单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 17381 - 17400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 17381 | 2024-08-07 |
mTORC2 acts as a gatekeeper for mTORC1 deficiency-mediated impairments in ILC3 development
2023-Nov, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-023-01120-8
PMID:37407703
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研究论文 | 本研究探讨了mTORC1在ILC3发育中的关键作用及其与mTORC2的相互作用 | 首次揭示了mTORC1缺乏通过mTORC2介导的机制影响ILC3发育和肠道稳态 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探究mTORC1和mTORC2在ILC3发育和肠道免疫中的作用 | 先天性淋巴细胞3组（ILC3s）及其在肠道免疫和屏障功能中的作用 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 17382 | 2024-08-05 |
TALKIEN: crossTALK IntEraction Network. A web-based tool for deciphering molecular communication through ligand-receptor interactions
2023-Oct-30, Molecular omics
IF:3.0Q3
DOI:10.1039/d3mo00049d
PMID:37403821
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研究论文 | TALKIEN是一个用于通过配体-受体相互作用解析分子通信的在线工具 | 提供了一种简单直观的在线应用程序来可视化分子交互信息，并构建和分析蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 具体的单细胞序列或空间转录组数据解析能力仍然未详细讨论 | 研究不同细胞类型之间的分子交流及其在癌症研究中的重要性 | 输入基因或蛋白质列表，以代表不同的细胞谱系 | 数字病理学 | 癌症 | 系统生物学技术 | NA | 基因或蛋白质列表 | NA |
| 17383 | 2024-08-05 |
Spatial regulation of plant hormone action
2023-10-13, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erad244
PMID:37401809
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研究论文 | 本文综述了植物激素作用的空间调控机制 | 探讨了植物激素传感器技术的新发展，提供了前所未有的空间域分辨率 | NA | 研究植物激素在不同植物部分的空间特异性作用及其调控机制 | 植物激素及其对植物生长和发育的影响 | NA | NA | FRET和单细胞RNA-seq | NA | NA | NA |
| 17384 | 2024-08-05 |
Clonal dynamics and copy number variants by single-cell analysis in leukemic evolution of myeloproliferative neoplasms
2023-10, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.27013
PMID:37399248
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了骨髓增生性肿瘤（MPN）向急性转变的克隆动态和拷贝数变异 | 首次利用单细胞测序技术揭示了MPN在急性转变过程中的克隆轨迹和拷贝数变异 | 仅分析了10名患者的配对样本，样本量较小可能影响广泛适用性 | 探讨骨髓增生性肿瘤从慢性相向急性相转化的机制 | 研究对象为10名骨髓增生性肿瘤患者的慢性和急性配对样本 | 数字病理学 | 血液癌症 | 单细胞测序 (SCS) | NA | 基因拷贝数数据 | 10名患者的慢性和急性配对样本 |
| 17385 | 2024-08-05 |
Heterogeneity of T cells in periapical lesions and in vitro validation of the proangiogenic effect of GZMA on HUVECs
2023-Oct, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.13951
PMID:37400946
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研究论文 | 本研究探讨了T细胞在慢性根尖周炎中的作用，并验证了GZMA对HUVECs的促血管生成效应 | 本研究提供了T细胞在根尖周病变中的异质性新见解，并揭示了GZMA在调节HUVECs血管生成中的潜在作用 | 样本数量有限，仅包括五个慢性根尖周炎病例 | 研究慢性根尖周炎中T细胞的作用及GZMA在血管生成中的调节机制 | 慢性根尖周炎患者的T细胞及其对HUVECs的影响 | 数字病理学 | 慢性根尖周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 五个慢性根尖周炎病例的样本 |
| 17386 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of mitochondrial dysfunction and necroptosis in intracranial aneurysms from the perspective of predictive, preventative, and personalized medicine
2023-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01865-x
PMID:37410216
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研究论文 | 本研究探讨了线粒体功能障碍和程序性坏死在颅内动脉瘤中的作用 | 研究首次揭示了线粒体功能障碍和程序性坏死在颅内动脉瘤形成中的重要性，并确定了几个关键基因 | 研究的样本大小和来源可能影响结果的普适性 | 探索线粒体功能障碍和程序性坏死在颅内动脉瘤的预测、预防和个性化医学中的应用 | 75个颅内动脉瘤样本和37个对照样本的转录组数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | 机器学习 | 基因表达数据 | 75个颅内动脉瘤样本和37个对照样本 |
| 17387 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Provides New Insights into Therapeutic Roles of Thyroid Hormone in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2023-10, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0080OC
PMID:37402274
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了甲状腺激素3,5,3'-三碘甲状腺原氨酸（T）在特发性肺纤维化中的治疗作用及其对肺泡再生的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了甲状腺激素T通过调节肺泡上皮细胞、巨噬细胞和成纤维细胞的状态和细胞间通讯，促进肺泡再生和减轻纤维化的机制 | NA | 探索甲状腺激素在特发性肺纤维化中的治疗作用及其对肺泡再生的影响 | 特发性肺纤维化中的甲状腺激素治疗作用 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用bleomycin处理的 mice 作为模型 |
| 17388 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell RNA sequencing analysis reveals a mesenchymal stem cell-associated signature for estimating prognosis and drug sensitivity in gastric cancer
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05058-6
PMID:37410142
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，识别与间充质干细胞相关的标志物，用于预测胃癌患者的预后和药物敏感性 | 开发了一种基于间充质干细胞标志基因的风险特征，不仅能预测胃癌患者的预后，还能反映抗肿瘤治疗的疗效 | NA | 识别间充质干细胞相关标志物在胃癌中的预后价值 | 胃癌患者的预后和药物敏感性 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 174个间充质干细胞标志基因，TCGA-STAD和GEO数据库中的数据 |
| 17389 | 2024-08-05 |
Identification of In-Droplet Multicellular Communities by Light-Induced Combinatorial DNA Barcoding
2023-Sep-21, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202301133
PMID:37404204
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研究论文 | 提出了一种通过光诱导组合DNA条形码在微滴中识别多细胞群落的策略 | 首次使用DNA功能化微颗粒作为微滴内亚群体的标识符，解决了单细胞测序分析中缺乏有效分子标识符的问题 | 未提及具体的实验验证或在复杂细胞环境中的应用 | 开发一种新的方法来识别微滴中的多细胞群落 | 异质细胞池中的细胞-细胞相互作用 | 数字病理学 | NA | DNA条形码 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 17390 | 2024-08-05 |
Deep learning applications in single-cell genomics and transcriptomics data analysis
2023-Sep, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.115077
PMID:37393865
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研究论文 | 本文探讨了深度学习在单细胞基因组学和转录组学数据分析中的应用 | 提出深度学习方法作为传统机器学习算法的潜在替代，特别是在单细胞研究中，同时显示出在数据预处理和下游分析中的优越性 | 深度学习尚未彻底改变单细胞组学领域面临的最紧迫挑战 | 评估深度学习技术在单细胞组学中的应用效果及其面临的独特挑战 | 单细胞基因组学、转录组学、空间转录组学和多组学整合 | 计算机视觉 | 癌症 | 深度学习 | NA | NA | NA |
| 17391 | 2024-08-05 |
Multi-omics dissection of stage-specific artemisinin tolerance mechanisms in Kelch13-mutant Plasmodium falciparum
2023-09, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2023.100978
PMID:37385107
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研究论文 | 本文研究了携带Kelch13 C580Y突变的Plasmodium falciparum对青蒿素的部分抗性机制 | 通过多组学策略，揭示了青蒿素部分抗性中的阶段特异性机制，提供了新的见解 | 研究可能主要集中在少数基因和蛋白，未涵盖所有潜在的抗性机制 | 探讨Plasmodium falciparum对青蒿素的部分抗性机制及其在不同发展阶段的表现 | 研究对象为具有Kelch13突变的Plasmodium falciparum及其对青蒿素的反应 | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞转录组学、无标记蛋白组学、脂质组学 | NA | 基因组数据、蛋白质组数据 | 包括多种阶段的Plasmodium falciparum样本，具体样本数量未明确说明 |
| 17392 | 2024-08-05 |
AT2 cell-derived IgA trapped by the extracellular matrix in silica-induced pulmonary fibrosis
2023-Sep, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110545
PMID:37390644
|
研究论文 | 该研究发现肺上皮细胞通过分泌IgA促进硅引起的肺纤维化 | 首次证明AT2细胞参与IgA的分泌，并且IgA的分泌通过细胞外基质被捕获，进一步加重肺纤维化 | 研究主要集中在小鼠模型中，尚未在人体样本中得出明确的结果 | 探讨肺上皮细胞的IgA分泌与硅诱导的肺纤维化之间的关系 | 研究对象为硅处理的小鼠及其肺部组织 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间转录组学和单细胞测序 | NA | 组织样本 | 纳入了硅处理的小鼠样本，具体样本数量未提及 |
| 17393 | 2024-08-05 |
Cancer-associated fibroblast expression of glutamine fructose-6-phosphate aminotransferase 2 (GFPT2) is a prognostic marker in gastric cancer
2023-09, The journal of pathology. Clinical research
DOI:10.1002/cjp2.333
PMID:37395335
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研究论文 | 研究表明，GFPT2在胃癌中的表达与预后相关 | 首次确认GFPT2在胃癌相关成纤维细胞中的重要功能，并提出其作为预后标志物的潜力 | 研究中未详细探讨GFPT2的具体作用机制 | 探讨GFPT2在胃癌中的生物学功能及临床意义 | 胃癌患者的转录组数据及相关细胞系和组织样本 | 数字病理 | 胃癌 | 转录组测序 | NA | 文本数据 | 分析了来自Harbin Medical University和The Cancer Genome Atlas的多个样本 |
