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当前共找到 37326 篇文献,本页显示第 1721 - 1740 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1721 2026-02-21
HiDDEN: a machine learning method for detection of disease-relevant populations in case-control single-cell transcriptomics data
2024-11-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为HiDDEN的机器学习方法,用于在病例对照单细胞转录组学数据中检测疾病相关细胞群体 HiDDEN通过优化病例对照标签,解决了标准单细胞分析在受影响细胞子集较小或扰动强度较弱时无法准确识别的问题,从而提高了生物信号恢复能力 方法主要基于模拟数据进行验证,实际应用中的复杂生物异质性可能未完全覆盖 开发一种计算方法来检测单细胞转录组数据中疾病相关的细胞群体 单细胞RNA-seq数据中的细胞群体,包括人类多发性骨髓瘤前体条件和脱髓鞘小鼠模型 机器学习 多发性骨髓瘤 单细胞RNA-seq 机器学习方法 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1722 2026-02-21
Loss of p53 and SMAD4 induces adenosquamous subtype pancreatic cancer in the absence of an oncogenic KRAS mutation
2024-Sep-17, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究通过建立基因工程小鼠模型,探索了在KRAS野生型背景下,Trp53/Smad4或Trp53/Tgfbr2缺失如何自发诱导胰腺癌,并揭示了其独特的组织学特征和肿瘤免疫微环境 首次在KRAS野生型小鼠模型中证明Trp53/Smad4或Trp53/Tgfbr2缺失足以驱动胰腺癌发生,并识别出腺鳞癌亚型,与KRAS突变型肿瘤在组织学和免疫微环境上存在差异 研究基于小鼠模型,可能无法完全模拟人类胰腺癌的复杂性,且样本量有限,需进一步验证 探究KRAS野生型胰腺癌的发病机制和分子特征 基因工程小鼠模型(PPSSC和PPTTC)及其胰腺肿瘤组织 肿瘤生物学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 基因工程小鼠模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1723 2026-02-21
Transcriptomic Analysis Reveals That Excessive Thyroid Hormone Signaling Impairs Phototransduction and Mitochondrial Bioenergetics and Induces Cellular Stress in Mouse Cone Photoreceptors
2024-Jul-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了过量甲状腺激素信号通过损害光转导和线粒体生物能量学并诱导细胞应激,从而导致小鼠视锥细胞退化的转录组学机制 首次在单细胞分辨率下系统揭示了过量甲状腺激素信号对视锥细胞转录组的影响,并明确了光转导、线粒体功能和细胞应激通路的具体变化 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类视网膜细胞或临床样本中验证 探究过量甲状腺激素信号诱导视锥细胞退化的基因/转录组学改变 C57BL/6小鼠的视网膜细胞,特别是视锥细胞 单细胞组学 视网膜退行性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 155,866个单细胞,来自甲状腺激素处理的小鼠视网膜 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1724 2026-02-21
Canopy2: tumor phylogeny inference by bulk DNA and single-cell RNA sequencing
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出Canopy2,一种贝叶斯框架,利用批量DNA和单细胞RNA测序数据推断肿瘤系统发育树并进行突变分析 Canopy2通过结合批量DNA和单细胞RNA测序数据,使用马尔可夫链蒙特卡洛方法从二项分布和β-二项分布的混合概率分布中采样,能有效解析单细胞数据中的零值来源,区分非癌性、随机性和技术性零值 未在摘要中明确提及具体局限性 推断肿瘤系统发育树并进行肿瘤亚群的突变分析,以理解肿瘤异质性 肿瘤细胞,特别是乳腺癌和胶质母细胞瘤数据 计算生物学 癌症 单细胞RNA测序,批量DNA测序 贝叶斯框架,马尔可夫链蒙特卡洛方法 单核苷酸变异数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序,批量DNA测序 NA NA
1725 2026-02-20
