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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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17541 | 2024-08-05 |
CCL24 regulates biliary inflammation and fibrosis in primary sclerosing cholangitis
2023-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.162270
PMID:37345655
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研究论文 | 本研究探讨了CCL24在原发性硬化性胆管炎中的作用及其潜在的治疗效果 | 首次验证了CCL24在原发性硬化性胆管炎中的关键作用,并评估了其作为治疗靶点的潜力 | 实验主要基于小鼠模型,临床适用性需进一步研究验证 | 评估CCL24在原发性硬化性胆管炎中的作用及其抑制对疾病的影响 | 原发性硬化性胆管炎及相关的肝脏炎症和纤维化 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 针对CCL24的单克隆抗体CM-101以及空间转录组学 | Mdr2-/-小鼠模型 | 组织样本和血清样本 | 使用了Mdr2-/-小鼠模型并分析了PSC患者的肝活检和血清样本 |
17542 | 2024-08-07 |
Nanoparticle-enhanced proton beam immunoradiotherapy drives immune activation and durable tumor rejection
2023-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.167749
PMID:37345658
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研究论文 | 本文研究了纳米颗粒增强的质子束免疫放疗在驱动免疫激活和持久肿瘤排斥中的作用 | 首次研究了质子束疗法作为组合免疫放疗策略的效果,并展示了纳米颗粒NBTXR3在增强免疫反应中的显著作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探索质子束疗法与免疫疗法结合在肿瘤治疗中的效果 | 小鼠的肺癌模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 质子束疗法(PBT) | NA | RNA测序数据 | 使用双肿瘤肺癌模型的小鼠 |
17543 | 2024-08-05 |
Interactions between MFAP5 + fibroblasts and tumor-infiltrating myeloid cells shape the malignant microenvironment of colorectal cancer
2023-06-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04281-6
PMID:37344903
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研究论文 | 本研究探讨了MFAP5 + 成纤维细胞与肿瘤浸润性髓系细胞之间的相互作用如何影响结直肠癌的恶性微环境 | 本研究揭示了肿瘤特异性MFAP5 + 成纤维细胞与髓系细胞之间的动态相互作用,并识别出多个肿瘤促进信号通路 | 未提供研究的具体局限性 | 探索结直肠癌中MFAP5 + 成纤维细胞与肿瘤浸润性髓系细胞之间的相互作用及其对肿瘤微环境的影响 | 主要研究MFAP5 + 成纤维细胞及其与肿瘤浸润性髓系细胞的相互作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 27,414个细胞,来自肿瘤及相邻组织 |
17544 | 2024-08-05 |
HOPX is a tumor-suppressive biomarker that corresponds to T cell infiltration in skin cutaneous melanoma
2023-Jun-21, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-023-02962-2
PMID:37344870
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研究论文 | HOPX作为一个肿瘤抑制生物标志物,与皮肤黑色素瘤中的T细胞浸润相关 | HOPX被确认为在SKCM进展中的抑制因子,并可能成为新的免疫治疗靶点 | HOPX在SKCM中的具体功能尚不明确,需要进一步研究 | 探讨HOPX在皮肤黑色素瘤患者中的诊断和预后价值 | 皮肤黑色素瘤患者,特别是HOPX表达的影响 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞测序,转录组测序 | A375细胞系 | 生物数据 | 使用TCGA和GEO数据库的多种样本,具体样本数量未提供 |
17545 | 2024-08-05 |
Joint inference of exclusivity patterns and recurrent trajectories from tumor mutation trees
2023-06-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39400-w
PMID:37344522
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研究论文 | 本文提出了一种新的概率框架TreeMHN,用于从肿瘤进化树共同推断排斥模式和重复轨迹 | 创新点在于TreeMHN能同时处理肿瘤的排斥模式和进化轨迹的推断 | 未提及现有方法在多个方面的不足 | 旨在通过肿瘤变异树推断肿瘤的进化过程和突变模式 | 分析血液、肺部和乳腺癌的数据集 | 数字病理学 | 肺癌 | 多区域和单细胞测序 | TreeMHN | 数据集 | NA |
17546 | 2024-08-07 |
Selective oxidative protection leads to tissue topological changes orchestrated by macrophage during ulcerative colitis
2023-06-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39173-2
PMID:37344477
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研究论文 | 本研究利用成像质谱流式细胞技术和单细胞RNA测序技术,描绘了人类结肠生态系统的单细胞景观,并探讨了溃疡性结肠炎中组织拓扑结构的变化及其机制。 | 本研究首次揭示了溃疡性结肠炎区域中组织驻留巨噬细胞的消失反应,并提出了炎症巨噬细胞替代驻留巨噬细胞的机制。 | NA | 理解溃疡性结肠炎生态系统的组成和空间变化 | 人类结肠生态系统的单细胞景观 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 成像质谱流式细胞技术,单细胞RNA测序 | NA | 图像,基因表达数据 | NA |
17547 | 2024-08-07 |
Integrative scATAC-seq and scRNA-seq analyses map thymic iNKT cell development and identify Cbfβ for its commitment
2023-Jun-20, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00547-x
PMID:37336875
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞转座酶可及染色质测序(scATAC-seq)技术,分析了超过17,000个iNKT细胞的转录组和超过39,000个iNKT细胞的染色质可及性状态,以描绘胸腺中iNKT细胞的发育轨迹并识别关键的转录因子Cbfβ。 | 本研究首次揭示了iNKT细胞在胸腺中的发育程序及其细胞异质性,并发现了一个新的转录因子Cbfβ,该因子在iNKT细胞早期承诺阶段起关键作用。 | NA | 揭示胸腺中iNKT细胞的发育程序及其细胞异质性,并识别关键的转录因子。 | iNKT细胞的发育过程及其分子机制。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞转座酶可及染色质测序(scATAC-seq) | NA | 转录组和染色质可及性数据 | 超过17,000个iNKT细胞的转录组和超过39,000个iNKT细胞的染色质可及性状态 |
17548 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling of sepsis identifies HLA-DRlowS100Ahigh monocytes with immunosuppressive function
2023-06-19, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-023-00462-y
PMID:37337301
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了与免疫抑制状态相关的HLA-DRlowS100Ahigh单核细胞的特征 | 本研究首次识别出HLA-DRlowS100Ahigh单核细胞,这些细胞在脓毒症患者中显著富集并可能具有免疫抑制功能 | 本研究主要依赖于已有的数据集,可能存在样本选择偏差 | 探讨脓毒症患者中免疫抑制的免疫细胞特征及其潜在治疗靶点 | 脓毒症患者的单核细胞亚群体 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自脓毒症患者和小鼠模型的两个已发表的数据集 |
17549 | 2024-08-05 |
Analysis of Notch1 signaling in mammalian sperm development
2023-Jun-19, BMC research notes
IF:1.6Q2
DOI:10.1186/s13104-023-06378-z
PMID:37337280
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研究论文 | 本文分析了Notch1信号在哺乳动物精子发育中的作用 | 利用转基因小鼠系统研究Notch1信号在精子发育中的表达情况,发现其在正常精子发育中的作用或许被低估 | 在转基因小鼠模型中未观察到Notch1信号的活跃表达,可能影响结果的普适性 | 验证Notch1在精子发育过程中的实际作用 | 小鼠和人类睾丸中的精子细胞谱系 | 数字病理 | NA | RNA-seq | NA | 单细胞数据 | 四个单细胞RNA-seq数据集 |
17550 | 2024-08-05 |
Significance of liquid-liquid phase separation (LLPS)-related genes in breast cancer: a multi-omics analysis
2023-06-19, Aging
DOI:10.18632/aging.204812
PMID:37338518
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研究论文 | 本研究探索了与液-液相分离(LLPS)相关的基因在乳腺癌中的重要性 | 建立了一个由九个基因组成的LLPS相关预后模型,特别是发现PGAM1作为新标记 | 研究模型的应用和验证主要集中在特定数据集和基因上,可能不适用于所有乳腺癌患者 | 探讨液-液相分离在乳腺癌中的作用和相关基因的重要性 | 乳腺癌细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序,转录组测序, COX回归,Lasso回归 | 加权共表达网络分析(WGCNA) | 基因表达数据 | 使用了GSE188600和GSE198745的单细胞测序数据集及转录组测序数据,具体样本数量未提及 |
