单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28527 篇文献，本页显示第 17441 - 17460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17441 | 2024-08-07 |
The energy metabolism of Balantidium polyvacuolum inhabiting the hindgut of Xenocypris davidi
2023-Oct-19, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09706-6
PMID:37858069
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研究论文 | 本研究使用透射电子显微镜和单细胞转录组分析揭示了寄生于戴氏鲌鱼后肠的Balantidium polyvacuolum的代谢机制 | 首次详细描述了Balantidium polyvacuolum的线粒体相关器官（MROs）的特殊结构及其可能的代谢途径 | NA | 探究Balantidium polyvacuolum适应消化道微环境的分子机制 | Balantidium polyvacuolum的代谢机制 | NA | NA | 透射电子显微镜（TEM）、单细胞转录组分析 | NA | 图像、转录组数据 | NA |
| 17442 | 2024-08-05 |
Exploring the global immune landscape of peripheral blood mononuclear cells in H5N6-infected patient with single-cell transcriptomics
2023-10-18, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01693-7
PMID:37853397
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组技术描绘了H5N6感染患者外周血单核细胞的免疫细胞景观 | 采用单细胞RNA测序技术，揭示了H5N6感染个体外周血中的免疫细胞组成及其相关的分子机制 | 样本量有限，仅包括一名重症儿童和一名健康对照，可能影响结果的普遍性 | 研究H5N6感染患者的免疫细胞组成和其在发病机制中的作用 | 外周血单核细胞样本来自一名H5N6禽流感感染的危重儿童和一名健康对照供体 | 数字病理学 | 禽流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 合计3,248个单细胞转录组，包括一名H5N6感染儿童和一名健康对照供体 |
| 17443 | 2024-08-05 |
Cuproptosis-related gene SLC31A1: prognosis values and potential biological functions in cancer
2023-10-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-44681-8
PMID:37853210
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研究论文 | 本研究探讨了SLC31A1在癌症中的作用及其预后价值 | 揭示了SLC31A1在多种癌症中的表达变化及其与免疫细胞的正相关性 | 对于SLC31A1在各种癌症中的具体机制仍未深入探讨 | 阐明SLC31A1在多种人类恶性肿瘤中的作用及预后价值 | 各类癌症患者中的SLC31A1基因及其表达情况 | 数字病理学 | 妇科癌症 | 单细胞测序、基因组数据库分析 | NA | 基因表达数据 | 采用来自癌症基因组图谱数据库的原始数据，涉及33种癌症 |
| 17444 | 2024-08-05 |
Potential network markers and signaling pathways for B cells of COVID-19 based on single-cell condition-specific networks
2023-Oct-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09719-1
PMID:37853311
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研究论文 | 本文探讨了COVID-19感染的人类B细胞的潜在网络标记和相关信号通路 | 研究揭示了与COVID-19高度相关的枢纽基因和'黑暗'基因，并首次链接了这些基因及其编码的关键蛋白与JAK-STAT通路 | 未提及具体的样本数量和实验细节，可能影响结果的普适性 | 研究COVID-19感染对人类B细胞的影响及其潜在的生物标志物 | 人类B细胞，尤其是受到COVID-19感染的B细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞测序 | 条件细胞特异性网络模型 | 基因表达数据 | NA |
| 17445 | 2024-08-05 |
Deciphering intratumoral heterogeneity of hepatocellular carcinoma with microvascular invasion with radiogenomic analysis
2023-10-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04586-6
PMID:37853415
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研究论文 | 本研究揭示了微血管侵袭阳性肝细胞癌的细胞图谱和免疫浸润模式 | 本研究创新性地结合了辐射基因组学分析，揭示了MVI+ HCC的细胞亚群相互作用和独特的代谢特征 | 样本数量相对较小，可能限制了结果的普遍性和代表性 | 本研究旨在通过辐射组学分析探索MVI+ 肝细胞癌的细胞图谱及其免疫浸润特征 | 分析了三例MVI阳性和三例MVI阴性的肝细胞癌样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序，整体转录组测序，辐射组学分析，外显子组测序 | NA | 组织样本 | 使用了6个单细胞样本以及26个MVI阳性和30个MVI阴性肝细胞癌组织样本 |
| 17446 | 2024-08-05 |
Interaction, immune infiltration characteristics and prognostic modeling of efferocytosis-related subtypes in glioblastoma
2023-10-18, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01688-4
PMID:37853449
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研究论文 | 本文探讨了与吞噬作用相关的亚型在胶质母细胞瘤中的相互作用、免疫浸润特征和预后建模 | 提出了一种新的与吞噬作用相关的评分系统，提供了胶质母细胞瘤肿瘤微环境的深入见解 | 对吞噬作用在胶质母细胞瘤中的作用了解不足 | 研究与吞噬作用相关的基因在胶质母细胞瘤中的表达和功能 | 549名胶质母细胞瘤患者和相关的22个与吞噬作用相关的基因 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq | 无监督聚类算法 | 基因表达数据 | 549名胶质母细胞瘤患者 |
| 17447 | 2024-08-07 |
Author Correction: Probabilistic embedding, clustering, and alignment for integrating spatial transcriptomics data with PRECAST
