单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 30126 篇文献,本页显示第 1721 - 1740 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
1721 2025-07-11
Inference after latent variable estimation for single-cell RNA sequencing data
2023-12-15, Biostatistics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种名为count splitting的新框架,用于在单细胞RNA测序数据分析中实现有效的统计推断 引入了count splitting框架,能够在单细胞RNA测序数据分析中实现有效的统计推断,适用于几乎任何潜在变量估计技术和推断方法 方法基于泊松假设,可能不适用于不符合该假设的数据 解决单细胞RNA测序数据分析中潜在变量估计后的统计推断问题 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 模拟研究和多能干细胞分化为心肌细胞的数据集
1722 2025-07-11
T cell-Mediated Development of Stromal Fibroblasts with an Immune-Enhancing Chemokine Profile
2023-08-01, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究探讨了癌症相关成纤维细胞(CAFs)在炎症组织中的适应性及其对免疫微环境的影响 首次发现CAFs具有表型可塑性,能够从免疫抑制表型转变为免疫激活表型 研究主要基于小鼠模型,人类CAFs的类似机制需要进一步验证 探究CAFs如何适应不同的免疫微环境并调节免疫反应 小鼠胰腺腺癌中的癌症相关成纤维细胞(CAFs)和CD8+ T细胞 肿瘤免疫学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 小鼠胰腺腺癌模型中的CAFs
1723 2025-07-10
Gut microbial Nordihydroguaiaretic acid suppresses macrophage pyroptosis to regulate epithelial homeostasis and inflammation
2025-Dec, Gut microbes IF:12.2Q1
研究论文 研究探讨了衰老相关的肠道菌群失调如何通过减少Nordihydroguaiaretic acid (NDGA)的产生加剧炎症性肠病(IBD),并发现NDGA通过下调GSDMD/NR4A1/NLRP3轴介导的巨噬细胞焦亡来缓解结肠炎 揭示了肠道微生物NDGA在调节巨噬细胞焦亡中的新作用,并提出了其作为老年相关IBD治疗靶点的潜力 研究主要基于小鼠模型,人类样本数据有限,需要进一步验证NDGA在人类IBD中的治疗效果 探究衰老相关肠道菌群失调对结肠炎发展的影响及其机制 野生型和IL-10缺陷小鼠、IBD患者和老年人 肠道微生物组学 炎症性肠病(IBD) 粪便微生物移植(FMT)、16S rDNA测序、代谢组学、单细胞RNA测序(scRNA-seq) 小鼠结肠炎模型 微生物组数据、代谢组数据、单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及小鼠模型、IBD患者和老年人样本
1724 2025-05-12
RETRACTION: Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Intratumoral Heterogeneity in Lung Adenocarcinoma
2025-Aug, Environmental toxicology IF:4.4Q1
撤稿声明 该文章因同行评审过程存在问题而被撤稿 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1725 2025-07-10
Tracing Early Migratory Neurons in the Developing Nose Using Contactin-2 (Cntn2) CreERT2
2025-Aug, Genesis (New York, N.Y. : 2000)
研究论文 本研究通过生成可诱导的Cntn2CreERT2小鼠系,追踪了发育中嗅觉系统中Cntn2的表达,以研究早期迁移神经元 利用Cntn2CreERT2小鼠系作为时间控制的工具,特异性操纵感兴趣的神经元群体 可用的分子标记数量有限,可能限制了研究的广泛性 研究发育中嗅觉系统的神经元迁移过程 早期迁移神经元,特别是起源于嗅觉区域的神经元 神经科学 NA 单细胞RNA测序,可诱导的CreERT2系统 Cntn2CreERT2小鼠模型 基因表达数据 NA
1726 2025-07-10
Cellular heterogeneity and patterning strategies as revealed by upper respiratory epithelium single cell atlas
2025-Jul-18, iScience IF:4.6Q1
research paper 通过单细胞RNA测序和空间验证,生成了小鼠上呼吸道上皮细胞的分子图谱,揭示了18种上皮细胞类型及其空间分布 首次生成了上呼吸道上皮的单细胞和分子图谱,揭示了细胞类型的空间分布和多样性 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本 解析上呼吸道上皮细胞的异质性和空间分布模式 小鼠上呼吸道上皮细胞 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 小鼠上呼吸道上皮细胞样本
1727 2025-07-10
Single-Cell RNA Sequencing Highlights a Contribution of Human Amniotic Mesenchymal Stem Cells-Derived Exosomes to Androgenetic Alopecia
2025-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究探讨了人羊膜间充质干细胞来源的外泌体(hAMSC-exo)对雄激素性脱发(AGA)的治疗效果及其分子机制 首次在单细胞水平揭示了hAMSC-exo通过Wnt/β-catenin信号通路减轻DHT诱导的毛乳头细胞(DPC)损伤,并促进毛囊再生的分子机制 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体临床试验中验证 探索hAMSC-exo对AGA的治疗潜力及其作用机制 雄激素性脱发(AGA)小鼠模型及人羊膜间充质干细胞来源的外泌体(hAMSC-exo) 干细胞治疗 雄激素性脱发 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确提及具体样本数量,但涉及小鼠背部皮肤的多种细胞类型
1728 2025-07-10
Impact of IKCa Channels on CD34+ Cells in Arteriole Remodeling in Angiotensin II-Induced Hypertension Model Mice
2025-Jul-09, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
研究论文 本研究探讨了IKCa通道在Ang II诱导的高血压模型中CD34+细胞介导的内皮修复中的作用 揭示了非骨髓来源的CD34+细胞在高血压条件下通过IKCa通道激活ERK/P38信号通路促进内皮修复的新机制 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 阐明高血压条件下内皮修复的分子机制 Ang II诱导的高血压模型小鼠中的CD34+细胞 心血管疾病研究 心血管疾病 单细胞RNA测序、免疫荧光、跨孔迁移实验、膜片钳技术 Cd34-CreERT2; R26-tdTomato谱系示踪模型 基因表达数据、细胞迁移数据、电生理数据 未明确说明具体样本数量,使用高血压模型小鼠进行研究
1729 2025-07-10
Proneural-Mesenchymal hybrid glioblastoma cells are resistant to therapy and dependent on nuclear import
2025-Jul-08, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 该研究揭示了胶质母细胞瘤中具有混合表型的细胞对常规治疗具有抗性,并依赖于核输入机制 首次发现并表征了同时表达前神经和间充质标记的胶质母细胞瘤混合细胞群,揭示了其通过核转运机制介导治疗抗性的新机制 研究主要基于体外细胞系和小鼠模型,需要进一步在人类患者组织中验证 探究胶质母细胞瘤细胞可塑性及治疗抗性的分子机制 胶质母细胞瘤患者来源的细胞系和肿瘤组织 肿瘤生物学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、单细胞ChIP测序、核蛋白质组学、高分辨率成像 NA 基因组数据、蛋白质组数据、影像数据 多个患者来源的细胞系和临床数据集
1730 2025-07-10
Peripheral immune imbalance in pediatric fulminant myocarditis revealed by single-cell sequencing and plasma proteomics
2025-Jul-08, Genes and immunity IF:5.0Q2
研究论文 通过单细胞测序和血浆蛋白质组学揭示了小儿暴发性心肌炎的外周免疫失衡 鉴定了外周血中几种独特的细胞类型,并揭示了急性期FM中免疫细胞比例和功能的显著失调 未提及样本量是否足够大以支持广泛推广 阐明小儿暴发性心肌炎的免疫特征和细胞通讯 小儿暴发性心肌炎患者的外周血单个核细胞和血浆 免疫学 心血管疾病 scRNA-seq, 血浆蛋白质组学 NA 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 未明确提及具体样本量
1731 2025-07-10
Temporal control of progenitor competence shapes maturation in GABAergic neuron development in mice
2025-Jul-08, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本研究探讨了小鼠胚胎中GABA能神经元发育过程中祖细胞能力的时间控制如何影响其成熟和分化 揭示了神经发生的时间进程如何塑造神经节隆起祖细胞的成熟能力,以及染色质重塑和转录因子NFIB及其靶基因如何影响晚期出生神经元的成熟能力 研究仅限于小鼠胚胎,未涉及其他物种或人类 理解GABA能神经元发育过程中祖细胞能力的时间控制机制 小鼠胚胎中的GABA能投射神经元和中间神经元 神经科学 NA 单细胞转录组学、染色质可及性分析、谱系追踪、出生日期标记、跨发育阶段移植和扰动测序 NA 转录组数据、染色质可及性数据 小鼠胚胎样本
1732 2025-07-10
Opposite regulation of intestinal and intrahepatic CD8+ T cells controls alcohol-associated liver disease progression
2025-Jul-07, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究探讨了肠道和肝内CD8+ T细胞在酒精相关肝病(ALD)中的相反调控作用及其对疾病进展的影响 揭示了CD8+ T细胞在肠道和肝脏中的相反调控机制及其在ALD中的关键作用,提出BCL2调控CD8+ T细胞存活的新治疗策略 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证仍需进一步扩大 阐明肠道-肝脏轴中CD8+ T细胞的调控机制及其在ALD发病中的作用 ALD患者和小鼠模型中的肠道及肝内CD8+ T细胞 肝脏病理学 酒精性肝病 单细胞RNA测序(scRNA seq),转录组学分析 Cd8 Bcl-2转基因小鼠模型 基因表达数据,免疫细胞分析数据 ALD患者样本和多种基因修饰小鼠模型
1733 2025-07-10
Regulation of revival stem cell differentiation by CREPT/RPRD1B during intestinal regeneration
2025-Jul-07, Cell & bioscience
研究论文 本研究探讨了CREPT/RPRD1B在肠道再生过程中对复兴干细胞(revSCs)分化的调控作用 首次发现CREPT/RPRD1B蛋白在肠道再生过程中对复兴干细胞分化的重要调控作用 研究主要基于小鼠模型,人类肠道再生中的类似机制尚需验证 阐明肠道再生过程中复兴干细胞分化的调控机制 小鼠肠道复兴干细胞(revSCs) 干细胞生物学 肠道损伤修复 单细胞转录组分析、谱系追踪实验 Villin-Cre介导的CREPT敲除小鼠模型 基因表达数据 未明确说明具体样本数量,使用基因工程小鼠模型
1734 2025-07-10
Glioma promotes macrophage immunosuppressive phenotype through ANXA1 in a methionine metabolism-dependent manner
2025-Jul-06, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究探讨了胶质瘤中甲硫氨酸代谢与肿瘤免疫抑制微环境的关系,揭示了ANXA1在甲硫氨酸代谢依赖的方式下促进巨噬细胞免疫抑制表型的机制 首次揭示了甲硫氨酸代谢通过上调ANXA1表达激活ANNEXIN通路,增强胶质母细胞瘤细胞与巨噬细胞的相互作用,促进M2型巨噬细胞极化 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内实验验证 探究甲硫氨酸代谢在胶质瘤免疫抑制微环境形成中的作用 胶质瘤患者队列和胶质母细胞瘤细胞 肿瘤免疫学 胶质瘤/胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 甲硫氨酸代谢活性评分(MMA-score) NA 基因表达数据, 单细胞测序数据 胶质瘤患者队列(未明确数量)
1735 2025-07-10
Single-cell transcriptome atlas reveals mitophagy dynamics in acute chemical injury model and the role of MSCs transplantation
2025-Jul-06, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组图谱揭示了急性化学损伤模型中线粒体自噬的动态变化以及间充质干细胞移植的作用 首次在单细胞水平上揭示了急性肝衰竭中线粒体自噬的细胞特异性变化,并阐明了间充质干细胞通过调控不同细胞类型的线粒体自噬状态来缓解疾病进展的分子机制 研究仅基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 探究间充质干细胞治疗急性肝衰竭过程中肝细胞和巨噬细胞的线粒体自噬状态变化 健康小鼠、急性肝衰竭小鼠和人脐带间充质干细胞移植小鼠的肝组织 单细胞转录组学 急性肝衰竭 scRNA-seq NA 单细胞转录组数据 健康小鼠、急性肝衰竭小鼠和hUC-MSC移植小鼠的肝组织样本
1736 2025-07-10
Systematic assessment of microenvironment-dependent transcriptional patterns and intercellular communication
2025-Jul-06, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)与空间转录组学(ST),系统评估空间微环境如何影响基因表达和细胞间通讯 首次系统性地结合scRNA-seq和ST技术,评估空间微环境对基因表达和细胞间通讯的影响 研究揭示了scRNA-seq数据在捕捉微环境特异性分子相互作用方面的局限性,即使利用了空间信息 理解细胞间通讯及其对空间组织的依赖性,以揭示组织复杂性和器官功能 乳腺癌、大脑皮层和心脏数据集 生物信息学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学(ST) NA 基因表达数据 多个乳腺癌、大脑皮层和心脏数据集(具体数量未明确说明)
1737 2025-07-10
The impact of T cells on immune-related liver diseases: an overview
2025-Jul-04, Inflammation and regeneration IF:5.0Q1
综述 本文综述了T细胞在免疫相关肝病中的作用及其生物学特性 利用单细胞RNA测序和空间转录组学等组学技术,揭示了T细胞在肝纤维化进展和恢复中的作用 免疫相关肝病领域仍存在大量未满足的需求 探讨T细胞在非病毒性肝病中的作用及最新治疗策略 自身免疫性肝炎(AIH)、原发性硬化性胆管炎(PSC)、原发性胆汁性胆管炎(PBC)和代谢相关脂肪性肝炎(MASH) 免疫学 肝病 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA NA
1738 2025-07-10
Unraveling the oxidative stress landscape in diabetic foot ulcers: insights from bulk RNA and single-cell RNA sequencing data
2025-Jul-04, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过生物信息学和初步验证方法揭示了糖尿病足溃疡(DFU)中的氧化应激景观 首次利用单细胞和批量RNA测序数据揭示DFU中的氧化应激相关基因和成纤维细胞的作用 研究结果需要进一步的体内实验验证 揭示糖尿病足溃疡中氧化应激的潜在机制 糖尿病足溃疡患者样本 数字病理学 糖尿病足溃疡 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 SVM-RFE, LASSO, RF RNA测序数据 31,787个细胞(来自10个不同集群)
1739 2025-07-10
An Intrinsic-hoc Framework for Heterogeneous Cellular Senescence Elucidation Using Deep Graph Representation Learning and Experimental Validation
2025-Jul-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为DeepSAS的框架,用于通过深度图表示学习和实验验证来阐明衰老细胞的异质性及其相关基因 DeepSAS框架结合深度图表示学习和单细胞RNA-seq数据,能够更准确地识别衰老细胞和相关基因,且在基准测试中表现优于现有方法 研究仅应用于健康眼细胞图谱和特发性肺纤维化数据集,未在其他疾病或组织中验证 理解衰老和年龄相关疾病中衰老细胞的异质性及其相关基因 衰老细胞及其相关基因 数字病理学 特发性肺纤维化 单细胞RNA-seq, Xenium空间转录组学 深度图表示学习 单细胞RNA-seq数据, 空间转录组数据 健康眼细胞图谱和特发性肺纤维化数据集
1740 2025-07-10
Single-cell analysis of ecto-mesenchymal cells derived from the neural crest reveals the regulatory role of P75NTR in odontogenic and osteogenic differentiation
2025-Jul-03, BMC oral health IF:2.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了p75NTR对神经嵴细胞牙源性和成骨分化的调控作用 首次在单细胞水平揭示了p75NTR通过细胞因子调控网络影响细胞间通讯和分化能力 研究仅在小鼠模型中进行,未在人类细胞中验证 探索p75NTR对颌面部发育过程中矿化和分化的影响机制 小鼠胚胎外胚层间充质干细胞(EMSCs) 发育生物学 颌面部发育异常 scRNA-seq, 矿化诱导实验, 伤口愈合实验 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 p75NTR敲除和野生型小鼠胚胎EMSCs
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