17551 | 2024-08-05 |
Prioritization and functional validation of target genes from single-cell transcriptomics studies
2023-06-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05006-7
PMID:37330599
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研究论文 | 该文章探讨了如何从单细胞转录组学研究中优先选择并功能验证靶基因 | 文章创新性地通过针对未报告的高排名尖端内皮细胞标记基因进行优先选择和功能验证 | 并非所有高排名的scRNA-seq标记都表现出预测功能,这可能限制了目标的实际应用 | 目标是选择和验证与血管生成相关的尖端内皮细胞靶基因 | 研究对象为尖端内皮细胞的标记基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因 | 六个候选基因 |
17552 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic profiling of microvascular endothelial cell heterogeneity in congenital diaphragmatic hernia
2023-06-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-37050-y
PMID:37330615
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术,探讨了先天性膈疝(CDH)中微血管内皮细胞的异质性及其与肺发育不良和重塑的关系 | 首次揭示了CDH肺中微血管内皮细胞的三个不同集群,并发现CDH微血管内皮细胞集群具有独特的炎症转录组特征 | 研究仅使用了硝苯酚诱导的CDH模型,可能限制了结果的普遍性 | 探究先天性膈疝肺中微血管内皮细胞的异质性及其与肺发育不良和重塑的关系 | 先天性膈疝(CDH)肺中的微血管内皮细胞 | 数字病理学 | 先天性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了E21.5的硝苯酚模型中的大鼠胎儿,包括健康对照组(2HC)、硝苯酚暴露对照组(NC)和硝苯酚暴露的CDH组 |
17553 | 2024-08-05 |
Heterogeneity of tumor immune microenvironment in malignant and metastatic change in LUAD is revealed by single-cell RNA sequencing
2023-06-16, Aging
DOI:10.18632/aging.204752
PMID:37335089
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了肺腺癌(LUAD)肿瘤免疫微环境的异质性。 | 通过单细胞测序技术,分析了LUAD中不同细胞类型的转录组特征,并识别了709个在LUAD微环境中发挥重要作用的基因。 | 本文没有详细说明样本的多样性及其对结果的影响。 | 研究肺腺癌的肿瘤微环境及其在恶性和转移变化中的异质性。 | 主要研究对象是肺腺癌(LUAD)中的免疫细胞和其相关的转录组特征。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
17554 | 2024-08-07 |
Feedback circuits are numerous in embryonic gene regulatory networks and offer a stabilizing influence on evolution of those networks
2023-Jun-16, EvoDevo
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s13227-023-00214-y
PMID:37322563
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研究论文 | 本文重新分析了两种海胆物种的发育基因调控网络(dGRNs),重点关注基因首次表达的时间,并发现了先前未被识别的反馈回路 | 发现了先前未被识别的反馈回路,并提出这些回路可能在高度保守的dGRNs中缓冲异时性表达的影响 | NA | 研究两种海胆物种的发育基因调控网络的相似性和差异 | Lytechinus variegatus和Strongylocentrotus purpuratus的发育基因调控网络 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 两种海胆物种的基因调控网络数据 |
17555 | 2024-08-07 |
Cord blood-derived Vδ2+ and Vδ2- T cells acquire differential cell state compositions upon in vitro expansion
2023-06-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf3120
PMID:37327346
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研究论文 | 研究了人脐带血来源的γδ T细胞在体外扩增过程中不同亚型的细胞状态组成差异 | 通过单细胞RNA测序追踪了脐带血来源的γδ T细胞在体外扩增过程中的分化过程,并揭示了不同亚型细胞的克隆特异性分化动态 | NA | 探讨人脐带血来源的γδ T细胞在早期新生儿阶段的内在细胞差异,并优化细胞制造过程 | 人脐带血来源的γδ T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
17556 | 2024-08-07 |
Single cell profiling of female breast fibroadenoma reveals distinct epithelial cell compositions and therapeutic targets
