单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 17481 - 17500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17481 | 2024-08-05 |
Deciphering the contributions of cuproptosis in the development of hypertrophic scar using single-cell analysis and machine learning techniques
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1207522
PMID:37409114
|
研究论文 | 本研究探讨了铜诱导细胞死亡在肥厚性瘢痕形成中的作用。 | 通过单细胞分析和机器学习算法，鉴定出新的治疗靶标基因（如ATP7A、ULK1和MTF1）并提出治疗新思路。 | 未提及样本量和具体实验设置的详细信息，可能影响结果的普适性。 | 研究铜诱导细胞死亡在肥厚性瘢痕形成中的潜在作用。 | 主要关注肥厚性瘢痕及相关细胞（如成纤维细胞）。 | 数字病理学 | 肥厚性瘢痕 | 单细胞测序，转录组数据分析，qRT-PCR | 随机森林，支持向量机 | 基因表达数据 | 未提供具体的样本量 |
| 17482 | 2024-08-05 |
Integration analysis of single-cell and spatial transcriptomics reveal the cellular heterogeneity landscape in glioblastoma and establish a polygenic risk model
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1109037
PMID:37397378
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组测序分析了胶质母细胞瘤的细胞异质性，建立了一个多基因风险模型 | 该研究提出了一种基于恶性细胞转变的TPRGRS，通过整合分析bulkRNA-seq和scRNA-seq数据，为胶质母细胞瘤患者提供个性化药物方案的可能性 | 未提及研究的具体局限性 | 探究胶质母细胞瘤中的细胞异质性及其对肿瘤进展的影响 | 胶质母细胞瘤中的恶性细胞亚群体 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 空间转录组测序 (stRNA-seq), bulk RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 涉及三个数据集的患者样本 |
| 17483 | 2024-08-05 |
A tricarboxylic acid cycle-based machine learning model to select effective drug targets for the treatment of esophageal squamous cell carcinoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1195195
PMID:37383713
|
研究论文 | 本文基于TCA循环相关基因构建了一种预测食管鳞状细胞癌的风险评分模型 | 创新性地将TCA循环基因与食管鳞状细胞癌相关联，并建立预测模型 | 未全面探讨TCA循环在食管鳞状细胞癌中的所有潜在作用 | 研究TCA循环基因在食管鳞状细胞癌中的角色，并预测患者预后 | 食管鳞状细胞癌样本及相关TCA循环基因 | 机器学习 | 食管癌 | 单细胞测序 | Cox回归和Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 38类8种细胞类型的单细胞序列数据 |
| 17484 | 2024-08-05 |
Deciphering the role of NETosis-related signatures in the prognosis and immunotherapy of soft-tissue sarcoma using machine learning
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1217488
PMID:37408763
|
研究论文 | 该论文探讨了NETosis相关基因在软组织肉瘤预后和免疫治疗中的作用 | 研究提供了NETosis评分系统以预测免疫治疗反应，展现了个性化治疗的潜力 | 关于NETosis在软组织肉瘤中的作用的研究仍然有限 | 研究NETosis相关基因在软组织肉瘤中的作用及其预后价值 | 使用TCGA和GEO数据库中的大规模队列研究NETosis相关基因 | 机器学习 | 软组织肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归和支持向量机递归特征消除（SVM-RFE） | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的大规模样本 |
| 17485 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing highlights the role of PVR/PVRL2 in the immunosuppressive tumour microenvironment in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1164448
PMID:37383234
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了肝细胞癌（HCC）肿瘤微环境中的免疫抑制作用，特别是PVR/PVRL2轴的作用 | 首次揭示了VCAN+肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）可能经历M2样极化，并发现TIGIT-PVR/PVRL2轴在免疫抑制微环境中的重要作用 | 研究仅限于体外实验，尚未进行临床试验验证 | 深入理解肝细胞癌中肿瘤微环境的异质性和细胞间通讯网络 | 肝细胞癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 35786个未选择的单细胞来自3个肝细胞癌肿瘤和3个匹配的邻近样本 |
| 17486 | 2024-08-07 |
The Regulation Network of Glycerolipid Metabolism as Coregulators of Immunotherapy-Related Myocarditis
2023, Cardiovascular therapeutics
IF:3.4Q2
DOI:10.1155/2023/8774971
PMID:37388276
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和代谢组学分析，研究了免疫疗法相关心肌炎中甘油酯代谢的调控网络 | 首次揭示了线粒体调控的甘油酯代谢在免疫疗法相关心肌炎中的关键作用，特别是DGKZ蛋白的作用 | NA | 探究免疫疗法相关心肌炎中代谢重编程的机制 | 免疫细胞在免疫疗法相关心肌炎中的异质性和代谢网络差异 | NA | 心肌炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS） | NA | RNA序列，代谢组学数据 | Pdcd1-/-Ctla4+/-和野生型小鼠心脏的CD45+单细胞 |
| 17487 | 2024-08-07 |
Impact of Cuproptosis-related markers on clinical status, tumor immune microenvironment and immunotherapy in colorectal cancer: A multi-omic analysis
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.06.011
PMID:37389187
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了铜死亡相关标记物在结直肠癌中的临床状态、肿瘤免疫微环境和免疫治疗中的作用 | 构建了一种基于铜死亡相关标记物的新型评分系统（CuproScore），用于预测结直肠癌患者的预后、肿瘤微环境及免疫治疗反应 | NA | 探讨铜死亡及其相关生物标志物在结直肠癌中的功能和临床价值 | 结直肠癌中的铜死亡相关标记物及其对临床状态、分子功能和肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多组学分析（转录组学、基因组学和单细胞转录组） | NA | 转录组数据 | 15对结直肠癌组织样本，以及4种结直肠癌细胞系的体外实验 |
| 17488 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of neural stem cells derived from human trisomic iPSCs reveals the abnormalities during neural differentiation of Down syndrome
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1137123
PMID:37396785
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了从唐氏综合征患者和正常对照患者的诱导多能干细胞（iPSCs）分化而来的神经干细胞（NSCs），揭示了唐氏综合征神经分化过程中的异常情况。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了唐氏综合征神经分化过程中的分子机制异常，特别是发现了一组未能分化为神经干细胞的唐氏综合征iPSCs（DS-iPSCs-ND），并分析了其异常表达模式。 | 研究仅限于细胞水平，未涉及临床患者，且未探讨这些发现如何转化为临床治疗策略。 | 探究唐氏综合征神经分化过程中的分子机制异常。 | 唐氏综合征患者的诱导多能干细胞（iPSCs）及其分化后的神经干细胞（NSCs）。 | 数字病理学 | 唐氏综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从唐氏综合征和正常对照的iPSC样本中分别获得了8,500和10,922个细胞，从NSC样本中分别获得了7,182和9,324个细胞。 |
| 17489 | 2024-08-07 |
Single cell transcriptome profiling reveals cutaneous immune microenvironment remodeling by photodynamic therapy in photoaged skin
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1183709
PMID:37404811
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，探讨了5-氨基酮戊酸光动力疗法（ALA-PDT）对光老化皮肤中免疫微环境的改造作用 | 首次详细揭示了ALA-PDT如何通过改变免疫细胞的功能和相互作用，逆转光老化皮肤的免疫衰老状态 | 研究仅限于人类前臂的伸侧皮肤样本，且结果需要进一步在更广泛的样本和人群中验证 | 探讨ALA-PDT对光老化皮肤免疫微环境的影响及其潜在机制 | 光老化皮肤中的免疫细胞及其功能变化 | 数字病理学 | 皮肤老化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 光老化皮肤样本在ALA-PDT治疗前后的对比 |
| 17490 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic profiling of dorsal root ganglion: an overview
2023, Frontiers in neuroanatomy
IF:2.1Q3
DOI:10.3389/fnana.2023.1162049
PMID:37405309
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术在背根神经节（DRG）中的应用，以增进对人类和啮齿动物DRG神经元分子转录组、细胞类型和功能注释的全面理解 | 利用单细胞（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）技术，提供了对DRG神经元组成和功能异质性的单细胞分辨率理解 | NA | 总结当前关于DRG单细胞转录组测序的文献，以全面理解DRG神经元的分子转录组、细胞类型和功能注释 | 背根神经节（DRG）中的感觉神经元 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 17491 | 2024-08-07 |
IL-15 promotes self-renewal of progenitor exhausted CD8 T cells during persistent antigenic stimulation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1117092
PMID:37409128
|
研究论文 | 本文研究了IL-15在持续抗原刺激下促进前体耗竭CD8 T细胞自我更新的机制 | 首次揭示了IL-15在慢性感染和癌症中促进前体耗竭CD8 T细胞自我更新的作用 | NA | 探讨IL-15在维持抗原特异性CD8 T细胞池中的作用及其作为免疫干预治疗靶点的潜力 | 耗竭的CD8 T细胞及其在慢性感染和癌症中的亚群 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和肾细胞癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞 |
| 17492 | 2024-08-07 |
Manifold Interpolating Optimal-Transport Flows for Trajectory Inference
2022-Dec, Advances in neural information processing systems
PMID:37397786
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Manifold Interpolating Optimal-Transport Flow (MIOFlow)的方法，用于从间断时间点采集的静态样本中学习随机连续的群体动态变化 | MIOFlow结合了动态模型、流形学习和最优传输，通过训练神经常微分方程(Neural ODE)来插值静态群体快照，并受到带有流形地面距离的最优传输的惩罚。此外，通过在称为测地线自动编码器(GAE)的自动编码器的潜在空间中操作，确保流遵循几何结构 | NA | 开发一种新的方法来学习从静态样本中推断群体动态变化 | 群体动态变化 | 机器学习 | NA | 神经常微分方程(Neural ODE) | 自动编码器 | 数据 | 模拟数据和scRNA-seq数据 |
| 17493 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq reveals actinic keratosis-specific keratinocyte subgroups and their crosstalk with secretory-papillary fibroblasts
2023-Nov, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.19289
PMID:37357444
|
研究论文 | 这项研究探讨了与日光角化症相关的角质形成细胞亚群及其与分泌性乳头状成纤维细胞之间的相互作用。 | 研究揭示了特定于日光角化症的角质形成细胞簇以及其功能，特别是IL1R2+WFDC2+聚类在AK发展中的重要性。 | 研究未详细探讨不同细胞间相互作用的全部机制和其他可能的信号通路。 | 研究的目的是调查角质形成细胞的异质性及其在日光角化症发展中的作用。 | 研究对象为日光角化症组织和其邻近正常皮肤中的角质形成细胞和成纤维细胞簇。 | 数字病理 | 日光角化症 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞数据 | 13个角质形成细胞亚群 |
| 17494 | 2024-08-07 |
Advanced Progression for the Heterogeneity and Homeostasis of Intestinal Stem Cells
2023-Oct, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-023-10578-2
PMID:37351833
|
综述 | 本文综述了肠道干细胞（ISCs）的异质性和稳态的最新进展，利用类器官和单细胞RNA测序技术阐明了细胞异质性 | 通过类器官和单细胞RNA测序技术，揭示了ISCs的异质性和稳态的关键因素，并识别了几种潜在的ISCs类型 | ISCs在肠道肿瘤发生、化疗抵抗和结肠癌偶尔复发中的复杂作用仍有待进一步讨论 | 旨在阐明ISCs的复杂性，揭示肠道隐窝微环境的整合，并为治疗开发创造新机会 | 肠道干细胞的异质性和稳态 | NA | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 17495 | 2024-08-07 |
Identification and validation of cancer-associated fibroblast-related subtypes and the prognosis model of biochemical recurrence in prostate cancer based on single-cell and bulk RNA sequencing
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05011-7
PMID:37369799
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序技术，识别和验证了与癌症相关成纤维细胞（CAFs）相关的亚型，并开发了前列腺癌生化复发（BCR）相关的CAF预测模型。 | 本研究首次通过非负矩阵分解（NMF）聚类方法，基于CAF相关基因揭示了肿瘤微环境（TME）的免疫特征差异，并建立了BCR相关的CAF签名，用于准确预测前列腺癌患者的预后和免疫治疗反应。 | NA | 研究前列腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的特征，并开发预测前列腺癌患者生化复发（BCR）的CAF签名。 | 前列腺癌患者的癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在生化复发（BCR）中的作用。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | 非负矩阵分解（NMF） | RNA序列数据 | 来自TCGA和GEO数据库的批量RNA-seq数据，以及从GEO数据库下载的单细胞RNA测序数据 |
| 17496 | 2024-08-05 |
Nav1.7 is essential for nociceptor action potentials in the mouse in a manner independent of endogenous opioids
2023-09-06, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.05.024
PMID:37352856
|
研究论文 | 该研究揭示了Nav1.7在小鼠痛觉感知中的重要性及其与内源性阿片类物质无关的机制 | 本研究首次确定Nav1.7在C纤维动作电位的发起中是必要的，并且阐明了其与内源性阿片不相关的机制 | 本研究主要在小鼠模型中进行，未必能完全反映人类的病理机制 | 探讨Nav1.7缺失导致疼痛不敏感的机制 | 小鼠的感觉神经元及其动作电位 | 神经科学 | 疼痛相关疾病 | 单细胞 RNA 测序、激光散斑对比成像 (LSCI)、体内电生理学 | NA | 行为数据、基因表达数据、神经电生理数据 | 在研究中涉及小鼠和特定类型的感觉神经元 |
| 17497 | 2024-08-05 |
scASGC: An adaptive simplified graph convolution model for clustering single-cell RNA-seq data
2023-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107152
PMID:37364529
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于自适应简化图卷积模型的无监督聚类方法 scASGC，用于聚类单细胞RNA测序数据 | 提出了一个自适应的简化图卷积模型，用于构建细胞图并聚合邻域信息，能够自适应地确定最优的卷积层数 | 未提及具体的限制 | 研究旨在改善单细胞RNA测序数据中细胞亚群体的聚类性能 | 聚类分析包含12个公共数据集和一个包含15,983个细胞的小鼠肠道肌肉样本 | 计算机视觉 | NA | RNA-seq | 图卷积网络 | 数据集包含多个单细胞RNA测序数据 | 在12个公共数据集进行实验，分析小鼠肠道肌肉包含15,983个细胞 |
| 17498 | 2024-08-05 |
San Huang Xiao Yan recipe modulates the HMGB1-mediated abnormal inflammatory microenvironment and ameliorates diabetic foot by activating the AMPK/Nrf2 signalling pathway
2023-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2023.154931
PMID:37364421
|
研究论文 | 该研究探讨了三黄消炎方对糖尿病足的抗炎作用及其分子机制 | 研究首次揭示了三黄消炎方通过激活AMPK/Nrf2信号通路抑制HMGB1表达来治疗糖尿病足的机制 | 本研究主要集中在动物模型及细胞培养实验，缺乏临床试验数据支持 | 本研究的目的是揭示三黄消炎方在糖尿病足治疗中的作用机制 | 研究对象包括C57小鼠和SD大鼠的糖尿病足模型 | 数字病理学 | 糖尿病足 | ELISA, HPLC, 单细胞测序, Western blot | NA | 动物模型数据, 细胞培养数据 | C57小鼠和SD大鼠糖尿病足模型 |
| 17499 | 2024-08-05 |
Integrating multi-modal information to detect spatial domains of spatial transcriptomics by graph attention network
2023-09, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2023.06.005
PMID:37356752
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SpaDAC的方法，通过图注意力网络整合多模态信息以检测空间转录组学的空间领域 | 创新点在于提出了SpaDAC方法，能够高效利用多模态信息以识别空间领域并重构去噪的基因表达谱 | 目前存在的方法在高效利用空间信息和匹配高分辨率组织学图像方面存在局限性 | 研究旨在充分利用空间转录组学数据中的多模态信息 | 研究对象为空间转录组学数据及其相关的多模态信息 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 图注意力网络 | 基因表达谱、空间位置、组织学图像 | 多个近期的空间转录组学数据集 |
| 17500 | 2024-08-05 |
A novel cryopreservation and biobanking strategy to study lymphoid tissue stromal cells in human disease
2023-09, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202250362
PMID:37366295
|
研究论文 | 本文介绍了一种新型的冷冻保存和生物库策略，用于研究人类疾病中的淋巴组织间质细胞 | 提出了利用冷冻保存技术来保存淋巴组织以便研究淋巴细胞间质细胞，具有广泛适用性 | 对于冷冻保存后的细胞功能和特性尚需进一步研究 | 研究淋巴组织间质细胞在各种人类疾病中的作用 | 人类扁 tonsils 和淋巴结中的非造血细胞 | 数字病理学 | 自体免疫疾病、异体免疫、淋巴增生性疾病 | 冷冻保存 | NA | 淋巴组织样本 | 包括人类扁 tonsils 和淋巴结的样本 |