单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 39582 篇文献,本页显示第 1721 - 1740 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1721 2026-05-02
TGF-β-p-STAT1-LAIR2 axis has a "self-rescue" role for exhausted CD8+ T cells in hepatocellular carcinoma
2023-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
研究论文 本研究揭示了TGF-β在肝细胞癌中通过TGF-β-p-STAT1-LAIR2轴对耗竭CD8+ T细胞产生“自我救援”作用 首次发现TGF-β在诱导CD8+ T细胞耗竭的同时,通过TGF-β-p-STAT1-LAIR2轴启动细胞内在的抗耗竭机制,即“自我救援” “自我救援”行为对TGF-β刺激具有时间和剂量限制,易被更强的抑制信号掩盖 研究TGF-β对肝细胞癌浸润CD8+ T细胞功能的调控效应及分子机制 肝细胞癌中的CD8+ T细胞 数字病理学 肝细胞癌 流式细胞术, 质谱流式细胞术, 免疫组织化学, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告基因实验 NA 图像, 文本, 序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1722 2026-05-02
MTHFD2 ablation in T cells protects against heart transplant rejection by perturbing IRF4/PD-1 pathway through the metabolic-epigenetic nexus
2023-11, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
研究论文 揭示MTHFD2在T细胞中通过代谢-表观遗传学影响IRF4/PD-1通路从而保护心脏移植免受排斥的机制 首次发现一碳代谢酶MTHFD2作为同种反应T细胞的代谢检查点,通过H3K4me3介导的代谢-表观遗传学机制影响IRF4/PD-1通路,并提出其作为心脏移植排斥治疗靶点的潜力 研究主要基于小鼠模型,且未深入探讨MTHFD2在其他免疫细胞中的作用或其长期治疗效果 研究一碳代谢酶MTHFD2在心脏移植排斥中的作用及其机制,评估其作为治疗靶点的可能性 人类和鼠类心脏移植受体的心脏组织、T细胞特异性Mthfd2基因敲除小鼠、人源化皮肤移植模型 数字病理学 心血管疾病 转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、酶联免疫斑点法、切割靶点与标记法 NA 基因表达数据、代谢物数据、单细胞转录组数据 人类和鼠类心脏移植受体心脏组织,小鼠T细胞特异性Mthfd2基因敲除模型,人源化皮肤移植模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1723 2026-05-02
Dissecting the single-cell transcriptome network of macrophage and identifies a signature to predict prognosis in lung adenocarcinoma
2023-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示肺腺癌中不同来源巨噬细胞的功能差异并构建预后预测模型 首次根据来源将巨噬细胞分为肺泡巨噬细胞和间质巨噬细胞,并阐明其在肿瘤微环境中的不同功能及预后价值 未提及具体局限性 探索不同来源巨噬细胞在肺腺癌肿瘤微环境中的功能及作为预后和治疗预测标志物的潜力 肺腺癌患者的肿瘤组织、正常肺组织和外周血样本中的巨噬细胞 数字病理学 肺腺癌 单细胞RNA测序 风险预测模型 基因表达数据 21例肺腺癌、12例正常和4例外周血样本用于单细胞分析;502例TCGA患者用于构建模型;544例GEO数据集患者用于验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1724 2026-05-02
Spatial transcriptomic profiling of coronary endothelial cells in SARS-CoV-2 myocarditis
2023, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 利用数字空间转录组学技术分析SARS-CoV-2心肌炎患者冠状动脉内皮细胞的转录特征 首次在保留组织原位结构的情况下,通过空间转录组学分析SARS-CoV-2感染对心肌和冠状动脉血管内皮细胞的差异表达影响 样本量较小(4例对照,8例COVID-19患者);未在大血管内皮观察到类似变化,限制了内皮炎作为COVID-19心血管事件关键驱动因素的结论 探讨重症COVID-19患者冠状动脉内皮和心肌的转录编程变化 COVID-19患者和对照尸检心脏组织中的心肌及冠状动脉血管组织 数字病理学 心血管疾病 空间转录组学 NA 基因表达数据 12例尸检心脏组织样本(4例对照,8例COVID-19患者) NA 空间转录组学 NA NA
1725 2026-05-02
Colorectal cancer organoid models uncover oxaliplatin-resistant mechanisms at single cell resolution
2022-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
研究论文 利用结直肠癌类器官模型通过单细胞RNA测序揭示奥沙利铂耐药机制 建立了来自奥沙利铂耐药和初治患者的患者源性类器官模型,并通过单细胞RNA测序解析耐药细胞群体及相关信号通路和驱动基因 未提及具体局限性 研究结直肠癌对奥沙利铂化疗耐药的分子机制 来自奥沙利铂耐药和初治结直肠癌患者的患者源性类器官 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 两株患者源性类器官(来自耐药和初治患者各一株) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1726 2026-05-02
Molecular signaling in pancreatic ductal metaplasia: emerging biomarkers for detection and intervention of early pancreatic cancer
2022-Apr, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
综述 总结了胰腺导管化生的分子机制及其作为早期胰腺癌检测和干预生物标志物的潜力 通过整合基因工程小鼠模型、细胞谱系追踪和单细胞测序等最新技术,揭示了PDM形成和演化的新型细胞和分子机制,并探讨其作为早期胰腺癌生物标志物的临床应用前景 基于综述性分析,可能缺乏原始实验数据支持,且PDM标志物向临床转化的有效性需进一步验证 阐释胰腺导管化生的细胞和分子机制,并探讨其作为早期胰腺癌筛查和干预生物标志物的潜在价值 胰腺导管化生细胞及其基因调控网络 数字病理学 胰腺癌 单细胞测序,细胞谱系追踪 NA 文本 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 可能使用10x Chromium平台进行单细胞转录组分析
1727 2026-05-02
A comprehensive prognostic signature for glioblastoma patients based on transcriptomics and single cell sequencing
2021-Aug, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
研究论文 基于转录组学和单细胞测序构建胶质母细胞瘤综合预后标志物 结合TCGA和CGGA数据库筛选出七种差异表达基因作为预后标志物,并利用单细胞测序分析这些基因在肿瘤细胞增殖和进展中的功能,最终构建了综合临床特征和基因谱的预后模型 模型主要基于公共数据集,可能在外部验证数据中表现待进一步确认,且老年患者亚组的特异性表现需更多研究支持 揭示胶质母细胞瘤的潜在预后标志基因并构建有效的预后模型 胶质母细胞瘤患者 机器学习 胶质母细胞瘤 RNA-seq, 单细胞测序, 实时定量PCR 预后风险评分模型 转录组数据, 单细胞测序数据 TCGA和CGGA数据库中的胶质母细胞瘤患者样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1728 2026-05-02
1p/19q co-deletion status is associated with distinct tumor-associated macrophage infiltration in IDH mutated lower-grade gliomas
2021-Feb, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
研究论文 本研究探讨1p/19q共缺失状态对IDH突变低级别胶质瘤中肿瘤相关巨噬细胞浸润的影响 首次揭示1p/19q共缺失状态与IDH突变低级别胶质瘤中TAM表型及浸润程度的关联,并发现M-CSF和TGFβ1信号通路可能介导这一过程 研究主要依赖TCGA转录组数据和有限样本的免疫染色,小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病 确定1p/19q共缺失状态是否影响IDH突变低级别胶质瘤中TAM的表型或浸润程度 IDH突变低级别胶质瘤中的肿瘤相关巨噬细胞 机器学习 脑胶质瘤 RNA-seq、单细胞RNA测序、免疫染色、小分子抑制剂 NA 转录组数据、单细胞测序数据、组织样本图像 230个TCGA样本及IDH突变LGG原代样本 NA bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
1729 2026-05-01
HOX code-based stratification reveals RUNX1T1-HDAC reprogramming as a targetable driver of lineage plasticity across cancers
2026-Jun-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 通过分析80,000多个RNA-seq样本的HOX基因表达,发现HOX代码能够跨癌种区分谱系受限和谱系可塑性状态,并揭示RUNX1T1-HDAC轴作为可治疗靶点 首次建立基于HOX代码的跨癌种谱系可塑性分类框架,发现RUNX1T1作为跨谱系可塑性调节因子,并验证HDAC3抑制可作为治疗策略 未明确提及,但可能包括机制验证主要基于前列腺癌模型,以及临床验证样本范围的潜在限制 探索HOX代码作为跨癌种谱系可塑性生物标志物的可行性,并鉴定潜在治疗靶点 前列腺癌、肺癌和急性髓系白血病的谱系可塑性亚型及相关细胞模型 机器学习 前列腺癌、肺癌、急性髓系白血病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CUT&RUN, 共免疫沉淀, 脂质纳米颗粒 人工智能结构建模 RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 染色质图谱数据 超过80,000个RNA-seq样本,涵盖23种癌症类型的114个亚型 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1730 2026-05-01
AMPK-p38 axis converts human pluripotent stem cells to naive state
2026-May-15, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究发现AMPK-p38轴可单独诱导人类多能干细胞(hPSCs)从始发态向原始态转化,并揭示了中间状态细胞的特征 首次发现AMPK/p38通路单因子即可驱动始发态hPSC向原始态转变,无需多种外源因子;通过scRNA-seq与RNA速率分析揭示了始发态与原始态之间的中间细胞状态 未提及具体局限性,可能需要进一步验证AMPK-p38通路的长期稳定性和安全性 探索将人类多能干细胞从始发态高效转化为原始态的新机制与简化方法 人类多能干细胞(hPSCs)在始发态与原始态之间的转化过程及中间状态细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量,研究基于细胞系实验及单细胞分析 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 使用10x Chromium平台进行单细胞RNA测序,结合RNA速率分析和Totem轨迹映射分析中间状态
1731 2026-05-01
Single-Cell Profiling Reveals Divergent Mechanisms of Fibrosis in Localized Scleroderma and Systemic Sclerosis
2026-May, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 通过单细胞测序揭示局限性硬皮病和系统性硬化症纤维化的不同机制 首次通过单细胞RNA测序比较两种纤维化疾病的机制差异,发现局限性硬皮病中三级淋巴结构驱动的局部免疫激活,而系统性硬化症中CREB3L1高表达成纤维细胞的系统性活化 样本量较小(每组仅3例患者),且未进行大规模队列验证 阐明局限性硬皮病和系统性硬化症纤维化差异的分子机制 皮肤活检样本(3例健康对照、3例局限性硬皮病患者、3例系统性硬化症患者)及小鼠模型 数字病理学 纤维化疾病(局限性硬皮病、系统性硬化症) 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 9例皮肤活检样本(3例健康对照、3例局限性硬皮病、3例系统性硬化症) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
1732 2026-05-01
Transcriptomics analyses reveal microgravity triggers estrogen synthesis amidst degeneration and aging in human ovarian granulosa cells
2026-May, Life sciences in space research IF:2.9Q2
研究论文 通过转录组学分析揭示微重力诱发人卵巢颗粒细胞退化和衰老过程中的雌激素合成 首次系统表征微重力对人卵巢颗粒细胞的多方面影响,包括细胞骨架、线粒体功能和雌激素合成相关过程的破坏,并鉴定抗衰老化合物如雷帕霉素作为潜在干预措施 由于测序数据稀缺,机制研究和干预开发受到限制,且研究仅在体外进行 探究微重力对人卵巢颗粒细胞的影响及其对生殖内分泌健康的潜在机制 人卵巢颗粒细胞 转录组学 生殖内分泌疾病 转录组学分析、单细胞转录组学解卷积分析 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
1733 2026-05-01
Methylene blue restores NAD+/NADH homeostasis to attenuate Achilles tendinopathy via activating AIF/Mitochondrial respiratory chain complex I
2026-May, Journal of orthopaedic translation IF:5.9Q1
research paper 本研究探讨亚甲蓝通过恢复NAD+/NADH稳态缓解跟腱病的机制,并发现其通过激活AIF/线粒体呼吸链复合体I发挥作用 首次揭示亚甲蓝靶向NAD代谢通过AIF驱动的线粒体修复机制促进线粒体复合体I生物合成,为老药新用提供转化医学范例 未提及具体研究局限性 研究NAD代谢失调在跟腱病中的作用,评估亚甲蓝恢复NAD稳态和缓解跟腱病的疗效 人类跟腱组织、大鼠实验性跟腱病模型、大鼠原代跟腱细胞 machine learning geriatric disease 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 人类跟腱组织和大鼠跟腱样本,具体数量未提及 NA single-cell RNA-seq NA NA
1734 2026-05-01
Multiomics Analysis Reveals Stromal Cell State Changes and INHBA-Associated Remodeling in Calcific Aortic Valve Disease
2026-Apr-30, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 通过多组学分析揭示钙化性主动脉瓣疾病中基质细胞状态变化及INHBA相关的重塑机制 首次整合GWAS、单细胞RNA测序和体外模型,系统解析胎儿、健康成人及CAVD瓣膜中基质细胞亚群状态转变,并鉴定INHBA在VIC成骨重塑中的关键作用 未明确说明具体局限性 阐明CAVD的细胞和分子机制,特别是基质细胞状态变化及INHBA在疾病相关重塑中的作用 主动脉瓣膜间质细胞和瓣膜源性基质细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、GWAS、bulk RNA测序 NA 基因表达数据 胎儿、健康成人和CAVD患者的瓣膜样本,以及体外VIC钙化模型 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序用于scRNA-seq; Illumina NovaSeq用于bulk RNA-seq和GWAS
1735 2026-05-01
TNF Pathway-Mediated Tolerogenic T-Cell Trajectory Driven by Allergen Immunotherapy
2026-Apr-30, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 本研究探讨过敏原免疫治疗如何通过TNF通路驱动耐受性T细胞轨迹,恢复免疫平衡 首次通过单细胞转录组学揭示Tr17细胞作为促炎与调节性T细胞程序之间的中间状态,并发现TNF/LTA信号通路在耐受性信号传导中的关键作用 主要基于动物模型和少量人类血液样本,未进行长期临床随访验证 探究AIT治疗第一年内从3型免疫向调节性状态转变的动态过程及效应细胞功能障碍 人类和实验性过敏性气道炎症模型的T细胞群体,包括Treg、Tr17和Th17细胞 机器学习和生物信息学交叉 过敏性气道疾病 单细胞转录组学、流式细胞术、增殖实验 NA 单细胞基因表达数据 人类血液样本和动物模型样本(具体数量未提供) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
1736 2026-05-01
Integrating single-cell RNA and bulk RNA sequencing data to identify prognostic genes associated with pyrimidine metabolism in triple-negative breast cancer by machine learning algorithm combinations
2026-Apr-30, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 利用机器学习算法整合单细胞和批量RNA测序数据,识别三阴性乳腺癌中与嘧啶代谢相关的预后基因 首次通过101种机器学习算法组合筛选与嘧啶代谢相关的预后基因,并基于单细胞RNA测序分析揭示上皮细胞与预后基因表达的相关性 所有数据来自公共数据库,缺乏独立外部验证队列;预后基因的功能验证仅限于SEPT3,其他基因的机制未深入探讨 识别三阴性乳腺癌中与嘧啶代谢相关的预后基因 三阴性乳腺癌患者 机器学习 乳腺癌 RNA-seq 加权基因共表达网络分析、单变量Cox回归、101种机器学习算法组合 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 公共数据库中的三阴性乳腺癌样本(具体数量未说明) NA 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
1737 2026-05-01
Engineering of Immunoactive Hydrogels Complements Tumor-Treating Fields for Glioblastoma Therapy
2026-Apr-29, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 该研究揭示了肿瘤治疗电场(TTF)通过鞘脂代谢相关通路介导的内质网应激诱导胶质母细胞瘤免疫原性细胞死亡,并设计了一种ATP响应性水凝胶佐剂与TTF协同作用,实现抗原和CpG的时空控释,增强抗肿瘤免疫效果 首次在单细胞RNA测序分辨率下阐明TTF诱导免疫原性细胞死亡的分子机制,并开发了ATP响应性水凝胶佐剂与TTF联合疗法(HaTTF),实现了对胶质母细胞瘤的更强效治疗 该研究尚未在人类临床试验中验证HaTTF的安全性和有效性,且水凝胶佐剂的长期生物降解性和免疫激活的潜在副作用需进一步评估 开发一种联合肿瘤治疗电场和免疫佐剂的综合疗法,以改善胶质母细胞瘤的治疗效果 胶质母细胞瘤(GBM)细胞和大鼠GBM模型 机器学习和数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未在摘要中明确提及样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1738 2026-05-01
Spatial-aware detection of copy number alterations from spatial transcriptomics using SpaCNA
2026-Apr-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出SpaCNA框架,整合空间转录组学多模态信息,实现肿瘤拷贝数变异的高精度检测 首次将隐马尔可夫随机场模型与空间连续性及形态学特征结合,实现空间转录组数据中CNAs的稳健检测,并扩展到3D空间连续切片的重建 未提及计算资源需求或对低质量数据的适应性等局限性 开发空间转录组数据中拷贝数变异检测的计算方法 模拟数据及多种真实癌症数据集(乳腺癌、结直肠癌、头颈鳞癌) 计算生物学 乳腺癌, 结直肠癌, 头颈鳞状细胞癌 空间转录组学 隐马尔可夫随机场 空间转录组数据 模拟数据及多种癌症数据集 NA 空间转录组学 NA NA
1739 2026-05-01
RUNX2 drives adenoma-to-carcinoma transition in colon cancer
2026-Apr-29, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序等技术揭示RUNX2驱动结肠腺瘤向腺癌转变的关键机制 首次发现RUNX2通过CD8耗竭T细胞-TNF-α-TNFRSF1A通路驱动结肠腺瘤向腺癌转变,并验证了其特异性抑制剂CADD522的抑制作用 未明确说明实验样本量及临床转化验证的局限性 阐明结肠腺瘤向腺癌转变的分子机制 结肠腺瘤和腺癌组织中的CD8耗竭T细胞和上皮细胞 机器学 结肠癌 单细胞RNA测序 九基因风险评分模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1740 2026-05-01
Clec3b⁺ fibroblasts are the primary effectors of portal fibrosis following activation via a KLF4/periostin axis
2026-Apr-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和遗传谱系追踪,鉴定Clec3b⁺成纤维细胞为门脉纤维化的主要效应细胞,并揭示KLF4/Periostin轴调控其活化 首次明确Clec3b⁺成纤维细胞是胆道损伤后门脉纤维化的主要效应细胞,并发现KLF4/Periostin信号轴是调控其活化的关键机制 研究主要基于小鼠模型,可能不完全代表人类疾病,且未涉及其他慢性肝病中的门脉纤维化机制 探究胆道疾病中门脉纤维化的细胞和分子机制,特别是寻找关键效应细胞和调控通路 小鼠模型中的门脉成纤维细胞,特别是Clec3b⁺成纤维细胞亚群 数字病理学 胆道疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型样本,具体数量文中未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于小鼠门脉成纤维细胞分析
回到顶部