了小鼠模型和早产儿样本 | NA | NA | NA | NA |
| 17616 | 2024-08-04 |
Smoking-induced CCNA2 expression promotes lung adenocarcinoma tumorigenesis by boosting AT2/AT2-like cell differentiation
2024-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216922
PMID:38704137
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研究论文 | 该论文探讨了吸烟诱导的CCNA2表达如何通过促进AT2/AT2样细胞的分化来促进肺腺癌肿瘤发生 | 揭示了吸烟诱导的CCNA2过表达及其对WNT/β-catenin信号通路的抑制作为控制AT2细胞分化和肺腺癌肿瘤发生的新机制 | 研究中没有探讨其他可能影响CCNA2表达和肿瘤发生的因素 | 本研究旨在探讨吸烟如何影响与肺腺癌相关的AT2细胞分化机制 | 研究对象为肺腺癌及其相关细胞，特别关注AT2细胞及其转变为AT2样细胞的过程 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 包含147个差异表达基因的分析 | NA | NA | NA | NA |
| 17617 | 2024-08-05 |
Adipocyte Progenitor Pools Composition and Cellular Niches Affect Adipogenesis Divergence in Porcine Subcutaneous and Intramuscular Fat
2024-Jun-07, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c01044
PMID:38848240
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研究论文 | 本研究探讨了猪的皮下脂肪和内脏脂肪在脂肪生成过程中的差异 | 揭示了猪的皮下脂肪和内脏脂肪在脂肪生成的内在和微环境机制上的新发现 | 研究可能未涵盖所有脂肪细胞类型的差异 | 深入理解猪的皮下脂肪和内脏脂肪间的脂肪生成差异 | 研究对象为猪的皮下脂肪和内脏脂肪细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 未具体提到样本量 | NA | NA | NA | NA |
| 17618 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal a high glycolysis B cell and tumor-associated macrophages cluster correlated with poor prognosis and exhausted immune microenvironment in diffuse large B-cell lymphoma
2024-Jun-05, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00605-w
PMID:38840205
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研究论文 | 这项研究揭示了与差生大B细胞淋巴瘤相关的高糖酵解B细胞和肿瘤相关巨噬细胞群体的代谢特征。 | 创新点在于首次利用单细胞转录组学和空间转录组学揭示糖酵解在DLBCL进展中的作用及其与免疫微环境的关系。 | 样本量相对有限，可能影响结果的普遍性和推广性。 | 研究DLBCL进展中的代谢特征，为个性化治疗提供依据。 | 研究对象包括高度恶性DLBCL细胞及其相关的肿瘤相关巨噬细胞。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学、空间转录组学、免疫组化、免疫荧光 | NA | 多组学数据 | 5个单细胞转录组样本，966个总体转录组样本，10个空间转录组样本，34个免疫组化样本和20个免疫荧光样本 | NA | NA | NA | NA |
| 17619 | 2024-08-04 |
HyperGCN: an effective deep representation learning framework for the integrative analysis of spatial transcriptomics data
2024-Jun-05, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10469-x
PMID:38840049
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研究论文 | 本文提出了HyperGCN框架用于空间转录组数据的综合分析 | HyperGCN利用超图引导的图卷积网络处理高几何复杂度的组织，提升了空间转录组数据的分析能力 | NA | 研究空间转录组数据的综合分析方法 | 来自不同组织和技术的数据集，包括人类前额叶皮层、人类乳腺肿瘤等 | 数字病理学 | 乳腺癌 | NA | 超图卷积网络 | 转录组数据 | 四个真实数据集，包括不同组织和技术 | NA | NA | NA | NA |
| 17620 | 2024-08-07 |
Author Correction: Multiplexed bulk and single-cell RNA-seq hybrid enables cost-efficient disease modeling with chimeric organoids
2024-Jun-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48984-w
PMID:38839746
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |