单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 17401 - 17420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17401 | 2024-08-07 |
Identifying a Lung Stem Cell Subpopulation by Combining Single-Cell Morphometrics, Organoid Culture, and Transcriptomics
2023-08-16, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxad044
PMID:37468433
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研究论文 | 本文通过结合单细胞形态学、类器官培养和转录组学，建立了一种新的单细胞分析方法scMORN，用于揭示肺组织干细胞的亚群 | 开发了一种名为scMORN的新方法，整合了单细胞形态学、类器官形成实验和RNA测序，以揭示组织干细胞的亚群及其分化潜能 | NA | 探索肺上皮干细胞，并揭示其亚群及其分化潜能 | 肺组织干细胞及其亚群 | 数字病理学 | 肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及多种肺干细胞，包括基底细胞、杯状细胞和肺泡类型2细胞 |
| 17402 | 2024-08-05 |
Integrating spatial and single-nucleus transcriptomic data elucidates microglial-specific responses in female cynomolgus macaques with depressive-like behaviors
2023-08, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01379-4
PMID:37443281
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学，对患有社交压力相关抑郁症状的雌性猕猴的背外侧前额叶皮层进行了分析 | 首次揭示了与抑郁样行为相关的微胶质细胞特异性基因表达变化 | 研究主要集中于特定物种的特定行为，可能无法完全推广至其他物种或抑郁症的所有方面 | 探讨与抑郁样行为相关的细胞和分子机制 | 雌性猕猴，这些猕猴表现出社会压力相关的抑郁样行为 | 数字病理学 | 抑郁症 | 单核RNA测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 通过分析雌性猕猴的背外侧前额叶皮层得到的数据，样本数量未具体列出 |
| 17403 | 2024-08-07 |
Integrated multiomic analysis and high-throughput screening reveal potential gene targets and synergetic drug combinations for osteosarcoma therapy
2023-Aug, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.317
PMID:37457661
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研究论文 | 本研究通过综合多组学分析和高通量筛选，揭示了骨肉瘤治疗中潜在的基因靶点和协同药物组合 | 首次通过长读RNA测序和基于串联质谱标签（TMT）的定量蛋白质组学，结合下一代测序（NGS）和高通量药物组合筛选，全面分析了骨肉瘤的分子特征和治疗靶点 | NA | 旨在发现骨肉瘤治疗的新基因靶点和协同药物组合 | 骨肉瘤及其邻近正常组织，骨肉瘤细胞系 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 长读RNA测序，串联质谱标签（TMT）定量蛋白质组学，下一代测序（NGS） | NA | RNA序列，蛋白质组数据 | 骨肉瘤和邻近正常组织样本，骨肉瘤细胞系 |
| 17404 | 2024-08-07 |
FDG uptake reflects an immune-enriched subtype of thyroid cancer: Clinical implications of imaging-based molecular characterization
2023-08, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.6350
PMID:37466323
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研究论文 | 本文通过转录组分析研究了甲状腺癌中葡萄糖代谢与肿瘤微环境（TME）之间的关系，并探讨了FDG摄取在甲状腺癌中的临床意义。 | 本文首次探讨了甲状腺癌中FDG摄取与免疫细胞富集的TME之间的关联，并提出了FDG摄取作为免疫富集型甲状腺癌的标志。 | NA | 研究甲状腺癌中葡萄糖代谢与肿瘤微环境的关系，并探讨FDG摄取的临床意义。 | 甲状腺癌及其肿瘤微环境中的葡萄糖代谢和免疫细胞。 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | F-18 FDG PET、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA序列 | NA |
| 17405 | 2024-08-07 |
Cross-organ single-cell transcriptome profiling reveals macrophage and dendritic cell heterogeneity in zebrafish
2023-07-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112793
PMID:37453064
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，全面分析了成年斑马鱼器官中组织驻留巨噬细胞（TRMs）和树突状细胞（DCs）的异质性 | 首次在斑马鱼中全面描绘了TRMs和DCs的异质性，并生成了用于体内追踪这些细胞亚群的特异性报告基因系 | NA | 揭示斑马鱼器官中TRMs和DCs的异质性，并为深入研究这些细胞提供有价值的工具 | 斑马鱼器官中的组织驻留巨噬细胞和树突状细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年斑马鱼多个器官中的细胞样本 |
| 17406 | 2024-08-07 |
Single cell RNA sequencing unravels mechanisms underlying senescence-like phenotypes of alveolar macrophages
2023-Jul-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107197
PMID:37456831
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了肺泡巨噬细胞衰老样表型的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序发现CBFβ转录因子对肺泡巨噬细胞自我更新的重要性，并揭示了老年肺泡巨噬细胞的胚胎干细胞样特征减少及DNA修复能力下降 | NA | 探究衰老对肺泡巨噬细胞动态、异质性和转录组的影响 | 肺泡巨噬细胞 | digital pathology | geriatric disease | scRNA-seq | NA | RNA | 老年小鼠和人类的肺泡巨噬细胞 |
| 17407 | 2024-08-05 |
Continuous muscle, glial, epithelial, neuronal, and hemocyte cell lines for Drosophila research
2023-07-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85814
PMID:37470241
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研究论文 | 本文介绍了通过激活Ras表达生成的连续细胞系，包括肌肉、胶质、上皮、神经和血细胞特征。 | 创新之处在于利用激活的Ras表达简化了连续细胞系的生成，并在此过程中分离了多种细胞类型。 | 本研究的局限性在于未提及细胞系在体内功能和长期稳定性方面的验证。 | 研究旨在开发用于果蝇研究的连续细胞系，以便更好地理解不同细胞类型的特性和相互作用。 | 研究对象包括肌肉、胶质、上皮、神经和血细胞类型的细胞系。 | 数字病理学 | NA | 激活Ras表达、转录组分析 | NA | 细胞系、转录组数据 | NA |
| 17408 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing analysis reveals the relationship between tumor microenvironment cells and oxidative stress in breast cancer bone metastases
2023-07-19, Aging
DOI:10.18632/aging.204885
PMID:37470685
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研究论文 | 这项研究揭示了乳腺癌骨转移的肿瘤微环境细胞与氧化压力之间的关系 | 研究首次通过单细胞RNA测序构建了乳腺癌骨转移的肿瘤微环境全景，识别了细胞亚群和相关生物过程 | 研究结果可能受限于样本量和单细胞测序技术的局限性 | 探索乳腺癌骨转移中的肿瘤微环境细胞及其与氧化压力的关系 | 研究对象为乳腺癌骨转移的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 17409 | 2024-08-05 |
Identification of cell subpopulations associated with disease phenotypes from scRNA-seq data using PACSI
2023-07-19, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01658-3
PMID:37468850
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为PACSI的方法，用于识别与疾病表型相关的细胞亚群。 | PACSI利用生物网络的拓扑特性，通过一种基于邻近度的度量来量化细胞与疾病表型之间的相关性 | 目前的研究并未提及PACSI在其他类型数据上的广泛适用性 | 本研究旨在区别与疾病表型相关的单细胞亚群 | 本研究的对象是相关疾病表型的细胞亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 模拟数据和空间转录组数据 | 四个案例研究的样本 |
| 17410 | 2024-08-05 |
Single-nucleus chromatin landscapes during zebrafish early embryogenesis
2023-07-19, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02373-y
PMID:37468546
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研究论文 | 本研究利用单核ATAC-seq生成了斑马鱼早期胚胎发生中的染色质可及性数据集 | 首次在斑马鱼胚胎发生的第一天生成了全面的染色质可及性数据，并与单细胞RNA-seq数据整合，描述了染色质可及性与基因表达的动态关系 | 研究仅限于斑马鱼的早期胚胎阶段，可能不适用于其他物种的发育过程 | 揭示斑马鱼胚胎发生中的表观遗传调控机制 | 51,620个高质量的核和23个细胞簇，涵盖斑马鱼胚胎发生的多个发育时间点 | 数字病理学 | NA | 单核ATAC-seq | NA | 数据集 | 51620个高质量核 |
| 17411 | 2024-08-07 |
Targeting the Siglec-sialic acid axis promotes antitumor immune responses in preclinical models of glioblastoma
2023-07-19, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adf5302
PMID:37467314
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研究论文 | 研究通过敲除Siglec-E（Siglec-9的鼠类同源物）在微胶质细胞和单核细胞衍生细胞中的表达，揭示了Siglec-E通过抑制这些细胞的吞噬作用促进免疫逃逸，从而在胶质母细胞瘤模型中增强抗肿瘤免疫反应。 | 首次证明Siglec-E在微胶质细胞和单核细胞衍生细胞中的作用，以及其对免疫逃逸的影响，并展示了Siglec-E阻断与其他免疫疗法的组合活性。 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证。 | 探索Siglec-9轴作为胶质母细胞瘤治疗新靶点的潜力。 | 胶质母细胞瘤及其免疫逃逸机制。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及微胶质细胞和单核细胞衍生细胞的小鼠模型 |
| 17412 | 2024-08-07 |
Transcriptional and spatial profiling of the kidney allograft unravels a central role for FcyRIII+ innate immune cells in rejection
2023-07-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39859-7
PMID:37468466
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光技术，研究了肾脏移植排斥反应中FcyRIII+先天免疫细胞的作用 | 首次揭示了FCGR3A+单核细胞和FCGR3A+ NK细胞在肾脏移植排斥反应中的关键作用，并提出了潜在的治疗靶点 | NA | 深入理解肾脏移植排斥反应中的细胞组成和细胞间相互作用 | 肾脏移植活检样本中的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光 | NA | 转录组，图像 | 35,152个转录组来自16个肾脏移植活检样本 |
| 17413 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing-based analysis: probing the mechanisms of glycoprotein NMB regulation of epithelial cells involved in silicosis
2023-07-19, Particle and fibre toxicology
IF:7.2Q1
DOI:10.1186/s12989-023-00543-9
PMID:37468937
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，探讨了糖蛋白NMB在硅肺病中调控上皮细胞的具体分子机制 | 首次在单细胞水平上揭示了糖蛋白NMB在硅肺病进展中对肺泡II型上皮细胞的持续放大效应及其对上皮-间质转化的影响 | NA | 阐明硅肺病的发病机制，并探索糖蛋白NMB作为纤维化预防潜在靶点的可能性 | 硅肺病模型中的上皮细胞及其分子机制 | 数字病理学 | 职业性肺病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组 | 实验使用了硅肺病小鼠模型 |
| 17414 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis of the temporomandibular joint condyle in 3 and 4-month-old human embryos
2023-Jul-19, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-023-01069-5
PMID:37468984
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了3个月和4个月大的人类胚胎颞下颌关节髁突的细胞类型及其分化过程 | 首次发现并描述了一种新的细胞类型——过渡状态细胞（TSCs），并揭示了间充质干细胞向TSCs转化的过程及其进一步分化为成骨细胞、肥大软骨细胞和成纤维细胞的机制 | NA | 建立人类胚胎颞下颌关节髁突（TMJC）的分子细胞图谱，以促进对TMJC组织修复过程病理生理学的深入理解并解决临床问题 | 3个月和4个月大的人类胚胎颞下颌关节髁突组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共捕获了16,624个细胞，确定了15个细胞集群的基因表达谱 |
| 17415 | 2024-08-07 |
New mouse genetic model of breast cancer from IKKα defects in dendritic cells revealed by single-cell RNA sequencing
2023-Jul-18, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00553-z
PMID:37460530
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17416 | 2024-08-07 |
Genetic insights into ossification of the posterior longitudinal ligament of the spine
2023-07-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86514
PMID:37461309
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联研究（GWAS）的元分析，探讨了脊柱后纵韧带骨化症（OPLL）的遗传学机制 | 首次识别了14个与OPLL相关的显著位点，其中8个为新发现的位点，并通过基因关联分析和转录组广泛孟德尔随机化方法确定了三个候选基因 | 研究主要基于日本人群，结果的普适性有待进一步验证 | 揭示脊柱后纵韧带骨化症的病因和发病机制 | 脊柱后纵韧带骨化症及其与2型糖尿病和高体重指数的关系 | 遗传学 | 脊柱疾病 | 全基因组关联研究（GWAS） | NA | 基因组数据 | 22,016名日本个体 |
| 17417 | 2024-08-07 |
Cancer-associated fibroblast classification in single-cell and spatial proteomics data
2023-07-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39762-1
PMID:37463917
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研究论文 | 本文通过分析单细胞RNA测序数据，定义并功能注释了九种癌症相关成纤维细胞表型，并在多种癌症类型中验证了这一分类系统。 | 首次在单细胞水平上定义并功能注释了九种癌症相关成纤维细胞表型，并使用高多重成像质谱技术在蛋白质水平上验证了这些表型。 | NA | 定义癌症相关成纤维细胞的表型，并分析其在肿瘤微环境中的功能角色。 | 癌症相关成纤维细胞及其在肿瘤微环境中的作用。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 16,000多个肿瘤间质细胞，来自14名乳腺癌患者 |
| 17418 | 2024-08-07 |
Bifidobacterium adolescentis induces Decorin+ macrophages via TLR2 to suppress colorectal carcinogenesis
2023-Jul-18, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02746-6
PMID:37464382
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研究论文 | 本文探讨了双歧杆菌 adolescentis 通过 TLR2 诱导 Decorin+ 巨噬细胞来抑制结直肠癌的发生 | 首次揭示了双歧杆菌 adolescentis 在结直肠癌中的功能及其通过 TLR2/YAP 轴调控 Decorin+ 巨噬细胞的机制 | NA | 阐明肠道微生物与肿瘤微环境在结直肠癌发病机制中的相互作用 | 双歧杆菌 adolescentis 及其在结直肠癌中的作用机制 | NA | 结直肠癌 | 单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) | NA | 组织样本 | 结直肠癌患者肿瘤及癌旁组织样本，以及结直肠癌动物模型 |
| 17419 | 2024-08-07 |
Multimodal immune cell phenotyping in GI biopsies reveals microbiome-related T cell modulations in human GvHD
2023-07-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101125
PMID:37467715
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研究论文 | 本研究通过结合多重组织成像和单细胞RNA测序技术，分析了异基因造血干细胞移植后患者的胃肠活检样本和粪便微生物组，揭示了微生物组多样性与短链脂肪酸产生菌对抑制性调节T细胞（Tregs）维持的影响，以及急性移植物抗宿主病（aGvHD）严重程度与CD8 T细胞克隆扩增的关系 | 首次将多模态免疫细胞表型分析与微生物组分析相结合，揭示了微生物组与T细胞调节在aGvHD中的作用 | NA | 探讨急性移植物抗宿主病的严重程度与免疫细胞及微生物组的关系 | 异基因造血干细胞移植后的胃肠活检样本和粪便微生物组 | 数字病理学 | 移植物抗宿主病 | 多重组织成像、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本、微生物组数据 | NA |
| 17420 | 2024-08-07 |
New insights about immune populations in gastrointestinal GvHD
2023-07-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101126
PMID:37467719
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研究论文 | Jarosch等人使用单细胞RNA测序和ChipCytometry技术深入研究了胃肠（GI）活检中免疫细胞浸润的情况，特别是在患有胃肠移植物抗宿主病（GI-GvHD）的个体中。 | 该研究首次详细描述了严重GI-GvHD患者GI活检中克隆扩增的细胞毒性CD8 T细胞的增加。 | NA | 探索胃肠移植物抗宿主病中免疫细胞的特征。 | 胃肠移植物抗宿主病患者的免疫细胞。 | 数字病理学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序，ChipCytometry | NA | 生物样本 | 多个GI活检样本 |