单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 17521 - 17540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17521 | 2024-08-05 |
Single-cell atlas of dental pulp stem cells exposed to the oral bacteria Porphyromonas gingivalis and Enterococcus faecalis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1166934
PMID:37287452
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研究论文 | 本文探讨了口腔细菌对人类牙髓干细胞的影响及其机制 | 该研究建立了牙髓干细胞在细菌刺激下的单细胞转录组图谱，并揭示了细菌如何影响干细胞的分化和再生能力 | 文章未详细探讨不同细菌种类的影响程度和比较分析 | 研究人类牙髓干细胞在细菌侵袭下的反应机制 | 人类牙髓干细胞（hDPSCs） | 数字病理学 | 牙髓炎和根尖周围炎 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 17522 | 2024-08-07 |
Bioinformatic analysis reveals potential relationship between chondrocyte senescence and protein glycosylation in osteoarthritis pathogenesis
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1153689
PMID:37265706
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，探讨了软骨细胞衰老与蛋白质糖基化在骨关节炎发病机制中的潜在关系 | 揭示了软骨细胞衰老信号与O-连接糖基化途径在骨关节炎发病机制中的相互关联 | NA | 研究软骨细胞衰老与蛋白质糖基化在骨关节炎发病机制中的关系 | 骨关节炎患者的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自Gene Expression Omnibus数据库的临床骨关节炎样本 |
| 17523 | 2024-08-07 |
Refined expression quantitative trait locus analysis on adenocarcinoma at the gastroesophageal junction reveals susceptibility and prognostic markers
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1180500
PMID:37265963
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研究论文 | 本研究旨在探索胃食管交界处腺癌（ACGEJ）的细胞类型水平表达数量性状位点（eQTL），并识别易感性和预后标记 | 本研究通过精细的eQTL分析，识别了2,036个潜在的ACGEJ特异性eQTL，并发现ACGEJ-gain eQTL在启动子区域富集程度高于ACGEJ-loss eQTL | NA | 探索胃食管交界处腺癌的细胞类型水平表达数量性状位点，并识别易感性和预后标记 | 胃食管交界处腺癌（ACGEJ） | 数字病理学 | 胃食管交界处腺癌 | 全基因组测序（WGS），RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 线性混合模型 | 基因组数据，转录组数据 | 120对来自中国ACGEJ患者的样本 |
| 17524 | 2024-08-07 |
Neutrophil-Derived IL-6 Potentially Drives Ferroptosis Resistance in B Cells in Lupus Kidney
2023, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/2023/9810733
PMID:37273451
|
研究论文 | 本研究通过scRNA-seq技术和流式细胞术，发现中性粒细胞中IL-6表达上调，并与狼疮肾炎中B细胞的IL-6受体和SLC7A11表达相关，揭示了中性粒细胞通过IL-6促进B细胞铁死亡抵抗的机制。 | 首次揭示了中性粒细胞通过IL-6和SLC7A11介导的B细胞铁死亡抵抗机制，为理解狼疮肾炎中中性粒细胞与B细胞的相互作用提供了新视角。 | NA | 探究狼疮肾炎中B细胞铁死亡抵抗的机制。 | 中性粒细胞和B细胞在狼疮肾炎中的相互作用。 | NA | 狼疮肾炎 | scRNA-seq, 流式细胞术 | NA | RNA | NA |
| 17525 | 2024-08-07 |
In-depth mining of single-cell transcriptome reveals the key immune-regulated loops in age-related macular degeneration
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1173123
PMID:37273909
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研究论文 | 本研究通过深入分析年龄相关性黄斑变性（AMD）的单细胞转录组，揭示了关键的免疫调节环路 | 本研究采用细胞表达特异性基因（CESG）作为指标，识别新的细胞标记物，并设计计算框架探索细胞特异性转录因子调节环路 | 年龄相关性黄斑变性是一种多因素疾病，其病理生理机制复杂，仍是一个持续的挑战 | 旨在更好地理解疾病发病机制并识别有效治疗靶点 | 年龄相关性黄斑变性的单细胞转录组 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞基因组学 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 17526 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals a cellular immune response in freshwater dark sleeper (Odontobutis potamophila) after infection with Aeromonas veronii
2023, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2023.1201914
PMID:37275236
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析（scRNA-seq）探讨了淡水暗睡鱼（Odontobutis potamophila）头部肾脏细胞在感染Aeromonas veronii后的基因表达调控及细胞免疫反应 | 本研究首次揭示了淡水暗睡鱼在感染Aeromonas veronii后，其头部肾脏细胞中B细胞、内皮细胞、巨噬细胞和粒细胞的基因表达差异，以及中性粒细胞的活化和免疫反应的激活 | NA | 研究淡水暗睡鱼在感染Aeromonas veronii后的细胞免疫反应及基因表达调控 | 淡水暗睡鱼的头部肾脏细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组 | 涉及B细胞、内皮细胞、巨噬细胞和粒细胞等多种细胞类型 |
| 17527 | 2024-08-07 |
The human Stat1 gain-of-function T385M mutation causes expansion of activated T-follicular helper/T-helper 1-like CD4 T cells and sex-biased autoimmunity in specific pathogen-free mice
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1183273
PMID:37275873
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研究论文 | 研究了人类STAT1基因的增益功能突变T385M在无特定病原体小鼠中的免疫影响，发现该突变导致激活的T滤泡辅助/T辅助1样CD4 T细胞扩张和性别偏向性自身免疫。 | 首次在无特定病原体条件下模拟STAT1 DNA结合域增益功能突变对免疫系统的影响，并通过单细胞RNA测序分析揭示了突变对B细胞和T细胞转录程序的激活作用。 | 研究仅在特定条件下的小鼠模型中进行，可能需要进一步在人类中验证这些发现。 | 探究STAT1增益功能突变在无特定病原体小鼠中的免疫影响及其与自身免疫的关系。 | STAT1 T385M突变小鼠的淋巴细胞及其在不同年龄段的免疫变化。 | 免疫学 | 自身免疫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Stat1T385M/+突变小鼠的淋巴细胞样本 |
| 17528 | 2024-08-07 |
A single-cell RNA sequencing atlas of circulating leukocytes from healthy and osteosarcoma affected dogs
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1162700
PMID:37275879
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对健康犬和骨肉瘤患犬的循环白细胞进行了详细的细胞图谱构建，并探讨了骨肉瘤对循环免疫细胞转录组的影响 | 首次构建了犬类循环白细胞的单细胞RNA测序图谱，并分析了骨肉瘤对这些细胞转录组的影响 | 研究样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨犬类作为疾病模型的适用性，并深入了解犬类免疫细胞的特性 | 健康犬和骨肉瘤患犬的循环白细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康犬7只，骨肉瘤患犬10只 |
| 17529 | 2024-08-07 |
The increased cfRNA of TNFSF4 in peripheral blood at late gestation and preterm labor: its implication as a noninvasive biomarker for premature delivery
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1154025
PMID:37275889
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研究论文 | 本研究探讨了晚期妊娠和早产时外周血中TNFSF4的cfRNA增加，并评估其作为非侵入性早产标志物的潜力 | 发现TNFSF4在晚期妊娠和早产时在外周血中的表达增加，可能作为非侵入性早产检测的新型cfRNA标志物 | NA | 识别早产的潜在生物标志物，并探讨母胎信号如何协同调节母胎界面的炎症过程 | 孕妇外周血中的cfRNA和外泌体miRNA | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 研究包括不同妊娠年龄经历足月或早产的孕妇 |
| 17530 | 2024-08-07 |
Deciphering the single-cell transcriptome network in keloids with intra-lesional injection of triamcinolone acetonide combined with 5-fluorouracil
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1106289
PMID:37275903
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了三胺环己酮（TAC）与5-氟尿嘧啶（5-FU）联合注射治疗瘢痕疙瘩的基因表达调控和细胞重编程模式 | 本研究揭示了TAC+5-FU通过中断成纤维细胞向促纤维化亚型的分化轨迹和抑制细胞间FGF信号通路，诱导瘢痕疙瘩萎缩，并刺激部分成纤维细胞具有自我复制和多向分化潜能 | 本研究未充分探讨TAC+5-FU抑制瘢痕疙瘩增殖的分子机制 | 阐明TAC+5-FU注射治疗瘢痕疙瘩的分子和细胞重编程机制 | 瘢痕疙瘩、皮肤及TAC+5-FU治疗后的瘢痕疙瘩 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 17531 | 2024-08-07 |
Machine learning-based solution reveals cuproptosis features in inflammatory bowel disease
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1136991
PMID:37275904
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研究论文 | 本文利用机器学习方法揭示了炎症性肠病中铜死亡特征的相关基因及其与免疫微环境的关系 | 首次系统研究了铜死亡相关基因在炎症性肠病中的临床意义及其与免疫微环境的关联 | NA | 探讨铜死亡在炎症性肠病中的作用及其相关基因作为免疫标志物和治疗靶点的潜力 | 铜死亡相关基因在炎症性肠病患者中的表达及其与免疫微环境的关系 | 机器学习 | 炎症性肠病 | 单样本GSEA (ssGSEA)、基因集富集分析 (GSEA)、基因集变异分析 (GSVA)、CIBERSORT、加权基因共表达网络分析 (WGCNA)、差异表达基因分析 (DEGs)、蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络构建、分子复合物检测 (MCODE) 算法、单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 使用了多个基因表达数据集 (GSE75214, GSE36807, GSE10616) 和公开的单细胞RNA测序数据集 |
| 17532 | 2024-08-07 |
Upregulation of HCFC1 expression promoted hepatocellular carcinoma progression through inhibiting cell cycle arrest and correlated with immune infiltration
2023, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.84579
PMID:37283799
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研究论文 | 本文研究了宿主细胞因子1（HCFC1）在肝细胞癌（HCC）中的表达及其对预后和免疫特性的影响 | 首次揭示了HCFC1在HCC患者预后和免疫特性中的作用 | 研究主要基于TCGA数据集和150名HCC患者的队列，可能需要更大规模的研究来验证结果 | 探讨HCFC1在HCC中的表达及其对预后和免疫特性的影响 | HCFC1在HCC中的表达及其与细胞周期、免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 150名HCC患者 |
| 17533 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals dysregulated inflammatory response in peripheral blood immunity in patients with acute respiratory distress syndrome
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1199122
PMID:37283946
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量测序技术，分析了健康志愿者和患有脓毒症相关急性呼吸窘迫综合征（sep-ARDS）及肺炎相关急性呼吸窘迫综合征（PNE-ARDS）患者的外周血单核细胞转录组，揭示了不同病因ARDS在细胞和分子水平以及生物信号通路上的差异性改变 | 首次详细揭示了不同病因ARDS患者外周血免疫细胞亚群的动态变化及其在细胞凋亡、炎症和免疫相关通路中的作用 | NA | 确定不同病因急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的差异机制，以提高ARDS治疗的有效性 | 健康志愿者和患有脓毒症相关ARDS及肺炎相关ARDS患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量测序 | NA | 转录组数据 | 健康志愿者和不同病因ARDS患者的样本 |
| 17534 | 2024-08-07 |
Development of a novel copper metabolism-related risk model to predict prognosis and tumor microenvironment of patients with stomach adenocarcinoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1185418
PMID:37284310
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研究论文 | 本文开发了一种与铜代谢相关的新风险模型，用于预测胃腺癌患者的预后和肿瘤微环境特征 | 首次利用铜代谢相关基因（CMRGs）构建风险模型，并探讨其在胃腺癌预后和免疫治疗反应预测中的应用 | NA | 旨在识别铜代谢相关基因在胃腺癌中的预后价值及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 胃腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据 | 使用TCGA数据库中的胃腺癌队列和GEO数据库中的GSE84437数据集进行验证 |
