单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 17521 - 17540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17521 | 2024-08-05 |
Identification of In-Droplet Multicellular Communities by Light-Induced Combinatorial DNA Barcoding
2023-Sep-21, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202301133
PMID:37404204
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研究论文 | 提出了一种通过光诱导组合DNA条形码在微滴中识别多细胞群落的策略 | 首次使用DNA功能化微颗粒作为微滴内亚群体的标识符，解决了单细胞测序分析中缺乏有效分子标识符的问题 | 未提及具体的实验验证或在复杂细胞环境中的应用 | 开发一种新的方法来识别微滴中的多细胞群落 | 异质细胞池中的细胞-细胞相互作用 | 数字病理学 | NA | DNA条形码 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 17522 | 2024-08-05 |
Deep learning applications in single-cell genomics and transcriptomics data analysis
2023-Sep, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.115077
PMID:37393865
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研究论文 | 本文探讨了深度学习在单细胞基因组学和转录组学数据分析中的应用 | 提出深度学习方法作为传统机器学习算法的潜在替代，特别是在单细胞研究中，同时显示出在数据预处理和下游分析中的优越性 | 深度学习尚未彻底改变单细胞组学领域面临的最紧迫挑战 | 评估深度学习技术在单细胞组学中的应用效果及其面临的独特挑战 | 单细胞基因组学、转录组学、空间转录组学和多组学整合 | 计算机视觉 | 癌症 | 深度学习 | NA | NA | NA |
| 17523 | 2024-08-05 |
Multi-omics dissection of stage-specific artemisinin tolerance mechanisms in Kelch13-mutant Plasmodium falciparum
2023-09, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2023.100978
PMID:37385107
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研究论文 | 本文研究了携带Kelch13 C580Y突变的Plasmodium falciparum对青蒿素的部分抗性机制 | 通过多组学策略，揭示了青蒿素部分抗性中的阶段特异性机制，提供了新的见解 | 研究可能主要集中在少数基因和蛋白，未涵盖所有潜在的抗性机制 | 探讨Plasmodium falciparum对青蒿素的部分抗性机制及其在不同发展阶段的表现 | 研究对象为具有Kelch13突变的Plasmodium falciparum及其对青蒿素的反应 | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞转录组学、无标记蛋白组学、脂质组学 | NA | 基因组数据、蛋白质组数据 | 包括多种阶段的Plasmodium falciparum样本，具体样本数量未明确说明 |
| 17524 | 2024-08-05 |
AT2 cell-derived IgA trapped by the extracellular matrix in silica-induced pulmonary fibrosis
2023-Sep, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110545
PMID:37390644
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研究论文 | 该研究发现肺上皮细胞通过分泌IgA促进硅引起的肺纤维化 | 首次证明AT2细胞参与IgA的分泌，并且IgA的分泌通过细胞外基质被捕获，进一步加重肺纤维化 | 研究主要集中在小鼠模型中，尚未在人体样本中得出明确的结果 | 探讨肺上皮细胞的IgA分泌与硅诱导的肺纤维化之间的关系 | 研究对象为硅处理的小鼠及其肺部组织 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间转录组学和单细胞测序 | NA | 组织样本 | 纳入了硅处理的小鼠样本，具体样本数量未提及 |
| 17525 | 2024-08-05 |
Cancer-associated fibroblast expression of glutamine fructose-6-phosphate aminotransferase 2 (GFPT2) is a prognostic marker in gastric cancer
2023-09, The journal of pathology. Clinical research
DOI:10.1002/cjp2.333
PMID:37395335
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研究论文 | 研究表明，GFPT2在胃癌中的表达与预后相关 | 首次确认GFPT2在胃癌相关成纤维细胞中的重要功能，并提出其作为预后标志物的潜力 | 研究中未详细探讨GFPT2的具体作用机制 | 探讨GFPT2在胃癌中的生物学功能及临床意义 | 胃癌患者的转录组数据及相关细胞系和组织样本 | 数字病理 | 胃癌 | 转录组测序 | NA | 文本数据 | 分析了来自Harbin Medical University和The Cancer Genome Atlas的多个样本 |
| 17526 | 2024-08-07 |
Clonal architecture and single-cell transcriptome landscape in Richter's syndrome
2023-09, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.18952
PMID:37401149
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17527 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a pro-metastatic subpopulation and the driver transcription factor NFE2L1 in ovarian cancer cells
2023-09, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01418-1
PMID:37405595
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了卵巢癌细胞中的促转移亚群及驱动转录因子NFE2L1 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了卵巢癌细胞中的促转移亚群，并确定了NFE2L1作为关键的转录因子 | NA | 阐明基因表达改变在获得转移潜能过程中的机制，并鉴定卵巢癌细胞中的转移亚群 | 卵巢癌细胞及其转移亚群 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两个卵巢癌细胞系：SKOV-3和SKOV-3-13 |
| 17528 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals cellular heterogeneity and highlights Fstl1-regulated alveolar myofibroblasts in mouse lung at birth
2023-09, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2023.110677
PMID:37406975
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了野生型和Fstl1基因敲除小鼠肺部的细胞异质性，并揭示了Fstl1调控的肺泡肌成纤维细胞的作用 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了Fstl1调控的肺泡肌成纤维细胞在肺发育中的作用，并阐明了其分子机制 | NA | 探究Fstl1在肺发育中的作用及其分子机制 | 野生型和Fstl1基因敲除小鼠的肺部细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 22,774个单细胞样本 |
| 17529 | 2024-08-07 |
Classification and characterisation of extracellular vesicles-related tuberculosis subgroups and immune cell profiles
2023-09, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17836
PMID:37409682
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研究论文 | 本文通过分析外泌体相关基因表达谱，探索了结核病（TB）的分子机制和潜在诊断标记物，并利用机器学习技术建立了TB风险模型。 | 本文首次通过外泌体相关基因表达谱分析，结合单细胞RNA测序技术，识别出九个与TB相关的重要基因，并建立了TB风险模型，为TB的诊断和治疗提供了新的生物标志物。 | NA | 探索结核病的分子机制，寻找有效的诊断标记物和治疗靶点。 | 结核病及其相关的外泌体和免疫细胞。 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 20个外泌体相关差异表达基因，其中17个上调，3个下调 |
| 17530 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq Revealed that Altered Tumor Infiltrating Lymphocytes in Cirrhotic Liver Indicate Development of Hepatocellular Carcinoma
2023-Aug-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2022.00062
PMID:37408821
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研究论文 | 本研究探讨了健康、肝硬化和肝细胞癌（HCC）肿瘤组织中的免疫微环境特征 | 发现肝硬化患者中减少的天真T细胞浸润和增加的中性粒细胞浸润可能是HCC发展的指征，并且这些免疫细胞亚群的动态变化可能作为新的生物标志物 | 本研究可能对肝硬化和HCC的生物标志物识别存在局限性，需进一步验证 | 旨在识别肝硬化向HCC过渡的免疫生物标志物 | 研究对象包括健康肝、肝硬化肝和HCC肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 样本表达矩阵 | NA |
| 17531 | 2024-08-05 |
Probabilistic tensor decomposition extracts better latent embeddings from single-cell multiomic data
2023-08-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad570
PMID:37403780
|
研究论文 | 该文章提出了一种概率张量分解框架，SCOIT，用于从单细胞多组学数据中提取嵌入。 | SCOIT结合了多种分布来处理稀疏、嘈杂和异质的单细胞数据，提升了嵌入的提取质量。 | NA | 研究单细胞多组学数据的嵌入提取和分析方法。 | 八个来自不同测序协议的单细胞多组学数据集。 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 多组学数据 | 八个单细胞多组学数据集 |
| 17532 | 2024-08-07 |
DOT1L activity affects neural stem cell division mode and reduces differentiation and ASNS expression
2023-08-03, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256233
PMID:37382163
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研究论文 | 本文研究了组蛋白甲基转移酶DOT1L的酶活性对神经干细胞分裂模式的影响，并探讨了其对神经元分化和ASNS表达的调控作用 | 首次揭示了DOT1L通过调控神经干细胞的分裂模式和代谢基因的转录，影响神经元分化和ASNS表达 | NA | 探讨DOT1L在皮质神经发生中的作用及其分子机制 | 神经干细胞的分裂模式和神经元分化 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 17533 | 2024-08-05 |
Developmental emergence of cortical neurogliaform cell diversity
2023-08-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201830
PMID:37401408
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研究论文 | 研究聚焦于皮层神经胶质细胞的多样性及其发育过程 | 揭示了皮层神经胶质细胞的分子亚型及其发育中的标志性转录因子Tox2的重要性 | 本研究主要集中于小鼠大脑皮层，可能不适用于其他物种的神经胶质细胞研究 | 探讨皮层神经胶质细胞的发育过程及其多样性 | 小鼠的皮层神经胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学, CRISPR-Cas9 | NA | NA | 使用小鼠模型的不同发育阶段的神经胶质细胞 |
| 17534 | 2024-08-05 |
Integrated analysis identifies RAC3 as an immune-related prognostic biomarker associated with chemotherapy sensitivity in endometrial cancer