| 17394 | 2024-08-07 |
Clonal architecture and single-cell transcriptome landscape in Richter's syndrome
2023-09, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.18952
PMID:37401149
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17395 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a pro-metastatic subpopulation and the driver transcription factor NFE2L1 in ovarian cancer cells
2023-09, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01418-1
PMID:37405595
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了卵巢癌细胞中的促转移亚群及驱动转录因子NFE2L1 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了卵巢癌细胞中的促转移亚群，并确定了NFE2L1作为关键的转录因子 | NA | 阐明基因表达改变在获得转移潜能过程中的机制，并鉴定卵巢癌细胞中的转移亚群 | 卵巢癌细胞及其转移亚群 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两个卵巢癌细胞系：SKOV-3和SKOV-3-13 |
| 17396 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals cellular heterogeneity and highlights Fstl1-regulated alveolar myofibroblasts in mouse lung at birth
2023-09, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2023.110677
PMID:37406975
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了野生型和Fstl1基因敲除小鼠肺部的细胞异质性，并揭示了Fstl1调控的肺泡肌成纤维细胞的作用 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了Fstl1调控的肺泡肌成纤维细胞在肺发育中的作用，并阐明了其分子机制 | NA | 探究Fstl1在肺发育中的作用及其分子机制 | 野生型和Fstl1基因敲除小鼠的肺部细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 22,774个单细胞样本 |
| 17397 | 2024-08-07 |
Classification and characterisation of extracellular vesicles-related tuberculosis subgroups and immune cell profiles
2023-09, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17836
PMID:37409682
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研究论文 | 本文通过分析外泌体相关基因表达谱，探索了结核病（TB）的分子机制和潜在诊断标记物，并利用机器学习技术建立了TB风险模型。 | 本文首次通过外泌体相关基因表达谱分析，结合单细胞RNA测序技术，识别出九个与TB相关的重要基因，并建立了TB风险模型，为TB的诊断和治疗提供了新的生物标志物。 | NA | 探索结核病的分子机制，寻找有效的诊断标记物和治疗靶点。 | 结核病及其相关的外泌体和免疫细胞。 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 20个外泌体相关差异表达基因，其中17个上调，3个下调 |
| 17398 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq Revealed that Altered Tumor Infiltrating Lymphocytes in Cirrhotic Liver Indicate Development of Hepatocellular Carcinoma
2023-Aug-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2022.00062
PMID:37408821
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研究论文 | 本研究探讨了健康、肝硬化和肝细胞癌（HCC）肿瘤组织中的免疫微环境特征 | 发现肝硬化患者中减少的天真T细胞浸润和增加的中性粒细胞浸润可能是HCC发展的指征，并且这些免疫细胞亚群的动态变化可能作为新的生物标志物 | 本研究可能对肝硬化和HCC的生物标志物识别存在局限性，需进一步验证 | 旨在识别肝硬化向HCC过渡的免疫生物标志物 | 研究对象包括健康肝、肝硬化肝和HCC肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 样本表达矩阵 | NA |
| 17399 | 2024-08-05 |
Probabilistic tensor decomposition extracts better latent embeddings from single-cell multiomic data
2023-08-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad570
PMID:37403780
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研究论文 | 该文章提出了一种概率张量分解框架，SCOIT，用于从单细胞多组学数据中提取嵌入。 | SCOIT结合了多种分布来处理稀疏、嘈杂和异质的单细胞数据，提升了嵌入的提取质量。 | NA | 研究单细胞多组学数据的嵌入提取和分析方法。 | 八个来自不同测序协议的单细胞多组学数据集。 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 多组学数据 | 八个单细胞多组学数据集 |
| 17400 | 2024-08-07 |
DOT1L activity affects neural stem cell division mode and reduces differentiation and ASNS expression
2023-08-03, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256233
PMID:37382163
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研究论文 | 本文研究了组蛋白甲基转移酶DOT1L的酶活性对神经干细胞分裂模式的影响，并探讨了其对神经元分化和ASNS表达的调控作用 | 首次揭示了DOT1L通过调控神经干细胞的分裂模式和代谢基因的转录，影响神经元分化和ASNS表达 | NA | 探讨DOT1L在皮质神经发生中的作用及其分子机制 | 神经干细胞的分裂模式和神经元分化 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |