单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1741 - 1760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1741 | 2025-10-05 |
A spatiotemporal atlas of mouse gastrulation and early organogenesis to explore axial patterning and project in vitro models onto in vivo space
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116047
PMID:40728928
|
研究论文 | 构建了小鼠原肠胚形成和早期器官发生的时空图谱，用于探索轴向模式并将体外模型投影到体内空间 | 整合了E7.25和E7.5天的空间转录组数据与现有单细胞RNA-seq图谱，创建了包含超过15万个细胞和82种精细细胞类型注释的时空图谱 | 仅针对小鼠胚胎发育的特定时期(E6.5-E9.5)，可能不适用于其他物种或发育阶段 | 探索小鼠原肠胚形成过程中的空间分化模式和轴向模式形成机制 | 小鼠胚胎发育过程中的细胞谱系和空间组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA-seq数据 | 超过150,000个细胞，涵盖E6.5至E9.5多个发育阶段的小鼠胚胎 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1742 | 2025-10-05 |
A Low Sodium Diet Activates HSD2 Neurons in the Nucleus Tractus Solitarii to Promote Sodium Appetite Via the cAMP/MAPK Signaling Pathway
2025-Aug-26, Journal of integrative neuroscience
IF:2.5Q3
DOI:10.31083/JIN42286
PMID:40919635
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研究论文 | 本研究揭示了低钠饮食通过激活NTS中HSD2神经元促进钠食欲的神经机制 | 首次阐明低钠饮食通过cAMP/MAPK信号通路激活HSD2神经元促进钠食欲的具体机制 | 研究仅使用小鼠模型，未在其它物种验证；未探讨长期低钠饮食的影响 | 探究低钠饮食条件下HSD2神经元在调节钠食欲中的神经生物学机制 | 小鼠模型中的HSD2神经元及其神经环路 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，药理学干预，顺行追踪，免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，生理参数数据，行为数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1743 | 2025-10-05 |
Stem cells within the HPA axis in tissue homeostasis and disease
2025-Aug-22, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf039
PMID:40590582
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综述 | 本文综述了HPA轴内干细胞在组织稳态和疾病中的作用，重点关注其起源、定位及功能 | 总结了单细胞RNA测序揭示的HPA轴干细胞群体异质性，并讨论了体外分化干细胞替代疗法的新策略 | 对HPA轴动态组织可塑性机制的理解仍有限，特别是在人类研究方面 | 探讨HPA轴中干细胞在组织稳态维持和疾病发生发展中的作用机制 | 下丘脑-垂体-肾上腺轴中的干细胞和祖细胞 | 发育生物学 | 代谢疾病、癌症、应激相关疾病 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、体外分化 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1744 | 2025-10-05 |
Reviewing the Developing Significance of the Serine Protease PRSS23
2025-Aug-18, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL27294
PMID:40917042
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综述 | 本文系统回顾了丝氨酸蛋白酶PRSS23在不同生理病理过程中的功能研究进展 | 首次全面梳理PRSS23从基础生物学功能到疾病机制的研究历程，特别关注近年单细胞技术带来的新发现 | 作为综述文章，主要整合现有研究而非提供原始实验数据 | 总结PRSS23的生物学功能及其在疾病中的作用机制 | 丝氨酸蛋白酶PRSS23及其在不同组织和疾病中的表达与功能 | 分子生物学 | 乳腺癌, 胃癌, 局限性硬皮病 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 药物筛选 | NA | 文献资料 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1745 | 2025-10-05 |
Astaxanthin promotes in vitro maturation of mouse oocytes by regulating mitochondrial functions and protein homeostasis†
2025-Aug-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf107
PMID:40324205
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研究论文 | 本研究揭示虾青素通过调控线粒体功能和蛋白质稳态促进小鼠卵母细胞体外成熟 | 首次报道虾青素在卵母细胞体外成熟中的作用，并阐明其通过调控线粒体功能和蛋白质稳态的机制 | 研究仅限于小鼠模型，未在其它物种验证 | 探究虾青素对小鼠卵母细胞体外成熟的影响及其作用机制 | 小鼠卵母细胞 | 生殖生物学 | NA | 单细胞转录组测序, 微量蛋白质组学, 透明带激光打孔, 体外受精 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1746 | 2025-10-05 |
Developmental cues from epicardial cells simultaneously promote cardiomyocyte proliferation and electrochemical maturation
2025-Aug-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102572
PMID:40614731
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研究论文 | 本研究通过共培养人诱导多能干细胞来源的心肌细胞与心外膜细胞，探索发育信号如何同时促进心肌细胞增殖和电化学成熟 | 发现心外膜细胞能同时促进心肌细胞增殖和电化学成熟，挑战了传统认为成熟会限制增殖的观点 | 3D工程心脏组织中心肌细胞增殖改善有限，研究主要基于体外模型 | 探究心外膜细胞对心肌细胞发育成熟的影响机制 | 人诱导多能干细胞来源的心肌细胞和心外膜细胞 | 干细胞与组织工程 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序，2D/3D共培养技术 | 工程心脏组织模型 | 基因表达数据，电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1747 | 2025-10-05 |
A clonally expanded nodal T-cell population diagnosed as T-cell lymphoma after CAR-T therapy
2025-Aug-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62709-7
PMID:40796743
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研究论文 | 报道一例CAR-T治疗后出现的克隆性扩增T细胞群体被诊断为T细胞淋巴瘤的病例 | 首次使用单细胞空间转录组学揭示CAR-T治疗后T细胞淋巴瘤的克隆特征和空间分布模式 | 仅基于单个病例报告，样本量有限 | 研究CAR-T治疗后继发性T细胞恶性肿瘤的分子特征 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者CAR-T治疗后出现的淋巴结病变 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 基因组测序, 单细胞空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 1例患者 | NA | 单细胞空间转录组学, 基因组测序 | NA | NA |
| 1748 | 2025-10-05 |
Singletrome enhances detection of long noncoding RNAs in single cell transcriptomes
2025-Aug-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-13528-9
PMID:40796606
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研究论文 | 介绍Singletrome工具，用于增强单细胞转录组中长链非编码RNA的检测 | 开发了Singularity镜像工具，整合蛋白质编码和lncRNA基因注释，考虑基因的正反义重叠，生成增强注释 | NA | 改进单细胞RNA测序中长链非编码RNA的检测和分析 | 长链非编码RNA和蛋白质编码基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1749 | 2025-10-05 |
Multi-omics single-cell data alignment and integration with enhanced contrastive learning and differential attention mechanism
2025-Aug-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf443
PMID:40795161
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研究论文 | 提出一种用于单细胞多组学数据对齐和整合的新方法scECDA | 采用增强对比学习和差异注意力机制，能自主学习各组学数据集的特征分布并减少噪声干扰 | NA | 提高单细胞多组学数据整合的准确性和细胞类型识别能力 | 单细胞多组学数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞多组学测序 | 自编码器,对比学习 | 单细胞多组学数据 | 八个配对单细胞多组学数据集 | 10x Genomics | 单细胞多组学 | 10X Multiome, CITE-seq, TEA-seq | 多种单细胞多组学技术平台生成的数据 |
| 1750 | 2025-10-05 |
A Single-Cell Atlas-Inspired Hitchhiking Therapeutic Strategy for Acute Pancreatitis by Restricting ROS in Neutrophils
2025-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202502200
PMID:40395143
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示急性胰腺炎中中性粒细胞亚群组成及极化过程，并开发了一种基于二氧化锰纳米反应器的靶向治疗策略 | 首次构建急性胰腺炎中性粒细胞单细胞图谱，并创新性地提出基于中性粒细胞搭便车递送的纳米治疗策略，实现原位合成抗氧化剂 | NA | 开发针对急性胰腺炎的靶向治疗策略，通过限制中性粒细胞中活性氧来减轻胰腺炎症 | 急性胰腺炎中的中性粒细胞 | 单细胞测序 | 急性胰腺炎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1751 | 2025-10-05 |
Decoding neuronal diversity: Mechanisms governing neural cell fate in Drosophila
2025-Aug, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2025.103061
PMID:40482397
|
综述 | 本文综述了果蝇神经细胞命运决定机制的最新研究进展 | 整合单细胞转录组学和全脑连接组学新技术，系统阐述神经细胞命运决定的三大关键机制 | 主要聚焦果蝇模型，对哺乳动物神经发育的普适性有待验证 | 解析神经干细胞如何产生神经元多样性的分子机制 | 果蝇神经系统发育 | 发育神经生物学 | NA | 单细胞转录组学、全脑连接组学、经典遗传学、标记技术 | NA | 基因表达数据、神经连接数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1752 | 2025-10-05 |
Principles of synaptogenesis: Insights from Caenorhabditiselegans
2025-Aug, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2025.103056
PMID:40483740
|
综述 | 基于秀丽隐杆线虫模型阐述突触发生的原理、组织与精细化调控机制 | 整合基因编辑、显微成像、单细胞转录组与计算分析等前沿技术解析突触发育机制 | NA | 揭示突触组装、精细化与重塑的遗传基础与调控机制 | 秀丽隐杆线虫神经系统 | 神经科学 | NA | 基因编辑, 显微成像, 单细胞转录组分析, 计算分析 | NA | 基因表达数据, 显微图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1753 | 2025-10-05 |
Molecular characterization and functional prioritization of CD46, IL6R, KLRC1, LEAP2 and SMOX as candidate targets in acute kidney injury
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146096
PMID:40683494
|
研究论文 | 通过多组学整合框架鉴定并验证急性肾损伤的候选治疗靶点 | 建立遗传信息指导的多组学整合框架，系统筛选具有治疗潜力的候选靶点，并结合计算药物重定位和实验验证 | NA | 识别和验证急性肾损伤的潜在治疗靶点 | CD46、IL6R、KLRC1、LEAP2和SMOX基因及其编码蛋白 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | 多组学整合分析、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、计算机药物重定位 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1754 | 2025-10-05 |
Computational methods for alternative polyadenylation and splicing in post-transcriptional gene regulation
2025-Aug, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01496-z
PMID:40804481
|
综述 | 全面概述选择性多聚腺苷酸化和选择性剪接的计算分析方法及其在转录后基因调控中的作用 | 系统总结了单细胞RNA测序专用的APA和AS分析技术，提供了从群体到单细胞水平的基因调控新见解 | 作为综述文章，主要总结现有方法而非提出新算法，依赖已有文献的覆盖范围 | 探讨选择性多聚腺苷酸化和选择性剪接在转录后基因调控中的计算分析方法 | 基因转录本和调控机制 | 生物信息学 | NA | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1755 | 2025-10-05 |
Clonal hematopoiesis is clonally unrelated to multiple myeloma and is associated with specific microenvironmental changes
2025-Jul-31, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026236
PMID:40112284
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研究论文 | 本研究探讨了克隆造血与多发性骨髓瘤的克隆无关性及其对肿瘤微环境的特定影响 | 首次证明CHIP与MM克隆起源无关，并通过单细胞RNA测序揭示了CHIP阳性微环境的特异性改变 | 样本量有限（16例单细胞RNA测序），血红蛋白差异趋势未达统计学显著性 | 研究克隆造血在多发性骨髓瘤肿瘤微环境中的作用机制 | 106例多发性骨髓瘤患者（其中16例进行单细胞RNA测序） | 单细胞基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 106例患者（16例进行单细胞RNA测序） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1756 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis unveils immune dysregulation and EBV-driven lymphoproliferative disorder in pediatric liver transplant recipients
2025-Jul, Human immunology
IF:3.1Q3
DOI:10.1016/j.humimm.2025.111309
PMID:40263002
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小儿肝移植受者中EB病毒驱动的淋巴增殖性疾病的免疫失调机制 | 首次在单细胞水平系统描绘PTLD患者的免疫微环境特征，揭示EBV感染特异性靶向记忆B细胞和浆细胞的机制 | 样本量有限，未涉及组织样本分析，未能验证功能性恢复策略 | 阐明小儿肝移植后EBV相关淋巴增殖性疾病的免疫病理机制 | 小儿肝移植受者外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 淋巴增殖性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 四组人群：EBV阳性PTLD患者、EBV阳性非PTLD移植受者、EBV阴性移植受者、健康儿童 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1757 | 2025-10-05 |
Astragalus polysaccharide reduces the severity of acute pancreatitis under a high-fat diet through enriching L. reuteri and propionate
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140021
PMID:39837455
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研究论文 | 本研究探讨黄芪多糖通过富集罗伊氏乳杆菌和丙酸盐减轻高脂饮食下急性胰腺炎严重程度的机制 | 首次揭示黄芪多糖通过调节肠道菌群-胰腺轴缓解急性胰腺炎的具体机制，发现罗伊氏乳杆菌和丙酸盐的协同保护作用 | 研究局限于小鼠模型，尚未在人体验证；具体信号通路细节需进一步探索 | 研究黄芪多糖对高脂饮食诱导的急性胰腺炎的保护作用及其机制 | 高脂饮食诱导的急性胰腺炎小鼠模型 | 消化系统疾病研究 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，微生物组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1758 | 2025-10-05 |
Genome-wide prediction of dominant and recessive neurodevelopmental disorder-associated genes
2025-Mar-06, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.02.001
PMID:40015282
|
研究论文 | 提出一种利用机器学习加速神经发育障碍风险基因识别的计算方法 | 首次证明仅使用单细胞RNA测序数据训练的模型能稳健预测NDD风险基因，并发现单等位基因和双等位基因遗传模式在发育中人皮层中的表达差异 | 未明确说明样本规模和具体数据来源的局限性 | 加速神经发育障碍风险基因的发现和识别 | 自闭症谱系障碍、发育性和癫痫性脑病、发育迟缓相关的风险基因 | 机器学习 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序, 机器学习 | 半监督机器学习框架(mantis-ml) | 基因表达数据, 蛋白互作数据, 遗传耐受度指标 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1759 | 2025-10-05 |
A survey of biclustering and clustering methods in clustering different types of single-cell RNA sequencing data
2025-Jan-15, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elaf010
PMID:40795763
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综述 | 本文系统综述了双聚类和聚类方法在不同类型单细胞RNA测序数据分析中的应用与性能比较 | 首次系统评估5种双聚类和21种聚类方法在10个真实scRNA-seq数据集上的性能，并从六个维度量化数据集特性以推荐最适合的方法 | 仅评估了有限数量的方法（5种双聚类和21种聚类），且仅使用10个公开数据集，可能无法覆盖所有场景 | 评估当前无监督方法在单细胞RNA测序数据分析中的发展现状，总结各方法的优缺点和改进策略 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 双聚类方法, 聚类方法 | 基因表达数据 | 10个公开真实数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1760 | 2025-10-05 |
A framework to mine laser microdissection-based omics data and uncover regulators of pancreatic cancer heterogeneity
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf101
PMID:40910795
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研究论文 | 开发并验证了一种基于激光显微切割的空间分辨RNA测序框架，用于挖掘胰腺癌异质性调控机制 | 提出优化的LMD-seq框架，在检测低表达基因方面优于单细胞RNA-seq方法，并首次绘制了PDAC形态生物型的调控网络图谱 | NA | 揭示胰腺导管腺癌肿瘤内异质性的分子机制和关键调控因子 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤组织 | 生物信息学 | 胰腺癌 | RNA测序(RNA-seq), 激光显微切割(LMD) | NA | 空间分辨转录组数据 | NA | NA | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 激光显微切割测序(LMD-seq) |