Bulk and single-cell transcriptomics for identification of potential diagnostic biomarkers associated with pulmonary arterial hypertension and integrated stress response and experimental validation
2026-Dec-31, Clinical and experimental hypertension (New York, N.Y. : 1993)
研究论文 本研究通过整合生物信息学、单细胞转录组学和实验方法,识别并验证了与肺动脉高压相关的四个新型整合应激反应相关诊断生物标志物 首次系统探索整合应激反应相关基因在肺动脉高压发病机制中的作用,并利用单细胞转录组学揭示其细胞类型特异性表达 研究主要基于公开数据集和临床血液样本,缺乏更广泛的组织样本验证 识别和验证肺动脉高压的潜在诊断生物标志物 肺动脉高压患者和对照组的转录组数据及临床血液样本 生物信息学 肺动脉高压 RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, ELISA 机器学习 转录组数据 多个数据集(GSE38267, GSE131793, GSE210248)及临床血液样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1726 2026-02-20
Age-associated differences in XBB.1.5 trivalent booster vaccine-induced adaptive responses revealed by single-cell RNA sequencing
2026-Dec, Emerging microbes & infections IF:8.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了年轻与老年个体在接种XBB.1.5三价重组蛋白加强疫苗后适应性免疫反应的年龄相关差异 首次使用单细胞RNA测序技术详细比较了年轻与老年人群在接种XBB.1.5三价加强疫苗后的免疫细胞状态转变、转录轨迹和T细胞受体多样性差异 样本量相对较小,且缺乏长期纵向数据来验证观察到的差异的临床意义 探究年龄对COVID-19加强疫苗免疫反应的影响 年轻(<38岁)和老年(≥73岁)健康个体 单细胞组学 COVID-19 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 42名个体(22名年轻,20名老年) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1727 2026-02-20
Diethyl Phthalate (DEP) as a potential osteosarcoma risk factor: a multi-omics study integrating network Toxicology, single-cell RNA sequencing, and molecular docking
2026-Dec, Journal of enzyme inhibition and medicinal chemistry IF:5.6Q1
研究论文 本研究通过整合网络毒理学、单细胞RNA测序和分子对接等多组学方法,探究了邻苯二甲酸二乙酯(DEP)作为潜在骨肉瘤风险因子的作用机制 首次将网络毒理学、单细胞RNA测序和分子动力学模拟相结合,系统研究DEP在骨肉瘤中的作用机制,并鉴定了P4HA2、COL18A1和COL10A1等新型生物标志物 研究主要基于计算分析和体外验证,缺乏体内实验验证DEP的直接致癌效应 探究邻苯二甲酸二乙酯(DEP)在骨肉瘤发生发展中的分子机制 骨肉瘤(OS)相关基因和信号通路 生物信息学 骨肉瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接、分子动力学模拟、机器学习 LASSO、SVM-RFE、Boruta算法 基因表达数据、蛋白质互作数据、分子结构数据 未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1728 2026-02-20
Integrin β1 Demarks Precursors of Brain-Residing Antibody-Secreting Cells in Multiple Sclerosis
2026-May, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
研究论文 本研究通过单细胞技术揭示了整合素β1(CD29)作为多发性硬化症中CXCR3+记忆B细胞的标志物,用于预测中枢神经系统抗体分泌细胞前体及治疗反应 首次将CD29鉴定为CXCR3+记忆B细胞的关键区分标志,并关联其在血脑屏障穿越和抗体分泌细胞成熟中的作用,为多发性硬化症治疗反应预测提供新生物标志物 研究基于体外实验和死后组织样本,可能无法完全模拟体内动态;样本量有限且治疗组别覆盖不全 探索多发性硬化症中B细胞进入中枢神经系统并成熟的标志物,并评估其与高效疗法治疗反应的关联 多发性硬化症患者和对照者的血液样本、死后中枢神经系统悬浮液,以及健康个体的血液样本 单细胞组学 多发性硬化症 单细胞RNA测序,光谱流式细胞术,体外细胞培养和迁移实验 NA 单细胞RNA测序数据,流式细胞术数据 多发性硬化症患者和对照者的血液及死后中枢神经系统样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1729 2026-02-20
Identification of potential drug targets for erectile dysfunction with single-cell RNA sequencing: A Mendelian randomization study
2026-Mar, Andrology IF:3.2Q1
研究论文 本研究利用孟德尔随机化方法,结合单细胞RNA测序数据,识别了勃起功能障碍的潜在药物靶点 首次将孟德尔随机化与单细胞RNA测序相结合,在细胞类型水平上识别并验证了勃起功能障碍的潜在治疗靶点 研究依赖于公开的汇总统计数据,无法进行个体水平的因果推断;单细胞测序数据来自单一数据集 识别勃起功能障碍的新型治疗靶点,以改善对现有药物反应不佳患者的治疗效果 勃起功能障碍患者 生物信息学 勃起功能障碍 单细胞RNA测序,孟德尔随机化,共定位分析,分子对接 孟德尔随机化模型 基因表达数据,全基因组关联研究汇总统计数据 eQTL数据:31,684人;ED队列1:229,980人(6,175例病例,223,805例对照);ED队列2:95,178人(1,154例病例,94,024例对照);单细胞RNA-seq数据集:GSE206528 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1730 2026-02-20
Breaking and making genes: the genesis of novel traits in plants
2026-Mar, The New phytologist
综述 本文综述了植物中基因融合事件的分子机制、功能及其在植物适应和进化中的作用 系统性地概述了植物中相对研究不足的基因融合现象,将其与人类研究中的致癌潜力进行对比,并强调了其在植物生物学中日益增长的重要性 这是一篇综述文章,主要总结现有知识,而非提出新的实验数据或模型 阐明基因融合在植物进化、功能多样化和适应中的机制与作用 植物中的基因融合事件 植物生物学与基因组学 NA 高通量测序技术、单细胞测序平台 NA 基因组与转录组数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
1731 2026-02-20
Development and Characterization of a Novel Chronic Thromboembolic Pulmonary Hypertension Rat Model: Identifying Sell-Podxl as Potential Regulators
2026-Mar, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
研究论文 本研究开发并表征了一种新型慢性血栓栓塞性肺动脉高压大鼠模型,并通过单细胞RNA测序揭示了Sell-Podxl作为潜在调控因子在疾病中的作用 开发了一种结合明胶海绵和SU5416的新型大鼠模型,成功模拟了人类慢性血栓栓塞性肺动脉高压的近端肺动脉阻塞和远端微血管病变的双重病理特征,并首次发现Sell-Podxl配体-受体对在疾病中的关键作用 研究仅使用雄性Sprague-Dawley大鼠,未考虑性别差异;模型建立时间为5周,长期病理变化尚需进一步观察 阐明慢性血栓栓塞性肺动脉高压的发病机制,特别是肺血管重塑的分子机制 Sprague-Dawley大鼠的肺组织 单细胞组学 肺动脉高压 单细胞RNA测序 动物模型 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,但涉及大鼠肺组织单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1732 2026-02-20
Comparative evaluation of 18S rDNA V4 and 28S rDNA D1-2 regions for resolving Alexandrium species diversity to improve its use for metabarcoding
2026-Mar, Harmful algae IF:5.5Q1
研究论文 本研究比较了18S rDNA V4和28S rDNA D1-2区域在解析亚历山大藻物种多样性方面的表现,以提升其在宏条形码技术中的应用准确性 首次构建了27种亚历山大藻的28S rDNA D1-2参考数据库,并扩展了18S rDNA V4数据库,同时通过实验确认了亚历山大藻中18S rDNA V4区域存在基因组内变异,并提出了仅使用优势序列构建参考数据库的建议 研究主要基于现有数据库挖掘和单细胞测序,可能未覆盖所有亚历山大藻物种或变异类型,且实验验证范围有限 提高亚历山大藻物种的准确鉴定能力,以支持有害藻华和麻痹性贝类中毒的早期检测 亚历山大藻物种的18S rDNA V4和28S rDNA D1-2分子标记序列 分子生物学 NA 单细胞测序、宏条形码、数据库挖掘 NA DNA序列数据 涉及27种亚历山大藻物种的分子序列 NA 单细胞测序 NA NA
1733 2026-02-20