2023-Oct-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42412-1
PMID:37852962
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17448 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analysis identified pyroptosis-related signature for diagnosis and prognosis in osteoarthritis
2023-10-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-44724-0
PMID:37853066
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，探讨了焦亡相关基因在骨关节炎中的作用及其在不同软骨细胞亚型中的表达 | 本研究首次识别了与焦亡相关的骨关节炎诊断和预后标志物，并探索了软骨细胞在骨关节炎和正常样本中的异质性 | NA | 研究焦亡相关基因在骨关节炎中的作用及其表达，以识别新的诊断和预后标志物 | 骨关节炎及其相关软骨细胞亚型 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序和RNA-seq | NA | RNA | 涉及多个骨关节炎相关数据集和正常样本 |
| 17449 | 2024-08-07 |
Single-cell characterization of self-renewing primary trophoblast organoids as modeling of EVT differentiation and interactions with decidual natural killer cells
2023-Oct-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09690-x
PMID:37853336
|
研究论文 | 本文首次从人类胎盘绒毛中生成自我更新的滋养层器官（TO），并将其分化为外绒毛滋养层细胞（EVT-TO），以研究分化事件和与母体蜕膜自然杀伤（NK）细胞的相互作用。 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）全面表征和分子探索了TO模型中的EVT分化及其与dNK的相互作用，揭示了多种不同的滋养层状态和dNK亚群，并发现了细胞类型特异性的转录因子（TF）调控网络和配体-受体复合物。 | NA | 研究外绒毛滋养层细胞（EVT）的分化及其与母体蜕膜自然杀伤（NK）细胞的相互作用，为人类胎盘研究提供新的方法和线索。 | 人类胎盘绒毛生成的自我更新滋养层器官（TO）及其分化为的外绒毛滋养层细胞（EVT-TO），以及与母体蜕膜自然杀伤（NK）细胞的相互作用。 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 多种不同的滋养层状态和dNK亚群 |
| 17450 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals pro-invasive cancer-associated fibroblasts in hypopharyngeal squamous cell carcinoma
2023-10-18, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-023-01312-z
PMID:37853464
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了喉下鳞状细胞癌中的癌症相关成纤维细胞，揭示了其在肿瘤微环境中的作用 | 首次详细描述了喉下鳞状细胞癌中恶性肿瘤相关成纤维细胞的亚型及其在促进肿瘤侵袭和构建肿瘤有利微环境中的作用 | NA | 探索喉下鳞状细胞癌的治疗新靶点和联合治疗策略 | 喉下鳞状细胞癌组织及其邻近正常黏膜 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6例未经治疗的喉下鳞状细胞癌患者的主要肿瘤组织和2例邻近正常黏膜 |
| 17451 | 2024-08-05 |
Resolving the tissue response to neoadjuvant chemotherapy in rectal cancer
2023-10-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101232
PMID:37852182
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研究论文 | 本文呈现了直肠癌肿瘤微环境在新辅助化疗前后的综合单细胞转录组分析 | 提供了直肠癌新辅助化疗对肿瘤微环境影响的深入数据 | 没有提供更广泛人群的样本数据 | 研究新辅助化疗对直肠癌肿瘤微环境的影响 | 直肠癌肿瘤及其微环境 | 数字病理学 | 直肠癌 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 17452 | 2024-08-05 |
Cancer-associated fibroblasts undergoing neoadjuvant chemotherapy suppress rectal cancer revealed by single-cell and spatial transcriptomics
2023-10-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101231
PMID:37852187
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研究论文 | 这项研究探讨了新辅助化疗对直肠癌相关成纤维细胞的影响 | 揭示了新辅助化疗如何通过重塑癌伴随成纤维细胞调节肿瘤微环境，提高治疗反应 | 未提及具体的局限性 | 阐明新辅助化疗对直肠癌的治疗反应及其对肿瘤微环境的影响 | 对29名接受新辅助化疗直肠癌患者的细胞动态进行研究 | 数字病理学 | 直肠癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组测序 | NA | NA | 29名直肠癌患者 |
| 17453 | 2024-08-07 |
Author Correction: Single-cell transcriptomics uncovers EGFR signaling-mediated gastric progenitor cell differentiation in stomach homeostasis
2023-Oct-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41823-4
PMID:37848419
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17454 | 2024-08-07 |
Decoding the immune landscape following hip fracture in elderly patients: unveiling temporal dynamics through single-cell RNA sequencing
2023-Oct-17, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-023-00380-6
PMID:37848979