2023-06-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39059-3
PMID:37328469
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了女性乳腺纤维腺瘤和正常乳腺组织的细胞组成,揭示了纤维腺瘤中上皮细胞的独特结构变化和功能特征,并开发了一种可扩展的人类纤维腺瘤类器官系统,探索了潜在的治疗策略。 | 首次利用单细胞RNA测序技术详细描述了纤维腺瘤的细胞组成和结构变化,并开发了可扩展的纤维腺瘤类器官系统,为纤维腺瘤的治疗提供了新的策略。 | 研究主要集中在细胞和类器官水平,尚未进行临床试验验证治疗策略的有效性。 | 揭示纤维腺瘤的细胞组成和结构变化,探索潜在的治疗方法。 | 女性乳腺纤维腺瘤和正常乳腺组织的上皮细胞。 | 数字病理学 | 乳腺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 人类纤维腺瘤和正常乳腺组织样本 |
17557 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome dataset of human and mouse in vitro adipogenesis models
2023-06-16, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02293-x
PMID:37328521
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研究论文 | 本文介绍了人类和小鼠体外脂肪形成模型的单细胞转录组数据集 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成前后的转录变化 | NA | 研究脂肪形成过程中细胞间的转录变异 | 3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成前后的转录变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 混合的3T3-L1和SGBS细胞 |
17558 | 2024-08-07 |
Discovery and characterization of potent pan-variant SARS-CoV-2 neutralizing antibodies from individuals with Omicron breakthrough infection
2023-06-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39267-x
PMID:37322000
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和BCR测序,从接种过疫苗并感染奥密克戎变异株的患者中发现了针对多种SARS-CoV-2变异株的中和抗体 | 本文首次从奥密克戎突破感染患者的恢复期血浆中筛选出具有广谱中和活性的抗体,并通过冷冻电镜分析揭示了多种刺突蛋白识别模式 | NA | 开发针对多种SARS-CoV-2变异株的广谱抗病毒药物 | 从奥密克戎突破感染患者的B细胞中筛选出具有广谱中和活性的抗体 | 生物技术 | 新冠肺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和BCR测序(scBCR-seq) | NA | 基因序列 | 来自接种过2或3剂灭活疫苗并感染奥密克戎变异株的患者 |
17559 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing of stria vascularis cells in the adult Slc26a4-/- mouse
2023-06-15, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01549-0
PMID:37322474
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了Slc26a4-/-小鼠的血管纹细胞,以识别可能影响内淋巴pH稳态的pH调节因子及其细胞致病机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了Slc26a4-/-小鼠血管纹细胞的基因表达谱,揭示了pH依赖性变化及其在SLC26A4相关听力损失中的潜在作用 | NA | 识别影响内淋巴pH稳态的pH调节因子及其细胞致病机制 | Slc26a4-/-小鼠的血管纹细胞 | 数字病理学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型(WT, Slc26a4+/+)和Slc26a4-/-小鼠的血管纹细胞 |
17560 | 2024-08-07 |
Formation of Müller glia-derived progenitor cells in retinas depleted of microglia
2023-Jun-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.08.544205
PMID:37333380
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研究论文 | 研究通过scRNA-seq技术分析了在鸡视网膜中微胶质细胞缺失后Müller胶质细胞的转录变化,探讨了微胶质细胞对Müller胶质细胞衍生前体细胞形成的影响。 | 首次揭示了微胶质细胞在视网膜损伤后通过调节HBEGF、FGF和视黄酸信号通路促进Müller胶质细胞向增殖性前体细胞转化的作用。 | 研究主要集中在鸡视网膜模型,可能需要进一步在其他物种中验证这些发现。 | 探讨微胶质细胞在视网膜损伤后对Müller胶质细胞衍生前体细胞形成的影响。 | 鸡视网膜中的Müller胶质细胞和微胶质细胞。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 鸡视网膜样本 |