单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 17501 - 17520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17501 | 2024-08-07 |
MitoTrace: A Computational Framework for Analyzing Mitochondrial Variation in Single-Cell RNA Sequencing Data
2023-06-04, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14061222
PMID:37372402
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研究论文 | 介绍了一个名为MitoTrace的R包，用于分析单细胞RNA测序数据中的线粒体遗传变异 | MitoTrace能够从单细胞RNA测序数据中稳健地恢复遗传变异，并适用于来自不同平台的scRNAseq数据 | NA | 研究单细胞RNA测序数据中的线粒体遗传变异 | 线粒体遗传变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了多个公开可用的数据集 |
| 17502 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of the sexually dimorphic Drosophila foreleg and its sensory organs during development
2023-06, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002148
PMID:37379332
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了雄性果蝇前肢第一跗节在蛹发育期间的细胞类型多样性及其遗传基础 | 首次揭示了果蝇前肢感觉器官的细胞景观，识别了一种新的细胞类型，并解析了支持细胞在不同感觉器官间的转录组差异 | NA | 探究果蝇前肢感觉器官的细胞类型多样性及其遗传基础 | 雄性果蝇前肢的第一跗节及其感觉器官 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 17503 | 2024-08-07 |
Identification and Functional Analysis of Transcriptome Profiles, Long Non-Coding RNAs, Single-Nucleotide Polymorphisms, and Alternative Splicing from the Oocyte to the Preimplantation Stage of Sheep by Single-Cell RNA Sequencing
2023-05-25, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14061145
PMID:37372325
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，从卵母细胞到胚胎着床前阶段，对绵羊细胞的转录组特征、长非编码RNA、单核苷酸多态性和选择性剪接进行了鉴定和功能分析 | 首次系统地分析了从卵母细胞到胚胎着床前各阶段绵羊细胞的转录组特征、长非编码RNA、单核苷酸多态性和选择性剪接，并构建了单细胞图谱 | NA | 研究胚胎发育过程中转录组特征、长非编码RNA、单核苷酸多态性和选择性剪接的作用 | 绵羊从卵母细胞到胚胎着床前阶段的细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从卵母细胞到胚胎着床前各阶段的绵羊细胞 |
| 17504 | 2024-08-05 |
Prognostic, Immunological, and Mutational Analysis of MTA2 in Pan-Cancer and Drug Screening for Hepatocellular Carcinoma
2023-05-24, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13060883
PMID:37371463
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研究论文 | 本研究探讨了MTA2在33种癌症中的预后价值及其潜在的免疫功能 | 提供了MTA2在不同癌症类型中的系统性分析及其与肿瘤突变负担和免疫细胞浸润的关联 | 缺乏长期的临床数据验证，实验结果在体外环境下可能无法完全代表体内情况 | 探究MTA2在全癌症中的预后作用及免疫功能 | 33种癌症类型中MTA2的表达和功能 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序(scRNA-seq)和免疫组织化学实验 | NA | 数据集分析和生物信息学方法 | HCC细胞系HepG2和不同癌症类型的样本 |
| 17505 | 2024-08-07 |
Revealing the roles of TLR7, a nucleic acid sensor for COVID-19 in pan-cancer
2023-May-09, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2023.05.004
PMID:37362864
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研究论文 | 本研究提出了一种计算框架，全面研究了TLR7在COVID-19和泛癌中的作用，涉及遗传、基因表达、蛋白质、表观遗传和单细胞水平 | 首次系统研究了TLR7在不同癌症中的表达模式及其与COVID-19的关联 | NA | 探讨TLR7在COVID-19和泛癌中的作用及其机制 | TLR7在不同癌症中的表达及其与COVID-19的关联 | 数字病理学 | COVID-19 | 计算框架 | NA | 基因表达数据 | 包括TCGA、GTEx、CCLE、HPA等多个数据库的数据 |
| 17506 | 2024-08-07 |
Decoding the lncRNAome Across Diverse Cellular Stresses Reveals Core p53-effector Pan-cancer Suppressive lncRNAs
2023-05, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-22-0473
PMID:37377895
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研究论文 | 本研究通过结合计算和实验框架，整合泛癌RNAi/CRISPR筛选、基因组、表观遗传和表达谱数据，揭示了跨多种癌症的核心p53转录调控的长非编码RNA（lncRNA），这些lncRNA在不同细胞应激条件下与泛癌细胞生存/生长抑制和患者生存相关。 | 本研究揭示了先前未报告的高可信度核心p53靶向lncRNA，这些lncRNA在不同细胞类型和应激条件下抑制肿瘤发生。 | NA | 研究长非编码RNA在不同细胞应激条件下的转录调控及其在癌症中的功能。 | 长非编码RNA（lncRNA）及其在癌症中的作用。 | 基因组学 | 癌症 | RNAi/CRISPR筛选、单细胞RNA测序 | NA | 基因组、表观遗传和表达谱数据 | 多个癌症类型、多个细胞类型、患者队列 |
| 17507 | 2024-08-05 |
Transcriptome-wide association study reveals novel susceptibility genes for coronary atherosclerosis
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1149113
PMID:37351287
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研究论文 | 本研究通过转录组关联研究筛选冠状动脉动脉粥样硬化的新易感基因 | 识别了19个基因并验证NBEAL1与冠状动脉动脉粥样硬化之间的因果关系，确认了NBEAL1的保护作用 | 未提及具体的研究限制 | 筛选与冠状动脉动脉粥样硬化相关的潜在致病基因及其机制 | 筛选与冠状动脉动脉粥样硬化相关的基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 转录组关联研究（TWAS） | NA | 基因表达数据 | 使用人类冠状动脉单细胞RNA-seq数据进行分析 |
| 17508 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics combined with proteomics of intrathecal IgG reveal transcriptional heterogeneity of oligoclonal IgG-secreting cells in multiple sclerosis
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1189709
PMID:37362001
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学和质谱分析研究了多发性硬化症中产生寡克隆IgG的细胞异质性 | 首次结合单细胞RNA-seq数据和IgG质谱分析，明确了多发性硬化症中产生寡克隆IgG的B细胞谱系 | 研究未充分探讨其他潜在细胞类型的影响，可能限制对整体免疫环境的理解 | 确定多发性硬化症中产生寡克隆IgG的B细胞的表型和来源 | 多发性硬化症患者的脑脊液中的B细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA-seq和质谱分析 | NA | RNA数据和蛋白质数据 | NA |
| 17509 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing in primary intraocular tumors: understanding heterogeneity, the microenvironment, and drug resistance
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1194590
PMID:37359513
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综述 | 本文重点讨论了单细胞测序在评估视网膜母细胞瘤和葡萄膜黑色素瘤患者中的应用 | 单细胞测序为肿瘤生物学的研究提供了独特的视角，揭示了肿瘤异质性、微环境特征和细胞基因组突变 | 未提及具体的研究限制 | 探讨单细胞测序如何帮助理解肿瘤的异质性和微环境 | 研究对象为视网膜母细胞瘤和葡萄膜黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤，葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 17510 | 2024-08-07 |
Integrated multi-omics analyses reveal the altered transcriptomic characteristics of pulmonary macrophages in immunocompromised hosts with Pneumocystis pneumonia
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1179094
PMID:37359523
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了免疫缺陷宿主中肺泡巨噬细胞在肺孢子菌肺炎感染下的转录特征变化 | 首次鉴定出一组在肺孢子菌感染中起保护作用的Mmp12+巨噬细胞，并发现糖皮质激素可抑制其功能 | NA | 探究免疫抑制相关肺炎中先天免疫的异质性和代谢变化 | 免疫缺陷宿主中的肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺孢子菌肺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 野生型C57BL/6小鼠及地塞米松处理的小鼠 |
| 17511 | 2024-08-07 |
Dynamic heterogeneity of colorectal cancer during progression revealed clinical risk-associated cell types and regulations in single-cell resolution and spatial context
2023, Gastroenterology report
IF:3.8Q2
DOI:10.1093/gastro/goad034
PMID:37360193
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组测序技术，揭示了结直肠癌进展过程中肿瘤异质性的动态变化及其与临床风险相关的细胞类型和调控机制 | 首次详细描述了结直肠癌进展中肿瘤异质性的动态变化，并鉴定了与患者总体生存率相关的细胞类型和癌症相关调控枢纽 | 研究仅基于八个单细胞RNA测序数据集和三个空间转录组测序数据集，可能存在样本量不足的问题 | 探究结直肠癌进展过程中肿瘤异质性的动态变化及其与临床风险的关系 | 结直肠癌的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组测序（ST-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组测序数据 | 八个单细胞RNA测序数据集，三个空间转录组测序数据集 |
| 17512 | 2024-08-07 |
Documenting the immune response in patients with COVID-19-induced acute respiratory distress syndrome
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1207960
PMID:37363730
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了COVID-19诱导的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）患者的免疫反应 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了COVID-19诱导的ARDS患者与对照组在单个细胞水平上的显著表型差异 | 研究仅限于外周血样本，未涉及其他组织或器官 | 深入了解COVID-19诱导的ARDS患者的细胞状态 | COVID-19诱导的ARDS患者的外周血细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个COVID-19诱导的ARDS患者的外周血样本 |
| 17513 | 2024-08-07 |
Constructing a cancer stem cell related prognostic model for predicting immune landscape and drug sensitivity in colorectal cancer
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1200017
PMID:37377935
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和批量转录组数据，构建了一个与癌症干细胞相关的预测结直肠癌免疫景观和药物敏感性的预后模型 | 本研究首次构建了一个包含七个基因的预后模型，能够有效区分高风险和低风险患者，并预测化疗和免疫治疗的反应 | NA | 旨在识别重要的癌症干细胞标记基因，并解析这些标记基因在结直肠癌中的作用 | 结直肠癌样本的单细胞RNA测序数据和批量转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | Lasso和stepAIC | 转录组数据 | NA |
| 17514 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq reveals abnormal differentiation of keratinocytes and increased inflammatory differentiated keratinocytes in atopic dermatitis
2023-Nov, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.19256
PMID:37326015
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析了中国群体特应性皮炎中角质形成细胞的异常分化和炎症表型 | 发现了特应性皮炎损伤中IL19+ IGFL1+角质形成细胞的新亚群，并探讨了IL19在角质形成细胞中的作用 | 研究样本数量有限，仅涉及五名特应性皮炎患者 | 深入分析特应性皮炎在中国人群中的转录组特征 | 来自五名成人特应性皮炎患者和四名健康对照的真皮活检样本 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞数据 | 五名特应性皮炎患者和四名健康对照 |
| 17515 | 2024-08-05 |
Investigation and verification of GIMAP6 as a robust biomarker for prognosis and tumor immunity in lung adenocarcinoma
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04980-z
PMID:37338641
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研究论文 | 本研究探讨了GIMAP6在肺腺癌中的预后和肿瘤免疫中的作用 | 确认GIMAP6作为一个有效的预后分子，并参与肺腺癌免疫微环境的调节 | 未提及具体的限制 | 探索GIMAP6在肺腺癌发展及肿瘤免疫中的影响 | 肺腺癌患者和细胞模型 | 数字病理 | 肺癌 | 反转录定量PCR、西方印迹、细胞计数试剂盒-8及其他细胞实验 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未提及 |
| 17516 | 2024-08-05 |
Comprehensive landscape of the miRNA-regulated prognostic marker LAYN with immune infiltration and stemness in pan-cancer
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04986-7
PMID:37335337
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研究论文 | 本文研究了miRNA调控的预后标志物LAYN在全癌症中的免疫浸润和干性方面的综合特征 | 揭示了LAYN在多种癌症中的功能机制，并为癌症预后、转移和免疫疗法提供了新见解 | 对LAYN的研究在全癌症的广泛性和深入性方面仍然有限 | 探讨LAYN在全癌症中的作用及其潜在的临床应用 | 主要研究了LAYN在不同类型癌症中的表达情况及其与预后的关系 | 数字病理学 | NA | 生物信息学方法和单细胞测序 | NA | 样本数据，包括健康和癌症患者的基因组数据 | 通过GTEx和TCGA数据库收集健康和癌症患者样本 |
| 17517 | 2024-08-07 |
Unraveling Mechanisms of Autoimmune Skin Blistering: Applying Single-Cell Transcriptomics to Pemphigus B Cells
2023-10, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.05.004
PMID:37330716
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17518 | 2024-08-07 |
Identification a unique disulfidptosis classification regarding prognosis and immune landscapes in thyroid carcinoma and providing therapeutic strategies
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05006-4
PMID:37347261
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研究论文 | 本研究探讨了二硫化物死亡（disulfidptosis）与甲状腺癌（THCA）预后之间的关系，并基于二硫化物死亡相关基因开发了一个预后指数 | 本研究首次利用二硫化物死亡相关基因进行分类，并开发了一个新的分类系统，能够有效预测甲状腺癌患者的临床预后和药物敏感性 | NA | 研究二硫化物死亡与甲状腺癌预后的关联，并开发基于二硫化物死亡基因的预后指数 | 甲状腺癌患者及其预后 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 非负矩阵分解（NMF） | Enet模型 | 基因表达数据、体细胞突变信息、拷贝数变异数据、临床数据 | 甲状腺癌患者的基因表达数据、体细胞突变信息、拷贝数变异数据和临床数据来自TCGA数据库，单细胞转录组数据GSE184362来自GEO数据库 |
| 17519 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from Kimura disease patient successfully treated with dupilumab
2023-10, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.alit.2023.06.002
PMID:37349231
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17520 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals cellular and molecular alterations in small cell lung cancer tumors following chemotherapy
2023-09-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34629
PMID:37334524
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了化疗对小细胞肺癌肿瘤微环境的影响 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了化疗后小细胞肺癌肿瘤微环境中细胞和分子水平的改变 | 研究样本量较小，仅包括五名化疗患者和五名未接受化疗的患者 | 探讨化疗如何影响小细胞肺癌的肿瘤微环境，以指导提高治疗效果 | 小细胞肺癌肿瘤微环境中的细胞和分子变化 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 五名化疗患者和五名未接受化疗的患者 |