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了老年髋部骨折患者从创伤后到恢复期的免疫谱动态变化。 | 研究首次揭示了老年髋部骨折患者在不同阶段免疫细胞亚群的比例变化和基因表达差异，特别是发现了新的CD14单核细胞亚群。 | 研究样本量较小，仅包括四名老年患者，可能影响结果的普遍性。 | 探讨老年髋部骨折患者在创伤后到恢复期间的免疫微环境动态变化。 | 老年髋部骨折患者的外周血样本。 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 四名老年髋部骨折患者的外周血样本，包括两名男性和两名女性，年龄均大于75岁。 |
| 17455 | 2024-08-07 |
Systematic analysis of glutamine metabolism family genes and exploration of the biological role of GPT in colorectal cancer
2023-10-17, Aging
DOI:10.18632/aging.205079
PMID:37851339
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研究论文 | 本研究系统分析了谷氨酰胺代谢家族基因在结直肠癌中的生物学作用，并探索了GPT在结直肠癌中的重要性 | 首次系统分析了谷氨酰胺代谢相关基因（GMRGs）在结直肠癌中的生物学作用，并发现GPT是结直肠癌的重要诊断、预后标志物和治疗靶点 | NA | 探索谷氨酰胺代谢相关基因在结直肠癌中的生物学作用及GPT的重要性 | 结直肠癌患者的基因表达数据、临床数据及单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | SVM-REF和RandomForest | 基因表达数据 | 结直肠癌患者的基因表达数据和临床数据来自TCGA数据库，单细胞RNA测序数据来自GEO数据库 |
| 17456 | 2024-08-05 |
Zfp335 establishes eTreg lineage and neonatal immune tolerance by targeting Hadha-mediated fatty acid oxidation
2023-10-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI166628
PMID:37843279
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研究论文 | 本研究探讨了Zfp335在调节性T细胞(eTregs)谱系建立和新生免疫耐受中的作用 | 揭示了Zfp335通过调控脂肪酸氧化介导的eTreg分化机制 | 本研究未探讨其他可能影响Treg分化的因素 | 阐明Zfp335在调节性T细胞分化及免疫耐受中的作用 | 研究调节性T细胞及其功能 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | KO小鼠 | RNA数据 | 涉及Zfp335缺失的调节性T细胞相关样本 |
| 17457 | 2024-08-05 |
Adenine crosses the biomarker bridge: from 'omics to treatment in diabetic kidney disease
2023-10-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI174015
PMID:37843281
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研究论文 | 本研究通过多组学方法识别腺苷作为早期糖尿病肾病的非侵入性生物标志物 | 首次提出腺苷作为糖尿病肾病进展的机制性生物标志物，并展示了多组学方法的潜力 | 研究未明确提及样本量和其他潜在的干扰因素 | 识别糖尿病肾病的机制性生物标志物以预测病程并作为治疗靶点 | 早期糖尿病肾病患者的尿腺苷/肌酐比率 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 多组学方法 | NA | 尿液样本 | 独立队列中的早期糖尿病肾病参与者 |
| 17458 | 2024-08-05 |
Single-cell landscape and spatial transcriptomic analysis reveals macrophage infiltration and glycolytic metabolism in kidney renal clear cell carcinoma
2023-10-16, Aging
DOI:10.18632/aging.205128
PMID:37847178
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研究论文 | 本研究探讨了肾脏透明细胞癌肿瘤微环境中糖酵解因子PGAM1的临床相关性 | 揭示了PGAM1在肾脏透明细胞癌中的表达及其与免疫细胞浸润的关系，具有重要的诊断和预后意义 | PGAM1的具体机制和如何在不同的肾脏区域发挥作用尚不明确 | 研究PGAM1在肾脏透明细胞癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 肾脏透明细胞癌患者的肿瘤样本以及小鼠肾损伤模型 | 数字病理学 | 肾脏癌症 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据和临床数据 | 60名肾脏透明细胞癌患者的肿瘤标本 |
| 17459 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing distinctly characterizes the wide heterogeneity in pediatric mixed phenotype acute leukemia
2023-10-16, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01241-z
PMID:37845689
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对儿童混合表型急性白血病（MPAL）的骨髓样本进行了分析，以揭示其细胞异质性和微环境特征。 | 首次描述了儿童MPAL的单细胞转录组景观，并展示了B/My和T/My MPAL在单细胞RNA测序中的独特特征。 | 需要更大规模的研究来验证基于治疗反应的转录组差异。 | 更好地理解MPAL的亚型异质性及其与急性髓系白血病（AML）和急性淋巴细胞白血病（ALL）的比较。 | 儿童MPAL的骨髓样本。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 分析了来自九名儿童MPAL骨髓样本的超过40,000个细胞。 |
| 17460 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics map of the embryonic mouse brain - a tool to explore neurogenesis
2023-10-15, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.060151
PMID:37855382
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研究论文 | 这篇文章提供了一个关于胚胎小鼠大脑的空间转录组图谱，旨在探索神经发生 | 建立了一个空间转录组图谱，并结合了单细胞RNAseq数据，揭示了特定解剖领域内的独特转录特征 | NA | 研究胚胎小鼠大脑发育中细胞类型及其相互作用 | 胚胎小鼠大脑的不同类型神经和非神经细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA数据 | 胚胎第13.5天小鼠脑切片的RNA测序数据 |