2023-08, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17824
PMID:37386813
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研究论文 | 本研究揭示了RAC3在子宫内膜癌中的作用及其作为免疫相关预后生物标志物的潜力 | 本研究首次指出RAC3在子宫内膜癌中的高表达与化疗敏感性之间的关系，并提出了其作为新型诊断生物标志物的可能性 | 本研究未提供RAC3在不同癌症类型中的比较数据，局限于子宫内膜癌的特定分析 | 探讨RAC3在子宫内膜癌中的作用及其作为化疗敏感性的生物标志物的潜力 | 本研究主要分析了子宫内膜癌组织中的RAC3的表达及其相关性 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床样本 | 基于TCGA，单细胞RNA测序，以及临床样本的分析 |
| 17535 | 2024-08-07 |
PRRX1+MSCs Enhance Mandibular Regeneration during Distraction Osteogenesis
2023-08, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345231176522
PMID:37387366
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研究论文 | 本研究通过建立犬下颌骨牵张成骨和骨缺损模型，探讨了牵张成骨过程中PRRX1+MSCs对下颌骨再生的影响 | 首次通过单细胞RNA测序分析了下颌骨牵张成骨和骨缺损中的细胞差异，并验证了PRRX1+MSCs在牵张成骨中的重要作用 | 研究主要在犬模型中进行，未来需在人类中进一步验证 | 探讨牵张成骨过程中PRRX1+MSCs对下颌骨再生的作用及其机制 | 犬下颌骨牵张成骨和骨缺损模型中的间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9 | NA | 细胞 | 26个细胞集群，代表6种主要细胞群体 |
| 17536 | 2024-08-07 |
Updated skin transcriptomic atlas depicted by reciprocal contribution of single-nucleus RNA sequencing and single-cell RNA sequencing
2023-Aug, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2023.06.005
PMID:37407342
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研究论文 | 本文通过单核RNA测序（snRNA-seq）与单细胞RNA测序（scRNA-seq）相结合的方法，更新了皮肤转录组图谱 | snRNA-seq能够使用冷冻、难以分离的材料，避免了scRNA-seq的局限性，并能更有效地检测转录因子 | NA | 通过snRNA-seq与scRNA-seq并行分析，绘制皮肤细胞图谱 | 皮肤细胞的转录组 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 一个皮肤样本 |
| 17537 | 2024-08-05 |
Dissecting the spermatogonial stem cell niche using spatial transcriptomics
2023-07-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112737
PMID:37393620
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研究论文 | 本文通过空间转录组学系统分析了精原干细胞庇护所的分子和细胞成分 | 结合空间转录组学和计算分析，首次系统地揭示了精原干细胞和其庇护所之间的相互作用 | 对精原干细胞及其庇护所的理解仍然不完全，尤其是在不同的生理状态下 | 研究精原干细胞与其微环境庇护所之间的分子和细胞相互作用 | 小鼠和人类的精原干细胞庇护所 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和人类的样本 |
| 17538 | 2024-08-05 |
Epigenetically regulated RNA-binding proteins signify malaria hypnozoite dormancy
2023-07-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112727
PMID:37392389
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研究论文 | 本研究探讨了调控假疟疾休眠状态的RNA结合蛋白。 | 首次揭示了调控假疟疾休眠的RNA结合蛋白及其基因沉默机制。 | 本研究主要集中在特定基因和模型的分析，可能未涵盖所有相关因子。 | 探索假疟疾休眠的基因调控机制。 | 假疟疾寄生虫，包括Plasmodium vivax和cynomolgi。 | 数字病理学 | 无效疟疾 | 单细胞转录组学，染色质可及性分析，荧光原位RNA杂交 | NA | 基因组数据 | NA |
| 17539 | 2024-08-05 |
Glutamine supplementation reverses manganese neurotoxicity by eliciting the mitochondrial unfolded protein response
2023-Jul-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107136
PMID:37408687
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研究论文 | 这篇文章研究了谷氨酰胺补充如何通过激发线粒体未折叠蛋白反应来逆转锰神经毒性 | 该研究揭示了谷氨酰胺通过增加谷胱甘肽浓度来触发线粒体未折叠蛋白反应，从而减轻锰引起的神经毒性 | 研究主要集中于斑马鱼和人类神经母细胞瘤细胞，结果可能不完全适用于其他神经组织或动物模型 | 探索改善神经线粒体代谢以治疗锰引起的神经毒性的潜在机制 | 研究对象包括斑马鱼多巴胺能神经元和人类神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序和代谢组学分析 | NA | 细胞数据 | 斑马鱼和人类神经母细胞瘤细胞 |
| 17540 | 2024-08-07 |
Identification of BST2 as a conjunctival epithelial stem/progenitor cell marker
2023-Jul-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107016
PMID:37389178
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，从人诱导多能干细胞（hiPSCs）衍生的结膜上皮细胞群体中鉴定出结膜上皮干细胞/祖细胞的特异性标记物BST2 | 首次鉴定出BST2作为结膜上皮干细胞/祖细胞的特异性标记物，并验证了其在分离和扩增这些细胞中的应用 | NA | 鉴定结膜上皮干细胞/祖细胞的特异性标记物 | 结膜上皮干细胞/祖细胞及其标记物 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从人诱导多能干细胞（hiPSCs）衍生的结膜上皮细胞群体 |