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当前共找到 31986 篇文献，本页显示第 17481 - 17500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17481 | 2024-08-04 |
Immune profiling of murine cardiac leukocytes identifies triggering receptor expressed on myeloid cells 2 as a novel mediator of hypertensive heart failure
2023-10-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad093
PMID:37314125
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研究论文 | 本文探讨了小鼠模型中Trem2在高血压性心力衰竭中的新型介导作用 | 发现Trem2在高血压性心力衰竭中的心脏保护作用，并表明其在心脏免疫细胞中的调控 | 尚未确定Trem2在高血压性心力衰竭具体机制的详细信息 | 研究心脏免疫细胞在HFpEF中的改变及其潜在的治疗策略 | 高血压性心力衰竭小鼠模型及其心脏免疫细胞 | 数字病理学 | 心力衰竭 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用小鼠模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 17482 | 2024-08-05 |
Gene signature from cutaneous autoimmune diseases provides potential immunotherapy-relevant biomarkers in melanoma
2023-09-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-42238-3
PMID:37700026
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研究论文 | 本研究探讨了自身免疫性皮肤病中T细胞基因特征在黑色素瘤免疫治疗中的应用潜力 | 提出了自身免疫性皮肤病的基因特征可以作为预测黑色素瘤免疫治疗反应的生物标志物 | 研究可能限制于特定类型的自身免疫性皮肤病，样本数量和多样性尚需进一步验证 | 探讨自身免疫性皮肤病的免疫细胞在黑色素瘤免疫治疗中的有效性 | 自身免疫性皮肤病（系统性红斑狼疮、特应性皮炎、银屑病）中的T细胞基因特征 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自多种自身免疫性皮肤病的样本，具体数量未在摘要中明确 | NA | NA | NA | NA |
| 17483 | 2024-08-05 |
Reanalysis of single-cell RNA sequencing data does not support herpes simplex virus 1 latency in non-neuronal ganglionic cells in mice
2023-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.17.549345
PMID:37503290
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研究论文 | 本文重新分析了单细胞RNA测序数据，未能支持小鼠非神经节细胞中存在单纯疱疹病毒1型的潜伏感染。 | 研究证明了在小鼠模型中，数据分析的不准确性导致了对潜伏病毒存在的错误结论。 | 该研究依赖于现有数据，未能提供新的实验数据。 | 重新分析与单纯疱疹病毒潜伏感染相关的RNA测序数据。 | 小鼠模型中的非神经节细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17484 | 2024-08-07 |
Chemoenzymatic Measurement of LacNAc in Single-Cell Multiomics Reveals It as a Cell-Surface Indicator of Glycolytic Activity of CD8+ T Cells
2023-06-14, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.3c02602
PMID:37276352
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研究论文 | 本文报道了一种化学酶法用于单细胞水平检测N-乙酰乳糖胺（LacNAc），并通过特定DNA条形码标记LacNAc，揭示了其在CD8+ T细胞中的糖酵解活性指示作用。 | 开发了一种新的化学酶法用于单细胞水平的LacNAc检测，该方法与多种单细胞RNA测序平台兼容，并能与TCR序列和细胞表面表位信息（如scTCR和CITE-seq）结合进行多组学分析。 | NA | 研究单细胞水平上LacNAc作为CD8+ T细胞糖酵解活性指示的生物学作用。 | CD8+ T细胞的糖酵解活性和LacNAc水平。 | 生物化学 | NA | 化学酶法 | NA | 单细胞RNA测序 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 17485 | 2024-08-05 |
Creeping fat exhibits distinct Inflammation-specific adipogenic preadipocytes in Crohn's disease
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1198905
PMID:38111581
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研究论文 | 本研究分析了克罗恩病患者中的爬行脂肪及其与炎症特异性脂肪前体细胞的关系 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了爬行脂肪中与炎症和纤维化相关的脂肪前体细胞的特征 | 尚未完全理解爬行脂肪在克罗恩病纤维化发展中的潜在机制 | 分析克罗恩病中爬行脂肪的转录组特征，探索与纤维化和炎症的关系 | 研究了克罗恩病患者的爬行脂肪及其相关的预脂肪细胞群体 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17486 | 2024-08-05 |
Systematic pan-cancer analysis identifies APOC1 as an immunological biomarker which regulates macrophage polarization and promotes tumor metastasis
2022-09, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2022.106376
PMID:35914680
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研究论文 | 本文通过系统的全癌症分析发现APOC1是一个免疫生物标志物，调节巨噬细胞极化并促进肿瘤转移 | 阐明了APOC1在肿瘤免疫中的作用及其在肾细胞癌中异常表达的机制 | 研究主要集中于肾细胞癌，缺乏对其他癌种中APOC1作用的深入探讨 | 探讨APOC1在肿瘤免疫中的角色及其对巨噬细胞极化的影响 | APOC1在不同癌症中的表达及其与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 肿瘤组织和血清样本 | 涉及多种癌症的系统分析和肾细胞癌患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 17487 | 2024-08-05 |
Identification of cell-type-specific marker genes from co-expression patterns in tissue samples
2021-Oct-11, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab257
PMID:33904573
|
研究论文 | 本文提出了一种新算法，通过分析组织样本中的共表达模式来识别细胞特异性标志基因 | 提出了一种半监督算法，结合已知标志基因的信息和大规模转录组数据来精确识别标志基因 | 研究依赖于已发表的可能标志基因的信息，可能影响算法的准确性 | 识别组织样本中特定细胞类型的标志基因 | 组织样本中的细胞类型标志基因 | 数字病理学 | NA | 转录组测序 | 半监督算法 | 大规模转录组数据 | 多个组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 17488 | 2024-08-05 |
Improved integration of single-cell transcriptome and surface protein expression by LinQ-View
2021-08-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2021.100056
PMID:35475142
|
研究论文 | 提出了一种名为LinQ-View的工具包，用于单细胞数据的多模态可视化和分析 | LinQ-View能够整合转录组和细胞表面蛋白表达数据，提供量化的群体纯度评估指标 | 目前数据的应用主要集中在CITE-seq数据上，可能限制了其广泛适用性 | 研究单细胞转录组与表面蛋白表达的集成分析 | 针对受SARS-CoV-2感染患者的单细胞转录组和蛋白表达数据 | 数字病理学 | NA | CITE-seq | NA | 单细胞转录组与蛋白表达数据 | 多个公共CITE-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 17489 | 2024-08-05 |
Distinct populations of antigen-specific tissue-resident CD8+ T cells in human cervix mucosa
2021-08-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.149950
PMID:34156975
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研究论文 | 研究了人类宫颈黏膜中抗原特异性组织驻留CD8+ T细胞的不同群体 | 首次通过单细胞RNA测序定义了人类宫颈中组织驻留记忆T细胞的表型和TCR克隆型 | 缺乏广泛关于人类FRT中T细胞受体库的全面知识 | 研究人类宫颈中组织驻留记忆T细胞的特征及其与特定病毒抗原的关系 | 主要研究人类宫颈黏膜中的CD8+ T细胞亚群 | 数字病理学 | 性传播感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HSV-2血清阳性个体中的Cervical CD8+ TRM克隆型，具体数量未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 17490 | 2024-08-05 |
Mucosal-associated invariant T cell responses differ by sex in COVID-19
2021-06-11, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2021.04.008
PMID:33870241
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研究论文 | 该研究探讨了COVID-19中粘膜相关不变T细胞反应在性别上的差异 | 揭示了女性特有的保护性MAIT细胞特征，可能解释了女性在COVID-19中的低感染率 | 尚未完全了解导致免疫反应性别差异的机制 | 研究性别对COVID-19免疫反应的影响 | 医院和非医院COVID-19感染者的外周血单核细胞样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 36色流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 包括住院和未住院的COVID-19感染者、未感染的密切接触者和健康对照个体的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 17491 | 2024-08-05 |
Profiling B cell immunodominance after SARS-CoV-2 infection reveals antibody evolution to non-neutralizing viral targets
2021-06-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.05.001
PMID:34022127
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研究论文 | 这篇文章解析了SARS-CoV-2感染后记忆B细胞的演变，揭示了抗体对非中和病毒靶点的进化 | 首次通过单细胞测序分析COVID-19患者的SARS-CoV-2反应性B细胞，并揭示了抗体对非中和内源性抗原的适应性 | 研究样本仅限于38名COVID-19患者，可能限制了结果的普适性 | 了解SARS-CoV-2感染后记忆B细胞的演变及其对二次暴露时抗体的重要性 | 研究对象为38名COVID-19患者的记忆B细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 38名COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |
| 17492 | 2024-08-05 |
Clonal kinetics and single-cell transcriptional profiling of CAR-T cells in patients undergoing CD19 CAR-T immunotherapy
2020-01-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-13880-1
PMID:31924795
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研究论文 | 本文探讨了在接受CD19 CAR-T免疫治疗的患者中，CAR-T细胞的克隆动力学和转录组特征 | 本研究揭示了CAR-T细胞在输注后如何受到转录程序的调控，特别关注了细胞的克隆多样性及其对抗肿瘤反应的影响 | 尽管发现了克隆动力学的不同模式，但整合位点并未被确认作为克隆动力学的主要驱动因素 | 研究CAR-T细胞在输注后行为的转录程序及其克隆动力学 | 研究重点是CD8 CAR-T细胞，包括输注产品和患者的血液样本 | 数字病理学 | B细胞恶性肿瘤 | TCRB测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 研究涉及的样本包括输注产品和接受治疗患者的血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 17493 | 2024-08-05 |
Assessing parameter efficient methods for pre-trained language model in annotating scRNA-seq data
2024-Aug, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2024.05.007
PMID:38759908
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研究论文 | 本文探讨了在注释单细胞RNA测序数据中的参数高效方法 | 引入参数高效微调(PEFT)的新方法，以减少计算成本，同时优化少量参数 | 微调预训练语言模型仍然需要大量计算资源，可能对一些研究者而言不够实用 | 研究如何高效地注释单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 探索三种参数高效微调方法在scRNA-seq细胞类型注释中的能力 | 自然语言处理 | 肿瘤 | scBERT | NA | 数据集 | 多个数据集的基准研究 | NA | NA | NA | NA |
| 17494 | 2024-08-05 |
Unraveling pancreatic ductal adenocarcinoma immune prognostic signature through a naive B cell gene set
2024-Jul-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216981
PMID:38795761
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺导管腺癌中的Naive B细胞免疫预后标志。 | 提出了一种基于Naive B细胞基因集的12个基因预后标志，能够精准映射PDAC中的免疫相互作用。 | 尚未完全理解肿瘤浸润免疫细胞与肿瘤微环境的详细分子相互作用。 | 研究Naive B细胞在胰腺导管腺癌中的免疫预后意义。 | 分析与PDAC相关的Naive B细胞基因及其在预后中的作用。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | CIBERSORT，单细胞RNA测序，WGCNA | Lasso，plsRcox | 转录组数据 | 包含多个外部队列以及多种风险分层的患者组 | NA | NA | NA | NA |
| 17495 | 2024-08-04 |
Developing a dormancy-associated ECM signature in TNBC that is linked to immunosuppressive tumor microenvironment and selective sensitivity to MAPK inhibitors
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e32106
PMID:38868025
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研究论文 | 本研究揭示了与休眠相关的ECM特征在三阴性乳腺癌中如何与免疫抑制肿瘤微环境及对MAPK抑制剂的选择性敏感性相关 | 首次描述了休眠癌细胞的ECM特征及其与免疫抑制微环境的相互作用 | 研究中缺乏临床样本验证和长期随访数据 | 探讨三阴性乳腺癌中休眠癌细胞与ECM的相互作用及其在治疗中的潜在应用 | 主要研究MDA-MB-231细胞系中的休眠癌细胞及其相关的ECM特征 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | RNA-seq，流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 主要使用MDA-MB-231细胞系进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 17496 | 2024-08-04 |
Multi-omics analysis uncovered systemic lupus erythematosus and COVID-19 crosstalk
2024-Jun-11, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00851-6
PMID:38862942
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研究论文 | 本研究探讨了COVID-19对系统性红斑狼疮(SLE)的影响及两种疾病之间的相互作用机制 | 发现了14个在COVID-19和SLE之间共享的中心基因，并确认了IFN-I/II介导的JAK-STAT信号通路在这些基因调控中的作用 | 本研究基于已有数据集，可能未完全覆盖所有相关的基因或信号通路 | 阐明COVID-19对SLE的影响及其潜在机制 | 研究COVID-19与系统性红斑狼疮之间的相互影响及其共享的基因特征 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | RNA-seq | NA | 基因组数据 | 使用了多个RNA-seq数据集和全基因组关联研究数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 17497 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing depicts tumor architecture and empowers clinical decision in metastatic conjunctival melanoma
2024-Jun-11, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-024-00683-y
PMID:38862482
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研究论文 | 这项研究使用单细胞RNA测序描绘了转移性结膜黑色素瘤的肿瘤结构，并为临床决策提供支持 | 本研究首次将单细胞RNA测序分析转化为针对癌症的临床试验，提供了一个新概念，将单细胞RNA测序数据与癌症治疗相结合 | 样本量可能有限，仅包括7个结膜黑色素瘤样本，研究结果的普遍性需要进一步验证 | 揭示结膜黑色素瘤在肿瘤发生和进展过程中的肿瘤微环境的景观和异质性 | 正常结膜样本（n=3）和结膜黑色素瘤（n=7）中的47017个细胞 | 数字病理学 | 结膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组 | 共获得47017个细胞，包含3个正常结膜样本和7个结膜黑色素瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 17498 | 2024-08-04 |
DOT: a flexible multi-objective optimization framework for transferring features across single-cell and spatial omics
2024-Jun-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48868-z
PMID:38862466
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研究论文 | 本文提出了DOT，一个灵活的多目标优化框架，旨在在单细胞转录组学和空间组学之间转移细胞特征 | DOT框架通过利用超出数据模式中的共同基因，进行空间特征的转移，并推断组织部位细胞群体的绝对和相对丰度，展示了其创新性 | 对细胞类型信息的空间特征转移可能受限于所使用的技术和数据的特点 | 研究单细胞转录组学与空间分辨率数据的结合 | 涉及细胞特征的转移和定位问题 | 数字病理学 | NA | 基于Frank-Wolfe算法的优化技术 | NA | 单细胞转录组数据和空间数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17499 | 2024-08-04 |
Spatially resolved multiomics on the neuronal effects induced by spaceflight in mice
2024-Jun-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48916-8
PMID:38862479
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研究论文 | 本研究探讨了航天飞行对小鼠大脑的神经影响，采用单细胞多组学与空间转录组学相结合的方法 | 首次将单细胞多组学与空间转录组学结合，深入解析航天飞行对小鼠脑部的影响 | 研究对象仅限于雌性小鼠，尚未纳入不同性别或品种的样本 | 旨在揭示航天飞行对中枢神经系统的影响 | 以雌性小鼠为研究对象，通过比较地面对照组和航天飞行暴露组 | 数字病理学 | NA | 单细胞多组学，空间转录组学 | NA | 数据集 | 小鼠样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 17500 | 2024-08-05 |
Metric multidimensional scaling for large single-cell datasets using neural networks
2024-Jun-11, Algorithms for molecular biology : AMB
IF:1.5Q3
DOI:10.1186/s13015-024-00265-3
PMID:38863064
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研究论文 | 该文章提出了一种基于神经网络的度量多维尺度方法，用于处理大规模单细胞数据集 | 本研究提出的神经网络方法比之前的先进方法快几个数量级，并能处理多达数百万个细胞的数据集 | 当前方法尚未在其它类型的数据集上进行验证 | 研究目的是解决传统方法在处理大规模单细胞RNA测序实验中面临的效率问题 | 研究对象为单细胞RNA测序实验中的大规模数据集 | 数字病理学 | NA | 神经网络 | NA | 单细胞数据 | 多达数百万个细胞 | NA | NA | NA | NA |