| 17535 | 2024-08-07 |
Risk prediction model construction for post myocardial infarction heart failure by blood immune B cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1163350
PMID:37287974
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研究论文 | 本研究通过分析心肌梗死患者的外周血单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建了一个用于预测心肌梗死后心力衰竭风险的模型 | 发现了区分心肌梗死后心力衰竭患者与非心力衰竭患者的免疫激活B细胞亚型，并开发了一个包含13个标记基因的预测模型 | NA | 构建一个用于预测心肌梗死后心力衰竭风险的模型 | 心肌梗死患者的外周血样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 包括心肌梗死后发展为心力衰竭和未发展为心力衰竭的患者的外周血样本 |
| 17536 | 2024-08-07 |
Practical bioinformatics pipelines for single-cell RNA-seq data analysis
2022-Jun-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2022.210041
PMID:37288243
|
综述 | 本文概述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的计算分析流程，详细介绍了分析步骤 | 提供了基于最佳实践的指南 | NA | 帮助实验人员分析其数据，并协助用户更新其分析流程 | 单细胞RNA测序数据分析工具的选择和比较 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 17537 | 2024-08-07 |
Single-cell multi-omics sequencing and its applications in studying the nervous system
2022-Jun-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2021.210031
PMID:37288245
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综述 | 本文综述了单细胞多组学测序技术及其在神经系统研究中的应用 | 介绍了从单细胞转录组测序到多组学分析的发展，以及如何通过这些技术提高对神经系统的理解 | NA | 探讨单细胞多组学测序技术在神经系统研究中的应用及未来可能解决的科学问题 | 神经系统 | NA | NA | 单细胞多组学测序 | NA | 转录组、DNA甲基化组、染色质可及性等 | 从数百个细胞到数万个细胞 |
| 17538 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics: new dimension of understanding biological complexity
2022-Jun-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2021.210037
PMID:37288247
|
综述 | 本文综述了空间转录组学技术的发展及其在理解生物复杂性中的应用 | 介绍了多种空间解析技术，这些技术提供了新的维度来探究区域基因表达、细胞微环境、解剖异质性和细胞间相互作用 | NA | 加速理解生物复杂性的新发现 | 空间转录组学技术及其在生物学中的应用 | 基因组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 17539 | 2024-08-07 |
Exploration of s new biomarker in osteosarcoma and association with clinical outcomes: TOP2A+ cancer associated fibroblasts
2023-Nov, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3528
PMID:37246449
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研究论文 | 本研究探索了骨肉瘤中的新型生物标志物TOP2A+癌症相关成纤维细胞及其与临床结果的关联 | 首次系统研究了癌症相关成纤维细胞（CAFs）在骨肉瘤中的作用，并识别出TOP2A+ CAFs作为致癌CAFs的亚群 | 研究样本量较小，仅基于6名骨肉瘤患者的单细胞RNA测序数据 | 旨在探索骨肉瘤中的新型生物标志物并评估其对临床结果的影响 | 骨肉瘤及其相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 6名骨肉瘤患者的单细胞RNA测序数据及88个骨肉瘤样本的转录组数据 |
| 17540 | 2024-08-05 |
Expression of Rab25 is down-regulated in the foreskin of children with hypospadias
2023-10, Journal of pediatric urology
IF:2.0Q2
DOI:10.1016/j.jpurol.2023.05.006
PMID:37246119
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研究论文 | 本研究探讨了Rab25在隐睾症儿童包皮组织中的表达情况 | 首次报告了Rab25在隐睾症患者包皮组织中的异常表达 | 研究样本量相对较小且仅限于某一地区的儿童 | 探讨Rab25在隐睾症发病机制中的关键分子调控作用 | 18名接受隐睾症修复手术的儿童及18名有包茎的儿童作为对照组 | 数字病理学 | 隐睾症 | 免疫组化、西方印迹、免疫荧光和聚合酶链反应 | NA | 生物样本 | 36名儿童（18名隐睾症儿童和18名包茎儿童） |