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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17581 | 2024-08-05 | Comprehensive single-cell atlas of the mouse retina 
          2024-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
          DOI:10.1101/2024.01.24.577060
          PMID:38328114
         | 研究论文 | 本文建立了小鼠视网膜的综合单细胞图谱 | 生成了迄今为止最大的视网膜单细胞RNA测序数据集,并整合了公共数据集以构建小鼠视网膜细胞图谱 | 样本可能局限于特定小鼠品系,可能无法代表全部生物学变异 | 建立小鼠视网膜的统一参考数据集 | C57BL/6J小鼠全视网膜中的单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 大约190,000个单细胞 | NA | NA | NA | NA | 
| 17582 | 2024-08-05 | A targeted CRISPR-Cas9 mediated F0 screen identifies genes involved in establishment of the enteric nervous system 
          2024, PloS one
          
          IF:2.9Q1
          
         
          DOI:10.1371/journal.pone.0303914
          PMID:38809858
         | 研究论文 | 本研究利用CRISPR-Cas9介导的F0筛选,识别与肠神经系统建立相关的基因 | 提出了一种新颖且高效的CRISPR筛选方法,专注于肠神经系统的发展 | 该研究未详细探讨所识别基因的功能机制 | 旨在揭示参与肠神经系统建立的基因 | 主要研究对象为斑马鱼中的肠神经嵴细胞及其相关基因 | 数字病理学 | Hirschsprung病 | CRISPR-Cas9 | NA | 单细胞RNA测序 | 使用斑马鱼作为模型生物,具体样本数量未说明 | NA | NA | NA | NA | 
| 17583 | 2024-08-05 | A targeted CRISPR-Cas9 mediated F0 screen identifies genes involved in establishment of the enteric nervous system 
          2023-Dec-29, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
          DOI:10.1101/2023.12.28.573581
          PMID:38234831
         | 研究论文 | 本研究利用CRISPR-Cas9介导的筛查识别参与肠神经系统建立的基因 | 使用高效的CRISPR筛查方法,发现新基因进而推动肠神经系统的研究 | 研究仅限于斑马鱼模型,可能不完全适用于其他脊椎动物 | 探讨和识别参与肠神经系统发育的基因 | 以斑马鱼为模型研究肠神经系统的形成与基因调控 | 数字病理学 | Hirschsprung病 | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 17584 | 2024-08-04 | Combined near infrared photoacoustic imaging and ultrasound detects vulnerable atherosclerotic plaque 
          2023-11, Biomaterials
          
          IF:12.8Q1
          
         | 研究论文 | 该研究显示近红外自发光声成像(NIRAPA)与超声联合可检测易损的动脉粥样硬化斑块 | 创新点在于首次将近红外自发光声成像与超声成像结合,用于区分稳定与易损斑块 | 研究的局限性在于仅在25名患者的切除斑块上进行的体外研究 | 研究旨在通过成像技术有效管理动脉粥样硬化疾病 | 研究对象为25例患者的切除动脉粥样硬化斑块 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 近红外自发光声成像(NIRAPA)与超声成像 | NA | 图像 | 25个切除的动脉粥样硬化斑块样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 17585 | 2024-08-05 | Hypoxic, glycolytic metabolism is a vulnerability of B-acute lymphoblastic leukemia-initiating cells 
          2022-04-26, Cell reports
          
          IF:7.5Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.celrep.2022.110752
          PMID:35476984
         | 研究论文 | 这篇文章探讨了高风险B-急性淋巴细胞白血病(B-ALL)中白血病起始细胞(LICs)的特性及其代谢弱点 | 发现抑制缺氧和糖酵解对MLL-r B-ALL LICs有害,提供了治疗靶向的新思路 | 对高风险B-ALL中LICs的特性理解仍不完全 | 研究高风险B-急性淋巴细胞白血病中的白血病起始细胞及其代谢特性 | MLL重排的B-ALL中的白血病起始细胞 | 数字病理学 | 骨髓瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 17586 | 2024-08-05 | Spatial transcriptional mapping of the human nephrogenic program 
          2021-08-23, Developmental cell
          