BTK inhibition suppresses neuroinflammation and neurodegeneration in amyotrophic lateral sclerosis
2026-Feb-19, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
研究论文 本文探讨了布鲁顿酪氨酸激酶(BTK)在肌萎缩侧索硬化症(ALS)神经炎症和神经退行性变中的关键调控作用 首次将BTK识别为ALS中失调的cGAS-STING-NF-κB信号轴的上游关键调控节点,并证明其同时协调运动神经元的细胞自主功能障碍和小胶质细胞激活的非细胞自主毒性 研究主要基于SOD1突变模型,可能无法完全代表所有ALS亚型;动物实验仅使用了SOD1-G93A小鼠模型 探究BTK在ALS发病机制中的作用,并评估BTK抑制作为治疗策略的潜力 ALS患者组织样本、SOD1突变人诱导多能干细胞分化的运动神经元和小胶质细胞、SOD1-G93A转基因小鼠 神经科学 肌萎缩侧索硬化症 RNA-seq、scRNA-seq、Western blot、ELISA、免疫荧光、吞噬功能测定 NA 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据、动物行为数据 公共RNA-seq数据集、SOD1突变hiPSC分化的细胞、SOD1-G93A小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq NA NA
1734 2026-02-20
Xenium-based spatial transcriptomic analyses uncover prognosis-associated heterogeneity in the tumor microenvironment (TME) of angioimmunoblastic T-cell lymphoma (AITL)
2026-Feb-19, The Journal of pathology IF:5.6Q1
研究论文 本研究利用基于Xenium平台的空间转录组学技术,分析了血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤(AITL)的肿瘤微环境异质性,并揭示了与预后相关的关键细胞亚群和免疫格局差异 首次在AITL中鉴定出具有干细胞样特征的NEIL3+滤泡辅助性T细胞亚群,并系统描绘了难治/复发与治疗敏感病例之间肿瘤微环境的空间组织差异 样本量较小(10例临床样本),且为观察性研究,需要更大队列和功能实验验证 解析AITL肿瘤微环境的异质性及其与临床预后的关联,寻找潜在治疗靶点 血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤(AITL)患者肿瘤组织 空间转录组学 淋巴瘤 空间转录组学 NA 空间转录组数据 10例临床样本(包括难治/复发与治疗敏感病例) 10x Genomics 空间转录组学 Xenium Xenium空间转录组分析平台
1735 2026-02-20
Recent advances in reproductive biology: European innovations in embryo development and research†
2026-Feb-18, Biology of reproduction IF:3.1Q2
综述 本文综述了欧洲在生殖生物学和胚胎学领域的开创性贡献,重点介绍了辅助生殖技术、高通量单细胞RNA测序以及合成胚胎模型的创新进展 整合了高通量单细胞RNA测序技术揭示早期胚胎发育的分子通路,并开发了合成胚胎模型作为自然胚胎研究的替代方案,展示了多能细胞的自我组织能力 在实现模型的可重复性和更稳健的植入模型方面仍存在挑战 推动生殖生物学和胚胎学的发展,改善人类和动物的生育结果 人类和动物的胚胎发育过程 生殖生物学 不孕症 高通量单细胞RNA测序 合成胚胎模型 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1736 2026-02-20
Computational integration of in vivo single cell and in vitro bulk transcriptomics across 236 human and mouse datasets differentiates physiological versus non-physiological hepatic cell lines for hepatotoxicity screening
2026-Feb-18, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合人类和小鼠的体内单细胞与体外批量转录组数据,评估了肝细胞系在毒性筛选中的生理相关性 提出了一种新的计算学方法,利用现有大数据指导选择功能相关性更强的细胞系,可应用于其他组织的体外建模和广泛的生物医学应用 研究主要基于转录组数据,可能未涵盖所有生理层面的差异,且数据集数量有限(236个) 区分生理性与非生理性肝细胞系,以优化肝毒性筛选的体外模型选择 人类和小鼠的肝细胞系、肝细胞、肝星状细胞、胆管细胞以及体内肝脏组织 计算生物学 肝毒性 单细胞RNA测序(scRNAseq)、批量转录组学 NA 转录组数据 236个人类和小鼠数据集,包括214个细胞系数据集和7个体内单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1737 2026-02-20
Characterization of p16-positive stromal cells in age-related cardiac disorders
2026-Feb-18, Journal of biochemistry IF:2.1Q4
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析衰老小鼠心脏中的p16阳性基质细胞,揭示了p16+成纤维细胞在年龄相关心脏纤维化中的关键作用 首次在单细胞水平上表征p16阳性基质细胞,并发现TGF-β信号和BMP4在p16+成纤维细胞中显著富集,选择性消除这些细胞可改善心脏纤维化 研究基于小鼠模型,人类样本验证尚不充分 探究p16阳性基质细胞在年龄相关心脏疾病中的作用机制 衰老小鼠心脏中的p16阳性基质细胞,特别是成纤维细胞 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 使用p16-Tom和p16-Col1a2-LRTD转基因小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1738 2026-02-20
Intercellular communication landscape and its working mechanism in systemic sclerosis-associated interstitial lung disease
2026-Feb-18, Rheumatology (Oxford, England)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC测序分析,揭示了系统性硬化症相关间质性肺病中细胞间通讯的景观及其工作机制 首次系统性评估了SSc-ILD中的促纤维化因子,并通过整合scRNA-seq和scATAC-seq数据,发现了SPP1/CCL18阳性巨噬细胞与COL1A2间充质细胞在细胞间通讯中的关键作用 样本量相对有限,动物模型数量较少,且主要基于相关性分析,需要进一步的功能性实验验证 探究系统性硬化症相关间质性肺病的发病机制,特别是细胞间通讯网络的作用 人类肺组织样本(正常和SSc-ILD患者)、SSc患者血清样本、博来霉素诱导的肺纤维化动物模型 数字病理学 系统性硬化症相关间质性肺病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)、ELISA、免疫荧光、免疫组化 NA 单细胞转录组数据、表观基因组数据、血清蛋白数据、组织图像数据 34例人类肺组织(17例正常,17例SSc-ILD)、55例SSc患者血清(32例伴ILD,23例不伴ILD)、5只动物模型 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
1739 2026-02-20
Exploration and Validation of the Diagnostic Potential of the Circadian Rhythm-Related Genes CCL23 and VNN1 in Adolescents with Depressive Disorder
2026-Feb-18, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
研究论文 本研究探索并验证了昼夜节律相关基因CCL23和VNN1作为青少年抑郁障碍诊断生物标志物的潜力 首次从转录组学角度识别CCL23和VNN1作为抑郁障碍的昼夜节律相关生物标志物,并通过多数据集验证其诊断性能 样本量较小(15例患者和15例对照),且研究仅基于血液样本,未直接评估脑组织表达 探索昼夜节律相关基因作为抑郁障碍诊断生物标志物的潜力 青少年抑郁障碍患者和年龄匹配的健康对照 自然语言处理 抑郁障碍 RNA测序、RT-qPCR、单细胞RNA测序 NA 转录组数据 15例青少年抑郁障碍患者和15例年龄匹配对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1740 2026-02-20
A pathomics-based pyroptosis signature predicts survival in clear cell renal cell carcinoma
2026-Feb-18, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究开发了一种基于病理组学特征和细胞焦亡信号的新型预后模型,用于预测透明细胞肾细胞癌患者的生存情况 首次在ccRCC中整合病理组学特征与细胞焦亡相关信号构建预后模型,并揭示了关键基因在肿瘤微环境中的表达模式 模型主要基于TCGA数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证其临床应用价值 开发更准确的预后工具以改善透明细胞肾细胞癌的临床管理 透明细胞肾细胞癌患者 数字病理学 肾细胞癌 病理组学分析、单细胞测序 StepCox[forward]+Lasso算法 全切片数字病理图像、基因表达数据 TCGA数据库中的ccRCC患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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