单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 17541 - 17560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17541 | 2024-08-07 |
Tissue-specific transcriptome analyses in Drosophila provide novel insights into the mode of action of the insecticide spinosad and the function of its target, nAChRα6
2023-Oct, Pest management science
IF:3.8Q1
DOI:10.1002/ps.7585
PMID:37248207
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研究论文 | 通过RNA测序比较了低剂量暴露下spinosad和imidacloprid的转录特征，揭示了它们对果蝇组织特异性基因表达的影响 | 发现了spinosad对溶酶体功能、蛋白质折叠和生殖相关基因的独特影响，并确认了nAChRα6在脂肪体细胞和雄性生殖细胞中的表达 | NA | 研究杀虫剂spinosad和imidacloprid的作用机制及其对目标nAChRα6功能的影响 | 果蝇的组织特异性转录组 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 17542 | 2024-08-07 |
Targeting the NLRP3 inflammasome reduces inflammation in hidradenitis suppurativa skin
2023-09-15, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljad184
PMID:37243544
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析了藏毛囊肿皮肤中的免疫细胞表达，发现NLRP3炎症小体在藏毛囊肿皮肤中的表达增强，并提出使用小分子抑制剂靶向NLRP3炎症小体作为新的治疗策略。 | 首次通过单细胞RNA测序和流式细胞术详细分析了藏毛囊肿皮肤中的免疫细胞表达，并证实了NLRP3炎症小体在疾病中的关键作用。 | NA | 为了更好地理解藏毛囊肿的发病机制，设计新的治疗策略。 | 藏毛囊肿皮肤中的免疫细胞及其基因表达。 | 数字病理学 | 藏毛囊肿 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 藏毛囊肿皮肤样本与健康皮肤样本 |
| 17543 | 2024-08-05 |
Mass spectrometry imaging and single-cell transcriptional profiling reveal the tissue-specific regulation of bioactive ingredient biosynthesis in Taxus leaves
2023-09-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100630
PMID:37231648
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研究论文 | 该文章揭示了加拿大红松叶中生物活性成分合成的组织特异性调控 | 本研究首次创建了加税叶代谢单细胞图谱，并识别了多个新的细胞特异性转录因子 | 尚未深入探讨的转录调控机制和生物活性成分的全部合成途径 | 研究加拿大红松叶的生物活性成分的分布及其转录调控机制 | 研究对象为Taxus mairei叶片中的细胞及其次级代谢成分 | 数字病理学 | 癌症 | 矩阵辅助激光解吸/电离质谱成像和单细胞测序 | NA | 细胞基因表达数据 | 8846个细胞 |
| 17544 | 2024-08-05 |
AHR, a novel inhibitory immune checkpoint receptor, is a potential therapeutic target for chemoresistant glioblastoma
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04894-w
PMID:37233762
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研究论文 | 本研究旨在阐明MGMT启动子低甲基化胶质母细胞瘤患者对替莫唑胺耐药的机制 | 识别AHR作为潜在的新型抑制免疫检查点受体，作为替莫唑胺耐药胶质母细胞瘤的治疗靶点 | 本研究为回顾性研究，可能存在偏倚和数据解释的局限性 | 识别适用于替莫唑胺耐药胶质母细胞瘤患者的治疗靶点和药物 | 457名胶质母细胞瘤患者的转录组测序数据和多组学数据 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序、单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 457名胶质母细胞瘤患者 |
| 17545 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-Seq and bulk RNA-Seq reveal reliable diagnostic and prognostic biomarkers for CRC
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04882-0
PMID:37247080
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研究论文 | 本研究整合了单细胞RNA测序和整体RNA测序数据，以选择结肠直肠癌（CRC）的诊断和预后生物标志物 | 首次将单细胞RNA测序与整体RNA测序相结合，识别出结肠直肠癌的特异性基因和生物标志物 | 本研究可能缺乏后续临床验证，且样本量需要进一步扩大 | 为结肠直肠癌的发展提供可靠的诊断和预后生物标志物 | 结肠直肠癌相关的上皮特异性基因 | 数字病理学 | 结肠直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和整体RNA测序 | LASSO-Cox回归和两步法回归 | 基因表达数据 | 使用了1063个共享差异表达基因（DEGs） |