          IF:10.7Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.devcel.2021.07.017
          PMID:34428401
         | 研究论文 | 本文建立了人类肾小管发育的空间转录组图谱 | 首次通过空间解析手段揭示了人类肾小管发育的过程,并构建了蛋白质三维图谱 | 样本数量和来源可能影响结果的普遍性 | 旨在建立人类肾小管发育的框架,以促进对肾脏发展和疾病的理解 | 人类肾小管的前体细胞及其发育 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 三维蛋白质图谱 | 一百万个肾小管前体细胞 | NA | NA | NA | NA | 
| 17587 | 2024-08-05 | Neurog3-Independent Methylation Is the Earliest Detectable Mark Distinguishing Pancreatic Progenitor Identity 
          2019-01-07, Developmental cell
          
          IF:10.7Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.devcel.2018.11.048
          PMID:30620902
         | 研究论文 | 本文展示了Neurog3独立的甲基化是区分胰腺祖细胞身份的最早可检测标志 | 通过单细胞RNA-seq和轨迹分析,揭示了Myt1与Neurog3的共表达在胰腺细胞命运选择中的作用 | 研究中甲基化状态的变化与能否定义的亚群体之间的关系尚不明确 | 探讨Neurog3细胞在胰腺发育中的细胞命运选择机制 | 胰腺内的Neurog3表达祖细胞及其甲基化状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq,轨迹分析 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 17588 | 2024-08-05 | Quantitative Clonal Analysis and Single-Cell Transcriptomics Reveal Division Kinetics, Hierarchy, and Fate of Oral Epithelial Progenitor Cells 
          2019-01-03, Cell stem cell
          
          IF:19.8Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.stem.2018.10.015
          PMID:30472156
         | 研究论文 | 本文探讨了口腔上皮祖细胞的分裂动力学、层级和命运 | 通过定量克隆分析和单细胞转录组学,揭示了口腔上皮祖细胞的独特分裂特性和细胞组织模型 | 没有提供具体的临床数据支持研究结果 | 了解口腔上皮祖细胞在稳态和疾病中的角色 | 口腔上皮祖细胞(OEPCs) | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 17589 | 2024-08-05 | Successful Anti-PD-1 Cancer Immunotherapy Requires T Cell-Dendritic Cell Crosstalk Involving the Cytokines IFN-γ and IL-12 
          2018-12-18, Immunity
          
          IF:25.5Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.immuni.2018.09.024
          PMID:30552023
         | 研究论文 | 本研究揭示了抗PD-1免疫疗法中T细胞与树突细胞之间的相互作用及其依赖的细胞因子IFN-γ和IL-12 | 揭示了树突细胞产生IL-12的机制及其在抗肿瘤免疫中的关键作用 | 本研究主要基于小鼠模型,临床转化需要进一步验证 | 研究抗PD-1免疫疗法在肿瘤内的作用机制 | 重点研究肿瘤浸润性树突细胞的功能和T细胞的作用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序和活体实时成像 | 小鼠模型 | 细胞和分子水平的数据 | 特定小鼠模型的树突细胞样本,具体数量未提供 | NA | NA | NA | NA | 
| 17590 | 2024-08-05 | Renal compartment-specific genetic variation analyses identify new pathways in chronic kidney disease 
          2018-11, Nature medicine
          
          IF:58.7Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41591-018-0194-4
          PMID:30275566
         | 研究论文 | 本文探讨了肾脏慢性疾病的基因变异及相关通路 | 通过建立肾脏不同部分的表达数量性状位点(eQTL)图谱,识别了与慢性肾病相关的新基因 | GWAS结果的生物学基础仍然不够清晰 | 识别与慢性肾病发展相关的新基因和细胞通路 | 人类肾脏的肾小球和肾小管部分 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序、表达数量性状位点图谱 | NA | 基因组数据、RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 17591 | 2024-08-05 | LC3-Associated Phagocytosis in Myeloid Cells Promotes Tumor Immune Tolerance 
          2018-10-04, Cell
          
          IF:45.5Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.cell.2018.08.061
          PMID:30245008
         | 研究论文 | 本文展示了髓系细胞中的LC3相关吞噬作用在肿瘤免疫耐受中的作用 | 研究指出LAP在髓系细胞中影响肿瘤生长,而不仅仅是经典自噬 | 本文未探讨不同类型肿瘤对LAP的影响 | 探讨自噬在肿瘤微环境中的不同功能及其对免疫反应的影响 | 研究重点为肿瘤相关巨噬细胞及其对肿瘤细胞的吞噬作用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 17592 | 2024-08-05 | Regulated Capture of Vκ Gene Topologically Associating Domains by Transcription Factories 
          2018-08-28, Cell reports
          
          IF:7.5Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.celrep.2018.07.091
          PMID:30157436
         | 研究论文 | 本文探讨了淋巴细胞抗原受体多样性表达的机制,重点研究了Vκ基因的转录和重组过程 | 该研究首次揭示了Vκ基因如何通过转录工厂在核矩阵上被选择性捕获,从而实现单拷贝基因的转录 | 本文未提供单细胞转录组数据的详细样本量和具体实验条件 | 研究Vκ基因在淋巴细胞中的单拷贝转录与重组的机制 | 研究对象为预B细胞中Vκ基因的转录和重组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 17593 | 2024-08-05 | Chemoresistance Evolution in Triple-Negative Breast Cancer Delineated by Single-Cell Sequencing 
          2018-05-03, Cell
          
          IF:45.5Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.cell.2018.03.041
          PMID:29681456
         | 研究论文 | 该文章探讨了三阴性乳腺癌中的化疗耐药性演变 | 该研究使用单细胞测序揭示了耐药基因型的存在与适应选择 | 样本数量较小,仅涉及20名患者,可能限制了结论的普遍性 | 研究三阴性乳腺癌在新辅助化疗中的耐药性机制 | 20名接受新辅助化疗的三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞DNA和RNA测序,整体外显子组测序 | NA | 细胞数据 | 20名三阴性乳腺癌患者,分析900个单细胞和6862个单细胞RNA | NA | NA | NA | NA | 
| 17594 | 2024-08-05 | Developmental and oncogenic programs in H3K27M gliomas dissected by single-cell RNA-seq 
          2018-04-20, Science (New York, N.Y.)
          
         
          DOI:10.1126/science.aao4750
          PMID:29674595
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了H3K27M胶质瘤中的致癌和发育程序。 | 首次使用单细胞分辨率解析H3K27M胶质瘤的细胞架构和发育程序,提供了潜在的治疗靶点。 | 研究仅在六个原发H3K27M胶质瘤模型中进行,样本数量相对较少,可能限制结果的普适性。 | 探索H3K27M胶质瘤的细胞组成及其发展机制。 | 本研究的对象为六个原发H3K27M胶质瘤和相匹配的模型中的细胞。 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 3321个细胞来自六个原发H3K27M胶质瘤 | NA | NA | NA | NA | 
| 17595 | 2024-08-05 | Depletion of Maternal Cyclin B3 Contributes to Zygotic Genome Activation in the Ciona Embryo 
          2018-04-02, Current biology : CB
          
          IF:8.1Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.cub.2018.02.046
          PMID:29576477
         | 研究论文 | 本文探讨了母体Cyclin B3在Ciona胚胎中对合子基因组激活的影响 | 揭示母体Cyclin B3在合子转录激活过程中的重要作用 | 研究主要基于Ciona intestinalis,可能不适用于所有动物 | 探索Ciona胚胎中合子基因组激活的机制 | Ciona intestinalis的胚胎 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 8细胞和16细胞阶段的胚胎 | NA | NA | NA | NA | 
| 17596 | 2024-08-05 | Developmental diversification of cortical inhibitory interneurons 
          2018-03-22, Nature
          