| 17546 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell RNA-seq analysis revealed podocyte injury through activation of the BMP7/AMPK/mTOR mediated autophagy pathway
2023-Sep-01, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2023.110559
PMID:37247809
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研究论文 | 本研究揭示了BMP7通过激活AMPK/mTOR介导的自噬通路引起的足细胞损伤 | 首次证明了BMP7参与ADR诱导的足细胞损伤并阐明了其潜在机制 | 尚未进行临床试验以验证实验结果 | 探索由足细胞损伤引起的肾病综合征的病理机制 | 主要以足细胞为研究对象，探讨其在肾病综合征中的作用 | 数字病理 | 肾病综合征 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)以及生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 在体外建立的ADR诱导足细胞损伤模型 |
| 17547 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis of the embryogenic callus clarifies the spatiotemporal developmental trajectories of the early somatic embryo in Dimocarpus longan
2023-09, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16319
PMID:37235696
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研究论文 | 本研究通过高分辨率单细胞RNA测序分析，揭示了龙眼胚性愈伤组织中细胞的时空发育轨迹及其在体细胞胚胎发生过程中的细胞分化路径 | 首次在单细胞水平上解析了龙眼体细胞胚胎发生的分子机制，并揭示了关键转录调控因子在细胞命运决定中的作用 | NA | 探究龙眼体细胞胚胎发生的分子机制及其细胞分化路径 | 龙眼胚性愈伤组织的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 龙眼胚性愈伤组织中的高度异质性细胞被分为12个假定集群 |
| 17548 | 2024-08-07 |
Differential regulation of IL-17A and IL-17F via STAT5 contributes to psoriatic disease
2023-09, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.03.035
PMID:37244461
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研究论文 | 本文研究了IL-17A和IL-17F在银屑病中的调控机制及其在疾病中的作用 | 开发了一种新的细胞因子捕获技术，结合染色质免疫沉淀测序和RNA测序，以更好地理解IL-17A和IL-17F的表达调控 | NA | 阐明IL-17A和IL-17F在银屑病中的调控机制 | IL-17A和IL-17F在银屑病中的表达及其对炎症细胞群体的影响 | NA | 银屑病 | 单细胞RNA测序，染色质免疫沉淀测序，RNA测序 | NA | 组织样本，细胞 | 来自患者的病变皮肤组织样本 |
| 17549 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing identifies a signature based on T-cell marker genes to predict prognosis and immunotherapy response in bladder cancer
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04881-1
PMID:37244876
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别出基于T细胞标记基因的签名，用于预测膀胱癌的预后和免疫治疗反应 | 本研究首次在膀胱癌中利用T细胞标记基因构建了一个新的预后签名，并验证了其在不同队列中的有效性 | NA | 开发一个基于T细胞标记基因的预后签名，用于预测膀胱癌患者的预后和免疫治疗反应 | 膀胱癌患者的单细胞和批量RNA测序数据 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 训练队列、测试队列和GEO队列分别包含不同数量的样本 |
| 17550 | 2024-08-07 |
scLiverDB: a Database of Human and Mouse Liver Transcriptome Landscapes at Single-Cell Resolution
2023-09, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202201421
PMID:37259264
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research paper | 本文介绍了scLiverDB数据库，该数据库用于解析人和小鼠肝脏在单细胞分辨率下的转录组景观，涵盖多种肝脏疾病、细胞类型和发展阶段。 | scLiverDB是首个专门针对人和小鼠肝脏转录组的数据库，提供了单细胞分辨率下的细胞类型、细胞异质性和基因表达的详细信息。 | NA | 开发一个专门的数据库，用于解析人和小鼠肝脏在不同疾病和发展阶段的单细胞转录组景观。 | 人和小鼠的肝脏细胞及其在不同疾病和发展阶段的转录组信息。 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | transcriptome | 62个数据集，包含9,050个样本和1,741,734个细胞 |
| 17551 | 2024-08-07 |
Elevated Mast Cell Abundance Is Associated with Enrichment of CCR2+ Cytotoxic T Cells and Favorable Prognosis in Lung Adenocarcinoma
2023-08-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-3140
PMID:37249584
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了肺腺癌（LUAD）患者的样本，全面描述了LUAD浸润性肥大细胞的特征 | 发现肥大细胞在LUAD中表现出功能异质性，并与CCR2+细胞毒性T细胞的招募有关，这可能是一种新的免疫治疗策略 | 研究结果显示肥大细胞和CCR2+细胞毒性T细胞的浸润与手术后良好预后相关，但未与化疗后生存改善相关 | 探究肥大细胞在肺腺癌中的调控和功能，以发现重新编程肿瘤微环境的潜在治疗策略 | 肺腺癌（LUAD）中的肥大细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 多个肺腺癌（LUAD）患者样本 |
| 17552 | 2024-08-05 |
Small Gene Networks Delineate Immune Cell States and Characterize Immunotherapy Response in Melanoma
2023-08-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0563
PMID:37229623
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研究论文 | 该文章探讨了小基因网络如何区分免疫细胞状态并特征化黑色素瘤的免疫治疗反应 | 提出了一种新的方法，通过转录因子指导的共表达网络从大规模RNA测序数据中解构免疫功能状态 | 研究仅包括19个治疗过免疫检查点抑制剂的转移性黑色素瘤样本，样本量较小 | 研究免疫细胞在黑色素瘤中的状态及其与免疫治疗反应的关系 | 研究对象为CD45+免疫细胞以及接受免疫检查点抑制剂治疗的黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 19个（发现数据集）和209个（验证数据集）黑色素瘤样本 |
| 17553 | 2024-08-05 |
p53 deacetylation alleviates calcium oxalate deposition-induced renal fibrosis by inhibiting ferroptosis
2023-Aug, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.114925
PMID:37236026
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研究论文 | 该研究揭示了p53去乙酰化如何通过抑制铁死亡减轻钙草酸盐沉积引起的肾纤维化 | 本研究首次将p53去乙酰化与钙草酸盐诱导的肾纤维化及其对铁死亡的调控联系起来 | 本研究未能完全阐明钙草酸盐引起的肾纤维化的所有机制 | 探讨钙草酸盐结石引起的肾纤维化机制及其与铁死亡的关系 | 重点研究肾结石患者及高草酸尿症小鼠中p53及铁死亡的表现 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA-seq, 单细胞测序, 西方印迹分析 | NA | NA | 在慢性肾病患者和HK-2细胞系中进行的实验 |
| 17554 | 2024-08-07 |
The single-cell landscape of alternative transcription start sites of diabetic retina
2023-08, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2023.109520
PMID:37236522
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研究论文 | 本研究通过基于5'-标签的单细胞RNA测序技术，分析了糖尿病视网膜中细胞类型特异性的替代转录起始位点（TSS）事件及其相关转录因子，并探讨了这些变化与糖尿病视网膜病变的关系 | 首次在单细胞水平上全面分析了糖尿病视网膜中不同细胞类型的替代TSS使用情况，并识别了可能的早期糖尿病视网膜病变标志物 | NA | 探究糖尿病视网膜中细胞类型特异性的替代TSS事件及其与疾病的关系 | 糖尿病视网膜中的细胞类型特异性替代TSS事件 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 17555 | 2024-08-07 |
The multifaceted roles of CD4+ T cells and MHC class II in cancer surveillance
2023-08, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2023.102345
PMID:37245413
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研究论文 | 本文讨论了CD4+ T细胞和MHC II类分子在癌症监测中的多方面作用 | 通过单细胞转录组分析揭示了肿瘤中几种不同的CD4 T细胞分化状态，包括与有利或不利结果相关的细胞毒性和调节性亚群 | NA | 探讨肿瘤微环境中的细胞网络如何促进或阻碍CD4 T细胞的癌症监测 | CD4+ T细胞和MHC II类分子在癌症监测中的作用 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 17556 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals that HSD17B2 in cancer-associated fibroblasts promotes the development and progression of castration-resistant prostate cancer
2023-07-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216244
PMID:37244445
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了癌症相关成纤维细胞中的HSD17B2在去势抵抗性前列腺癌发展中的作用 | 首次发现HSD17B2在癌症相关成纤维细胞中的表达与去势抵抗性前列腺癌的迁移、侵袭和去势抵抗性有关 | 研究主要在体外进行，需要进一步的体内实验验证HSD17B2作为治疗靶点的有效性 | 探讨癌症相关成纤维细胞在去势抵抗性前列腺癌发展中的作用及HSD17B2的潜在治疗价值 | 去势抵抗性前列腺癌和激素敏感性前列腺癌样本中的单细胞转录组 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个去势抵抗性前列腺癌样本和两个激素敏感性前列腺癌样本 |
| 17557 | 2024-08-05 |
Old and newly synthesized histones are asymmetrically distributed in Drosophila intestinal stem cell divisions
2023-Jul-05, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256404
PMID:37255015
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研究论文 | 本文报道了Drosophila肠道干细胞分裂过程中旧的和新合成的组蛋白H3和H4的不对称分配 | 研究揭示了组蛋白的非对称遗传对细胞命运基因Delta表达模式的影响 | 尚未探讨其他潜在的影响因素或机制 | 探讨组蛋白的不对称遗传在细胞身份确定中的生物学意义 | Drosophila肠道干细胞及其细胞分裂过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 17558 | 2024-08-05 |
Novel synergistic mechanism of 11-keto-β-boswellic acid and Z-Guggulsterone on ischemic stroke revealed by single-cell transcriptomics
2023-07, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2023.106803
PMID:37230158
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研究论文 | 本研究揭示了11-keto-β-boswellic酸和Z-Guggulsterone对缺血性脑卒中的协同机制 | 建立了一种创新的药物-基因协同调控模式，并且找到了Spp1作为KBA-Z-GS的枢纽靶点 | 未在临床中验证研究结果 | 探索11-keto-β-boswellic酸和Z-Guggulsterone在缺血性脑卒中中的协同作用及其机制 | 缺血性脑卒中相关的细胞类型，尤其是小胶质细胞和星形胶质细胞 | 数字病理学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | KBA-Z-GS处理的缺血半影中的十四种细胞类型 |
| 17559 | 2024-08-07 |
Integrative analysis reveals marker genes for intestinal mucosa barrier repairing in clinical patients
2023-Jun-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106831
PMID:37250791
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研究论文 | 本研究旨在识别肠道修复的生物标志物，并为改善肠道炎症或损伤后的功能恢复和预后表现提供潜在的治疗线索 | 通过大规模筛选多个转录组和单细胞RNA测序数据集，识别出10个潜在的肠道屏障修复标志基因，并在临床研究中验证了这些基因的表达与肠道功能恢复的关联 | NA | 识别肠道修复的生物标志物，改善肠道炎症或损伤后的功能恢复和预后表现 | 炎症性肠病患者的肠道修复标志基因 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 11名接受回肠切除术的患者 |
| 17560 | 2024-08-05 |
Silicon chambers for enhanced incubation and imaging of microfluidic droplets
2023-Jun-13, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d2lc01143c
PMID:37255014
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研究论文 | 这篇文章展示了硅材料在微流体液滴成像和培养中的应用 | 提出了使用硅作为液滴腔体的理想材料，优于常用的PDMS | 未明确讨论硅相较于其他材料的长期稳定性 | 旨在提升微流体液滴的成像和培养效果 | 使用约150,000个液滴的多重数字分析 | 微流体学 | NA | NA | NA | NA | 大约150,000个液滴 |