          IF:50.5Q1
          
         
          DOI:10.1038/nature25999
          PMID:29513653
         | 研究论文 | 本文探讨了皮层抑制性中间神经元的发育多样性及其生成机制 | 通过单细胞RNA测序揭示了小鼠细胞的转录组异质性及其在发育过程中的动态变化 | NA | 研究皮层内神经元如何在发育过程中产生多样性 | 小鼠的皮层抑制性中间神经元及其前体细胞 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠细胞沿发展时间过程的样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 17597 | 2024-08-05 | A Novel Approach to Single Cell RNA-Sequence Analysis Facilitates In Silico Gene Reporting of Human Pluripotent Stem Cell-Derived Retinal Cell Types 
          2018-03, Stem cells (Dayton, Ohio)
          
         
          DOI:10.1002/stem.2755
          PMID:29230913
         | 研究论文 | 本研究提出了一种新的单细胞RNA测序分析方法,以促进对人类多能干细胞衍生视网膜细胞类型的基因报告。 | 创新点在于开发了一种简单、通用的方法,通过排名单个细胞的基因表达水平来生成与报告基因线相似的表达数据。 | 传统单细胞RNA测序分析方法基于无偏算法的应用未能揭示结果,可能限制了细胞鉴定的明确性。 | 研究旨在分析人类多能干细胞衍生的多种视网膜细胞类型的基因表达谱。 | 研究对象为人类多能干细胞衍生的视网膜细胞类型及其基因表达特征。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 来自光感受器样结构的单细胞 | NA | NA | NA | NA | 
| 17598 | 2024-08-05 | Single-cell analysis of experience-dependent transcriptomic states in the mouse visual cortex 
          2018-01, Nature neuroscience
          
          IF:21.2Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41593-017-0029-5
          PMID:29230054
         | 研究论文 | 本文探讨了小鼠视觉皮层中经历依赖的转录组状态的单细胞分析 | 识别了30种细胞类型中显著且不同的刺激响应,揭示了611个刺激响应基因 | 尚缺乏对所有皮层细胞类型转录响应多样性的全面理解 | 研究小鼠视觉皮层在光照刺激后的转录变化 | 小鼠视觉皮层中的不同细胞类型 | 数字病理学 | 发育性脑障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 30种细胞类型 | NA | NA | NA | NA | 
| 17599 | 2024-08-05 | Dissecting Cell-Type Composition and Activity-Dependent Transcriptional State in Mammalian Brains by Massively Parallel Single-Nucleus RNA-Seq 
          2017-Dec-07, Molecular cell
          
          IF:14.5Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.molcel.2017.11.017
          PMID:29220646
         | 研究论文 | 本文提出了一种新的单核RNA测序方法,可以有效地分析成年哺乳动物大脑中的细胞类型组成和活性依赖的转录状态 | 创新点在于结合了蔗糖梯度纯化和液滴微流体技术,开发出无酶解和无核Sorting的高通量单核RNA-seq方法 | 研究未提及样本来源的具体多样性和可能的生物学变异性 | 研究成年哺乳动物大脑中细胞多样性及其活性依赖的转录状态 | 成年小鼠皮层组织中的约18,000个细胞核 | 数字病理学 | NA | 单核RNA-seq | NA | RNA数据 | 约18,000个细胞核 | NA | NA | NA | NA | 
| 17600 | 2024-08-05 | Single-cell transcriptomics reconstructs fate conversion from fibroblast to cardiomyocyte 
          2017-11-02, Nature
          
          IF:50.5Q1
          
         
          DOI:10.1038/nature24454
          PMID:29072293
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学重构了成纤维细胞向心肌细胞的命运转换 | 揭示了在成纤维细胞转化为心肌细胞过程中,细胞异质性及重编程的分子机制 | 重编程过程的异步特性以及细胞间的固有异质性使得传统的批量基因组技术难以研究这一过程 | 探索成纤维细胞向心肌细胞转化的机制及相关基因表达变化 | 小鼠成纤维细胞及其转化为诱导心肌细胞的过程 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |